单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 3401 - 3420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3401 | 2024-12-25 |
Uncovering the molecular networks of ferroptosis in the pathogenesis of type 2 diabetes and its complications: a multi-omics investigation
2024-Dec-23, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-01045-w
PMID:39716081
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示铁死亡在2型糖尿病及其并发症发病机制中的分子网络 | 首次通过多组学分析揭示铁死亡相关基因在2型糖尿病及其并发症中的作用，并验证了影像基因组学在非侵入性诊断中的潜力 | 研究依赖于现有数据集，可能存在样本偏倚和数据异质性 | 揭示铁死亡在2型糖尿病及其并发症中的作用，并探索非侵入性诊断的可能性 | 2型糖尿病及其并发症，包括糖尿病肾病、糖尿病心肌病和非酒精性脂肪肝病 | NA | 糖尿病 | 多组学分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质丰度数据、影像基因组数据 | 包括发现队列、验证队列和影像基因组队列的多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3402 | 2024-12-25 |
Single-cell transcriptome analysis reveals reciprocal epithelial and endothelial cell evolution in ovarian cancer
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111417
PMID:39717089
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了卵巢癌中上皮细胞和内皮细胞的相互进化关系 | 首次揭示了输卵管上皮细胞向卵巢癌上皮细胞的潜在发展趋势，并发现了与肿瘤血管生成相关的内皮细胞亚型 | 研究仅限于卵巢癌中的上皮细胞和内皮细胞，未涉及其他细胞类型 | 探讨卵巢癌发展过程中上皮细胞和内皮细胞的相互作用 | 卵巢癌中的上皮细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 87,847个上皮细胞和11,696个内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3403 | 2024-12-25 |
Current transcriptome database and biomarker discovery for immunotherapy by immune checkpoint blockade
2024-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.09.627506
PMID:39713380
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综述 | 本文综述了免疫检查点阻断（ICB）疗法的当前转录组数据库和生物标志物发现，重点讨论了肿瘤基因组、肿瘤微环境和肿瘤-宿主相互作用的生物标志物，并介绍了IOhub平台用于基准分析当前生物标志物 | 介绍了IOhub平台，该平台整合了36个bulk和10个单细胞转录组数据集，用于生物标志物的基准分析 | NA | 探讨免疫检查点阻断疗法的生物标志物发现和当前转录组数据库 | 肿瘤基因组、肿瘤微环境和肿瘤-宿主相互作用的生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 36个bulk和10个单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3404 | 2024-12-25 |
Rates of evolution differ between cell types identified by single-cell RNAseq in threespine stickleback
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.06.627160
PMID:39713298
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研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序（scRNAseq）和进化基因组学，研究了不同细胞类型在进化过程中的基因差异性 | 首次将单细胞RNA测序技术与进化基因组数据结合，揭示了免疫细胞类型的基因进化速度特别快 | 研究仅限于三刺鱼，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨不同细胞类型在进化过程中的基因差异性 | 三刺鱼的不同细胞类型及其特征基因的进化速度 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因数据 | 多个三刺鱼种群和物种的基因数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3405 | 2024-12-25 |
Inference and analysis of cell-cell communication of non-myeloid circulating cells in late sepsis based on single-cell RNA-seq
2024-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12109
PMID:39578684
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症中非髓系循环细胞间的细胞间通讯 | 揭示了脓毒症患者中细胞间相互作用的数量和强度增加，并发现了几条显著改变的信号通路，特别是传统树突状细胞和浆细胞样树突状细胞中的通路 | NA | 深入理解晚期脓毒症中免疫功能障碍的潜在机制 | 晚期脓毒症中淋巴系来源的白细胞间的细胞间通讯 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3406 | 2024-12-25 |
Identification of CCR7 and CBX6 as key biomarkers in abdominal aortic aneurysm: Insights from multi-omics data and machine learning analysis
2024-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12106
PMID:39602349
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研究论文 | 本研究利用多组学数据和机器学习技术，识别了腹主动脉瘤中的关键生物标志物CCR7和CBX6，并揭示了其免疫机制 | 首次通过多组学数据和机器学习技术识别了腹主动脉瘤中的关键生物标志物CCR7和CBX6，并揭示了它们与免疫细胞浸润的相关性 | 研究主要基于数据分析，缺乏实验验证 | 识别腹主动脉瘤的关键生物标志物并揭示其免疫机制 | 腹主动脉瘤中的关键生物标志物和免疫机制 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3407 | 2024-12-25 |
Cell- and tissue-specific glycosylation pathways informed by single-cell transcriptomics
2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae169
PMID:39703423
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了人类组织和细胞类型的糖基化相关基因表达，揭示了细胞和组织特异性糖基化途径 | 首次在糖科学领域应用单细胞转录组学，揭示了糖基化基因和途径的表达层次结构，并展示了细胞和组织特异性糖基化模式 | 研究依赖于Tabula Sapiens数据集，可能无法涵盖所有人类细胞类型和组织 | 探讨单细胞水平上糖基化相关基因的表达模式及其在不同组织和细胞类型中的特异性 | 人类组织和细胞类型的糖基化相关基因表达 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | Tabula Sapiens数据集中的人类组织和细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 3408 | 2024-12-25 |
Deep clustering representation of spatially resolved transcriptomics data using multi-view variational graph auto-encoders with consensus clustering
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.041
PMID:39717398
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研究论文 | 提出了一种名为STMVGAE的新工具，结合多视图变分图自编码器和共识聚类框架，用于空间转录组数据的深度聚类表示 | STMVGAE通过结合多视图变分图自编码器和共识聚类框架，有效整合了基因表达数据、组织学图像和空间坐标数据，显著提高了聚类精度和稳定性 | NA | 开发一种新的工具，用于准确识别空间转录组数据中的空间域，以支持下游分析 | 空间转录组数据中的空间域识别 | 数字病理学 | NA | 变分图自编码器（VGAE） | 卷积神经网络（CNN） | 图像和基因表达数据 | 五个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3409 | 2024-12-25 |
CPARI: a novel approach combining cell partitioning with absolute and relative imputation to address dropout in single-cell RNA-seq data
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae668
PMID:39715686
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CPARI的新方法，结合细胞分区与绝对和相对插值技术来解决单细胞RNA测序数据中的dropout问题 | CPARI通过结合细胞分区与绝对和相对插值方法，能够有效区分真实的生物零值和dropout零值，并提高插值的准确性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的dropout问题 | 单细胞RNA测序数据中的dropout零值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3410 | 2024-12-25 |
Unlocking the Complexity: Exploration of Acute Lymphoblastic Leukemia at the Single Cell Level
2024-11, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-024-00739-5
PMID:39190087
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在急性淋巴细胞白血病（ALL）研究中的应用，探讨了其在揭示ALL分子复杂性、异质性及其与微环境相互作用方面的优势和局限性 | 本文介绍了单细胞测序技术的最新进展，从分析数百个细胞发展到同时分析数千个细胞，使得研究肿瘤异质性成为可能 | 本文主要讨论了单细胞测序技术在ALL研究中的局限性，包括技术复杂性和数据分析的挑战 | 探讨单细胞测序技术在急性淋巴细胞白血病（ALL）研究中的应用 | 急性淋巴细胞白血病（ALL）的分子复杂性、异质性及其与微环境的相互作用 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞测序 | NA | DNA、RNA、表观遗传修饰、细胞内和细胞表面蛋白 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3411 | 2024-12-25 |
Single-cell RNA Sequencing Identifies a Novel Subtype of Microglia with High Cd74 Expression that Facilitates White Matter Inflammation During Chronic Cerebral Hypoperfusion
2024-Oct, Neurochemical research
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11064-024-04206-9
PMID:39012534
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别出一种新型的小胶质细胞亚型，该亚型具有高Cd74表达，并促进慢性脑低灌注期间的脑白质炎症 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术发现了一种新型的小胶质细胞亚型（CIAM），并揭示了Cd74在其中的核心作用 | 本研究的局限性在于仅使用了大鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 研究微胶质细胞在血管性痴呆中的新型亚型及其在神经炎症中的作用 | 微胶质细胞及其在慢性脑低灌注模型中的变化 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了慢性脑低灌注大鼠模型，并通过磁激活细胞分选技术分离微胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3412 | 2024-12-25 |
Dendritic cell effector mechanisms and tumor immune microenvironment infiltration define TLR8 modulation and PD-1 blockade
2024-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.03.610636
PMID:39282367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重染色技术，探讨了TLR8激动剂与PD-1阻断剂联合治疗在头颈部鳞状细胞癌患者中的作用机制 | 首次揭示了TLR8激动剂与PD-1阻断剂联合治疗在人类中的作用机制，并展示了其在提高树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞密度方面的显著效果 | 研究样本量较小，仅涉及三名患者，且为预手术临床试验，结果的广泛适用性有待进一步验证 | 探讨TLR8激动剂与PD-1阻断剂联合治疗在头颈部鳞状细胞癌患者中的作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三名头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 3413 | 2024-12-25 |
Cell and tissue-specific glycosylation pathways informed by single-cell transcriptomics
2024-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559616
PMID:38260527
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了人类组织和细胞类型中的糖基化相关基因表达，揭示了细胞和组织特异性糖基化途径 | 首次在糖科学领域应用单细胞转录组学，揭示了糖基化基因和糖基化途径表达的层次结构，并展示了细胞和组织特异性糖基化模式 | 研究依赖于Tabula Sapiens数据集，可能无法涵盖所有人类组织和细胞类型 | 探讨单细胞水平上糖基化相关基因的表达模式及其在不同组织和细胞类型中的特异性 | 人类组织和细胞类型中的糖基化相关基因和糖基化途径 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | Tabula Sapiens数据集中的人类组织和细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 3414 | 2024-12-25 |
Exploring the impact of deubiquitination on melanoma prognosis through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1509049
PMID:39712483
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索去泛素化对黑色素瘤预后的影响，并构建了一个新的预后模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析去泛素化相关基因在黑色素瘤中的作用，并构建了一个有效的预后模型 | 需要进一步的临床验证以确认模型的适用性 | 研究去泛素化在黑色素瘤中的作用，并开发新的预后模型 | 黑色素瘤细胞和患者的预后 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林和岭回归 | RNA测序数据 | 使用了来自TCGA队列和外部验证队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3415 | 2024-12-25 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing to Explore the Molecular Mechanisms Related to Skin Photoaging
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496328
PMID:39713718
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组测序探索皮肤光老化的分子机制 | 发现了三个关键基因（Atp2b1、Plekho2和Tspan13）在光老化过程中的重要作用，并验证了这些基因在免疫细胞浸润和代谢途径中的关键作用 | NA | 揭示皮肤光老化的分子机制 | 光老化患者的基因表达谱和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞测序、转录组测序、RT-qPCR、免疫荧光标记、Western blotting | LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的光老化患者基因表达数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3416 | 2024-12-25 |
Construction and clinical application of a risk model based on N6-methyladenosine regulators for colorectal cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18719
PMID:39717046
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研究论文 | 本研究基于N6-甲基腺苷（m6A）调控因子构建了一个结直肠癌（CRC）的风险模型，并探讨了其在临床中的应用 | 首次基于m6A调控因子构建了CRC的风险评分模型，并验证了其在区分高风险和低风险患者中的有效性 | 研究主要基于现有数据集，缺乏大规模的临床验证 | 开发一个基于m6A调控因子的风险模型，用于预测结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者的m6A调控因子表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | RNA序列数据 | AC-ICAM和GSE33113数据集中的结直肠癌样本，以及GSE146771单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3417 | 2024-12-25 |
Neuron stress-related genes serve as new biomarkers in hypothalamic tissue following high fat diet
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1443880
PMID:39717104
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研究论文 | 研究探讨了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化及其作为新生物标志物的潜力 | 首次揭示了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化，并发现Bmi1基因作为关键基因反映肥胖的病理生理机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床转化和人类应用仍需进一步验证 | 探讨高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中基因表达变化，寻找新的生物标志物 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中的神经应激相关基因 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞测序 RNA-seq 蛋白质印迹 免疫荧光染色 | LASSO模型 | 基因表达数据 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 3418 | 2024-12-25 |
Vascular Smooth Muscle Cells Transdifferentiate into Chondrocyte-Like Cells and Facilitate Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0555
PMID:39717465
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研究论文 | 本文研究了血管平滑肌细胞向类软骨细胞的转分化及其在半月板纤维软骨再生中的作用 | 首次发现血管平滑肌细胞可以转分化为纤维软骨细胞，并参与自发性的半月板再生；低强度脉冲超声刺激可以增强这种转分化过程 | 研究主要在动物模型中进行，尚未在人体中验证其有效性和安全性 | 探索有效的半月板纤维软骨再生策略 | 血管平滑肌细胞、半月板纤维软骨、低强度脉冲超声刺激 | NA | NA | 低强度脉冲超声（LIPUS）、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了平滑肌细胞系追踪转基因小鼠和比格犬的半月板缺损模型 | NA | NA | NA | NA |
| 3419 | 2024-12-25 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Reveal Molecular Mechanisms and Causal Relationships of Immune-Related Biomarkers in Periodontitis
2024, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9983323
PMID:39717623
|
研究论文 | 本研究利用机器学习和孟德尔随机化方法，揭示了牙周炎中免疫相关生物标志物的分子机制和因果关系 | 本研究整合了机器学习、孟德尔随机化和单细胞测序，提供了一种新颖的方法来增强对牙周炎中免疫动态和基因相互作用的理解 | 研究受限于数据集的人口统计和样本量，可能影响结果的普遍性 | 探讨牙周炎的分子机制并识别关键的免疫相关生物标志物 | 牙周炎中的免疫相关生物标志物及其分子机制 | 机器学习 | 牙周疾病 | 机器学习算法、孟德尔随机化、单细胞测序 | XGBoost | 基因表达数据 | 682个差异表达基因，19个核心基因 | NA | NA | NA | NA |
| 3420 | 2024-12-25 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals That C5AR1 in Follicle Monocyte Cells Could Predict the Development of POI
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S490996
PMID:39717665
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了卵泡单核细胞中的C5AR1基因在预测早发性卵巢功能不全（POI）发展中的潜在作用 | 首次揭示了C5AR1基因在卵泡单核细胞中的高表达，并发现其在预测POI发展中的潜在作用 | 样本量较小，仅包括9名接受IVF或ICSI治疗的女性 | 探讨早发性卵巢功能不全（POI）患者的卵泡微环境，并识别潜在的治疗靶点 | 早发性卵巢功能不全（POI）患者的卵泡微环境 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9名接受IVF或ICSI治疗的女性 | NA | NA | NA | NA |