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当前共找到 7466 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2026-08-22
Single-cell RNA-seq of Drosophila miranda testis reveals the evolution and trajectory of germline sex chromosome regulation
2024-04, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序研究果蝇miranda睾丸中生殖系性染色体调控的演化轨迹,揭示剂量补偿关闭而非减数分裂性染色体失活导致X连锁基因下调,并探讨neo-Y染色体对剂量平衡的补偿机制 首次在果蝇中结合单细胞和批量RNA测序与核糖体分析,以年轻性染色体为模型,揭示生殖系中X下调主要由剂量补偿关闭而非传统MSCI驱动,并发现neo-Y连锁基因通过翻译补偿蛋白剂量 研究局限于单一果蝇物种,且依赖转录和翻译数据,未直接验证调控机制的功能性 探究果蝇中年轻性染色体如何获得性、细胞类型特异的调控程序,以及这些机制对性染色体架构演化的影响 果蝇miranda的睾丸生殖细胞(包括精原细胞、精母细胞等)及其性染色体(X、neo-X、neo-Y) 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq、核糖体分析 不适用 单细胞基因表达数据、批量转录组数据、翻译组数据 未明确说明样本数量,涉及果蝇miranda睾丸的多个细胞类型 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
262 2026-08-21
Brca1 haploinsufficiency promotes early tumor onset and epigenetic alterations in a mouse model of hereditary breast cancer
2024-Dec, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 利用新的基因工程小鼠模型,揭示Brca1单倍剂量不足通过表观遗传改变促进遗传性乳腺癌早期发生。 首次证明Brca1杂合状态下的早期肿瘤发生不能完全由经典'二次打击'假说解释,并发现表观遗传预编程在肿瘤加速中的关键作用。 研究基于小鼠模型,其结果在人类中的适用性有待进一步验证。 阐明Brca1单倍剂量不足促进乳腺癌早期发生的机制。 Brca1杂合小鼠的乳腺上皮细胞及肿瘤细胞。 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, ATAC测序 NA 基因组数据, 表观基因组数据 小鼠模型,涉及多个个体,具体数量未提供。 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和ATAC测序
263 2026-08-21
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 利用单细胞和空间转录组学技术在空间和时间上详细描绘了人类胚胎肢体发育过程,揭示了细胞多样化和新的细胞群体,并绘制了胎儿后肢的空间转录图谱 首次对人类胚胎肢体发育进行跨空间和时间的单细胞与空间转录组综合分析,发现了多个新的细胞群体和两波肌肉发育过程,并利用新开发的VisiumStitcher工具拼接多个空间转录组样本 未提及具体局限性 深入表征人类胚胎肢体发育的细胞和分子机制,以填补模式生物之外的人类研究空白 人类胚胎肢体(包括上肢和下肢)及小鼠胚胎肢体 转录组学 先天性肢体畸形 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 未明确提及具体样本数量,但包括多个人类胚胎肢体样本和小鼠胚胎肢体样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞转录组和10x Visium空间转录组,使用VisiumStitcher拼接多个空间样本
264 2026-08-21
Proinflammatory immune cells disrupt angiogenesis and promote germinal matrix hemorrhage in prenatal human brain
2024-Nov, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 该研究揭示了产前人类大脑中促炎免疫细胞破坏血管生成并促进生发基质出血的机制 首次发现小胶质细胞与新生血管的年龄依赖性相互作用,并证明在早产儿生发基质出血中,激活的中性粒细胞和单核细胞通过产生促炎因子破坏血管完整性 研究主要基于小鼠模型和早产儿样本,可能无法完全代表人类胎儿发育的复杂情况,且具体分子机制尚需进一步验证 探究生发基质出血的病因,特别是免疫细胞在血管生成和血管脆弱性中的作用 产前小鼠和人类大脑的生发基质,以及CD45免疫细胞 神经科学 生发基质出血 单细胞转录组学,流式细胞术 NA 基因表达数据 包含正常早产儿和生发基质出血早产儿的CD45细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
265 2026-08-21
MultiSC: a deep learning pipeline for analyzing multiomics single-cell data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 MultiSC是一个用于分析多组学单细胞数据的深度学习流程,通过整合基因表达、染色质可及性和转录因子蛋白表达,实现细胞聚类和基因调控网络预测 提出了一种新颖的多模态约束自编码器(单细胞层次约束自编码器)用于聚类过程中的多组学数据整合 未提及 填补多组学单细胞数据分析工具缺乏的空白,提供综合性的分析流程 多组学单细胞数据(以NEAT-seq为例) 机器学习 NA 单细胞测序 自编码器、矩阵分解模型、多元线性回归模型 基因表达、染色质可及性、蛋白质表达数据 NA NA 单细胞多组学 NA NA
266 2026-08-21
Knocking Out CD70 Rescues CD70-Specific NanoCAR T Cells from Antigen-Induced Exhaustion
2024-09-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 该研究通过敲除CD70基因,挽救了CD70特异性纳米CAR T细胞免受抗原诱导的耗竭,显著增强了其在弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型中的功能 首次发现CD70特异性纳米CAR T细胞的耗竭是由CD70与CAR的顺式相互作用引起的,而非自相残杀;通过CRISPR/Cas9敲除CD70可防止抗原诱导的耗竭,提高治疗效果 研究主要在体外类器官和PDX模型中进行,可能需要进一步的临床试验验证;未深入探讨CD70敲除对T细胞其他功能的影响 优化CD70特异性纳米CAR T细胞的功能,并克服其抗原诱导的耗竭问题 CD70特异性纳米CAR T细胞,恶性横纹肌样肿瘤类器官,弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型 免疫治疗 弥漫性大B细胞淋巴瘤 CRISPR/Cas9基因敲除,单细胞转录组学 纳米CAR(VHH-based CAR) 单细胞转录组数据 体外共培养(类器官)和体内PDX模型,具体样本量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞转录组测序
267 2026-08-21
Single-cell genomic profiling to study regeneration
2024-08, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2
综述 本文综述了近年来单细胞转录组等单细胞分析技术在多种动物模型再生研究中的应用,并总结了关于再生机制的关键概念。 系统梳理了不同物种和细胞类型中再生的细胞和分子机制,强调了再生与发育的差异及再生特异性细胞类型和基因调控网络。 未提及具体局限性,可能受限于综述范围和涵盖的研究深度。 总结单细胞基因组分析在再生研究中的最新进展,并提炼核心概念。 多种动物模型,包括涡虫等无脊椎动物及不同细胞类型和器官。 单细胞基因组学 NA 单细胞转录组学、单细胞分析技术 NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
268 2026-08-21
Characterisation of HBV and co-infection with HDV and HIV through spatial transcriptomics
2024-Aug, eGastroenterology
研究论文 通过空间转录组学技术研究了慢性乙肝患者合并丁型肝炎病毒或人类免疫缺陷病毒共感染时的肝内转录组景观、细胞组成和生物学通路 首次应用空间转录组学方法对HBV与HDV或HIV共感染的肝活检样本进行表征,揭示了空间离散的转录组特征和共感染特异性的生物学通路 样本量小(仅3名患者),属于概念验证研究,结果需在更大队列中验证 评估空间转录组学在表征HBV及其与HDV或HIV共感染的肝内转录组、细胞组成和生物学通路中的价值 慢性乙肝合并HDV或HIV共感染的三名未接受治疗患者的肝活检样本 空间转录组学 慢性乙型肝炎、丁型肝炎病毒共感染、人类免疫缺陷病毒共感染 空间转录组学(NanoString GeoMx数字空间分析) 加权基因共表达网络分析(WGCNA) 空间转录组数据 3例肝活检样本 NanoString 空间转录组学 GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas NanoString GeoMx数字空间分析平台,使用FFPE组织,检测HBsAg和CD45表达
269 2026-08-21
Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression
2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England)
研究论文 该研究通过单细胞转录组学分析受辐射与未受辐射的人类皮肤样本,揭示成纤维细胞亚群的变化及窖蛋白表达的变异性,为辐射诱导纤维化的机制提供了新见解。 首次在单细胞水平上识别出辐射皮肤中成纤维细胞的五个不同转录簇,并发现仅一个簇特异性表达Cav2,提示Cav1和Cav2可能对抗性调节纤维化反应。 研究样本量较小(仅六名患者),且主要基于观察性分析,未进行功能验证实验来确认Cav2在纤维化中的直接作用。 通过组织学与单细胞转录组分析,识别辐射诱导纤维化发展中的新型特征,以指导未来治疗策略的制定。 六名接受肿瘤切除术后乳房重建的女性患者的成对辐射与对侧非辐射皮肤样本。 单细胞转录组学 辐射诱导纤维化 单细胞RNA测序、组织学评估、免疫组化、生物力学测试 Seurat聚类、SingleR分类器 单细胞转录组数据、组织图像、力学数据 12个皮肤样本(来自6名患者,每位患者配对的辐射与非辐射样本) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x单细胞平台(具体配置未在摘要中提供)
270 2026-08-21
PIK3CA inhibition in models of proliferative glomerulonephritis and lupus nephritis
2024-06-06, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过基因工程小鼠模型、单细胞RNA测序和空间转录组学揭示PIK3CA在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎中的关键作用,并展示PI3Kα抑制剂alpelisib的治疗效果 首次发现体细胞PIK3CA功能获得性突变在足细胞中的作用,并证明PI3Kα抑制剂alpelisib不仅靶向足细胞,还影响淋巴细胞功能,这在狼疮性肾炎中尤为重要 研究主要基于小鼠模型,人类验证仅限于来自活动性狼疮性肾炎患者的淋巴细胞,可能无法完全反映人类疾病的复杂性 探究PIK3CA通路在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎发病机制中的作用,并评估PI3Kα抑制剂alpelisib的治疗潜力 增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎的小鼠模型及人类淋巴细胞 数字病理学 肾小球肾炎 单细胞RNA测序, 空间转录组学 基因工程小鼠模型 基因表达数据, 组织切片 多个基因工程小鼠模型及人类淋巴细胞样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
271 2026-08-21
RIPK1 protects naive and regulatory T cells from TNFR1-induced apoptosis
2024-06, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
research paper 本研究揭示了RIPK1作为支架蛋白在维持外周T细胞稳态中的关键作用,并通过条件敲除小鼠模型证明其缺失导致T细胞通过TNF和caspase-8介导的凋亡而死亡 首次证明不同外周T细胞亚群对RIPK1的需求存在差异,并明确了RIPK1缺失导致T细胞凋亡的具体信号通路 研究主要在动物模型中进行,未涉及人类样本验证 探究RIPK1在不同外周T细胞亚群存活中的具体作用及其介导的细胞死亡途径 小鼠外周T细胞亚群,包括naive CD4、naive CD8和FoxP3调节性T细胞 免疫学 自身免疫性疾病 条件性基因敲除、单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 转录组数据(单细胞RNA测序数据) 未明确提及,涉及多种小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
272 2026-08-21
ALKBH5-mediated m6A modification of IL-11 drives macrophage-to-myofibroblast transition and pathological cardiac fibrosis in mice
2024-03-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学等揭示了ALKBH5介导的IL-11 mRNA m6A去甲基化促进巨噬细胞向肌成纤维细胞转变及高血压性心脏纤维化的机制 首次发现ALKBH5通过m6A去甲基化稳定IL-11 mRNA,驱动巨噬细胞向肌成纤维细胞转变,并验证靶向递送siRNA可缓解心脏纤维化 研究基于小鼠模型,结果需在人类中验证;未详细探讨其他RNA修饰或细胞类型的作用 阐明心脏巨噬细胞在纤维化中转变的调控机制,并探索治疗靶点 小鼠心脏巨噬细胞、循环单核细胞、Ang II诱导的高血压心脏纤维化模型 单细胞转录组学 心脏纤维化 单细胞RNA测序、谱系追踪、连体共生、RNA免疫沉淀测序 NA 单细胞转录组数据、RNA测序数据 小鼠模型,具体样本数未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
273 2026-08-21
5 signature genes revealed by single-cell profiling identified unique immune subtypes affecting the prognosis of ovarian cancer
2024-03, European review for medical and pharmacological sciences
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别出5个预后相关基因,并据此将卵巢癌患者划分为不同免疫亚型,以评估其预后及对免疫治疗和化疗的反应 利用单细胞RNA测序数据识别出5个预后关键基因(IGFBP7、JCHAIN、CCDC80、VSIG4、MS4A1),并通过无监督共识聚类将患者分为不同预后亚型,为卵巢癌的免疫治疗和化疗反应预测提供了新的生物标志物和分型方法 研究主要基于公共数据库(TIGER、TCGA、TIMER等),缺乏外部独立验证;且为回顾性分析,需进一步前瞻性临床研究验证其应用价值 识别卵巢癌中预测预后的基因特征并建立预后亚型,以指导免疫治疗和化疗的临床决策 卵巢癌患者 基因组学 卵巢癌 单细胞RNA测序 无监督共识聚类 基因表达数据 TCGA-OV患者样本(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
274 2026-08-21
Quantifying the clusterness and trajectoriness of single-cell RNA-seq data
2024-02, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出多个评分来量化单细胞RNA-seq数据的“聚类性”和“轨迹性”,以指导分析选择 首次提出基于多种数学方法(如距离分布、持续同调、向量幅度、Ripley's K和连通度)的评分体系,客观评估数据更偏向聚类还是轨迹 评分在模拟和真实数据上验证,但未详细讨论对复杂或噪声数据的鲁棒性 开发量化单细胞RNA-seq数据聚类性和轨迹性的评分方法,帮助研究者选择更合适的分析策略 模拟数据集和真实单细胞RNA-seq数据集 机器学习 NA 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 未明确具体样本数量,包括模拟数据和真实单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
275 2026-08-21
A novel batch-effect correction method for scRNA-seq data based on Adversarial Information Factorization
2024-02, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出一种基于对抗信息分解的scRNA-seq数据批次效应校正方法,无需细胞类型先验或特定标准化策略,适用于多种下游分析。 提出Adversarial Information Factorization方法,不依赖细胞类型先验知识或特定标准化策略,在低信噪比、批次特异性细胞类型、多批次不均衡等场景中表现优于现有方法,且能最好地保留细胞类型间相对基因表达,提升差异表达分析结果。 摘要未提及明显的局限性。 开发一种鲁棒的批次效应校正方法,以消除scRNA-seq数据中的批次效应,支持聚合下游分析。 scRNA-seq数据集,包括模拟场景和白血病队列。 机器学习 白血病 scRNA-seq 对抗网络(Adversarial Network) 基因表达数据(单细胞RNA测序数据) 未明确提及具体样本数量,提及多个模拟场景和一个白血病队列。 NA scRNA-seq NA NA
276 2026-08-21
Interleukin 13 Promotes Maturation and Proliferation in Metaplastic Gastroids
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究建立Meta1胃类器官模型,探究IL-13对化生性SPEM细胞成熟和增殖的促进作用及其分子机制 首次建立可靠的Meta1胃类器官模型,并揭示IL-13通过STAT6信号通路促进SPEM细胞成熟与增殖 未提及具体局限性 阐明IL-13在SPEM细胞成熟和增殖中的分子效应,并建立体外模型 Mist1-Kras转基因小鼠的化生胃类器官、IL-13-tdTomato报告小鼠的ILC2细胞、人类化生胃类器官 分子生物学 胃化生 单细胞RNA测序、细胞分选、三维共培养、空气-液体界面培养、STAT6抑制 类器官模型 基因表达数据、细胞图像 小鼠类器官及人类化生胃类器官,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台,具体配置未提及
277 2026-08-21
Autophagy Contributes to Homeostasis in Esophageal Epithelium Where High Autophagic Vesicle Level Marks Basal Cells With Limited Proliferation and Enhanced Self-Renewal Potential
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 通过遗传学手段抑制自噬和细胞分选分析,探究自噬在食管上皮稳态维持中的作用 首次揭示了高自噬囊泡水平的食管基底细胞具有有限增殖和增强自我更新能力,并利用单细胞RNA测序深入解析了其机制 未提供明确的局限性信息 明确自噬在食管上皮稳态中的作用 食管基底细胞和小鼠食管上皮组织 分子生物学 食管疾病 条件性基因敲除、流式细胞分选、RNA测序、单细胞RNA测序、三维类器官培养 NA 基因表达数据、图像数据 使用他莫昔芬诱导的鳞状上皮特异性Atg7条件敲除小鼠,以及分选的Cyto-IDHigh和Cyto-IDLow食管基底细胞 NA NA NA NA
278 2026-08-21
Single-cell RNA sequencing reveals different chondrocyte states in femoral cartilage between osteoarthritis and healthy individuals
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示了骨关节炎患者与健康个体股骨软骨中不同的软骨细胞状态 发现了两种新的软骨细胞亚型(METRNL+和PRG4+),并提出了新的软骨细胞亚型分类,同时揭示了细胞分化过程中的转录组特征和信号通路变化 未在摘要中明确提及局限性 比较健康与骨关节炎软骨细胞的类型差异,并探讨这些类型在软骨再生和骨关节炎进展中的作用 健康股骨远端软骨和骨关节炎股骨软骨 单细胞转录组学 骨关节炎 单细胞RNA测序、RNA速率分析、拟时间分析、SCENIC、免疫组化 NA 单细胞转录组数据 共包含75,104个细胞,分为19个簇和11个软骨细胞亚型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
279 2026-08-20
PKM2-mediated STAT3 phosphorylation promotes acute liver failure via regulating NLRP3-dependent pyroptosis
2024-12-25, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示了PKM2通过促进STAT3磷酸化调控NLRP3依赖性细胞焦亡,从而加重急性肝衰竭的机制 首次阐明PKM2通过核转位与STAT3结合,增强其磷酸化并促进NLRP3表达的非代谢功能,在巨噬细胞焦亡和急性肝衰竭中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证有限,且具体分子机制细节未完全阐明 探究PKM2在急性肝衰竭中调控炎症反应的分子机制,特别是对NLRP3介导的焦亡的影响 小鼠肝脏巨噬细胞及D-半乳糖胺/LPS诱导的急性肝衰竭小鼠模型 生物信息学 急性肝衰竭 单细胞转录组测序 CNN 基因表达数据 小鼠模型及巨噬细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
280 2026-08-20
Enhancing immuno-oncology investigations through multidimensional decoding of tumor microenvironment with IOBR 2.0
2024-12-16, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 升级并标准化IOBR包至2.0版本,提供六个模块用于基于多组学数据的肿瘤微环境分析,并支持从单细胞RNA测序数据构建基因签名和参考矩阵以进行微环境反卷积 IOBR 2.0提供了从数据预处理到建模的完整分析流程,并支持从单细胞RNA测序数据构建基因签名和参考矩阵,增强了多组学整合能力 文章未明确提及局限性 推进肿瘤微环境研究中的多组学整合,提供标准化的分析工具以增强对肿瘤免疫相互作用的理解 肿瘤微环境 生物信息学 肿瘤 多组学分析,单细胞RNA测序,空间转录组测序 NA 转录组数据,多组学数据,单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组测序 NA NA
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