单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202401-202412] [清除筛选条件]
当前共找到 7466 篇文献,本页显示第 3381 - 3400 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3381 2024-12-28
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to construct a neutrophil prognostic model for predicting prognosis and immune response in oral squamous cell carcinoma
2024-Dec-26, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建了一个用于预测口腔鳞状细胞癌预后和免疫反应的中性粒细胞预后模型 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建中性粒细胞预后模型,并揭示其在口腔鳞状细胞癌中的关键作用 研究依赖于现有数据集,未进行实验验证,可能影响模型的普适性 构建中性粒细胞预后模型,预测口腔鳞状细胞癌的预后和免疫反应 口腔鳞状细胞癌患者 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq),加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) Lasso-Cox回归模型 RNA测序数据 未明确提及具体样本数量 NA NA NA NA
3382 2024-12-28
SPP1+ macrophages promote head and neck squamous cell carcinoma progression by secreting TNF-α and IL-1β
2024-Dec-26, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了SPP1+巨噬细胞在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)恶性进展中的作用及其机制 首次揭示了SPP1+巨噬细胞通过分泌TNF-α和IL-1β促进HNSCC进展的机制,并验证了其作为抗肿瘤治疗潜在靶点的可能性 样本量较小,仅涉及5名HNSCC患者,且未探讨SPP1+巨噬细胞在其他类型癌症中的作用 识别和验证SPP1+巨噬细胞在HNSCC恶性进展中的角色和功能 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者及其肿瘤组织 肿瘤免疫学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR、多重免疫组化染色、多重免疫荧光染色、Luminex液体悬浮芯片检测 NA RNA测序数据、免疫组化数据、免疫荧光数据、细胞因子检测数据 5名HNSCC患者的配对肿瘤和正常组织 NA NA NA NA
3383 2024-12-28
Comprehensive analysis identifies a lactylation-related signature for predicting prognosis and guiding therapies in colon adenocarcinoma
2024-Dec-24, Gene IF:2.6Q2
研究论文 本研究旨在识别与乳酸化相关的基因特征,用于预测结肠腺癌的预后并指导治疗 首次提出与乳酸化相关的3基因特征(SUSD5, FABP4, CALB2),并验证其在多个独立队列中的预测性能 研究主要依赖于公共数据库的多组学数据,缺乏实验验证的广泛性 解决结肠腺癌预后预测中的肿瘤异质性和治疗反应差异问题 结肠腺癌(COAD)患者 生物信息学 结肠癌 LASSO回归分析、Cox风险模型、功能富集分析、免疫浸润分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达谱、临床数据、乳酸化相关基因(LRGs) 四个独立COAD队列(GSE39582, GSE71187, GSE75500, GSE17536) NA NA NA NA
3384 2024-12-28
Driver mutation landscape of acute myeloid leukemia provides insights for neoantigen-based immunotherapy
2024-Dec-24, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过DNA和RNA测序,全面分析了急性髓性白血病(AML)的驱动突变及其对患者预后和免疫微环境的影响,为基于新抗原的免疫治疗提供了新的见解 首次全面描绘了AML的新抗原景观,开发了两种表位免疫原性模型,并通过实验验证了30个新抗原的免疫原性 研究主要基于体外实验,需要进一步的体内实验验证 探索AML驱动突变产生的新抗原及其对免疫治疗的影响 304名AML患者及其匹配的DNA和RNA测序数据,以及约2,500例AML病例的整合数据 数字病理学 急性髓性白血病 DNA测序, RNA测序, 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术 表位免疫原性模型 DNA, RNA, 单细胞RNA测序数据 304名AML患者及约2,500例AML病例 NA NA NA NA
3385 2024-12-28
Decoding Kidney Pathophysiology: Omics-Driven Approaches in Precision Medicine
2024-Dec-19, Journal of personalized medicine IF:3.0Q1
研究论文 本文探讨了利用多组学技术在精准医学中解码肾脏病理生理学的方法 结合基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和表观基因组学等多组学技术,识别疾病亚型、分子生物标志物和治疗靶点,推动个性化治疗 数据整合问题、高成本和伦理困境等挑战仍然存在 通过精准医学改善肾脏疾病的诊断、风险评估和个性化治疗 慢性肾脏病(CKD) 精准医学 慢性肾脏病 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学、单细胞转录组学、空间转录组学 机器学习和因果推理模型 多组学数据 NA NA NA NA NA
3386 2024-12-28
MitoSort: Robust Demultiplexing of Pooled Single-cell Genomic Data Using Endogenous Mitochondrial Variants
2024-Dec-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为MitoSort的工具,利用线粒体种系变异对单细胞基因组数据进行样本去复用和交叉基因型双联体检测 MitoSort使用线粒体种系变异作为内源性条形码,解决了现有工具在单细胞测序方法中覆盖核基因组区域不足的局限性 MitoSort的应用依赖于线粒体变异的可靠检测,可能在某些情况下受到限制 开发一种高效且准确的方法,用于单细胞基因组数据中的样本去复用和双联体检测 单细胞基因组数据,特别是单细胞ATAC-seq数据 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq) NA 单细胞基因组数据 八个供体的B细胞 NA NA NA NA
3387 2024-12-28
Neonatal Brain Injury Triggers Niche-Specific Changes to Cellular Biogeography
2024-Dec, eNeuro IF:2.7Q3
研究论文 本文通过高分辨率成像空间转录组学技术,构建了新生小鼠脑损伤后的全脑再生反应图谱,揭示了慢性缺氧对早期神经发育的影响 开发了一种新的方法来推断细胞类型空间邻近性的条件相关差异,从而识别细胞结构的特定区域变化 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 探讨新生儿脑损伤后的分子机制,特别是慢性缺氧对神经发育的影响 新生小鼠的脑组织 数字病理学 新生儿脑损伤 高分辨率成像空间转录组学 NA 空间转录组数据 超过800,000个细胞 NA NA NA NA
3388 2024-12-28
Comprehensive Analysis of Bulk RNA-Seq and Single-Cell RNA-Seq Data Unveils Sevoflurane-Induced Neurotoxicity Through SLC7A11-Associated Ferroptosis
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过分析bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据,揭示了七氟醚通过SLC7A11相关的铁死亡诱导神经毒性的机制 首次发现七氟醚通过SLC7A11调控星形胶质细胞铁死亡,提供了七氟醚相关神经毒性通路的新见解 研究主要基于小鼠模型和U251星形胶质瘤细胞,尚未在人类样本中验证 探讨七氟醚对认知功能和神经发育的潜在影响,特别是对易感人群如婴儿和老年人的影响 七氟醚暴露的小鼠和U251星形胶质瘤细胞 神经科学 神经毒性 bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq (scRNA-seq) NA RNA-Seq数据 七氟醚暴露的小鼠和U251星形胶质瘤细胞 NA NA NA NA
3389 2024-12-28
CD74+ fibroblasts proliferate upon mechanical stretching to promote angiogenesis in keloids
2024-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析,揭示了CD74+成纤维细胞在机械拉伸诱导的瘢痕疙瘩进展中的关键作用 首次识别出CD74+成纤维细胞作为机械拉伸诱导瘢痕疙瘩进展的关键细胞群,并阐明了其通过PIEZO1介导的钙内流及下游ERK和AKT信号通路促进血管生成和增殖的机制 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据,缺乏在体实验验证 探究机械拉伸诱导瘢痕疙瘩进展的细胞机制 瘢痕疙瘩组织中的CD74+成纤维细胞 细胞生物学 瘢痕疙瘩 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA NA NA NA
3390 2024-12-28
Identification of a seven-gene prognostic model for renal cell carcinoma associated with CD8+T lymphocyte cell
2024-Oct-04, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过分析肾细胞癌(RCC)中CD8+ T淋巴细胞相关的基因特征,构建了一个七基因预后模型 首次构建了一个与CD8+ T淋巴细胞相关的七基因预后模型,用于肾细胞癌患者的风险分层 研究数据主要来源于The Cancer Genome Atlas,可能缺乏多样性和广泛性 构建一个与CD8+ T淋巴细胞相关的肾细胞癌预后模型 肾细胞癌患者 生物信息学 肾细胞癌 加权基因共表达网络分析、基因本体富集分析、京都基因与基因组百科全书信号通路分析、单细胞测序 LASSO回归、单变量和多变量Cox回归 基因表达数据 来自The Cancer Genome Atlas的肾细胞癌患者数据 NA NA NA NA
3391 2024-12-28
A New Graph Autoencoder-Based Consensus-Guided Model for scRNA-seq Cell Type Detection
2024-02, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1
研究论文 本文提出了一种基于图自编码器的共识引导模型(scGAC),用于单细胞RNA测序(scRNA-seq)中的细胞类型检测 提出了一种新的基于图自编码器(GAE)的共识引导模型(scGAC),通过迭代学习相似性矩阵来整合最终的一致性相似性矩阵,从而提高细胞类型识别的准确性 未提及具体的数据集或实验结果的局限性 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 单细胞RNA测序数据 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 图自编码器(GAE) 单细胞RNA测序数据 NA NA NA NA NA
3392 2024-12-28
An update review of the application of single-cell RNA sequencing in pregnancy-related diseases
2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在妊娠相关疾病中的应用 提供了scRNA-seq技术在人类胎盘研究中的最新进展,特别是在正常妊娠和妊娠相关疾病中的应用 讨论了scRNA-seq技术在生殖领域中的局限性和未来展望 更新产科医生对scRNA-seq技术在妊娠并发症中的理解,以帮助诊断和治疗这些疾病 人类胎盘,特别是在正常妊娠和妊娠相关疾病中的细胞 生物信息学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 NA NA NA NA NA
3393 2024-12-28
Exposure to Nanoplastics Cause Caudal Vein Plexus Damage and Hematopoietic Dysfunction by Oxidative Stress Response in Zebrafish (Danio rerio)
2024, International journal of nanomedicine IF:6.6Q1
研究论文 本研究探讨了纳米塑料对斑马鱼尾静脉丛发育和造血功能的负面影响及其机制 首次揭示了纳米塑料通过氧化应激反应导致斑马鱼尾静脉丛损伤和造血功能障碍的分子机制 研究仅基于斑马鱼胚胎模型,未涉及其他生物或人类细胞模型 探究纳米塑料对斑马鱼早期造血器官发育的影响 斑马鱼胚胎 环境毒理学 NA 荧光显微镜、RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR NA 基因表达数据、显微镜图像 斑马鱼胚胎 NA NA NA NA
3394 2024-12-26
Single cell profiling of hematopoietic stem cell transplant recipients reveals TGF-β1 and IL-2 confer immunoregulatory functions to NK cells
2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了在造血干细胞移植受者中,TGF-β1和IL-2如何赋予NK细胞免疫调节功能 首次定义了在造血干细胞移植后,CD56NK细胞群体与急性移植物抗宿主病(GVHD)保护之间的关联,并阐明了IL-2和TGF-β1联合作用在促进NK细胞调节表型中的角色 诱导的调节性NK细胞表型不稳定,暴露于不同细胞因子后会失去分泌TGF-β1的能力 研究造血干细胞移植后NK细胞的免疫调节功能 造血干细胞移植受者的NK细胞 免疫学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA序列数据 造血干细胞移植受者的NK细胞样本 NA NA NA NA
3395 2024-12-26
Myeloperoxidase and Thyrotropin-Releasing Hormone Within Leukaemia Stem Cells Increased Chemosensitivity in Acute Myeloid Leukaemia
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究探讨了白血病干细胞(LSCs)中的髓过氧化物酶(MPO)和促甲状腺激素释放激素(TRH)在急性髓性白血病(AML)化疗敏感性中的作用 首次在LSCs中识别出MPO和TRH作为AML化疗敏感性的潜在生物标志物,并发现其与患者无复发生存率和总生存率的显著相关性 样本量较小(20名患者),且仅涉及接受'7+3'诱导治疗的患者,可能限制结果的普遍性 识别LSCs中能预测AML化疗敏感性的生物标志物 急性髓性白血病(AML)患者 生物医学研究 白血病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 20名新诊断的AML患者 NA NA NA NA
3396 2024-12-26
Single-Cell RNA-Seq Reveals Injuries in Aortic Dissection and Identifies PDGF Signalling Pathway as a Potential Therapeutic Target
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了主动脉夹层中的细胞异质性及相关损伤,并识别出PDGF信号通路作为潜在的治疗靶点 首次应用单细胞RNA测序技术全面解析主动脉夹层的细胞异质性,并发现PDGF信号通路在疾病中的关键作用 样本量较小,且未进行长期随访以验证治疗靶点的临床效果 揭示主动脉夹层的细胞异质性及分子机制,探索潜在治疗靶点 主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞 NA NA NA NA
3397 2024-12-26
Single-cell profiling uncovers synovial fibroblast subpopulations associated with chondrocyte injury in osteoarthritis
2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序分析揭示了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞损伤之间的相互作用和关联 首次通过单细胞测序技术详细分析了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞之间的相互作用,并识别了具有修复和保护作用的CILP+成纤维细胞以及可能加剧软骨损伤的POSTN+成纤维细胞 研究主要基于单细胞测序数据,缺乏体内实验验证,且样本量未明确说明 阐明骨关节炎中滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用和关联,以深化对骨关节炎发病机制的理解 骨关节炎患者的滑膜细胞和软骨细胞 单细胞测序 骨关节炎 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 NA NA NA NA NA
3398 2024-12-25
Interplay between Netrin-1 and Norrin controls arteriovenous zonation of blood-retina barrier integrity
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 研究探讨了Netrin-1和Norrin信号通路在控制视网膜屏障完整性中的相互作用 首次揭示了Netrin-1/Unc5b和Norrin/Lrp5信号通路在视网膜屏障中的区室化基因表达调控机制 研究主要基于小鼠模型,可能需要进一步验证在人类中的适用性 探讨Netrin-1和Norrin信号通路在视网膜屏障完整性中的作用 视网膜屏障的完整性和基因表达调控 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用出生后视网膜屏障功能性小鼠视网膜内皮细胞进行单细胞RNA测序,识别了超过100个视网膜屏障相关基因 NA NA NA NA
3399 2024-12-25
Pathway metrics accurately stratify T cells to their cells states
2024-Dec-24, BioData mining IF:4.0Q1
研究论文 本文介绍了一种名为PathSingle的Python工具,用于单细胞数据分析中的通路分析,能够准确分类T细胞的不同状态 PathSingle采用独特的基于图的算法,能够分类不同的细胞状态,如T细胞亚型 NA 开发一种工具,用于从单细胞转录组数据中揭示生物学上有意义的见解 T细胞及其亚型 生物信息学 NA 单细胞转录组分析 基于图的算法 基因表达数据 NA NA NA NA NA
3400 2024-12-25
Systematic pan-cancer analysis identifies ZBTB11 as a potential pan-cancer biomarker and immunotherapy target in multiple tumor types
2024-Dec-23, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本文系统分析了ZBTB11在多种肿瘤类型中的表达、预后价值、基因突变和DNA启动子甲基化,并探讨了其在肿瘤发生和免疫治疗中的潜在作用 首次系统性地分析了ZBTB11在多种肿瘤类型中的表达和预后价值,并构建了ZBTB11的竞争性lncRNA-miRNA网络,揭示了其在肿瘤生物学行为中的调控作用 研究主要基于数据库和在线工具的分析,缺乏实验验证 探讨ZBTB11在多种肿瘤类型中的生物学意义及其作为潜在生物标志物和免疫治疗靶点的可能性 ZBTB11在不同肿瘤类型中的表达、预后价值、基因突变、DNA甲基化和免疫细胞浸润 数字病理学 多种肿瘤类型 DNA甲基化测序、单细胞测序 NA 基因表达数据、突变数据、甲基化数据 多种肿瘤类型的样本 NA NA NA NA
回到顶部