单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7513 篇文献，本页显示第 2841 - 2860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2841 | 2024-11-17 |
Combining single-cell RNA sequencing and network pharmacology to explore the target of cangfu daotan decoction in the treatment of obese polycystic ovary syndrome from an immune perspective
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1451300
PMID:39539629
|
研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序和网络药理学，从免疫角度探讨苍附导痰汤治疗肥胖型多囊卵巢综合征的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学，揭示苍附导痰汤在肥胖型多囊卵巢综合征中的免疫调节机制 | 研究样本量较小，且为单中心研究，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨苍附导痰汤在肥胖型多囊卵巢综合征中的作用机制，特别是其免疫调节作用 | 肥胖型多囊卵巢综合征患者及其免疫微环境 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 129例，包括肥胖型多囊卵巢综合征患者、正常体重多囊卵巢综合征患者和健康女性 |
| 2842 | 2024-11-17 |
Uncovering SPP1+ Macrophage, Neutrophils and Their Related Diagnostic Biomarkers in Intracranial Aneurysm and Subarachnoid Hemorrhage
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S493828
PMID:39539729
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研究论文 | 本研究通过单细胞和转录组数据分析，揭示了颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中SPP1+巨噬细胞和嗜中性粒细胞的作用及其相关诊断生物标志物 | 首次通过单细胞测序和孟德尔随机化分析揭示了SPP1+巨噬细胞在颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中的有害作用，并识别出CD36作为风险因素和有效的血液生物标志物 | NA | 探讨颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血的分子机制和诊断生物标志物 | 颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中的巨噬细胞、嗜中性粒细胞及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞测序、转录组分析、孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞数据、转录组数据 | 从GEO数据库获取的单细胞和转录组数据，以及建立的临床队列 |
| 2843 | 2024-11-17 |
Differences in cell subsets between sun-exposed and unexposed skin: preliminary single-cell sequencing and biological analysis from a single case
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1453940
PMID:39540047
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和生物分析，比较了同一患者阳光暴露和未暴露皮肤中的细胞亚群差异 | 首次揭示了光老化皮肤中单个病例的细胞成分变化，并提供了关于细胞亚群和病理学的新见解 | 研究仅基于单一病例，结果的普遍性和代表性有待进一步验证 | 评估光老化皮肤中细胞亚群变化的生物学过程和机制 | 阳光暴露和未暴露的皮肤细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 单一病例，包括阳光暴露的前臂皮肤和未暴露的臀部皮肤 |
| 2844 | 2024-11-17 |
Identify novel therapeutic targets for type II diabetes and periodontitis: insights from single-cell analysis and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1410537
PMID:39544234
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研究论文 | 通过单细胞分析和孟德尔随机化分析，识别II型糖尿病和牙周炎的新治疗靶点 | 整合单细胞分析、孟德尔随机化分析和共定位分析，识别出II型糖尿病和牙周炎的新治疗靶点 | NA | 揭示II型糖尿病和牙周炎之间的关联，并识别新的治疗靶点 | II型糖尿病和牙周炎 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞分析、孟德尔随机化分析、共定位分析 | NA | 基因数据 | NA |
| 2845 | 2024-11-17 |
Possible involvement of Toll-like receptor 8-positive monocytes/macrophages in the pathogenesis of Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1480675
PMID:39544932
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研究论文 | 研究探讨了Toll样受体8阳性单核细胞/巨噬细胞在干燥综合征发病机制中的可能作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色技术，揭示了Toll样受体8阳性单核细胞/巨噬细胞在干燥综合征中的表达和功能 | 研究样本量较小，且仅限于干燥综合征患者，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨Toll样受体在干燥综合征发病机制中的作用 | 干燥综合征患者的唾液腺组织 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、实时PCR、多色免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 32例实时PCR样本，19例多色免疫荧光染色样本 |
| 2846 | 2024-11-15 |
Integration of transcriptomics and spatial biology analyses reveals Galactomyces ferment filtrate promotes epidermal interconnectivity via induction of keratinocyte differentiation, proliferation and cellular bioenergetics
2024-Dec, International journal of cosmetic science
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/ics.12991
PMID:38924095
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研究论文 | 研究评估了Galactomyces Ferment Filtrate（GFF）对表皮分化和氧化应激反应的影响 | 首次通过转录组学和空间生物学分析揭示了GFF促进表皮细胞间连通性，并通过诱导角质形成细胞分化、增殖和细胞生物能量来实现 | NA | 评估GFF对表皮分化和氧化应激反应的影响 | 角质形成细胞和体外皮肤组织 | NA | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个供体的角质形成细胞和体外皮肤组织 |
| 2847 | 2024-11-15 |
Single-cell integrated transcriptomics reveals the role of keratinocytes in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Dec, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-024-00842-7
PMID:38421592
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，全面分析了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞水平特征，揭示了角质形成细胞在HNSCC发展中的潜在作用 | 通过hdWGCNA共表达网络分析，识别了与HNSCC进展相关的基因模块，并构建了一个基于特定基因的预测模型，展示了其在多个数据集中的稳健预测性能 | 需要进一步研究来验证和扩展这些发现，以最终改善HNSCC患者的治疗效果 | 理解HNSCC的分子机制，识别预后标志物和治疗靶点，以提高患者治疗效果 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 多个数据集 |
| 2848 | 2024-11-15 |
Prediction of clinical prognosis and drug sensitivity in hepatocellular carcinoma through the combination of multiple cell death pathways
2024-Dec, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12235
PMID:39192561
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研究论文 | 研究通过结合多种细胞死亡途径预测肝细胞癌的临床预后和药物敏感性 | 开发了一种基于细胞死亡指数（CDI）的预测模型，结合了多种细胞死亡途径和临床信息，用于预测肝细胞癌的预后和药物敏感性 | 研究依赖于现有数据集，可能存在数据偏差；模型在不同数据集上的验证结果可能存在差异 | 开发一种预测肝细胞癌临床预后和药物敏感性的模型 | 肝细胞癌患者的临床预后和药物敏感性 | 机器学习 | 肝癌 | 机器学习算法 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据、基因组数据和临床信息 | 使用了来自TCGA-LIHC、GSE14520、GSE45436和GSE166635数据集的数据 |
| 2849 | 2024-11-15 |
Identification and Verification of Key Genes in Colorectal Cancer Liver Metastases Through Analysis of Single-Cell Sequencing Data and TCGA Data
2024-Dec, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-024-16194-9
PMID:39382748
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据和TCGA数据分析，识别和验证结直肠癌肝转移中的关键基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据和TCGA数据结合，识别出结直肠癌肝转移中的关键基因，并进行了实验验证 | 研究主要基于现有数据库和实验验证，未涉及大规模临床试验 | 识别结直肠癌肝转移中的关键基因，为治疗提供潜在靶点 | 结直肠癌肝转移样本和相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17个结直肠癌肝转移样本 |
| 2850 | 2024-11-15 |
Deciphering the cellular landscape and potential targets of nasopharyngeal and oral cancers using single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12236
PMID:39205595
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序技术研究鼻咽癌和口腔癌的细胞异质性及其潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鼻咽癌和口腔癌的肿瘤微环境中的细胞多样性及其相互作用，并发现MHC-II高表达的上皮细胞亚群与良好的预后和CD4 T细胞浸润相关 | 研究仅限于鼻咽癌和口腔癌，未涉及其他类型的癌症 | 揭示鼻咽癌和口腔癌的细胞异质性及其潜在治疗靶点 | 鼻咽癌和口腔癌的肿瘤微环境中的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2851 | 2024-11-15 |
Targeted inhibition of CHKα and mTOR in models of pancreatic ductal adenocarcinoma: A novel regimen for metastasis
2024-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217280
PMID:39343354
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研究论文 | 本文研究了胰腺导管腺癌（PDAC）中CHKα和mTOR的靶向抑制，提出了一种新的抗转移治疗方案 | 设计了一种新的CHKα抑制剂CHKI-03，并验证了其在多个临床前模型中抑制转移的有效性 | NA | 探索胰腺导管腺癌转移的机制，并开发新的治疗方案 | 胰腺导管腺癌的转移机制及CHKα和mTOR的靶向抑制 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序和代谢组学分析 | NA | RNA | 多个临床前模型 |
| 2852 | 2024-11-15 |
Spatial transcriptomics reveals profound subclonal heterogeneity and T-cell dysfunction in extramedullary myeloma
2024-Nov-14, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024590
PMID:39172759
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研究论文 | 本文应用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，分析了多发性骨髓瘤的髓外病变中的三维肿瘤细胞和微环境结构 | 揭示了髓外病变中的显著亚克隆异质性和T细胞功能障碍，并发现了GPRC5D和TNFRSF17的空间表达差异 | 样本量较小，仅分析了14个髓外病变活检样本 | 探讨多发性骨髓瘤髓外病变中的肿瘤细胞和微环境的三维结构及其异质性 | 多发性骨髓瘤的髓外病变及其微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14个髓外病变活检样本，其中2个样本使用tomo-seq技术，12个样本使用10x Visium技术，3个样本使用单细胞RNA测序技术 |
| 2853 | 2024-11-15 |
Dual decoding of cell types and gene expression in spatial transcriptomics with PANDA
2024-Nov-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae876
PMID:39404057
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PANDA的新方法，用于在空间转录组学中同时解码细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达 | PANDA方法通过整合原型分析和动态学习细胞类型特征，能够捕捉细胞类型内的异质性，并在解卷积过程中动态学习每个斑点的细胞类型特征 | NA | 旨在改进空间转录组学数据的解卷积方法，以更好地理解复杂生物系统的组织动态 | 空间转录组学数据中的细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 原型分析 | 基因表达数据 | 包括肿瘤、大脑和发育中的心脏等多种组织的真实空间转录组学数据 |
| 2854 | 2024-11-15 |
UBR7 E3 Ligase Suppresses Interferon-β Mediated Immune Signaling by Targeting Sp110 in Hepatitis B Virus-Induced Hepatocellular Carcinoma
2024-Nov-08, ACS infectious diseases
IF:4.0Q1
DOI:10.1021/acsinfecdis.4c00213
PMID:38938101
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研究论文 | 研究报告了UBR7 E3连接酶通过靶向Sp110抑制干扰素-β介导的免疫信号传导，从而促进乙型肝炎病毒（HBV）诱导的肝细胞癌（HCC）的发展 | 首次揭示了UBR7在非组蛋白蛋白质泛素化中的新功能，并阐明了其在HBV诱导的HCC中的作用机制 | NA | 探讨UBR7在HBV诱导的肝细胞癌中的作用及其机制 | UBR7 E3连接酶及其底物Sp110在HBV感染和HCC中的功能 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 来自HCC患者的样本 |
| 2855 | 2024-11-15 |
Human vascularized macrophage-islet organoids to model immune-mediated pancreatic β cell pyroptosis upon viral infection
2024-Nov-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.08.007
PMID:39232561
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研究论文 | 研究利用人类多能干细胞衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官模型，模拟病毒感染下的免疫介导胰腺β细胞焦亡 | 开发了人类多能干细胞衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官模型，用于研究免疫细胞介导的宿主损伤 | NA | 建立模型以研究免疫介导的宿主损伤和病毒暴露下的β细胞损伤机制 | 人类胰腺β细胞和巨噬细胞在病毒感染下的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 涉及COVID-19胰腺尸检样本和暴露于SARS-CoV-2或CVB4病毒的人类胰岛细胞 |
| 2856 | 2024-11-15 |
Alveolar regeneration by airway secretory-cell-derived p63+ progenitors
2024-Nov-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.08.005
PMID:39232560
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研究论文 | 研究报道了在博莱霉素诱导的小鼠肺损伤后，p63阳性祖细胞从气道分泌细胞中出现，并参与肺泡修复和再生 | 首次揭示了p63阳性祖细胞来源于气道分泌细胞，并在肺损伤后通过不同途径分化为肺泡I型和II型细胞 | NA | 阐明肺损伤后肺泡修复和再生的机制 | p63阳性祖细胞的来源和分化途径 | NA | NA | 单细胞RNA测序、克隆分析、双重组酶介导的顺序遗传谱系追踪 | NA | RNA | 小鼠肺组织样本 |
| 2857 | 2024-11-15 |
Macrophage-mediated heart repair and remodeling: A promising therapeutic target for post-myocardial infarction heart failure
2024-Nov, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31372
PMID:39014935
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在心肌梗死后心脏修复和重塑中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 本文整合了巨噬细胞在心肌梗死后心衰过程中的时空动态、功能、机制和信号传导，并讨论了新兴的生物材料和针对巨噬细胞的治疗剂 | NA | 揭示心肌梗死后心衰的机制，并探讨巨噬细胞靶向治疗的可能性 | 巨噬细胞在心肌梗死后心脏修复和重塑中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 2858 | 2024-11-15 |
Decoder-seq enhances mRNA capture efficiency in spatial RNA sequencing
2024-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-02086-y
PMID:38228777
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Decoder-seq的空间RNA测序技术，该技术结合了树枝状纳米基质和微流控坐标条码，提高了mRNA捕获效率和分辨率 | Decoder-seq技术在DNA密度和分辨率方面相比现有方法有显著提升，同时保持了高灵敏度 | NA | 开发一种高灵敏度和高分辨率的空间RNA测序技术 | 小鼠嗅球中的低表达嗅觉受体基因、小鼠海马体的空间单细胞图谱、人类肾细胞癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 空间RNA测序 | NA | RNA | 小鼠嗅球、小鼠海马体、人类肾细胞癌样本 |
| 2859 | 2024-11-15 |
Inhibition of JNK ameliorates rod photoreceptor degeneration in a mouse model of retinitis pigmentosa
2024-Nov, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14978
PMID:39010325
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研究论文 | 研究了JNK抑制对视网膜色素变性小鼠模型中视杆细胞退化的影响 | 发现JNK信号通路的增强与视网膜色素变性中的视杆细胞退化有关，并通过抑制JNK减轻了微胶质细胞的激活和视杆细胞的退化 | NA | 探讨视网膜色素变性中视杆细胞退化的分子机制及潜在治疗策略 | 视网膜色素变性小鼠模型中的视杆细胞和微胶质细胞 | NA | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | rd1小鼠模型 |
| 2860 | 2024-11-15 |
Understanding mechanisms of JAK1 inhibition on synovial fibroblasts using combinatorial approaches of bulk and single cell RNAseq analyses
2024-11, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/s705qn
PMID:38910570
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研究论文 | 研究使用组合方法分析JAK1抑制剂对类风湿关节炎患者滑膜成纤维细胞的影响 | 首次通过bulk和单细胞RNA测序分析JAK1抑制剂对滑膜成纤维细胞的影响，揭示了JAK抑制剂不仅抑制炎症通路，还导致成纤维细胞分化为多个异质性细胞群 | 样本量较小，仅包括6个bulk RNA-seq和4个scRNA-seq供体 | 研究JAK1抑制剂对类风湿关节炎患者滑膜成纤维细胞的分子效应 | 类风湿关节炎患者的滑膜成纤维细胞 | NA | 类风湿关节炎 | RNA测序 | NA | RNA | 6个bulk RNA-seq供体和4个scRNA-seq供体 |