单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 3241 - 3260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3241 | 2024-12-18 |
Building a FAIR data ecosystem for incorporating single-cell transcriptomics data into agricultural genome to phenome research
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1460351
PMID:39678381
|
研究论文 | 本文探讨了如何构建一个FAIR数据生态系统，将单细胞转录组学数据整合到农业基因组到表型研究中 | 本文利用人类基因组学基础设施的最新进展，开发了连接不同资源的数据工具，并扩展了功能以实现数据在不同平台间的传输和分析 | 本文仅描述了一个试点项目，未来需要进一步构建更完善的数据资源和分析生态系统 | 构建一个基于FAIR原则的科学家友好的数据资源和分析生态系统，以促进单细胞水平的基因组分析 | 单细胞转录组学数据在农业基因组到表型研究中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 包括植物、原生生物和动物（包括人类）的高通量测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3242 | 2024-12-18 |
Spatial transcriptomics and in situ immune cell profiling of the host ectocervical landscape of HIV infected Kenyan sex working women
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483346
PMID:39687623
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和多表位配体绘图技术，研究了HIV感染的肯尼亚性工作者宫颈外组织的免疫细胞图谱 | 首次结合空间转录组学和多表位配体绘图技术，深入分析了慢性HIV感染下宫颈外组织的免疫景观 | 样本仅来自肯尼亚的性工作者，可能限制了研究结果的普适性 | 研究慢性HIV感染对宫颈外组织免疫景观的影响 | HIV感染和未感染的肯尼亚女性性工作者的宫颈外组织 | 数字病理学 | HIV感染 | 空间转录组学，多表位配体绘图 | NA | 组织样本 | HIV阳性组和阴性组的宫颈外组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3243 | 2024-12-17 |
Inhibition of JNK Signaling Overcomes Cancer-Associated Fibroblast-Mediated Immunosuppression and Enhances the Efficacy of Immunotherapy in Bladder Cancer
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0940
PMID:39292817
|
研究论文 | 研究揭示了JNK信号通路在癌症相关成纤维细胞中介导的免疫抑制作用，并探讨了通过抑制JNK信号增强免疫治疗效果的策略 | 首次发现JNK信号通路在癌症相关成纤维细胞中通过上调胸腺基质淋巴细胞生成素（TSLP）表达来促进免疫抑制微环境，并提出抑制JNK信号与PD-1阻断联合治疗的新策略 | 研究主要集中在膀胱癌样本，结果的普适性需要进一步验证 | 探讨免疫抑制肿瘤微环境的机制，并寻找提高免疫治疗效果的新方法 | 膀胱癌中的癌症相关成纤维细胞（CAF）和CD8+ T细胞 | NA | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 膀胱癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3244 | 2024-12-17 |
A human forebrain organoid model reveals the essential function of GTF2IRD1-TTR-ERK axis for the neurodevelopmental deficits of Williams syndrome
2024-Dec-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98081
PMID:39671308
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研究论文 | 本文研究了Williams综合征患者前脑类器官模型中GTF2IRD1-TTR-ERK轴对神经发育缺陷的关键作用 | 首次揭示了GTF2IRD1通过调节TTR-ERK通路在前脑类器官和小鼠模型中调控神经发育的关键功能 | 研究主要集中在体外类器官模型和小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨Williams综合征神经发育缺陷的分子机制 | Williams综合征患者的前脑类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | Williams综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照和Williams综合征类器官的13个细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 3245 | 2024-12-17 |
Single-cell RNA sequencing reveals the important role of Dcaf17 in spermatogenesis of golden hamsters†
2024-Dec-12, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae132
PMID:39239833
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研究论文 | 本文研究了Dcaf17在金黄地鼠精子发生中的重要作用，通过单细胞RNA测序分析了Dcaf17缺失对不同精子发生阶段转录水平的影响 | 本文首次通过CRISPR-Cas9技术创建了Dcaf17缺陷的金黄地鼠模型，揭示了Dcaf17在精子发生中的关键调控作用，并提供了新的动物模型用于研究Dcaf17 | 本文仅在金黄地鼠模型中研究了Dcaf17的作用，未来需要进一步在其他物种中验证其普遍性 | 探讨Dcaf17在雄性生殖系统中的作用及其在精子发生中的分子机制 | Dcaf17缺陷的金黄地鼠及其精子发生过程 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Dcaf17缺陷的金黄地鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 3246 | 2024-12-17 |
Bgee in 2024: focus on curated single-cell RNA-seq datasets, and query tools
2024-Dec-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1118
PMID:39656924
|
研究论文 | 本文介绍了Bgee数据库的更新，重点是整合了经过精心筛选的单细胞RNA测序数据集，并提供了新的查询工具 | Bgee现在能够提供跨物种的基因表达模式比较，直至细胞分辨率，并且扩展了物种数量，增加了对鱼类、农业和兽医重要物种以及非人类灵长类动物的支持 | NA | 更新Bgee数据库，整合单细胞RNA测序数据，并提供新的查询工具 | 跨物种的基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及52个物种的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3247 | 2024-12-17 |
Exploring the Role of EBV Infection in EBV-T/NKLPD With EBV Capture Technology Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70094
PMID:39679761
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3248 | 2024-12-17 |
Inferring single-cell resolution spatial gene expression via fusing spot-based spatial transcriptomics, location, and histology using GCN
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae630
PMID:39656774
|
研究论文 | 提出了一种基于Vision Transformer和图卷积网络的多模态信息融合方法scstGCN，用于推断单细胞分辨率的空间基因表达 | scstGCN通过融合组织学图像、基于spot的空间转录组数据和空间位置信息，实现了单细胞水平的空间基因表达超分辨率推断 | NA | 提高空间转录组技术的分辨率，以更准确地推断基因表达水平 | 不同组织类型的空间转录组数据，包括疾病和健康样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | 图卷积网络（GCN） | 图像和文本 | 多种组织的ST数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3249 | 2024-10-09 |
Correction to: Single-cell RNA sequencing reveals the important role of Dcaf17 in spermatogenesis of golden hamsters
2024-Nov-11, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae144
PMID:39376075
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3250 | 2024-12-17 |
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics for Central Nervous System Disease
2024-Oct-10, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01499-w
PMID:39387975
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）在中枢神经系统（CNS）疾病研究中的应用 | 通过scRNA-seq和ST技术，揭示了CNS疾病的细胞异质性和功能特异性，发现了新的细胞类型或亚型，提出了新的病理生理机制，并发现了潜在的治疗靶点和生物标志物 | NA | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 中枢神经系统疾病，包括慢性神经退行性疾病和急性中枢神经系统损伤等 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3251 | 2024-12-17 |
A Bibliometric Analysis of the Spatial Transcriptomics Literature from 2006 to 2023
2024-Jun-10, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01484-3
PMID:38856921
|
综述 | 本文对2006年至2023年间的空间转录组学文献进行了文献计量分析，揭示了该领域的研究前沿和趋势 | 首次对空间转录组学领域进行了全面的文献计量分析，揭示了该领域的研究热点和全球合作网络 | 文献计量分析主要基于已发表的文献，可能无法全面反映该领域的所有研究动态 | 分析空间转录组学领域的研究前沿和趋势 | 2006年至2023年间发表的空间转录组学相关文献 | NA | NA | 文献计量分析 | NA | 文本 | 1467篇论文和综述 | NA | NA | NA | NA |
| 3252 | 2024-12-17 |
PhyloVelo enhances transcriptomic velocity field mapping using monotonically expressed genes
2024-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01887-5
PMID:37524958
|
研究论文 | PhyloVelo通过使用单调表达基因（MEGs）增强转录组速度场映射 | 引入PhyloVelo框架，利用单调表达基因（MEGs）估计转录组动力学的速度，并通过整合单细胞RNA测序数据与谱系信息重建转录组速度场 | NA | 提高在疾病条件下准确追踪细胞命运转变的能力 | 单细胞RNA测序数据和谱系信息 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 七个谱系追踪的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3253 | 2024-12-17 |
Single-cell transcriptomics unveil profiles and interplay of immune subsets in rare autoimmune childhood Sjögren's disease
2024-04-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06124-6
PMID:38641668
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了儿童罕见自身免疫性疾病Sjögren病的免疫亚群特征及其相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出儿童Sjögren病中的关键免疫细胞亚群，包括IFN基因富集的单核细胞、CD4 T效应记忆细胞和XCL1 NK细胞，并发现这些细胞在伴有复发性腮腺炎的儿童患者中尤为显著 | 研究仅限于儿童Sjögren病的外周免疫细胞，未涉及其他组织或器官的免疫细胞 | 揭示儿童Sjögren病的免疫细胞亚群及其相互作用，为精准医学奠定基础 | 儿童Sjögren病患者的免疫细胞亚群及其相互作用 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 3254 | 2024-12-17 |
SPADE: spatial deconvolution for domain specific cell-type estimation
2024-04-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06172-y
PMID:38632414
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SPADE的空间反卷积方法，用于在特定领域中估计细胞类型的组成 | SPADE通过整合空间模式到细胞类型组成的分析中，显著提升了对空间基因表达模式的理解 | NA | 理解不同细胞类型在其空间背景下的基因表达 | 细胞类型的组成及其在不同位置的比例 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、组织学数据 | 空间反卷积 | 基因表达数据 | 合成数据和真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3255 | 2024-12-16 |
Homoharringtonine synergizes with venetoclax in early T cell progenitor acute lymphoblastic leukemia: Bench and bed
2024-Dec-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.07.018
PMID:39151422
|
研究论文 | 研究评估了homoharringtonine（HHT）与venetoclax（VEN）联合治疗早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病（ETP-ALL）的协同效应及其机制 | 首次展示了HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的强协同效应，并通过单细胞RNA测序和western blot验证了其机制 | 研究样本量较小，仅包括6名患者，需要进一步的大规模临床试验验证 | 探索HHT与VEN联合治疗ETP-ALL的疗效及其机制 | 早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病（ETP-ALL）患者 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序，western blot | NA | 细胞 | 6名ETP-ALL患者 | NA | NA | NA | NA |
| 3256 | 2024-12-16 |
Single-cell transcriptomics of vomeronasal neuroepithelium reveals a differential endoplasmic reticulum environment amongst neuronal subtypes
2024-Dec-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98250
PMID:39670989
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析小鼠犁鼻器感觉上皮细胞，揭示了不同神经元亚型之间的内质网环境的差异 | 首次通过单细胞转录组学揭示了犁鼻器感觉上皮细胞中不同神经元亚型的内质网环境差异，并提供了可搜索的基因表达模式网络资源 | 研究仅限于小鼠犁鼻器感觉上皮细胞，未涉及其他物种或其他类型的细胞 | 探究犁鼻器感觉上皮细胞中的细胞类型、发育基因表达模式以及神经元之间的功能差异 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的神经元亚型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的多个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3257 | 2024-12-16 |
CAR T cells secreting NGF-neutralizing scFv enhance efficacy in clear cell renal cell carcinoma by relieving immunosuppression through immunosympathectomy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009910
PMID:39653553
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研究论文 | 本研究探讨了通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv来缓解肾透明细胞癌免疫抑制微环境，从而增强CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 首次提出通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv实现肿瘤免疫交感神经切除，从而减弱肿瘤微环境的免疫抑制 | 研究主要集中在肾透明细胞癌，其结果在其他类型肿瘤中的适用性尚不明确 | 探索通过免疫交感神经切除增强CAR T细胞在实体瘤中的疗效 | 肾透明细胞癌的免疫抑制微环境和CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 免疫学 | 肾癌 | RNA测序 | CAR T细胞 | RNA | 多种癌症类型的基因集和肾透明细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3258 | 2024-12-16 |
Multiomics reveals tumor microenvironment remodeling in locally advanced gastric and gastroesophageal junction cancer following neoadjuvant immunotherapy and chemotherapy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010041
PMID:39653554
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了局部晚期胃癌和胃食管交界癌在接受新辅助免疫治疗和化疗后肿瘤微环境的动态变化 | 首次通过多组学分析揭示了新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的动态变化，并构建了一个预测主要病理反应的模型 | 样本量较小，仅基于一个临床试验的数据，可能限制了结果的普适性 | 探讨新辅助免疫化疗对局部晚期胃癌和胃食管交界癌肿瘤微环境的影响及其机制 | 局部晚期胃癌和胃食管交界癌患者在接受新辅助免疫化疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序、全转录组测序、多重免疫荧光和单细胞RNA测序 | 回归模型 | 基因组数据、转录组数据、免疫细胞数据 | 30名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 3259 | 2024-12-16 |
Impact of Mitophagy-Related Genes on the Diagnosis and Development of Esophageal Squamous Cell Carcinoma via Single-Cell RNA-seq Analysis and Machine Learning Algorithms
2024-Nov-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2407.07052
PMID:39344350
|
研究论文 | 研究探讨了自噬相关基因在食管鳞状细胞癌诊断和预后中的作用，通过单细胞RNA测序和机器学习算法构建预测模型 | 首次通过单细胞RNA测序和机器学习算法构建了基于自噬相关基因的食管鳞状细胞癌预测模型，并验证了PYCARD基因在其中的关键作用 | 研究主要基于基因数据和机器学习模型，未涉及临床试验验证 | 探讨自噬相关基因在食管鳞状细胞癌诊断和预后中的作用，提供新的治疗策略 | 食管鳞状细胞癌及其自噬相关基因 | 机器学习 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因数据 | 169个自噬相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 3260 | 2024-12-16 |
Single-cell RNA-seq Reveals the Inhibitory Effect of Methamphetamine on Liver Immunity with the Involvement of Dopamine Receptor D1
2024-Oct-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae060
PMID:39196711
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序探讨甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的影响及多巴胺受体D1的参与 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的抑制作用，并发现多巴胺受体D1在其中的调节作用 | 研究仅限于慢性甲基苯丙胺暴露模型，未探讨急性暴露的影响 | 探讨甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的影响及多巴胺受体D1的参与 | 肝脏免疫细胞及多巴胺受体D1 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肝脏免疫细胞类型 | NA | NA | NA | NA |