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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2741 | 2024-12-13 |
Multiomic profiling reveals metabolic alterations mediating aberrant platelet activity and inflammation in myeloproliferative neoplasms
2024-Feb-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172256
PMID:38060311
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研究论文 | 研究揭示了骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者血小板异常活性和炎症的代谢改变 | 首次揭示了MPN患者中与PI3K/AKT/mTOR信号通路异常相关的代谢紊乱,并发现α-酮戊二酸(α-KG)补充能够显著减少血小板活化和炎症反应 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上,尚未在人体中进行临床试验验证 | 探讨骨髓增殖性肿瘤患者血小板异常活性和炎症的代谢机制 | 骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者的血小板和单核细胞 | NA | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学 | NA | RNA、蛋白质、代谢物 | 包括MPN患者和Jak2 V617F-knockin小鼠的血小板和单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2742 | 2024-12-13 |
Cellular MSI-H score: a robust predictive biomarker for immunotherapy response and survival in gastrointestinal cancer
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/AIWP6518
PMID:39659917
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞水平的MSI-H评分方法,用于预测免疫治疗反应和胃肠道癌症患者的生存率 | 通过单细胞RNA测序数据,开发了一种新的细胞MSI-H评分方法,相比传统的分子MSI-H评分,能够更准确地预测免疫治疗反应和生存率 | 需要进一步的临床试验来验证该方法在不同癌症类型和患者群体中的适用性 | 开发一种更准确的MSI-H评分方法,以指导胃肠道癌症的免疫治疗决策 | 胃肠道癌症患者的免疫治疗反应和生存率 | 数字病理学 | 胃肠道癌 | 单细胞RNA测序 | 高斯有限混合模型 | 基因表达数据 | 97名接受免疫治疗的胃肠道癌症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2743 | 2024-12-13 |
Effect of subcutaneous adipose tissue-associated CSRP2 on the progression of prostate cancer via the WDR5/USP44 pathway
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/AHQT5920
PMID:39659944
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研究论文 | 研究探讨了皮下脂肪组织相关蛋白CSRP2通过WDR5/USP44途径影响前列腺癌进展的机制 | 首次揭示了CSRP2通过抑制WDR5的去泛素化来抑制前列腺癌细胞增殖的机制 | 研究主要基于细胞实验和动物模型,尚未在人体中验证该机制 | 探讨肥胖相关蛋白CSRP2在前列腺癌进展中的作用及其分子机制 | 前列腺癌细胞及其相关蛋白CSRP2、WDR5和USP44 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、组织芯片、免疫共沉淀、质谱分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas的前列腺癌转录组数据以及来自前列腺癌细胞的单细胞RNA测序和组织芯片数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2744 | 2024-12-13 |
Multi-modal transcriptomics: integrating machine learning and convolutional neural networks to identify immune biomarkers in atherosclerosis
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1397407
PMID:39660117
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和卷积神经网络技术,分析多模态转录组数据,以识别与动脉粥样硬化相关的免疫生物标志物 | 本研究首次揭示了与动脉粥样硬化相关的三个关键基因(CD36、S100A10、CSNK1A1),并提出了基于这些基因的两种不同亚型(C2和C1),为临床免疫药物研究提供了新范式 | 本研究主要基于公开的GEO数据集,样本量和数据多样性可能有限,未来需要更大规模和多样化的实验验证 | 建立计算模型,揭示与动脉粥样硬化相关的分子水平标志物 | 动脉粥样硬化相关的免疫生物标志物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 卷积神经网络(CNN) | 基因表达数据 | 共分析了198个样本(包括104个动脉粥样硬化病变样本和94个对照样本)以及30,498个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2745 | 2024-12-13 |
A novel molecular classification system based on the molecular feature score identifies patients sensitive to immune therapy and target therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1466069
PMID:39660131
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研究论文 | 本研究基于多维分子特征评分开发了一种新的分子分类系统,用于识别对免疫治疗和靶向治疗敏感的肝细胞癌患者 | 提出了基于多维分子特征评分的分子分类系统,并开发了实用的预测软件,识别了对免疫治疗和靶向治疗敏感的患者群体 | NA | 研究肝细胞癌的多维分子特征评分,并基于此进行分子分类,以指导精准医学 | 肝细胞癌患者的分子特征和分类 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、单核苷酸变异分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2746 | 2024-12-13 |
Decoding NY-ESO-1 TCR T cells: transcriptomic insights reveal dual mechanisms of tumor targeting in a melanoma murine xenograft model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1507218
PMID:39660132
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研究论文 | 本研究探讨了靶向NY-ESO-1抗原的TCR-T细胞在黑色素瘤小鼠异种移植模型中的功能状态和肿瘤靶向机制 | 首次揭示了NY-ESO-1 TCR-T细胞通过抗原非依赖性NK样和抗原特异性CTL样反应实现双重抗肿瘤效应 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行,结果的临床转化仍需进一步验证 | 探讨TCR-T细胞在治疗实体瘤中的作用机制 | 靶向NY-ESO-1抗原的TCR-T细胞及其在黑色素瘤中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | NanoString技术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | SK-Mel-37异种移植模型中的TCR-T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2747 | 2024-12-12 |
Spatial transcriptomics identifies RBM39 as a gene associated with Gleason score progression in prostate cancer
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111351
PMID:39650727
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探讨了前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组模式,并鉴定了与Gleason评分进展相关的基因RBM39 | 首次通过空间转录组学技术揭示了前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组模式,并验证了RBM39与Gleason评分进展的相关性 | 研究主要基于Visium空间转录组学数据,可能无法完全捕捉到肿瘤的异质性 | 探讨前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组模式,并鉴定与Gleason评分进展相关的基因 | 前列腺癌不同Gleason评分区域的转录组 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | PCA, Louvain聚类分析, inferCNV, DPT, PAGA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2748 | 2024-12-12 |
Corneal strain influences keratocyte proliferation and migration through upregulation of ALDH3A1 expression
2024-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401392R
PMID:39652089
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研究论文 | 本研究探讨了角膜应变对角膜基质细胞增殖和迁移的影响,发现应变通过上调ALDH3A1表达抑制细胞增殖 | 首次揭示了角膜应变通过上调ALDH3A1表达抑制角膜基质细胞增殖和迁移的机制 | 研究主要集中在体外实验和动物模型,缺乏人体临床数据 | 探讨角膜应变对角膜基质细胞行为的影响及其分子机制 | 角膜基质细胞及其在角膜应变下的增殖和迁移行为 | NA | NA | RT-qPCR, 免疫荧光染色, RNA干扰, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞行为数据 | 人类角膜基质细胞, 小鼠角膜损伤模型, 圆锥角膜患者角膜基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2749 | 2024-12-12 |
Nuclear translocation of plasma membrane protein ADCY7 potentiates T cell-mediated antitumour immunity in HCC
2024-Dec-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332902
PMID:39349007
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研究论文 | 本文研究了ADCY7蛋白在肝细胞癌(HCC)中通过核转位增强T细胞介导的抗肿瘤免疫的作用 | 首次揭示了ADCY7通过核转位作为转录共激活因子促进CCL5表达,从而增强CD8+ T细胞浸润,抑制HCC进展 | NA | 探讨HCC中导致免疫逃逸的关键基因,并提出重塑HCC微环境的新治疗策略 | 肝细胞癌(HCC)中的免疫逃逸机制及ADCY7蛋白的功能 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | CRISPR筛选、单细胞RNA测序、流式细胞术、染色质免疫沉淀、共免疫沉淀 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 使用HCC小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 2750 | 2024-12-12 |
RNA isoform diversity in human neurodegenerative diseases
2024-Dec-10, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0296-24.2024
PMID:39658200
|
研究论文 | 本文结合10X Genomics短读长单核RNA测序和PacBio长读长单核RNA测序,研究了与神经退行性疾病相关的基因在单细胞水平上的RNA异构体多样性 | 本文首次在单细胞水平上结合短读长和长读长测序技术,揭示了人类前额叶皮层中与神经退行性疾病相关的基因的RNA异构体多样性,并开发了一种用于检测异构体结构差异的信息学方法 | 本文仅比较了阿尔茨海默病、路易体痴呆和帕金森病三种神经退行性疾病,且样本量有限 | 研究人类神经退行性疾病中RNA异构体的多样性及其潜在的疾病特征和治疗靶点 | 人类前额叶皮层样本中的单核RNA异构体 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA | 25名阿尔茨海默病、路易体痴呆或帕金森病患者及年龄匹配的对照组样本,共分析了超过165,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2751 | 2024-12-12 |
Single-cell RNA sequencing in stroke and traumatic brain injury: Current achievements, challenges, and future perspectives on transcriptomic profiling
2024-Dec-09, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X241305914
PMID:39648853
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在卒中和创伤性脑损伤中的应用,讨论了当前的成就、挑战以及未来的发展方向 | 本文介绍了scRNA-seq技术的最新进展,包括空间转录组学的应用,以及如何结合蛋白质组学、代谢组学或染色质可及性数据进行未来研究 | 本文未详细讨论scRNA-seq技术在实际应用中的具体限制,如组织解离过程中引起的细胞应激反应 | 探讨scRNA-seq技术在卒中和创伤性脑损伤中的应用及其未来发展 | 卒中和急性创伤性脑损伤的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2752 | 2024-12-12 |
Advances in integrating single-cell sequencing data to unravel the mechanism of ferroptosis in cancer
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae025
PMID:38874174
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在铁死亡相关癌症研究中的进展 | 单细胞测序技术提供了比传统批量测序更精细的细胞和分子特征信息,有助于揭示铁死亡相关的机制和途径 | NA | 探讨单细胞测序技术在铁死亡相关癌症研究中的应用 | 铁死亡相关的途径、免疫检查点、生物标志物以及与铁死亡相关的肿瘤细胞簇 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2753 | 2024-12-12 |
A comprehensive survey of dimensionality reduction and clustering methods for single-cell and spatial transcriptomics data
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae023
PMID:38860675
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综述 | 本文系统总结了用于单细胞和空间转录组数据降维和聚类分析的最广泛认可的算法 | 提供了对该领域现有工具的全面总结,为开发新工具提供了有价值的见解和思路 | NA | 总结单细胞和空间转录组数据降维和聚类分析的算法 | 单细胞转录组和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2754 | 2024-12-12 |
A comprehensive review of approaches for spatial domain recognition of spatial transcriptomes
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae040
PMID:39426802
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综述 | 本文综述了空间转录组学中空间域识别方法的现状和进展 | 本文探讨了现有方法的优缺点,并为未来工具开发提供了建议和方向 | 本文未提及具体方法的局限性,而是从整体上讨论了现有方法的局限性 | 回顾空间域识别研究的现状和进展,探讨现有方法的优缺点,并提供未来工具开发的建议和方向 | 空间转录组学中的空间域识别方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2755 | 2024-12-12 |
Single-cell transcriptome profiling of m6A regulator-mediated methylation modification patterns in elderly acute myeloid leukemia patients
2024-12-06, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-024-00234-7
PMID:39641872
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研究论文 | 本研究探讨了老年急性髓性白血病患者中单细胞转录组中m6A调控因子介导的甲基化修饰模式及其在造血细胞中的具体作用 | 首次揭示了m6A调控因子在老年急性髓性白血病患者造血细胞中的异常表达及其通过WNT信号通路和氧化磷酸化途径抑制细胞分化的机制,并提供了潜在的治疗靶点 | 研究主要基于体外实验和细胞系验证,缺乏临床样本的长期随访数据 | 揭示m6A甲基化修饰在老年急性髓性白血病患者中的病理机制 | 老年急性髓性白血病患者的造血干细胞、髓系细胞、T细胞和红细胞 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 使用了THP-1和MV411细胞系进行验证,并进行了外部独立单细胞RNA测序数据集的验证 | NA | NA | NA | NA |
| 2756 | 2024-12-12 |
Rescue of cochlear vascular pathology prevents sensory hair cell loss in Norrie disease
2024-Dec-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322124121
PMID:39585982
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研究论文 | 研究通过条件激活β-catenin在血管内皮细胞中的稳定表达,探讨其在Norrie疾病小鼠模型中对耳蜗血管病理和感觉毛细胞损失的修复作用 | 首次证明在耳蜗微血管中,β-catenin是norrin结合内皮细胞表面受体后的主要下游细胞内效应因子,并验证了恢复该信号通路足以防止感觉毛细胞死亡和听力损失 | 研究仅在动物模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨Norrie疾病中耳蜗病理的修复机制 | Norrie疾病小鼠模型的耳蜗血管病理和感觉毛细胞损失 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类耳蜗样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2757 | 2024-12-12 |
Single-Cell Meta-Analysis Uncovers the Pancreatic Endothelial Cell Transcriptomic Signature and Reveals a Key Role for NKX2-3 in PLVAP Expression
2024-Dec, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321781
PMID:39445426
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研究论文 | 本研究通过单细胞元分析揭示了胰腺内皮细胞的转录组特征,并发现NKX2-3在PLVAP表达中的关键作用 | 首次定义了跨物种和发育阶段的胰腺内皮细胞特异性基因特征,并揭示了NKX2-3作为关键转录因子在胰腺内皮细胞中的作用 | 研究主要依赖于现有的单细胞RNA测序数据,可能存在数据偏倚 | 揭示胰腺内皮细胞的转录组特征及其在胰腺血管系统中的作用 | 胰腺内皮细胞及其特异性基因特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个单细胞和单核RNA测序数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 2758 | 2024-12-12 |
Rhythmic IL-17 production by γδ T cells maintains adipose de novo lipogenesis
2024-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08131-3
PMID:39478228
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研究论文 | 本文研究了γδ T细胞产生的IL-17在维持脂肪组织从头脂肪生成中的节律性作用 | 首次揭示了IL-17产生的γδ T细胞依赖分子钟维持脂肪组织稳态,并展示了其在脂肪库中RORγt和IL-17A的强节律性表达 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类中验证这些发现 | 探讨免疫系统的昼夜节律在免疫稳态中的作用,特别是IL-17在脂肪组织代谢中的作用 | γδ T细胞、不变自然杀伤T细胞、黏膜相关不变T细胞以及脂肪组织中的从头脂肪生成 | 免疫学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2759 | 2024-12-12 |
Polyclonal-to-monoclonal transition in colorectal precancerous evolution
2024-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08133-1
PMID:39478225
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研究论文 | 本文使用基于碱基编辑的DNA条形码系统,在肠道肿瘤发生的小鼠模型中全面绘制了单细胞谱系图谱,揭示了结直肠癌前病变的克隆演化过程 | 首次通过高分辨率单细胞谱系分析,揭示了结直肠息肉的克隆起源和多克隆到单克隆的转变过程,并发现了早期多克隆病变中的细胞间相互作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的批量测序数据,可能无法完全反映人类结直肠癌前病变的复杂性 | 揭示结直肠癌前病变的起源和演化过程,为早期干预提供理论基础 | 小鼠肠道肿瘤模型和人类散发性结直肠息肉 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、全外显子测序、全基因组测序 | NA | 单细胞数据 | 260,922个单细胞,来自正常、炎症和肿瘤性肠道组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2760 | 2024-12-12 |
Tau Accumulation Induces Microglial State Alterations in Alzheimer's Disease Model Mice
2024-Dec, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0260-24.2024
PMID:39592224
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研究论文 | 本研究通过向人源化tau的敲入小鼠脑内注射来自人类大脑的tau蛋白,生成了一种新的阿尔茨海默病模型小鼠,并探讨了tau积累对小胶质细胞状态的影响 | 首次通过空间转录组学和单细胞RNA测序数据,展示了tau传播和积累在阿尔茨海默病模型小鼠脑中诱导疾病相关小胶质细胞表型的现象 | 需要进一步使用单细胞分辨率的空间转录组学来更准确地解释tau病理对小胶质细胞的影响 | 探讨tau病理与小胶质细胞状态之间的关系 | 阿尔茨海默病模型小鼠的小胶质细胞状态 | NA | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA | 人源化tau的敲入小鼠 | NA | NA | NA | NA |