单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7513 篇文献，本页显示第 3341 - 3360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3341 | 2024-10-24 |
Designing Oligonucleotide-Based FISH Probe Sets with PaintSHOP
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3766-1_12
PMID:38502486
|
研究论文 | 本文介绍了使用PaintSHOP平台设计基于寡核苷酸的FISH探针集的方法 | PaintSHOP平台提供了用户友好的网页界面，用于设计基于寡核苷酸的FISH探针集，并包含大量预先发现的探针序列和功能序列 | NA | 介绍如何使用PaintSHOP平台设计基于寡核苷酸的FISH探针集 | 基于寡核苷酸的FISH探针集的设计 | 生物信息学 | NA | 荧光原位杂交 (FISH) | NA | 序列数据 | NA |
| 3342 | 2024-10-24 |
Transcriptome meta-analysis of Kawasaki disease in humans and mice
2024, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2024.1423958
PMID:39350793
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meta-analysis | 本研究对川崎病（KD）在人类和小鼠中的转录组数据进行了元分析，以探索KD的转录组特征并评估动物模型 | 本研究首次对人类和小鼠的KD转录组数据进行了全面的元分析，揭示了关键的差异表达基因和通路，并验证了KD动物模型在识别治疗靶点方面的有效性 | 本研究主要依赖于bulk和单细胞RNA-seq数据，未来需要更全面的单细胞测序来详细描述不同血液细胞群体中的基因表达 | 探索川崎病的转录组特征并评估动物模型 | 川崎病患者的血液和冠状动脉样本，以及川崎病小鼠模型的心脏和大动脉样本 | 数字病理学 | 儿童疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括来自KD患者的血液和冠状动脉样本，以及KD小鼠模型的心脏和大动脉样本 |
| 3343 | 2024-10-24 |
[Molecular pathogenesis of adult T-cell leukemia/lymphoma]
2024, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.65.1019
PMID:39358256
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研究论文 | 本文总结了成人T细胞白血病/淋巴瘤（ATLL）的分子发病机制，重点关注遗传、表观遗传和单细胞分析的最新进展 | 本文通过遗传、表观遗传和单细胞分析揭示了ATLL的分子发病机制，特别是T细胞受体/NF-κB通路和免疫相关分子的频繁改变 | NA | 探讨成人T细胞白血病/淋巴瘤（ATLL）的分子发病机制 | 成人T细胞白血病/淋巴瘤（ATLL）的分子发病机制 | NA | 白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因数据 | NA |
| 3344 | 2024-10-24 |
[Immune microenvironment and immunotherapy resistance in multiple myeloma]
2024, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.65.1058
PMID:39358261
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研究论文 | 本文探讨了多发性骨髓瘤（MM）的免疫微环境及其对免疫治疗抵抗的影响 | 利用单细胞RNA测序和飞行时间流式细胞术分析了MM患者骨髓中MM细胞与免疫细胞之间的时空相互作用 | 未提及具体的研究局限性 | 研究MM的免疫微环境及其对免疫治疗抵抗的机制，为开发长期完全缓解和治愈的免疫治疗策略提供依据 | 多发性骨髓瘤（MM）患者的免疫微环境 | NA | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序、飞行时间流式细胞术 | NA | RNA | 未提及具体样本数量 |
| 3345 | 2024-10-24 |
Discovery of plasma biomarkers related to blood-brain barrier dysregulation in Alzheimer's disease
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1463001
PMID:39429696
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研究论文 | 本研究旨在通过整合公开的组学数据集，识别与阿尔茨海默病（AD）相关的血浆生物标志物，特别是与血脑屏障功能障碍相关的蛋白质 | 本研究首次通过整合血浆和脑蛋白质组数据，识别出五个符合生物标志物标准的蛋白质，并验证了其在AD中的生物学有效性 | 研究尚未深入探讨蛋白质通过血脑屏障泄漏的机制 | 识别与阿尔茨海默病相关的血浆生物标志物 | 血浆和脑蛋白质组数据 | NA | 阿尔茨海默病 | 蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
| 3346 | 2024-10-24 |
Single-cell sequencing decodes the secrets of the RAP phenomenon of corticotomy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397727
PMID:39430747
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了皮质切开术后铁代谢相关基因的显著增加，并探讨了Atf3+巨噬细胞在加速牙齿移动中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了皮质切开术后巨噬细胞的转录组异质性，并发现Atf3+巨噬细胞在加速牙齿移动中的新作用 | 研究主要集中在巨噬细胞和铁代谢上，未全面探讨其他细胞类型和分子机制 | 探讨皮质切开术后加速牙齿移动的分子机制 | 皮质切开术后的巨噬细胞和铁代谢 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 皮质切开术后的巨噬细胞样本 |
| 3347 | 2024-10-24 |
Unraveling the ecological landscape of mast cells in esophageal cancer through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1470449
PMID:39430754
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了食管癌中肥大细胞的生态景观，并构建了预测模型 | 首次应用单细胞RNA测序技术全面分析食管癌中的免疫微环境，并发现了肥大细胞的特定亚型及其在肿瘤发展中的作用 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 揭示食管癌肿瘤微环境中肥大细胞的作用，并探索潜在的治疗策略 | 食管癌中的肥大细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5001个肥大细胞样本 |
| 3348 | 2024-10-24 |
Integrating genomics and AI to uncover molecular targets for mRNA vaccine development in lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381445
PMID:39430760
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习技术，分析了狼疮性肾炎患者的基因表达数据，以揭示mRNA疫苗开发的潜在分子靶点 | 本研究首次将单细胞基因组学与非负矩阵分解和机器学习相结合，揭示了狼疮性肾炎中不同的白细胞元程序，并识别了潜在的mRNA疫苗靶点 | 本研究仅限于狼疮性肾炎患者，结果可能不适用于其他自身免疫性疾病 | 本研究旨在通过整合基因组学和人工智能技术，揭示狼疮性肾炎中mRNA疫苗开发的潜在分子靶点 | 本研究主要研究对象为狼疮性肾炎患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 24名狼疮性肾炎患者和10名健康对照组 |
| 3349 | 2024-10-24 |
Targeting exercise-related genes and placental growth factor for therapeutic development in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1476076
PMID:39431157
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，识别与头颈鳞状细胞癌（HNSCC）预后相关的运动相关基因，并特别关注胎盘生长因子（PIGF）的治疗潜力 | 本研究首次识别了与HNSCC预后相关的运动相关基因，并探讨了PIGF作为治疗靶点的潜力 | 本研究主要基于生物信息学分析和体外实验，尚未进行体内实验验证 | 识别与HNSCC预后相关的运动相关基因，并探讨PIGF的治疗潜力 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）及其相关基因和胎盘生长因子（PIGF） | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 转录组数据分析、基因集富集分析（GSEA）、基因本体论（GO）、京都基因与基因组百科全书（KEGG） | NA | 转录组数据 | 来自TCGA数据库的HNSCC转录组数据 |
| 3350 | 2024-10-24 |
RUNX2 as a novel biomarker for early identification of patients progressing to advanced-stage mycosis fungoides
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1421443
PMID:39435287
|
研究论文 | 本文研究了RUNX2作为早期识别进展到晚期蕈样霉菌病患者的潜在生物标志物 | 首次证明RUNX2在识别进展到晚期蕈样霉菌病患者中的潜力，并展示了空间转录组学与单细胞RNA测序分析结合的分析优势 | 样本量较小，仅包括15名患者 | 寻找早期区分蕈样霉菌病进展到晚期阶段的生物标志物 | 蕈样霉菌病患者的皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | RNA基因表达数据 | 15名蕈样霉菌病患者 |
| 3351 | 2024-10-22 |
Graph attention automatic encoder based on contrastive learning for domain recognition of spatial transcriptomics
2024-Oct-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07037-0
PMID:39424696
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对比学习的图注意力自动编码器方法，用于空间转录组学的领域识别 | 提出了一种新的深度学习方法GAAEST，结合空间位置信息和基因表达数据，通过图注意力网络和对比学习优化嵌入表示，显著提升了空间域识别的准确性 | 未提及 | 开发一种能够准确识别空间转录组学中空间域的深度学习方法 | 空间转录组学中的基因表达数据和空间位置信息 | 机器学习 | NA | 图注意力网络、对比学习 | 自动编码器 | 基因表达数据 | 多个数据集 |
| 3352 | 2024-10-22 |
Insights into the molecular characteristics of embryonic cranial neural crest cells and their derived mesenchymal cell pools
2024-Oct-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07056-x
PMID:39424998
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研究论文 | 研究探讨了胚胎期颅神经嵴细胞及其衍生的间充质细胞池的分子特征 | 通过单细胞RNA测序和全基因组DNA甲基化分析，揭示了鹿角再生和牙齿间充质细胞之间的共同基因表达谱和甲基化特征 | NA | 揭示颅神经嵴细胞衍生的间充质细胞的发育生物学和再生潜力 | 胚胎期颅神经嵴细胞及其衍生的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，全基因组DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据，DNA甲基化数据 | NA |
| 3353 | 2024-10-22 |
Multi-scalar data integration decoding risk genes for chronic kidney disease
2024-Oct-18, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03798-2
PMID:39425076
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研究论文 | 本研究通过整合全基因组关联研究、RNA测序和单细胞RNA测序数据，探索与慢性肾脏疾病相关的基因和细胞类型 | 本研究首次整合了多种尺度的数据，包括全基因组关联研究、RNA测序和单细胞RNA测序，以揭示慢性肾脏疾病的基因和细胞类型 | 本研究主要基于现有数据库中的数据，未进行新的实验验证 | 探索与慢性肾脏疾病相关的基因、通路和细胞类型，为进一步的机制研究奠定基础 | 慢性肾脏疾病的基因和细胞类型 | 基因组学 | 肾脏疾病 | 全基因组关联研究、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 779个SNPs，涉及681个基因 |
| 3354 | 2024-10-22 |
Scalable identification of lineage-specific gene regulatory networks from metacells with NetID
2024-Oct-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03418-0
PMID:39425176
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为NetID的方法，用于从单细胞RNA测序数据中识别基因调控网络，特别是针对细胞谱系特异性网络 | NetID通过利用同质性metacells并避免虚假的基因-基因相关性，克服了数据稀疏性和高维度的挑战，相比基于插补的方法表现出更优越的性能 | NA | 旨在开发一种可扩展的方法来识别细胞谱系特异性的基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大规模单细胞转录组数据 |
| 3355 | 2024-10-22 |
MEF2C is a Potential Prognostic Biomarker and is Correlated with Immune Infiltrates in Lung Adenocarcinoma
2024-Oct-18, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 研究探讨了MEF2C在肺腺癌中的表达及其作为预后生物标志物的潜力，并分析了其与免疫浸润的关系 | 首次系统分析了MEF2C在肺腺癌中的表达及其与临床特征、预后指标和免疫系统相互作用的关系 | 研究主要基于TCGA数据和部分实验验证，缺乏大规模临床验证 | 探讨MEF2C在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | MEF2C在肺腺癌中的表达及其与临床特征、预后指标和免疫系统相互作用的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 生物信息学分析、定量实时PCR | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA数据集，涉及多种癌症类型，重点研究肺腺癌 |
| 3356 | 2024-10-22 |
Revealing Fibrosis Genes as Biomarkers of Ulcerative Colitis: A Bioinformatics Study Based on ScRNA and Bulk RNA Datasets
2024-Oct-18, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究旨在通过分析单细胞和批量RNA测序数据，揭示与纤维化相关的基因作为溃疡性结肠炎的生物标志物，并预测对TNFα抑制剂的敏感性 | 本研究首次结合单细胞和批量RNA测序数据，利用多种机器学习算法识别与纤维化相关的基因，并开发了用于诊断溃疡性结肠炎的模型 | 本研究仅基于有限的UC患者数据，且未在其他疾病或健康人群中验证模型的普适性 | 揭示与纤维化相关的基因作为溃疡性结肠炎的生物标志物，并预测对TNFα抑制剂的敏感性 | 溃疡性结肠炎患者及其纤维化相关基因 | 生物信息学 | 消化系统疾病 | RNA测序 | 随机森林、支持向量机、Xgboost、多层感知器、逻辑回归 | RNA数据 | 8个批量RNA测序数据集和1个单细胞RNA测序数据集，来自溃疡性结肠炎患者 |
| 3357 | 2024-10-21 |
Predictive biomarkers for immune checkpoint inhibitors therapy in lung cancer
2024-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2024.2406063
PMID:39415535
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综述 | 本文综述了用于预测肺癌免疫检查点抑制剂疗效的生物标志物及其相关技术 | 本文结合单细胞测序和空间成像技术，以及深度学习和人工智能，探讨了新的预测生物标志物 | PD-L1作为首个预测生物标志物，其预测价值仅限于特定人群 | 探讨用于预测肺癌免疫检查点抑制剂疗效的生物标志物及其相关技术 | 肺癌患者对免疫检查点抑制剂的反应 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞测序、空间成像技术、深度学习、人工智能 | NA | NA | NA |
| 3358 | 2024-10-21 |
Excavating regulated cell death signatures to predict prognosis, tumor microenvironment and therapeutic response in HR+/HER2- breast cancer
2024-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102117
PMID:39241556
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研究论文 | 研究探讨了调控性细胞死亡（RCD）在HR+/HER2-乳腺癌中的作用及其临床价值 | 构建了一个基于六个关键基因的RCD评分系统（CDScore），用于预测HR+/HER2-乳腺癌的预后、肿瘤微环境和治疗反应 | NA | 探索调控性细胞死亡在HR+/HER2-乳腺癌中的作用及其临床应用 | HR+/HER2-乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3359 | 2024-10-21 |
Single-cell RNA sequencing and immune repertoire analysis revealed dynamic immune characteristics associated with peripheral blood during sepsis
2024-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150751
PMID:39357334
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组库分析，揭示了脓毒症期间外周血细胞的动态免疫特征 | 结合单细胞基因表达谱和B细胞受体组库分析，揭示了感染对B细胞抗原呈递能力和B细胞受体多样性的短期影响 | 研究仅在脓毒症小鼠模型中进行，结果的临床适用性需进一步验证 | 探索脓毒症期间免疫反应失调的机制并识别潜在的治疗靶点 | 脓毒症小鼠的外周血细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症小鼠 |
| 3360 | 2024-10-21 |
Genomic insights into the contribution of de novo lipogenesis to intramuscular fat deposition in chicken
2024-Nov, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.003
PMID:38065407
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研究论文 | 研究揭示了从头脂肪生成在鸡肌肉内脂肪沉积中的作用及其基因调控机制 | 首次通过全基因组重测序和单细胞RNA测序揭示了脂肪酸合酶在肌肉内脂肪沉积中的关键作用，并发现从头脂肪生成是肌肉内脂肪沉积的重要贡献者 | 研究样本量有限，且仅针对特定品种的鸡进行研究，结果的普适性有待进一步验证 | 探究肌肉内脂肪沉积的调控机制，以提高鸡肉品质 | 黄羽鸡的肌肉内脂肪沉积 | NA | NA | 全基因组重测序、单细胞RNA测序、转录组测序、13C同位素示踪技术 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 516只黄羽鸡和3只63日龄的雌性JXY鸡 |