单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-05-31 |
Targeting PLCG2 Suppresses Tumor Progression, Orchestrates the Tumor Immune Microenvironment and Potentiates Immune Checkpoint Blockade Therapy for Colorectal Cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.98200
PMID:39494327
|
研究论文 | 本文探究PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤免疫微环境和增强免疫检查点阻断治疗中的作用 | 首次发现PLCG2可作为结直肠癌精准生物标志物和治疗靶点，逆转免疫逃逸及免疫检查点阻断治疗耐药 | 未提及 | 研究PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤微环境及增强免疫检查点阻断治疗中的作用 | 结直肠癌患者及临床样本、细胞和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq、单细胞转录组、空间转录组、蛋白印迹、定量逆转录PCR、多色免疫荧光、多重免疫组化、流式细胞术、动物模型 | NA | 基因表达数据、图像 | 结直肠癌患者样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 302 | 2026-05-31 |
Reconstruction of the Hepatic Microenvironment and Pathological Changes Underlying Type II Diabetes through Single-Cell RNA Sequencing
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.99176
PMID:39494341
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序重建II型糖尿病肝脏微环境及病理变化 | 首次利用单细胞RNA-seq技术系统性地探索了两种T2DM小鼠模型中肝脏微环境的变化，揭示了肝星状细胞活化、Kupffer细胞新亚群及细胞间相互作用在糖尿病性MAFLD进展中的动态作用 | 研究对象仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；对某些基因（如Tgfb1i1、Txnip）的功能机制仍需进一步探索 | 阐明II型糖尿病并发代谢相关脂肪性肝病在不同阶段的肝脏微环境变化和病理机制 | II型糖尿病小鼠模型（两种）的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | II型糖尿病、代谢相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 两种T2DM小鼠模型肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 303 | 2026-05-31 |
Complement C1q is a key player in tumor-associated macrophage-mediated CD8+ T cell and NK cell dysfunction in malignant pleural effusion
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.100607
PMID:39664577
|
研究论文 | 本研究揭示了补体C1q在恶性胸腔积液中通过肿瘤相关巨噬细胞介导CD8+ T细胞和NK细胞功能障碍的关键作用 | 首次通过全基因和巨噬细胞特异性敲除小鼠模型提供C1q介导巨噬细胞促进肿瘤的直接证据，并阐明C1q通过CCR2-CCL2信号轴调控免疫抑制的机制 | 未明确说明研究局限性 | 探究C1q在恶性胸腔积液中巨噬细胞介导的免疫抑制机制 | 小鼠恶性胸腔积液模型及C1q缺陷巨噬细胞 | 机器学习 | 恶性胸腔积液 | scRNA-seq, 代谢组学分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | C1qa小鼠MPE模型（具体样本数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 304 | 2026-05-30 |
Reliable estrogen-related prognostic signature for uterine corpus endometrial carcinoma
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究探索子宫体子宫内膜癌(UCEC)中关键的雌激素相关基因(ERGs)，并构建可靠的预后风险评分 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA数据识别出8个雌激素相关基因构建预后风险评分，并发现其与免疫微环境及药物敏感性相关 | 未提及外部验证队列，且样本来源可能存在偏倚 | 探索子宫体子宫内膜癌中关键的雌激素相关基因并建立预后预测模型 | 子宫体子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序 | LASSO Cox回归、多元Cox回归 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本量，数据来源包括GEO和TCGA数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 305 | 2026-05-30 |
Highlighting roles of autophagy in human diseases: a perspective from single-cell RNA sequencing analyses
2024-12, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2024.104224
PMID:39521332
|
综述 | 该综述探讨了自噬在人类疾病中的作用，并从单细胞RNA测序分析的角度进行了阐述 | 利用单细胞RNA测序技术揭示自噬通路在多种生理和病理背景下的转录景观，提供了分子层面的新视角 | 未明确说明具体局限性 | 总结单细胞RNA测序在自噬研究中的最新进展，并强调其在多种疾病分子特征研究中的潜力 | 自噬相关的人类疾病 | 单细胞转录组学 | 癌症及其他疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-05-30 |
Polyclonal regeneration of mouse bone marrow endothelial cells after irradiative conditioning
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114779
PMID:39489938
|
research paper | 研究照射预处理后小鼠骨髓内皮细胞的多克隆再生机制 | 利用单细胞RNA测序、成像、流式细胞术及体外克隆形成实验和Rainbow小鼠模型，首次揭示了骨髓内皮细胞在照射损伤后再生过程中的细胞和克隆机制，特别是其多克隆再生特性 | 未具体说明研究的局限性 | 探究照射预处理后骨髓内皮细胞的细胞和克隆再生机制 | 小鼠骨髓内皮细胞 | machine learning | NA | 单细胞RNA测序, 成像, 流式细胞术, 体外克隆形成实验 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据, 流式细胞术数据 | 使用了Rainbow小鼠模型，具体样本数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台具体配置未详述 |
| 307 | 2026-05-30 |
An estrogen receptor signaling transcriptional program linked to immune evasion in human hormone receptor-positive breast cancer
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.23.619172
PMID:39651157
|
研究论文 | 本文探讨了雌激素受体信号转录程序与激素受体阳性乳腺癌免疫逃逸的关联机制 | 首次通过整合多种转录组学和多重免疫荧光技术，揭示雌激素受体信号基因模块与TNFα/NF-κB及I型干扰素免疫通路负相关，并阐明其通过抑制抗原呈递降低T细胞浸润的机制 | 未明确列出具体局限性，但可能包括样本量有限或机制验证不足 | 探究激素受体阳性乳腺癌中T细胞稀疏的驱动机制，特别是雌激素受体信号与免疫逃逸的关系 | 激素受体阳性乳腺癌组织、细胞系及患者相关样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组测序、单细胞转录组测序、多重免疫荧光 | NA | 转录组数据、图像数据 | 多来源临床乳腺癌组织样本及人类细胞系，具体数量未说明 | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 308 | 2026-05-30 |
Mesoscopic structure graphs for interpreting uncertainty in non-linear embeddings
2024-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109105
PMID:39265479
|
研究论文 | 提出基于节点链接的可视化技术ManiGraph，通过构建动态介观结构图来解读非线性降维中的不确定性 | 首次通过动态介观结构图重新评估高低维空间之间的邻域保真度，并引入区域自适应的可信度度量 | 未明确提及，但散点图可视化的过度绘制问题在大规模数据集上仍有挑战 | 解决概率非线性降维方法中虚假邻域关系导致的误导性可视化问题 | 高维数据的低维嵌入可视化结果 | 计算机视觉 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 单细胞RNA测序数据集及组织病理学-MNIST数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2026-05-30 |
Proximogram-A multi-omics network-based framework to capture tissue heterogeneity integrating single-cell omics and spatial profiling
2024-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109082
PMID:39255657
|
研究论文 | 提出了一种名为Proximogram的基于图的多组学网络框架，整合单细胞组学和空间数据以捕获组织异质性 | 首次提出Proximogram图表示方法，能够将独立获取的组学数据和空间数据整合到统一框架中，并通过图深度学习模型提高疾病分类性能 | 未提及具体局限性 | 开发一种可定制且可扩展的方法，联合利用多模态生物数据以提升疾病诊断能力 | 来自正常、慢性胰腺炎和胰腺导管腺癌患者的复用免疫荧光图像和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 图深度学习模型 | 图像 | 两种胰腺疾病患者样本，包括正常、慢性胰腺炎和胰腺导管腺癌 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 310 | 2026-05-30 |
Glycoengineered extracellular vesicles released from antibacterial hydrogel facilitate diabetic wound healing by promoting angiogenesis
2024-Nov, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70013
PMID:39600241
|
研究论文 | 研究了一种由明胶甲基丙烯酰、糖工程化细胞外囊泡和聚赖氨酸组成的新型水凝胶敷料，通过促进血管生成来治疗感染的糖尿病伤口 | 通过糖工程化改造细胞外囊泡表面表达sLeX配体，增强其靶向E-选择素的能力，并结合水凝胶实现持续释放，用于糖尿病伤口治疗 | 研究局限于小鼠模型，临床转化尚需进一步验证 | 开发一种新型水凝胶敷料，利用糖工程化细胞外囊泡促进糖尿病伤口愈合 | 糖尿病伤口、细胞外囊泡、血管生成、E-选择素 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、慢病毒转染 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台 |
| 311 | 2026-05-30 |
RIPK3 causes mitochondrial dysfunction and albuminuria in diabetic podocytopathy through PGAM5-Drp1 signaling
2024-10, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2024.155982
PMID:39089491
|
研究论文 | 研究RIPK3通过PGAM5-Drp1信号通路导致糖尿病足细胞病变中线粒体功能障碍和蛋白尿的机制 | 首次揭示RIPK3在糖尿病肾病的足细胞损伤中通过PGAM5-Drp1信号调控线粒体分裂，并证明血浆RIPK3水平可作为肾功能恶化的生物标志物 | 未明确说明 | 阐明RIPK3在糖尿病肾病肾小球损伤中的作用及其分子机制 | 糖尿病肾病患者、2型糖尿病前瞻性观察队列、高脂饮食诱导的Ripk3敲除和野生型小鼠、系膜细胞及永生化足细胞 | NA | 糖尿病肾病 | ELISA、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床生化指标 | 活检确诊的糖尿病肾病患者（数量未明确）、2型糖尿病前瞻性队列（数量未明确）、Ripk3敲除和野生型小鼠（数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2026-05-30 |
Single-cell analysis of tumor microenvironment and cell adhesion reveals that interleukin-1 beta promotes cancer cell proliferation in breast cancer
2024-10, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12445
PMID:38860503
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示白细胞介素1β在三阴性乳腺癌中促进癌细胞增殖的机制 | 首次发现浆细胞通过细胞间粘附分子2-整合素aLb2复合物与T细胞相互作用，释放IL1B促进TNBC肿瘤生长，并鉴定IL1B为新的预后标志物 | 未明确说明 | 探究浆细胞在三阴性乳腺癌肿瘤微环境中调控肿瘤迁移进展的作用 | 三阴性乳腺癌样本中的浆细胞和肿瘤微环境 | 机器学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5个HER2阳性、12个ER阳性/PR阳性和9个TNBC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2026-05-30 |
TGF-β1 mediates hypoxia-preconditioned olfactory mucosa mesenchymal stem cells improved neural functional recovery in Parkinson's disease models and patients
2024-07-22, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00550-7
PMID:39034405
|
研究论文 | 本文研究了低氧预处理嗅黏膜间充质干细胞通过TGF-β1信号通路改善帕金森病模型和患者的神经功能恢复 | 首次在临床级低氧预处理嗅黏膜间充质干细胞治疗帕金森病的研究中，结合单细胞RNA测序、ATAC-seq和全长转录本异构体测序等多种技术，揭示TGF-β1通过激活ALK/PI3K/Akt信号通路调节小胶质细胞免疫调节和线粒体功能恢复的机制，并开展了I期首次人体临床试验 | I期临床试验样本量较小，需要更大规模临床试验进一步验证安全性和有效性 | 探索低氧预处理嗅黏膜间充质干细胞对帕金森病模型和患者的神经功能恢复作用及其机制 | 帕金森病模型（小鼠）和帕金森病患者 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 全长转录本异构体测序 | NA | NA | I期临床试验中严重帕金森病患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 314 | 2026-05-30 |
MR1-restricted T cell clonotypes are associated with "resistance" to Mycobacterium tuberculosis infection
2024-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.166505
PMID:38716731
|
研究论文 | 本研究探讨MR1限制性T细胞克隆型与结核分枝杆菌感染抵抗性的关联 | 首次揭示MR1限制性T细胞克隆型在结核感染抵抗者中富集，并发现其通过TCR依赖方式识别分枝杆菌感染细胞 | 仅涉及8名捐赠者的样本，且未明确功能验证机制 | 阐明供体非限制性T细胞（DURTs）与结核感染抵抗性的关系 | 乌干达结核病例家庭接触者中的抵抗者（RSTRs）和潜伏感染者（LTBIs） | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 8名捐赠者的18,251个MR1T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于MR1T细胞的转录组分析 |
| 315 | 2026-05-30 |
High-Frequency Spinal Stimulation Suppresses Microglial Kaiso-P2X7 Receptor Axis-Induced Inflammation to Alleviate Neuropathic Pain in Rats
2024-05, Annals of neurology
IF:8.1Q1
DOI:10.1002/ana.26898
PMID:38450773
|
研究论文 | 该文章通过建立临床前脊髓刺激模型，发现高频脊髓刺激可通过抑制小胶质细胞中Kaiso-P2X7受体轴介导的炎症反应，从而缓解大鼠神经病理性疼痛 | 揭示了10kHz高频脊髓刺激通过调控小胶质细胞Kaiso-P2X7R通路减轻神经炎症的新机制，并证明靶向该通路可增强传统脊髓刺激的治疗效果 | 研究仅基于大鼠模型，临床转化仍需验证；未深入探讨HF10 SCS对其他类型免疫细胞或长期效应的具体影响 | 探究高频脊髓刺激缓解神经病理性疼痛的潜在机制，为优化临床脊髓刺激治疗方案提供科学依据 | 神经病理性疼痛大鼠模型的脊髓背角组织及小胶质细胞 | 机器学习 | 神经病理性疼痛 | 大量RNA测序, 单细胞RNA测序, 慢病毒系统基因操作 | NA | 测序数据, 行为学数据 | 神经病理性疼痛大鼠模型样本，未明确具体数量 | Illumina | 大量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina测序平台 | 未提供具体平台配置详情 |
| 316 | 2026-05-30 |
Shotgun lipidomics of human subretinal fluids under rod-dominant retina reveals cone-dominated lipids
2024-03, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109807
PMID:38278468
|
研究论文 | 使用鸟枪法脂质组学鉴定孔源性视网膜脱离患者视网膜下液中的脂质分子，发现其与视锥细胞外节脂质谱相似 | 首次对孔源性视网膜脱离患者视网膜下液进行全面的脂质分子鉴定，并通过与公开单细胞测序数据对比，提出视锥细胞外节降解产物持续释放到光感受器间基质的假设 | 样本量只有两例患者，脂质来源的验证主要依赖公开数据库的基因表达数据，缺乏直接证据 | 阐明孔源性视网膜脱离患者视网膜下液中的脂质成分及其来源，为外视网膜相关疾病发病机制提供线索 | 孔源性视网膜脱离患者视网膜下液样本中的脂质分子 | 数字病理学 | 视网膜疾病（孔源性视网膜脱离） | 鸟枪法脂质组学、质谱、串联质谱、电喷雾电离四极杆飞行时间质谱 | NA | 质谱数据、单细胞测序数据 | 2例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2026-05-30 |
Single-cell transcriptomics analysis of cellular heterogeneity and immune mechanisms in neurodegenerative diseases
2024-02, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16242
PMID:38221677
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学分析在神经退行性疾病中细胞异质性和免疫机制研究中的应用 | 深入探讨了单细胞转录组学技术在揭示神经退行性疾病中细胞异质性和免疫调控机制方面的最新进展 | NA | 强调单细胞转录组学技术的原理及其在神经退行性疾病细胞异质性和免疫机制研究中的最新进展 | 神经退行性疾病中的单细胞转录组 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2026-05-29 |
Neuronal cell populations in circumoral nerve ring of sea cucumber Apostichopus japonicus: Ultrastructure and transcriptional profile
2024-12, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101263
PMID:38850626
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究了仿刺参围口神经环中神经元的超微结构和转录谱，鉴定出六种神经元细胞类型 | 首次对海参神经元细胞进行单细胞转录组分析，鉴定了六种神经元类型及神经肽前体基因和G蛋白偶联受体的表达模式 | 仅聚焦于围口神经环区域，未涵盖海参其他神经组织；尚未对鉴定出的神经元类型进行功能验证 | 阐明海参神经元细胞的类型、分子特征和进化意义 | 仿刺参（Apostichopus japonicus）围口神经环中的神经元细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2026-05-29 |
Dual spatial host-bacterial gene expression in Mycobacterium abscessus respiratory infections
2024-10-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06929-5
PMID:39384974
|
研究论文 | 该文章展示了在福尔马林固定石蜡包埋组织中利用定制细菌探针进行空间转录组学分析，以同时检测宿主和细菌基因表达的方法 | 首次在FFPE组织中成功实现宿主和病原体双空间转录组分析，揭示了宿主-病原体相互作用的时空信息 | 研究基于小鼠模型和特定细菌（脓肿分枝杆菌），可能未涵盖所有感染类型 | 探索使用定制细菌探针在FFPE组织中进行宿主和病原体空间转录组分析的可行性 | 慢性感染脓肿分枝杆菌的小鼠肺组织 | 空间转录组学 | 分枝杆菌感染 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肺组织样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium FFPE空间转录组学平台 |
| 320 | 2026-05-29 |
Imputing spatial transcriptomics through gene network constructed from protein language model
2024-10-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06964-2
PMID:39369061
|
研究论文 | 提出stImpute方法，利用蛋白质语言模型ESM-2构建基因网络，基于参考单细胞RNA-seq数据对空间转录组学进行基因表达插补 | 首次将蛋白质语言模型ESM-2用于构建基因-基因关系网络，结合自编码器和图神经网络提升空间转录组学基因插补准确性和细胞聚类能力 | 未明确阐述局限性，但依赖参考scRNA-seq数据质量，且仅适用于有限基因检测的空间转录组学技术 | 开发一种基于基因网络的空间转录组学缺失基因插补方法，提升预测准确性和细胞群体识别能力 | 图像型空间转录组学数据与参考单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序、单细胞RNA测序 | 自编码器、图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |