单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 3221 - 3240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3221 | 2024-11-15 |
Integrative analysis of single-cell and bulk multi-omics data to reveal subtype-specific characteristics and therapeutic strategies in clear cell renal cell carcinoma patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101451
PMID:39513109
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量多组学数据，揭示了透明细胞肾细胞癌患者的亚型特异性特征和治疗策略 | 本研究创新性地结合了单细胞RNA测序和批量数据，识别出两种异质性亚型，并分析了其分子特征、免疫治疗反应和药物敏感性差异 | 本研究主要基于已有的数据集进行分析，未来需要更多的临床验证和实验数据来进一步验证和优化结果 | 揭示透明细胞肾细胞癌患者的亚型特异性特征和治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤亚型及其分子特征、免疫治疗反应和药物敏感性 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达、DNA甲基化和基因突变数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3222 | 2024-11-15 |
Immunofluorescence-Verified Sphingolipid Signatures Indicate Improved Prognosis in Liver Cancer Patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101330
PMID:39513103
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研究论文 | 本文通过多组学整合和免疫荧光验证，开发了一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型，并探讨了其在免疫治疗反应中的应用 | 首次通过多组学整合和免疫荧光验证，开发了一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型，并揭示了其在免疫治疗反应中的潜在应用 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的临床应用 | 开发一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型，并探讨其在免疫治疗反应中的应用 | 肝细胞癌患者及其预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq, AUCell算法, Cox比例风险模型, Lasso回归, 免疫荧光 | Cox比例风险模型, Lasso回归 | 基因表达数据 | 独立验证队列来自国际癌症基因组联盟（ICGC） | NA | NA | NA | NA |
| 3223 | 2024-11-14 |
Single cell RNA-seq reveals cellular and transcriptional heterogeneity in the splenic CD11b+Ly6Chigh monocyte population expanded in sepsis-surviving mice
2024-Nov-06, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00970-0
PMID:39506629
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研究论文 | 研究分析了在脓毒症幸存小鼠中扩增的脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症幸存小鼠脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 研究仅限于C57BL/6J和BALB/c小鼠模型，结果可能不适用于其他物种或人类 | 探讨脓毒症幸存者免疫失调的分子基础 | 脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57BL/6J和BALB/c小鼠的脾脏CD11b+Ly6Chigh细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3224 | 2024-11-14 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
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研究论文 | 研究探讨了在空间转录组数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提高细胞类型聚类性能 | 首次研究了将高变异基因与空间变异基因结合对细胞类型聚类性能的影响 | 仅在50个真实空间转录组数据集上进行了测试，可能需要更多数据集验证 | 探讨在空间转录组数据中，结合高变异基因与空间变异基因对细胞类型聚类性能的影响 | 空间转录组数据中的高变异基因和空间变异基因 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 50个真实空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3225 | 2024-11-14 |
Single-cell sequencing technology to characterize stem T-cell subpopulations in acute T-lymphoblastic leukemia and the role of stem T-cells in the disease process
2024-Oct-17, Aging
DOI:10.18632/aging.206123
PMID:39422621
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研究论文 | 研究使用单细胞测序技术分析急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病过程中的作用 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 探讨急性T淋巴母细胞白血病中干细胞T细胞亚群的特征及其在疾病过程中的作用 | 急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 来自公共数据库的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3226 | 2024-11-14 |
IKKα-STAT3-S727 axis: a novel mechanism in DOX-induced cardiomyopathy
2024-Sep-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05439-1
PMID:39287798
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研究论文 | 研究探讨了IKKα在DOX诱导的心肌病中的作用及其机制 | 发现了IKKα-STAT3-S727信号通路在DOX诱导的心肌病中的关键作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究IKKα如何调节巨噬细胞激活并导致DOX诱导的心肌病 | 巨噬细胞IKKα在小鼠模型中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用巨噬细胞特异性IKKα敲除小鼠进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 3227 | 2024-11-14 |
TWIST1+FAP+ fibroblasts in the pathogenesis of intestinal fibrosis in Crohn's disease
2024-Jul-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179472
PMID:39024569
|
研究论文 | 研究了克罗恩病中肠纤维化的发病机制，特别是TWIST1+FAP+成纤维细胞的作用 | 首次揭示了TWIST1+FAP+成纤维细胞在肠纤维化中的关键作用，并提出了通过抑制TWIST1来治疗克罗恩病纤维化的潜在策略 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，需要进一步的临床验证 | 探讨克罗恩病中肠纤维化的发病机制，并寻找有效的治疗策略 | 克罗恩病患者的纤维化和非纤维化回肠组织，以及小鼠的慢性葡聚糖硫酸钠盐结肠炎模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 克罗恩病患者和小鼠模型的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3228 | 2024-11-14 |
Differential CpG methylation at Nnat in the early establishment of beta cell heterogeneity
2024-Jun, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06123-6
PMID:38512414
|
研究论文 | 研究探讨了Nnat基因在β细胞异质性早期建立中的差异CpG甲基化机制 | 首次揭示了Nnat基因的差异甲基化在β细胞异质性建立中的作用 | NA | 探讨β细胞异质性建立的分子机制 | 胰腺β细胞及其亚群 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、亲和纯化质谱分析、钙成像 | NA | RNA、蛋白质 | 转基因小鼠和db/db小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 3229 | 2024-11-14 |
Comprehensive phenotypic and genomic characterization of venous malformations
2024-03, Human pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.humpath.2024.02.004
PMID:38367816
|
研究论文 | 研究静脉畸形（VMs）的表型和基因型特征，并探讨基因突变与临床病理特征之间的关系 | 首次系统地分析了TEK和PIK3CA基因突变与静脉畸形临床病理特征之间的关联，并揭示了基因特异性效应 | 研究样本量有限，且未涉及所有可能的基因突变类型 | 探讨静脉畸形中基因突变与临床病理特征之间的关联 | 静脉畸形患者及其基因突变和临床病理特征 | 数字病理学 | 血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因数据 | 114名静脉畸形患者 | NA | NA | NA | NA |
| 3230 | 2024-11-13 |
Spatial domains identification in spatial transcriptomics using modality-aware and subspace-enhanced graph contrastive learning
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.10.029
PMID:39507820
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研究论文 | 本文提出了一种基于图对比学习和子空间分析的框架GRAS4T，用于空间转录组学中的空间域识别 | 结合对比学习和子空间分析模型，通过捕捉同一域内点的自表达性来准确区分不同的空间域 | NA | 开发一种新的方法来提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组学数据中的空间域 | 空间转录组学 | NA | 图对比学习 | 图对比学习框架 | 空间转录组数据 | 八个来自五个不同平台的空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3231 | 2024-11-13 |
Shared and unique transcriptomic signatures of antidepressant and probiotics action in the mammalian brain
2024-Nov, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02619-0
PMID:38844534
|
研究论文 | 研究探讨了不同抗抑郁药物和益生菌对哺乳动物大脑不同区域的转录组影响 | 首次系统分析了抗抑郁药物和益生菌在哺乳动物大脑中的共同和独特转录组特征 | 研究仅限于特定药物和益生菌组合，未涵盖所有可能的治疗方案 | 揭示抗抑郁药物和益生菌在治疗情绪障碍中的共同和差异机制 | 抗抑郁药物（如安非他酮、地昔帕明、氟西汀）和益生菌（Lacidofil®）对大脑10个区域的影响 | 数字病理学 | 情绪障碍 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及10个大脑区域，每个区域-治疗组合平均有2211个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 3232 | 2024-11-13 |
Interpretable spatially aware dimension reduction of spatial transcriptomics with STAMP
2024-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02463-8
PMID:39407016
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STAMP的空间感知维度缩减方法，用于空间转录组学数据的高维基因表达测量 | STAMP基于深度生成模型，能够返回生物学上有意义的低维空间主题和相关基因模块，适用于多种数据类型和样本 | NA | 开发一种可解释的空间感知维度缩减方法，以获得空间转录组学数据的有意义的低维表示 | 空间转录组学数据，包括单个切片、多个切片、不同技术以及时间序列数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度生成模型 | NA | 基因表达数据 | 超过500,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3233 | 2024-11-13 |
The multifaceted role of mitochondria in cardiac function: insights and approaches
2024-Oct-29, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01899-x
PMID:39472951
|
综述 | 本文综述了线粒体在心脏功能中的多方面作用及其在心血管疾病中的重要性 | 讨论了线粒体异质性和亚群在维持心脏功能和疾病相关重塑中的作用，并强调了线粒体与核的逆向通讯 | 未提供具体的研究数据或实验结果 | 探讨线粒体在心脏功能中的作用及其在心血管疾病中的潜在治疗策略 | 线粒体及其在心脏功能和疾病中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究 (GWAS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3234 | 2024-11-13 |
Plasma proteometabolome in lung cancer: exploring biomarkers through bidirectional Mendelian randomization and colocalization analysis
2024-09-19, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae110
PMID:39011643
|
研究论文 | 研究利用孟德尔随机化方法探索肺癌相关的血浆蛋白质组和代谢组生物标志物 | 首次通过双向孟德尔随机化和共定位分析识别出与肺癌相关的血浆蛋白质和代谢物的新关联 | NA | 开发非侵入性诊断生物标志物以改善肺癌管理 | 血浆蛋白质组和代谢组 | 生物标志物 | 肺癌 | 孟德尔随机化 | NA | 蛋白质组学数据、代谢组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3235 | 2024-11-13 |
ADAMTS12 promotes fibrosis by restructuring extracellular matrix to enable activation of injury-responsive fibroblasts
2024-Sep-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170246
PMID:39286973
|
研究论文 | 研究揭示了ADAMTS12在纤维化过程中的作用，通过重构细胞外基质促进损伤响应性成纤维细胞的激活 | 首次发现ADAMTS12在纤维化中的关键作用，并阐明了其通过重构细胞外基质和切割HMCN1来激活特定成纤维细胞亚群的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证其结果 | 探讨ADAMTS12在纤维化中的作用及其分子机制 | ADAMTS12在心脏和肾脏纤维化中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 3236 | 2024-11-13 |
Predicting prognosis and immunotherapy response in colorectal cancer by pericytes insights from single-cell RNA sequencing
2024-07-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae064
PMID:38652261
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析，揭示了结直肠癌微环境中周细胞的功能及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 首次揭示了周细胞在结直肠癌微环境中的富集及其与不良预后和免疫治疗抵抗的关系 | 研究主要基于现有数据集，缺乏体内实验验证 | 探讨周细胞在结直肠癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 结直肠癌中的周细胞及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过1000个样本，包括453个免疫治疗数据集样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3237 | 2024-11-13 |
Mapping Somatosensory Afferent Circuitry to Bone Identifies Neurotrophic Signals Required for Fracture Healing
2024-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.06.597786
PMID:38895367
|
研究论文 | 研究描述了在骨折愈合过程中，感觉神经元如何介导骨骼再生，并确定了神经源性信号在骨折修复中的关键作用 | 首次详细描述了感觉神经元在骨折愈合中的神经解剖学通路，并揭示了神经源性FGF9在骨折修复中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床应用可能受限 | 探讨感觉神经元在骨折愈合中的作用机制，并确定关键的神经源性信号 | 小鼠的长骨骨折及其愈合过程 | 神经科学 | 骨折 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 6648个背根神经节神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 3238 | 2024-11-13 |
Peripheral HMGB1 is linked to O3 pathology of disease-associated astrocytes and amyloid
2024-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13825
PMID:38624088
|
研究论文 | 研究了臭氧（O3）对疾病相关星形胶质细胞和淀粉样蛋白病理的影响，并探讨了外周高迁移率族蛋白B1（HMGB1）在其中的作用 | 首次探讨了外周髓系细胞中的HMGB1在O3诱导的疾病相关星形胶质细胞表型中的作用 | NA | 探讨臭氧（O3）对阿尔茨海默病（AD）相关病理的影响及其机制 | 疾病相关星形胶质细胞（DAAs）和外周髓系细胞中的高迁移率族蛋白B1（HMGB1） | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学和蛋白质组学 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 5xFAD小鼠和Hmgb1fl/fl LysM-Cre+小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 3239 | 2024-11-13 |
FixNCut: single-cell genomics through reversible tissue fixation and dissociation
2024-03-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03219-5
PMID:38553769
|
研究论文 | 介绍了一种名为FixNCut的方法，用于可逆的组织固定和解离，以提高单细胞基因组学在临床应用中的鲁棒性和可重复性 | FixNCut方法克服了现有技术的局限性，能够在固定和解离过程中保持RNA完整性、测序库复杂性和细胞组成，同时减少应激相关的人工假象 | NA | 开发一种新的方法，以提高单细胞技术在临床应用中的鲁棒性和可重复性 | 人类和小鼠的组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3240 | 2024-11-13 |
Single-cell time series analysis reveals the dynamics of HSPC response to inflammation
2024-03, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302309
PMID:38110222
|
研究论文 | 研究了HSPC在炎症反应中的动态变化和异质性 | 开发了新的计算方法来处理和分析单细胞时间序列数据，包括无偏细胞类型注释和丰度分析、全局和细胞类型特异性响应基因的鉴定工具，以及用于响应伪时间重建的半监督线性回归方法 | NA | 研究HSPC在急性炎症中的动态变化 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 单细胞测序 | 半监督线性回归 | 单细胞时间序列数据 | 10,046个细胞，来自四个时间点，涵盖炎症反应的前72小时 | NA | NA | NA | NA |