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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-05-29 |
Spatial multi-omics in whole skeletal muscle reveals complex tissue architecture
2024-10-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06949-1
PMID:39369093
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研究论文 | 结合RNA断层扫描和质谱成像技术，揭示整个小鼠胫骨前肌的空间转录组、代谢组和脂质组组织，发现肌纤维类型比例的显著区域化分布 | 首次结合两种空间组学技术（RNA断层扫描和质谱成像）在全肌肉水平上解析三维空间组织，发现基因表达沿近端-远端轴的意外强烈区域化及代谢差异 | 仅针对小鼠胫骨前肌进行了分析，尚未验证在其他肌肉或物种中的普遍性 | 阐明整个骨骼肌组织的完整空间结构，揭示肌纤维类型比例、基因表达和代谢的沿轴区域化分布 | 小鼠胫骨前肌、趾长伸肌和比目鱼肌的整个肌肉组织 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 质谱成像 | NA | 图像, 文本 | 24只小鼠的胫骨前肌、趾长伸肌和比目鱼肌样本 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 空间脂质组学 | NA | RNA tomography（RNA断层扫描）和MSI（质谱成像） |
| 322 | 2026-05-29 |
STPDA: Leveraging spatial-temporal patterns for downstream analysis in spatial transcriptomic data
2024-10, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出STPDA框架，利用空间-时间模式分析空间转录组数据，实现基因表达空间动态的高分辨率解析 | 创新性结合ARMA和LSTM模型同时捕捉全局与局部时空动态，将空间-时间模式整合进下游分析流程，实现配体-受体相互作用识别和细胞类型分类等任务性能超越现有方法 | 未提及验证数据集多样性及计算资源需求等局限性 | 开发适用于空间转录组数据下游分析的时空模式计算框架 | 空间转录组数据中的基因表达时空模式及细胞类型、配体-受体相互作用 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | ARMA, LSTM | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 323 | 2026-05-29 |
Single-cell transcriptome sequencing revealed the metabolic changes and microenvironment changes of cardiomyocytes induced by diabetes
2024-10, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序分析糖尿病小鼠心肌细胞的代谢变化和微环境变化 | 通过单细胞转录组测序揭示糖尿病诱导的代谢重组及心肌细胞与心肌成纤维细胞、淋巴内皮细胞等微环境成分间配体-受体相互作用改变 | 仅基于一个公开数据集进行分析，缺乏实验验证；研究对象为小鼠模型，结论向人类转化需进一步验证 | 探究糖尿病对心肌细胞异质性及细胞间通讯特性的影响 | 对照组和链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠心脏 | 单细胞转录组学 | 糖尿病性心肌病 | 单细胞RNA测序 | 无明确模型应用 | 基因表达数据 | GEO数据库GSE213337数据集，包含糖尿病和对照小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 324 | 2026-05-29 |
XgCPred: Cell type classification using XGBoost-CNN integration and exploiting gene expression imaging in single-cell RNAseq data
2024-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109066
PMID:39180857
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研究论文 | 提出一种结合XGBoost和CNN的新方法XgCPred，用于单细胞RNA-seq数据中的细胞类型分类 | 首次将XGBoost与CNN集成应用于scRNA-seq细胞类型分类，利用KEGG BRITE数据库中基因层级组织生成基因表达图像表示 | 未明确提及局限性，但隐含了对不同数据集适应性的潜在挑战 | 提高单细胞RNA-seq数据中细胞类型分类的准确性和可靠性 | 单细胞RNA-seq数据集中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | XGBoost, CNN | 基因表达图像 | 多个scRNA-seq数据集，涵盖不同细胞数量、基因表达多样性和细胞异质性 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2026-05-29 |
Comprehensive profiling of the human fecal proteome from IBD patients with DIA-MS enables evaluation of disease-relevant proteins
2024-09, Proteomics. Clinical applications
DOI:10.1002/prca.202300075
PMID:38552248
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研究论文 | 使用DIA-MS技术对炎症性肠病（IBD）患者粪便蛋白质组进行综合分析，识别与疾病活动相关的非侵入性生物标志物 | 首次采用数据非依赖采集（DIA）LC-MS/MS方法系统分析IBD患者的粪便蛋白质组，在两个独立队列中鉴定了523种常见蛋白质，并发现了新的粪便蛋白质与免疫细胞浸润和溃疡/直肠出血等IBD病理标志相关 | 样本量相对较小（健康对照组25例，UC患者15例，CD患者15例），研究结果需在更大规模队列中验证 | 识别可用于监测炎症性肠病疾病活动性的非侵入性粪便生物标志物 | 炎症性肠病（IBD）患者，包括溃疡性结肠炎（UC）和克罗恩病（CD）患者，以及健康对照者 | 蛋白质组学 | 炎症性肠病 | DIA-MS（数据非依赖采集质谱） | NA | 蛋白质质谱数据，单细胞RNA测序数据 | 队列1：健康5例，UC 5例，CD 5例；队列2：健康20例，UC 10例，CD 10例（共计健康25例，UC 15例，CD 15例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 326 | 2026-05-29 |
Perturbed liver gene zonation in a mouse model of non-alcoholic steatohepatitis
2024-05, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2024.155830
PMID:38428673
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研究论文 | 结合空间转录组学、批量RNA测序和原位杂交技术，研究非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型中肝脏基因分区模式的扰动 | 首次在NASH小鼠模型中系统揭示Wnt信号通路调控的肝脏基因分区扰动，发现Rspo3表达区域从中央静脉周围扩展到门静脉周围，并通过AAV介导的过表达和基因敲除实验验证其因果作用 | 未观察到Rspo3调控对NASH病理特征（脂肪变性、炎症、纤维化）的影响，可能无法直接解释疾病进展 | 探究NASH疾病状态下肝脏基因分区及其调控因子的变化机制 | 非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型（对照与NASH模型小鼠） | 计算机视觉, 自然语言处理, 空间转录组学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 空间转录组学, 批量RNA测序, 原位杂交, AAV介导的基因调控 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA（未在摘要中明确样本数量） | NA | 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2026-05-29 |
Synergistic induction of tertiary lymphoid structures by chemoimmunotherapy in bladder cancer
2024-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02598-7
PMID:38332180
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research paper | 研究化疗免疫联合疗法在膀胱癌中诱导三级淋巴结构形成的协同作用 | 首次系统揭示免疫治疗和化疗对三级淋巴结构（TLS）形成的各自影响，并证明联合疗法在促进TLS成熟和提高治疗反应率方面具有协同优势 | NA | 探究免疫治疗联合其他治疗方式能否增强免疫反应，从而改善膀胱癌患者的总体缓解率 | 膀胱癌患者的肿瘤组织样本及转录组数据 | machine learning | bladder cancer | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 包括IMvigor 210研究队列和RJBLC-I2N003队列中的膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 328 | 2026-05-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals that PTPRG activates the m6A methyltransferase VIRMA to block mitophagy-mediated neuronal death in Alzheimer's disease
2024-03, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107098
PMID:38325728
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示PTPRG通过激活m6A甲基转移酶VIRMA阻断线粒体自噬介导的阿尔茨海默病神经元死亡 | 首次发现PTPRG通过结合并上调m6A甲基转移酶VIRMA抑制PRKN mRNA翻译，从而阻断线粒体自噬导致神经元死亡的信号通路，并阐明小胶质细胞亚群Mic_PTPRG与特定神经元亚群的通讯机制 | 未提及但可能包括：动物模型与人类AD的差异、实验验证范围有限、样本来源的地理和人口多样性不足 | 阐明阿尔茨海默病中神经元死亡的起始机制，探索潜在治疗靶点 | 阿尔茨海默病相关脑区和外周血 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 85个AD样本和83个对照样本，6只App AD小鼠和6只对照C57Bl/6J小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 329 | 2026-05-29 |
Allosteric inhibitor of SHP2 enhances macrophage endocytosis and bacteria elimination by increasing caveolae activation and protects against bacterial sepsis
2024-03, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107096
PMID:38320736
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研究论文 | SHP2变构抑制剂通过增强小窝蛋白活化促进巨噬细胞胞吞和细菌清除，保护小鼠免受细菌性脓毒症侵害 | 首次揭示SHP2变构抑制剂通过维持Cav-1磷酸化增强巨噬细胞胞吞功能以清除细菌，并提出其与抗生素联用可完全保护小鼠免于死亡 | 未明确说明本研究的局限性 | 研究巨噬细胞在脓毒症中胞吞功能受损的分子机制，并评估SHP2变构抑制剂作为治疗脓毒症的潜力 | 脓毒症小鼠和巨噬细胞 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（大肠杆菌感染或盲肠结扎穿刺诱导脓毒症） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于单细胞RNA测序；Illumina NovaSeq用于批量RNA测序 |
| 330 | 2026-05-29 |
MMP14high macrophages orchestrate progressive pulmonary fibrosis in SR-Ag-induced hypersensitivity pneumonitis
2024-02, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107070
PMID:38218353
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析，发现MMP14高表达的巨噬细胞在SR-Ag诱导的过敏性肺炎中驱动进行性肺纤维化 | 首次鉴定出MMP14高表达的巨噬细胞亚群在纤维化过敏性肺炎中的作用，并揭示其通过外泌体MMP14调控成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未完全阐明人类纤维化过敏性肺炎中MMP14巨噬细胞的具体作用机制及临床转化潜力 | 探究MMP14高表达巨噬细胞在SR-Ag诱导的纤维化过敏性肺炎中的作用及机制 | 纤维化过敏性肺炎小鼠模型中的肺巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 决策树模型 | 基因表达数据 | 未明确提及样本量 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 331 | 2026-05-29 |
Effect of aging on the human myometrium at single-cell resolution
2024-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45143-z
PMID:38296945
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研究论文 | 利用单细胞/单核RNA测序和空间转录组学，构建了衰老子宫肌层的细胞图谱，揭示了与衰老相关的细胞变化 | 首次在单细胞分辨率下研究人类子宫肌层衰老，鉴定了23个细胞亚群，并发现了衰老导致的细胞间通讯改变和25条信号通路丧失 | 样本量有限（20名围绝经期和绝经后女性），可能无法完全代表所有年龄段的女性，且功能性验证不足 | 研究衰老对人类子宫肌层在单细胞水平的影响 | 围绝经期和绝经后女性的子宫肌层组织 | 单细胞生物学 | 妊娠并发症、分娩并发症 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 20名围绝经期和绝经后女性的186,120个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Gene Expression |
| 332 | 2026-05-29 |
scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data
2024-01-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45227-w
PMID:38291052
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研究论文 | 提出scDisInFact框架，用于多批次多条件单细胞RNA测序数据的解耦学习，同时实现批次效应去除、条件相关关键基因检测和扰动预测 | 首次通过解耦学习同时处理批次效应和条件效应，实现三个任务的统一框架 | 未提及具体局限性，但可能依赖数据质量且真实场景中复杂条件效应可能难以完全解耦 | 开发一种能够同时处理多批次单细胞RNA测序数据中技术批次效应和生物条件效应的深度学习方法 | 多批次多条件下的单细胞RNA测序数据，包括不同人口统计组、疾病阶段和药物处理的样本 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架（解耦学习） | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 333 | 2026-05-29 |
A proteome-wide screen identifies the calcium binding proteins, S100A8/S100A9, as clinically relevant therapeutic targets in aortic dissection
2024-01, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.107029
PMID:38056513
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研究论文 | 通过蛋白质组学筛选发现S100A8/S100A9是主动脉夹层的临床相关治疗靶点 | 首次通过蛋白质组学筛选鉴定S100A8/A9为主动脉夹层的新治疗靶点，并验证其通过调节平滑肌细胞表型转换和炎症反应发挥作用的机制 | 未提及具体局限性 | 发现主动脉夹层的新型治疗靶点 | 主动脉夹层患者和对照者的升主动脉样本、小鼠主动脉夹层模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学分析、ELISA、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据、循环蛋白水平、单细胞转录组数据 | 主动脉夹层患者与对照者样本、小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 334 | 2024-12-15 |
Cell type and dynamic state govern genetic regulation of gene expression in heterogeneous differentiating cultures
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100701
PMID:39626676
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研究论文 | 研究探讨了在异质性分化培养物中，细胞类型和动态状态如何调控基因表达的遗传机制 | 利用异质性分化培养物系统，研究了53个人类供体的单细胞RNA测序数据，揭示了与发育和疾病相关基因的新型调控变异 | 研究主要集中在体外系统，可能无法完全反映体内复杂的调控机制 | 探讨人类遗传变异在不同细胞环境中的分子效应，以理解与疾病相关位点的机制 | 异质性分化培养物中的细胞类型和发育阶段 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 53个人类供体的900,000多个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2026-05-28 |
scTrends: A living review of commercial single-cell and spatial 'omic technologies
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100723
PMID:39667347
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综述 | 对商业化单细胞和空间组学技术进行动态综述，涵盖从微流控到成像等多种方法，并讨论其在药物研发中的应用趋势 | 首次以“活综述”形式动态追踪单细胞和空间组学技术的商业化进展，系统整合微流控、组合索引、NGS和成像等多种平台方法，并特别强调新兴技术对药物机制发现的潜在扩展作用 | 文章未对具体平台性能进行量化比较，且作为动态综述可能难以完全覆盖所有最新技术细节 | 系统梳理单细胞和空间组学商业化技术的现状与趋势，为药物研发和学术研究提供资源参考 | 商业化单细胞技术（微流控、板基法、组合索引）和空间组学技术（测序和成像基方法） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、微流控、组合索引、成像技术 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics, Illumina, BGI, 布鲁克 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ | 微流控单细胞平台、基于组合索引的plate-based方法、NGS空间转录组学（如10x Visium）、成像基空间转录组学（如MERFISH） |
| 336 | 2026-05-28 |
B cell heterogeneity in cancer comes of age
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.09.013
PMID:39406185
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评论 | 本文评论了三项最新研究，这些研究利用单细胞RNA测序技术描绘了肿瘤浸润B细胞亚群的泛癌图谱，为理解B细胞依赖性抗肿瘤免疫的深层机制铺平了道路 | 综合多项研究，首次定义了泛癌层面肿瘤浸润B细胞亚群的异质性，揭示了B细胞在癌症免疫中的潜在新功能 | 仅基于现有研究成果进行评述，未提供新的实验数据或验证结果 | 总结并强调近期关于B细胞异质性在癌症中作用的研究进展 | 肿瘤浸润B细胞亚群 | 机器学习和数字病理学交叉领域 | 癌症（泛癌） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个研究中的肿瘤样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 337 | 2026-05-28 |
Low protein diet protects the liver from Salmonella Typhimurium-mediated injury by modulating the mTOR/autophagy axis in macrophages
2024-09-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06932-w
PMID:39349819
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研究论文 | 研究低蛋白饮食对小鼠肝脏抵抗鼠伤寒沙门氏菌感染的保护作用及其机制 | 首次揭示低蛋白饮食通过调控巨噬细胞中mTOR/自噬轴来保护肝脏免受细菌感染损伤 | NA | 探究低蛋白饮食对先天免疫系统的影响及其在肝脏细菌感染中的保护机制 | 小鼠肝脏细胞及人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 | NA | 感染性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠肝脏细胞及人外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 338 | 2026-05-28 |
Full-length single-cell BCR sequencing paired with RNA sequencing reveals convergent responses to pneumococcal vaccination
2024-09-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06823-0
PMID:39341987
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研究论文 | 提出一种从3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长配对BCR可变区序列的方法，并应用于分析肺炎球菌疫苗诱导的B细胞应答 | 首次实现从广泛使用的3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长配对BCR可变区序列，能够同时获取转录组和BCR信息，并揭示疫苗诱导的趋同应答 | 方法在婴儿恒河猴模型中验证，尚需在更大样本和更广泛疫苗接种场景中进一步验证 | 开发并验证从3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长BCR序列的方法，以解析疫苗诱导的B细胞应答特征 | 5只婴儿恒河猴的B细胞（针对肺炎球菌血清型3荚膜多糖的糖缀合疫苗应答） | 单细胞测序、免疫学 | 肺炎球菌感染 | 单细胞RNA测序、BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据、BCR序列数据 | 5只婴儿恒河猴 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 3'条形码单细胞RNA测序文库（具体版本未提及） |
| 339 | 2026-05-28 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-06-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
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评论 | 本文总结了2023年EMBO研讨会“发育代谢：能量、物质和信息的流动”中的关键讨论，强调了现代发育生物学面临的挑战和机遇 | 提出了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算建模等新技术在发育代谢领域中的应用，为探索细胞和组织特异性代谢网络、器官间代谢通信以及基因与代谢物在时空上的交互作用提供了新机会 | 本文为研讨会总结，未提供具体实验数据或验证，属于观点性文章 | 总结发育代谢领域的最新进展和未来研究方向 | 发育代谢中的代谢网络、器官间通信和基因-代谢物相互作用 | 其他 | NA | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 计算建模 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 340 | 2026-05-28 |
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200884
PMID:38722217
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综述 | 探讨新技术如何促进细胞类型进化研究，强调发育同源性在识别同源细胞中的重要性，并总结单细胞转录组学在细胞类型进化研究中的最新发现和未来方向 | 结合基因编辑和单细胞基因组学等技术突破，系统分析细胞类型进化研究的新方法，并特别关注发育同源性对鉴定同源细胞的意义 | 未涉及实际实验数据或模型验证，仅基于文献综述提出观点，对同源性判断的潜在误区缺乏系统性量化分析 | 综述细胞类型进化研究的当前进展，指出关键问题和未来探索领域 | 细胞类型及其进化机制，涵盖多种研究生物体的同源细胞比较 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |