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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3281 | 2024-12-15 |
Senescence Reprogramming by MTHFD2 Deficiency Facilitates Tumor Progression
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.99168
PMID:39668825
|
研究论文 | 研究探讨了年龄对癌症预后的影响,并开发了一个基于基因的衰老相关预后模型 | 首次揭示了MTHFD2在癌症衰老中的关键作用,其缺失通过诱导细胞衰老和促进衰老相关分泌表型(SASP)促进肿瘤生长 | 研究主要基于基因表达和单细胞RNA测序数据,可能缺乏对其他潜在因素的全面考虑 | 探讨年龄对癌症预后的影响,并开发衰老相关预后模型 | 老年和年轻癌症患者的肿瘤样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 收集了老年和年轻癌症患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3282 | 2024-12-15 |
Evaluating the prognostic potential of telomerase signature in breast cancer through advanced machine learning model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462953
PMID:39669558
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研究论文 | 本文通过先进的机器学习模型评估端粒酶特征在乳腺癌中的预后潜力 | 开发了一种基于机器学习的端粒酶特征(MLTS),并展示了其在乳腺癌预后中的优越预测性能 | 未来研究需要进一步整合MLTS与其他分子特征以增强其临床应用 | 评估端粒酶特征在乳腺癌中的预后潜力 | 乳腺癌患者的生存预后 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法 | 机器学习模型 | 多组学数据 | 九个独立的乳腺癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3283 | 2024-12-15 |
The effector function of mucosal associated invariant T cells alters with aging and is regulated by RORγt
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1504806
PMID:39669566
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研究论文 | 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞)在衰老过程中的转录组和功能变化,并揭示了RORγt在调节这些变化中的作用 | 首次揭示了衰老过程中MAIT细胞从MAIT17到MAIT1的功能转变,并发现RORγt在调节这一转变中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道MAIT细胞,可能无法完全反映其他组织或物种中的情况 | 探讨衰老对MAIT细胞功能的影响及其潜在的分子机制 | 肠道中的MAIT细胞及其在衰老过程中的转录组和功能变化 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和人类肠道MAIT细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3284 | 2024-12-15 |
Integrated immunogenomic analyses of high-grade serous ovarian cancer reveal vulnerability to combination immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1489235
PMID:39669575
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研究论文 | 本文通过综合免疫基因组分析高级别浆液性卵巢癌,揭示了其对联合免疫治疗的脆弱性 | 开发了一个24基因特征来预测BRCAness,并创建了一个网络应用程序和R包OvRSeq,用于全面表征卵巢癌患者样本并评估对联合免疫治疗的脆弱性 | NA | 研究高级别浆液性卵巢癌对联合免疫治疗的反应,并开发预测工具 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序、免疫荧光分析、免疫组化 | 机器学习分类模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个患者队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3285 | 2024-12-15 |
Integrative multiomics analysis reveals association of gut microbiota and its metabolites with susceptibility to keloids
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1475984
PMID:39669776
|
研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了肠道微生物及其代谢产物与瘢痕疙瘩易感性之间的关联 | 首次通过整合粪便宏基因组、血浆代谢组和组织代谢组等多组学数据,揭示了肠道微生物及其代谢产物在瘢痕疙瘩形成中的作用 | 研究样本量较小,且仅限于特定人群,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨肠道微生物及其代谢产物与瘢痕疙瘩易感性之间的关系 | 瘢痕疙瘩患者和正常瘢痕对照组的肠道微生物、血浆代谢物和组织代谢物 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 宏基因组分析、代谢组学、单细胞测序 | 随机森林模型 | 粪便宏基因组数据、血浆代谢组数据、组织代谢组数据 | 瘢痕疙瘩患者56例,正常瘢痕对照组60例,组织代谢组分析分别为35例和32例,靶向组织代谢组分析分别为41例和36例 | NA | NA | NA | NA |
| 3286 | 2024-12-14 |
Paired-Related Homeobox 1-Positive Cells Are Needed for Osseointegration
2024-Dec-11, The International journal of oral & maxillofacial implants
DOI:10.11607/jomi.10852
PMID:38498783
|
研究论文 | 研究Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中对种植体诱导骨整合过程的贡献及其潜在机制 | 首次揭示了Prrx1阳性细胞在骨整合过程中的作用,并发现Sema3C在Prrx1阳性细胞驱动的成骨过程中起关键作用 | 研究仅在啮齿动物模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨Prrx1阳性细胞在种植体诱导骨整合过程中的作用及其机制 | Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中的作用 | NA | NA | Cre重组酶诱导的谱系追踪、细胞消融、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用小鼠牙种植体模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 3287 | 2024-12-14 |
EEE1F1 could serve as a prognostic biomarker for patients with endometrial cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Dec-11, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.065
PMID:39668036
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3288 | 2024-12-14 |
Conserved B cell signaling, activation, and differentiation in porcine jejunal and ileal Peyer's patches despite distinct immune landscapes
2024-Dec, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.08.005
PMID:39147277
|
研究论文 | 研究了猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化,尽管存在不同的免疫环境,但发现了保守的B细胞动态 | 首次通过单细胞和空间转录组学研究猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化,并发现尽管存在不同的免疫环境,B细胞动态在肠道位置间是保守的 | 研究仅限于猪的空肠和回肠Peyer's patches,未涉及其他物种或其他肠道区域 | 探讨Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化,并研究其在不同肠道位置的保守性 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3289 | 2024-12-14 |
GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model
2024-Dec, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01034-y
PMID:39375485
|
研究论文 | 本文构建了一个跨物种的基础模型GeneCompass,用于解析普遍的基因调控机制 | GeneCompass通过整合四种先验生物学知识,在自监督学习中增强了基因调控机制的理解,并在多个下游任务中超越了现有模型 | NA | 解析跨物种的普遍基因调控机制,推动基础生命过程研究和临床应用 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型 | 转录组数据 | 12000万个人类和小鼠的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3290 | 2024-12-14 |
Investigating intra-tumoural heterogeneity and microenvironment diversity in primary cardiac angiosarcoma through single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70113
PMID:39658531
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境多样性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了原发性心脏血管肉瘤的复杂细胞景观和免疫微环境,并识别了潜在的分子治疗靶点 | 样本量较小,仅基于四个患者的肿瘤样本进行分析 | 揭示原发性心脏血管肉瘤的细胞异质性和肿瘤微环境,为开发新型疗法提供分子靶点 | 原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个患者的肿瘤样本和五个正常心脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3291 | 2024-12-14 |
Oxygen, angiogenesis, cancer and immune interplay in breast tumour microenvironment: a computational investigation
2024-Dec, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.240718
PMID:39665095
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研究论文 | 本研究利用乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型(MMTV-PyMT)的数据,探讨了乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的相互作用 | 引入了一种基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据估算乳腺癌微环境中免疫细胞比例的方法,并通过混合遗传算法(HGA)进行参数估计 | NA | 研究乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的复杂动态相互作用 | 乳腺癌微环境中的内皮细胞、氧气、血管内皮生长因子(VEGF)以及免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 混合遗传算法(HGA) | 单细胞RNA测序数据 | 乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型(MMTV-PyMT) | NA | NA | NA | NA |
| 3292 | 2024-12-14 |
Single-cell transcriptomics: a new frontier in plant biotechnology research
2024-Nov-25, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03383-9
PMID:39585480
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综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在植物生物技术研究中的最新进展及其对植物发育理解的深远影响 | 单细胞转录组技术提供了前所未有的细胞分辨率,揭示了复杂的细胞过程和发育途径 | 单细胞转录组技术在植物研究中面临样本准备、细胞分离、数据复杂性和计算分析等挑战 | 探讨单细胞转录组技术在植物生物技术中的应用及其未来发展前景 | 植物细胞的基因表达、发育过程和环境响应 | 植物生物技术 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3293 | 2024-12-14 |
Expression of Anoikis-Related Genes and Potential Biomarkers in Colon Cancer Based on RNA-seq and scRNA-seq
2024-Nov, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-04957-9
PMID:38727936
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研究论文 | 本研究整合了结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据,评估了患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达,并构建了结肠癌风险模型 | 首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据,评估了结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达,并构建了结肠癌风险模型 | 研究仅基于现有数据集,未进行体外或体内实验验证 | 通过整合转录组和单细胞RNA测序数据,评估结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达,并构建结肠癌风险模型 | 结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,单细胞转录组数据 | 结肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3294 | 2024-12-14 |
Aging- and alcohol-associated spatial transcriptomic signature in mouse acute pancreatitis reveals heterogeneity of inflammation and potential pathogenic factors
2024-08, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-024-02460-6
PMID:38940937
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研究论文 | 本研究通过建立衰老酒精性急性胰腺炎小鼠模型,应用Visium空间转录组学技术,揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎空间转录组特征 | 首次通过空间转录组学技术揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的炎症异质性,并识别出潜在的致病因素 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证这些发现 | 阐明衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的空间转录组特征及其潜在机制 | 衰老和年轻小鼠的急性胰腺炎模型 | NA | 胰腺炎 | Visium空间转录组学 | NA | 转录组 | 衰老小鼠(18个月)和年轻小鼠(3个月)各一组 | NA | NA | NA | NA |
| 3295 | 2024-12-14 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559569
PMID:37808650
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研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经再生的化合物 | 首次使用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子分析,筛选出促进神经再生的化合物 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经再生能力,以恢复视网膜疾病患者的视力 | 小鼠Müller胶质细胞的神经再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 | NA | NA | NA | NA |
| 3296 | 2024-12-14 |
Segregation of morphogenetic regulatory function of Shox2 from its cell fate guardian role in sinoatrial node development
2024-03-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06039-2
PMID:38553636
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研究论文 | 研究探讨了Shox2在窦房结发育中的形态发生调控功能与其细胞命运守护角色之间的分离 | 首次展示了Shox2在窦房结发育中细胞命运决定与形态发生调控功能的分离 | 研究仅限于Shox2和Nkx2-5的共同失活对窦房结发育的影响,未探讨其他可能的调控因子 | 探讨Shox2在窦房结发育中的双重角色及其相互关系 | Shox2在窦房结发育中的形态发生调控功能与细胞命运守护角色 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Shox2突变体、Nkx2-5突变体及两者的共同失活突变体(dKO)的窦房结细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3297 | 2024-12-14 |
Endothelial gene regulatory elements associated with cardiopharyngeal lineage differentiation
2024-03-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06017-8
PMID:38514806
|
研究论文 | 研究识别了与心脏咽弓中胚层分化相关的内皮细胞基因调控元件 | 通过整合染色质重塑和基因表达数据与单细胞RNA测序数据,识别了101个内皮细胞基因的潜在调控元件,并使用机器学习策略预测增强子 | 研究主要基于小鼠胚胎数据,可能需要进一步验证在其他物种中的适用性 | 识别和验证在心脏咽弓中胚层分化过程中激活的内皮细胞基因调控元件 | 内皮细胞基因调控元件及其在心脏咽弓中胚层分化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 3298 | 2024-12-14 |
Unveiling the role of TGF-β signaling pathway in breast cancer prognosis and immunotherapy
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1488137
PMID:39664194
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β信号通路在乳腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 开发了一种新的TGF-β通路相关预后签名(TSPRS),并验证了其在乳腺癌预后和免疫治疗中的预测能力 | NA | 研究TGF-β信号通路与乳腺癌临床结果及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响 | 乳腺癌患者的转录组和单细胞测序数据 | NA | 乳腺癌 | 转录组测序,单细胞测序,加权基因共表达网络分析(WGCNA) | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌转录组和单细胞测序数据,涉及54个与TGF-β信号通路相关的基因 | NA | NA | NA | NA |
| 3299 | 2024-12-13 |
Computational analysis of the functional impact of MHC-II-expressing triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1497251
PMID:39664386
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研究论文 | 研究分析了MHC-II表达的三阴性乳腺癌的功能影响 | 揭示了MHC-II表达的肿瘤细胞在调节免疫环境和影响患者生存结果中的功能重要性,并开发了一个包含40个显著基因的预后标志物,通过机器学习模型成功预测了患者的生存结果和免疫浸润程度 | NA | 理解MHC-II表达的肿瘤细胞在肿瘤微环境中的作用 | 三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3300 | 2024-12-13 |
CAR-NK cells derived from cord blood originate mainly from CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK progenitor cells
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101374
PMID:39659759
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研究论文 | 研究探讨了脐血来源的CAR-NK细胞主要来源于CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK祖细胞 | 首次确定CAR-NK细胞主要来源于CD56 NK祖细胞,并揭示了CD56CD7CD34HLA-DR Lin细胞是人类脐血来源CAR-NK细胞的主要来源 | 研究未详细探讨如何增强从这些NK祖细胞中产生NK细胞的质量和数量 | 探讨CAR-NK细胞在脐血中的起源 | 脐血来源的CAR-NK细胞及其祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 脐血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |