单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-06 |
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1063
PMID:37953308
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研究论文 | 介绍了一个专门用于造血干细胞命运决定基因功能注释的综合知识库StemDriver | 整合了42项研究的单细胞RNA测序数据，构建了从胚胎期到成年期的全面造血谱系图谱 | NA | 建立造血干细胞命运决定相关基因功能的知识库 | 人类和小鼠的造血干细胞及其分化谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 整合42项研究数据，涵盖14种组织类型，评估人类23,839个基因和小鼠29,533个基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2025-10-06 |
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Dec-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5398491/v1
PMID:39711562
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研究论文 | 开发了一种整合成像和测序的空间多组学方法DBiTplus，可在同一组织切片上同时进行空间转录组和空间蛋白质分析 | 首次将测序型空间转录组与成像型空间蛋白质分析整合在同一组织切片上，实现单细胞分辨率细胞分型和基因组规模生物学通路研究 | NA | 开发空间多组学技术以更好地理解异质性细胞过程并连接细胞类型与功能 | 小鼠胚胎、正常人淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织 | 空间多组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组测序、空间蛋白质成像、微流控技术 | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质成像数据 | 小鼠胚胎、正常人淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织样本 | NA | 单细胞空间转录组、空间蛋白质组学 | DBiTplus、CODEX | DBiTplus整合了测序型空间转录组和CODEX高重蛋白质成像技术，通过微流控递送DNA寡核苷酸进行空间条形码标记，利用RNaseH酶选择性降解RNA-DNA杂交体中的RNA，保留完整组织切片用于蛋白质成像 |
| 263 | 2025-10-06 |
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.07.622523
PMID:39605581
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研究论文 | 提出DBiTplus整合多模态空间组学方法，在同一组织切片上结合测序型空间转录组和成像型空间蛋白质分析 | 开发了DBiTplus整合工作流程，首次实现同一组织切片上测序型空间转录组和成像型空间蛋白质的同时分析 | NA | 开发整合多模态空间组学技术，实现单细胞分辨率的空间转录组和蛋白质组联合分析 | 小鼠胚胎、正常人淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织 | 空间组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组测序,空间蛋白质成像,微流控技术 | NA | 空间转录组数据,空间蛋白质图像数据 | 小鼠胚胎、正常人淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织样本 | NA | 单细胞空间转录组,空间蛋白质组学,多组学整合 | DBiTplus,CODEX | DBiTplus整合测序型空间转录组和CODEX高重蛋白质成像技术 |
| 264 | 2025-10-06 |
Monocyte Single-Cell Multimodal Profiling in Cardiovascular Disease Risk States
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324457
PMID:39105287
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术对心血管疾病风险状态下单核细胞进行综合表征 | 首次采用CITE-seq和单细胞RNA测序相结合的多模态方法，系统揭示单核细胞的高度异质性及其在心血管疾病风险状态下的变化 | 研究主要关注特定心血管疾病风险因素，未涵盖所有可能的病理条件 | 探索单核细胞在心血管疾病风险状态下的异质性变化和功能特征 | 437,126个人类单核细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | CITE-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表位数据 | 437,126个单核细胞 | NA | 单细胞多组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-06 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
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研究论文 | 开发了一种整合细胞形态和空间转录组学的肿瘤生态系统深度分析框架METI | 首次将空间转录组学、细胞形态学和基因特征整合到端到端分析框架中，无需匹配单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本量的具体数量和研究设计的局限性 | 开发能够增强肿瘤微环境中细胞相互作用理解的分析工具 | 胃癌、肺癌、膀胱癌肿瘤组织及癌前组织 | 数字病理学 | 多癌种肿瘤 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 空间转录组数据、细胞形态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 266 | 2025-10-06 |
Decoding the mosaic of inflammatory bowel disease: Illuminating insights with single-cell RNA technology
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.07.011
PMID:39421242
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的最新进展与应用 | 系统整合单细胞转录组、蛋白质组、T细胞受体谱和表观遗传分析，提供IBD发病机制的全面视角 | 缺乏纵向研究数据，需要整合多种单细胞和空间转录组技术 | 探索单细胞测序技术在炎症性肠病研究中的应用价值 | 炎症性肠病（包括溃疡性结肠炎和克罗恩病）患者细胞 | 数字病理 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组分析, T细胞受体谱分析, 表观遗传分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 267 | 2025-10-06 |
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-May-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66850
PMID:38767376
|
研究论文 | 开发了一种用于骨组织空间转录组学分析的方法，能够有效处理新鲜骨组织和存档样本 | 解决了硬组织样本在空间转录组学分析中的技术难题，特别是骨组织的脱钙处理与RNA保存的平衡 | 方法主要针对骨组织，对其他硬组织的适用性需要进一步验证 | 开发适用于骨组织的空间转录组学分析方法 | 骨组织样本，包括新鲜骨组织和组织库中的存档样本 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，组织形态学数据 | 骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 268 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and spatial analysis reveals MUC1-mediated cellular crosstalk in mucinous colorectal adenocarcinoma
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1701
PMID:38778448
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，系统分析黏液性结直肠腺癌的肿瘤微环境，揭示MUC1介导的细胞间相互作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析MCA肿瘤微环境，发现MUC1+肿瘤细胞与ZEB1+内皮细胞的关键相互作用 | 研究样本量有限，需要更大规模队列验证发现 | 深入理解黏液性结直肠腺癌肿瘤微环境的细胞间相互作用机制 | 黏液性结直肠腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 三维生物打印, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 269 | 2025-10-06 |
Melanocyte stem cells in the skin: Origin, biological characteristics, homeostatic maintenance and therapeutic potential
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1720
PMID:38778457
|
综述 | 本文全面概述皮肤黑色素细胞干细胞的起源、生物学特性、稳态维持及治疗潜力 | 重点强调单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9技术和实用模型在黑色素细胞干细胞研究中的重要意义 | NA | 探讨黑色素细胞干细胞在皮肤组织稳态维持和疾病治疗中的潜在应用价值 | 哺乳动物毛囊、表皮或汗腺中的黑色素细胞干细胞 | 再生医学 | 皮肤色素障碍疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 270 | 2025-10-06 |
Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1699
PMID:38783408
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析HIV感染者肠道黏膜免疫细胞，揭示免疫无应答者B细胞向浆细胞分化存在缺陷 | 首次在单细胞水平描绘HIV感染者肠道黏膜免疫细胞图谱，发现免疫无应答者滤泡/记忆B细胞向浆细胞分化存在障碍 | 样本量较小（仅17名参与者），需要更大规模研究验证 | 探究HIV感染者肠道黏膜免疫细胞在免疫恢复中的作用机制 | HIV感染者肠道黏膜免疫细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，免疫组化，16S rRNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，微生物组数据，流式细胞数据 | 17名参与者（5名HIV阴性对照，9名免疫应答者，3名免疫无应答者），54,475个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序，16S rRNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1668
PMID:38649737
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2025-10-06 |
Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche
2024-01-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152
PMID:38181095
|
研究论文 | 本研究揭示了皮肤中调节性T细胞通过IL-2信号通路保护毛囊干细胞生态位的免疫豁免机制 | 开发了皮肤特异性Treg细胞基因重组技术，首次证明非淋巴器官中存在局部免疫耐受机制 | 研究主要依赖基因工程小鼠模型，人类疾病验证仅限于罕见脱发类型 | 探究皮肤局部调节性T细胞维持自身免疫耐受的生物学机制 | 皮肤调节性T细胞、毛囊干细胞生态位、脱发疾病模型 | 免疫学 | 脱发症 | 空间转录组学、遗传重组技术 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-06 |
Contributions of T Cell Signaling for Wound Healing
2024-11-14, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irae151
PMID:39110034
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光成像技术揭示了T细胞在伤口愈合过程中的信号传导特征 | 首次在伤口愈合过程中发现并验证了耗竭T细胞的存在，并揭示了不同T细胞亚群具有独特的信号传导特征 | 耗竭T细胞在伤口愈合中的分子机制和具体作用需要未来更深入的研究 | 探索T细胞在伤口愈合过程中的信号传导作用 | 伤口愈合过程中的T细胞亚群 | 免疫学 | 伤口愈合 | scRNA-seq, 免疫荧光成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 274 | 2025-10-06 |
The unveiled mosaic of intra-tumor heterogeneity in ovarian cancer through spatial transcriptomic technologies: A systematic review
2024-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.08.001
PMID:39111726
|
系统综述 | 通过空间转录组技术揭示卵巢癌肿瘤内异质性的系统综述 | 系统整合空间转录组技术在卵巢癌研究中的应用，强调空间背景对理解肿瘤异质性和微环境的重要性 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于现有文献分析 | 探讨空间转录组技术在卵巢癌肿瘤内异质性和肿瘤微环境研究中的应用价值 | 卵巢癌肿瘤组织及其微环境 | 数字病理 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 275 | 2025-10-06 |
Perivascular NOTCH3+ Stem Cells Drive Meningioma Tumorigenesis and Resistance to Radiotherapy
2024-Oct-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1459
PMID:38742767
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研究论文 | 本研究揭示了血管周围NOTCH3+干细胞在脑膜瘤发生和放疗抵抗中的关键作用 | 首次发现血管周围NOTCH3+干细胞在人类、犬类和鼠类脑膜瘤中保守存在，并驱动肿瘤发生和放疗抵抗 | NA | 探索脑膜瘤发生和放疗抵抗的细胞类型及信号机制 | 人类、犬类和鼠类脑膜瘤模型 | 肿瘤生物学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、成像技术 | 基因工程小鼠模型、异种移植模型 | 基因表达数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2025-10-06 |
DC-derived CXCL10 promotes CTL activation to suppress ovarian cancer
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.013
PMID:38823437
|
研究论文 | 本研究探讨树突状细胞来源的CXCL10通过激活细胞毒性T淋巴细胞抑制卵巢癌的机制 | 首次揭示CXCL10在卵巢癌微环境中作为树突状细胞与细胞毒性T淋巴细胞相互作用的关键调节因子 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床验证 | 阐明树突状细胞及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中的作用机制 | 卵巢癌微环境中的树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 免疫浸润分析, 体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 277 | 2025-10-06 |
WITHDRAWN: Single-cell RNA Sequencing Revealing that MMP12+ Macrophages are Associated with Cancer Liver Metastasis
2024-09-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
撤稿文章 | 该文章因作者要求已被出版商撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell RNA sequencing of endothelial cells and proteomics to unravel the role of ICAM1-PTGS2 communication in apical periodontitis: A laboratory investigation
2024-09, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14080
PMID:38713190
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术，揭示了内皮细胞在慢性根尖周炎中的多样性及ICAM1-PTGS2通讯在铁死亡中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析慢性根尖周炎中内皮细胞亚群多样性，并发现ICAM1通过调控PTGS2影响铁死亡的新机制 | 样本量较小（5个CAP样本），主要基于体外细胞实验验证，需要更多临床样本进一步确认 | 探究慢性根尖周炎中内皮细胞多样性及ICAM1-PTGS2通讯在疾病发生发展中的作用机制 | 慢性根尖周炎患者组织样本、人脐静脉内皮细胞（HUVECs）、THP-1来源的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 根尖周炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 实时PCR, 蛋白质印迹, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 基因表达数据 | 5个慢性根尖周炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2025-10-06 |
Inhalable Stem Cell Exosomes Promote Heart Repair After Myocardial Infarction
2024-Aug-27, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过吸入干细胞外泌体治疗心肌梗死的无创方法 | 首次报道通过吸入方式递送干细胞外泌体的无创治疗方法，并发现内皮细胞CD36在心脏修复中的新机制 | 研究主要基于动物模型，尚未进行临床试验验证 | 开发心肌梗死后心脏修复的无创治疗方法 | C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，心脏磁共振成像，超声心动图 | NA | 基因表达数据，影像数据，组织学数据 | 小鼠和猪的心肌梗死模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 280 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic map of the developing Atoh1 lineage identifies neural fate decisions and neuronal diversity in the hindbrain
2024-08-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.007
PMID:39106860
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序绘制发育中小鼠后脑Atoh1谱系的转录图谱，揭示神经命运决定和神经元多样性 | 首次在单细胞分辨率下揭示Atoh1谱系神经元的转录程序，发现增殖性单极刷细胞前体群 | 研究仅限于小鼠模型，人类相关性的验证需要进一步研究 | 解析Atoh1谱系神经元的命运决定机制和多样性 | 发育中小鼠后脑Atoh1谱系神经元 | 单细胞生物学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，ATOH1 DNA结合分析 | NA | 单细胞转录组数据，DNA结合数据 | 小鼠后脑Atoh1谱系神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |