单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 7464 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2026-04-03
A novel sorting method for the enrichment of early human spermatocytes from clinical biopsies
2024-05, F&S science
研究论文 本研究开发了一种利用荧光激活细胞分选技术富集人类睾丸活检样本中早期精母细胞的新方法 首次通过生物信息学分析鉴定出早期精母细胞特异性表面标志物TSP50,并成功应用于临床活检样本的细胞分选富集 研究样本量较小(仅3名参与者),且仅限于梗阻性无精子症患者,结果可能需要更大样本验证 开发从人类睾丸活检样本中富集早期精母细胞的方法,以促进减数分裂起始阶段生殖细胞的靶向研究 人类睾丸活检组织中的早期精母细胞 生殖医学 男性不育症 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据、免疫染色图像 3名30-40岁梗阻性无精子症男性的睾丸活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
282 2026-04-03
Staphylococcus aureus induces drug resistance in cancer T cells in Sézary syndrome
2024-04-11, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究揭示了金黄色葡萄球菌及其肠毒素如何诱导Sézary综合征中恶性T细胞产生药物耐药性 首次发现金黄色葡萄球菌肠毒素通过TCR、NF-κB和JAK/STAT信号通路诱导恶性T细胞对多种抗癌药物产生耐药性 研究主要基于体外实验,需要进一步在体实验验证;耐药机制的具体分子通路细节仍需深入探索 探究金黄色葡萄球菌感染如何导致Sézary综合征患者治疗耐药性 Sézary综合征患者的原代恶性T细胞和金黄色葡萄球菌肠毒素 肿瘤免疫学 皮肤T细胞淋巴瘤 多模态单细胞测序 NA 单细胞测序数据 患者原代恶性T细胞样本 NA 单细胞测序 NA NA
283 2026-04-03
Autofluorescence is a biomarker of neural stem cell activation state
2024-Apr-04, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文利用自发荧光成像技术,揭示了小鼠神经干细胞静息与激活状态的独特自发荧光特征,并建立了基于自发荧光的细胞状态预测方法 首次将自发荧光成像技术应用于神经干细胞状态研究,发现静息神经干细胞中特定溶酶体自发荧光可作为细胞静息程度的梯度标志物 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证;技术依赖特定成像设备,可能限制广泛应用 开发一种无标记、活细胞成像方法,以研究神经干细胞从静息到激活状态的转变过程 小鼠神经干细胞(包括静息状态和激活状态) 数字病理学 NA 荧光寿命成像(FLIM)、单细胞RNA测序 NA 图像、转录组数据 未明确具体样本数量,但涉及小鼠神经干细胞群体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
284 2026-04-03
Multi-omics in exploring the pathophysiology of diabetic retinopathy
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)及其他多组学技术在探索糖尿病视网膜病变(DR)病理生理机制中的重要作用 系统性地整合并强调了scRNA-seq与其他多组学技术(如转录组学、遗传关联研究、代谢组学)的协同作用,为揭示DR的复杂分子机制、发现新生物标志物和治疗靶点提供了革命性的视角 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据,其结论基于对现有研究的总结和展望 探讨多组学技术,特别是scRNA-seq,在阐明糖尿病视网膜病变(DR)病理生理机制中的应用与贡献 糖尿病视网膜病变(DR)的分子机制、细胞类型、信号通路、生物标志物及潜在治疗靶点 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多组学分析(包括转录组学、遗传关联研究、代谢组学) NA NA NA NA 单细胞RNA测序,多组学分析 NA NA
285 2026-04-03
Breast pericytes: a newly identified driver of tumor cell proliferation
2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和细胞培养实验,揭示了乳腺周细胞作为肿瘤微环境中的关键因子,能显著促进乳腺癌细胞增殖 首次成功分离并纯化乳腺周细胞,利用单细胞RNA测序定义了其异质性,并发现周细胞在部分乳腺肿瘤中脱离血管成为主要间充质细胞类型,且能诱导肿瘤细胞快速生长 周细胞在肿瘤中的具体刺激机制尚未完全阐明,且样本量可能有限,需要进一步研究验证 探究乳腺周细胞在乳腺癌微环境中的作用及其对肿瘤细胞增殖的影响 乳腺组织中的周细胞和乳腺癌细胞 数字病理学 乳腺癌 FACS, 单细胞RNA测序, 转录组深度测序 NA RNA序列数据, 细胞培养数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
286 2026-04-02
Single-cell multi-omics map of human fetal blood in Down syndrome
2024-10, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据,构建了人类唐氏综合征胎儿血液的高分辨率多组学图谱 首次结合单细胞多组学与空间转录组学,揭示了唐氏综合征中造血干细胞被“启动”分化的分子机制,并发现了非编码元件与基因调控网络的重构 样本量相对较小(仅18个胎儿),且仅关注胎儿期,未涉及出生后或成人阶段的造血异常 理解唐氏综合征中失调的造血过程及其分子基础 人类胎儿肝脏和骨髓样本,包括3个二倍体和15个三倍体(唐氏综合征)胎儿 数字病理学 唐氏综合征 单细胞转录组学,染色质可及性分析,空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据,ATAC-seq数据,空间转录组数据 18个胎儿样本(3个二倍体,15个三倍体),超过110万个细胞 10x Genomics 单细胞多组学,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression,10x Visium空间转录组技术
287 2026-04-02
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了胆碱能神经元活动通过毒蕈碱信号通路促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 首次发现中脑胆碱能神经元的长程投射通过M1和M3毒蕈碱受体促进DMG生长,并揭示了其与健康少突胶质前体细胞增殖的平行效应 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,人类患者样本验证有限,且胆碱能神经元亚群的具体作用机制仍需进一步探索 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 弥漫性中线胶质瘤细胞、健康少突胶质前体细胞、胆碱能神经元 神经科学 弥漫性中线胶质瘤 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、体外共培养、药理学阻断 小鼠模型、hiPSC衍生神经元模型 基因表达数据、细胞增殖数据 原发性患者DMG样本、DMG荷瘤小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
288 2026-04-02
Spatial transcriptomics of fetal membrane-Decidual interface reveals unique contributions by cell types in term and preterm births
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术分析了胎儿膜-蜕膜界面在足月和早产中的细胞类型特异性贡献 首次在空间水平上揭示胎儿膜各层(羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和蜕膜)在足月与早产中的差异基因表达模式 样本量较小(13例患者),且未涉及更广泛的妊娠并发症或种族多样性 探究胎儿膜-蜕膜界面在足月分娩和早产中的分子机制 人类胎儿膜组织(包括羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和母体蜕膜) 空间转录组学 早产 单细胞转录组学 分层聚类分析 转录组数据 13例患者(包括足月未临产、足月临产、早产和早产胎膜早破) NA 空间转录组学 NA NA
289 2026-04-01
Tppp3 is a novel molecule for retinal ganglion cell identification and optic nerve regeneration
2024-12-29, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究探索了Tppp3分子在视网膜神经节细胞神经保护和轴突再生中的作用 首次揭示了Tppp3在哺乳动物视网膜神经节细胞轴突再生中的促进作用,并发现其通过上调Bmp4等基因和神经炎症通路发挥作用 研究主要基于啮齿类动物模型,尚未在更高等的哺乳动物中进行验证 寻找促进中枢神经系统轴突再生的分子调控因子 视网膜神经节细胞(RGCs) 神经科学 中枢神经系统损伤 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA RNA测序数据 小鼠、猕猴和人类的视网膜神经节细胞 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
290 2026-04-01
Sparse dimensionality reduction for analyzing single-cell-resolved interactions
2024-Dec-26, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种针对单细胞细胞间相互作用数据的端到端降维工作流程,旨在简化细胞对间相互作用模式的分析 采用稀疏降维方法(特别是Boosting Autoencoder)来精确定位与细胞对簇相关的特定配体-受体相互作用,并提供了包含结果可视化的全面工作流程 未在摘要中明确提及具体限制 增强单细胞转录组学数据中细胞间相互作用的下游分析 单细胞细胞间相互作用数据,特别是基于已知配体-受体相互作用的细胞对 机器学习 NA 单细胞转录组学 Boosting Autoencoder 单细胞转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
291 2026-04-01
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-cell Data Analysis
2024-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过综合实验评估了基础模型在单细胞测序数据分析中的性能,并比较了其与任务特定方法的优劣 首次对十种单细胞基础模型在八个下游任务中的性能进行全面评估,并提出了一个用于评估训练稳定性、超参数影响的框架 研究发现单细胞基础模型并非在所有任务中都优于任务特定方法,这挑战了开发单细胞分析基础模型的必要性 评估基础模型在单细胞数据分析中的效用,并为模型预训练和微调提供指导 单细胞测序数据 机器学习 NA 单细胞测序 基础模型(如scGPT、Geneformer、CellPLM) 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
292 2026-04-01
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-05-03, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文描述了一种处理新鲜骨组织样本以生成高质量空间转录组数据的方法,并提供了针对先前石蜡包埋样本的详细指南 开发了一种针对硬组织(如骨)的空间转录组学方法,解决了在切片处理过程中保持RNA质量和组织形态的挑战 NA 开发适用于骨组织的空间转录组学方法,以分析细胞基因表达与组织学背景的关系 骨组织样本,包括新鲜样本和先前石蜡包埋的样本,如骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本 空间转录组学 骨肉瘤 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
293 2026-04-01
Single-cell analyses reveal transient retinal progenitor cells in the ciliary margin of developing human retina
2024-Apr-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了人类视网膜发育过程中睫状缘区存在短暂性视网膜祖细胞 结合单细胞RNA测序和空间转录组学,首次在人类视网膜发育中鉴定出睫状缘区的短暂性早期视网膜祖细胞,并揭示了其转录和染色质可及性变化 研究仅涵盖人类视网膜发育至妊娠中期的阶段,未涉及后期发育或成熟视网膜 探究人类视网膜发育过程中视网膜祖细胞的起源、分化和时空分布 人类视网膜发育过程中的细胞,特别是睫状缘区的视网膜祖细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 人类早期眼样本,涵盖至妊娠中期 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
294 2026-04-01
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究探讨了套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的机制,并发现mTOR信号通路上调是耐药的关键因素,通过mTORC1抑制剂temsirolimus可克服耐药性 首次在套细胞淋巴瘤中系统研究PRMT5抑制剂耐药机制,结合患者来源异种移植模型和细胞系模型,通过单细胞RNA测序揭示mTOR信号通路在耐药中的核心作用,并验证了联合靶向治疗的协同效应 研究主要基于体外细胞系和PDX模型,缺乏大规模临床样本验证;耐药机制可能涉及其他未被发现的通路;长期联合治疗的安全性和有效性需进一步评估 探究套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的分子机制,并寻找克服耐药性的治疗策略 套细胞淋巴瘤细胞系、患者来源异种移植模型 肿瘤生物学 套细胞淋巴瘤 RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 8个细胞系(4个敏感,4个原发耐药),4个耐药细胞系,PDX模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
295 2026-03-31
Interpreting single-cell and spatial omics data using deep neural network training dynamics
2024-12, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本研究开发了Annotatability框架,通过监测深度神经网络在单细胞和空间组学数据上的训练动态,来识别注释不匹配并表征生物数据结构 提出了一种基于深度神经网络训练动态的新方法,用于评估细胞注释的可靠性并揭示生物信号结构,结合信号感知图嵌入技术进行下游分析 未明确说明方法在更大规模或更复杂数据集上的可扩展性,且依赖于预定义的细胞注释,可能受注释主观性影响 解决单细胞和空间组学数据注释中的模糊性和错误问题,以更好地解释细胞类型、状态和异质性 单细胞和空间组学数据中的细胞注释和生物信号结构 机器学习 NA 单细胞RNA测序,空间组学 深度神经网络 单细胞RNA测序数据,空间组学数据 八个单细胞RNA测序和空间组学数据集 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
296 2026-03-31
Mapping the gene space at single-cell resolution with gene signal pattern analysis
2024-12, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文提出了一种名为基因信号模式分析(GSPA)的图信号处理方法,用于从单细胞数据中学习丰富的基因表示,以映射基因空间 首次系统性地提出基因嵌入问题,并开发了基于细胞-细胞图的扩散小波字典的GSPA方法,实现了基因在细胞流形上的模式化和定位表征 未明确提及方法在特定疾病或大规模数据集上的验证限制 开发计算方法来映射单细胞测序分析中的基因空间,并评估基因表示的有效性 单细胞测序数据中的基因 机器学习 NA 单细胞测序 图信号处理(GSPA) 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
297 2026-03-30
Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data
2024-03, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文介绍了一种名为SCORPION的工具,用于从单细胞/核RNA测序数据重建可比较的基因调控网络,以支持群体水平的比较 SCORPION利用消息传递算法和相同基线先验,克服了数据稀疏性和细胞异质性,在合成数据上优于12种现有基因调控网络重建技术,并能准确识别野生型和转录因子扰动细胞间的调控网络差异 未在摘要中明确提及 开发一种工具,用于从单细胞转录组学数据重建可比较的基因调控网络,以进行群体水平的比较 单细胞/核RNA测序数据,特别是来自结直肠癌和相邻健康组织的200,436个细胞 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序 消息传递算法 单细胞转录组学数据 200,436个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
298 2026-03-30
Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools
2024-02, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文介绍了CellBarcode工具包及其条形码模拟套件CellBarcodeSim,用于从批量或单细胞测序数据中高效、灵活地提取和过滤多种条形码类型 开发了支持多种条形码类型和分析策略的通用工具,并提供了条形码模拟功能以优化识别过程 未明确提及具体的技术限制或性能边界 提高DNA细胞条形码识别的准确性和可重复性 DNA细胞条形码 生物信息学 NA PCR和测序 NA 测序数据 NA NA 单细胞测序, 批量测序 NA NA
299 2026-03-29
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中向肌成纤维细胞分化的轨迹,并发现转录因子KLF4在此过程中的关键作用 通过单细胞RNA测序和空间转录组学方法,首次阐明了冠状动脉相关AdvSca1-SM细胞在心脏纤维化中的促纤维化分化轨迹,并发现KLF4的双重功能 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;KLF4调控AdvSca1-SM表型的具体分子机制仍需进一步探索 探究AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中的作用及KLF4的调控机制 小鼠血管平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞及人类心脏肥厚组织 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪, RNA测序 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
300 2026-03-29
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-03-29, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文提供了一个关于在脑类器官中生成和分析单细胞及单核转录组的逐步实验指南 通过结合单细胞和单核转录组学方法,克服了难以分离细胞类型的限制,使单个细胞的转录组分析在脑类器官研究中普遍适用 NA 为脑类器官研究提供单细胞和单核转录组学的实验流程,以促进对大脑发育的细胞过程和分子机制的全面研究 脑类器官 数字病理学 NA 单细胞转录组学,单核转录组学,RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq NA NA
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