单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7848 篇文献，本页显示第 2721 - 2740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2721 | 2024-10-18 |
OrganogenesisDB: A Comprehensive Database Exploring the Cell-Type Identities and Gene Expression Dynamics during Organogenesis
2024-Oct, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301758
PMID:38967205
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研究论文 | 本文介绍了一个名为OrganogenesisDB的综合数据库，用于探索器官发生过程中细胞类型身份和基因表达动态 | 开发了一个包含超过140万个细胞的单细胞RNA测序数据的综合数据库，涵盖49个已发表的数据集，并手动整理了3324个细胞标记 | NA | 旨在填补理解器官发生过程中细胞分化和成熟的数据空白 | 器官发生过程中的细胞类型身份和基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过140万个细胞，来自49个已发表的数据集，涵盖9个人类器官和4个老鼠器官 |
| 2722 | 2024-10-18 |
Single Nucleus Total RNA Sequencing of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Gliomas
2024-Oct, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301801
PMID:38958078
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研究论文 | 开发了一种名为snRandom-seq的高通量单核总RNA测序平台，用于固定石蜡包埋（FFPE）的胶质瘤样本，并分析了17个FFPE样本中的116,492个单核 | 开发了自动化snRandom-seq平台，优化了FFPE样本的单核总RNA测序，适用于广泛的样本类型，并应用于多种胶质瘤亚型的分析 | NA | 研究胶质瘤的分子多样性和进化过程，以推动新治疗方法的发展 | 固定石蜡包埋的胶质瘤样本及其分子特征 | 数字病理学 | 脑癌 | 单核总RNA测序 | NA | RNA | 17个FFPE样本中的116,492个单核 |
| 2723 | 2024-10-18 |
Enhancing Endogenous Hyaluronic Acid in Osteoarthritic Joints with an Anti-Inflammatory Supramolecular Nanofiber Hydrogel Delivering HAS2 Lentivirus
2024-Oct, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400542
PMID:38593309
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研究论文 | 开发了一种超分子纳米纤维水凝胶，通过递送编码透明质酸合成酶2的慢病毒来增强骨关节炎关节中的内源性透明质酸 | 创新性地使用超分子纳米纤维水凝胶递送HAS2慢病毒，促进内源性透明质酸生成并抑制滑膜炎症 | NA | 开发一种新型治疗策略，以改善骨关节炎的管理 | 骨关节炎关节中的内源性透明质酸生成和滑膜炎症 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 前交叉韧带切断诱导的骨关节炎小鼠模型 |
| 2724 | 2024-10-18 |
Role of TOMM34 on NF-κB activation-related hyperinflammation in severely ill patients with COVID-19 and influenza
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105343
PMID:39276680
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研究论文 | 研究探讨了TOMM34在COVID-19和流感重症患者中与NF-κB激活相关的过度炎症中的作用 | 首次揭示了TOMM34在病毒感染中通过招募TRAF6促进NEMO的K63连接的多聚泛素化，从而促进NF-κB激活的机制 | NA | 识别驱动NF-κB激活和炎症的未知宿主因子，以开发免疫干预策略 | COVID-19和流感重症患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 健康个体27人，COVID-19重症患者21人，健康个体22人，COVID-19重症患者45人，流感重症患者16人 |
| 2725 | 2024-10-18 |
Damping excessive viral-induced IFN-γ rescues the impaired anti-Aspergillus host immune response in influenza-associated pulmonary aspergillosis
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105347
PMID:39353282
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研究论文 | 研究流感相关肺曲霉病（IAPA）中免疫病理机制，发现过度产生的IFN-γ是主要驱动因素，并探讨了其分子机制和潜在的免疫治疗靶点 | 揭示了流感诱导的IFN-γ过度产生是IAPA中免疫功能障碍的主要驱动因素，并提出了新的免疫治疗靶点 | NA | 揭示流感相关肺曲霉病的免疫病理机制，开发辅助免疫调节疗法 | 流感相关肺曲霉病（IAPA）的免疫病理机制 | NA | 肺曲霉病 | 微计算机断层扫描（μCT）、生物发光成像（BLI）、空间转录组学、免疫荧光染色、功能性吞噬和杀伤试验 | NA | NA | 使用免疫功能正常的鼠模型进行研究 |
| 2726 | 2024-10-18 |
vSPACE: Exploring Virtual Spatial Representation of Articular Chondrocytes at the Single-Cell Level
2024-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.577817
PMID:38370845
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研究论文 | 本文介绍了一种名为vSPACE的新方法，用于在二维空间中虚拟表示单细胞RNA测序数据，特别是人类关节软骨细胞 | vSPACE方法通过模拟空间转录组技术，在虚拟二维图中展示了人类关节软骨细胞的区域分布模式，揭示了可解释且在不同供体中一致的基因表达模式 | NA | 开发一种新的方法来虚拟表示单细胞RNA测序数据，揭示人类关节软骨细胞的区域分布模式 | 人类关节软骨细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6名健康供体的样本 |
| 2727 | 2024-10-17 |
Single-cell RNA sequencing and transcriptomic analysis reveal key genes and regulatory mechanisms in sepsis
2024-Nov, Biotechnology & genetic engineering reviews
DOI:10.1080/02648725.2023.2196475
PMID:37017187
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和转录组分析揭示了脓毒症中的关键基因及其调控机制 | 通过单细胞RNA测序和转录组分析，识别出与脓毒症发展相关的九个关键基因，并构建了miRNA网络和调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析，未进行实验验证 | 深入研究脓毒症的分子发病机制，识别关键的脓毒症相关基因 | 脓毒症的关键基因及其调控机制 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的scRNA数据集（GSE167363）和RNA-seq数据集（GSE65682，GSE134347） |
| 2728 | 2024-10-17 |
Identification of kidney cell types in scRNA-seq and snRNA-seq data using machine learning algorithms
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38567
PMID:39403515
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研究论文 | 本文研究了使用机器学习算法在scRNA-seq和snRNA-seq数据中识别肾细胞类型的方法 | 本文测试了五种监督分类方法在自动细胞类型注释中的表现，展示了机器学习算法在肾细胞类型注释中的高准确性 | 研究样本数量有限，且在scRNA-seq数据训练的模型在snRNA-seq数据上的表现有所下降 | 旨在通过机器学习算法自动注释肾细胞类型，提高注释效率和通用性 | scRNA-seq和snRNA-seq数据中的肾细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | 支持向量机, 随机森林, 多层感知器, k近邻, 极端梯度提升 | 基因表达数据 | 62,120个细胞，来自79个肾活检样本 |
| 2729 | 2024-10-17 |
Peripheral mononuclear cells and systemic lupus erythematosus association: Integrated study of single-cell sequencing and mendelian randomization analysis
2024-Oct-15, Lupus
IF:1.9Q3
DOI:10.1177/09612033241292705
PMID:39404110
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研究论文 | 本研究整合单细胞测序和孟德尔随机化分析，探讨外周单核细胞与系统性红斑狼疮的关联 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了系统性红斑狼疮发病机制中的关键基因和细胞亚型 | 本研究依赖于公开数据集，样本量有限，且未进行体内验证 | 探讨外周单核细胞与系统性红斑狼疮的关联，并识别疾病进展中的关键基因 | 系统性红斑狼疮患者的外周单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GSE135779数据集的样本 |
| 2730 | 2024-10-17 |
Non-homogenous intratumor ionizing radiation doses synergize with PD1 and CXCR2 blockade
2024-Oct-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53015-9
PMID:39397001
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研究论文 | 研究非均匀肿瘤内电离辐射剂量与PD1和CXCR2阻断剂的协同作用 | 提出了一种结合低剂量和高剂量放射治疗与免疫调节剂的新策略，以增强抗肿瘤反应并减少放射治疗的毒性 | 研究仅在免疫功能正常的雌性小鼠的结直肠癌和乳腺癌模型中进行，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨非均匀肿瘤内电离辐射剂量与PD1和CXCR2阻断剂的协同作用，以提高放射治疗和免疫检查点抑制剂组合的治疗效果 | 结直肠癌和乳腺癌模型中的肿瘤免疫微环境 | 肿瘤学 | 癌症 | 流式细胞术、细胞因子分析和单细胞RNA测序 | NA | 细胞和基因表达数据 | 免疫功能正常的雌性小鼠 |
| 2731 | 2024-10-17 |
Root-specific theanine metabolism and regulation at the single-cell level in tea plants (Camellia sinensis)
2024-Oct-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95891
PMID:39401074
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了茶树根部特定细胞类型中L-茶氨酸的代谢途径及其调控机制 | 首次在单细胞水平上解析了茶树根部L-茶氨酸的生物合成、储存和运输过程，并提出了多细胞分隔的生物合成模型 | NA | 探讨茶树根部特定细胞类型中L-茶氨酸的代谢及其调控机制 | 茶树根部特定细胞类型中的L-茶氨酸代谢 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
| 2732 | 2024-10-17 |
B cell heterogeneity in cancer comes of age
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.09.013
PMID:39406185
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研究论文 | 本文探讨了B细胞在癌症中的作用，并通过单细胞RNA测序定义了肿瘤浸润B细胞亚群的泛癌图谱 | 通过单细胞RNA测序技术定义了肿瘤浸润B细胞亚群的泛癌图谱，为理解B细胞依赖的抗肿瘤免疫提供了新的视角 | B细胞在癌症中的作用仍不完全清楚，需要进一步研究 | 探讨B细胞在癌症中的作用及其对肿瘤免疫的影响 | B细胞及其在癌症中的亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2733 | 2024-10-17 |
A pan-cancer single-cell RNA-seq atlas of intratumoral B cells
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.09.011
PMID:39406187
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术构建了一个泛癌肿瘤内B细胞的图谱 | 首次提供了泛癌肿瘤内B细胞和浆细胞的单细胞RNA测序图谱，揭示了这些细胞在肿瘤微环境中的异质性和功能多样性 | NA | 旨在填补肿瘤浸润B细胞缺乏全面分类系统的空白 | 肿瘤浸润B细胞和浆细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 大量样本 |
| 2734 | 2024-10-17 |
Immunotherapy and pan-apoptotic characterization of the tumor microenvironment in gastric cancer (STAD): a single-cell multidimensional analysis
2024-Oct-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01429-8
PMID:39397186
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研究论文 | 本研究通过单细胞多维分析，探讨了胃癌肿瘤微环境中自噬相关基因聚集的关键作用及其在细胞功能中的主要作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和非负矩阵分解技术，揭示了自噬相关基因在胃癌肿瘤微环境中的动态表达及其在细胞间通信中的作用 | 本研究主要集中在胃癌肿瘤微环境中的细胞亚群和基因表达模式，未涉及其他癌症类型或更广泛的应用场景 | 阐明自噬相关基因在胃癌肿瘤微环境细胞中的关键作用及其在细胞功能中的主要作用 | 胃癌肿瘤微环境中的细胞亚群及其自噬相关基因的表达模式 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 (NMF) | 基因表达数据 | 多个胃癌肿瘤微环境中的细胞亚群 |
| 2735 | 2024-10-17 |
Heterogeneity in extracellular matrix and immune microenvironment of anterior vaginal wall revealed by single-cell sequencing in women with stress urinary incontinence
2024-Oct-10, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114280
PMID:39395557
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了压力性尿失禁患者前阴道壁中不同细胞类型的转录组特征，揭示了细胞外基质和免疫微环境的异质性 | 首次通过单细胞测序技术揭示了压力性尿失禁患者前阴道壁中细胞外基质和免疫微环境的异质性，并发现了与疾病发生相关的特定细胞类型和细胞间通信变化 | 研究样本仅限于压力性尿失禁患者，且样本量未明确提及，可能影响结果的普适性 | 探索压力性尿失禁病理生理学中的细胞外基质和免疫微环境的异质性 | 压力性尿失禁患者前阴道壁中的不同细胞类型 | NA | 泌尿系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2736 | 2024-10-17 |
Multimodal screen identifies noise-regulatory proteins
2024-Oct-10, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.09.015
PMID:39406240
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研究论文 | 本文通过多模态筛选方法识别出调控基因表达噪声的蛋白质 | 本文首次通过整合单细胞RNA测序、蛋白质组学和调控因子富集分析，识别出32个潜在的噪声调控因子，并证明SON蛋白能够独立于平均表达水平调控转录噪声 | 本文主要集中在SON蛋白的研究，未全面探讨其他潜在噪声调控因子的功能 | 研究是否存在独立于平均表达水平调控基因表达噪声的蛋白质或通路 | 基因表达噪声调控蛋白 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、长读长RNA测序 | NA | RNA、蛋白质 | 小鼠胚胎干细胞 |
| 2737 | 2024-10-17 |
Exposure to PFOA, PFOS, and PFHxS induces Alzheimer's disease-like neuropathology in cerebral organoids
2024-Oct-09, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.125098
PMID:39389246
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研究论文 | 研究探讨了全氟烷基物质（PFASs）暴露对大脑类器官的神经毒性影响 | 首次使用单细胞RNA测序和大脑类器官模型，揭示了PFASs暴露与阿尔茨海默病样神经病理学之间的关联 | 研究仅限于体外模型，需要进一步的体内实验验证 | 探究PFASs暴露对人类长期神经健康的影响 | 大脑类器官和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大脑类器官暴露于不同浓度的PFAS混合物，持续35天，并在第70天进行后续分析 |
| 2738 | 2024-10-17 |
Bulk integrated single-cell-spatial transcriptomics reveals the impact of preoperative chemotherapy on cancer-associated fibroblasts and tumor cells in colorectal cancer, and construction of related predictive models using machine learning
2024-10-05, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167535
PMID:39374811
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研究论文 | 研究探讨了术前化疗对结直肠癌中成纤维细胞和上皮细胞生物学功能的影响，并构建了相关的预测模型 | 首次识别了与术前化疗相关的三个细胞亚群（NOTCH3+成纤维细胞、TNNT1+上皮细胞和HSPA1A+上皮细胞），并构建了术前化疗风险签名模型（PCRSM），该模型在结直肠癌的预后和治疗中显示出潜力 | NA | 探讨术前化疗对结直肠癌中成纤维细胞和上皮细胞的影响，并构建预测模型以改善患者预后 | 结直肠癌中的成纤维细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 22个独立结直肠癌队列的数据 |
| 2739 | 2024-10-17 |
Mechanism exploration and model construction for small cell transformation in EGFR-mutant lung adenocarcinomas
2024-Oct-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01981-3
PMID:39353908
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研究论文 | 研究探索了EGFR突变型肺腺癌中向小细胞肺癌转化的机制，并构建了一个预测模型 | 首次通过转录组分析和多重免疫荧光技术揭示了EGFR-TKI治疗后肺腺癌向小细胞肺癌转化的潜在分子机制，并构建了一个高灵敏度和特异性的预测模型 | 研究样本量较小，且仅限于EGFR突变型肺腺癌，可能限制了结果的普适性 | 探索EGFR突变型肺腺癌中向小细胞肺癌转化的分子机制，并开发预测模型 | EGFR-TKI治疗前后的肺腺癌和小细胞肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析、空间转录组学、多重免疫荧光 | 预测模型 | 转录组数据、免疫荧光图像 | 包括LUAD-NT、SCLC-P、LUAD-BT和SCLC-AT的多个样本 |
| 2740 | 2024-10-17 |
Exploring the impact of PDGFD in osteosarcoma metastasis through single-cell sequencing analysis
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00949-3
PMID:38652223
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探索PDGFD在骨肉瘤转移中的影响 | 使用单细胞RNA测序技术验证了非转移性和转移性骨肉瘤之间的差异表达基因和信号通路，揭示了PDGFD在抑制骨肉瘤转移中的作用 | 研究主要集中在PDGFD和PDGFRB的表达和功能上，未全面探讨其他潜在的转移机制 | 验证非转移性和转移性骨肉瘤之间的差异表达基因和信号通路，以增强对转移机制的理解并揭示潜在的治疗靶点 | 非转移性和转移性骨肉瘤的基因表达和信号通路 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个原发性骨肉瘤病变（1个非转移性和1个转移性） |