单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
281	2026-02-05	β-cell Jagged1 is sufficient but not necessary for islet Notch activity and insulin secretory defects in obese mice 2024-Mar, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2024.101894 PMID:38311286	研究论文	本研究探讨了Jagged1在肥胖小鼠胰岛Notch信号通路中的作用及其对胰岛素分泌缺陷的影响	首次通过单细胞RNA测序和遗传学模型，揭示了β细胞Jagged1在肥胖诱导的Notch信号激活中的充分性而非必要性	遗传功能丧失实验表明β细胞可能不是Jagged1信号的主要来源，限制了靶向β细胞Jagged1的治疗潜力	研究肥胖小鼠中β细胞Jagged1表达是否决定Notch信号异常及胰岛素分泌缺陷	高脂饮食或瘦素受体缺陷小鼠、2型糖尿病患者胰岛、诱导性β细胞特异性Jagged1转基因和功能缺失小鼠	糖尿病研究	2型糖尿病	单细胞RNA测序、葡萄糖耐量测试、葡萄糖刺激胰岛素分泌测定	转基因小鼠模型、功能缺失模型	基因表达数据、生理功能数据	未明确样本数量，但涉及多种小鼠模型和人类胰岛样本	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
282	2026-02-03	Single-cell RNA sequencing comparison of the human metastatic prostate spine tumor microenvironment 2024-03-15, STAR protocols IF:1.3Q4 DOI:10.1016/j.xpro.2023.102805 PMID:38341849	研究论文	本文提出了一种从前列腺癌患者临床样本中，从手术室到实验台进行单细胞处理的方案，并比较了人类转移性前列腺脊柱肿瘤的微环境	针对脊柱肿瘤组织异质性高、难以处理的特点，开发了从手术室到实验台的单细胞处理方案，用于骨性脊柱转移瘤的研究	NA	开发用于临床样本单细胞组学研究的方案，以识别预后标志物和治疗靶点	前列腺癌患者的脊柱转移瘤临床样本	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
283	2026-02-03	A deep learning adversarial autoencoder with dynamic batching displays high performance in denoising and ordering scRNA-seq data 2024-Mar-15, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109027 PMID:38361616	研究论文	本文提出了一种名为动态批处理对抗自编码器（DB-AAE）的深度神经网络生成框架，用于有效去噪和排序单细胞RNA测序数据	DB-AAE直接捕获输入数据中的最优特征，增强特征保留能力，包括细胞类型特异性基因表达模式，并在去噪准确性和生物信号保留方面优于其他方法	NA	提高单细胞RNA测序数据的去噪质量和下游分析的可靠性	单细胞RNA测序数据	机器学习	NA	单细胞RNA测序	对抗自编码器	基因表达数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
284	2026-02-03	Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites 2024-02-16, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adj7481 PMID:38354249	研究论文	本研究探讨了运动如何通过减少血流再循环并激活内皮SCD1酶来催化保护性脂质代谢物，从而改善血管健康	首次揭示了运动通过调节血流动力学（如减少主动脉弓小弯处的血流再循环）并激活内皮SCD1酶，催化产生抗炎脂质代谢物（油酸和棕榈油酸），为血管保护提供新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；且SCD1的具体信号通路和长期效应需进一步探索	探究运动如何通过代谢转换器SCD1介导血管保护作用，并阐明其与血流动力学变化的关联	野生型小鼠、内皮特异性SCD1敲除小鼠、高脂饮食小鼠以及主动脉内皮细胞	心血管疾病研究	心血管疾病	非靶向代谢组学分析、单细胞转录组学、计算机模拟分析、腺病毒转染	NA	代谢组数据、转录组数据、血流动力学模拟数据	小鼠模型（具体数量未明确说明）	NA	单细胞转录组学	NA	NA
285	2026-01-29	Epigenomic, transcriptomic and proteomic characterizations of reference samples 2024-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.09.612110 PMID:39314461	研究论文	本研究通过ATAC-seq、Methyl-seq、RNA-seq和蛋白质组学分析，全面表征了乳腺癌细胞系和配对B细胞系的表观基因组、转录组和蛋白质组景观，提供了多组学参考材料	首次为两种细胞系提供了包括表观基因组和蛋白质组在内的全面多组学参考数据，填补了现有参考材料在表观组学和蛋白质组学方面的空白	研究仅基于两种细胞系，可能无法完全代表更广泛的生物样本多样性	开发和验证用于下一代测序技术和临床应用的参考标准材料	乳腺癌细胞系和配对的B细胞系	多组学分析	乳腺癌	ATAC-seq, Methyl-seq, RNA-seq, 蛋白质组学分析, 全基因组测序, HiC, scRNA-seq	NA	基因组、表观基因组、转录组、单细胞RNA-seq和蛋白质组数据	两种细胞系（乳腺癌细胞系和配对B细胞系）	Illumina, PacBio, Nanopore	全基因组测序, HiC, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 甲基化测序, RNA-seq, 蛋白质组学	NA	NA
286	2026-01-29	Single-cell RNA sequencing data locate ALDH1A2-mediated retinoic acid synthetic pathway to glomerular parietal epithelial cells 2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.) DOI:10.3389/ebm.2024.10167 PMID:39360029	综述	本文通过挖掘小鼠和人类肾脏的单细胞及单核RNA测序数据库，发现肾小球壁层上皮细胞（PECs）表达全谱的视黄酸合成相关基因，并定位了ALDH1A2介导的视黄酸合成通路，探讨了其在肾脏生理和病理中的潜在作用	首次利用单细胞及单核RNA测序数据，系统性地将ALDH1A2介导的视黄酸合成通路定位到肾小球壁层上皮细胞，并揭示了该通路在多种肾脏疾病模型及患者中的表达变化	本文主要基于数据挖掘和生物信息学分析，提出的假说（即PECs中ALDH1A2介导的视黄酸合成在肾脏中发挥未定义的作用且其失调介导损伤）仍需通过条件性基因敲除、RNA沉默及转基因小鼠模型等实验进行验证	阐明ALDH1A2介导的视黄酸合成通路在肾脏（特别是肾小球壁层上皮细胞）中的定位、表达调控及其在肾脏生理和病理（如肾小球肾炎、急性肾损伤、慢性肾病等）中的潜在作用	小鼠和人类肾脏组织，特别是肾小球壁层上皮细胞（PECs）	数字病理学	肾脏疾病（包括肾小球肾炎、急性肾损伤、慢性肾病、糖尿病肾病、局灶节段性肾小球硬化、多囊肾病等）	单细胞RNA测序，单核RNA测序，Spearman秩相关系数分析，基因本体通路分析	NA	RNA测序数据（单细胞及单核水平）	NA（涉及多个公开数据库中的小鼠模型及人类患者数据）	NA	单细胞RNA-seq，单核RNA-seq	NA	NA
287	2026-01-28	STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics 2024-Dec, Advances in neural information processing systems DOI:10.52202/079017-1129 PMID:41551654	研究论文	本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过提供子图块图像的基因组特征，弥补了现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷	STimage-1K4M数据集首次将空间转录组学数据与组织病理学图像结合，为子图块区域提供高维基因表达信息，实现了前所未有的数据粒度	数据集仅包含1,149张图像，可能无法覆盖所有病理类型或变异，且基因表达维度较高可能增加计算复杂度	旨在推动多模态数据分析在计算病理学等领域的先进研究	空间转录组学数据衍生的组织病理学图像及其对应的基因表达信息	计算病理学	NA	空间转录组学	NA	图像、基因表达数据	1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对	NA	空间转录组学	NA	NA
288	2026-01-28	UBR7 E3 Ligase Suppresses Interferon-β Mediated Immune Signaling by Targeting Sp110 in Hepatitis B Virus-Induced Hepatocellular Carcinoma 2024-11-08, ACS infectious diseases IF:4.0Q1 DOI:10.1021/acsinfecdis.4c00213 PMID:38938101	研究论文	本研究揭示了E3泛素连接酶UBR7通过泛素化Sp110蛋白，抑制I型干扰素信号通路，从而促进乙型肝炎病毒（HBV）持续感染和HBV诱导的肝细胞癌（HCC）发生的新机制	首次发现UBR7在非组蛋白（Sp110）泛素化中的新功能，并阐明其通过下调I型干扰素反应促进HBV持续感染和HCC发生的分子机制	研究主要基于体外细胞模型和患者样本分析，缺乏体内动物模型验证；UBR7-Sp110轴在HCC发生发展中的具体调控网络仍需进一步探索	探究UBR7在HBV诱导的肝细胞癌发生中的作用机制	乙型肝炎病毒（HBV）、肝细胞癌（HCC）细胞、HCC患者样本	分子生物学与肿瘤免疫学	肝细胞癌	RNA-Seq、单细胞RNA-Seq、转录组学分析、基因敲低	NA	转录组数据、单细胞转录组数据	HCC患者样本（具体数量未明确说明）	NA	RNA-Seq、单细胞RNA-Seq	NA	NA
289	2026-01-28	Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes 2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.31.621315 PMID:39574584	研究论文	本文通过整合多个小鼠肠道神经系统单细胞RNA测序数据集，构建了一个元图谱，旨在识别新的细胞类型、共享标记基因，并达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识	首次系统整合多个独立的小鼠肠道神经系统scRNA-seq数据集，生成共识元图谱，以改善罕见神经元类别的分辨率，并连接转录组谱与历史分类系统	数据集依赖于不同的细胞分离和文库生成方法，可能导致细胞类型检测差异；未来研究需将深度转录组谱与历史分类系统更紧密连接	通过整合scRNA-seq数据集，达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识，并提高罕见神经元类别的检测能力	小鼠肠道神经系统中的神经元	单细胞转录组学	肠道动力障碍	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	多个独立数据集，涉及数百至数百万个细胞	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
290	2026-01-28	Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data 2024-Oct-25, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1 PMID:39502778	研究论文	本研究探讨在空间转录组学数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能	首次系统评估高变异基因与空间变异基因联合使用对细胞类型聚类的影响，覆盖多个平台和超过50个真实数据集	未详细探讨基因选择方法对聚类结果的具体影响机制，可能受数据集异质性限制	提高空间转录组学数据中细胞类型聚类的准确性和效率	空间转录组学数据中的基因表达模式	空间转录组学	NA	空间转录组学技术	NA	转录组数据	超过50个真实空间转录组学数据集	NA	空间转录组学	NA	NA
291	2026-01-28	STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics 2024-Jun-20, ArXiv PMID:38947920	研究论文	本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过空间转录组学数据提供子图块图像的基因组特征，以弥补现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷	STimage-1K4M是首个将病理图像子图块与高维基因表达数据（15,000-30,000维）配对的大规模数据集，提供了前所未有的空间分辨率，支持多模态数据分析的深入研究	数据集中仅包含1,149张原始图像，且基因表达数据维度较高，可能对计算资源要求较高，同时未提及数据来源的具体疾病类型或样本多样性	旨在通过提供细粒度的图像-基因表达配对数据，推动计算病理学和多模态算法的发展	空间转录组学数据中的病理图像及其对应的基因表达信息	计算病理学	NA	空间转录组学	NA	图像和基因表达数据	1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对	NA	空间转录组学	NA	NA
292	2026-01-27	Transcriptomic Approaches to Cardiomyocyte-Biomaterial Interactions: A Review 2024-07-08, ACS biomaterials science & engineering IF:5.4Q2 DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00303 PMID:38934720	综述	本文综述了转录组学方法在心肌细胞与生物材料相互作用研究中的应用，强调了其在心脏生物工程和再生医学中的重要性	聚焦于转录组学技术（如bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、单核RNA-seq和空间转录组学）在解析心肌细胞-生物材料相互作用网络中的创新应用，并探讨了纵向研究、通路分析和机器学习等方法的整合潜力	存在成本高、细胞尺寸限制、样本差异以及分析流程复杂等挑战	旨在通过转录组学方法深入理解心肌细胞与生物材料的相互作用机制，以促进心脏健康相关研究	心肌细胞与生物材料的相互作用	数字病理学	心血管疾病	bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学	机器学习	转录组数据	NA	NA	单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq	NA	NA
293	2026-01-24	Bulk and single-cell RNA-seq analyses reveal canonical RNA editing associated with microglia homeostasis and its role in sepsis-associated encephalopathy 2024-11-12, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2024.09.027 PMID:39293730	研究论文	本研究通过分析小鼠大脑的bulk和单细胞RNA-seq数据，揭示了与稳态小胶质细胞相关的典型RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的潜在作用	首次将稳态小胶质细胞与RNA编辑联系起来，并探索了其在脓毒症相关脑病中的作用，揭示了不同小胶质细胞亚群间RNA编辑的异质性及其对脂多糖的不同反应	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性有待验证；样本量相对有限（107个样本）	探索稳态小胶质细胞相关的典型RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的潜在作用	小鼠大脑组织和小胶质细胞	生物信息学	脓毒症相关脑病	RNA-seq, 单细胞RNA-seq	NA	RNA-seq数据	107个小鼠大脑组织和小胶质细胞样本	NA	单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq	NA	NA
294	2026-01-24	Restoring social deficits in IRSp53-deleted mice: chemogenetic inhibition of ventral dentate gyrus Emx1-expressing cells 2024-10-07, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-024-03104-6 PMID:39375329	研究论文	本研究通过化学遗传学抑制小鼠腹侧齿状回Emx1表达细胞，恢复了IRSp53缺失导致的社会行为缺陷	首次确定腹侧齿状回是IRSp53缺失引起社会行为缺陷的关键脑区，并通过化学遗传学方法实现行为恢复	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床验证；机制研究仍待深入	探究IRSp53缺失导致社会行为缺陷的神经机制并寻找潜在治疗靶点	Emx1-Cre;IRSp53 flox/flox基因工程小鼠	神经科学	精神疾病	化学遗传学、bulk RNA测序、单细胞RNA测序	基因工程小鼠模型	行为学数据、基因表达数据	未明确说明，但涉及实验组和对照组小鼠	NA	bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq	NA	NA
295	2026-01-24	Single-cell multiomics analysis reveals cell/tissue-specific associations in bipolar disorder 2024-08-06, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-024-03044-1 PMID:39107272	研究论文	本研究通过整合单细胞多组学数据，探讨了双相情感障碍的细胞起源和组织异质性	识别了一个名为ADCY1的新型脑细胞簇，并从高分辨率遗传学角度揭示了胶质细胞作为双相情感障碍的主要细胞病理学关联	研究样本量有限，特别是单细胞RNA测序数据仅来自胚胎和胎儿脑组织，可能无法完全代表成年患者的情况	探究双相情感障碍的细胞起源、组织异质性及其潜在致病机制	双相情感障碍患者及对照组的脑组织样本	生物信息学	双相情感障碍	单细胞RNA测序, ATAC-seq, 全基因组关联研究, 转录组范围关联研究	scDRS算法	单细胞RNA测序数据, ATAC-seq数据, 批量RNA测序数据, GWAS汇总数据	单细胞RNA测序数据（n=8个样本，1,266个细胞），ATAC-seq数据（n=210），批量RNA测序数据（n=314），GWAS汇总数据（n=413,466）	NA	单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 批量RNA-seq, GWAS	NA	NA
296	2026-01-24	Single-cell insights into mouse testicular toxicity under peripubertal exposure to di(2-ethylhexyl) phthalate 2024-08-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2 DOI:10.1093/toxsci/kfae064 PMID:38730545	研究论文	本研究首次通过单细胞转录组学揭示了青春期小鼠睾丸在邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯暴露下的毒性机制	首次提供了青春期小鼠睾丸在DEHP暴露下的单细胞转录组图谱，明确了支持细胞和间质细胞是DEHP的关键靶点	研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；实验周期限于青春期暴露，长期效应未评估	探究DEHP在青春期暴露下对睾丸毒性的具体细胞靶点和分化过程影响	青春期雄性小鼠睾丸组织	单细胞转录组学	生殖系统疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	16只3周龄雄性小鼠（对照组和DEHP暴露组各8只）	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
297	2026-01-24	Single-cell transcriptomics unveiled that early life BDE-99 exposure reprogrammed the gut-liver axis to promote a proinflammatory metabolic signature in male mice at late adulthood 2024-06-26, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2 DOI:10.1093/toxsci/kfae047 PMID:38648751	研究论文	本研究通过单细胞转录组学揭示了生命早期暴露于阻燃剂BDE-99会重编程肠道-肝脏轴，导致雄性小鼠在成年后期出现促炎症代谢特征	首次结合单细胞转录组测序（scRNA-seq）和无菌（GF）小鼠模型，阐明了生命早期BDE-99暴露如何通过改变肠道微生物组，持久地重编程肝脏细胞类型特异性基因表达和细胞间通讯，从而促进成年后期的促炎症状态	研究仅针对雄性C57BL/6小鼠，未探讨性别差异；暴露时间窗口（出生后2-4天）和剂量（57 mg/kg）可能无法完全模拟人类真实暴露场景；机制关联性部分基于预测和相关性分析	探究生命早期暴露于环境污染物BDE-99对肠道-肝脏轴的长期影响，特别是其对肝脏免疫代谢稳态和肠道微生物组的重编程作用	雄性C57BL/6小鼠（包括常规饲养和无菌小鼠），重点关注其肝脏细胞（如肝细胞、中性粒细胞）和肠道组织	单细胞组学	代谢与炎症相关疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），微生物移植	NA	单细胞转录组数据，基因表达数据	雄性C57BL/6小鼠（具体数量未明确说明），包括BDE-99暴露组和玉米油对照组，并在15月龄进行分析	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
298	2026-01-24	Single-cell transcriptome analysis reveals keratinocyte subpopulations contributing to psoriasis in corneum and granular layer 2024-Feb, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI) IF:2.0Q3 DOI:10.1111/srt.13572 PMID:38279596	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，揭示了与银屑病相关的角质形成细胞亚群及其分子机制	首次在单细胞水平上系统鉴定了银屑病皮肤角质层和颗粒层中特定的角质形成细胞功能亚群，并阐明了它们参与的关键信号通路	研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证；样本量相对有限；未进行体内功能实验验证	探究银屑病发病机制中角质形成细胞的具体功能亚群及其分子特征	正常和银屑病皮肤组织	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	未明确说明具体样本数量	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
299	2026-01-23	Inflammation and mechanical force-induced bone remodeling 2024-Dec-30, Periodontology 2000 IF:17.5Q1 DOI:10.1111/prd.12619 PMID:39740162	综述	本文综述了炎症和机械力诱导的骨重塑过程，重点关注牙周炎和正畸牙齿移动中的细胞作用	利用单细胞RNA测序技术的新进展，深入探讨了不同细胞类型在炎症和机械力驱动的骨重塑中的作用和相互作用，并分析了这两种条件（慢性炎症与急性瞬时炎症）的联合效应	NA	探讨炎症和机械力在骨重塑中的作用机制，特别是在牙周炎和正畸牙齿移动中的细胞和分子基础	宿主免疫细胞（角质形成细胞、白细胞、基质细胞、骨细胞、成骨细胞、破骨细胞）及其在骨重塑中的功能	NA	牙周炎	单细胞RNA测序	NA	NA	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
300	2026-01-23	Neuron-glia crosstalk and inflammatory mediators in migraine pathophysiology 2024-11-12, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2024.10.006 PMID:39389252	综述	本文综述了偏头痛病理生理学中神经胶质细胞相互作用和炎症介质的作用机制	整合了细胞和分子层面的神经炎症机制，并强调了如PBR28靶向成像和单细胞测序等新技术在理解偏头痛神经炎症中的突破性应用	作为一篇综述文章，未进行原始研究，主要基于现有文献总结，可能未涵盖所有最新进展	概述偏头痛中神经炎症的机制，并探讨其治疗靶点	偏头痛的神经炎症过程，涉及中枢和外周神经系统的胶质细胞及炎症介质	神经科学	偏头痛	单细胞测序，靶向成像	NA	文献数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA