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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2841 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of the endothelin system in the kidneys of mice, rats, and humans
2024-07-31, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20240768
PMID:38904098
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫定位技术对小鼠、大鼠和人类肾脏中的内皮素系统进行全面分析 | 首次结合单细胞RNA测序数据和免疫定位技术,跨物种比较肾脏内皮素系统的表达特征 | 商业抗体在不同物种间效果不一致,RNA表达水平与蛋白质水平并不总是相关 | 表征人类和啮齿类动物肾脏中内皮素系统的表达特征 | 人类、大鼠和小鼠的肾脏组织样本 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 免疫定位 | NA | 基因表达数据, 蛋白质定位数据 | 多物种肾脏样本(人类活体供者活检组织、大鼠和小鼠肾脏样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2842 | 2025-10-07 |
Heart failure promotes multimorbidity through innate immune memory
2024-05-24, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade3814
PMID:38787963
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研究论文 | 本研究揭示了心力衰竭通过改变造血干细胞表观基因组驱动多病共存的新机制 | 首次发现心力衰竭通过抑制TGF-β信号通路改变造血干细胞的表观遗传状态,形成天然免疫记忆,从而促进多病共存 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究心力衰竭促进多病共存的分子机制 | 心力衰竭小鼠模型及其造血干细胞 | 基础医学研究 | 心血管疾病 | 骨髓移植、染色质可及性分析、单细胞RNA测序 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2843 | 2025-10-07 |
Gene networks and systems biology in Alzheimer's disease: Insights from multi-omics approaches
2024-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13790
PMID:38534018
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综述 | 本文综述了多组学方法在阿尔茨海默病基因网络和系统生物学研究中的应用与发现 | 整合单细胞组学和空间组学技术,在单细胞分辨率和空间维度上研究阿尔茨海默病的基因调控网络 | NA | 全面理解阿尔茨海默病的发病机制 | 阿尔茨海默病相关的基因网络和分子机制 | 系统生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,表观基因组学,空间组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2844 | 2025-10-07 |
Clonal differences underlie variable responses to sequential and prolonged treatment
2024-Mar-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.01.011
PMID:38401539
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和条形码技术追踪耐药克隆在连续治疗过程中的变化,揭示了克隆间基因表达差异导致的不同治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序与克隆条形码技术,系统追踪耐药克隆在连续和长期治疗过程中的命运差异 | 未明确说明研究涉及的癌症类型和具体样本数量 | 探究癌症细胞克隆差异如何影响连续治疗反应,为靶向最侵袭性耐药克隆的优化治疗策略提供依据 | 癌症细胞克隆 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 克隆条形码 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2845 | 2025-10-07 |
Response to tumor-infiltrating lymphocyte adoptive therapy is associated with preexisting CD8+ T-myeloid cell networks in melanoma
2024-02-02, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg7995
PMID:38306416
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研究论文 | 本研究通过分析黑色素瘤患者接受肿瘤浸润淋巴细胞过继疗法前后的样本,揭示了治疗反应与预先存在的CD8+T细胞-髓系细胞网络之间的关联 | 首次系统揭示了TIL-ACT治疗反应与基线肿瘤微环境中T细胞-髓系细胞网络的关系,并识别了潜在的生物标志物 | 样本量较小(仅13例患者),且为单中心研究 | 探索肿瘤浸润淋巴细胞过继疗法治疗反应的生物学机制和预测标志物 | 转移性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 空间蛋白质组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质空间分布数据 | 13例转移性黑色素瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 2846 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas of IL-23 inhibition in cutaneous psoriasis distinguishes clinical response
2024-01-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adi2848
PMID:38277466
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析银屑病患者皮肤免疫细胞,揭示IL-23抑制治疗的临床反应机制 | 首次在单细胞水平建立银屑病IL-23抑制治疗的临床反应图谱,发现治疗抵抗性T17细胞活化和不可逆免疫异常状态 | 样本量有限,未明确不可逆免疫异常的分子机制 | 解析IL-23信号阻断治疗银屑病的临床反应机制 | 银屑病患者皮肤组织中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 银屑病患者皮肤样本(未明确具体数量) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2847 | 2025-10-07 |
Tuft cells and fibroblasts promote thymus regeneration through ILC2-mediated type 2 immune response
2024-01-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq6930
PMID:38215193
|
研究论文 | 本研究揭示了簇细胞和成纤维细胞通过激活ILC2介导的2型免疫反应促进胸腺再生的新机制 | 首次发现胸腺簇细胞和成纤维细胞通过产生警报素IL-25和IL-33激活ILC2,进而促进胸腺上皮细胞分化的再生机制 | 研究仅使用地塞米松诱导的急性胸腺萎缩小鼠模型,未验证其他应激模型 | 探究胸腺再生过程中非T细胞的造血细胞如何参与调控机制 | 小鼠胸腺组织中的造血细胞(不包括T细胞),特别是ILC2、簇细胞和成纤维细胞 | 免疫学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 地塞米松诱导胸腺萎缩的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2848 | 2025-10-07 |
A practical handbook on single-cell RNA sequencing data quality control and downstream analysis
2024-Sep, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100103
PMID:39094968
|
综述 | 提供单细胞RNA测序数据质量控制与下游分析的实用指南 | 系统性地提出单细胞分析中高质量细胞筛选标准和分析流程的规范化指南 | NA | 改善单细胞分析质量,为研究人员提供标准化分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2849 | 2025-10-07 |
Transfer Learning Reveals Cancer-Associated Fibroblasts Are Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition and Inflammation in Cancer Cells in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1660
PMID:38587552
|
研究论文 | 本研究通过整合人类肿瘤单细胞数据与类器官共培养实验,揭示了胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞与上皮细胞上皮-间质转化和炎症状态的关联 | 引入从人类单细胞数据到类器官共培养分析的迁移学习方法,用于细胞间相互作用的实验验证 | NA | 识别肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 胰腺导管腺癌患者样本和类器官共培养系统 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,迁移学习,类器官共培养 | 迁移学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2850 | 2025-10-07 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotype and phenotype in chronic lymphocytic leukemia
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585298
PMID:38559060
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研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术研究慢性淋巴细胞白血病中癌症亚克隆的基因型和表型特征 | 首次将长读长单细胞RNA测序技术应用于研究BTK抑制剂治疗中出现的突变亚克隆,能够更全面地分析转录本覆盖度 | 研究样本量较小(仅6名患者),且仅在部分患者中观察到突变亚克隆的转录组差异 | 探究BTK抑制剂治疗中突变亚克隆的扩张机制和转录组特征 | 慢性淋巴细胞白血病患者中的癌症亚克隆 | 单细胞测序 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序,bulk DNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,DNA测序数据 | 6名获得BTK抑制剂治疗期间出现突变的CLL患者 | NA | 单细胞RNA测序,长读长测序 | MAS-seq | 长读长单细胞RNA测序技术 |
| 2851 | 2025-03-20 |
Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in the Study of Central Nervous System Diseases
2024-Jun, Cell biochemistry and biophysics
IF:1.8Q4
DOI:10.1007/s12013-023-01207-3
PMID:38133792
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术及其在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 单细胞测序技术能够对混合细胞群体中的单个细胞进行精确分析,并从中枢神经系统的不同空间位置、时间阶段和细胞类型中收集细胞,从而发现与特定疾病相关的细胞亚群及其相关基因 | NA | 探索单细胞测序技术在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 中枢神经系统中的细胞,包括神经元和胶质细胞(如星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞) | 生物信息学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2852 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals a unique microenvironment in peri-implantitis
2024-12, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13982
PMID:38566468
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示种植体周围炎独特的免疫微环境特征 | 首次通过单细胞分析发现种植体周围炎中CXCL13+成纤维细胞亚群特异性增加,并揭示其通过CXCL8/CXCL6-CXCR2/CXCR1轴招募中性粒细胞的机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 揭示种植体周围炎的独特微环境特征 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体的组织活检样本 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2853 | 2025-10-07 |
Single-Cell Proteomic and Transcriptomic Characterization of Drug-Resistant Prostate Cancer Cells Reveals Molecular Signatures Associated with Morphological Changes
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619905
PMID:39553982
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研究论文 | 通过单细胞蛋白质组学和转录组学技术表征耐药前列腺癌细胞的分子特征及其与形态变化的关联 | 开发了优化的高通量DIA方法实现单细胞水平蛋白质定量,并首次整合单细胞蛋白质组和转录组数据揭示耐药细胞的分子异质性 | 研究主要基于PC3细胞系,未在更多细胞系或临床样本中验证 | 揭示前列腺癌耐药细胞的蛋白质组学特征和分子机制 | 前列腺癌PC3细胞系及其衍生的耐药细胞 | 单细胞多组学 | 前列腺癌 | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 数据非依赖性采集 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 优化高通量DIA方法(通量60样本/天) |
| 2854 | 2025-10-07 |
Association between biological ageing and periodontitis: Evidence from a cross-sectional survey and multi-omics Mendelian randomization analysis
2024-10, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14040
PMID:38956929
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研究论文 | 通过横断面调查和多组学孟德尔随机化分析探讨生物衰老与牙周炎之间的关联及潜在因果关系 | 首次结合横断面调查、孟德尔随机化分析和多组学整合方法系统研究生物衰老与牙周炎的因果关系及分子机制 | 基于观察性数据和遗传数据,无法完全排除残余混杂因素的影响 | 探究生物衰老与牙周炎之间的关系及潜在因果机制 | 3189名NHANES参与者和GWAS汇总统计数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞测序, GWAS, 孟德尔随机化分析, 多组学整合分析 | 多元回归分析, 两步MR中介分析 | 基因组数据, 调查数据, 单细胞测序数据 | 3189名NHANES参与者 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 2855 | 2025-10-07 |
SCIPAC: quantitative estimation of cell-phenotype associations
2024-05-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03263-1
PMID:38741183
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研究论文 | 开发了首个能够定量估计单细胞数据中每个细胞与表型关联的算法SCIPAC | 首个能够定量估计单细胞数据中细胞与表型关联的算法,并为每个关联提供p值 | 未在摘要中明确说明 | 确定单细胞RNA测序数据中细胞与表型(如癌症)之间的关联 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | SCIPAC算法 | 单细胞RNA测序数据 | 四个真实数据集(癌性和非癌性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2856 | 2025-10-07 |
IQGAP2 regulates blood-brain barrier immune dynamics
2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.07.527394
PMID:38645082
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研究论文 | 本研究揭示了IQGAP2蛋白在调控血脑屏障免疫特权和免疫细胞进入中枢神经系统中的关键作用 | 首次发现IQGAP2作为支架蛋白在调控血脑屏障免疫动态中的核心功能,并证明其在阿尔茨海默病患者海马体中表达降低 | IQGAP2调控免疫细胞浸润的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究IQGAP2蛋白如何调控血脑屏障的免疫细胞浸润 | 小鼠、斑马鱼模型以及人类组织样本 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 小鼠和斑马鱼模型,人类阿尔茨海默病组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2857 | 2025-10-07 |
Altered ontogeny and transcriptomic signatures of tissue-resident pulmonary interstitial macrophages ameliorate allergic airway hyperresponsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1371764
PMID:38983858
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研究论文 | 本研究探讨组织驻留肺间质巨噬细胞发育轨迹改变对过敏性气道高反应性的影响 | 首次揭示LPS诱导肺损伤后巨噬细胞发育谱系改变可减轻过敏性气道反应,并通过单细胞测序鉴定出与过敏性疾病相关的间质巨噬细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证 | 阐明环境暴露引起的巨噬细胞发育轨迹改变对过敏性气道反应的影响机制 | 组织驻留肺巨噬细胞和屋尘螨诱导的过敏性气道反应 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、胚胎谱系标记 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2858 | 2024-08-07 |
Prediction of cell-cell communication patterns of dorsal root ganglion cells: single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.384067
PMID:37905887
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2859 | 2025-10-07 |
Androgen deprivation induces double-null prostate cancer via aberrant nuclear export and ribosomal biogenesis through HGF and Wnt activation
2024-Feb-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45489-4
PMID:38336745
|
研究论文 | 研究揭示雄激素剥夺疗法通过异常HGF和Wnt信号激活诱导双阴性前列腺癌的机制 | 首次发现当前ADT通过异常HGF/MET信号激活进一步升高Wnt/β-catenin信号,并鉴定XPO1和核糖体蛋白在DNPC中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本,需要更大规模临床验证 | 探索雄激素剥夺疗法诱导双阴性前列腺癌的分子机制 | 前列腺癌细胞、小鼠前列腺组织、人类DNPC临床样本 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类临床DNPC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2860 | 2025-10-07 |
Gpnmb and Spp1 mark a conserved macrophage injury response masking fibrosis-specific programming in the lung
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182700
PMID:39509324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肺损伤后巨噬细胞亚群,揭示了Gpnmb和Spp1标记的巨噬细胞是组织损伤的保守反应而非纤维化特异性程序 | 首次发现巨噬细胞亚群聚类主要由细胞起源和组织分区驱动而非损伤模型,并鉴定出Gpnmb表达巨噬细胞作为组织损伤的保守反应标志 | 研究仅基于小鼠模型和已有的人类数据集,需要进一步实验验证机制 | 探究肺损伤后不同巨噬细胞亚群在健康修复和纤维化修复中的不同作用机制 | 小鼠肺巨噬细胞和人类肺疾病数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS或博来霉素处理的小鼠肺巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |