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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2701 | 2024-12-12 |
Skin treatment with non-thermal plasma modulates the immune system through miR-223-3p and its target genes
2024-01, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2024.2361571
PMID:38828710
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研究论文 | 研究非热等离子体对小鼠耳部皮肤的治疗效果及其通过miR-223-3p及其靶基因调节免疫系统的机制 | 首次通过非编码RNA测序和单细胞血液测序揭示了非热等离子体对miRNA表达的特定影响及其在伤口愈合和组织再生中的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证其效果 | 探讨非热等离子体在皮肤治疗中的分子机制及其对免疫系统的影响 | 小鼠耳部皮肤及血液中的miRNA和靶基因 | NA | NA | 非编码RNA测序,单细胞血液测序 | NA | RNA | 小鼠耳部皮肤样本及血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2702 | 2024-12-12 |
Pan-cancer dissection of vasculogenic mimicry characteristic to provide potential therapeutic targets
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1346719
PMID:38694917
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研究论文 | 本研究基于多组学数据分析了不同癌症类型中血管拟态(VM)的特征,并提供了潜在的治疗靶点和策略 | 首次全面解析了跨癌症类型的血管拟态特征,揭示了其与肿瘤侵袭性、转移潜力、恶性程度和预后的相关性,并发现了与免疫抑制微环境的关系 | 研究主要基于现有数据库数据,缺乏实验验证,且样本量和数据类型可能限制了结果的普适性 | 阐明不同癌症类型中血管拟态的特征及其调控机制,并提供潜在的治疗靶点 | 跨癌症类型的血管拟态特征及其与肿瘤侵袭性、免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 多组学数据分析、单细胞转录组数据分析 | NA | 多组学数据、转录组数据、药物反应数据 | 来自The Cancer Genome Atlas的多组学数据和Genomics of Drug Sensitivity in Cancer数据库的转录组及药物反应数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2703 | 2024-12-12 |
Identification of early Alzheimer's disease subclass and signature genes based on PANoptosis genes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462003
PMID:39650656
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研究论文 | 本研究基于PANoptosis基因识别阿尔茨海默病(AD)的早期亚类和特征基因 | 本研究首次基于PANoptosis基因识别了AD的两个亚类,并预测了针对早期AD的治疗候选药物 | 本研究的样本量较小,且仅基于GEO数据库的数据进行分析,可能存在数据偏倚 | 识别阿尔茨海默病的不同分子亚型并探索潜在的治疗药物 | 阿尔茨海默病及其相关PANoptosis基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的三个数据集(GSE48350, GSE5281, GSE122063) | NA | NA | NA | NA |
| 2704 | 2024-12-11 |
Comprehensive Analysis of circRNA-Related mRNAs as Prognostic Factors in Non-Smoking Women with Lung Adenocarcinoma
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S490478
PMID:39650787
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研究论文 | 本文研究了circRNA相关的mRNA作为非吸烟女性肺腺癌的预后标志物 | 构建了circRNA-miRNA-mRNA网络,并基于相关mRNA创建了预后风险评分模型 | 样本量较小,仅16对肿瘤和癌旁组织样本 | 探讨circRNA相关的mRNA在非吸烟女性肺腺癌中的预后价值 | 非吸烟女性肺腺癌患者的肿瘤和癌旁组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 高通量测序、免疫组织化学 | NA | RNA | 16对肺腺癌组织及其对应的癌旁组织 | NA | NA | NA | NA |
| 2705 | 2024-12-12 |
Integrating multi-omics techniques and in vitro experiments reveals that GLRX3 regulates the immune microenvironment and promotes hepatocellular carcinoma cell proliferation and invasion through iron metabolism pathways
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1496886
PMID:39654899
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研究论文 | 本研究通过整合多组学技术和体外实验,揭示了GLRX3通过铁代谢途径调控免疫微环境并促进肝细胞癌细胞增殖和侵袭 | 首次系统分析了肝细胞癌肿瘤微环境中铁代谢的变化,并揭示了GLRX3在铁代谢调控中的关键作用及其对肿瘤细胞增殖和免疫逃逸的机制 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内实验验证 | 系统分析肝细胞癌肿瘤微环境中铁代谢的变化,并探讨铁代谢调控对肝癌患者生存的影响 | 肝细胞癌患者的单细胞测序数据以及GLRX3基因的表达和功能 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | 来自GEO数据库的肝细胞癌患者单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2706 | 2024-12-11 |
Cordycepin enhances the Anticancer efficacy of PD-L1 blockade by modulating the tumor microenvironment of colon cancer
2024-Dec-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.177089
PMID:39489279
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研究论文 | 研究评估了抗PD-L1抗体与虫草素联合治疗结肠癌的效果及其机制 | 首次探讨了虫草素通过调节肿瘤微环境增强PD-L1阻断的抗肿瘤效果 | NA | 评估抗PD-L1抗体与虫草素联合治疗结肠癌的疗效 | 结肠癌及其肿瘤微环境 | NA | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2707 | 2024-12-11 |
Leukemia inhibitory factor receptor inhibition by EC359 reduces atherosclerotic stenosis grade in Ldlr-/- mice
2024-Dec-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.177121
PMID:39528103
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研究论文 | 本研究探讨了白血病抑制因子(LIF)受体在动脉粥样硬化发展中的作用,并通过实验验证了LIF受体抑制剂EC359在减少动脉粥样硬化狭窄程度方面的潜力 | 首次深入研究了LIF及其受体在动脉粥样硬化中的作用,并证明了LIF受体抑制剂EC359在减少动脉粥样硬化斑块大小和降低胆固醇水平方面的效果 | 研究仅在Ldlr-/-小鼠模型中进行,结果的普遍性和在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探讨LIF受体信号在动脉粥样硬化发展中的作用,并评估LIF受体抑制剂EC359的疗效 | LIF受体在动脉粥样硬化中的作用及EC359对动脉粥样硬化的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 实验涉及30只Ldlr-/-小鼠,分为两组,每组15只 | NA | NA | NA | NA |
| 2708 | 2024-12-11 |
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear-cell renal-cell carcinoma tumor microenvironment
2024-Dec-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03435-z
PMID:39639369
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学研究了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中整合素和胶原蛋白IV的空间耦合,以更好地理解免疫治疗耐药性 | 本文首次使用细胞分辨率的空间转录组学技术,分析了免疫治疗前后ccRCC肿瘤微环境中的分子变化,并发现免疫治疗后肿瘤中胶原蛋白IV和整合素αV的表达显著增加 | 本文仅分析了21个肿瘤样本,样本量较小,且未探讨潜在的治疗策略 | 研究透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中免疫治疗耐药性的分子机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤及其微环境 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学 | NA | 空间分子图像 | 21个ccRCC肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2709 | 2024-12-11 |
Single-cell transcriptome analysis of the mouse lungs during the injury and recovery periods after lipopolysaccharide administration
2024-Dec, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01951-z
PMID:39377802
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了小鼠肺部在脂多糖处理后损伤和恢复期的细胞和分子变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脂多糖诱导的急性肺损伤(ALI)期间细胞间相互作用及Dpp4在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨急性肺损伤(ALI)期间细胞和分子变化,并寻找有效的治疗靶点 | 小鼠肺部在脂多糖处理后损伤和恢复期的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自损伤(第3天)和恢复(第6天)小鼠的肺泡组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2710 | 2024-12-11 |
Doxorubicin resistance involves modulation of interferon signaling, transcriptional bursting, and gene co-expression patterns of U-ISGF3-related genes
2024-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101071
PMID:39405604
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研究论文 | 研究了多柔比星(DOX)在人结肠癌细胞中诱导的转录组变化,揭示了与U-ISGF3相关基因的表达变化及其在化疗耐药中的潜在作用 | 首次揭示了U-ISGF3相关基因在多柔比星耐药中的作用,并发现HSH2D作为不良预后标志物在耐药细胞中的高表达 | 研究仅限于人结肠癌细胞,未探讨其他癌症类型中的适用性 | 探讨多柔比星诱导的化疗耐药机制及其潜在治疗靶点 | 人结肠癌细胞在亚毒性多柔比星处理后的转录组变化 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 转录组数据 | 人结肠癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2711 | 2024-12-11 |
Systematic analysis of human colorectal cancer scRNA-seq revealed limited pro-tumoral IL-17 production potential in gamma delta T cells
2024-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101072
PMID:39454432
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研究论文 | 本研究重新分析了九个已发表的人类结直肠癌全组织单细胞RNA测序数据集,揭示了γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的潜力有限 | 首次系统分析了人类结直肠癌中单细胞RNA测序数据,发现γδ T细胞在肿瘤微环境中主要表现为细胞毒性效应细胞,而非IL-17产生细胞 | 研究仅基于已发表的数据集,未进行新的实验验证 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的作用 | γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 165名结直肠癌患者的肿瘤和邻近正常组织中的951,785个细胞,其中18,483个为γδ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2712 | 2024-12-11 |
Elucidating tobacco smoke-induced craniofacial deformities: Biomarker and MAPK signaling dysregulation unraveled by cross-species multi-omics analysis
2024-Dec, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117343
PMID:39549573
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研究论文 | 本研究使用斑马鱼幼体模型,通过多组学分析揭示了烟草烟雾引起的颅面畸形与MAPK信号通路失调之间的关系 | 首次通过跨物种多组学分析揭示了烟草烟雾引起的颅面畸形相关的新型生物标志物和MAPK信号通路的失调 | 研究主要基于斑马鱼模型和人类胚胎腭间充质细胞,可能需要进一步的人体临床研究验证 | 揭示烟草烟雾引起的颅面畸形的发生机制,并寻找相关的生物标志物和信号通路 | 斑马鱼幼体和人类胚胎腭间充质细胞 | NA | NA | 多组学分析(mRNA-miRNA分析、单细胞转录组学、定量实时PCR) | NA | 基因、蛋白质、代谢物 | 斑马鱼幼体和人类胚胎腭间充质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2713 | 2024-12-11 |
Key Regulatory Elements of the TGFβ-LRRC15 Axis Predict Disease Progression and Immunotherapy Resistance Across Cancer Types
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.22.624939
PMID:39651139
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研究论文 | 本文研究了TGFβ-LRRC15轴的关键调控元件,揭示其在不同癌症类型中预测疾病进展和免疫治疗抵抗的潜力 | 本文通过结合功能性化合物筛选和单细胞RNA测序,揭示了调控TGFβ增加LRRC15表达的关键基因特征,并验证了这些基因在预测免疫治疗反应中的潜力 | 本文主要基于细胞模型进行验证,尚未在临床试验中验证其效果 | 揭示TGFβ-LRRC15轴的关键调控元件,并探索其在个性化免疫治疗中的应用 | TGFβ-LRRC15轴的关键调控基因及其在癌症进展和免疫治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | 基因表达数据 | 细胞模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2714 | 2024-12-11 |
An estrogen receptor signaling transcriptional program linked to immune evasion in human hormone receptor-positive breast cancer
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.23.619172
PMID:39651157
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研究论文 | 本文研究了雌激素受体信号传导程序与激素受体阳性乳腺癌中免疫逃避的关系 | 首次定义并研究了与雌激素受体信号传导(ERS)和免疫信号相关的基因模块,揭示了ERS与T细胞浸润减少的潜在机制 | 研究主要基于批量和单细胞转录组数据,缺乏功能验证实验 | 探讨雌激素受体信号传导在激素受体阳性乳腺癌中免疫逃避的机制 | 激素受体阳性乳腺癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序,多重免疫荧光 | NA | 转录组数据,免疫荧光图像 | 来自多个临床来源的乳腺癌组织和人类细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 2715 | 2024-12-11 |
Prenatal p25-activated Cdk5 induces pituitary tumorigenesis through MCM2 phosphorylation-mediated cell proliferation
2024-11, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101054
PMID:39366214
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研究论文 | 研究揭示了产前p25激活的Cdk5通过MCM2磷酸化介导的细胞增殖诱导垂体肿瘤发生 | 首次揭示了Cdk5和Mcm2在垂体腺瘤肿瘤发生中的新作用,并提供了一种新的中间叶来源的垂体腺瘤小鼠模型 | NA | 探讨Cdk5在垂体肿瘤发生中的作用及其机制 | Cdk5、Mcm2以及中间叶来源的垂体肿瘤 | NA | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型和293T细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 2716 | 2024-12-11 |
IgG autoantibodies in bullous pemphigoid directly induce a pathogenic MyD88-dependent pro-inflammatory response in keratinocytes
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.616103
PMID:39569141
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研究论文 | 研究探讨了天疱疮(BP)中的IgG自身抗体如何直接诱导角质形成细胞中的病理性MyD88依赖性促炎反应 | 首次揭示了BP-IgG自身抗体依赖的角质形成细胞反应在天疱疮病理中的作用,并证明了MyD88在BP-IgG诱导的炎症反应中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上,尚未完全阐明这些发现在人类中的直接应用 | 探讨天疱疮中IgG自身抗体对角质形成细胞的直接影响及其在疾病病理中的作用 | 天疱疮患者的IgG自身抗体、角质形成细胞、MyD88信号通路 | NA | 天疱疮 | 多重免疫分析、bulk RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括天疱疮患者和对照组的IgG处理过的原代角质形成细胞,以及患病和对照皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2717 | 2024-12-11 |
Graph-Regularized Non-Negative Matrix Factorization for Single-Cell Clustering in scRNA-Seq Data
2024-08, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3400050
PMID:38787664
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研究论文 | 本文提出了一种基于图正则化的非负矩阵分解方法(Sc-GNNMF),用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 创新点在于采用图正则化的非负矩阵分解算法(GNNMF),通过拉普拉斯核和p-最近邻图估计细胞间和基因间的稀疏相似性,并使用加权p-最近已知邻居优化单细胞RNA测序数据 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性,揭示细胞异质性的潜在机制 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图正则化非负矩阵分解(GNNMF) | 基因表达数据 | 11个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2718 | 2024-12-11 |
Holliday junction recognition protein (HJURP) could reflect the clinical outcomes of lung adenocarcinoma patients, and impact the choice of precision therapy
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1475511
PMID:39649097
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研究论文 | 本文研究了HJURP蛋白在肺腺癌患者中的表达及其对临床结果和精准治疗选择的影响 | 首次揭示了HJURP作为肺腺癌的可靠预后生物标志物,并探讨了其在精准治疗中的潜在作用 | 研究结果需要在更大规模的队列中进行验证 | 识别肺腺癌的可靠预后生物标志物和潜在治疗靶点,以改善患者预后 | HJURP蛋白在肺腺癌中的表达及其与临床结果、遗传改变、免疫细胞浸润和治疗反应的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共1507例肺腺癌患者(TCGA-LUAD: 453例,GSE31210: 226例,GSE68465: 442例,GSE72094: 386例) | NA | NA | NA | NA |
| 2719 | 2024-12-10 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in ophthalmology]
2024-Dec-11, [Zhonghua yan ke za zhi] Chinese journal of ophthalmology
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在眼科领域的最新进展 | 单细胞RNA测序技术提供了研究细胞间基因表达和功能特征差异的强大工具 | 本文未提及具体的局限性 | 提供关于眼科疾病发病机制的新见解,并改进诊断和治疗策略 | 眼科疾病的发病机制和诊断治疗策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2720 | 2024-12-10 |
AOPPs induces EMT and fibrosis by activating oxidative stress through ERK/p38 MAPK signaling pathway in endometriosis
2024-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100950
PMID:39241657
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研究论文 | 研究探讨了高级氧化蛋白产物(AOPPs)通过激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导子宫内膜异位症(EMs)中的上皮-间质转化(EMT)和纤维化的机制 | 首次揭示了AOPPs在EMs中通过氧化应激激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导EMT和纤维化的机制 | 研究主要基于临床样本、单细胞测序和体内外模型,缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨AOPPs在子宫内膜异位症中诱导EMT和纤维化的分子机制 | 子宫内膜异位症(EMs)中的上皮-间质转化(EMT)和纤维化 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 使用正常大鼠进行慢性给药研究 | NA | NA | NA | NA |