单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7465 篇文献，本页显示第 2941 - 2960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2941 | 2024-12-11 |
An estrogen receptor signaling transcriptional program linked to immune evasion in human hormone receptor-positive breast cancer
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.23.619172
PMID:39651157
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研究论文 | 本文研究了雌激素受体信号传导程序与激素受体阳性乳腺癌中免疫逃避的关系 | 首次定义并研究了与雌激素受体信号传导（ERS）和免疫信号相关的基因模块，揭示了ERS与T细胞浸润减少的潜在机制 | 研究主要基于批量和单细胞转录组数据，缺乏功能验证实验 | 探讨雌激素受体信号传导在激素受体阳性乳腺癌中免疫逃避的机制 | 激素受体阳性乳腺癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序，多重免疫荧光 | NA | 转录组数据，免疫荧光图像 | 来自多个临床来源的乳腺癌组织和人类细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 2942 | 2024-12-11 |
Prenatal p25-activated Cdk5 induces pituitary tumorigenesis through MCM2 phosphorylation-mediated cell proliferation
2024-11, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101054
PMID:39366214
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研究论文 | 研究揭示了产前p25激活的Cdk5通过MCM2磷酸化介导的细胞增殖诱导垂体肿瘤发生 | 首次揭示了Cdk5和Mcm2在垂体腺瘤肿瘤发生中的新作用，并提供了一种新的中间叶来源的垂体腺瘤小鼠模型 | NA | 探讨Cdk5在垂体肿瘤发生中的作用及其机制 | Cdk5、Mcm2以及中间叶来源的垂体肿瘤 | NA | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型和293T细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 2943 | 2024-12-11 |
IgG autoantibodies in bullous pemphigoid directly induce a pathogenic MyD88-dependent pro-inflammatory response in keratinocytes
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.616103
PMID:39569141
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研究论文 | 研究探讨了天疱疮（BP）中的IgG自身抗体如何直接诱导角质形成细胞中的病理性MyD88依赖性促炎反应 | 首次揭示了BP-IgG自身抗体依赖的角质形成细胞反应在天疱疮病理中的作用，并证明了MyD88在BP-IgG诱导的炎症反应中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，尚未完全阐明这些发现在人类中的直接应用 | 探讨天疱疮中IgG自身抗体对角质形成细胞的直接影响及其在疾病病理中的作用 | 天疱疮患者的IgG自身抗体、角质形成细胞、MyD88信号通路 | NA | 天疱疮 | 多重免疫分析、bulk RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括天疱疮患者和对照组的IgG处理过的原代角质形成细胞，以及患病和对照皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2944 | 2024-12-11 |
Graph-Regularized Non-Negative Matrix Factorization for Single-Cell Clustering in scRNA-Seq Data
2024-08, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3400050
PMID:38787664
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研究论文 | 本文提出了一种基于图正则化的非负矩阵分解方法（Sc-GNNMF），用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 创新点在于采用图正则化的非负矩阵分解算法（GNNMF），通过拉普拉斯核和p-最近邻图估计细胞间和基因间的稀疏相似性，并使用加权p-最近已知邻居优化单细胞RNA测序数据 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性，揭示细胞异质性的潜在机制 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图正则化非负矩阵分解（GNNMF） | 基因表达数据 | 11个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2945 | 2024-12-11 |
Holliday junction recognition protein (HJURP) could reflect the clinical outcomes of lung adenocarcinoma patients, and impact the choice of precision therapy
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1475511
PMID:39649097
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研究论文 | 本文研究了HJURP蛋白在肺腺癌患者中的表达及其对临床结果和精准治疗选择的影响 | 首次揭示了HJURP作为肺腺癌的可靠预后生物标志物，并探讨了其在精准治疗中的潜在作用 | 研究结果需要在更大规模的队列中进行验证 | 识别肺腺癌的可靠预后生物标志物和潜在治疗靶点，以改善患者预后 | HJURP蛋白在肺腺癌中的表达及其与临床结果、遗传改变、免疫细胞浸润和治疗反应的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共1507例肺腺癌患者（TCGA-LUAD: 453例，GSE31210: 226例，GSE68465: 442例，GSE72094: 386例） | NA | NA | NA | NA |
| 2946 | 2024-12-10 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in ophthalmology]
2024-Dec-11, [Zhonghua yan ke za zhi] Chinese journal of ophthalmology
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在眼科领域的最新进展 | 单细胞RNA测序技术提供了研究细胞间基因表达和功能特征差异的强大工具 | 本文未提及具体的局限性 | 提供关于眼科疾病发病机制的新见解，并改进诊断和治疗策略 | 眼科疾病的发病机制和诊断治疗策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2947 | 2024-12-10 |
AOPPs induces EMT and fibrosis by activating oxidative stress through ERK/p38 MAPK signaling pathway in endometriosis
2024-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100950
PMID:39241657
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研究论文 | 研究探讨了高级氧化蛋白产物（AOPPs）通过激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导子宫内膜异位症（EMs）中的上皮-间质转化（EMT）和纤维化的机制 | 首次揭示了AOPPs在EMs中通过氧化应激激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导EMT和纤维化的机制 | 研究主要基于临床样本、单细胞测序和体内外模型，缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨AOPPs在子宫内膜异位症中诱导EMT和纤维化的分子机制 | 子宫内膜异位症（EMs）中的上皮-间质转化（EMT）和纤维化 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 使用正常大鼠进行慢性给药研究 | NA | NA | NA | NA |
| 2948 | 2024-12-10 |
ATN-161 alleviates caerulein-induced pancreatitis
2024-Dec, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.002
PMID:39396744
|
研究论文 | 研究显示ATN-161通过阻断Integrin-α5信号减轻caerulein诱导的急性胰腺炎病理状况 | 首次揭示了ATN-161作为Integrin-α5拮抗剂在减轻急性胰腺炎症状中的治疗潜力 | NA | 探索减轻急性胰腺炎病理状况的药物干预方法 | ATN-161对caerulein诱导的急性胰腺炎的影响 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2949 | 2024-12-10 |
Targeting cancer-associated fibroblasts with pirfenidone: A novel approach for cancer therapy
2024-Dec, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102624
PMID:39581071
|
研究论文 | 本文探讨了使用吡非尼酮靶向癌症相关成纤维细胞（CAFs）作为癌症治疗的新方法 | 本文提出了一种新的癌症治疗方法，通过吡非尼酮靶向CAFs，并结合化疗药物和纳米载体递送系统，以提高疗效和减少副作用 | 尽管吡非尼酮显示出抗肿瘤潜力，但其安全性和有效性仍需通过临床试验进一步验证 | 研究吡非尼酮在癌症治疗中的应用，特别是通过靶向CAFs来抑制癌症进展 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在癌症进展中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2950 | 2024-12-10 |
Endothelial KDM5B Regulated by Piezo1 Contributes to Disturbed Flow Induced Atherosclerotic Plaque Formation
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70237
PMID:39643939
|
研究论文 | 研究了Piezo1调控的内皮细胞KDM5B在扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的作用 | 首次揭示了Piezo1通过上调KDM5B表达促进动脉粥样硬化斑块形成的机制 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在人体中验证 | 探讨扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的表观遗传调控机制 | 内皮细胞中的KDM5B表达及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了HUVECs细胞和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2951 | 2024-12-09 |
Statistical and computational methods for enabling the clinical and translational application of spatial transcriptomics
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70119
PMID:39644148
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2952 | 2024-12-10 |
M2 macrophage derived HMOX1 defines chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Dec, Clinical and translational allergy
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/clt2.70014
PMID:39644500
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研究论文 | 本研究旨在开发与慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）相关的巨噬细胞诊断特征 | 提出了基于M2巨噬细胞来源的HMOX1作为CRSwNP的创新诊断标志物 | NA | 开发与CRSwNP相关的巨噬细胞诊断特征 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者和健康对照组的转录组数据 | NA | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 转录组分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | 诊断模型 | 转录组数据 | 54名CRSwNP患者和37名健康对照组，以及29个验证样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2953 | 2024-12-10 |
The Risk Genes S1PR5, CMC1, and ASAH1 as Potential Targets for the Diagnosis, Immunotherapy, and Treatment of Colon Adenocarcinoma by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Analysis
2024-11-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据构建了一个新的免疫细胞功能风险模型，用于预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次提出了S1PR5、CMC1和ASAH1作为结肠腺癌的新型治疗靶点，并通过单细胞和批量RNA测序数据验证了其潜在的临床应用价值 | 本研究仅在特定的数据集和临床队列中验证了模型的有效性，未来需要在更多独立队列中进行验证 | 开发新的风险模型以预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果，并发现新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Lasso回归分析 | RNA测序数据 | 使用了来自Tumour Immune Single Cell Hub数据库的COAD单细胞数据集GSE146771，并在多个独立队列中进行了验证 | NA | NA | NA | NA |
| 2954 | 2024-12-10 |
Analysis of the heterogeneity and complexity of murine extraorbital lacrimal gland via single-cell RNA sequencing
2024-Oct, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.06.005
PMID:38945476
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠眶外泪腺的细胞异质性和复杂性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了小鼠眶外泪腺的细胞多样性，并构建了细胞异质性的图谱 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠的眶外泪腺，未涉及其他物种或组织 | 研究小鼠眶外泪腺的细胞类型和异质性，以了解其对维持眼表健康的作用 | 小鼠眶外泪腺的细胞类型和异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 43,850个高质量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2955 | 2024-12-10 |
Joint Bayesian estimation of cell dependence and gene associations in spatially resolved transcriptomic data
2024-04-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60002-z
PMID:38664448
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研究论文 | 本文提出了一种联合贝叶斯方法，用于同时估计空间转录组数据中的基因关联和细胞依赖性 | 本文的创新点在于提出了一种联合贝叶斯方法，能够同时估计基因和空间细胞的相关性，从而保留基因表达的依赖结构 | 本文的局限性在于仅通过模拟和真实数据集进行了方法的验证，未探讨其在其他类型数据上的适用性 | 本文的研究目的是开发一种新的方法，用于分析空间转录组数据中的基因关联和细胞依赖性 | 本文的研究对象是空间转录组数据中的基因表达和细胞空间位置 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | 多个真实空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2956 | 2024-12-10 |
Glioblastoma-instructed microglia transition to heterogeneous phenotypic states with phagocytic and dendritic cell-like features in patient tumors and patient-derived orthotopic xenografts
2024-04-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01321-8
PMID:38566128
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研究论文 | 研究了胶质母细胞瘤（GBM）患者肿瘤和患者来源的同种异体移植瘤中，GBM诱导的微胶质细胞向具有吞噬和树突状细胞样特征的异质表型状态的转变 | 首次系统地描述了GBM患者肿瘤和PDOX中肿瘤微环境（TME）的单细胞和空间水平特征，揭示了GBM细胞与宿主细胞之间的相互作用及其在TME中的异质性 | 研究主要集中在GBM患者肿瘤和PDOX中的TME，未涉及其他类型的肿瘤或更广泛的免疫细胞群体 | 深入了解GBM生态系统及其在临床前模型中的再现，以提高临床试验的准确性和成功率 | GBM患者肿瘤和患者来源的同种异体移植瘤中的肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多色流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 不同肿瘤表型的GBM PDOX和患者肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2957 | 2024-12-10 |
Integrated analysis of disulfidptosis-related immune genes signature to boost the efficacy of prognostic prediction in gastric cancer
2024-Mar-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03294-5
PMID:38528532
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研究论文 | 研究探讨了二硫化物应激相关免疫基因在胃癌中的潜在生物标志物价值，并构建了一个预测模型 | 首次揭示了二硫化物应激相关免疫基因在胃癌中的潜在生物标志物价值 | NA | 探索二硫化物应激与免疫相关基因在胃癌中的内在关联，并评估其作为生物标志物的潜力 | 胃癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | Cox和LASSO分析 | 基因表达数据 | 63对胃癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2958 | 2024-12-10 |
Single-cell sequencing reveals the evolution of immune molecules across multiple vertebrate species
2024-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.02.017
PMID:36871615
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了多个脊椎动物物种免疫细胞的转录组特征，揭示了免疫分子在进化过程中的变化 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，系统地比较了多个脊椎动物物种的免疫细胞转录组特征，揭示了免疫分子在进化过程中的保守性和特异性 | 本文仅分析了七个脊椎动物物种的免疫细胞，可能无法全面代表所有脊椎动物的免疫进化特征 | 研究免疫系统在不同脊椎动物物种中的进化特征 | 七个脊椎动物物种的免疫细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 七个脊椎动物物种的免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2959 | 2024-12-09 |
PTX3 exacerbates hepatocyte pyroptosis in hepatic ischemia-reperfusion injury by promoting macrophage M1 polarization
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113604
PMID:39549552
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研究论文 | 研究探讨了PTX3在肝缺血-再灌注损伤中通过促进巨噬细胞M1极化加剧肝细胞焦亡的作用 | 首次揭示了PTX3在肝缺血-再灌注损伤中通过调节巨噬细胞极化影响肝细胞焦亡的作用 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探讨PTX3在巨噬细胞介导的肝缺血-再灌注损伤中的潜在作用 | PTX3在肝缺血-再灌注损伤中的表达及其对巨噬细胞极化和肝细胞焦亡的影响 | NA | 肝病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和鼠肝缺血-再灌注损伤模型样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2960 | 2024-11-29 |
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity in ovarian cancer and constructs a prognostic signature for prognostic prediction and immunotherapy" [Int. Immunopharmacol. 140 (2024) 112855]
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113489
PMID:39603953
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |