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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2821 | 2025-10-07 |
Base editing screens define the genetic landscape of cancer drug resistance mechanisms
2024-Nov, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01948-8
PMID:39424923
|
研究论文 | 通过CRISPR碱基编辑筛选系统鉴定癌症药物耐药机制的遗传基础 | 前瞻性利用CRISPR碱基编辑技术构建包含32,476种变异的筛选文库,系统绘制癌症药物耐药性变异功能图谱 | 研究仅在四种癌细胞系中进行,未涵盖所有癌症类型和体内微环境 | 系统鉴定癌症药物耐药性的遗传机制并探索克服策略 | 四种癌细胞系中的11个癌症基因变异 | 功能基因组学 | 肺癌 | CRISPR碱基编辑, 单细胞转录组测序 | CRISPR筛选 | 基因组编辑数据, 单细胞RNA测序数据 | 四种癌症细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2822 | 2025-10-07 |
Characterization of a novel mitophagy-related 5-genes signature for diagnosis of acute myocardial infarction
2024-09, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2024.107417
PMID:39159737
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研究论文 | 本研究开发了一个基于5个线粒体自噬相关基因的诊断标志物,用于急性心肌梗死的诊断 | 首次基于线粒体自噬相关基因表达将心肌梗死患者分为三个亚群,并建立了5基因诊断标志物 | 研究样本量未明确说明,需要进一步验证 | 开发心肌梗死的诊断标志物 | 心肌梗死患者的心脏组织和外周血样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,支持向量机-递归特征消除,随机森林 | SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2823 | 2025-10-07 |
Conditional deletion of miR-204 and miR-211 in murine retinal pigment epithelium results in retinal degeneration
2024-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107344
PMID:38705389
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研究论文 | 通过条件性敲除小鼠视网膜色素上皮中的miR-204和miR-211,研究其对视网膜结构和功能的影响 | 首次在成年小鼠中实现视网膜色素上皮特异性条件性敲除miR-204/211家族,并揭示其在维持视网膜功能中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 评估miR-204和miR-211在成熟小鼠眼睛中的功能作用 | 条件性敲除miR-204/211的小鼠视网膜色素上皮和视网膜组织 | 分子生物学 | 视网膜变性 | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序,光学相干断层扫描,免疫染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,成像数据,组织学数据 | 两组条件性KO小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2824 | 2025-10-07 |
A revised conceptual framework for mouse vomeronasal pumping and stimulus sampling
2024-03-25, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.01.036
PMID:38320553
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研究论文 | 本研究通过多学科方法重新探讨小鼠犁鼻器刺激采样机制,提出修正的泵送概念框架 | 发现小鼠犁鼻器侧部主要由平滑肌组成,识别出两种具有不同特性和功能的平滑肌纤维亚型,揭示了新的刺激采样机制 | 研究主要聚焦于小鼠模型,结果向其他物种的普适性需要进一步验证 | 阐明犁鼻器的物理机械功能和刺激采样基本原理 | 小鼠犁鼻器组织 | 神经生物学 | NA | 单细胞转录组学、药理学分析、2D/3D断层扫描 | NA | 解剖学数据、组织学数据、生理学数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2825 | 2025-10-07 |
Development of a prognostic gene signature and exploration of P4HA1 in the modulation of cuproptosis in colorectal cancer
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82625-y
PMID:39738206
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研究论文 | 本研究开发了一个基于铜死亡相关基因的预后模型,并探索了P4HA1在结直肠癌铜死亡调控中的作用 | 首次构建了结直肠癌铜死亡相关基因的预后模型,并发现P4HA1作为关键基因调控铜死亡过程 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索铜死亡在结直肠癌中的作用并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组分析,WGCNA,LASSO回归,随机森林,单细胞测序,体外实验 | 预后预测模型 | 转录组数据,临床数据 | TCGA数据库结直肠癌患者数据及两个独立外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2826 | 2025-10-07 |
Human Enteric Glia Diversity in Health and Disease: New Avenues for the Treatment of Hirschsprung Disease
2024-Dec-24, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.12.011
PMID:39725172
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了儿童肠道中两种主要肠胶质细胞亚类,并探索了5-HT激动剂对赫希施普龙病的治疗潜力 | 首次在人类肠道中鉴定出施万样肠胶质细胞和经典肠胶质细胞两种主要亚类,发现前者在出生后更为丰富且在赫希施普龙病无神经节段中持续存在 | 样本来源于儿科患者,结果可能不适用于成人群体;斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 | 探索健康与疾病状态下肠胶质细胞的多样性及其在赫希施普龙病治疗中的应用 | 儿科对照组和赫希施普龙病患者的肠道全层切除标本,以及野生型和ret突变斑马鱼 | 单细胞转录组学 | 赫希施普龙病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,荧光原位杂交,荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 儿科对照组和赫希施普龙病患者肠道样本,野生型和ret突变斑马鱼 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2827 | 2025-10-07 |
GSK-3β in Dendritic Cells Exerts Opposite Functions in Regulating Cross-Priming and Memory CD8 T Cell Responses Independent of β-Catenin
2024-Sep-10, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines12091037
PMID:39340067
|
研究论文 | 本研究揭示了树突状细胞中GSK-3β在调控交叉呈递和记忆CD8 T细胞应答中的相反功能,且该功能不依赖于β-连环蛋白 | 首次发现GSK-3β在树突状细胞中独立于β-连环蛋白调控CD8 T细胞免疫应答的双重功能 | 研究主要基于基因敲除小鼠模型,尚未在人类细胞中验证 | 探究GSK-3β在树突状细胞中对CD8 T细胞免疫应答的调控机制 | CD11c-GSK-3β条件性敲除小鼠的树突状细胞和CD8 T细胞 | 免疫学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序, Western blot, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2828 | 2025-10-07 |
Nociceptor-immune interactomes reveal insult-specific immune signatures of pain
2024-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01857-2
PMID:38806708
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了三种皮肤炎症疼痛模型中与疼痛发展相关的免疫基因特征和神经免疫相互作用 | 首次系统绘制了损伤特异性神经免疫相互作用组,发现免疫细胞上调的血栓反应蛋白-1能抑制伤害感受器敏化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类疾病中得到验证 | 解析疼痛发展的免疫机制和神经免疫相互作用 | 小鼠皮肤炎症疼痛模型(酵母聚糖注射、皮肤切口和紫外线烧伤) | 单细胞转录组学 | 炎症性疼痛 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三种小鼠皮肤炎症疼痛模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2829 | 2025-10-07 |
Systematic dissection of tumor-normal single-cell ecosystems across a thousand tumors of 30 cancer types
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48310-4
PMID:38744958
|
研究论文 | 通过整合分析490万个单细胞转录组数据,系统解析了30种癌症类型中肿瘤-正常组织的生态系统 | 首次在如此大规模的单细胞水平上系统描绘肿瘤-正常组织生态系统,发现了AKR1C1或WNT5A标记的炎症成纤维细胞特征及干扰素富集的群落状态 | 样本来源和癌症类型可能存在选择偏差,部分发现需要进一步功能验证 | 全面解析肿瘤微环境中肿瘤与正常组织的相互作用和异质性 | 1070个肿瘤样本和493个正常样本,涵盖30种癌症类型 | 单细胞生物学 | 多癌种 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 去卷积分析, 共现分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 490万单细胞(1070肿瘤+493正常样本), 137个空间转录组, 8887个TCGA样本, 1261个免疫治疗样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2830 | 2025-10-07 |
Twin study identifies early immunological and metabolic dysregulation of CD8+ T cells in multiple sclerosis
2024-09-27, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adj8094
PMID:39331727
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析多发性硬化症患者CD8+ T细胞的免疫和代谢失调 | 首次在同卵双胞胎研究中揭示CD8+ T细胞在多发性硬化症亚临床阶段的早期免疫代谢异常 | 样本量有限,主要基于双胞胎队列研究 | 探究CD8+ T细胞在多发性硬化症发病机制中的作用 | 同卵双胞胎队列(包括健康、亚临床神经炎症和确诊多发性硬化症个体) | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据,T细胞受体序列数据 | 同卵双胞胎队列及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 2831 | 2025-10-07 |
Targeting Fibroblast-Endothelial Interactions in LAM Pathogenesis: 3D Spheroid and Spatial Transcriptomic Insights for Therapeutic Innovation
2024-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.12.544372
PMID:37398026
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和3D球体模型探索淋巴管平滑肌瘤病中成纤维细胞-内皮细胞相互作用的机制 | 首次使用空间转录组学技术识别LAM中与肌成纤维细胞相关的激酶信号通路基因簇,并发现多激酶抑制剂索拉非尼比雷帕霉素更有效抑制细胞侵袭 | 研究样本量有限,主要基于体外模型,需要进一步临床验证 | 探索LAM疾病发病机制并寻找新的治疗靶点 | 淋巴管平滑肌瘤病肺组织、原发性LAM成纤维细胞、淋巴管内皮细胞和TSC2缺失的AML细胞 | 空间转录组学 | 肺部疾病 | 空间转录组学, 3D球体共培养, 激酶阵列分析 | 3D共培养球体模型 | 空间转录组数据, 细胞侵袭数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2832 | 2025-10-07 |
Emerging measurements for tumor-infiltrating lymphocytes in breast cancer
2024-Jun-01, Japanese journal of clinical oncology
IF:1.9Q3
DOI:10.1093/jjco/hyae033
PMID:38521965
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综述 | 本文概述了乳腺癌中肿瘤浸润淋巴细胞的评估方法及其临床意义 | 系统总结了从传统病理学方法到人工智能、单细胞分析等新兴技术在肿瘤浸润淋巴细胞评估中的应用 | 作为综述文章,未涉及原始研究数据和分析 | 探讨乳腺癌肿瘤浸润淋巴细胞的评估方法和技术进展 | 乳腺癌肿瘤微环境中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学、流式细胞术、多组学分析、单细胞分析、空间转录组学 | 人工智能 | 组织图像、分子数据 | NA | NA | 单细胞分析、空间转录组学、多组学分析 | NA | NA |
| 2833 | 2025-10-07 |
Identification and validation of up-regulated TNFAIP6 in osteoarthritis with type 2 diabetes mellitus
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82985-5
PMID:39733138
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研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定并验证了TNFAIP6作为2型糖尿病相关骨关节炎的关键上调基因 | 首次在转录水平系统研究T2DM与OA的关联,发现TNFAIP6作为前肥大软骨细胞标志物在T2DM相关OA中的新作用机制 | 研究样本来源为公共数据库,实验验证仅限于大鼠软骨细胞和人类关节软骨 | 探索2型糖尿病促进骨关节炎进展的分子机制 | 骨关节炎和2型糖尿病患者的基因表达数据、大鼠软骨细胞、人类关节软骨 | 生物信息学 | 骨关节炎, 2型糖尿病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析 | WGCNA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2834 | 2025-10-07 |
Neoadjuvant nivolumab or nivolumab plus ipilimumab in early-stage triple-negative breast cancer: a phase 2 adaptive trial
2024-Nov, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03249-3
PMID:39284953
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研究论文 | 评估早期三阴性乳腺癌患者使用纳武利尤单抗或纳武利尤单抗联合伊匹木单抗新辅助免疫治疗的疗效和安全性 | 首次探索在不联合化疗的情况下,单独使用免疫检查点抑制剂作为早期三阴性乳腺癌新辅助治疗的可行性 | 样本量较小,为II期适应性试验,需要更大规模研究验证 | 评估新辅助免疫治疗在早期三阴性乳腺癌中的疗效和安全性 | 早期三阴性乳腺癌患者 | 临床医学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 临床数据,基因表达数据 | 45例患者(队列A:15例,队列B:15例,队列C:15例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2835 | 2025-10-07 |
Timing and location dictate monocyte fate and their transition to tumor-associated macrophages
2024-07-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk3981
PMID:39058763
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和高维流式细胞术揭示了胰腺导管腺癌中单细胞向肿瘤相关巨噬细胞的转化过程 | 首次在胰腺导管腺癌模型中系统描绘了单细胞向肿瘤相关巨噬细胞分化的动态过程,发现了一个短暂存在的中间TAM群体及其产生的两个终末分化TAM谱系 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞的起源、分化过程及其在肿瘤发展中的演变 | 胰腺导管腺癌小鼠模型和人类PDAC患者样本中的单核细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 诱导性单核细胞命运图谱小鼠和人类PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2836 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics unravels palmitoylation and zonation-dependent gene regulation by AEG-1 in mouse liver
2024-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107322
PMID:38677511
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示AEG-1蛋白棕榈酰化修饰及肝脏分区对基因调控的影响 | 首次结合空间转录组学技术解析AEG-1棕榈酰化修饰在肝脏分区特异性基因调控中的作用机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明棕榈酰化如何影响AEG-1介导的基因调控与肝脏分区的关系 | AEG-1-WT和AEG-1-C75S基因敲入小鼠的肝脏组织 | 空间转录组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和肝细胞癌 | 空间转录组学 | 基因敲入小鼠模型 | 空间转录组数据 | AEG-1-WT和AEG-1-C75S同窝小鼠肝脏样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2837 | 2025-10-07 |
Age-associated CD4+ T cells with B cell-promoting functions are regulated by ZEB2 in autoimmunity
2024-03-29, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk1643
PMID:38330141
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研究论文 | 本研究鉴定了一种随年龄增长而扩增的CD4+ T细胞新亚群——年龄相关T辅助细胞(TA细胞),并揭示了其在自身免疫疾病中的作用机制 | 首次发现并命名了年龄相关的CXCR3CD4效应记忆T细胞亚群(TA细胞),揭示了其同时具有细胞毒性和B细胞辅助功能的双重特性,并证明ZEB2转录因子调控这些功能 | 样本量相对有限(354例),且主要基于流式细胞术和bulk RNA测序技术,可能需要单细胞水平的功能验证 | 探究衰老与自身免疫疾病之间的关联机制 | 354名自身免疫疾病患者和健康对照者的CD4 T细胞亚群 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 354例(自身免疫疾病患者和健康对照) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2838 | 2025-10-07 |
Increased Chemokine Production is a Hallmark of Rhesus Macaque Natural Killer Cells Mediating Robust Anti-HIV Envelope-Specific Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity
2024, Pathogens & immunity
DOI:10.20411/pai.v10i1.734
PMID:39911143
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析恒河猴自然杀伤细胞在介导抗HIV抗体依赖性细胞毒性反应中的功能异质性 | 首次在单细胞水平揭示CD107a+恒河猴NK细胞亚群具有更强的趋化因子产生能力 | 研究仅限于恒河猴模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究恒河猴自然杀伤细胞在抗HIV抗体依赖性细胞毒性反应中的功能特征 | 恒河猴自然杀伤细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2839 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of stem cells from human exfoliated deciduous teeth investigating functional heterogeneity in immunomodulation
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82734-8
PMID:39732760
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人脱落乳牙干细胞在免疫调节中的功能异质性 | 首次在单细胞水平揭示SHED不同分化状态下的免疫调节功能异质性,并与其他人源MSCs进行功能比较 | 仅进行体外实验验证,缺乏体内实验数据支持 | 探究人脱落乳牙干细胞的免疫调节功能异质性 | 人脱落乳牙干细胞(SHED) | 单细胞组学 | 炎症性疾病,自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2840 | 2025-10-07 |
Extrasinusoidal macrophages are a distinct subset of immunologically active dural macrophages
2024-12-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh1129
PMID:39705337
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术鉴定并表征了硬脑膜外窦巨噬细胞这一独特的免疫活性细胞亚群 | 首次发现硬脑膜外窦巨噬细胞在起源、扩增动力学和转录谱方面与软脑膜和中枢神经系统实质巨噬细胞存在显著差异,并揭示其在自身免疫性神经炎症中执行粒细胞凋亡清除功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类硬脑膜巨噬细胞的特性和功能仍需进一步验证 | 探究硬脑膜外窦巨噬细胞的细胞和功能异质性 | 小鼠硬脑膜巨噬细胞 | 免疫学 | 自身免疫性神经炎症 | 单细胞转录组学, 命运图谱, 共聚焦成像, 克隆分析, 转基因小鼠系 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |