单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-05 |
Single-cell landscape of functionally cured chronic hepatitis B patients reveals activation of innate and altered CD4-CTL-driven adaptive immunity
2024-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.017
PMID:38423478
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了功能性治愈慢性乙型肝炎患者的免疫病理特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了慢性乙型肝炎与功能性治愈患者的肝内组织和外周血免疫细胞状态，发现了CD4细胞毒性T淋巴细胞和天然免疫细胞激活等新机制 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 探索慢性乙型肝炎功能性治愈的免疫病理机制和生物标志物 | 慢性乙型肝炎患者和功能性治愈患者的肝内组织及匹配的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 免疫荧光图像 | 慢性乙型肝炎和功能性治愈患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 262 | 2025-10-05 |
Lupus dermal fibroblasts are proinflammatory and exhibit a profibrotic phenotype in scarring skin disease
2024-02-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173437
PMID:38358820
|
研究论文 | 本研究探讨狼疮皮肤成纤维细胞的炎症反应特征及其在瘢痕形成中的作用机制 | 首次揭示系统性红斑狼疮成纤维细胞对炎症的过度反应特性，并发现瘢痕与非瘢痕患者存在差异性的TGF-β反应通路 | 样本量有限（56例），仅针对皮肤成纤维细胞进行研究 | 探究皮肤狼疮患者瘢痕形成的细胞机制 | 系统性红斑狼疮和皮肤狼疮患者的真皮成纤维细胞 | 细胞生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，细胞因子刺激实验 | NA | 基因表达数据 | 22例狼疮患者和34例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 263 | 2025-10-05 |
Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature
2024-02-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173337
PMID:38358826
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析神经母细胞瘤骨转移骨髓微环境，揭示免疫细胞重塑和转移特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘神经母细胞瘤骨转移微环境的细胞组成和转录重编程特征 | 样本量相对有限，需要更大队列验证发现 | 探究神经母细胞瘤骨转移的微环境机制和开发新治疗策略 | 神经母细胞瘤患者的骨髓样本 | 单细胞组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含转移和非转移患者的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2025-10-05 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576260
PMID:38328172
|
研究论文 | 本研究应用深度迁移学习工具DEGAS识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 首次使用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据中，识别出特定的β细胞亚群 | 研究样本量有限，未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群以更好理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq, 免疫染色 | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据, 批量表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 265 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis defines LGALS1+ fibroblasts that promote proliferation and migration of intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-11-25, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae023
PMID:38862197
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌肿瘤微环境，鉴定出促进肿瘤恶性表型的LGALS1+成纤维细胞亚群 | 首次在肝内胆管癌中鉴定出特异性表达LGALS1的成纤维细胞亚群，并阐明其通过调控CCR2、ADAM15和β-整合素促进肿瘤进展的机制 | 样本量较小（14例患者），需更大规模研究验证 | 探究肝内胆管癌肿瘤异质性及成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用 | 14例初治肝内胆管癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 单细胞测序分析 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2025-10-05 |
Decoding Functional and Developmental Trajectories of Tissue-Resident Uterine Dendritic Cells Through Integrative Omics
2024-Nov-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5424920/v1
PMID:39606471
|
研究论文 | 通过整合多组学方法解析子宫驻留树突状细胞的功能和发育轨迹 | 首次系统鉴定人类子宫内膜中子宫树突状细胞的亚型及其发育轨迹，并揭示不同亚型在胚胎植入前后的特异性功能 | 研究样本数量有限，且主要关注早期妊娠阶段 | 阐明子宫树突状细胞的起源、分子特征及其在子宫内膜功能和胚胎植入过程中的作用 | 人类子宫内膜组织中的子宫树突状细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据,表面蛋白表达数据 | 不同月经周期和早期妊娠阶段的子宫组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | NA |
| 267 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing reveals the impact of endothelial cell PIEZO1 expression on thoracic aortic aneurysm
2024-06, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.04.015
PMID:38718563
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示内皮细胞PIEZO1表达对胸主动脉瘤的影响 | 首次发现PIEZO1在胸主动脉瘤中表达降低，并证实其激动剂Yoda1可通过干预巨噬细胞浸润、细胞外基质降解和新血管形成抑制动脉瘤形成 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究PIEZO1在胸主动脉瘤发病机制中的作用 | 胸主动脉瘤患者样本和基因工程小鼠模型 | 单细胞生物学 | 胸主动脉瘤 | 单细胞测序，基因敲除模型，体内外药理学干预 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据，蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 268 | 2025-10-05 |
Syngeneic murine models with distinct immune microenvironments represent subsets of human intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-06, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.008
PMID:38458319
|
研究论文 | 本研究开发并表征了具有不同遗传驱动因素的免疫活性小鼠肝内胆管癌模型，揭示了肿瘤基因型与免疫微环境表型之间的相关性 | 首次开发了Fbxw7ΔF/Akt驱动的肝内胆管癌遗传小鼠模型，并系统比较了三种不同基因型模型的肿瘤免疫微环境特征和免疫治疗反应差异 | 研究基于小鼠模型，其临床转化价值需要进一步验证；样本规模相对有限 | 阐明胆管癌肿瘤免疫微环境特征，测试新型免疫治疗策略 | 肝内胆管癌小鼠模型和人类胆管癌患者队列 | 肿瘤免疫学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序,CITE-seq,全外显子测序,批量RNA测序 | 小鼠遗传模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 | 三种不同基因型的小鼠胆管癌模型 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 269 | 2024-08-07 |
Correction to 'Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno'
2024-Jan-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1229
PMID:38109292
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2025-10-05 |
Fate (or state) of CA2 neurons in a mineralocorticoid receptor knockout
2024-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.29.626110
PMID:39651204
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法探究盐皮质激素受体敲除后海马CA2区神经元的命运变化 | 首次发现MR敲除导致CA2神经元获得CA1样分子表型，揭示了MR在控制CA2神经元发育状态中的关键作用 | 研究主要关注分子表型变化，对行为功能影响的直接证据不足 | 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2区神经元命运的影响 | 小鼠海马CA2区神经元 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 条件性基因敲除模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 271 | 2025-10-05 |
Linking transcriptome and morphology in bone cells at cellular resolution with generative AI
2024-Dec-31, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjae151
PMID:39303095
|
观点文章 | 探讨生成式AI在骨细胞转录组与形态学关联分析中的应用前景与挑战 | 首次系统提出将生成式AI应用于骨细胞多模态数据整合分析，实现细胞分辨率下的转录组与形态学关联研究 | 骨单细胞数据集存在技术偏差、重要骨细胞类型缺乏分析、空间信息不足等问题 | 推动生成式AI在骨细胞生物学研究中的应用，揭示细胞水平的复杂生物过程 | 骨细胞 | 计算机视觉,自然语言处理,机器学习 | 骨科疾病 | 单细胞测序,空间转录组学 | 生成式AI | 组织学图像,单细胞分子数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 272 | 2025-10-05 |
Substrate Stiffness Dictates Unique Doxorubicin-induced Senescence-associated Secretory Phenotypes and Transcriptomic Signatures in Human Pulmonary Fibroblasts
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.623471
PMID:39605579
|
研究论文 | 研究机械张力通过基质刚度调控人肺成纤维细胞衰老相关分泌表型和转录组特征 | 首次揭示基质刚度特异性影响多柔比星诱导的细胞衰老和SASP表型，并发现高刚度驱动的胶原蛋白富集特征 | 研究主要基于体外细胞模型，体内验证相对有限 | 探究机械力刺激对细胞衰老和衰老相关分泌表型的影响机制 | 人原代肺成纤维细胞（IMR-90）和小鼠肺纤维化模型 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 质谱分析、转录组测序、单细胞RNA测序、计算元分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 人原代肺成纤维细胞在不同刚度基质上的培养模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-05 |
Spatial analysis reveals targetable macrophage-mediated mechanisms of immune evasion in hepatocellular carcinoma minimal residual disease
2024-Oct, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00828-8
PMID:39304772
|
研究论文 | 通过空间分析揭示肝细胞癌微小残留病中巨噬细胞介导的免疫逃逸机制 | 首次通过单细胞高plex细胞成像和空间转录组学识别PD-L1+M2样巨噬细胞与干细胞样肿瘤细胞的空间互作机制 | 研究样本量相对有限（108例患者），且主要基于小鼠模型验证 | 探索肝细胞癌微小残留病的免疫逃逸机制及治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本（108例，107万个细胞）和转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞高plex细胞成像，空间转录组学 | 转基因小鼠模型，同源原位移植模型 | 空间成像数据，转录组数据 | 108例患者，107万个细胞 | NA | 单细胞成像，空间转录组学 | NA | NA |
| 274 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics Identifies Cellular and Molecular Characteristics of Scleroderma Skin Lesions: Pilot Study in Juvenile Scleroderma
2024-Aug-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179182
PMID:39273131
|
研究论文 | 本研究首次利用空间转录组学技术分析幼年硬皮病患者皮肤病变的细胞和分子特征 | 首次将Visium CytAssist空间转录组学平台应用于幼年硬皮病皮肤病变研究，并结合单细胞RNA测序数据进行验证 | 初步研究，样本量有限 | 探索幼年硬皮病皮肤病变的细胞和分子机制 | 幼年硬皮病患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 幼年硬皮病患者皮肤病变组织（具体数量未明确） | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组学平台 |
| 275 | 2025-10-05 |
Optimizing cryopreservation of nasal polyp tissue for cellular functional studies and single-cell RNA sequencing
2024-May, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23275
PMID:37742089
|
研究论文 | 比较不同冷冻保存方法对鼻息肉组织细胞功能和单细胞RNA测序的影响 | 首次系统评估鼻息肉组织不同冷冻保存方法对特定细胞类型功能和单细胞测序的影响 | 仅针对鼻息肉组织，研究结果可能不适用于其他组织类型 | 优化鼻息肉组织的冷冻保存方法以支持细胞功能研究和单细胞RNA测序 | 鼻息肉组织样本 | 单细胞测序 | 鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2025-10-05 |
An integrated single-nucleus and spatial transcriptomics atlas reveals the molecular landscape of the human hippocampus
2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.590643
PMID:38712198
|
研究论文 | 通过整合单核和空间转录组学数据构建人类海马体分子图谱 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术揭示人类海马体细胞类型的分子特征和空间分布 | 研究样本仅来自10名神经典型成年捐赠者，样本量相对有限 | 解析人类海马体细胞类型的分子特征和空间组织 | 人类前海马体组织 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 非负矩阵分解(NMF) | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 10名成年神经典型捐赠者的相邻组织切片 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 277 | 2025-10-05 |
Addressing the mean-variance relationship in spatially resolved transcriptomics data with spoon
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621867
PMID:39574747
|
研究论文 | 提出一种名为spoon的统计框架，用于解决空间转录组数据中的均值-方差关系偏差，从而更准确地识别空间可变基因 | 首次在空间转录组数据中证明均值-方差关系的存在，并提出使用经验贝叶斯技术消除这种技术偏差的新方法 | 方法性能仅在模拟和真实空间转录组数据中进行了验证，未在其他类型空间组学数据中测试 | 开发更准确识别空间可变基因的统计方法 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 经验贝叶斯模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-05 |
Shear stress is uncoupled from atheroprotective KLK10 in atherosclerotic plaques
2024-11, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究通过比较健康和动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应力的转录组反应，揭示了动脉粥样硬化斑块中生理剪切应力与保护性因子KLK10的解耦现象 | 首次发现动脉粥样硬化斑块中生理剪切应力与保护性因子KLK10的解耦机制，揭示了疾病状态下内皮细胞对机械力刺激反应能力的改变 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证；单细胞RNA测序样本量有限 | 探究动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应力保护性反应的改变机制 | 小鼠主动脉内皮细胞，包括健康C57BL/6小鼠、轻度病变Apoe-/-正常饮食小鼠和重度病变Apoe-/-高脂饮食小鼠 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，3D光片成像，计算流体动力学 | NA | 单细胞转录组数据，成像数据 | 三组小鼠模型的内皮细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2025-10-05 |
Glutathione accelerates the cell cycle and cellular reprogramming in plant regeneration
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.28.569014
PMID:38168452
|
研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽通过加速细胞周期和细胞重编程在植物再生中的关键作用 | 首次发现损伤附近细胞通过缩短G1期显著提高分裂速率，并鉴定出G1期存在短暂的谷胱甘肽核内峰值 | 研究主要基于拟南芥根系，在其他植物系统中的普适性有待验证 | 探究细胞重编程过程中的细胞周期动态 | 拟南芥根系细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2025-10-05 |
SpotSweeper: spatially-aware quality control for spatial transcriptomics
2024-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.06.597765
PMID:38895212
|
研究论文 | 开发了一种名为SpotSweeper的空间转录组学质量控制方法 | 首次提出考虑空间位置信息的质量控制方法，能够识别局部异常值和区域伪影 | 仅使用公开数据进行验证，缺乏更广泛的数据集验证 | 开发专门针对空间转录组数据的质量控制方法 | 空间转录组数据中的低质量点和组织伪影 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多尺度方法 | 空间转录组数据 | 公开数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium平台 |