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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 2941 - 2960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2941 | 2025-10-07 |
Gas6-Axl signal promotes indoor VOCs exposure-induced pulmonary fibrosis via pulmonary microvascular endothelial cells-fibroblasts cross-talk
2024-08-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.134786
PMID:38824778
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研究论文 | 本研究通过建立室内VOCs暴露小鼠模型，揭示了Gas6-Axl信号通过肺微血管内皮细胞与成纤维细胞相互作用促进肺纤维化的新机制 | 首次发现室内VOCs暴露通过诱导肺微血管内皮细胞PANoptosis表型分泌Gas6，激活成纤维细胞Axl受体促进肺纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需要进一步验证 | 阐明室内挥发性有机化合物暴露诱导肺纤维化的分子机制 | 小鼠模型、肺微血管内皮细胞、肺成纤维细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | VOCs暴露小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2942 | 2025-10-07 |
Genetic inference and single cell expression analysis of potential targets in heart failure and breast cancer
2024-Oct-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06010-y
PMID:39460820
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研究论文 | 通过遗传推断和单细胞表达分析探索心力衰竭与乳腺癌的潜在遗传靶点 | 整合全基因组关联研究、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，首次系统揭示ITM2B基因在乳腺癌中的功能作用 | 研究样本量未明确说明，体外实验仅针对MCF7细胞系，缺乏体内验证 | 探索心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点并验证其因果关系 | 心力衰竭和乳腺癌相关的遗传变异及ITM2B基因 | 生物信息学 | 乳腺癌,心血管疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫荧光 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2943 | 2025-10-07 |
Astrocytes Modulate a Specific Paraventricular Thalamus→Prefrontal Cortex Projection to Enhance Consciousness Recovery from Anesthesia
2024-Aug-21, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1808-23.2024
PMID:38926088
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研究论文 | 本研究揭示了星形胶质细胞通过调控丘脑室旁核→前额叶皮层特定神经通路促进七氟醚麻醉后意识恢复的新机制 | 首次发现星形胶质细胞Kir4.1通道在麻醉恢复中的关键作用，并鉴定出丘脑室旁核中两种不同的谷氨酸能神经元亚型 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未验证在雌性动物中的适用性；机制研究主要集中于PVT-mPFC通路 | 探索星形胶质细胞在麻醉后意识恢复中的调控机制 | 雄性小鼠的丘脑室旁核星形胶质细胞和谷氨酸能神经元 | 神经科学 | 麻醉相关意识障碍 | 单细胞RNA测序,电生理记录,膜片钳技术 | 动物模型 | 基因表达数据,电生理数据 | 雄性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2944 | 2025-10-07 |
[Microglia differential genes and their functions in paraquat-induced Parkinson's disease-like in mice's brains based on single-cell RNA sequencing]
2024-Apr-20, Zhonghua lao dong wei sheng zhi ye bing za zhi = Zhonghua laodong weisheng zhiyebing zazhi = Chinese journal of industrial hygiene and occupational diseases
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序分析百草枯诱导帕金森病样小鼠脑内小胶质细胞亚群的差异基因及相关信号通路 | 首次在百草枯诱导的帕金森病样小鼠模型中通过单细胞RNA测鉴定了小胶质细胞亚群，并发现其向M2表型极化的新机制 | 样本量较小（每组3只小鼠），且仅在细胞系中验证了部分基因表达 | 阐明百草枯诱导帕金森病样脑部变化的机制 | C57BL/6小鼠和小鼠小胶质细胞（BV2细胞） | 单细胞测序分析 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，实时荧光定量PCR，生物信息学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 6只6周龄雄性C57BL/6小鼠（对照组和实验组各3只），BV2细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 2945 | 2025-10-07 |
Association of HLA-DRB1*15:01 Status with Transcriptomic Pattern of B cells in CSF in Multiple Sclerosis (P7-6.011)
2024-Apr-09, Neurology
IF:7.7Q1
DOI:10.1212/WNL.0000000000208131
PMID:39977876
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性硬化症患者脑脊液中B细胞的基因表达模式与HLA-DRB1*15:01单倍型状态的关联 | 首次在单细胞水平揭示HLA-DRB1*15:01单倍型状态与多发性硬化症患者脑脊液B细胞转录组模式的关联 | 样本量有限（25个脑脊液样本），且使用公开数据可能受原始研究设计限制 | 探讨HLA-DRB1*15:01单倍型状态对多发性硬化症患者脑脊液B细胞基因表达模式的影响 | 多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单核细胞和脑脊液样本 | 单细胞转录组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, VDJ分析 | TRUST4, ArcasHLA | 单细胞RNA测序数据 | 25个脑脊液样本中的1376个B系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2946 | 2025-10-07 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels the molecular feature of M2 macrophages of head and neck squamous cell carcinoma
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18083
PMID:38393307
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq分析头颈鳞状细胞癌中M2巨噬细胞的分子特征 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建M2巨噬细胞相关特征模型，并鉴定FCGR2A作为潜在免疫治疗靶点 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明M2肿瘤相关巨噬细胞在头颈鳞状细胞癌中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者和肿瘤微环境中的M2巨噬细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | Consensus Clustering, 特征模型 | 基因表达谱, 临床数据 | TCGA数据库HNSC患者数据 + GSE139324单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2947 | 2025-02-21 |
FastTENET: an accelerated TENET algorithm based on manycore computing in Python
2024-11-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae699
PMID:39570606
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研究论文 | 本文提出了一种基于多核计算的加速版TENET算法，称为FastTENET，用于从单细胞RNA测序数据中重建基因调控网络 | FastTENET通过数组计算优化了TENET算法，使其在多核处理器（如GPU）上加速，性能提升高达973倍 | 尽管FastTENET显著提升了计算速度，但其性能提升依赖于硬件（如GPU）的支持 | 解决TENET算法在处理大规模单细胞RNA测序数据时计算时间过长的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | TENET算法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2948 | 2025-02-21 |
Microfluidic Chip-Based Automatic System for Sequencing Patient-Derived Organoids at the Single-Cell Level
2024-10-22, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05111
PMID:39399894
|
研究论文 | 本研究介绍了一种基于微流控芯片的自动系统MASSO，用于在单细胞水平上对患者来源的类器官进行测序 | MASSO系统通过在单一微流控芯片上执行所有必要步骤，避免了珍贵PDO的损失，并确保了单PDO细胞的全基因组扩增的高质量，自动化操作过程消除了人为错误，提高了数据重复性 | NA | 解决现有单细胞测序技术在处理临床组织样本来源的PDO时效率低下的问题 | 患者来源的类器官（PDOs） | 数字病理学 | 肺癌 | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2949 | 2025-02-21 |
DEPICT-seq: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Rare Cell Subsets Isolated via Nucleic Acid Cytometry
2024-10-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03075
PMID:39287475
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DEPICT-seq的高通量液滴核酸细胞计数方法，用于分离和分析基于核酸标记的稀有细胞亚群 | DEPICT-seq方法结合了批量细胞固定、双乳液数字PCR细胞分选和单细胞分辨率下的全长转录组分析，能够针对感兴趣的核酸标记进行细胞分选和转录组分析 | NA | 开发一种能够深入分析稀有细胞亚群的方法，以理解组织生理学和病理学 | 稀有细胞亚群，特别是T细胞受体（TCR）工程化的T细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 双乳液数字PCR、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2950 | 2025-02-21 |
Correlation of LLT-1 and NLRC4 inflammasome and its effect on glioblastoma prognosis
2024-Sep, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04750-y
PMID:38907949
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研究论文 | 本研究探讨了LLT-1与NLRC4炎症小体在胶质母细胞瘤（GBM）组织中的表达及其相互作用，揭示了它们与肿瘤恶性程度和预后的潜在关联 | 揭示了LLT-1与NLRC4炎症小体在GBM中的共表达及其与肿瘤炎症和进展的潜在关联，提出了新的NK细胞介导的抗胶质瘤途径 | 研究样本量相对较小，且主要基于中国人群数据，可能限制了结果的普适性 | 探讨LLT-1与NLRC4炎症小体在GBM中的表达及其相互作用，以揭示其与肿瘤恶性程度和预后的关联 | 胶质母细胞瘤（GBM）组织 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序（RNA-seq）、免疫荧光实验、单细胞RNA测序分析 | NA | RNA-seq数据、免疫荧光图像 | 296名患者来自中国胶质瘤基因组图谱，52名患者来自CHA医疗记录 | NA | NA | NA | NA |
| 2951 | 2025-10-07 |
The transcription factor Aiolos restrains the activation of intestinal intraepithelial lymphocytes
2024-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01693-w
PMID:38049581
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Aiolos通过调控肠道上皮内淋巴细胞活化来限制其效应功能 | 首次发现Aiolos作为IELs活化的调节因子，并阐明其通过影响IL-15信号通路和染色质可及性来调控效应功能 | Ikzf3缺陷仅部分解释观察到的表型，表明存在其他调控机制 | 探究Aiolos在肠道上皮内淋巴细胞活化调控中的作用机制 | 小鼠肠道上皮内淋巴细胞 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序，染色质可及性分析，组蛋白乙酰化检测 | NA | 基因表达数据，表观遗传数据 | Ikzf3+/+和Ikzf3-/-小鼠IELs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2952 | 2025-10-07 |
NLSDeconv: an efficient cell-type deconvolution method for spatial transcriptomics data
2024-12-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae747
PMID:39705170
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研究论文 | 提出了一种基于非负最小二乘的空间转录组学数据细胞类型反卷积方法NLSDeconv | 开发了计算效率优于现有18种反卷积方法的新算法 | NA | 解决空间转录组学数据缺乏单细胞分辨率的问题 | 空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 非负最小二乘法 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2953 | 2025-10-07 |
Accurate RNA velocity estimation based on multibatch network reveals complex lineage in batch scRNA-seq data
2024-Dec-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-02085-8
PMID:39696422
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研究论文 | 提出一种名为VeloVGI的新方法，用于在批次单细胞RNA测序数据中准确估计RNA速度并揭示复杂细胞谱系 | 通过结合最优传输和互最近邻方法构建批次数据中的邻居关系，并将图结构整合到编码器中改进速度估计 | 未明确说明方法在更广泛数据集上的适用性和计算效率 | 解决批次效应对RNA速度估计的影响，提高细胞发育轨迹推断的准确性 | 小鼠脊髓和嗅球组织细胞，以及多个公共单细胞RNA测序数据集 | 单细胞生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | VeloVGI（基于图神经网络的编码器模型） | 单细胞RNA测序数据（剪接和未剪接矩阵） | 多个公共数据集，包括小鼠脊髓和嗅球组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2954 | 2025-10-07 |
B-Cell Activation Gene Signature in Blood and Liver of Hepatitis B e Antigen-Positive Patients With Immune Active Chronic Hepatitis B
2024-Dec-16, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae280
PMID:38847286
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研究论文 | 本研究通过分析慢性乙型肝炎患者血液和肝脏中B细胞的基因表达谱，揭示了免疫活跃期患者的B细胞激活特征 | 首次在慢性乙型肝炎患者中同时分析血液和肝脏B细胞的基因表达特征，并通过单细胞RNA测序技术识别了naive和记忆B细胞亚群作为主要特征携带者 | 样本量有限，研究主要关注免疫活跃期患者，未涵盖所有慢性HBV感染阶段 | 探究慢性乙型肝炎患者B细胞的激活状态及其在HBV感染中的免疫反应特征 | 免疫活跃期慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏B细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | RNA测序, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | NA |
| 2955 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine
2024-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601271
PMID:38979337
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析预测了缺血损伤肠道中急性上皮修复的新型潜在调节因子 | 首次在猪模型中识别出表达细胞迁移转录途径的修复性肠细胞亚群，并预测CSF-1作为年龄依赖性修复反应的上游调节因子 | 研究基于猪模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探索年龄依赖性肠道屏障修复的分子机制，寻找改善新生儿肠道损伤预后的潜在治疗靶点 | 幼猪和新生猪的肠道黏膜上皮细胞，猪肠道上皮细胞系IPEC-J2 | 单细胞转录组学 | 肠道缺血损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 猪肠道黏膜上皮细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2956 | 2025-10-07 |
High throughput single cell metagenomic sequencing with semi-permeable capsules: unraveling microbial diversity at the single-cell level in sewage and fecal microbiomes
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1516656
PMID:39968047
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研究论文 | 本研究验证了使用微流控和半透性胶囊技术对污水和猪粪便样本进行高通量单细胞宏基因组测序的方法 | 开发了结合半透性胶囊和组合拆分-合并单扩增基因组条形码的高通量单细胞测序方法，可在单细胞水平解析微生物多样性 | 仅测试了污水和猪粪便两种样本类型，样本量相对有限 | 开发和应用高通量单细胞测序技术研究微生物群落 | 污水和猪粪便样本中的单个细菌细胞 | 宏基因组学 | NA | 单细胞测序，微流控技术，组合拆分-合并单扩增基因组条形码，短读长测序 | NA | 基因组测序数据 | 污水样本和猪粪便样本各1个，深测序检测1,796和1,220个SAGs，浅测序检测12,731和17,909个SAGs | Atrandi | 单细胞测序，微流控技术 | 半透性胶囊技术 | 微流控和半透性胶囊单细胞分离技术，结合组合拆分-合并单扩增基因组条形码 |
| 2957 | 2025-10-07 |
Recruitment of homodimeric proneural factors by conserved CAT-CAT E-boxes drives major epigenetic reconfiguration in cortical neurogenesis
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae950
PMID:39494521
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研究论文 | 通过整合分析揭示神经发生过程中同源二聚体前神经因子通过CAT-CAT E-boxes驱动表观遗传重编程的机制 | 发现NEUROG2和NEUROD2作为同源二聚体优先结合CAT-CAT E-boxes，并在神经元分化中期阶段发挥最大染色质重塑作用 | 研究主要基于小鼠皮层发育数据，人类中的保守性需要进一步验证 | 探究前神经因子在不同E-box类型上的协作机制及其染色质重塑功能 | 小鼠发育中的皮层神经细胞 | 表观遗传学 | 神经精神疾病 | ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, DNA甲基化测序, HT-SELEX, DNA足迹分析 | 结构建模 | 基因组学数据，表观基因组数据 | NA | NA | 染色质免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 2958 | 2025-10-07 |
Accurate and efficient integrative reference-informed spatial domain detection for spatial transcriptomics
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02284-9
PMID:38844627
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研究论文 | 开发了一种名为IRIS的计算方法，用于在空间转录组学研究中准确高效地检测空间域 | 独特利用单细胞RNA测序数据进行参考信息化的空间域检测，整合多个SRT切片并同时考虑切片内和切片间的相关性 | NA | 表征空间转录组学研究中的组织空间组织结构 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 脑部疾病,肿瘤,糖尿病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 计算方法 | 空间转录组数据 | 六个SRT数据集，涵盖不同技术、组织、物种和分辨率 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 10x Xenium,Stereo-seq | NA |
| 2959 | 2025-10-07 |
Mechanism of mTOR/RILP-regulated autophagic flux in increased susceptibility to myocardial ischemia-reperfusion in diabetic mice
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1506401
PMID:39958873
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病小鼠心肌缺血再灌注损伤易感性增加的机制，重点关注mTOR/RILP通路调控的自噬流 | 首次通过单细胞测序分析糖尿病心肌缺血再灌注后自噬相关基因的转录组变化，并揭示mTOR/RILP通路在调节自噬流中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究糖尿病心肌缺血再灌注损伤易感性增加的内在机制 | 糖尿病小鼠模型和高糖培养的心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 透射电镜, HE染色 | 动物模型和细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 形态学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2960 | 2025-10-07 |
CBX1 is involved in hepatocellular carcinoma progression and resistance to sorafenib and lenvatinib via IGF-1R/AKT/SNAIL signaling pathway
2024-Oct, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-024-10696-0
PMID:38769286
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研究论文 | 本研究探讨CBX1在肝细胞癌进展及对索拉非尼和乐伐替尼耐药性中的作用机制 | 首次揭示CBX1通过IGF-1R/AKT/SNAIL信号通路促进肝细胞癌进展和酪氨酸激酶抑制剂耐药性的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，需要进一步临床验证 | 探究CBX1在泛癌及肝细胞癌中的表达特征、功能作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织、癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、RT-PCR、Western Blotting、免疫组化、组织芯片、CCK-8、集落形成、Transwell侵袭、划痕实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 | 肝细胞癌组织及癌旁组织、多种癌细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |