单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 2761 - 2780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intercellular crosstalk and the regulatory landscape of stromal cells during the whole life of the mouse ovary
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae041
PMID:39872151
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠卵巢整个生命周期中基质细胞的细胞间通讯和调控景观 | 首次整合从胚胎期到老年期的单细胞RNA测序数据，系统描绘卵巢基质细胞的发育轨迹和细胞间通讯网络，并鉴定出CD24阳性间充质祖细胞作为基质细胞起源 | 研究主要基于小鼠模型，人类卵巢中的情况可能需要进一步验证 | 探索卵巢基质细胞的异质性、发育轨迹和细胞间通讯网络 | 小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 卵巢衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从胚胎11.5天到12月龄小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2762 | 2025-10-07 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了GPR35在MASLD中调控肝脏分区特异性脂质代谢的机制 | 首次结合空间转录组学、空间代谢组学和脂质代谢组学，在肝脏分区水平上系统解析GPR35调控MASLD进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足；机制研究仍需进一步功能实验证实 | 阐明GPR35在代谢功能障碍相关脂肪肝病中调控肝脏分区特异性基因表达和代谢物分布的机制 | 小鼠肝脏组织，重点关注GPR35缺陷模型在MASLD进展中的变化 | 空间多组学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 空间转录组学，空间代谢组学，脂质代谢组学 | NA | 空间基因表达数据，空间代谢物分布数据 | GPR35缺陷小鼠模型 | NA | 空间转录组学，空间代谢组学 | NA | NA |
| 2763 | 2025-10-07 |
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae028
PMID:39872443
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研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组和染色质可及性分析揭示卵巢体细胞的进化特征 | 首次在人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子五个物种中整合分析单细胞转录组和染色质可及性数据，揭示卵巢细胞进化规律 | 研究仅针对成年卵巢，未涵盖发育过程；物种数量有限 | 探究不同物种间卵巢体细胞分子机制的保守性与差异性 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢体细胞 | 单细胞多组学 | 卵巢生理与疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 五个物种的卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2764 | 2025-10-07 |
Comparative dissection of transcriptional landscapes of human iPSC-NK differentiation and NK cell development
2024-Aug, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae032
PMID:39872864
|
研究论文 | 通过比较分析人类iPSC-NK细胞分化与NK细胞发育的转录景观，识别诱导分化过程中的关键缺失因子 | 首次对胎儿肝脏NK细胞和iPSC-NK细胞进行关键分化阶段的比较性单细胞转录组分析，并创建具有NK细胞和巨噬细胞双重特征的STAT5A-iPSC新细胞系 | 未明确说明样本数量和实验重复次数，STAT5A-iPSC新细胞系的功能验证需要进一步临床前研究 | 解析iPSC-NK细胞分化机制以改进治疗性iNK细胞的生产和工程化 | 人类iPSC-NK细胞和胎儿肝脏NK细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2765 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility and its application on tumor investigation
2024-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae015
PMID:39872661
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综述 | 总结单细胞转录组和染色质可及性测序方法的最新进展，及其在肿瘤研究中的整合应用 | 整合单细胞转录组和表观遗传测序数据的生物信息学策略，深化对肿瘤发生发展的理解 | 未提及具体实验样本量和数据验证结果 | 探讨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用与整合策略 | 单细胞转录组和染色质可及性测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2766 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing algorithms underestimate changes in transcriptional noise compared to single-molecule RNA imaging
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100933
PMID:39662473
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研究论文 | 比较单细胞RNA测序算法与单分子RNA成像在转录噪声量化方面的差异 | 首次系统比较多种scRNA-seq算法与smFISH在量化转录噪声变化方面的性能差异 | 所有scRNA-seq算法均系统性低估噪声变化，且仅测试了代表性基因面板 | 评估基因组范围内转录噪声的最佳量化方法 | 人类和小鼠数据集中的基因表达噪声 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子RNA荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, smFISH | NA | NA |
| 2767 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes
2024-Dec, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003
PMID:39426602
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示生殖器疱疹患者免疫细胞多样性和系统性免疫反应特征 | 首次在单细胞水平系统分析生殖器疱疹患者外周血免疫细胞的转录组特征，发现特定免疫细胞亚群的激活状态和关键信号通路变化 | 样本量相对有限，主要关注外周血免疫细胞而未直接研究局部感染部位的免疫反应 | 探究HSV-2感染和复发过程中免疫系统的应答机制 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2768 | 2025-10-07 |
Low-intensity focused ultrasound stimulation promotes stroke recovery via astrocytic HMGB1 and CAMK2N1 in mice
2024-Nov-05, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2023-002614
PMID:38191183
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研究论文 | 本研究探讨低强度聚焦超声刺激通过星形胶质细胞中的HMGB1和CAMK2N1促进小鼠脑卒中恢复的机制 | 首次揭示LIFUS通过调控星形胶质细胞特定亚群中HMGB1上调和CAMK2N1下调来促进血管生成和突触形成 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未涉及性别差异分析 | 探究低强度聚焦超声在缺血性脑卒中中的神经修复机制 | 成年雄性小鼠的缺血性脑卒中模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | iTRAQ蛋白质组学分析,scRNA-seq,激光散斑成像,电肌电图,纤维光度记录,荧光原位杂交,Western blot | NA | 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据,影像数据,电生理数据 | 成年雄性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 2769 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-sequencing reveals a profound immune cell response in human cytomegalovirus-infected humanized mice
2024-Oct, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.08.006
PMID:39153545
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人巨细胞病毒感染人源化小鼠后外周血单核细胞的基因表达变化 | 首次在人源化小鼠模型中应用单细胞RNA测序技术研究HCMV感染后的免疫细胞反应 | 研究基于人源化小鼠模型，与真实人体感染环境存在差异 | 揭示HCMV感染过程中病毒与宿主的相互作用机制 | 人源化小鼠模型中的外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞测序分析 | 人巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2770 | 2025-10-07 |
G-protein signaling of oxytocin receptor as a potential target for cabazitaxel-resistant prostate cancer
2024-Jan, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgae002
PMID:38250514
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞，发现催产素受体信号通路可作为治疗靶点 | 首次在卡巴他赛耐药前列腺癌中发现催产素受体信号通路上调，并验证氯哌斯汀通过抑制该通路具有抗肿瘤活性 | 样本量有限，需要更大规模的临床研究验证 | 探索卡巴他赛耐药前列腺癌的耐药机制并寻找治疗靶点 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞和肿瘤组织 | 单细胞测序 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间基因表达分析, 质谱磷酸化蛋白质组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2771 | 2025-10-07 |
Gene regulatory network inference based on novel ensemble method
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae036
PMID:39324652
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研究论文 | 提出一种基于13种基础分类方法和灵活神经树的集成方法用于提高基因调控网络识别准确率 | 开发了基于基因编程变体和粒子群优化的混合进化算法来搜索最优灵活神经树模型 | NA | 提高基因调控网络识别准确率 | 基因调控网络 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 集成学习,灵活神经树,粒子群优化 | 基因表达数据 | 三个模拟数据集和三个真实单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2772 | 2025-10-07 |
Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids
2024-12, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-024-01357-5
PMID:39400711
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研究论文 | 本研究通过比较约400个脊椎动物CXCR6直系同源基因，揭示了CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性和基因丢失现象 | 首次在脊椎动物广泛尺度上揭示CXCR6的DRF基序非普遍性，发现鸟类中反复发生的CXCR6基因丢失现象 | 研究主要基于基因序列分析，功能验证实验相对有限 | 探究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化历程和多样性 | 约400个脊椎动物的CXCR6直系同源基因 | 进化生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序，基因序列比对 | NA | 基因序列数据，单细胞RNA测序数据 | 涵盖36个鸟类目和多种脊椎动物的约400个CXCR6直系同源基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2773 | 2025-10-07 |
Metabolic Reprogramming Induced by Aging Modifies the Tumor Microenvironment
2024-10-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201721
PMID:39451239
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研究论文 | 本研究通过计算模型分析衰老如何通过代谢重编程改变肿瘤微环境 | 首次系统揭示衰老通过代谢可塑性影响肿瘤微环境的机制，特别是能量代谢通路在免疫细胞中的差异性变化 | 基于计算模型的分析需要实验验证，样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探索衰老与代谢重编程的相互作用如何影响肿瘤微环境并促进肿瘤发生 | 17种与衰老相关的癌症类型，包括T细胞、巨噬细胞等免疫细胞 | 计算生物学 | 多种癌症 | MMPC计算模型，RNA-seq分析 | MMPC（代谢可塑性通路配对比较模型） | RNA-seq数据 | 涵盖17种癌症类型的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2774 | 2025-10-07 |
Podoplanin Expression in Early-Stage Colorectal Cancer-Associated Fibroblasts and Its Utility as a Diagnostic Marker for Colorectal Lesions
2024-10-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201682
PMID:39451200
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研究论文 | 本研究探讨了podoplanin在早期结直肠癌相关成纤维细胞中的表达及其作为结直肠病变诊断标志物的应用价值 | 首次发现早期结直肠癌中隐窝周围成纤维细胞和网状细胞是CAFs的细胞来源，并证实PDPN表达可作为区分结直肠非肿瘤性与肿瘤性病变的诊断特征 | 早期结直肠癌中PDPN阳性CAFs的研究尚不充分，样本量未明确说明 | 研究早期结直肠癌相关成纤维细胞中podoplanin的表达特征及其诊断价值 | 腺瘤、早期结直肠癌、神经内分泌肿瘤、正常邻近组织和非肿瘤性结直肠病变 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2775 | 2025-10-07 |
WIP1-mediated regulation of p38 MAPK signaling attenuates pyroptosis in sepsis-associated acute kidney injury
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152832
PMID:38943814
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研究论文 | 本研究探讨WIP1通过调节p38 MAPK信号通路在脓毒症相关急性肾损伤中抑制细胞焦亡的作用机制 | 首次揭示WIP1在急性肾损伤中通过p38 MAPK信号通路调控肾小管细胞焦亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和HK2细胞系，尚未在更复杂的人类病理环境中验证 | 阐明WIP1在脓毒症相关急性肾损伤中的分子调控机制 | 小鼠模型、人类HK2肾小管上皮细胞、急性肾损伤患者组织样本 | 分子病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 细胞活力检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | 小鼠模型和细胞系实验，包含人类患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2776 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of macrophage subpopulations contributing to chemotherapy resistance in ovarian cancer
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152811
PMID:38941863
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示卵巢癌化疗耐药中巨噬细胞亚群的作用机制 | 首次在单细胞水平鉴定出与卵巢癌化疗耐药相关的CXCL5+、THBS1+和MMP9+巨噬细胞亚群，并揭示其促肿瘤分子表达特征 | 样本量未明确说明，机制研究主要基于生物信息学分析缺乏实验验证 | 探究巨噬细胞在卵巢癌化疗耐药中的功能和机制 | 卵巢癌组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞组学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | Seurat分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2777 | 2025-10-07 |
Identification and validation of potential biomarkers related to oxidative stress in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152791
PMID:39180853
|
研究论文 | 通过生物信息学技术鉴定与特发性肺纤维化氧化应激相关的潜在诊断生物标志物 | 首次结合随机森林算法和LASSO回归从氧化应激相关基因中筛选出7个诊断基因，并构建了具有出色预测能力的列线图模型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 鉴定与特发性肺纤维化氧化应激相关的可靠诊断生物标志物 | 特发性肺纤维化患者基因表达数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 基因表达分析，单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 随机森林，LASSO回归，列线图 | 基因表达数据 | GSE70866和GSE141939数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2778 | 2025-10-07 |
Targeting the dynamic transcriptional landscape of Treg subpopulations in pancreatic ductal adenocarcinoma: Insights from single-cell RNA sequencing analysis with a focus on CTLA4 and TIGIT
2024-07, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152822
PMID:38852289
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胰腺导管腺癌中调节性T细胞亚群的动态转录景观及其与其他细胞的相互作用 | 首次在PDAC中系统分析Treg亚群异质性，揭示iTreg与nTreg在肿瘤和正常组织中的分布差异，并识别CTLA4和TIGIT作为关键免疫治疗靶点 | 基于已发表数据集进行重新分析，样本量有限且缺乏实验验证 | 探究胰腺导管腺癌中调节性T细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤和癌旁组织中的调节性T细胞及其他肿瘤微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 已发表数据集（具体样本数未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2779 | 2025-10-07 |
The heterogeneity of tumour-associated macrophages contributes to the clinical outcomes and indications for immune checkpoint blockade in colorectal cancer patients
2024-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152805
PMID:38669865
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其与临床预后和免疫检查点阻断治疗的关系 | 首次系统性地定义了21个决定巨噬细胞状态的基因模块，并发现其中7个与临床预后相关、11个与免疫检查点阻断治疗适应症相关，鉴定出具有高免疫治疗响应特征的HIM TAM亚群 | 样本量相对有限（60例患者），需要更大规模的研究验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞异质性对结直肠癌患者临床预后和免疫检查点阻断治疗适应症的影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 配体-受体相互作用分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 60例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2780 | 2025-10-07 |
Initial regional cytoarchitectonic differences in dorsal and orbitobasal human developing frontal cortex revealed by spatial transcriptomics
2024-Dec-18, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-024-02865-6
PMID:39692769
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研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示人类胚胎发育期前额叶皮层背侧和眶基底区域早期细胞构筑差异 | 首次在转录组水平发现人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域瞬时细胞区室的基因表达差异，证实前额叶皮层区域特化在胎儿发育早期即已出现 | 研究仅聚焦于15孕周这一特定发育时期，样本量有限 | 探究人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域细胞构筑特征的转录组基础 | 人类胚胎发育期前额叶皮层组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 15孕周人类胚胎前额叶皮层样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler空间转录组分析平台 |