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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-01-23 |
Bacterial phenotypic heterogeneity through the lens of single-cell RNA sequencing
2024 Feb-Apr, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2024.2334110
PMID:38532542
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在研究细菌表型异质性方面的应用与前景 | 将单细胞转录组学技术应用于微生物群体，为研究细胞分化和细菌生态学提供了新的视角 | 作为一篇综述文章，未涉及具体实验数据或方法验证 | 探讨细菌转录异质性及其在微生物系统中的作用 | 细菌群体及其转录异质性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 302 | 2026-01-22 |
Matrine induces V-ATPase-dependent cytoplasmic vacuolation and inhibits the function of the lysosome in leukemia cells
2024-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2023.100013
PMID:41550167
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研究论文 | 本文研究了苦参碱通过诱导V-ATPase依赖性细胞质空泡化并抑制溶酶体功能来抑制白血病细胞增殖的新分子机制 | 揭示了苦参碱通过质子化激活V-ATPase导致溶酶体功能抑制和空泡形成的新机制 | NA | 探究苦参碱抑制白血病细胞增殖的分子机制 | 白血病细胞 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序, 透射电子显微镜, 荧光显微镜, 蛋白质印迹, 流式细胞术 | NA | RNA-seq数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 303 | 2026-01-22 |
Schizophrenia endothelial cells exhibit higher permeability and altered angiogenesis patterns in patient-derived organoids
2024-01-23, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-02740-2
PMID:38263175
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研究论文 | 本研究利用精神分裂症患者来源的iPSCs生成3D脑类器官，通过单细胞RNA测序发现其内皮细胞比例增加，并揭示了基因表达、血管结构和通透性的异常变化 | 首次在患者来源的脑类器官模型中系统揭示了精神分裂症内皮细胞的高通透性和血管生成模式改变，为疾病病因提供了新视角 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本量相对有限（23名供体） | 探究精神分裂症中内皮/血管功能障碍对疾病发展的贡献 | 精神分裂症患者和健康对照者来源的诱导多能干细胞生成的3D脑类器官 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、显微图像数据 | 23名供体（患者与健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 304 | 2026-01-21 |
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Dec-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5398491/v1
PMID:39711562
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DBiTplus的整合多模态空间组学方法，结合了基于测序的空间转录组学和基于成像的空间蛋白质分析，用于在同一组织切片上进行单细胞分辨率细胞分型和基因组尺度生物通路研究 | 开发了DBiTplus方法，首次在同一组织切片上整合了测序和成像两种空间组学技术，实现了单细胞分辨率的转录组和蛋白质组空间图谱构建 | 在应用示例中，小鼠胚胎研究使用了有限的蛋白质标记物，可能限制了蛋白质分析的全面性 | 开发一种整合多模态空间组学方法，以在同一组织切片上同时分析转录组和蛋白质组空间信息 | 小鼠胚胎、正常人类淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织 | 空间组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质分析、微流体技术 | NA | 空间转录组数据、蛋白质成像数据 | 多个组织样本，包括小鼠胚胎、人类淋巴结和淋巴瘤FFPE组织 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质分析 | DBiTplus、CODEX | DBiTplus整合了测序和成像技术，CODEX用于高多重蛋白质成像 |
| 305 | 2026-01-21 |
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.07.622523
PMID:39605581
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研究论文 | 本文介绍了DBiTplus，一种整合成像和测序的空间组学方法，用于在同一组织切片上同时进行空间转录组学和蛋白质谱分析 | DBiTplus通过微流体DNA寡核苷酸递送和RNaseH处理，首次实现了测序基空间转录组学与成像基高复用蛋白质谱在同一组织切片上的整合，支持单细胞分辨率细胞分型和基因组尺度生物通路探索 | 在应用示例中，小鼠胚胎研究使用了有限的蛋白质标记物，可能影响蛋白质谱的全面性 | 开发一种多模态空间组学方法，以整合空间转录组学和蛋白质谱，促进对异质性细胞过程的理解 | 小鼠胚胎、正常人淋巴结和人类淋巴瘤FFPE组织 | 空间组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质谱、微流体技术、RNaseH处理 | NA | 空间转录组数据、蛋白质成像数据 | 包括小鼠胚胎、正常人淋巴结和人类淋巴瘤FFPE组织，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞空间转录组学、空间蛋白质谱 | DBiTplus、CODEX | DBiTplus结合了测序基空间转录组学和CODEX高复用蛋白质成像技术，使用微流体DNA寡核苷酸进行空间条形码编码 |
| 306 | 2026-01-21 |
Single cell RNA-sequencing identifies the effect of Normothermic ex vivo liver perfusion on liver-resident T cells
2024-10, Transplant immunology
IF:1.6Q3
DOI:10.1016/j.trim.2024.102104
PMID:39128812
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了常温体外肝脏灌注对肝脏驻留记忆T细胞的影响，并评估了抗炎细胞因子在减少T细胞激活中的作用 | 首次在大鼠肝脏中创建了肝脏驻留记忆T细胞的图谱，并在单细胞基因表达水平上展示了常温体外肝脏灌注对T细胞的影响 | 研究仅基于大鼠模型，未涉及人类样本，且样本规模有限，可能影响结果的普适性 | 研究常温体外肝脏灌注对肝脏驻留记忆T细胞表型的影响，并评估抗炎细胞因子在灌注过程中的保护作用 | 大鼠肝脏及其中的组织驻留记忆T细胞 | 单细胞测序 | 肝脏移植相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大鼠肝脏样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 307 | 2026-01-21 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.26.600782
PMID:38979296
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STAN的计算框架，用于从空间转录组学数据中推断空间信息化的转录因子活性 | STAN是一种线性混合效应计算方法，首次整合了转录因子-靶基因先验知识、mRNA表达、空间坐标和形态学特征，以预测斑点特异性的空间转录因子活性 | NA | 系统性地估计调控细胞身份的转录因子活性，并揭示转录因子与空间组织之间的相互作用 | 淋巴结、乳腺癌和胶质母细胞瘤的空间转录组学数据集 | 计算生物学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组学数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 308 | 2026-01-21 |
The Transcriptional Landscape of Pericytes in Acute Ischemic Stroke
2024-08, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-023-01169-x
PMID:37378751
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在小鼠永久性大脑中动脉闭塞模型中，探究了缺血性卒中后1、12和24小时周细胞转录组特征的时间差异 | 首次在急性缺血性卒中模型中，通过单细胞RNA测序揭示了周细胞在卒中后特定时间点（12和24小时）出现一个独特的亚群，该亚群以细胞因子信号和免疫反应相关基因上调为特征 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中得到验证；且仅关注了急性期（24小时内）的变化，未涉及更长期的转录组动态 | 探究急性缺血性卒中后周细胞的转录组变化，以寻找潜在的治疗靶点 | 小鼠模型中的周细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠永久性大脑中动脉闭塞模型在卒中后1、12和24小时的时间点样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 309 | 2026-01-21 |
Deciphering the molecular landscape of human peripheral nerves: implications for diabetic peripheral neuropathy
2024-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.15.599167
PMID:38915676
|
研究论文 | 本研究通过批量与空间RNA测序分析人类胫神经和腓肠神经，揭示了糖尿病周围神经病变的分子机制和细胞转录组变化 | 首次结合批量与空间转录组学分析人类周围神经，发现感觉轴突mRNA运输在神经退行中的潜在作用 | 样本主要来自糖尿病患者截肢手术，可能无法完全代表早期或轻度病变 | 深入探究糖尿病周围神经病变的分子机制和细胞变化 | 人类胫神经和腓肠神经 | 数字病理学 | 糖尿病周围神经病变 | 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 来自下肢截肢手术的胫神经和腓肠神经样本，主要来自糖尿病患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 310 | 2026-01-21 |
SLC45A3 Serves as a Potential Therapeutic Biomarker to Attenuate White Matter Injury After Intracerebral Hemorrhage
2024-06, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-023-01145-5
PMID:36913120
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和动物实验，发现SLC45A3基因在脑出血后白质损伤中作为潜在治疗生物标志物，其过表达可减轻脑损伤 | 首次结合加权基因共表达网络分析、差异表达基因筛选及单细胞RNA-seq技术，系统鉴定SLC45A3在脑出血后白质损伤中的关键作用，并验证其治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据集，尚未在人类临床样本中进行验证，且具体分子机制需进一步探索 | 探究脑出血后白质损伤的分子机制，并寻找潜在治疗靶点 | 脑出血小鼠模型（自体血或胶原酶诱导）及公共基因表达数据集（GSE24265、GSE125512、GSE167593） | 生物信息学与神经科学 | 脑血管疾病（脑出血） | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、差异表达基因分析、单细胞RNA-seq、扩散张量成像（DTI）、基础医学实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、影像数据 | 两个公共数据集（GSE24265和GSE125512）及一个单细胞RNA-seq数据集（GSE167593），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 311 | 2026-01-17 |
Single-Cell Analysis Reveals a Subset of High IL-12p40-Secreting Dendritic Cells within Mouse Bone Marrow-Derived Macrophages Differentiated with M-CSF
2024-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300431
PMID:38416039
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了在小鼠骨髓来源巨噬细胞中，存在一个高分泌IL-12p40的树突状细胞亚群 | 首次在M-CSF分化的巨噬细胞培养物中识别出一个转录独特的DC样亚群，该亚群在LPS刺激下表现出典型的DC激活程序 | 研究基于体外小鼠BMDM培养模型，可能无法完全反映体内情况；且该DC样亚群无法通过表面标记物分离 | 探究巨噬细胞与树突状细胞在先天免疫中的异质性和功能重叠 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）及其中的细胞亚群 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序，微孔分泌检测 | NA | RNA测序数据，基因表达数据 | 小鼠骨髓来源细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 312 | 2026-01-16 |
Computational methods for allele-specific expression in single cells
2024-11, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.07.003
PMID:39127549
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综述 | 本文综述了单细胞等位基因特异性表达（ASE）数据的计算处理方法，包括从原始读取到统计分析的完整流程 | 系统总结了单细胞ASE分析的计算方法，并强调了集成优化生物信息学流程和统计方法进一步发展的需求 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或算法，主要基于现有文献进行归纳 | 综述单细胞等位基因特异性表达的计算分析方法及其在生物学问题中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的等位基因特异性表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2026-01-16 |
Unveiling contact-mediated cellular crosstalk
2024-10, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.05.010
PMID:38906738
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综述 | 本文探讨了细胞间相互作用在复杂生物功能中的作用，并综述了单细胞测序、空间转录组学等前沿技术如何革新我们对细胞间通讯的理解 | 整合了单细胞测序、空间转录组学与生物工程工具，提供了分析细胞接触介导基因表达变化的新视角 | 作为综述文章，未涉及具体实验数据或方法验证 | 解析细胞间接触如何调控细胞反应网络 | 多细胞生物中的细胞间相互作用 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 314 | 2026-01-16 |
APOE ε4-associated downregulation of the IL-7/IL-7R pathway in effector memory T cells: Implications for Alzheimer's disease
2024-09, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14173
PMID:39129310
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研究论文 | 本研究探讨了APOE ε4等位基因通过下调IL-7/IL-7R通路影响效应记忆T细胞，从而加剧阿尔茨海默病中海马萎缩的机制 | 首次揭示了APOE ε4等位基因与IL-7/IL-7R通路下调在效应记忆T细胞中的关联，并建立了血浆IL-7水平与海马萎缩程度的负相关关系 | 样本量较小（仅54名患者），且为横断面研究，无法确定因果关系 | 探究APOE ε4等位基因影响外周炎症和神经炎症的潜在机制 | 晚发性阿尔茨海默病患者（包括APOE ε4携带者和非携带者） | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 54名患者（28名APOE ε4携带者，26名非携带者） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2026-01-16 |
Discovering mechanisms of human genetic variation and controlling cell states at scale
2024-07, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.03.010
PMID:38658256
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评论 | 本文探讨了单细胞测序在揭示人类遗传变异机制和控制细胞状态方面的潜力 | 提出将单细胞测序用于大规模构建变异效应表型图谱，并将遗传变异解释方法应用于工程化治疗性细胞状态 | NA | 加速人类遗传变异机制发现并推动基因组医学发展 | 人类遗传变异和细胞状态 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 316 | 2026-01-16 |
Single-cell phylotranscriptomics of developmental and cell type evolution
2024-06, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.02.005
PMID:38490933
|
综述 | 本文总结了单细胞系统转录组学在揭示发育和细胞类型进化分子机制中的应用 | 利用单细胞系统转录组学分析，揭示了发育过程中谱系和细胞类型间转录组年龄的异质性，并识别了驱动整体生物钟形模式的谱系和组织 | NA | 探讨单细胞系统转录组学在理解发育进化模式和细胞类型进化史中的作用 | 发育过程中的谱系、细胞类型和组织 | 计算生物学 | NA | 单细胞系统转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 317 | 2026-01-16 |
The Transpeptidase Sortase A Binds Nucleic Acids and Mediates Mammalian Cell Labeling
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305605
PMID:38581131
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研究论文 | 本文发现金黄色葡萄球菌的转肽酶Sortase A能与核酸结合，并基于此开发了CellID技术用于单细胞RNA测序中的样本多重标记 | 首次揭示了Sortase A与核酸的未知相互作用，并利用这一特性开发了新的细胞标记技术CellID | 未详细探讨Sortase A与核酸结合的具体分子机制，且技术应用潜力尚未完全验证 | 探索Sortase A的非经典功能及其在生物技术中的应用 | 金黄色葡萄球菌Sortase A蛋白、哺乳动物细胞、核酸寡核苷酸 | 生物技术 | NA | CRISPR筛选、scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2026-01-15 |
Single-cell spatial transcriptomics of fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.11.623014
PMID:39605355
|
研究论文 | 本研究开发并优化了一种基于成像的单细胞空间转录组学框架，用于分析存档的福尔马林固定石蜡包埋活检样本，以揭示结肠炎相关的细胞网络 | 首次对三种能够分析FFPE样本的单细胞空间转录组学平台进行全面基准比较，并开发了一个统一的处理流程，成功应用于长达5年历史的临床存档样本 | 研究样本量相对有限（n=57），且仅针对炎症性肠病，可能限制了结果的普遍适用性 | 开发一个稳健的框架，将基于成像的单细胞空间转录组学应用于存档的临床FFPE黏膜活检样本，以研究炎症性肠病的细胞网络 | 来自非IBD对照和溃疡性结肠炎患者的FFPE黏膜活检样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 57例FFPE黏膜活检样本（包括9例非IBD对照和11例溃疡性结肠炎患者） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | 自定义290-plex Xenium基因面板 |
| 319 | 2026-01-15 |
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4536158/v1
PMID:38978567
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TACIT的无监督算法，用于空间生物学中的细胞类型和状态注释，无需训练数据，并在多个数据集中验证了其准确性和可扩展性 | 开发了TACIT算法，这是一种无监督方法，利用预定义签名进行细胞注释，无需训练数据，并通过无偏阈值处理区分阳性细胞与背景，专注于相关标记以识别多组学检测中的模糊细胞 | 未明确说明算法的计算资源需求或处理大规模数据时的潜在限制 | 解决空间生物学中细胞类型和状态识别的时间消耗和易错挑战，提高注释的准确性和可扩展性 | 细胞类型和细胞状态，涉及大脑、肠道和腺体三个生态位 | 空间生物学 | 炎症性腺体疾病 | 空间转录组学和空间蛋白质组学 | 无监督算法 | 空间多组学数据 | 五个数据集，总计5,000,000个细胞，涉及51种细胞类型 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 320 | 2026-01-15 |
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596861
PMID:38895230
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TACIT的无监督算法，用于空间生物学中的细胞类型和状态注释，无需训练数据，通过预定义签名和阈值区分细胞，并在多个数据集中验证其准确性和可扩展性 | 开发了TACIT算法，这是一种无监督方法，利用预定义签名和阈值区分细胞，无需训练数据，能处理细胞、邻域和生态位层面的变异性，在多组学分析中识别模糊细胞 | NA | 解决空间生物学中细胞类型和状态注释的耗时和易错挑战，提高注释的准确性和可扩展性 | 细胞类型和状态，包括来自大脑、肠道和腺体等生态位的细胞 | 空间生物学 | 炎症性腺体疾病 | 空间转录组学和蛋白质组学 | 无监督算法 | 空间多组学数据 | 5个数据集，涉及5,000,000个细胞和51种细胞类型 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |