单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202401-202412] [清除筛选条件]
当前共找到 7466 篇文献,本页显示第 3041 - 3060 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3041 2024-11-25
OSCC-derived EVs educate fibroblasts and remodel collagen landscape
2024-Dec, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology IF:4.5Q2
研究论文 研究探讨了口腔鳞状细胞癌(OSCC)来源的细胞外囊泡(EVs)如何通过调节癌症相关肌成纤维细胞(mCAFs)和相关胶原蛋白来重塑肿瘤微环境 首次揭示了OSCC来源的EVs在调控纤维母细胞向mCAFs分化以及特定胶原蛋白类型富集中的重要作用 NA 探讨OSCC来源的EVs在肿瘤微环境重塑中的作用机制 OSCC来源的EVs、纤维母细胞、mCAFs、胶原蛋白 数字病理学 口腔癌 单细胞测序、免疫荧光染色、蛋白质组分析 NA 单细胞测序数据、免疫荧光图像、蛋白质组数据 OSCC组织样本 NA NA NA NA
3042 2024-11-25
MCGAE: unraveling tumor invasion through integrated multimodal spatial transcriptomics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为MCGAE的多视角对比图自编码器,用于整合多模态空间转录组数据,以揭示肿瘤侵袭区域 MCGAE通过创建多视角表示和整合基因表达、空间邻接矩阵及形态学图像特征,显著提升了多模态数据处理能力 NA 开发一种先进的深度计算框架,用于复杂的空间转录组数据分析 空间转录组数据,特别是结直肠癌肝转移中的肿瘤侵袭区域 生物医学研究 结直肠癌 空间转录组学 多视角对比图自编码器 基因表达数据、空间坐标数据、形态学信息 模拟数据集和真实空间转录组数据集 NA NA NA NA
3043 2024-11-25
Roles of cathepsin S expression levels on the prognosis and tumour microenvironment in clear cell renal cell carcinoma
2024-Nov-21, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 研究了组织蛋白酶S在透明细胞肾细胞癌中的表达水平及其对预后和肿瘤微环境的影响 首次探讨了组织蛋白酶S在透明细胞肾细胞癌中的潜在作用及其分子功能,并发现其作为预后生物标志物和免疫相关治疗靶点的潜力 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据分析,体外实验验证较少 探讨组织蛋白酶S在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对预后和肿瘤微环境的影响 透明细胞肾细胞癌患者的组织样本和相关数据 数字病理学 肾癌 qRT-PCR, IHC NA 基因表达数据, 免疫细胞浸润数据, 单细胞测序数据 来自TCGA和GEO数据库的多个透明细胞肾细胞癌样本 NA NA NA NA
3044 2024-11-25
Peripheral nerve-derived CSF1 induces BMP2 expression in macrophages to promote nerve regeneration and wound healing
2024-Nov-21, NPJ Regenerative medicine IF:6.4Q1
研究论文 研究揭示了周围神经来源的CSF1通过诱导巨噬细胞中BMP2表达促进神经再生和伤口愈合的机制 首次验证了神经与巨噬细胞之间的相互作用在去神经伤口愈合中的关键作用,并揭示了CSF1诱导BMP2表达的神经免疫调节途径 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人体中验证其有效性和安全性 探讨炎症和修复性巨噬细胞的调控机制及其在伤口愈合中的作用 巨噬细胞、神经元、伤口愈合过程 NA NA scRNA-seq NA 转录组数据 小鼠早期和晚期皮肤伤口样本 NA NA NA NA
3045 2024-11-25
Single-cell sequencing of full-length transcripts and T-cell receptors with automated high-throughput Smart-seq3
2024-Nov-21, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 开发了一种自动化高通量Smart-seq3工作流程,用于单细胞全长转录本和T细胞受体的测序 提出了自动化高通量Smart-seq3工作流程,显著提高了细胞捕获效率、基因检测灵敏度和T细胞受体重建的准确性 NA 开发和优化单细胞测序技术,以提高数据质量和细胞异质性解析能力 人类初级CD4+ T细胞 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 转录本 人类初级CD4+ T细胞 NA NA NA NA
3046 2024-11-25
High content of nuclei-free low-quality cells in reference single-cell atlases: a call for more stringent quality control using nuclear fraction
2024-Nov-21, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文探讨了现有单细胞RNA测序数据集中存在的低质量细胞污染问题,并呼吁采用更严格的质控标准 提出了将细胞内含子分数或MALAT1表达纳入质控标准,以提高细胞图谱数据的可靠性 未详细描述具体实施这些质控标准的步骤和方法 揭示现有单细胞RNA测序数据集中的低质量细胞污染问题,并提出改进建议 人类细胞图谱、Tabula Sapiens和Tabula Muris等大型单细胞RNA测序数据集 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 涉及多个组织和器官的数据集 NA NA NA NA
3047 2024-11-24
Macrophage depletion in inflamed rat knees prevents the activation of synovial mesenchymal stem cells by weakening Nampt and Spp1 signaling
2024-Nov-20, Inflammation and regeneration IF:5.0Q1
研究论文 研究探讨了在炎症状态下,通过清除巨噬细胞来抑制滑膜间充质干细胞的激活 首次揭示了巨噬细胞通过Nampt和Spp1信号通路调控滑膜间充质干细胞的激活 研究仅在急性炎症模型中进行,未探讨慢性炎症情况下的效果 探究巨噬细胞在炎症和组织再生中的作用及其与滑膜间充质干细胞的相互作用 滑膜间充质干细胞和巨噬细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及大鼠膝关节样本,具体数量未明确提及 NA NA NA NA
3048 2024-11-24
Pulrodemstat, a selective inhibitor of KDM1A, suppresses head and neck squamous cell carcinoma growth by triggering apoptosis
2024-Nov-20, BMC pharmacology & toxicology IF:2.8Q2
研究论文 研究了一种名为Pulrodemstat的选择性KDM1A抑制剂,通过触发凋亡来抑制头颈鳞状细胞癌的生长 Pulrodemstat在临床试验中显示出比传统化疗药物5-Fu更强的抗肿瘤活性,并且对正常细胞无毒性 NA 寻找更精确和有效的头颈鳞状细胞癌治疗方案 头颈鳞状细胞癌 NA 头颈鳞状细胞癌 高通量筛选、单细胞测序、CCK-8检测、流式细胞术 NA 基因组数据 NA NA NA NA NA
3049 2024-11-24
TNFR2 blockade promotes antitumoral immune response in PDAC by targeting activated Treg and reducing T cell exhaustion
2024-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 研究通过阻断TNFR2受体来增强胰腺导管腺癌(PDAC)的抗肿瘤免疫反应 提出了一种新的治疗策略,即结合CD40激动剂和TNFR2拮抗剂来治疗PDAC 单独使用TNFR2阻断剂对CD8+ T细胞的激活效果有限,肿瘤生长抑制效果不显著 探讨TNFR2阻断剂在PDAC中的抗肿瘤免疫反应机制 胰腺导管腺癌(PDAC)患者和免疫活性小鼠模型 NA 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞分析数据 24名PDAC患者和免疫活性小鼠模型 NA NA NA NA
3050 2024-11-24
Prediction of single-cell RNA expression profiles in live cells by Raman microscopy with Raman2RNA
2024-Nov, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Raman2RNA的方法,通过拉曼显微镜图像预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 Raman2RNA方法通过无标记的超光谱拉曼显微镜图像和领域翻译技术,实现了对活细胞中单细胞RNA表达谱的非破坏性预测 NA 开发一种非破坏性的方法来预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 活细胞中的单细胞RNA表达谱 数字病理学 NA 拉曼显微镜 对抗自编码器 图像 涉及小鼠成纤维细胞和胚胎干细胞的活细胞追踪 NA NA NA NA
3051 2024-11-24
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-Nov, Endocrine IF:3.0Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值 揭示了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌进展中的重要作用,特别是BRAF V600E突变与侵袭性特征的关联 NA 探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后意义 甲状腺乳头状癌患者中的BRAF和RAS突变 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 甲状腺乳头状癌和正常样本 NA NA NA NA
3052 2024-11-24
Transcriptomics of Human Brain Tissue in Parkinson's Disease: a Comparison of Bulk and Single-cell RNA Sequencing
2024-Nov, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
综述 本文综述了利用RNA测序技术研究帕金森病(PD)的文献,特别是比较了批量RNA测序和单细胞RNA测序的结果 本文通过整合批量和单细胞RNA测序的结果,展示了这两种技术在揭示神经退行性疾病转录变化方面的互补性 本文主要基于文献综述,未提供新的实验数据 评估批量和单细胞RNA测序技术在研究帕金森病中的兼容性和互补性 帕金森病患者的人脑组织 数字病理学 神经退行性疾病 RNA测序 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
3053 2024-11-24
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing Research for Neurological Diseases
2024-Nov, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
综述 本文详细介绍了单细胞RNA测序技术,并总结了其在神经系统疾病研究中的应用 单细胞RNA测序技术不仅识别了多种细胞类型和反应状态,还揭示了细胞特异性基因表达变化、基因调控网络、细胞间通讯和细胞运动轨迹等 NA 探讨单细胞RNA测序技术在神经系统疾病研究中的应用,揭示疾病的具体机制,并为新的治疗策略提供依据 神经系统疾病及其相关细胞 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
3054 2024-11-24
Targeting METTL3 as a checkpoint to enhance T cells for tumour immunotherapy
2024-Nov, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文研究了通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 首次探讨了m6A在调节T细胞功能和增强抗肿瘤免疫中的作用,并发现靶向METTL3可以增强肿瘤细胞的免疫原性和T细胞功能 NA 探索通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 METTL3抑制剂STM2457对肿瘤细胞和T细胞功能的影响 肿瘤学 NA RNA测序 (RNA-seq),单细胞RNA测序 (scRNA-seq),CRISPR Cas9 NA RNA 多种癌细胞系,小鼠黑色素瘤 (B16) 和小鼠结直肠腺癌 (MC38) 模型,人黑色素瘤模型 (A375) 和人T细胞 NA NA NA NA
3055 2024-11-24
Targeting IL-33 reprograms the tumor microenvironment and potentiates antitumor response to anti-PD-L1 immunotherapy
2024-09-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 研究探讨了IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的作用,并开发了sST2-Fc融合蛋白和双功能融合蛋白anti-PD-L1-sST2,以增强抗肿瘤效果 首次揭示了IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的免疫抑制机制,并开发了新的融合蛋白策略以增强抗肿瘤效果 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在临床试验中验证其效果 探讨IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的作用,并开发新的治疗策略以增强抗肿瘤效果 IL-33/ST2信号、PD-L1抗体、sST2-Fc融合蛋白、双功能融合蛋白anti-PD-L1-sST2 NA 肺癌、结肠癌 RNA测序、ELISA、WB、免疫荧光 NA RNA、蛋白质 小鼠肿瘤模型 NA NA NA NA
3056 2024-11-24
Bulk and single cells transcriptomes with experimental validation identify USP18 as a novel glioma prognosis and proliferation indicator
2024-May, Experimental and therapeutic medicine IF:2.4Q3
研究论文 本研究通过批量和单细胞转录组分析,结合实验验证,揭示了USP18作为胶质瘤预后和增殖的新指标 首次揭示了USP18在胶质瘤中的上调与不良预后相关,并影响患者对免疫治疗的反应 研究仅限于U251和U87MG ATCC细胞系,未涵盖所有胶质瘤细胞类型 探讨USP18在胶质瘤中的作用及其对预后和增殖的影响 胶质瘤细胞和患者的预后及增殖情况 数字病理学 脑癌 转录组分析 NA 转录组数据 U251和U87MG ATCC细胞系 NA NA NA NA
3057 2024-11-24
Nature and nurture in fruit fly hearing
2024, Frontiers in neural circuits IF:3.4Q2
review 本文综述了果蝇听觉感知中的“先天与后天”现象,特别是歌曲偏好学习的神经机制 整合了单细胞转录组和脑连接组等组学数据库,结合传统分子遗传学,使果蝇成为研究听觉感知和行为中“先天与后天”神经基础的杰出模型 NA 探讨果蝇歌曲偏好学习的神经机制及其在听觉感知和行为中的作用 果蝇的歌曲偏好学习及其神经回路 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3058 2024-11-24
Single-cell sequencing reveals transcriptional dynamics regulated by ERα in mouse ovaries
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 研究使用单细胞RNA测序揭示ERα在小鼠卵巢中的转录调控动态 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了ERα缺失对卵巢细胞转录组的影响 研究仅限于αERKO小鼠模型,可能无法完全代表所有卵巢功能障碍的情况 阐明ERα调控卵巢细胞转录动力学的分子机制 ERα敲除小鼠的卵巢细胞 NA NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 转录组数据 野生型和αERKO小鼠的卵巢细胞 NA NA NA NA
3059 2024-11-24
BreCML: identifying breast cancer cell state in scRNA-seq via machine learning
2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本文开发了一种基于机器学习的预测工具BreCML,用于准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因 BreCML在训练数据集上达到了98.92%的准确率,并在测试数据集上展示了卓越的准确性、精确度、召回率和F1分数 NA 开发一种能够准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因的机器学习预测工具 乳腺癌细胞及其相关标记基因 机器学习 乳腺癌 scRNA-seq XGBoost 基因数据 NA NA NA NA NA
3060 2024-11-24
Cellular Characterization and Interspecies Evolution of the Tree Shrew Retina across Postnatal Lifespan
2024, Research (Washington, D.C.)
研究论文 研究了树鼩视网膜细胞在出生后生命周期中的细胞特征和跨物种进化 建立了树鼩视网膜细胞的年龄相关单细胞RNA测序图谱,并进行了跨物种分析 NA 探讨树鼩视网膜细胞在不同年龄阶段的细胞组成和基因表达模式 树鼩视网膜细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 15只树鼩 NA NA NA NA
回到顶部