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当前共找到 7466 篇文献,本页显示第 341 - 360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
341 2026-08-17
CH6824025, Potent and Selective Discoidin Domain Receptor 1 Inhibitor, Reduces Kidney Fibrosis in Unilateral Ureteral Obstruction Mice
2024-11-19, The Journal of pharmacology and experimental therapeutics IF:3.1Q2
研究论文 本研究探讨了新型DDR1抑制剂CH6824025对单侧输尿管梗阻小鼠肾纤维化的改善作用,并通过空间转录组分析揭示其潜在机制 首次报道强效选择性DDR1抑制剂CH6824025在肾纤维化模型中的治疗效果,并结合10x Visium空间转录组分析揭示其作用机制 研究仅在单侧输尿管梗阻小鼠模型中进行,缺乏对其他肾纤维化模型和人类样本的验证,且未深入探讨DDR1抑制剂的长期安全性 评估CH6824025对肾纤维化的改善作用及其潜在机制,并探索DDR1作为治疗靶点的可行性 单侧输尿管梗阻小鼠的肾脏组织 数字病理学 肾纤维化 空间转录组学 NA 基因表达数据 未明确说明,涉及UUO小鼠模型和多组比较 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组分析
342 2026-08-17
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-27, Research square
研究论文 开发了一种名为TACIT的无监督算法,利用预定义签名进行细胞注释,以解决空间生物学中细胞类型和状态识别的挑战,并在多个数据集上验证其准确性和可扩展性 TACIT无需训练数据,采用无偏阈值区分阳性细胞与背景,聚焦相关标记物识别多组学检测中的模糊细胞,并整合空间转录组和蛋白质组数据发现疾病相关免疫细胞类型和状态 文中未明确提及局限性 提高空间生物学中细胞类型和状态注释的准确性和可扩展性,并促进多组学数据在临床转化中的应用 五种数据集(500万个细胞、51种细胞类型)来自三个生态位(脑、肠、腺体) 机器学习 炎症性腺疾病 空间转录组学、空间蛋白质组学 无监督算法(TACIT) 空间转录组数据、蛋白质组数据 5,000,000个细胞,涵盖51种细胞类型,来自脑、肠、腺体三个生态位 NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
343 2026-08-17
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了一种无监督算法TACIT,用于空间多组学数据中细胞类型和状态的去卷积,无需训练数据即可进行细胞注释 无需训练数据,使用无偏阈值区分阳性细胞,关注相关标记物识别模糊细胞,适用于多组学检测 未在文中明确提及局限性 解决空间生物学中细胞类型和状态识别耗时且易出错的问题,提高准确性和可扩展性 来自大脑、肠道和腺体三个微环境的数据集,包含约500万个细胞和51种细胞类型 空间生物学、深度学习、机器学习 炎症性腺体疾病 空间转录组学、空间蛋白质组学 无监督算法(TACIT) 空间多组学数据(包括转录组和蛋白质组) 五个数据集,约500万个细胞,51种细胞类型 NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
344 2026-08-17
JAK/STAT3 represents a therapeutic target for colorectal cancer patients with stromal-rich tumors
2024-Mar-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了JAK/STAT3抑制在结直肠癌中的治疗效果,并发现高表达与富含基质肿瘤患者的不良预后相关。 通过空间转录组学揭示高pSTAT3病例中肿瘤与微环境差异基因表达,并识别非经典成纤维细胞信号。 未提及 评估JAK/STAT3抑制在结直肠癌中的抗癌活性,并确定高表达作为预后标志物的适用背景。 结直肠癌细胞系、小鼠类器官、患者来源类器官及临床患者队列。 数字病理学 结直肠癌 免疫组化、突变谱分析、bulk RNA测序、空间转录组学 类器官模型 基因表达数据、空间转录组数据、临床病理数据 3个结直肠癌患者队列,包括TransSCOT临床试验队列及两个独立回顾性队列 NanoString 空间转录组学 NanoString GeoMx NanoString GeoMx® 空间转录组学平台
345 2026-08-17
Defining Endogenous Mitochondrial Transfer in Muscle After Rotator Cuff Injury
2024-02, The American journal of sports medicine
研究论文 本研究探讨了肩袖损伤后肌肉中内源性线粒体从纤维脂肪生成祖细胞(FAPs)向肌原细胞转移的过程,并评估了β-激动剂对这一过程的影响。 首次描述了肩袖损伤中FAPs与肌原细胞之间内源性线粒体转移的新机制,并发现β-激动剂能显著促进这一过程,为肩袖肌肉退化的治疗提供了新靶点。 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;未深入探讨线粒体转移对肌肉功能恢复的具体生理效应。 研究FAPs向肌原细胞线粒体水平转移的机制,并评估β-激动剂对这一过程的促进作用。 小鼠肩袖损伤模型、纤维脂肪生成祖细胞(FAPs)、C2C12肌母细胞。 数字病理学 肩袖损伤(肌肉退化) 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、共培养、荧光显微镜、旋转盘共聚焦显微镜、双光子显微镜 NA 图像(荧光显微图像)、单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) 10x Genomics(推测,未明确指定) 单细胞RNA-seq NA NA
346 2026-08-16
Retinoic acid, an essential component of the roof plate organizer, promotes the spatiotemporal segregation of dorsal neural fates
2024-10-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本文通过单细胞转录组学揭示了视黄酸在背侧神经管中促进神经嵴与顶板及中间神经元谱系分离的关键作用,并阐明了其通过Notch信号调控顶板-dI1边界建立的机制。 首次利用单细胞RNA测序结合在体局部抑制技术,全面解析了视黄酸在背侧神经命运分离过程中的下游分子机制,并发现视黄酸缺失导致感觉祖细胞与黑色素细胞未分离,形成异常的胶质-黑色素细胞。 未提及具体局限性,但可能受限于鸡胚模型与人类等哺乳动物的物种差异,且单细胞测序分析仅限于特定发育阶段。 探究背侧神经管来源的视黄酸如何影响中枢和外周谱系的时空分离,以及其在神经嵴生产终止和顶板形成中的作用。 鸡胚背侧神经管中的神经嵴细胞、顶板细胞和dI1中间神经元祖细胞。 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据(基因表达矩阵) 具体数量未提及,涉及鸡胚样本。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
347 2026-08-16
In vivo CRISPR screens identify Mga as an immunotherapy target in triple-negative breast cancer
2024-09-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过体内CRISPR筛选识别出Mga作为三阴性乳腺癌的免疫治疗靶点,并探讨其在肿瘤免疫逃逸中的作用 采用迭代式体内CRISPR筛选覆盖七种同基因肿瘤模型,识别核心及情境依赖性免疫逃逸通路,并聚焦TNBC发现Mga敲除可增强抗肿瘤免疫,结合转录组与单细胞RNA测序揭示其机制 Mga影响肿瘤免疫微环境的确切机制仍需进一步研究 识别肿瘤内在免疫调节因子,探索有效的抗癌治疗靶点,特别是针对三阴性乳腺癌 七种同基因肿瘤模型以及三阴性乳腺癌 基因组学,免疫学 三阴性乳腺癌,肿瘤 CRISPR筛选,转录组测序,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 七种同基因肿瘤模型,以及乳腺癌患者样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 或类似平台(具体配置未提及)
348 2026-08-16
Developmental emergence of first- and higher-order thalamic neuron molecular identities
2024-09-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 通过单细胞RNA测序研究发育中的小鼠胚胎丘脑,揭示一阶和高阶丘脑神经元分子身份的发育出现过程 发现高阶神经元较早分化,一阶神经元的成熟依赖于出生后的外周输入,且这种依赖仅限于兴奋性神经元而非抑制性神经元 未提供具体限制信息 探究一阶和高阶丘脑神经元分子身份在发育过程中的出现机制 发育中的小鼠胚胎和出生后丘脑神经元 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据 未提供具体样本量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
349 2026-08-16
Clustering and visualization of single-cell RNA-seq data using path metrics
2024-05, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于路径度量的单细胞RNA测序数据聚类与可视化新框架scPMP,该框架能够同时保留数据的全局几何结构和局部聚类结构 采用幂加权路径度量,该度量具有数据驱动、密度敏感的特点,能够尊重数据的底层几何结构,与常用的欧氏距离等度量方法有所不同 摘要中未提及明确的局限性 解决单细胞数据分析中常用降维和聚类方法难以同时保留局部聚类结构与全局数据几何结构的问题 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
350 2026-08-16
Single-cell transcriptome analysis reveals characteristic transcription factors in polydactyly
2024-04, European review for medical and pharmacological sciences
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示多指畸形中的特征转录因子及其调控网络 首次利用单细胞RNA测序技术分析多指畸形样本,识别出与成纤维细胞和角质形成细胞相关的特定转录因子,并构建了调控网络 数据仅来自公共数据库,样本量有限,且未进行实验验证 识别多指畸形中的特征转录因子,作为潜在的生物标志物和治疗靶点 多指畸形样本中的成纤维细胞和角质形成细胞亚群 单细胞转录组学 多指畸形 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 4个多指畸形样本,共11,806个单细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 数据来源于GEO公共数据库
351 2026-08-16
Integration of single-cell and RNA-seq data to explore the role of focal adhesion-related genes in osteoporosis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 整合单细胞RNA测序和RNA测序数据,探索黏着斑相关基因在骨质疏松症中的作用,并识别出两个关键基因FAM129A和RNF24 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,系统性地挖掘与黏着斑相关的骨质疏松症枢纽基因,并构建了ceRNA网络、转录因子调控网络及预测模型,同时开展了药物预测和功能验证 未提供详细信息 挖掘与黏着斑相关的枢纽基因,并研究它们在骨质疏松症中的作用,为治疗和评估提供新见解 骨质疏松症患者和小鼠模型,重点关注骨细胞中的黏着斑相关基因 基因组学 骨质疏松症 单细胞RNA测序、RNA测序 列线图(Nomogram) 基因表达数据、临床数据 未提供具体样本数 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
352 2026-08-13
Engineering regional diversity: A morphogen screen for patterned brain organoids
2024-12-05, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文介绍了一种将平行形态发生素调节剂筛选与神经类器官单细胞测序相结合的平台,以增强大脑区域化并实现详细细胞注释 创新性地将平行形态发生素调节剂筛选与单细胞测序整合,用于神经类器官的区域化调控 摘要中未提及具体局限 探索形态发生素在干细胞分化中调控神经区域多样性的系统性方法 神经类器官 机器学习 NA 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
353 2026-08-13
A cross-disease resource of living human microglia identifies disease-enriched subsets and tool compounds recapitulating microglial states
2024-Dec, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 通过对来自74名捐赠者的215,680个活人小胶质细胞进行单细胞RNA测序,构建了跨疾病的资源,识别出疾病富集的亚型,并验证了能够模拟这些状态的化合物。 首次提供了跨多种神经系统疾病和脑区的活人小胶质细胞单细胞转录组资源,结合RNAscope和MERFISH进行原位验证,并利用数据集作为分类工具发现化合物可模拟小胶质细胞状态。 研究中未提及具体局限性。 理解人类小胶质细胞的异质性,并开发针对其状态或功能的靶向治疗。 来自74名捐赠者的人类小胶质细胞,涉及多种神经系统疾病和中枢神经系统区域。 单细胞测序 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 215,680个活人小胶质细胞,来自74名捐赠者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
354 2026-08-13
Targeting GSDME-mediated macrophage polarization for enhanced antitumor immunity in hepatocellular carcinoma
2024-12, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 本研究通过RNA测序分析发现GSDME在抗PD1治疗耐药的肝细胞癌患者中上调,并揭示其通过调控巨噬细胞M2样极化影响抗肿瘤免疫,提出联合使用Eliprodil和抗PD1的治疗策略 首次揭示GSDME在肿瘤相关巨噬细胞中介导的M2样极化及对CD8+T细胞毒性的影响,并发现Eliprodil作为小分子抑制剂能阻断GSDME-PDPK1相互作用,增强抗PD1疗效 研究主要基于少数患者样本和小鼠模型,有待更多临床验证;具体机制细节未完全阐明 探索肝细胞癌抗PD1治疗耐药的机制,寻找提高免疫治疗效果的联合策略 9例接受抗PD-1单药治疗的肝细胞癌患者的肿瘤组织,以及小鼠模型(c-Myc过表达和流体力学尾静脉注射模型) 肿瘤免疫学 肝细胞癌 RNA-seq NA 转录组数据、单细胞测序数据、流式细胞术数据 9例患者组织样本及小鼠模型 Illumina RNA-seq, 单细胞测序 Illumina NovaSeq RNA-seq平台可能为NovaSeq,单细胞测序具体平台未提及
355 2026-08-13
Human vascularized macrophage-islet organoids to model immune-mediated pancreatic β cell pyroptosis upon viral infection
2024-11-07, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 利用GeoMx空间多组学平台和单细胞RNA测序分析COVID-19胰腺尸检样本及人类胰岛病毒感染模型,开发了hPSC衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官,揭示了促炎巨噬细胞通过TNFSF12-TNFRSF12A通路介导β细胞焦亡的机制 首次开发人类多能干细胞衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官模型,用于模拟病毒感染时免疫介导的宿主细胞损伤,并揭示了促炎巨噬细胞诱导β细胞焦亡的新机制 类器官模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境,且研究主要基于体外实验,缺乏体内验证 建立研究免疫介导宿主损伤的人类模型,并探究病毒感染时β细胞损伤的机制 COVID-19胰腺尸检样本、人类胰岛细胞、hPSC衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官 数字病理学 糖尿病、COVID-19、病毒感染相关疾病 空间多组学、单细胞RNA测序 类器官模型 空间转录组数据、单细胞转录组数据、图像 COVID-19胰腺尸检样本(具体数量未提及)及人类胰岛细胞样本(具体数量未提及) NanoString 空间转录组学, 单细胞RNA测序 GeoMx Digital Spatial Profiler, Chromium GeoMx空间多组学平台, 10x Genomics Chromium单细胞RNA测序
356 2026-08-13
Alveolar regeneration by airway secretory-cell-derived p63+ progenitors
2024-11-07, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究揭示肺损伤后由气道分泌细胞衍生的p63阳性祖细胞在肺泡再生中的作用机制 首次通过单细胞RNA测序和克隆分析揭示p63祖细胞在肺损伤后的起源与分化轨迹,并利用双重组酶介导的谱系追踪证实其来源于气道分泌细胞 尚未明确p63激活调控肺泡再生的具体分子通路,且动物模型结果向人类肺损伤修复的转化需进一步验证 阐明肺损伤后p63阳性祖细胞的起源、命运及其在肺泡再生中的功能 小鼠博来霉素诱导的肺损伤模型中的p63阳性祖细胞及其衍生细胞 细胞生物学、再生医学 肺损伤 单细胞RNA测序、克隆分析、双重组酶介导的谱系追踪 NA 单细胞转录组数据、遗传谱系追踪数据 小鼠肺组织样本,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
357 2026-08-13
Tryptophan 2,3-dioxygenase-positive matrix fibroblasts fuel breast cancer lung metastasis via kynurenine-mediated ferroptosis resistance of metastatic cells and T cell dysfunction
2024-11, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究揭示了乳腺癌肺转移中TDO2阳性基质成纤维细胞通过犬尿氨酸介导的转移细胞铁死亡抵抗和T细胞功能障碍促进肺转移的机制 首次解析了肺转移微环境中转移相关成纤维细胞的异质性,并发现TDO2+基质成纤维细胞作为主要亚型通过产生犬尿氨酸上调FTH1增强转移细胞铁死亡抵抗,同时分泌趋化因子招募并诱导T细胞功能障碍,提出靶向肺特异性基质细胞代谢的治疗策略 未提及 阐明乳腺癌肺转移中转移相关成纤维细胞的异质性及其在肺转移形成中的不同作用 乳腺癌肺转移小鼠模型、转移相关成纤维细胞、TDO2+基质成纤维细胞、T细胞、播散肿瘤细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'端测序
358 2026-08-13
Hepatocellular carcinoma-specific epigenetic checkpoints bidirectionally regulate the antitumor immunity of CD4 + T cells
2024-11, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 本研究揭示了MATR3作为肝细胞癌特异性表观遗传检查点,双向调控CD4+ T细胞的抗肿瘤免疫,为HCC免疫治疗提供新策略 首次发现MATR3在肝细胞癌中作为表观遗传检查点,通过招募SWI/SNF复合物调节TOX启动子区域的染色质状态,双向调控CD4+ T细胞的抗肿瘤活性 未提及 阐明MATR3在肝细胞癌微环境中对CD4+ T细胞功能的调控机制及其在免疫逃逸中的作用 肝细胞癌中的CD4+ T细胞,特别是常规CD4+ T细胞 免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
359 2026-08-13
Inflammation-induced epigenetic imprinting regulates intestinal stem cells
2024-10-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究探讨了炎症如何通过表观遗传印记影响肠道干细胞的功能,并发现这些变化会持续存在并影响后续再生能力。 首次揭示了炎症诱导的代谢改变(特别是琥珀酸积累)导致肠道干细胞表观基因组重编程,从而持久影响其分化与再生能力。 未具体提及局限性。 探究肠道干细胞对炎症暴露的适应机制及其是否留下影响后续再生的表观遗传印记。 Lgr5肠道干细胞,来自急性胃肠道移植物抗宿主病模型。 数字病理学 移植物抗宿主病 单细胞转录组学、类器官培养、代谢组学、表观基因组学、体内模型 NA 单细胞转录组数据、代谢数据、表观基因组数据 临床相关急性胃肠道移植物抗宿主病模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
360 2026-08-13
CCKBR+ cancer cells contribute to the intratumor heterogeneity of gastric cancer and confer sensitivity to FOXO inhibition
2024-10, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 通过单细胞测序分析揭示胃癌中CCKBR+癌细胞异质性,并发现FOXO抑制对其具有治疗敏感性 首次识别CCKBR+干细胞样癌细胞与胃癌不良分化及预后相关,并揭示FOXO-唾液酸转移酶轴在维持肿瘤细胞稳态和生长中的新机制 研究主要基于有限样本(5例胃癌患者及40个样本的靶向分析),可能限制结果的普遍性 探索胃癌内肿瘤异质性的分子机制,并评估FOXO抑制作为靶向治疗策略的潜力 胃腺癌患者的恶性上皮细胞及CCKBR+肿瘤细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、CUT&Tag测序、凝集素沉降 NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据 5例胃腺癌患者及40个样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
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