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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-02-12 |
Mast cell activation disrupts interactions between endothelial cells and pericytes during early life allergic asthma
2024-Mar-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173676
PMID:38487999
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研究论文 | 本研究通过定量成像和空间转录组学揭示了早期生命过敏性哮喘中肥大细胞激活破坏内皮细胞与周细胞相互作用的机制 | 首次发现新生儿期过敏暴露通过肥大细胞蛋白酶（如类胰蛋白酶）驱动周细胞覆盖缺失，并利用空间转录组学在儿科哮喘活检中验证血管应激与肥大细胞激活通路的关联 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自活检样本的空间转录组学分析，样本量有限 | 探究早期生命过敏性哮喘对肺微循环的影响及肥大细胞在血管重塑中的作用 | 新生小鼠的肺组织切片（PCLSs）和儿科哮喘患者的气管内活检样本 | 数字病理学 | 哮喘 | 定量成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 262 | 2026-02-11 |
PURE-seq identifies Egr1 as a Potential Master Regulator in Murine Aging by Sequencing Long-Term Hematopoietic Stem Cells
2024-Aug-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4863813/v1
PMID:39184105
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研究论文 | 本文开发了PURE-seq技术，用于高效富集和测序稀有细胞，并应用于小鼠长期造血干细胞的研究，识别出Egr1作为衰老背景下造血过程的潜在主调控因子 | 开发了PURE-seq技术，通过直接FACS加载细胞到PIP-seq反应中，减少处理步骤和细胞损失，实现了对稀有细胞（如1/1,000,000稀有度）的可扩展测序 | NA | 开发一种可扩展的稀有细胞测序方法，并研究小鼠长期造血干细胞在造血衰老中的转录组变化 | 小鼠长期造血干细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 263 | 2026-02-10 |
Identification of kidney cell types in scRNA-seq and snRNA-seq data using machine learning algorithms
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38567
PMID:39403515
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研究论文 | 本文评估了五种监督机器学习算法在自动注释肾脏单细胞和单核RNA测序数据中细胞类型的性能 | 首次系统比较了五种监督分类方法在肾脏scRNA-seq和snRNA-seq数据中的细胞类型注释性能，并展示了跨数据集和测序技术的高准确性 | 研究样本数量有限，且当模型主要在scRNA-seq数据上训练并测试于snRNA-seq数据时，性能有所下降 | 开发自动细胞类型注释方法以替代耗时的手动注释，促进肾脏疾病细胞机制研究 | 肾脏细胞 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | 支持向量机, 随机森林, 多层感知器, k近邻, 极端梯度提升 | RNA测序数据 | 79个肾脏活检样本中的62,120个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2026-02-09 |
Single-cell RNA sequencing of appendiceal adenocarcinoma reveals a low proportion of epithelial cells and a fibroblast enriched tumor microenvironment
2024-Dec, ESMO gastrointestinal oncology
DOI:10.1016/j.esmogo.2024.100094
PMID:41646948
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次对阑尾腺癌的肿瘤微环境进行了深入分析，揭示了其与结直肠癌的差异 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于阑尾腺癌研究，揭示了其肿瘤微环境中成纤维细胞的富集特征和独特的细胞组成 | 样本量较小（仅3例阑尾腺癌和1例结直肠癌患者），可能限制结果的普遍性 | 探索阑尾腺癌的单细胞水平特征，以支持其作为独立疾病实体的分类 | 阑尾腺癌和结直肠癌患者的腹膜转移样本 | 数字病理学 | 阑尾腺癌 | 单细胞RNA测序 | k-means聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 3例阑尾腺癌和1例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5' 单细胞RNA测序 |
| 265 | 2026-02-08 |
scGIST: gene panel design for spatial transcriptomics with prioritized gene sets
2024-02-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03185-y
PMID:38408997
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGIST的约束特征选择工具，用于设计单细胞空间转录组学（sc-ST）的基因面板，优先考虑用户指定的基因，同时不损害细胞类型检测的准确性 | scGIST是一种创新的约束特征选择工具，能够在有限的面板大小下优先纳入用户指定的基因（如配体-受体复合物或特定通路基因），同时保持细胞类型检测的准确性，解决了sc-ST技术中面板大小的关键挑战 | NA | 开发一种工具以优化单细胞空间转录组学（sc-ST）的基因面板设计，在有限的面板大小内平衡用户指定基因的优先纳入和细胞类型检测的准确性 | 单细胞空间转录组学（sc-ST）技术中的基因面板设计 | 空间转录组学 | NA | 单细胞空间转录组学（sc-ST），荧光原位杂交（FISH） | 约束特征选择工具 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 266 | 2026-02-08 |
Kidney double positive T cells have distinct characteristics in normal and diseased kidneys
2024-02-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54956-3
PMID:38396136
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研究论文 | 本研究探讨了正常和疾病状态下肾脏中TCR+CD4+CD8+（双阳性；DP）T细胞的存在、特征及功能 | 首次系统描述了肾脏DP T细胞在正常和损伤条件下的独特炎症与代谢特征，并利用单细胞RNA-seq揭示了其基因表达变化 | DP T细胞在肾脏中为少数群体，其具体病理生理作用仍需进一步验证；人类样本仅来源于肾细胞癌患者，可能限制结果的普适性 | 探究正常和疾病状态下肾脏DP T细胞的特性与功能 | 小鼠肾脏（正常、缺血再灌注损伤、顺铂损伤、病毒感染模型）及人类肾细胞癌患者的肾脏组织 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及人类肾细胞癌患者肾脏样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 267 | 2026-02-08 |
Circulating cancer-specific CD8 T cell frequency is associated with response to PD-1 blockade in Merkel cell carcinoma
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101412
PMID:38340723
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研究论文 | 本研究探讨了Merkel细胞癌中循环MCPyV特异性CD8 T细胞频率与PD-1阻断治疗反应之间的关联 | 首次利用MCPyV肽-HLA-I多聚体结合多色流式细胞术、单细胞转录组学和TCR测序，系统分析了病毒驱动癌症中特异性T细胞的特征，并发现循环中而非肿瘤内的这些细胞频率与治疗反应显著相关 | 样本量较小（27例患者），且研究仅针对病毒驱动的Merkel细胞癌，可能不适用于非病毒性癌症 | 探究癌症特异性T细胞在PD-1免疫治疗中的作用机制 | Merkel细胞癌患者中的MCPyV特异性CD8 T细胞 | 免疫肿瘤学 | Merkel细胞癌 | MCPyV肽-HLA-I多聚体检测、26色流式细胞术、单细胞转录组学、T细胞受体测序 | NA | 流式细胞数据、单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 27例Merkel细胞癌患者 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 268 | 2026-02-08 |
Lineage and ecology define liver tumor evolution in response to treatment
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101394
PMID:38280378
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞转录组的策略，通过测量细胞谱系和生态来追踪肝癌患者纵向肿瘤活检的进化，并构建了一个谱系与生态评分系统来预测临床结果 | 开发了一种结合细胞谱系和微环境生态的联合动态评分系统，用于分类肿瘤状态并追踪其在治疗响应中的进化轨迹 | NA | 监测肝癌在治疗干预下的肿瘤进化，并预测临床结果 | 肝癌患者的纵向肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包括纵向活检样本和额外716名肝癌患者的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 269 | 2026-02-07 |
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-related platelet bias: implications for bone marrow transplantation and blood disorders
2024-12-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04084-6
PMID:39623507
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综述 | 本文综述了造血干细胞（HSCs）的异质性，特别是与年龄相关的血小板偏向性（P-HSCs），并探讨了其对骨髓移植和血液疾病的临床意义 | 聚焦于Claus Nerlov团队的研究，揭示了血小板偏向性HSCs在物种间的进化保守性及其在衰老过程中的扩增 | 讨论了当前研究方法（如单细胞RNA测序和分子条形码技术）的局限性，并提出了未来研究方向 | 优化基于HSC的疗法，改善血液疾病的临床结果 | 造血干细胞（HSCs），特别是血小板偏向性HSCs（P-HSCs） | NA | 血液疾病 | 单细胞RNA测序，分子条形码 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 270 | 2026-02-07 |
N-CADHERIN+/CD168- subpopulation determines therapeutic variations of UC-MSCs for cardiac repair after myocardial infarction
2024-11-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04032-4
PMID:39533355
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，鉴定了脐带间充质干细胞中N-CADHERIN+/CD168-亚群在心肌梗死后心脏修复中的关键作用，并揭示了其与治疗疗效差异的关联 | 首次利用单细胞RNA测序技术识别出UC-MSCs中N-CADHERIN+/CD168-亚群作为促进血管生成的功能亚群，并证实其比例与治疗心肌梗死的疗效正相关 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证；样本量相对有限，且仅针对脐带来源的MSCs | 探究间充质干细胞治疗心肌梗死疗效不一致的机制，并筛选出关键功能亚群以提高治疗效果 | 脐带来源的间充质干细胞（UC-MSCs）及其亚群，以及心肌梗死小鼠模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、GSEA分析、Scissor分析、管形成实验、迁移和增殖实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质分泌数据、细胞功能实验数据 | 10,463个UC-MSCs进行单细胞RNA测序，使用不同供体的UC-MSCs治疗心肌梗死小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2026-02-07 |
Phenotypic and transcriptomic profiling of induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived NK cells and their cytotoxicity against cancers
2024-11-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04029-z
PMID:39533434
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研究论文 | 本研究开发了一种高效、无饲养层的单层分化方案，从诱导多能干细胞生成自然杀伤细胞，并评估了其表型、转录组特征及对胆管癌和乳腺癌细胞的细胞毒性 | 开发了一种新的、更高效的无饲养层单层分化方案来生成iNK细胞，避免了传统胚状体培养方案的劳动密集性和异质性，并通过单细胞RNA测序证实了其转录组特征与PB-NK细胞高度相似 | NA | 开发一种更高效、均一的iPSC来源NK细胞生成方法，并评估其作为'现货'免疫治疗产品的潜力 | 诱导多能干细胞来源的自然杀伤细胞 | NA | 胆管癌, 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 272 | 2026-02-07 |
High-Dimensional Overdispersed Generalized Factor Model With Application to Single-Cell Sequencing Data Analysis
2024-11-10, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.10213
PMID:39237124
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研究论文 | 本文提出了一种用于高维非线性因子分析的过离散广义因子模型（OverGFM），以处理过离散混合类型数据，并应用于单细胞测序数据分析 | 引入额外误差项以捕获因子无法解释的过离散性，并开发了一种结合拉普拉斯和泰勒近似的新型变分EM算法，解决了高维非线性模型中的计算挑战 | 未明确讨论模型在极端过离散或稀疏数据场景下的鲁棒性，且应用仅限于基因组学领域 | 开发一种能够处理高维过离散混合类型数据的非线性因子分析方法 | 过离散混合类型数据，特别是单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 过离散广义因子模型（OverGFM） | 混合类型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 273 | 2026-02-06 |
Single-cell dissection reveals promotive role of ENO1 in leukemia stem cell self-renewal and chemoresistance in acute myeloid leukemia
2024-10-08, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03969-w
PMID:39380054
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了α-烯醇化酶（ENO1）在急性髓系白血病干细胞自我更新和化疗耐药中的促进作用 | 首次在单细胞水平上结合生物信息学和机器学习算法，系统分析了ENO1在白血病干细胞中的功能，并验证其作为治疗靶点和预后生物标志物的潜力 | 样本量相对较小（8名患者和4名健康对照），且功能研究主要在细胞系中进行，缺乏体内实验验证 | 探究ENO1是否以及如何影响急性髓系白血病中白血病干细胞的自我更新和化疗耐药性 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本、健康对照者的骨髓样本以及AML细胞系 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、机器学习算法 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 8名复发/难治性AML患者和4名健康对照的骨髓样本，以及37名对照受试者的表达数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2026-02-06 |
Endocytosis as a critical regulator of hematopoietic stem cell fate -implications for hematopoietic stem cell and gene therapy
2024-09-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03927-6
PMID:39334274
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评论 | 本文讨论了内吞作用作为造血干细胞命运关键调节因子的新发现及其对造血干细胞和基因治疗的影响 | 强调了MYCT1蛋白在调节造血干细胞内吞作用和环境感知中的新作用，为体外培养和扩增提供了新见解 | 对造血干细胞中所有潜在机制及其相互作用的完全理解仍存在空白，尤其是在细胞增殖时如何转化 | 探讨内吞作用在造血干细胞命运调节中的作用及其在细胞和基因治疗中的应用 | 造血干细胞，特别是脐带血造血干细胞 | 造血干细胞生物学 | 血液和免疫细胞疾病 | 敲低、过表达、单细胞RNA测序、移植实验 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2026-02-06 |
MEF2C Hypofunction in GABAergic Cells Alters Sociability and Prefrontal Cortex Inhibitory Synaptic Transmission in a Sex-Dependent Manner
2024-Mar, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2024.100289
PMID:38390348
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研究论文 | 本研究探讨了GABA能细胞中MEF2C功能减退如何以性别依赖的方式影响小鼠的社交行为和前额叶皮层抑制性突触传递 | 首次在GABA能细胞中特异性操纵Mef2c杂合性，揭示了其在雌性小鼠中导致社交偏好缺陷和抑制性神经元功能异常的性别特异性效应 | 研究仅在小鼠模型中进行，未直接验证人类MCHS患者中的类似机制，且样本量可能有限 | 探究MEF2C功能减退在GABA能神经元中对MCHS样表型的影响，特别是社交行为和神经环路功能 | 小鼠模型，特别是GABA能细胞中Mef2c杂合性的雌雄个体 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学、膜片钳电生理学、光遗传学、脑电图 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据、电生理记录、行为数据 | 未明确指定，但涉及雌雄小鼠的多个实验组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2026-02-06 |
Digital spatial profiling of segmental outflow regions in trabecular meshwork reveals a role for ADAM15
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298802
PMID:38394161
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法，识别了与人类小梁网高流出和低流出区域相关的基因，特别是ADAM15在调节房水流出中的作用 | 首次应用数字空间分析技术于小梁网分段流出区域，揭示了ADAM15等基因在房水流出调控中的新角色 | 研究基于器官培养的人类前段样本，可能无法完全模拟体内条件，且样本量有限 | 探索小梁网中与房水流出相关的基因表达差异，以理解分段流出的分子机制 | 人类小梁网的高流出和低流出区域 | 空间转录组学 | 青光眼 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler平台用于石蜡包埋组织切片 |
| 277 | 2026-02-06 |
Sphingosine 1-phosphate receptor 2 in keratinocytes plays a key role in reducing inflammation in psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1469829
PMID:39391307
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研究论文 | 本研究探讨了角质形成细胞中S1PR2在银屑病炎症中的关键作用，发现其通过抑制Th17细胞募集来减轻炎症 | 首次研究了S1PR2在银屑病中的作用，揭示了其作为下调因子抑制Th17细胞招募的新机制 | 研究基于小鼠模型，可能无法完全反映人类银屑病的复杂性 | 研究S1PR2在银屑病发病机制中的作用 | S1pr2fl/fl K14-Cre小鼠和野生型小鼠的皮肤组织 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学, RT-qPCR, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 基因表达数据, 细胞表型数据 | 使用S1pr2fl/fl K14-Cre小鼠和野生型小鼠进行IMQ诱导的银屑病样炎症实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 278 | 2026-02-05 |
Imaging spatial transcriptomics reveals molecular patterns of vulnerability to pathology in a transgenic α-synucleinopathy model
2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.31.606032
PMID:39372781
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研究论文 | 本研究利用成像空间转录组学技术，结合免疫荧光分析，在转基因α-突触核蛋白病小鼠模型中揭示了特定神经元亚型对病理的易感性及其分子机制 | 首次将成像空间转录组学与下游免疫荧光技术结合，在同一组织切片中识别出易受α-突触核蛋白磷酸化病理影响的神经元亚型，并揭示了相关转录调控机制 | 研究基于转基因小鼠模型，可能无法完全模拟人类疾病的所有特征，且样本量未明确说明 | 探究帕金森病和路易体痴呆中α-突触核蛋白病理选择性易感性的分子基础 | 转基因过表达人类α-突触核蛋白的小鼠模型中的皮层和海马神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 成像空间转录组学，免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 279 | 2026-02-05 |
Machine learning identifies activation of RUNX/AP-1 as drivers of mesenchymal and fibrotic regulatory programs in gastric cancer
2024-06-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278565.123
PMID:38777607
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研究论文 | 本研究利用ATAC-seq和RNA-seq数据，通过机器学习方法识别了胃癌中驱动间质和纤维化调控程序的关键转录因子，特别是RUNX/AP-1的激活 | 开发了一种基于ATAC-seq数据的机器学习方法，首次系统性地确定了胃癌中间质和上皮状态的转录因子驱动者，并揭示了拷贝数变异如何影响这些转录因子的失调 | NA | 探究胃癌中间质表型的调控机制，识别驱动胃癌异质性和进展的关键转录因子 | 胃癌细胞系和原发性肿瘤样本 | 机器学习 | 胃癌 | ATAC-seq, RNA-seq | 机器学习方法 | 基因组和转录组数据 | NA | NA | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2026-02-05 |
ScSNViz: a user-friendly toolset for visualization and analysis of Cell-Specific Expressed SNVs
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596816
PMID:38895293
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scSNViz的R语言工具集，用于可视化和分析单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异 | scSNViz是首个提供3D sceSNV可视化功能、兼容主流scRNA-seq处理工具（如Seurat、SingleR、scType）并支持轨迹推断（如Slingshot）的综合性工具集，填补了单细胞水平遗传变异分析工具的空缺 | 工具依赖于R环境，可能对非编程用户有一定学习曲线，且未提及处理大规模数据时的性能优化 | 开发一个用户友好的工具集，以可视化和分析单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异，促进对细胞异质性、克隆进化和基因表达调控的理解 | 单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |