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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2921 | 2025-10-07 |
Illuminating the terminal nerve: Uncovering the link between GnRH-1 neuron and olfactory development
2024-03, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25599
PMID:38488687
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了终末神经神经元在GnRH-1神经元形成和迁移中的关键作用 | 首次发现Prokr2在终末神经神经元中的表达,并通过单细胞技术确认终末神经与嗅觉神经元的差异 | 研究主要基于小鼠模型,人类直接证据有限 | 阐明嗅觉系统与GnRH-1神经元发育的机制联系 | 小鼠胚胎发育过程中的终末神经神经元和GnRH-1神经元 | 发育神经生物学 | 卡尔曼综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2922 | 2025-10-07 |
Application of Single Cell Gene Expression Technologies to Neurotoxicology
2024-Mar, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2023.100458
PMID:38617035
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术在神经毒理学研究中的应用价值 | 首次系统阐述单细胞转录组技术在解决神经毒理学中细胞类型特异性差异和选择性脆弱性等挑战的潜力 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于技术前景的理论分析 | 探索单细胞基因表达技术在神经毒理学领域的应用前景 | 神经元细胞及复杂组织模型中的多种细胞类型 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2923 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Salivary Gland Endothelial Cells
2024-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231219987
PMID:38411696
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示唾液腺内皮细胞在纤维化和再生过程中的配体-受体相互作用 | 首次系统比较稳态与损伤状态下唾液腺内皮细胞的转录特征,并预测其与其他细胞类型的动态相互作用变化 | 研究仅基于雌性小鼠模型,样本量有限,且预测的相互作用需要实验验证 | 探索唾液腺内皮细胞在纤维化和再生过程中的细胞间通讯机制 | 成年雌性小鼠颌下腺和舌下腺的基质富集细胞 | 单细胞生物学 | 唾液腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,使用成年雌性小鼠唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2924 | 2025-10-07 |
Multiscale differential geometry learning of networks with applications to single-cell RNA sequencing data
2024-03, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108211
PMID:38422960
|
研究论文 | 本文提出了一种多尺度微分几何策略,用于解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战 | 首次将多尺度微分几何方法应用于scRNA-seq数据分析,通过构建多尺度细胞间相互作用流形来揭示复杂细胞网络关系 | NA | 开发新的计算方法以提升单细胞RNA测序数据的分析能力 | 单细胞RNA测序数据中的细胞网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多尺度微分几何模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2925 | 2025-10-07 |
Molecular and Spatial Signatures of Mouse Embryonic Endothelial Cells at Single-Cell Resolution
2024-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323956
PMID:38348657
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组技术绘制了小鼠胚胎内皮细胞的时空异质性图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘胚胎内皮细胞异质性,发现动脉和静脉内皮细胞共享具有静脉特征的毛细血管前体细胞 | 研究局限于小鼠胚胎模型,人类相关性需要进一步验证 | 揭示血管系统发育过程中内皮细胞异质性建立机制 | E9.5、E12.5和E15.5小鼠胚胎的内皮细胞和内皮祖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 多重错误鲁棒荧光原位杂交, CRISPR基因敲除 | 轨迹推断, 网络分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 7682个E9.5至E15.5内皮细胞进行单细胞测序,15448个内皮细胞进行空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 液滴式单细胞RNA测序 |
| 2926 | 2025-10-07 |
Secreted clusterin inhibits tumorigenesis by modulating tumor cells and macrophages in human meningioma
2024-07-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae034
PMID:38416702
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了分泌型簇集蛋白(CLU)通过诱导线粒体损伤和触发1型干扰素通路抑制脑膜瘤肿瘤发生和恶性转化的机制 | 首次发现分泌型CLU通过同步调控肿瘤细胞和巨噬细胞抑制脑膜瘤恶性转化,并揭示TNFα可增强CLU的抑癌作用 | 研究样本量相对有限,动物模型验证需要进一步扩展 | 探索脑膜瘤恶性转化的生物学机制并识别潜在治疗靶点 | 人类脑膜瘤组织样本,包括正常脑膜、良性肿瘤、高级别原位肿瘤和肺转移灶 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 18个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2927 | 2025-10-07 |
Tumor and immune cell types interact to produce heterogeneous phenotypes of pediatric high-grade glioma
2024-03-04, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad207
PMID:37934854
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童高级别胶质瘤中肿瘤细胞与免疫细胞的相互作用及其异质性 | 首次在单细胞水平揭示PHGG包含三种主要肿瘤细胞类型及其与免疫细胞的相互作用机制 | 样本量较小(仅19个PHGG样本),需要更大规模研究验证 | 解析儿童高级别胶质瘤的肿瘤异质性及其形成机制 | 19例儿童高级别胶质瘤样本中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 19个儿童高级别胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2928 | 2025-10-07 |
Copper drives remodeling of metabolic state and progression of clear cell renal cell carcinoma
2024-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.16.575895
PMID:38293110
|
研究论文 | 本研究揭示了铜通过驱动代谢重塑促进肾透明细胞癌进展的机制 | 首次阐明铜通过调控线粒体呼吸链复合物形成和谷胱甘肽生物合成,协调能量代谢与氧化还原平衡的新机制 | 未明确铜积累的具体调控机制及其在其他癌症类型中的普适性 | 探究铜在肾透明细胞癌代谢重塑和肿瘤进展中的作用机制 | 肾透明细胞癌细胞和肿瘤组织 | 癌症代谢研究 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2929 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq in diabetic foot ulcer wound healing
2024 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.13218
PMID:39264020
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索糖尿病足溃疡创面愈合的分子机制 | 首次在单细胞水平系统研究糖尿病足溃疡创面愈合过程中的细胞亚群、基因和分子特征 | NA | 深入理解糖尿病足溃疡创面愈合机制并识别潜在治疗靶点 | 糖尿病足溃疡慢性创面相关细胞 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2930 | 2025-10-07 |
Intestinal Stromal Cells in the Turmoil of Inflammation and Defective Connective Tissue Remodeling in Inflammatory Bowel Disease
2024-09-03, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izae066
PMID:38581412
|
综述 | 本文综述了肠道基质细胞在炎症性肠病中对炎症反应和细胞外基质重塑的调控作用 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示了基质细胞表型复杂性及空间功能分区,为靶向治疗提供新视角 | 当前IBD治疗主要针对炎症过程,对纤维狭窄或瘘管性疾病疗效有限 | 探讨肠道基质细胞在IBD发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 肠道上皮下肌成纤维细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2931 | 2025-10-07 |
Multi-omics analyses and machine learning prediction of oviductal responses in the presence of gametes and embryos
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598905
PMID:38915688
|
研究论文 | 通过多组学分析和机器学习预测输卵管对配子和胚胎存在的响应机制 | 开发了基于transformer的机器学习模型整合转录组和蛋白质组数据,首次系统揭示输卵管对配子和胚胎的时空特异性响应 | 小鼠模型与人类输卵管炎症反应存在部分差异,样本采集时间点有限 | 阐明输卵管与配子/胚胎之间的适应性相互作用机制 | 小鼠输卵管组织及输卵管液样本 | 机器学习 | 生殖系统疾病 | RNA-seq, scRNA-seq, 蛋白质组学 | transformer | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 小鼠输卵管组织在不同交配后时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2932 | 2025-10-07 |
cfDiffusion: diffusion-based efficient generation of high quality scRNA-seq data with classifier-free guidance
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf071
PMID:39987461
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研究论文 | 提出基于扩散模型的高质量单细胞RNA测序数据生成方法cfDiffusion | 结合无分类器引导和高级特征缓存机制,显著降低训练成本并提高多属性单细胞数据生成效率 | 推理时间仍长于scDiffusion方法 | 解决单细胞RNA测序数据模拟中的质量和效率问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2933 | 2025-10-07 |
Characterization of an orthotopic mouse transplant model reveals early changes in the tumor microenvironment of lung cancer
2024-Nov, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:39044458
|
研究论文 | 本研究通过建立原位移植小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术揭示了肺癌早期肿瘤微环境的细胞和分子变化 | 首次在携带Kras G12C突变的Lewis肺癌原位移植模型中,通过检测突变Kras转录本识别肿瘤细胞,并系统揭示了早期肿瘤微环境中成纤维细胞、髓系细胞和T/NK细胞的表型变化 | 研究基于小鼠移植模型,可能无法完全模拟人类肺癌的自然发生过程 | 探究肺癌早期阶段的细胞和分子动态变化 | Lewis肺癌细胞系(LLC)和原位移植小鼠模型 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2934 | 2025-10-07 |
POSTN+ cancer-associated fibroblasts determine the efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024-Jul-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008721
PMID:39067872
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据、空间转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌免疫治疗抵抗中的关键作用 | 首次系统鉴定POSTN+ CAF亚群在肝癌免疫治疗中的屏障作用,并阐明其通过IL-6/STAT3信号通路招募SPP1+巨噬细胞形成免疫抑制微空间的机制 | 研究基于六个数据集的220个样本,样本来源和数量可能存在局限性 | 探究肝细胞癌免疫治疗抵抗机制,特别关注癌症相关成纤维细胞亚群的作用 | 肝细胞癌患者肿瘤微环境中的细胞组成和相互作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 220个样本来自六个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2935 | 2025-10-07 |
The rise of single-cell transcriptomics in yeast
2024-04, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3934
PMID:38403881
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在酵母研究中的应用现状与发展前景 | 系统总结了酵母单细胞RNA测序技术面临的独特技术挑战及解决方案 | NA | 探讨单细胞转录组技术在酵母研究中的技术发展和应用潜力 | 酵母单细胞转录组学研究 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2936 | 2025-10-07 |
scMGATGRN: a multiview graph attention network-based method for inferring gene regulatory networks from single-cell transcriptomic data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae526
PMID:39417321
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研究论文 | 提出基于多视图图注意力网络的scMGATGRN方法,用于从单细胞转录组数据推断基因调控网络 | 首次将多视图图注意力网络应用于基因调控网络推断,能够同时利用局部特征信息和高阶邻居特征信息 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性 | 开发更准确的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图注意力网络(GAT), 多视图注意力机制 | 单细胞转录组数据 | 7个基准单细胞RNA测序数据集,来自5个细胞系(2个人类,3个小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2937 | 2025-10-07 |
Identification of microenvironment features associated with primary resistance to anti-PD-1/PD-L1 + antiangiogenesis in gastric cancer through spatial transcriptomics and plasma proteomics
2024-Sep-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02092-x
PMID:39272096
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研究论文 | 通过空间转录组学和血浆蛋白质组学分析胃癌对抗PD-1/PD-L1+抗血管生成联合疗法原发性耐药的肿瘤微环境特征 | 首次结合空间转录组学和血浆蛋白质组学系统分析胃癌联合治疗耐药机制,发现M2巨噬细胞浸润和S100A10过表达的关键作用 | 研究样本仅限REGOMUNE II期临床试验的 Caucasian 患者群体,样本代表性有限 | 探究胃癌患者对抗PD-1/PD-L1+抗血管生成联合疗法原发性耐药的分子机制 | 晚期胃癌患者 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学, 血浆蛋白质组学, 生物标志物分析 | NA | 空间转录组数据, 血浆蛋白质数据, 临床数据 | REGOMUNE II期临床试验患者群体 | NA | 空间转录组学, 血浆蛋白质组学 | NA | NA |
| 2938 | 2025-10-07 |
SFXN1-mediated immune cell infiltration and tumorigenesis in lung adenocarcinoma: A potential therapeutic target
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111918
PMID:38537539
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研究论文 | 本研究探讨了SFXN1在肺腺癌中的功能作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示SFXN1通过调节ERK磷酸化和CCL20表达影响免疫细胞浸润的分子机制 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库,需要更多临床样本验证 | 研究SFXN1在肺腺癌进展中的功能意义并评估其治疗靶点潜力 | 肺腺癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的RNA-seq和scRNA-seq数据 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, Western blot, IHC | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2939 | 2025-10-07 |
Integrated scRNAseq analyses of mouse cochlear supporting cells reveal the involvement of Ezh2 in hair cell regeneration
2024-Jan-28, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09173-y
PMID:38281217
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研究论文 | 通过整合分析小鼠耳蜗支持细胞的单细胞RNA测序数据,揭示Ezh2在毛细胞再生中的潜在作用 | 首次通过整合多个发育时间点的单细胞RNA测序数据,识别出与发育阶段相关的共表达基因,并发现Ezh2和KLF15可能是关键转录调控因子 | 研究主要基于公共数据库的测序数据,需要进一步实验验证Ezh2的具体调控机制 | 探索小鼠耳蜗毛细胞再生能力的分子基础 | 小鼠耳蜗前感觉细胞和支持细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损伤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠耳蜗组织从胚胎期14天到出生后33天的多个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2940 | 2025-10-07 |
Ectopic expression of NKG7 enhances CAR-T function and improves the therapeutic efficacy in liquid and solid tumors
2024-Dec, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107506
PMID:39551173
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现NKG7过表达可增强CAR-T细胞功能并提高对液体和实体瘤的治疗效果 | 首次利用临床样本单细胞测序数据发现NKG7可作为增强CAR-T细胞功能的靶点,并验证其在多种消化系统癌症模型中的治疗效果 | 研究样本量有限(19例单细胞测序数据),且缺乏治疗后活检样本验证 | 探索增强CAR-T细胞功能的策略并提高其抗肿瘤疗效 | 消化系统癌症患者肿瘤浸润T细胞及B7H3阳性消化系统癌细胞系 | 单细胞测序分析 | 消化系统癌症 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞模型 | 单细胞RNA测序数据 | 19例消化系统癌症临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |