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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 2981 - 3000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2981 | 2025-10-07 |
CD_99 G1 neutrophils modulate osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells in the pathological process of ankylosing spondylitis
2024-Feb-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224107
PMID:37977819
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了强直性脊柱炎患者脊柱附着点中细胞亚群的异质性及其在骨生成过程中的相互作用机制 | 发现新型早期中性粒细胞亚群CD99_G1在AS中升高，并揭示间充质干细胞通过CAR细胞亚群向成骨分化的两条分化路径 | 样本量较小（5例患者和3例健康对照），需要在更大队列中验证发现 | 探究强直性脊柱炎脊柱附着点中细胞类型异质性及骨生成机制 | 强直性脊柱炎患者和健康个体的脊柱附着点组织 | 单细胞生物学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序，实时定量PCR，免疫荧光，流式细胞术，成骨诱导，茜素红染色，免疫组化，shRNA | 伪时间分析，配体-受体对分析 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 5例强直性脊柱炎患者和3例健康个体，共40,065个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2982 | 2025-10-07 |
RNA-seq analysis reveals prenatal alcohol exposure is associated with placental inflammatory cells and gene expression
2024-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147951
PMID:37918548
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现产前酒精暴露与胎盘炎症细胞比例和基因表达改变相关 | 首次利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型反卷积分析，研究产前酒精暴露对胎盘细胞组成和炎症基因表达的影响 | 样本量相对较小（68例），需要未来研究进一步验证和功能分析 | 探究产前酒精暴露对胎盘细胞类型组成和炎症基因表达的影响 | 南非开普敦前瞻性出生队列中的35名重度饮酒孕妇和33名对照孕妇的胎盘样本 | 生物信息学 | 胎儿酒精谱系障碍 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，细胞类型反卷积分析 | 线性回归模型 | RNA测序数据 | 68例胎盘样本（35例酒精暴露，33例对照） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2983 | 2025-02-14 |
Reconstruction of gene regulatory networks from single cell transcriptomic data
2024-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/vjgb-24-104
PMID:39944798
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综述 | 本文综述了从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据重建基因调控网络（GRNs）的方法和程序 | 本文特别关注了利用其他组学数据（主要是转录因子结合位点和开放染色质图谱）来提高单细胞转录组数据重建GRN的准确性 | 单细胞组学数据的技术和生物学特性需要特定的GRN推断方法 | 理解和研究细胞在发育过程中及响应各种内外刺激时使用的机制 | 基因调控网络（GRNs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2984 | 2025-10-07 |
Deconvolution of spatial transcriptomics data via graph contrastive learning and partial least square regression
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf052
PMID:39924717
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研究论文 | 提出一种基于图对比学习和偏最小二乘回归的空间转录组数据反卷积方法CLPLS | 首次将图对比学习与偏最小二乘回归结合用于空间转录组反卷积，并能整合单细胞多组学数据探索空间表观基因组异质性 | NA | 开发空间转录组数据反卷积方法以解析组织内细胞空间架构 | 空间转录组数据和单细胞多组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组测序，单细胞多组学测序 | 图对比学习，偏最小二乘回归 | 基因表达数据，染色质可及性数据 | 模拟数据集和来自不同平台的真实数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 2985 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic revealed intratumor heterogeneity and cancer stem cell enrichment in colorectal cancer metastasis
2024-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217181
PMID:39159882
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研究论文 | 本研究通过空间转录组技术揭示结直肠癌原发灶和肝转移灶的瘤内异质性及癌症干细胞富集机制 | 首次利用空间转录组技术系统揭示结直肠癌转移过程中的瘤内异质性特征，发现FOXD1作为新型转移性癌症干细胞标志物 | 仅分析两对原发灶与匹配转移灶样本，样本量有限 | 探索结直肠癌转移的细胞机制和癌症干细胞作用 | 结直肠癌患者的原发肿瘤组织及匹配的肝转移组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | 轨迹分析、伪时间分析、CellphoneDB互作分析 | 空间RNA转录组数据 | 2例原发结直肠癌组织及其匹配的肝转移组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组技术 |
| 2986 | 2025-10-07 |
Inferring pattern-driving intercellular flows from single-cell and spatial transcriptomics
2024-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02380-w
PMID:39187683
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研究论文 | 提出FlowSig方法，从单细胞和空间转录组数据推断细胞间通讯驱动的信息流 | 首次结合图形因果建模和条件独立性分析，揭示细胞间通讯与细胞内基因模块之间的耦合关系 | 方法依赖于因果推断假设，需要实验验证其生物学意义 | 开发从单细胞和空间转录组数据推断细胞间信息流的方法 | 皮质类器官、胰腺胰岛、COVID-19患者样本、小鼠胚胎 | 生物信息学 | COVID-19, 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图形因果模型 | 基因表达数据 | 多种实验数据集和合成数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2987 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals placental response under environmental stress
