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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2721 | 2025-10-07 |
Computational cell-cell interaction technologies drive mechanistic and biomarker discovery in the tumor microenvironment
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103048
PMID:38142648
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究肿瘤微环境中细胞间相互作用的最新进展 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术阐明肿瘤微环境动态,推动关键细胞间相互作用和药物靶点生物标志物的发现 | NA | 促进肿瘤微环境中细胞间相互作用机制研究和生物标志物发现 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用网络 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2722 | 2025-10-07 |
Strategies for dissecting the complexity of neurodevelopmental disorders
2024-02, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2023.10.009
PMID:37949722
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综述 | 本文综述了利用模型生物、诱导多能干细胞、单细胞测序技术和大规模平行报告分析等策略解析神经发育障碍复杂性的方法 | 重点介绍了基于单细胞CRISPR筛选技术,能够以高效率、准确性和高通量方式研究细胞转录组 | NA | 解析神经发育障碍的复杂性并探索疾病因果关系和潜在机制 | 神经发育障碍 | 生物医学研究 | 神经发育障碍 | 高通量测序, 单细胞测序, CRISPR筛选, 大规模平行报告分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2723 | 2025-10-07 |
Astrocyte ensheathment of calyx-forming axons of the auditory brainstem precedes accelerated expression of myelin genes and myelination by oligodendrocytes
2024-02, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25552
PMID:37916792
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研究论文 | 本研究揭示了听觉脑干中星形胶质细胞在少突胶质细胞髓鞘形成前包裹轴突的新机制 | 首次证明小鼠MNTB中星形胶质细胞在少突胶质细胞包裹和髓鞘压实前广泛包裹生长的CH终末轴突 | 研究局限于小鼠早期 postnatal 发育阶段,需要进一步验证在其他物种或发育阶段的普适性 | 探究听觉脑干早期发育阶段神经元与胶质细胞相互作用的分子机制和时序特征 | 小鼠 medial nucleus of the trapezoid body (MNTB) 组织 | 神经科学 | NA | 微阵列基因表达分析, bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 电子显微镜3D成像 | NA | 基因表达数据, 电子显微镜图像 | postnatal day P0-P14 发育时间序列的小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2724 | 2025-10-07 |
Multi-omic analysis of human kidney tissue identified medulla-specific gene expression patterns
2024-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.10.024
PMID:37995909
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示成人肾脏髓质特异性基因表达模式 | 首次系统描述成人肾脏髓质的基线基因表达和表观基因组特征,并整合染色质可及性、构象与空间转录组数据 | 样本量较小(仅5例男性患者),仅使用肿瘤旁正常组织 | 解析肾脏髓质发育和功能的分子机制 | 成人肾脏皮质和髓质组织 | 基因组学 | 肾脏疾病 | RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, 空间转录组, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 5例男性患者的肾切除标本 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, 空间转录组 | NA | NA |
| 2725 | 2025-10-07 |
Single-cell resolution of human airway epithelial cells exposed to bronchiolitis obliterans-associated chemicals
2024-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00304.2023
PMID:38084407
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析暴露于闭塞性细支气管炎相关化学物质的人气道上皮细胞的转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示不同BO相关化学物质暴露引起的气道上皮细胞表型变化和功能通路差异 | 研究仅限于体外细胞模型,未涉及动物模型或临床样本验证 | 阐明闭塞性细支气管炎相关化学物质暴露诱导疾病发生的分子机制 | 原代人气道上皮细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 75,663个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2726 | 2025-10-07 |
Distribution of P2Y and P2X purinergic receptor expression within the intestine
2024-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00108.2023
PMID:37987757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肠道上皮细胞中P2Y和P2X嘌呤能受体的分布模式 | 首次系统性地描述了胃肠道上皮细胞中嘌呤能受体的表达谱,并发现人肠道类器官是研究肠道嘌呤能信号传导的优选模型 | 研究主要基于mRNA表达水平,蛋白质表达和功能验证需要进一步研究 | 探究嘌呤能受体在肠道上皮细胞中的表达分布和功能 | 人类小肠和大肠组织、人肠道类器官、T84、Caco2和HT29肠道上皮细胞系 | 单细胞生物学 | 肠道炎性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类肠道组织单细胞测序数据、三种肠道上皮细胞系和人肠道类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2727 | 2025-10-07 |
A review of computational methods for predicting cancer drug response at the single-cell level through integration with bulk RNAseq data
2024-02, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2023.102745
PMID:38109840
|
综述 | 综述通过整合单细胞RNA测序与bulk RNAseq数据预测癌症药物反应的计算方法 | 系统梳理了利用大规模药物筛选数据在单细胞层面预测药物敏感性的计算方法 | NA | 填补单细胞RNA测序知识向治疗策略转化的空白,解决肿瘤异质性导致的治疗抵抗问题 | 肿瘤异质性、恶性细胞克隆 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2728 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of human prostate basal epithelial cells reveals zone-specific cellular populations and gene expression signatures
2024-02, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6227
PMID:37984408
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类前列腺基底上皮细胞的区域特异性细胞群体和基因表达特征 | 首次在前列腺基底细胞中识别出区域特异性细胞群体和与前列腺癌及良性前列腺增生相关的基因表达特征 | 研究基于原代前列腺上皮细胞培养,可能无法完全反映体内微环境的影响 | 探究前列腺基底细胞在区域特异性疾病发生中的潜在驱动作用 | 人类前列腺和精囊的原代基底上皮细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫染色,生物信息学分析 | Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) | 单细胞RNA测序数据 | 人类前列腺和精囊的原代上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2729 | 2025-10-07 |
Interleukin-10 signaling in somatosensory neurons controls CCL2 release and inflammatory response
2024-02, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.12.013
PMID:38081433
|
研究论文 | 本研究揭示了白细胞介素-10通过直接作用于感觉神经元上的受体来下调CCL2释放并调控炎症反应的新机制 | 首次证明抗炎细胞因子可通过直接结合感觉神经元受体来限制炎症 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究IL-10信号在感觉神经元中对炎症反应的调控作用 | 背根神经节感觉神经元、三叉神经节神经元 | 神经免疫学 | 炎症性疾病 | scRNA-seq, 原代神经元培养 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、细胞因子水平数据 | 野生型与IL-10R1特异性敲除小鼠的比较研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2730 | 2025-10-07 |
Method for Collecting Single Epithelial Cells from the Mouse Larynx
2024-02, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30970
PMID:37602769
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研究论文 | 开发了一种从小鼠喉部收集单个上皮细胞的可靠方法 | 首次建立了使用小型牙科刷从小鼠喉部特异性收集上皮细胞的技术,能够最小化非喉部部位和非上皮细胞的污染 | 该方法会移除喉部上皮层和部分下层组织,可能影响组织完整性 | 开发从小鼠喉部收集单个上皮细胞的可靠方法 | 小鼠喉部上皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫荧光染色, 组织病理学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 单个喉部收集6000-8000个细胞,三个组织合并收集35000-40000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2731 | 2024-08-07 |
Partners in Crime: Inferring Cell-to-cell Interactions in Kidney Allograft Rejection From Single-cell RNA Sequencing
2024-Feb-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004763
PMID:37638872
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2732 | 2025-10-07 |
Reduced TRIM expression correlates with anomalous CD4 T cell activation in systemic lupus Erythematosus and its clinical diagnostic potential
2024-12, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106913
PMID:39233252
|
研究论文 | 本研究探讨了TRIM分子在系统性红斑狼疮患者CD4+T细胞中的表达特征及其临床诊断价值 | 首次揭示TRIM表达与CD4+T细胞异常活化的关联,并证明其在SLE临床鉴别诊断中的潜力 | 样本来源包括人和小鼠,但具体样本数量未明确说明 | 阐明TRIM在SLE患者CD4+T细胞中的表达、功能和临床相关性 | 系统性红斑狼疮患者、健康对照者和类风湿关节炎患者的PBMCs及小鼠外周血和脾脏CD4+T细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | SLE患者、健康对照和RA患者的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2733 | 2025-10-07 |
Graph contrastive learning of subcellular-resolution spatial transcriptomics improves cell type annotation and reveals critical molecular pathways
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf020
PMID:39883515
|
研究论文 | 提出一种名为Focus的图对比学习方法,利用亚细胞分辨率空间转录组数据改进细胞类型注释 | 首次开发能够显式建模RNA亚细胞分布和社区的半监督图对比学习方法 | NA | 改进细胞类型注释并揭示关键分子通路 | 亚细胞分辨率空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组技术 | 图对比学习 | 空间转录组数据 | NA | NA | 单分子分辨率空间转录组学 | MERFISH, CosMx SMI, Xenium | 亚细胞分辨率空间转录组平台 |
| 2734 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing has revealed a more complex array of thymic epithelial cells
2024-10, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106904
PMID:39117004
|
综述 | 本文通过单细胞测序技术揭示了胸腺上皮细胞在正常和肿瘤状态下的更复杂分类 | 利用单细胞测序技术重新定义了胸腺上皮细胞的分类体系,揭示了从pre-AIRE状态到成熟medullary细胞再到post-AIRE细胞的分化轨迹 | NA | 探讨单细胞测序对胸腺上皮细胞分类的新见解 | 正常和肿瘤状态下的胸腺上皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2735 | 2025-10-07 |
Molecular Organization of Autonomic, Respiratory, and Spinally-Projecting Neurons in the Mouse Ventrolateral Medulla
2024-Jul-31, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2211-23.2024
PMID:38918066
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠延髓腹外侧区细胞的全面分子图谱 | 首次通过靶向测序富集脊髓投射和肾上腺素能/去甲肾上腺素能神经元,识别出23种神经元亚型和5种星形胶质细胞亚型 | 研究仅针对小鼠模型,未在其它物种中验证 | 解析延髓腹外侧区的分子和细胞组织结构 | 小鼠延髓腹外侧区细胞,特别是脊髓投射神经元和单胺能神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 114,805个VLM细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2736 | 2025-10-07 |
Intratumoural CD8+ CXCR5+ follicular cytotoxic T cells have prognostic value and are associated with CD19+ CD38+ B cells and tertiary lymphoid structures in colorectal cancer
2024-Dec-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03887-z
PMID:39739032
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中CD8+ CXCR5+滤泡细胞毒性T细胞的预后价值及其与B细胞和三级淋巴结构的关系 | 首次系统比较TFC细胞在MSI-high和MSS结直肠癌中的生物学功能差异,并建立了预后预测模型 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 探索TFC细胞在结直肠癌中的特征及其在MSI-high和MSS亚型中的生物学功能差异 | 结直肠癌患者肿瘤组织和外周血样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 共培养实验 | 预测模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 临床队列和公共数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2737 | 2025-10-07 |
TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage
2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528
PMID:39494399
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析TNFα对小鼠软骨细胞转录组的差异影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示TNFα对骨骺软骨细胞不同亚群的差异调控作用 | 研究仅使用新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞,未验证其他年龄或物种 | 探究TNFα在软骨细胞炎症反应中的作用机制 | 新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 14,239个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2738 | 2025-10-07 |
Spatial resolution of the head and neck cancer tumor microenvironment to identify tumor and stromal features associated with therapy response
2024-10, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12811
PMID:39048134
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术解析头颈癌肿瘤微环境特征与免疫治疗反应的关系 | 首次结合NanoString GeoMx空间转录组和Akoya Phenocycler-Fusion空间蛋白质组技术,在头颈癌中识别与免疫治疗反应相关的肿瘤和基质特征 | 样本量较小(仅12名患者),且为回顾性研究 | 识别头颈癌肿瘤微环境中与免疫治疗反应相关的生物学特征 | 头颈癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理 | 头颈癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 12名患者的25个组织核心(包括4名无应答者8个核心,2名应答者5个核心,6名未治疗者12个核心) | NanoString, Akoya | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler, PhenoCycler-Fusion | NanoString GeoMx全转录组空间分析, Akoya PhenoCycler-Fusion空间蛋白质组分析 |
| 2739 | 2025-10-07 |
Computational estimation of clonal diversity in autoimmunity
2024-09, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12801
PMID:39010261
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序测量T细胞和B细胞受体多样性及其在自身免疫病研究中的应用 | 结合单细胞测序与多样性评估方法,推动自身免疫病机制发现和治疗创新 | NA | 探讨免疫受体多样性测量方法及其在自身免疫病研究中的意义 | T细胞受体和B细胞受体 | 生物信息学 | 自身免疫病 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2740 | 2025-10-07 |
Discovery of a monoclonal, high-affinity CD8+ T-cell clone following natural hepatitis C virus infection
2024-08, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12791
PMID:38855806
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研究论文 | 在自然HCV感染后发现了一个具有高亲和力的单克隆CD8+ T细胞克隆 | 发现了在急性HCV感染后持续存在的单克隆CD8+ T细胞群体,其TCR-pMHC相互作用的解离时间异常长 | 研究样本量有限,仅从两名个体中分析HCV特异性T细胞群体 | 研究HCV感染后CD8+ T细胞的特异性免疫应答 | HCV感染个体的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 丙型肝炎 | 单细胞测序,HLA多聚体染色 | NA | 测序数据,流式细胞术数据 | 两名HCV感染个体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |