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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3261 | 2025-01-15 |
Single-cell RNA-seq reveals keratinocyte and fibroblast heterogeneity and their crosstalk via epithelial-mesenchymal transition in psoriasis
2024-03-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06583-z
PMID:38472183
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了银屑病中角质形成细胞和成纤维细胞的异质性及其通过上皮-间质转化的相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了银屑病皮肤中角质形成细胞和成纤维细胞的异质性,并发现它们通过上皮-间质转化相互作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证仍需进一步研究 | 探索银屑病的发病机制,特别是角质形成细胞和成纤维细胞在其中的作用 | 银屑病模型小鼠和野生型小鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 13个样本中的94,759个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3262 | 2025-10-07 |
Gasdermin E promotes translocation of p65 and c-jun into nucleus in keratinocytes for progression of psoriatic skin inflammation
2024-03-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06545-5
PMID:38429278
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研究论文 | 本研究探讨了Gasdermin E在角质形成细胞中通过促进p65和c-jun核转位推动银屑病皮肤炎症进展的机制 | 首次揭示GSDME以不依赖细胞焦亡的方式通过促进p65和c-jun核转位参与银屑病发病机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,需要进一步临床验证 | 阐明角质形成细胞中GSDME在银屑病发病机制中的具体作用 | 银屑病患者皮肤样本、IMQ诱导的银屑病样皮炎小鼠模型、角质形成细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, GEO数据分析, 基因敲除 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | GEO数据集中的银屑病患者样本和IMQ诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3263 | 2025-10-07 |
Endocardium gives rise to blood cells in zebrafish embryos
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113736
PMID:38308842
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼胚胎模型证实心内膜能够产生血细胞 | 首次在斑马鱼胚胎中通过实时成像和谱系追踪证实心内膜来源的髓系细胞生成 | 研究仅针对斑马鱼胚胎模型,在哺乳动物中的保守性需要进一步验证 | 探究心内膜在造血过程中的贡献 | 斑马鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,实时成像,谱系追踪,表达分析 | NA | 基因表达数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3264 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal role of SETD2-H3K36me3 in murine pancreatic organogenesis
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113703
PMID:38265933
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术揭示了SETD2-H3K36me3在小鼠胰腺器官发生中的时空调控作用 | 首次系统阐明SETD2介导的H3K36me3修饰在胰腺发育过程中的动态变化及其对内外分泌谱系分化的调控机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类胰腺发育中验证 | 探究组蛋白修饰H3K36me3在胰腺器官发生中的调控作用 | 小鼠胚胎胰腺发育过程 | 表观遗传学 | 胰腺疾病 | CUT&Tag, ATAC-seq, bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据,转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性测序,靶向切割标记技术 | NA | NA |
| 3265 | 2025-10-07 |
The single-cell transcriptome program of nodule development cellular lineages in Medicago truncatula
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113747
PMID:38329875
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了蒺藜苜蓿根瘤发育过程中细胞谱系的转录重编程机制 | 首次在蒺藜苜蓿中构建了根瘤发育的单细胞转录组图谱,鉴定了参与共生响应的表皮根毛和中柱亚细胞类型,并发现新的根瘤形成调控因子STYLISH 4 | 研究主要关注早期根瘤发育阶段,对成熟根瘤的功能研究相对有限 | 解析豆科植物与根瘤菌共生过程中根瘤发育的细胞类型特异性转录调控网络 | 蒺藜苜蓿野生型Jemalong A17及其超结瘤突变体sunn-4的根组织细胞 | 植物单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断,基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变体苜蓿根组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3266 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of cervical exfoliated cells reveals potential biomarkers and cellular pathogenesis in cervical carcinogenesis
2024-02-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06522-y
PMID:38346944
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈脱落细胞,揭示宫颈癌发生过程中的潜在生物标志物和细胞发病机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘宫颈癌发生过程中免疫细胞和上皮细胞的动态变化,鉴定出脂质相关巨噬细胞作为预测LSIL向HSIL进展的生物标志物 | 样本量相对有限(15个样本),需要在更大队列中验证研究结果 | 探索宫颈癌发生过程中的细胞异质性和潜在生物标志物 | 宫颈脱落细胞 | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 15个样本(包含正常宫颈、LSIL、HSIL和恶性肿瘤),56,173个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3267 | 2025-10-07 |
Mechanistic insights into sevoflurane-induced hippocampal neuronal damage and cognitive dysfunction through the NEAT1/Nrf2 signaling axis in aged rats
2024-12-21, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09964-4
PMID:39707048
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了七氟醚通过NEAT1/Nrf2信号轴诱导老年大鼠海马神经元损伤和认知功能障碍的分子机制 | 首次发现lncRNA NEAT1通过抑制Nrf2/ARE/HO-1通路在七氟醚诱导的神经元损伤中发挥关键作用 | 研究仅针对老年大鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 阐明七氟醚麻醉导致老年患者神经损伤和认知功能障碍的分子机制 | 老年大鼠海马神经元 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,转录组分析,TUNEL染色,H&E染色,免疫组化,免疫荧光,流式细胞术 | 大鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 老年大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3268 | 2025-10-07 |
Durable complete response after combined treatment with tumor-infiltrating lymphocytes and oncolytic adenovirus (TILT-123) in a patient with metastatic mucosal melanoma
2024-Dec, Immuno-oncology technology
DOI:10.1016/j.iotech.2024.100726
PMID:39801682
|
病例报告 | 报道一例转移性黏膜黑色素瘤患者通过肿瘤浸润淋巴细胞与溶瘤腺病毒联合治疗获得持久完全缓解的病例 | 首次展示TILT-123溶瘤病毒与肿瘤浸润淋巴细胞联合治疗在不使用预处理化疗或后处理白介素-2的情况下实现完全缓解 | 单病例报告,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探索联合免疫疗法在转移性黏膜黑色素瘤治疗中的效果 | 48岁女性转移性鼻窦黏膜黑色素瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞测序,免疫组织化学分析 | NA | 临床数据,单细胞测序数据,免疫组织化学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3269 | 2025-10-07 |
Spatial multiomics atlas reveals smooth muscle phenotypic transformation and metabolic reprogramming in diabetic macroangiopathy
2024-10-12, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02458-x
PMID:39395983
|
研究论文 | 本研究首次构建了糖尿病大血管病变的空间多组学图谱,揭示了平滑肌细胞表型转化和代谢重编程的特征 | 首次构建了胫前动脉的空间基因-代谢图谱,揭示了平滑肌细胞表型转化的转录驱动网络和代谢重编程关键基因 | 样本仅来自11例截肢糖尿病患者,样本量有限 | 探索糖尿病大血管病变中平滑肌细胞表型转化和代谢重编程的分子机制 | 糖尿病患者的胫前动脉组织 | 空间多组学 | 糖尿病大血管病变 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,空间代谢组测序 | 多组学整合分析,细胞通讯分析,时间序列分析,网络分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,空间代谢组数据 | 11例糖尿病截肢患者的胫前动脉 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
| 3270 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics in thyroid eye disease
2024 Oct-Dec, Taiwan journal of ophthalmology
IF:1.0Q4
DOI:10.4103/tjo.TJO-D-23-00096
PMID:39803402
|
综述 | 总结单细胞转录组学在甲状腺眼病研究中的最新突破和应用前景 | 首次系统综述单细胞RNA测序技术在甲状腺眼病研究中的应用,揭示疾病发病机制的新见解 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要依赖已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞转录组学在甲状腺眼病研究中的应用价值和未来方向 | 甲状腺眼病患者眼眶后组织 | 数字病理学 | 甲状腺眼病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | NA |
| 3271 | 2025-10-07 |
Interferon signaling and ferroptosis in tumor immunology and therapy
2024-Aug-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00668-w
PMID:39127858
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研究论文 | 本研究阐明了干扰素信号通路通过调控铁死亡影响CD8+T细胞耗竭的机制及其在肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次揭示干扰素信号通路与铁死亡的相互作用机制,并发现沉默HSPA6或DNAJB1可增强PD-1疗法疗效 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究干扰素信号通路对肿瘤细胞铁死亡的影响及其与CD8+T细胞耗竭的关联机制 | 肿瘤细胞、CD8+T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序、生物信息学分析、体外实验、体内验证 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质水平数据、细胞活性数据 | TCGA数据库数据及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3272 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics reveals gene interactions and signaling pathway dynamics in rat embryos with anorectal malformation
2024-05-21, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09878-1
PMID:38769159
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了大鼠胚胎肛门直肠畸形的基因表达特征和信号通路动态 | 首次在胚胎发育过程中应用空间转录组学技术,揭示了肛门直肠畸形中位置特异性基因表达模式和信号通路协同作用 | 研究仅针对GD14-GD16胚胎期,缺乏更早期或更晚期的发育阶段分析 | 探究肛门直肠畸形的分子机制和基因调控网络 | 大鼠胚胎(正常组和肛门直肠畸形组) | 空间转录组学 | 肛门直肠畸形 | 空间转录组学,免疫荧光染色,WGCNA,GSEA,PROGENy | NA | 空间基因表达数据,图像数据 | GD14-GD16胚胎期大鼠样本(包含正常和畸形病例) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3273 | 2025-10-07 |
Lactylation-driven TNFR2 expression in regulatory T cells promotes the progression of malignant pleural effusion
2024-Dec-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010040
PMID:39721754
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控调节性T细胞中TNFR2表达的机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 首次发现乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控NF-κB p65转录因子,进而上调TNFR2表达的新表观遗传机制 | NA | 探索调节性T细胞中TNFR2表达的调控机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 人类和小鼠的恶性胸腔积液样本及调节性T细胞 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3274 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Sheds Light on Tumor Evolution: Perspectives from City of Hope's Clinical Trial Teams
2024-Dec-10, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13247507
PMID:39768430
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学在临床肿瘤研究中的应用及其对理解肿瘤演化的意义 | 提出了整合单细胞RNA测序到临床实验设计的实践经验,并强调了计算团队与临床团队协作的'团队医学'方法 | 实施单细胞方法面临高质量细胞获取、技术变异性和复杂计算分析等挑战 | 理解肿瘤异质性对肿瘤演化和治疗反应的影响,以开发更有效的治疗方法 | 乳腺癌、脑癌和卵巢癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多种癌症(乳腺癌、脑癌、卵巢癌) | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3275 | 2025-10-07 |
Deciphering progressive lesion areas in breast cancer spatial transcriptomics via TGR-NMF
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae707
PMID:39780487
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研究论文 | 本研究开发了TGR-NMF方法,用于解析乳腺癌空间转录组数据中的疾病进展相关区域 | 提出了三图正则化非负矩阵分解方法和单元化策略,整合基因表达和空间位置邻域拓扑,能够利用完整的基因表达计数数据并提高可解释性 | 未明确说明样本数量和具体的技术验证细节 | 解析乳腺癌组织异质性,识别与疾病进展相关的空间区域 | 乳腺癌空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | TGR-NMF(三图正则化非负矩阵分解) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3276 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional atlas of human breast cancers and model systems
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70044
PMID:39417215
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研究论文 | 构建了人类乳腺癌的单细胞转录图谱,包含患者样本和多种模型系统 | 整合了多种乳腺癌模型系统的单细胞RNA测序数据,开发了动态细胞样本注释方法 | 样本数量有限,模型系统与真实患者样本仍存在差异 | 深入理解乳腺癌细胞多样性,识别有效治疗方法 | 乳腺癌患者肿瘤组织、淋巴结转移灶、减乳成形术样本、PDX模型、PDXO类器官和细胞系 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | SCSubtype, TNBCtype细胞分型预测器 | 单细胞转录组数据 | 117个样本,共506,719个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3277 | 2025-10-07 |
The Effect of Exposure to Neighborhood Violence on Glucocorticoid Receptor Signaling in Lung Tumors
2024-07-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0032
PMID:38912926
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研究论文 | 本研究探讨了居住区暴力犯罪暴露对肺肿瘤中糖皮质激素受体信号通路的影响 | 首次将社区暴力犯罪暴露与肺肿瘤中糖皮质激素受体染色质招募的重新编程联系起来 | 样本量较小(仅15个肺肿瘤样本),研究结果需要更大样本验证 | 研究社会压力暴露与肺肿瘤基因表达之间的关系 | 肺肿瘤样本和居住区暴力犯罪率 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学,CUT&RUN(ChIP测序技术) | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 15个肺肿瘤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 3278 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling and modeling of mouse brain at single-cell resolution reveals cell proximity effects of aging and rejuvenation
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.16.603809
PMID:39071282
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研究论文 | 通过单细胞空间转录组学构建小鼠大脑时空图谱,开发空间衰老时钟模型揭示衰老和 rejuvenation 过程中的细胞邻近效应 | 首次开发基于空间转录组学的机器学习模型(空间衰老时钟),系统揭示衰老过程中细胞对邻近细胞的影响机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类大脑的适用性需要进一步验证 | 探究大脑衰老过程中细胞间相互作用的分子机制及其对组织功能衰退的影响 | 小鼠大脑细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞空间转录组测序 | 深度学习, 机器学习 | 空间转录组数据 | 420万个细胞,来自20个不同年龄阶段的小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 3279 | 2025-10-07 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-06-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
|
研究论文 | 本研究探讨SOS1和MEK抑制剂联合治疗对KRASG12D胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及免疫治疗响应改善机制 | 首次揭示SOS1i+MEKi联合治疗通过调节iCAF和髓系细胞导致免疫抑制微环境,并提出CD40激动剂联合检查点阻断的新策略 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索KRAS靶向治疗对肿瘤微环境的影响及改善免疫治疗响应的组合策略 | KRASG12D/p53突变小鼠胰腺导管腺癌细胞系(KPCY)及荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KPCY细胞系及荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3280 | 2025-10-07 |
Flow Cytometry Analysis of Microglial Phenotypes in the Murine Brain During Aging and Disease
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5018
PMID:38948260
|
研究论文 | 开发了一种优化的流式细胞术方案,用于区分小鼠脑组织中四种不同的小胶质细胞表型 | 建立了无需细胞分选、成像或单细胞RNA测序就能区分四种小胶质细胞表型的流式细胞术方案,具有成本低、通量高的优势 | 该方法依赖于前期单细胞RNA测序研究确定的基因标记,可能需要特定多色检测能力的细胞分析仪 | 开发一种区分小胶质细胞表型的标准化流程 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞 | 免疫学 | 神经退行性疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据 | NA | Cytek | 流式细胞术 | Cytek Aurora | Cytek Aurora 5激光光谱流式细胞仪 |