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50914-9
PMID:39095385
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究环境应激下胎盘的反应机制 | 首次在单细胞水平揭示砷暴露下胎盘细胞类型特异性反应，发现PRAP1基因在26种胎盘细胞类型中显著上调并具有性别偏好性 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞验证有限 | 探究环境应激下胎盘的分子响应机制 | 小鼠胎盘细胞和人类滋养层细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，体外实验，离体实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种胎盘细胞类型（包括多种滋养层细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2988 | 2025-10-07 |
Hofbauer cells and fetal brain microglia share transcriptional profiles and responses to maternal diet-induced obesity
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114326
PMID:38848212
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了母体饮食诱导肥胖模型中胎儿脑小胶质细胞与胎盘霍夫bauer细胞具有共同的转录特征 | 首次证实胎儿脑小胶质细胞与胎盘霍夫bauer细胞具有共同起源和相似的转录程序，并提出霍夫bauer细胞可作为胎儿脑小胶质细胞编程的非侵入性生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，虽然与人类数据集比较显示保守性，但需要进一步临床验证 | 探索母体肥胖对胎儿免疫细胞编程的影响及其与神经发育障碍的关联 | 小鼠模型中的胎儿脑小胶质细胞和胎盘霍夫bauer细胞 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2989 | 2025-10-07 |
Targeting metabolic sensing switch GPR84 on macrophages for cancer immunotherapy
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03603-3
PMID:38349405
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现脂肪酸受体GPR84是调控肿瘤相关巨噬细胞抗肿瘤表型的重要代谢感应开关 | 首次发现GPR84作为代谢感应开关调控巨噬细胞抗肿瘤极化，并证明其激动剂6-OAU可增强抗PD-1疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠肿瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞代谢重编程机制以增强癌症免疫治疗效果 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其GPR84受体 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组测序，基因敲除，药理学激活 | NA | 转录组数据 | 多个肿瘤模型的小鼠数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2990 | 2025-10-07 |
Innovative super-resolution in spatial transcriptomics: a transformer model exploiting histology images and spatial gene expression
2024-01-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae052
PMID:38436557
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研究论文 | 提出了一种基于Transformer架构的无监督模型TransformerST，用于提升空间转录组学的分辨率至单细胞水平 | 首次将Transformer架构应用于空间转录组学超分辨率分析，无需参考单细胞RNA测序数据，通过视觉Transformer编码器发掘图像-基因表达的潜在共表征 | 未提及具体的数据集验证范围和计算资源需求 | 提升空间转录组学技术的分辨率，实现单细胞级别的空间基因表达分析 | 空间转录组学数据，特别是Visium平台产生的多细胞水平数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Transformer，视觉Transformer，图Transformer | 组织学图像，空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 2991 | 2025-10-07 |
Network-based prioritization and validation of regulators of vascular smooth muscle cell proliferation in disease
2024, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00474-4
PMID:38898928
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研究论文 | 本研究通过构建基因调控网络识别并验证了血管平滑肌细胞增殖的关键调控因子 | 首次通过单细胞转录组和表观遗传分析重建基因调控网络，发现RUNX1和TIMP1-CD74轴等新型增殖调控因子 | 研究主要基于计算分析和体外验证，需要进一步的体内实验确认 | 阐明血管平滑肌细胞增殖的分子决定因素 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 表观遗传分析, 计算机扰动分析 | 基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2992 | 2025-10-07 |
The role of SASP in ischemic stroke: a deep dive into cellular mechanisms
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1513357
PMID:39931101
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞转录组分析，探究衰老相关分泌表型在缺血性脑卒中中的作用机制 | 首次结合bulk芯片和单细胞测序数据系统分析SASP在缺血性脑卒中中的作用，发现嗜碱性粒细胞中Ccl3和Lcp1基因的关键调控作用 | 研究样本量有限，主要基于动物模型数据，人类临床验证不足 | 解析SASP在缺血性脑卒中发病机制中的细胞分子作用 | 人类外周血bulk芯片数据、MCAO小鼠单细胞测序数据、MCAO和假手术大鼠血清样本 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, bulk转录组分析, RT-qPCR, 蛋白互作网络分析, 富集分析 | MCAO动物模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量，包含人类外周血芯片数据、小鼠单细胞数据和大鼠血清样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2993 | 2025-10-07 |
Leveraging Single-Cell RNA-Seq to Generate Robust Microglia Aging Clocks
2024-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.05.616811
PMID:39554035
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据开发稳健的小胶质细胞衰老时钟 | 首次在单细胞水平开发小胶质细胞衰老时钟，并证明其可应用于常规批量RNA-seq数据 | NA | 建立能够准确反映大脑衰老过程的生物标志物 | 小胶质细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督频率特征化方法 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2994 | 2025-10-07 |
Influence of Vitamin D Receptor Signalling and Vitamin D on Colonic Epithelial Cell Fate Decisions in Ulcerative Colitis
2024-Oct-15, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjae074
PMID:38747639
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研究论文 | 本研究探讨维生素D受体信号传导和维生素D对溃疡性结肠炎患者结肠上皮细胞命运决定的影响 | 首次在人类结肠类器官模型中系统研究维生素D-VDR轴对上皮细胞分化的调控机制，并利用CRISPR/Cas9技术验证VDR依赖性 | 研究主要基于体外类器官模型，需要进一步在体实验验证 | 阐明维生素D-VDR信号轴在溃疡性结肠炎发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康个体的结肠活检样本及患者来源的结肠类器官 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 免疫组织化学, RNA表达阵列, 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因敲除 | NA | 图像, 文本(基因表达数据) | 来自UC患者和健康个体的结肠活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2995 | 2024-08-08 |
Correction to: Machine learning applications on intratumoral heterogeneity in glioblastoma using single-cell RNA sequencing data
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad022
PMID:37226813
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2996 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics of vulvar lichen sclerosus reveal multi-compartmental alterations in gene expression and signaling cross-talk
2024-Aug-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.14.607986
PMID:39211101
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析外阴硬化性苔藓病变组织，揭示多细胞区室的基因表达改变和信号通路交互作用 | 首次结合单细胞和空间转录组技术系统揭示VLS病变中角质形成细胞、成纤维细胞、免疫细胞和黑色素细胞的分子异质性与统一性变化 | 样本量有限，疾病机制验证主要依赖体外模型 | 解析外阴硬化性苔藓的分子发病机制 | VLS患者病变和非病变皮肤组织、健康对照外阴皮肤 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 单层培养模型, 器官型培养模型 | 基因表达数据, 空间定位数据 | VLS患者和健康对照的外阴皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2997 | 2025-10-07 |
Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells from Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway
2024-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585556
PMID:38562805
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研究论文 | 本研究探讨了伊布地司特在兴奋性毒性视网膜损伤模型中对视网膜神经元的保护作用及其作用机制 | 首次发现伊布地司特通过激活mTOR通路保护视网膜双极细胞，并揭示双极细胞与穆勒胶质细胞之间的旁分泌信号交流在神经保护中的重要作用 | 研究仅使用鸡视网膜损伤模型，mTOR抑制剂雷帕霉素未能减少细胞死亡，机制尚未完全阐明 | 研究伊布地司特对视网膜神经元的保护作用及其分子机制 | 鸡视网膜神经元，特别是双极细胞和穆勒胶质细胞 | 神经科学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序，光谱域光学相干断层扫描，视网膜电图，TUNEL检测 | NA | 基因表达数据，影像数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2998 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes of dissecting the intra-tumoral heterogeneity of breast cancer microenvironment
2024-Dec-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06015-7
PMID:39724260
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示乳腺癌肿瘤微环境的瘤内异质性 | 首次构建包含54,055个细胞的乳腺癌单细胞转录组图谱，识别了恶性上皮细胞的六种共同表达程序和六种亚型特异性表达程序 | 样本量较小（仅4例恶性患者和4例非恶性患者），需要更大规模研究验证 | 研究乳腺癌异质性在单细胞转录组中的形成机制和作用 | 乳腺癌临床标本中的细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 54,055个高质量细胞，来自4例恶性和4例非恶性患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2999 | 2025-10-07 |
Integrated analysis reveals prognostic correlation and immune characteristics of a tumor-associated macrophage-based risk signature in triple-negative breast cancer
2024-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1037
PMID:39525038
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研究论文 | 本研究通过整合分析构建了基于肿瘤相关巨噬细胞的风险特征，用于三阴性乳腺癌的预后预测和免疫特征分析 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别TAM簇并构建8基因风险特征，开发了整合分期和TAM风险特征的新型列线图 | NA | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的特征，构建预后风险特征并验证其与免疫特征的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，逆转录聚合酶链反应，Western blot，免疫组织化学 | LASSO回归，单变量Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3000 | 2025-10-07 |
The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.026
PMID:38776918
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研究论文 | 本研究揭示了外周CD8+ T细胞耐受检查点触发了一种由蛋白质翻译缺陷定义的独特分化状态 | 首次证明外周耐受触发与耗竭、记忆和功能效应细胞完全不同的分化状态，并发现该状态由蛋白质翻译缺陷维持 | 研究主要关注早期分化阶段（60小时内），长期耐受状态的维持机制需要进一步探索 | 阐明外周CD8 T细胞耐受检查点的分子机制和细胞状态特征 | 外周CD8+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |