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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-06-07 |
Single-cell transcriptome analysis of medaka lymphocytes reveals absence of fully mature T cells in the thymus and the T-lineage commitment in the kidney
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517467
PMID:39867910
|
研究论文 | 通过对青鳉淋巴细胞进行单细胞转录组分析，揭示了胸腺中缺乏完全成熟的T细胞以及肾脏中T谱系定向分化的特征 | 首次利用scRNA-seq分析青鳉淋巴细胞发育，发现与斑马鱼不同的种属特异性特征，包括胸腺中缺乏成熟SP T细胞及肾脏中存在T谱系定向淋巴细胞前体 | 仅分析了胸腺和肾脏两个器官，未覆盖其他淋巴组织；研究基于单一突变体模型，可能无法完全反映正常发育过程 | 理解青鳉淋巴细胞发育的分子和细胞机制，并与斑马鱼进行比较以揭示硬骨鱼类的共性和种属特异性 | 青鳉淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 包含突变体和野生型青鳉的胸腺和肾脏淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 262 | 2026-06-07 |
ScRNA-seq unveils the functional characteristics of glioma-associated macrophages and the regulatory effects of chlorogenic acid on the immune microenvironment-a study based on mouse models and clinical practice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494806
PMID:39867913
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示胶质瘤相关巨噬细胞的功能特性及绿原酸对免疫微环境的调控作用 | 首次通过单细胞转录组学解析绿原酸对骨髓来源单核巨噬细胞和小胶质细胞分化轨迹及功能的调控机制，并验证其与STAT1的高亲和力 | 仅基于小鼠模型和单例临床患者数据，缺乏大规模临床验证 | 揭示胶质瘤相关巨噬细胞亚群与功能特征，探索绿原酸对免疫微环境的调控作用及临床应用潜力 | 胶质瘤模型小鼠、一例胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, PPI蛋白互作网络, 分子对接 | NA | 单细胞转录组数据 | 胶质瘤模型小鼠及1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 263 | 2026-06-07 |
Identification and validation of BATF as a prognostic biomarker and regulator of immune cell infiltration in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429855
PMID:39872530
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研究论文 | 鉴定并验证BATF在急性髓系白血病中作为预后生物标志物和免疫细胞浸润调节因子的作用 | 首次系统研究BATF在AML中的表达与预后关联、免疫调节作用及药物敏感性影响，结合生物信息学分析与实验验证 | 未提及具体局限性，可能包括样本量有限或机制研究深度不足 | 探索BATF在急性髓系白血病中的表达、预后价值及免疫调节机制 | 急性髓系白血病患者和细胞系（C1498小鼠模型） | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 流式细胞术, 单细胞测序, EdU试验, 集落形成试验, CCK-8试验 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 | 来自TCGA和GEO数据库的AML患者数据，以及C1498小鼠模型 | NA | 单细胞测序, RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2026-06-07 |
Single-cell RNA-seq reveals immune cell heterogeneity and increased Th17 cells in human fibrotic skin diseases
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522076
PMID:39872534
|
研究论文 | 本研究利用荧光激活细胞分选富集CD45+免疫细胞并进行单细胞RNA测序，构建了纤维化皮肤病的免疫细胞图谱，发现Th17细胞在瘢痕疙瘩中显著增加并促进成纤维细胞增殖、迁移和胶原表达 | 首次通过富集免疫细胞进行单细胞RNA测序，揭示了纤维化皮肤病中免疫细胞的精细图谱，并发现Th17细胞通过IL-17A促进成纤维细胞功能的广泛机制 | 未提及研究的具体局限性 | 探究纤维化皮肤病（以瘢痕疙瘩为代表）中免疫细胞的复杂细胞图谱及其在疾病发展中的作用 | 纤维化皮肤病（瘢痕疙瘩、增生性瘢痕和硬皮病）中的免疫细胞和成纤维细胞 | 机器学习和数字病理学 | 纤维化皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2026-06-07 |
The immune landscape of fetal chorionic villous tissue in term placenta
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506305
PMID:39872537
|
研究论文 | 该研究利用流式细胞术、单细胞RNA测序及染色质可及性分析，揭示了足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型与功能多样性，并探讨了孕前肥胖对胎儿免疫及神经发育的影响 | 首次在足月期对胎盘绒毛免疫细胞进行深度表型分析，并整合转录组与染色质可及性数据，同时探索孕前肥胖对绒毛髓系细胞及胎儿小胶质细胞的影响 | 样本量可能有限，且研究仅聚焦于无并发症的足月妊娠，未涉及病理妊娠状态 | 阐明足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的组成、功能状态及其随妊娠期的变化，并评估孕前肥胖对免疫适应及胎儿神经发育的影响 | 足月胎盘绒毛组织中的免疫细胞（包括胎儿Hofbauer细胞和母体来源的巨噬细胞）及体外模型中的脐血源性小胶质细胞 | 机器学习和生物信息学 | 无特定疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CITE-seq、单核ATAC测序（snATAC-seq）、流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据 | 人类足月妊娠胎盘绒毛组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-seq和CITE-seq；10x Chromium用于snATAC-seq |
| 266 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution
2024-12, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
PMID:39393164
|
综述 | 本短篇综述强调了单细胞RNA测序在揭示基因型-表型关系中的关键作用，特别是在非模式生物对环境污染反应中的应用潜力 | 将单细胞RNA测序的应用范围从典型疾病研究扩展到非模式生物对环境污染物的反应，提供了对细胞异质性的全面理解 | 未详细讨论单细胞RNA测序在非模式生物中应用的技术挑战或数据分析难点 | 通过分析已发表文章，说明单细胞RNA测序在生物学领域的最新进展，并探讨其在非模式生物对环境污染反应研究中的潜力 | 单细胞RNA测序应用相关的已发表文章 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 267 | 2026-06-02 |
Batch effects correction in scRNA-seq based on biological-noise decoupling autoencoder and central-cross loss
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出基于生物噪声解耦自编码器和中心交叉损失的BDACL模型，用于消除单细胞RNA测序数据的批次效应 | 通过自编码器重构数据和层次聚类树逐步合并小簇，引入中心交叉损失以无监督方式消除批次效应，同时保留稀有细胞类型 | 未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据中批次效应导致稀有细胞类型信息丢失的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 268 | 2026-06-02 |
CopyMix: Mixture model based single-cell clustering and copy number profiling using variational inference
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出CopyMix模型，通过变分推断同时进行单细胞聚类和拷贝数变异分析，以研究肿瘤异质性 | 首次通过变分推断联合推断细胞聚类及其拷贝数谱，避免了传统分步处理中引入的人为聚类伪影 | 未明确说明局限性 | 开发一种能同时进行单细胞聚类和拷贝数谱推断的方法，以更好地研究肿瘤异质性 | 肿瘤细胞亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞DNA测序 | 混合隐马尔可夫模型 | 拷贝数数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2026-06-02 |
Deconvolution of cell-type-associated markers predictive of response to neoadjuvant radiotherapy
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据，对直肠癌新辅助放疗前样本进行细胞类型解卷积，识别预测放疗反应的细胞类型相关标记 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据，系统解析了直肠癌新辅助放疗响应的细胞类型特异性标记及其相互作用网络 | 未明确说明具体局限性 | 揭示直肠癌放疗后耐药和复发的细胞来源分子标记及治疗靶点 | 直肠癌患者新辅助放疗前的肿瘤样本 | 数字病理学, 机器学习 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 三个独立数据集（GSE119409、GSE35452、GSE45404） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 270 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-05, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IL-7抗癌免疫疗法介导的髓系细胞和T细胞共刺激作用 | 首次发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多效性表达，并证明重组IL-7疗法通过激活T细胞和促炎性髓系细胞诱导抗肿瘤免疫 | 检查点抑制剂的靶点缺乏表达和免疫抑制细胞的持续存在限制了其普遍疗效 | 探索IL-7疗法作为替代方法共刺激T细胞和免疫微环境以克服检查点抑制剂的局限性 | 多种人类癌症和鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种人类癌症样本和鼠肿瘤移植模型样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 271 | 2026-06-02 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-05-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序表征小鼠肾淋巴内皮细胞在静息和顺铂损伤肾中的反应，首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的分子通路 | 首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的新分子通路，为AKI治疗提供潜在靶点 | 仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；仅分析了顺铂损伤后72小时时间点，未涵盖AKI全病程 | 探究肾淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的反应及其免疫调节作用 | 小鼠肾淋巴内皮细胞（顺铂损伤和缺血再灌注损伤模型）及体外培养人淋巴内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏样本（顺铂损伤组和对照组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 272 | 2026-06-02 |
Tissue niches and immunopathology through the lens of spatial tissue profiling techniques
2024-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350484
PMID:37985207
|
综述 | 本综述通过空间组织分析技术探讨了组织微环境与免疫病理学的关系，强调了多组学组织学和空间转录组学在研究免疫反应中的重要性 | 综合讨论了空间组织分析技术相较于传统组织病理学研究的优势，并指出了其在疾病诊断和治疗中的革命性潜力 | 承认了空间组织分析技术存在挑战和局限性 | 探讨空间组织分析技术如何揭示组织微环境调控区域免疫的机制，及其在组织免疫病理学中的相关性 | 组织微环境、免疫反应、空间组织分析技术 | 计算机视觉, 机器学习 | 癌症, 自身免疫性疾病, 感染性疾病 | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | NA |
| 273 | 2026-06-02 |
Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1017-7
PMID:37955814
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq分析揭示RG样和pri-OPC样胶质瘤之间不同的免疫逃逸和微环境特征 | 首次将胶质瘤分为原始少突胶质前体细胞样和放射状胶质样亚型，并发现它们在免疫逃逸机制上的显著差异，尤其是pri-OPC样肿瘤中MHC-I基因下调以及肿瘤浸润淋巴细胞中特定基因表达与免疫检查点和不良预后的关联 | 样本量较小，仅基于26例胶质瘤的单细胞RNA-seq分析，且结论主要依赖公共数据库验证，可能缺乏广泛的临床代表性 | 研究神经发生和胶质发生与胶质瘤的关系，揭示不同胶质瘤亚型的免疫逃逸机制 | 26例胶质瘤样本及其肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组表达数据 | 26例胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 274 | 2026-06-02 |
Tumor-derived exosomes induce initial activation by exosomal CD19 antigen but impair the function of CD19-specific CAR T-cells via TGF-β signaling
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1010-1
PMID:37870681
|
研究论文 | 研究了肿瘤来源外泌体通过外泌体CD19抗原诱导初始激活，但通过TGF-β信号损害CD19特异性CAR-T细胞功能 | 首次揭示了B细胞淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞的双重作用：初始激活与后续抑制，并发现TGF-β抑制剂可逆转抑制作用 | 未明确外泌体诱导CAR-T细胞凋亡和功能损害的具体分子机制细节 | 探究淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞功能的影响及其机制 | B细胞淋巴瘤来源外泌体、CD19-CAR T细胞、淋巴瘤患者血浆外泌体 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究对象包括来自淋巴瘤患者的血浆外泌体及CD19-CAR T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 275 | 2026-06-02 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
|
研究论文 | 研究指出标准单细胞RNA测序比对流程易将杀伤细胞免疫球蛋白样受体（KIR）转录本错误分配，导致活化型KIR基因表达被低估 | 首次揭示单细胞RNA-seq数据中KIR基因错误分配是导致激活型KIR表达被低估的根本原因 | 未提供具体解决方案或替代比对算法来纠正KIR基因错误分配问题 | 阐明单细胞RNA-seq数据中KIR基因表达低估的机制原因 | KIR基因转录本及单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2026-06-02 |
Macrophage heterogeneity in atherosclerosis: A matter of context
2024-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350464
PMID:37943053
|
综述 | 探讨动脉粥样硬化中巨噬细胞的异质性与功能特化及其与微环境的关系 | 强调巨噬细胞在动脉粥样硬化中具有高度异质性和功能特化，并指出传统炎症/抗炎范式不足以解释其复杂致病机制，提出空间多组学方法的重要性 | 对局部微环境在动脉粥样硬化中塑造巨噬细胞表型和功能的作用仍大多未被描述 | 综述巨噬细胞在动脉粥样硬化中的起源、功能特化、表型多样性及微环境的影响 | 巨噬细胞亚群（小鼠和人类动脉粥样硬化模型中的斑块巨噬细胞） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3' |
| 277 | 2026-06-01 |
Airway-derived emphysema-specific alveolar type II cells exhibit impaired regenerative potential in COPD
2024-Dec, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02071-2023
PMID:39147413
|
研究论文 | 发现了一种位于肺泡远端囊泡中的特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），该细胞在COPD中表现出再生潜力受损，并可能成为新的治疗靶点 | 首次发现并描述了一种同时表达肺泡标记物表面活性蛋白C和club细胞标记物SCGB3A2的肺气肿特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），并在小鼠模型中证实其来源于club细胞 | 未提及具体研究局限，但基于摘要可推断可能包括：研究主要在体外类器官模型中进行，缺乏体内功能验证；样本量及临床相关性有待进一步确认 | 探究COPD肺气肿中组织再生受损的驱动因素，特别是肺上皮祖细胞异常 | COPD患者和健康对照的肺泡II型（ATII）细胞及气道club细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、谱系标记 | NA | 基因表达数据 | 人及小鼠样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2026-06-01 |
Graph attention automatic encoder based on contrastive learning for domain recognition of spatial transcriptomics
2024-10-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07037-0
PMID:39424696
|
研究论文 | 提出了一种基于图注意力自动编码器和对比学习的空间转录组数据域识别方法GAAEST | 引入自监督对比学习从局部、全局和上下文三个层次捕捉空间信息，显著提升空间域识别性能 | 未明确讨论方法的计算开销或对大规模数据集的扩展性 | 从空间转录组数据中准确识别空间域 | 空间转录组数据的空间域识别 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图注意力自动编码器 (GAAEST) | 基因表达数据，空间位置信息 | 基于多个数据集进行实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 279 | 2026-06-01 |
Insights into the molecular characteristics of embryonic cranial neural crest cells and their derived mesenchymal cell pools
2024-10-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07056-x
PMID:39424998
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示胚胎颅神经嵴细胞及其衍生间充质细胞池的分子特征 | 首次发现鹿茸源性祖细胞与牙髓间充质细胞在转录组特征上的惊人相似性，并揭示全基因组DNA甲基化分析中再生性鹿茸骨膜中CNCC衍生特征基因的低甲基化现象 | 未明确提及 | 研究颅神经嵴细胞衍生间充质细胞的分子特征及其再生潜力 | 鹿的牙齿和鹿茸组织中的颅神经嵴衍生间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、全基因组DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据、DNA甲基化数据 | 未明确说明样本数量，涉及鹿的牙齿和鹿茸组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 280 | 2026-06-01 |
scRNA-Explorer: An End-user Online Tool for Single Cell RNA-seq Data Analysis Featuring Gene Correlation and Data Filtering
2024-09-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168654
PMID:39237193
|
研究论文 | 提出了面向最终用户的单细胞RNA-seq数据在线分析工具scRNA-Explorer，支持基因相关性分析和数据过滤 | 开发了交互式在线工具，整合基因相关性分析、生物学重要性评估和基因富集分析，简化了单细胞RNA-seq数据的下游分析 | NA | 简化单细胞RNA-seq数据分析流程，提供面向非专业用户的交互式在线分析工具 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |