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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 2941 - 2960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2941 | 2025-01-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the changes of the pulmonary immune environment in rat after Siegesbeckia orientalis L. treatment
2024-Nov, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2024.101035
PMID:39759974
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了东方泽兰治疗后大鼠肺部免疫环境的变化 | 使用单细胞RNA测序技术详细分析东方泽兰治疗对大鼠肺部免疫环境的影响 | NA | 研究东方泽兰治疗对大鼠肺部免疫环境的影响 | 大鼠肺部免疫环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2942 | 2025-01-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics analysis of non-small cell lung cancer
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48700-8
PMID:38782901
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，探讨了非小细胞肺癌中的肿瘤生态系统，特别是髓系细胞的作用 | 揭示了肿瘤中抗炎性巨噬细胞与NK细胞/T细胞之间的反向关系，以及巨噬细胞在肿瘤中的转录重编程现象 | 样本量相对较小，仅包括25名未接受治疗的患者 | 研究非小细胞肺癌肿瘤生态系统中的免疫细胞类型及其作用 | 25名未接受治疗的腺癌和鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 约900,000个细胞，来自25名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2943 | 2025-01-07 |
MUSTANG: Multi-sample spatial transcriptomics data analysis with cross-sample transcriptional similarity guidance
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100986
PMID:38800365
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MUSTANG的空间转录组数据分析框架，能够通过跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性进行多样本空间转录组数据的细胞去卷积 | MUSTANG框架创新性地结合了跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性，提升了多样本空间转录组数据的分析能力 | NA | 开发一种能够有效分析多样本空间转录组数据的框架，以揭示组织样本细胞特征中的生物学见解 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 一个半合成空间转录组数据集和三个真实世界空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2944 | 2025-01-07 |
DeepDecon accurately estimates cancer cell fractions in bulk RNA-seq data
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100969
PMID:38800361
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研究论文 | 本文介绍了DeepDecon，一种利用单细胞基因表达信息准确预测大块组织中癌细胞比例的深度神经网络模型 | DeepDecon通过迭代估计癌细胞比例的策略，提高了大块RNA-seq数据中细胞组成分解的准确性 | NA | 研究目的是提高大块RNA-seq数据中癌细胞比例的估计准确性 | 大块RNA-seq数据中的癌细胞比例 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | 深度神经网络 | RNA-seq数据 | 模拟和真实癌症数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2945 | 2025-01-07 |
Comprehensive integration of single-cell transcriptomic data illuminates the regulatory network architecture of plant cell fate specification
2024-May, Plant diversity
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.pld.2024.03.008
PMID:38798726
|
研究论文 | 本文通过整合63个已发表的单细胞转录组数据集，构建了一个全面的植物幼苗单细胞转录组图谱，揭示了细胞类型特异性基因调控网络 | 首次整合大量单细胞转录组数据，构建了涵盖广泛组织的植物细胞图谱，并系统性地构建了细胞类型特异性基因调控网络 | NA | 揭示植物细胞命运决定的调控网络架构 | 植物幼苗 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了63个已发表的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2946 | 2025-01-07 |
Spatial transcriptomics in breast cancer: providing insight into tumor heterogeneity and promoting individualized therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1499301
PMID:39749323
|
研究论文 | 本文综述了空间转录组学的关键技术方法、最新进展及其在乳腺癌中的应用，并讨论了当前空间转录组学方法的局限性和未来发展前景 | 空间转录组学解决了单细胞RNA测序缺乏空间信息的问题，能够定位和区分特定组织区域内功能基因的活跃表达，有助于识别新的乳腺癌亚型和空间区分特征，促进个体化精准治疗 | 当前空间转录组学方法仍存在局限性，未来需要进一步发展和改进 | 推进乳腺癌研究，全面理解肿瘤异质性、肿瘤微环境和耐药机制 | 乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2947 | 2025-01-07 |
New Posttranslational Modification Lactylation Brings New Inspiration for the Treatment of Rheumatoid Arthritis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497240
PMID:39758940
|
综述 | 本文综述了乳酸化在类风湿性关节炎（RA）相关细胞和机制中的研究，为RA的发病机制、诊断和治疗提供了新的见解 | 提出了乳酸化作为一种新的翻译后修饰在RA中的关键作用，并发现了潜在的生物标志物 | 本文为综述文章，未涉及具体实验数据，缺乏直接的研究验证 | 探讨乳酸化在类风湿性关节炎中的作用及其潜在的治疗应用 | 类风湿性关节炎相关细胞，如成纤维样滑膜细胞（FLSs）和巨噬细胞 | 生物医学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2948 | 2025-01-07 |
Unveiling Ventilator-Associated Pneumonia: S100A8 as a Promising Biomarker Through Integrated RNA-Seq Analysis
2024, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S495121
PMID:39759083
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA-Seq分析，揭示了S100A8作为呼吸机相关性肺炎（VAP）的潜在生物标志物 | 结合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析，筛选并验证了S100A8作为VAP诊断的潜在生物标志物，为VAP诊断提供了新的视角 | 样本量相对较小，仅分析了46个VAP样本和48个正常样本 | 探索VAP的发病机制并识别潜在的生物标志物 | 呼吸机相关性肺炎（VAP）患者 | 生物信息学 | 肺炎 | RNA-Seq, scRNA-seq, Western blot | NA | RNA序列数据 | 46个VAP样本和48个正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2949 | 2025-01-07 |
Spatially-resolved analyses of muscle invasive bladder cancer microenvironment unveil a distinct fibroblast cluster associated with prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522582
PMID:39759522
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研究论文 | 本研究利用成像质谱流式细胞术（IMC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，分析了肌肉浸润性膀胱癌（MIBC）微环境的空间异质性，并揭示了一个与预后相关的特定成纤维细胞簇 | 通过IMC和scRNA-seq技术结合空间转录组学（ST），首次揭示了MIBC微环境中特定成纤维细胞簇（S3）与内皮细胞之间的相互作用及其对预后的影响 | 样本量相对较小（40个组织样本），且研究结果需要进一步验证 | 评估MIBC微环境的空间异质性，并探索其临床意义 | 肌肉浸润性膀胱癌（MIBC）的微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 成像质谱流式细胞术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | 机器学习算法 | 图像、RNA序列数据 | 40个组织样本中的185个感兴趣区域 | NA | NA | NA | NA |
| 2950 | 2025-01-06 |
Online-adjusted evolutionary biclustering algorithm to identify significant modules in gene expression data
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae681
PMID:39749664
|
研究论文 | 本文提出了一种新的基于进化的双聚类算法OAEVOB，用于高效处理大规模基因表达数据 | OAEVOB算法引入了在线调整功能，通过更新突变概率和交叉参数来有效识别显著基因群组 | 现有算法未解决对不同基因表达数据源的泛化问题 | 开发一种可靠的创新方法，用于深入分析生物数据并确保基于准确信息做出决策 | 基因表达数据 | 机器学习 | 癌症 | DNA微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序 | 进化算法 | 基因表达数据 | 六个来自不同测序数据源的基因表达数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2951 | 2025-01-06 |
BACT: nonparametric Bayesian cell typing for single-cell spatial transcriptomics data
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae689
PMID:39751646
|
研究论文 | 本文提出了一种非参数贝叶斯模型BACT，用于单细胞空间转录组数据的细胞类型分析 | BACT模型无需预先指定细胞类型数量，能够自动从数据中学习细胞类型数量，并利用非参数Potts先验引入邻近细胞的空间依赖性 | NA | 解决现有细胞空间聚类方法需要预先指定细胞类型数量的问题 | 单细胞空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞空间转录组技术 | 非参数贝叶斯模型 | 基因表达数据和空间坐标数据 | 三个单细胞空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2952 | 2025-01-06 |
MNMST: topology of cell networks leverages identification of spatial domains from spatial transcriptomics data
2024-05-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03272-0
PMID:38783355
|
研究论文 | 本文提出了一种多层网络模型MNMST，用于通过联合学习识别空间转录组数据中的空间域 | 利用细胞网络的拓扑结构精确表征和区分空间域，提高了空间域的识别和可解释性，超越了现有基线方法 | 未提及具体局限性 | 提高空间转录组数据中空间域的识别和可解释性 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 多层网络模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2953 | 2025-01-05 |
Spatial transcriptomics reveals unique metabolic profile and key oncogenic regulators of cervical squamous cell carcinoma
2024-Dec-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06011-y
PMID:39741285
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了宫颈鳞状细胞癌（CSCC）肿瘤微环境和代谢特征，揭示了不同肿瘤区域的代谢分布及其与肿瘤分化程度的关系 | 首次结合空间转录组学（ST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，详细描绘了CSCC肿瘤边缘和核心区域的空间代谢分布，并发现了APP和TRPS1在肿瘤进展中的关键作用 | 研究样本量有限，且主要基于FFPE样本，可能影响结果的普适性 | 深入理解CSCC的肿瘤微环境和代谢特征，探索肿瘤进展的潜在机制 | 宫颈鳞状细胞癌（CSCC）患者的FFPE肿瘤样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 空间转录组学（ST）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | CSCC患者的FFPE肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2954 | 2025-01-05 |
Targeting AURKA with multifunctional nanoparticles in CRPC therapy
2024-Dec-30, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-03070-7
PMID:39734237
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研究论文 | 本研究探讨了ART-T细胞膜包裹的AMS@AD纳米颗粒在光热-化疗-免疫联合治疗中对去势抵抗性前列腺癌（CRPC）的疗效 | 首次将光热、化疗和免疫治疗结合，使用T细胞膜仿生纳米颗粒靶向AURKA，为CRPC提供了一种新的三重联合治疗方法 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验，实际疗效和安全性仍需进一步验证 | 评估CM-AMS@AD纳米颗粒在CRPC治疗中的疗效和潜在临床应用 | 去势抵抗性前列腺癌（CRPC） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、动态光散射、透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | TCGA-PRAD数据集和GEO数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2955 | 2025-01-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies the expression of hemoglobin in chondrocyte cell subpopulations in osteoarthritis
2024-Dec-30, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-024-00519-3
PMID:39736555
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了骨关节炎中软骨细胞亚群中血红蛋白的表达特征及其相关通路 | 首次在软骨细胞中发现血红蛋白的表达，并揭示了其在骨关节炎进展中的潜在机制 | 研究依赖于公共数据库中的数据，未进行实验验证 | 探讨骨关节炎中软骨细胞亚群中血红蛋白的表达特征及其相关通路 | 正常人和骨关节炎患者的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库下载的正常人和骨关节炎患者的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2956 | 2025-01-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal SPP1-CD44 signaling drives primary resistance to immune checkpoint inhibitors in RCC
2024-Dec-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06018-5
PMID:39736762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了SPP1-CD44信号在肾细胞癌中对免疫检查点抑制剂原发性耐药的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床样本分析，揭示了SPP1-CD44信号在肾细胞癌中对免疫检查点抑制剂原发性耐药的具体机制 | 研究主要基于实验室数据，尚未进行大规模临床试验验证 | 揭示肾细胞癌中对免疫检查点抑制剂原发性耐药的肿瘤-免疫相互作用和信号通路 | 肾细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因集富集分析(GSEA) | 细胞-细胞通信网络, 伪时间轨迹 | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 2957 | 2025-01-05 |
Microdissection and Single-Cell Suspension of Neocortical Layers From Ferret Brain for Single-Cell Assays
2024-Dec-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5133
PMID:39735300
|
研究论文 | 本文描述了一种从活体脑切片中微解剖发育中的大脑皮层各层，并通过酶解和机械解离生成单细胞悬液的方法，适用于高通量单细胞分析 | 该方法提高了大脑皮层遗传分析的分辨率，并促进了比小鼠更能模拟人类皮层发育的实验室动物模型（如雪貂）的研究 | NA | 研究大脑皮层发育过程中的遗传复杂性 | 雪貂大脑的发育中的大脑皮层 | 生物医学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, TrackerSeq | NA | 单细胞数据 | 胚胎期和早期出生后的雪貂大脑皮层 | NA | NA | NA | NA |
| 2958 | 2025-01-05 |
S100A8 promotes tumor progression by inducing phenotypic polarization of microglia through the TLR4/IL-10 signaling pathway in glioma
2024-Dec, Journal of the National Cancer Center
IF:7.6Q1
DOI:10.1016/j.jncc.2024.07.001
PMID:39735438
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研究论文 | 本研究探讨了S100A8在胶质瘤进展中的表达模式及其功能作用，揭示了其通过TLR4/IL-10信号通路诱导小胶质细胞表型极化促进肿瘤进展的机制 | 首次揭示了S100A8通过TLR4/IL-10信号通路诱导小胶质细胞M2极化，从而促进胶质瘤进展的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本量相对有限，需要进一步的大规模临床研究验证 | 全面评估S100A8在胶质瘤进展中的表达模式及功能作用 | 胶质瘤组织及细胞系 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 免疫组化(IHC)、Transwell实验、伤口愈合实验、CCK8实验、单细胞测序、共免疫沉淀(Co-IP) | NA | 组织样本、细胞系、公共数据库数据 | 98例胶质瘤患者组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2959 | 2025-01-05 |
Deciphering the Role of SLFN12: A Novel Biomarker for Predicting Immunotherapy Outcomes in Glioma Patients Through Artificial Intelligence
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70317
PMID:39740094
|
研究论文 | 本研究通过人工智能方法识别了SLFN12作为预测胶质瘤患者抗PD-1免疫治疗效果的生物标志物 | 首次将SLFN12基因与胶质瘤患者的免疫治疗效果联系起来，并通过单细胞RNA测序和大规模转录组数据分析验证其预测价值 | 研究结果需要进一步在更大规模的患者群体中进行验证，以确认SLFN12作为生物标志物的普适性 | 探索和验证能够预测胶质瘤患者免疫治疗效果的生物标志物 | 胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组数据分析 | 人工智能方法 | RNA测序数据, 转录组数据 | 超过3000名患者的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2960 | 2025-01-05 |
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.093393
PMID:39750553
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病（AD）的发病机制，特别是血管功能障碍在AD中的作用 | 使用新型敲入小鼠模型（EOAD和LOAD）结合空间转录组学技术（Stereo-seq）研究AD的血管功能障碍 | 研究局限于小鼠模型，可能无法完全反映人类AD的复杂性 | 研究AD的血管功能障碍及其在AD发病机制中的作用 | 早发性AD（EOAD）和晚发性AD（LOAD）小鼠模型 | 数字病理学 | 老年病 | 空间转录组学（Stereo-seq） | 敲入小鼠模型 | 基因表达数据 | EOAD小鼠（3、6、9个月）和LOAD小鼠（4、8、12个月），以及年龄匹配的C57BL/6J小鼠作为对照 | NA | NA | NA | NA |