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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-05-28 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
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研究论文 | 通过Fgf18CreER谱系追踪小鼠、单细胞RNA测序等技术，鉴定新生小鼠肺部肌成纤维细胞分化程序及其在肺泡发育中的作用 | 首次利用Fgf18CreER谱系追踪小鼠结合单细胞RNA测序，揭示新生肺间充质细胞中一个不成熟祖细胞向成熟肌成纤维细胞分化的独特程序，并发现内源性ROSA26位点可作为肌成纤维细胞成熟的敏感报告基因 | 未详细说明 | 探究肺泡发育过程中间充质细胞亚型及其分化机制 | 新生小鼠肺部间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, Fgf18CreER谱系追踪, 细胞分选, 原代细胞培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 新生小鼠（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 342 | 2026-05-28 |
Semi-supervised integration of single-cell transcriptomics data
2024-01-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45240-z
PMID:38287014
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研究论文 | 提出一种名为STACAS的半监督单细胞转录组数据整合方法，利用先验细胞类型知识在批量校正中保留生物变异性 | 首次将先验细胞类型信息纳入单细胞数据的半监督批量效应校正，在开放基准测试中优于现有无监督和完全监督方法 | 对不完整或不精确的输入细胞类型标签具有一定鲁棒性，但极端情况下的性能边界未明确讨论 | 开发一种能保留生物变异性的半监督单细胞RNA-seq批量效应校正方法 | 单细胞RNA-seq数据中的批量效应和细胞类型标签 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | STACAS（基于先验细胞类型的半监督整合模型） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 343 | 2026-05-28 |
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2024-01-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45177-3
PMID:38287033
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研究论文 | 利用稳态、新生和单细胞RNA测序策略全面表征雄性生殖细胞群体的基因表达，揭示RNA聚合酶II暂停在精子发生和减数分裂中的关键作用 | 首次发现RNA聚合酶II暂停在精子分化早期建立基因活性景观的必要性，并揭示其在减数分裂中调控双链断裂形成和修复的新功能 | 未提供具体实验限制信息 | 解析雄性生殖细胞发育中基因表达的调控机制，为男性不育症治疗提供新见解 | 雄性小鼠生殖细胞群体 | 机器学习和基因组学 | 男性不育症 | RNA-seq | NA | RNA表达数据（稳态、新生和单细胞） | NA | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2026-05-28 |
Cebp1 and Cebpβ transcriptional axis controls eosinophilopoiesis in zebrafish
2024-01-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45029-0
PMID:38280871
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研究论文 | 利用斑马鱼模型研究嗜酸性粒细胞的发育模式与调控机制 | 首次鉴定eslec为嗜酸性粒细胞谱系特异性标志物，建立Tg(eslec:eGFP)报告品系；通过单细胞RNA测序揭示嗜酸性粒细胞从祖细胞到成熟细胞的发育轨迹；发现Cebp1-Cebpβ转录轴调控嗜酸性粒细胞谱系决定和分化，并证明斑马鱼Cebp1是人C/EBPε的功能直系同源物 | 主要基于斑马鱼模型，结论向哺乳动物和人类的推广需进一步验证 | 解析嗜酸性粒细胞的发育模式、分布及转录调控机制 | 斑马鱼嗜酸性粒细胞谱系细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 345 | 2026-05-28 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-01-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
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研究论文 | 本研究结合高质量全基因组比对和计算结构建模，分析了果蝇中新生基因的起源、进化及蛋白质结构变化，鉴定出555个新生基因候选。 | 首次系统性结合全基因组比对与计算结构建模，揭示果蝇亚科特异性新生基因的起源与蛋白质结构演化，并发现早期精原细胞在新生基因起源中的潜在重要角色 | 可能受限于基因组比对质量和结构预测准确性，部分候选基因的结构变化未充分捕捉 | 研究新生基因的起源、进化及蛋白质结构变化 | 果蝇（D. melanogaster）中果蝇亚科特异性新生基因 | 计算生物学, 基因组学 | NA | 全基因组比对, 计算结构建模, 祖先序列重建, 单细胞RNA-seq | 计算结构模型 | 基因组序列, 蛋白质结构数据, 单细胞转录组数据 | 果蝇属多个物种的基因组比对数据及果蝇睾丸单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2026-05-28 |
Trajectory inference across multiple conditions with condiments
2024-01-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44823-0
PMID:38280860
|
研究论文 | 提出condiments方法，用于跨多个条件的单细胞RNA测序数据轨迹推断与比较 | 首次提出一种统一框架，整合多条件下细胞轨迹的推断、比较及基因表达差异分析，支持大规模发育进程变化及细微基因行为改变的检测 | NA | 开发一种跨多个生物条件（如野生型与基因敲除）进行单细胞RNA测序轨迹推断与比较的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹，特别是干细胞分化过程中的细胞状态连续体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2026-05-28 |
A potential defensive role of TIM-3 on T lymphocytes in the inflammatory involvement of diabetic kidney disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1365226
PMID:38812511
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研究论文 | 探讨T淋巴细胞上TIM-3分子在糖尿病肾病炎症发展中的潜在保护作用 | 首次发现外周血CD3+TIM-3+ T细胞比例与糖尿病肾病严重间质单核细胞浸润呈显著负相关，提示TIM-3可能具有保护性免疫调节功能 | 未明确TIM-3保护作用的具体分子机制，且研究仅基于糖尿病患者和动物模型数据，缺乏干预实验验证 | 阐明TIM-3在T淋巴细胞上对糖尿病肾病炎症进展的调控作用及其作为生物标志物的潜力 | 糖尿病肾病患者及糖尿病肾病小鼠模型 | 免疫学 | 糖尿病肾病 | 流式细胞术、免疫荧光染色、单细胞测序 | NA | 外周血样本、肾组织样本、单细胞测序数据 | 360例成人糖尿病肾病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 348 | 2026-05-28 |
Single-cell RNA-seq reveals T cell exhaustion and immune response landscape in osteosarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1362970
PMID:38629071
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤中T细胞耗竭和免疫反应景观 | 首次系统性地利用单细胞RNA-seq数据分析骨肉瘤微环境中CD8+ T细胞的耗竭情况，并基于三个耗竭相关基因（RAD23A, SAC3D1, PSIP1）构建预后模型，该模型在多个数据集中验证了其预测骨肉瘤预后的能力 | 研究主要依赖公共数据库数据，可能受限于数据质量和样本代表性，且T细胞耗竭模型需在更大规模前瞻性队列中进一步验证 | 探究骨肉瘤中T细胞耗竭与免疫抑制及肿瘤进展的关系，并构建预后模型 | 骨肉瘤患者肿瘤微环境中的CD8+ T细胞及其耗竭相关基因 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GEO数据库中的骨肉瘤单细胞RNA-seq数据，以及TARGETs和Meta队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 来自GEO数据库的单细胞RNA-seq数据 |
| 349 | 2026-05-28 |
Cell-Specific Targeting of the Endothelium in the Cardiorenal Syndrome
2024, Cardiorenal medicine
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000537764
PMID:38342088
|
综述 | 本文探讨了心肾综合征中血管内皮的细胞特异性靶向策略，包括基于基因、细胞和纳米技术的新型疗法，以及空间转录组学等技术在靶向治疗中的应用 | 提出通过细胞特异性内皮靶向的病毒载体进行基因治疗，可避免脱靶效应并改善治疗耐药性 | 未提及具体实验数据或临床验证，缺乏对靶向技术实际应用中的安全性及长期效果的深入讨论 | 阐述心肾综合征中内皮细胞作为治疗靶点的潜力，并介绍新兴的靶向治疗方法 | 血管内皮细胞及心肾疾病模型 | 机器学习 | 心血管疾病, 肾脏疾病 | 测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 350 | 2026-05-28 |
Coupled scRNA-seq and Bulk-seq reveal the role of HMMR in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363834
PMID:38633247
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序揭示HMMR在肝细胞癌中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序全面分析HMMR在肝细胞癌中的诊断、预后和治疗价值 | 未提及在动物模型或临床样本中验证HMMR的功能 | 探究HMMR在肝细胞癌中的作用及其作为分子标志物的潜力 | 肝细胞癌患者组织样本及细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 多个队列研究及组织微阵列中的肝细胞癌样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 351 | 2026-05-27 |
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629499
PMID:39763713
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研究论文 | 本研究通过细胞谱系追踪、靶向细胞消融和单细胞RNA测序，揭示了肺成纤维细胞在烟曲霉感染中的激活及其通过免疫调节和组织重塑增强宿主防御的作用 | 首次发现肺成纤维细胞在烟曲霉感染中的保护性角色，证明成纤维细胞通过免疫调节和细胞外基质分泌参与宿主防御，而非仅仅作为组织损伤的被动响应者 | 未明确说明研究局限性 | 探索肺成纤维细胞在烟曲霉感染引起的肺损伤中的功能响应及其对宿主防御的重要性 | 肺成纤维细胞及烟曲霉感染的小鼠模型 | 数字病理学 | 侵袭性曲霉病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 免疫正常和免疫抑制小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3′测序 |
| 352 | 2026-05-27 |
The opposite aging effect to single cell transcriptome profile among cell subsets
2024-11, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-024-10138-2
PMID:39261411
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研究论文 | 该研究利用Tabula Muris Senis数据集，揭示了细胞亚群间对衰老效应的相反转录组变化 | 首次系统性地报告了不同细胞亚群之间衰老效应的相反模式，即衰老在一个细胞亚群中上调基因表达，在另一个亚群中下调表达 | 信息不足，无法提供 | 探究不同细胞亚群中衰老对基因表达的相反效应 | 小鼠的多个细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明，但使用了Tabula Muris Senis公共数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 353 | 2026-05-27 |
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-08-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50880-2
PMID:39128904
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研究论文 | 一项针对未治疗淋巴浆细胞淋巴瘤患者的个性化新抗原DNA疫苗一期临床试验，评估其安全性和免疫反应 | 首次在人体中使用个性化新抗原DNA疫苗治疗无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者，并通过单细胞转录组学揭示了肿瘤B细胞减少和耐药机制 | 样本量小（9名患者），且为非随机化试验，未来需联合疫苗与靶向浆细胞亚群或阻断IGF-1信号的策略 | 评估个性化新抗原DNA疫苗在未治疗淋巴浆细胞淋巴瘤患者中的安全性和免疫治疗效果 | 9名无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴浆细胞淋巴瘤 | DNA疫苗，单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名未治疗的无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3’测序 |
| 354 | 2026-05-27 |
Hydrogel crosslinking modulates macrophages, fibroblasts, and their communication, during wound healing
2024-08-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50072-y
PMID:39122702
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研究论文 | 本研究探讨明胶基水凝胶的交联程度如何影响伤口愈合过程中巨噬细胞和成纤维细胞的行为及其相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示不同交联程度水凝胶对巨噬细胞亚群形成及与成纤维细胞RANKL信号通路的差异性调控机制 | 未明确说明样本量及临床转化可行性 | 阐明水凝胶物理特性通过调控免疫-基质细胞通讯优化伤口愈合的机制 | 雌性小鼠的伤口愈合组织 | 机器学习 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 明胶基水凝胶交联程度调控巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的单细胞转录组分析 |
| 355 | 2026-05-27 |
Deubiquitylase ubiquitin-specific protease 7 plays a crucial role in the lineage differentiation of preimplantation blastocysts†
2024-07-12, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae034
PMID:38438135
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研究论文 | 本研究探讨了去泛素化酶USP7在植入前胚胎发育中的关键作用，尤其对谱系分化的调控机制 | 首次揭示USP7通过稳定YAP蛋白调控桑椹胚向囊胚转换，并影响表观遗传修饰和关键基因表达 | 未详细说明动物实验的伦理审批及样本量统计效力 | 阐明USP7在植入前胚胎谱系分化和表观遗传重编程中的功能及机制 | 小鼠植入前胚胎 | 机器学习 | NA | RNA干扰，单细胞RNA测序，逆转录定量聚合酶链反应，蛋白质印迹，免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据，DNA甲基化数据，蛋白质数据 | 小鼠胚胎样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序平台（未说明具体型号） |
| 356 | 2026-05-27 |
Spatial transcriptomics reveals influence of microenvironment on intrinsic fates in melanoma therapy resistance
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601416
PMID:39005406
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示黑色素瘤治疗抵抗中微环境对内在命运的影响 | 首次通过空间转录组学揭示黑色素瘤抵抗程序与肿瘤微环境免疫特征的空间共定位关系，证明组织特征（如坏死区域）可影响抵抗命运的选择 | NA | 探究黑色素瘤治疗抵抗中内在细胞状态与肿瘤微环境的相互作用机制 | 黑色素瘤细胞系、患者样本、异种移植模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 共识非负矩阵分解 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 多种细胞系、患者肿瘤样本、异种移植模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2026-05-27 |
Interstitial macrophages are a focus of viral takeover and inflammation in COVID-19 initiation in human lung
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20232192
PMID:38597954
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研究论文 | 利用健康人肺组织感染SARS-CoV-2并进行单细胞RNA测序，揭示间质巨噬细胞是病毒感染和炎症的关键靶点 | 首次发现活化的间质巨噬细胞是SARS-CoV-2病毒大量复制和转录组劫持的主要场所，并鉴定病毒进入该细胞的受体为DC-SIGN/CD209 | 研究基于体外感染模型，可能无法完全反映体内早期感染的复杂微环境 | 阐明SARS-CoV-2在人类肺组织中的细胞嗜性和转录组效应 | 健康人类肺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 健康人类肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 358 | 2026-05-27 |
Targeting Monocyte Derived CCL17 Attenuates Murine Crescentic Glomerulonephritis by Affecting Renal CCR4+ Regulatory T-Cell Recruitment
2024, American journal of nephrology
IF:4.3Q1
DOI:10.1159/000534151
PMID:37742620
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现单核细胞来源的CCL17在肾小球肾炎中影响CCR4+调节性T细胞的招募，靶向CCL17可减轻小鼠新月体性肾小球肾炎 | 首次揭示了CCL17-CCR4轴在免疫介导的新月体性肾小球肾炎中对肾内调节性T细胞招募的功能重要性，并验证了靶向CCL17的治疗潜力 | 研究仅基于小鼠模型，结果向人类疾病转化需要进一步验证 | 探索CCR4及其配体CCL17和CCL22在免疫介导的新月体性肾小球肾炎中白细胞招募的功能意义 | 人类和小鼠肾小球肾炎肾脏中的白细胞，特别是CD4+ T细胞亚群和调节性T细胞 | machine learning | 肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和鼠源性肾炎肾脏分离的白细胞样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 359 | 2026-05-25 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析，揭示IL-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的驱动作用 | 首次在人类ACM样本中采用单核RNA测序和空间转录组学联合分析，鉴定出疾病相关的炎症-纤维化空间微环境，并证明抗IL-1β中和抗体在ACM小鼠模型中可减轻纤维化、保护心脏功能 | 主要基于小鼠模型验证治疗策略，人类样本数量有限且未进行干预性临床试验验证 | 阐明IL-1β在ACM发病机制中的作用并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类ACM心肌样本和Dsg2突变小鼠模型 | 数字病理学 | 致心律失常性心肌病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 人类ACM患者与对照供体的心肌样本，以及Dsg2基因纯合突变小鼠 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Genomics单核RNA测序和Visium空间转录组学平台 |
| 360 | 2026-05-25 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
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研究论文 | 通过局部控制释放IL-4减少牙周炎小鼠模型中的炎症性骨丢失 | 首次证明使用可控药物递送策略局部释放IL-4可逆转炎症性骨丢失并促进骨再生，并利用单细胞RNA测序揭示其通过将巨噬细胞转向修复表型的作用机制 | 未提及具体局限性，但可能包括小鼠模型与人类的差异、递送系统的长期效果及安全性需进一步验证 | 评估使用可控药物递送策略靶向口腔巨噬细胞治疗慢性炎症的可行性 | 牙周炎小鼠模型中的巨噬细胞和牙周组织 | 数字化病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牙周炎小鼠模型，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |