单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7848 篇文献，本页显示第 2661 - 2680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2661 | 2024-10-19 |
Gamma-aminobutyric acid-mediated neuro-immune interactions in glioblastoma: Implications for prognosis and immunotherapy response
2024-Nov-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123067
PMID:39322177
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研究论文 | 研究探讨了伽马氨基丁酸（GABA）在胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 引入了GABA相关评分模型（GABAAS），提供了新的预后指标，并揭示了GABA相关基因（如NDRG2和TIMP1）在免疫调节中的关键作用 | NA | 研究GABA在胶质母细胞瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的GABA及其相关基因 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、非负矩阵分解（NMF）、免疫组化（IHC）、免疫荧光（IF）、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2662 | 2024-10-19 |
High-Dimensional Overdispersed Generalized Factor Model With Application to Single-Cell Sequencing Data Analysis
2024-Nov-10, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.10213
PMID:39237124
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研究论文 | 本文提出了一种高维过度分散广义因子模型（OverGFM），用于处理高维非线性因子分析中的过度分散混合型数据 | 引入了一个额外的误差项来捕捉因子无法解释的过度分散，并提出了一种新的变分EM算法来解决计算挑战 | NA | 解决高维非线性因子模型在处理过度分散混合型数据时的不足 | 高维过度分散混合型数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 广义因子模型 | 混合型数据 | NA |
| 2663 | 2024-10-19 |
Integrated analysis of single-cell transcriptome and structural biology approach reveals the dynamics changes of NP subtypes and roles of Menaquinone in attenuating intervertebral disc degeneration
2024-Nov, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2023.2275172
PMID:37902557
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和结构生物学方法，揭示了椎间盘退变过程中NP亚型的动态变化及甲萘醌在缓解椎间盘退变中的作用 | 首次报道了甲萘醌在缓解退变性NP细胞中的重要作用，并结合scRNA-seq、bulk-RNA seq和HTVS技术系统解析了IDD过程中NP亚型的纵向变化 | NA | 研究椎间盘退变（IDD）过程中NP细胞的异质性及其动态变化，并探索潜在的治疗药物 | 椎间盘退变过程中的NP细胞亚型及甲萘醌的作用 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞测序分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、差异表达分析、高通量筛选（HTVS）、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | 5种NP亚群 |
| 2664 | 2024-10-19 |
The opposite aging effect to single cell transcriptome profile among cell subsets
2024-Nov, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-024-10138-2
PMID:39261411
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研究论文 | 本研究探讨了不同细胞亚群中单细胞转录组谱的相反衰老效应 | 首次报告了衰老在不同细胞亚群中对基因表达的相反效应，并强调了在干预衰老相关基因时考虑细胞亚群的重要性 | NA | 研究衰老对不同细胞亚群基因表达的影响 | 小鼠的单细胞RNA测序数据 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Tabula Muris Senis数据集，包含大量小鼠的单细胞RNA测序数据 |
| 2665 | 2024-09-27 |
Spatial transcriptomics of acute kidney injury
2024-Nov, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-024-00899-x
PMID:39322738
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2666 | 2024-10-19 |
MAPbrain: a multi-omics atlas of the primate brain
2024-Oct-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae911
PMID:39420633
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研究论文 | 介绍了MAPbrain，一个整合了灵长类大脑多组学数据的图谱平台 | MAPbrain整合并标准化了实验室和公开的多组学数据，提供了一个独特的、强大的、交互式的平台，用于全面探索大脑发育 | NA | 理解基因如何影响大脑发育，解码人类认知功能的形成和神经疾病的潜在机制 | 灵长类大脑的多组学数据 | 生物信息学 | NA | 多组学技术 | NA | 转录组学、表观基因组学和空间转录组学数据 | 2100万大脑细胞，来自38个关键脑区和436个子区域，涵盖胚胎和成年阶段，164个时间点 |
| 2667 | 2024-10-19 |
scTWAS Atlas: an integrative knowledgebase of single-cell transcriptome-wide association studies
2024-Oct-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae931
PMID:39420631
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研究论文 | 介绍了scTWAS Atlas，一个整合单细胞转录组全关联研究的全面数据库 | 提出了scTWAS Atlas，整合了文献整理和数据分析，提供了交互式知识图谱和跨细胞类型分析功能 | NA | 解决传统TWAS结果中细胞类型异质性的解释难题，并提供一个整合scTWAS数据的平台 | 单细胞转录组全关联研究的数据和基因-性状关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组全关联研究 | NA | 基因表达数据 | 2,765,211个关联，涵盖34个性状，30种细胞类型，9种细胞条件和16,470个基因 |
| 2668 | 2024-10-19 |
Employing single-cell RNA sequencing coupled with an array of bioinformatics approaches to ascertain the shared genetic characteristics between osteoporosis and obesity
2024-Oct-16, Bone & joint research
IF:4.7Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合多种生物信息学方法，探讨了骨质疏松症和肥胖之间的共享遗传特征 | 本研究首次揭示了Toll样受体2（TLR2）在连接骨质疏松症和肥胖中的关键作用，并提出TLR2作为治疗这两种疾病的潜在双重靶点 | 本研究主要依赖于公共数据库中的数据，未来需要更多的实验验证和临床数据来进一步确认结果 | 旨在识别骨质疏松症和肥胖之间的共享遗传标记和分子机制，以促进针对这两种疾病同时治疗的疗法开发 | 骨质疏松症和肥胖的共享遗传特征 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的数据集 |
| 2669 | 2024-10-19 |
Ccl5+ Macrophages drive pro-inflammatory responses and neutrophil recruitment in sepsis-associated acute kidney injury
2024-Oct-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113339
PMID:39418726
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研究论文 | 研究探讨了Ccl5+巨噬细胞在脓毒症相关急性肾损伤中的促炎反应和嗜中性粒细胞招募的作用 | 首次揭示了Ccl5+巨噬细胞在脓毒症中的促炎作用及其通过CCL5-CCR1配体受体对招募嗜中性粒细胞的影响 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 深入了解脓毒症相关急性肾损伤的分子机制 | Ccl5+巨噬细胞在脓毒症中的作用 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 小鼠模型 |
| 2670 | 2024-10-19 |
Putting proteins in context
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009
PMID:39418999
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研究论文 | 本文介绍了一种通过几何深度学习方法生成蛋白质上下文表示的新技术 | 引入了PINNACLE方法，通过结合蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组学分析，生成蛋白质的上下文表示 | NA | 解决现有蛋白质表示方法缺乏生物学和环境上下文的问题 | 蛋白质的细胞类型特异性功能和相互作用 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | NA | 蛋白质相互作用数据和单细胞转录组学数据 | NA |
| 2671 | 2024-10-19 |
Cancer-Associated Fibroblasts Expressing Sulfatase 1 Facilitate VEGFA-Dependent Microenvironmental Remodeling to Support Colorectal Cancer
2024-Oct-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3987
PMID:39250301
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研究论文 | 研究揭示了表达硫酸酯酶1（SULF1）的癌症相关成纤维细胞（CAF）在结直肠癌中的促肿瘤作用 | 首次发现SULF1+ CAF通过增强VEGFA的释放促进结直肠癌的微环境重塑和肿瘤进展 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要进一步的人体临床验证 | 探讨癌症相关成纤维细胞在结直肠癌中的分子机制及其治疗潜力 | 结直肠癌患者和表达SULF1的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及结直肠癌患者的单细胞测序数据和小鼠模型 |
| 2672 | 2024-10-19 |
YAP1 Status Defines Two Intrinsic Subtypes of LCNEC with Distinct Molecular Features and Therapeutic Vulnerabilities
2024-Oct-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0361
PMID:39150543
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研究论文 | 研究探讨了YAP1状态在大细胞神经内分泌癌（LCNEC）中的作用，定义了两种内在亚型，并分析了其分子特征和治疗脆弱性 | 首次通过YAP1状态区分LCNEC的两种亚型，并揭示了其独特的分子特征和治疗策略 | NA | 研究LCNEC的生物学特性，并探索基于YAP1状态的个性化治疗策略 | 大细胞神经内分泌癌（LCNEC）及其亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化（IHC）和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自LCNEC患者的核心针活检样本和临床前模型 |
| 2673 | 2024-10-19 |
TGF-β-mediated crosstalk between TIGIT+ Tregs and CD226+CD8+ T cells in the progression and remission of type 1 diabetes
2024-Oct-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53264-8
PMID:39406740
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研究论文 | 研究探讨了TGF-β介导的TIGIT+ Tregs与CD226+CD8+ T细胞在1型糖尿病进展和缓解中的相互作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了不同1型糖尿病阶段免疫细胞的动态变化，并发现TIGITCCR7 Tregs和CD226CCR7CD8细胞毒性T细胞在疾病进展和缓解中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体临床验证 | 探讨1型糖尿病进展和缓解过程中免疫细胞的相互作用及其潜在的治疗靶点 | TIGIT+ Tregs和CD226+CD8+ T细胞 | 免疫学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA | 涉及不同1型糖尿病阶段的多个患者样本 |
| 2674 | 2024-10-19 |
Comprehensive analysis of a necroptosis-associated diagnostic signature for myelodysplastic syndromes based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Oct-15, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-024-00335-x
PMID:39407301
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，全面分析了与坏死性凋亡相关的骨髓增生异常综合征诊断特征 | 开发了一种新的坏死性凋亡基因特征，用于早期区分和诊断骨髓增生异常综合征 | NA | 探讨坏死性凋亡在骨髓增生异常综合征中的作用和机制，并开发新的诊断特征 | 骨髓增生异常综合征患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 骨髓增生异常综合征患者和健康对照组 |
| 2675 | 2024-10-19 |
BRD4 inhibitor reduces exhaustion and blocks terminal differentiation in CAR-T cells by modulating BATF and EGR1
2024-Oct-15, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00667-w
PMID:39407311
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研究论文 | 研究探讨了BRD4抑制剂通过调节BATF和EGR1来减少CAR-T细胞的耗竭并阻止其终末分化 | 首次揭示了BRD4抑制剂通过下调BATF活性和表达以及上调EGR1活性和表达来减少CAR-T细胞的耗竭并阻止其终末分化 | 研究仅限于体外实验，未涉及临床试验 | 阐明BRD4抑制剂减少CAR-T细胞耗竭的机制 | CAR-T细胞和BRD4抑制剂 | 细胞治疗 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自白血病患者的耗竭T细胞 |
| 2676 | 2024-10-19 |
Pyroptosis-related genes features on prediction of the prognosis in liver cancer: An integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38438
PMID:39416843
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研究论文 | 本研究探讨了细胞焦亡相关基因（PRG）对肝癌（LC）预后的影响 | 构建了一个基于细胞焦亡的风险评分模型，用于预测肝癌患者的预后，并发现该模型在区分高风险和低风险患者方面具有显著效果 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，未涉及临床试验验证 | 探讨细胞焦亡相关基因对肝癌预后的影响，并构建预测模型 | 肝癌患者的预后和细胞焦亡相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | Lasso Cox回归 | RNA表达数据 | 421个样本（371个肿瘤样本和50个正常样本） |
| 2677 | 2024-10-19 |
Intratumoral STING agonist reverses immune evasion in PD-(L)1-refractory Merkel cell carcinoma: mechanistic insights from detailed biomarker analyses
2024-Oct-14, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009803
PMID:39401968
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研究论文 | 本文报道了一例抗PD-L1耐药的Merkel细胞癌患者在接受STING激动剂和抗PD-1抗体联合治疗后，实现了持久的客观缓解，并进行了详细的生物标志物分析 | 首次揭示了STING激动剂在Merkel细胞癌中通过肿瘤微环境中的免疫和基质细胞间接发挥作用，而不一定需要癌细胞表达STING | 研究仅基于单个病例，需要进一步的临床试验验证 | 探讨STING激动剂在PD-(L)1耐药的Merkel细胞癌中的作用机制 | 抗PD-L1耐药的Merkel细胞癌患者及其肿瘤微环境 | NA | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、30参数流式细胞术、T细胞受体测序、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据、免疫细胞数据、组织切片数据 | 1例患者，88例Merkel细胞癌肿瘤标本 |
| 2678 | 2024-10-19 |
Cell type and regulatory analysis in amphioxus illuminates evolutionary origin of the vertebrate head
2024-Oct-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52938-7
PMID:39402029
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学、信号通路扰动和顺式调控分析，揭示了文昌鱼中脊椎动物头部发育的进化起源 | 本研究首次在文昌鱼中识别出类似前脊索板、前迁移和迁移神经嵴细胞群，并通过跨物种转基因实验揭示了神经嵴和前脊索板发育程序在脊椎动物和文昌鱼中的调控环境相似性 | NA | 揭示脊椎动物头部发育的进化起源 | 文昌鱼中的细胞类型和发育信号通路 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2679 | 2024-10-19 |
Computational approach for decoding malaria drug targets from single-cell transcriptomics and finding potential drug molecule
2024-10-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-72427-7
PMID:39402081
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞转录组数据的计算方法，用于识别疟疾药物靶点并预测潜在的药物分子 | 本文创新性地结合了互信息特征选择算法和分类算法，从单细胞转录组数据中筛选出关键蛋白质，并通过蛋白质-蛋白质相互作用网络分析确定重要靶点，最终利用深度学习技术预测潜在药物分子 | 本文仅针对恶性疟原虫进行了研究，未涵盖其他疟原虫种类 | 旨在通过单细胞转录组数据识别疟疾药物靶点，并预测潜在的新药物分子 | 恶性疟原虫的单细胞转录组数据及其蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 机器学习 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 转录组数据 | 恶性疟原虫的有性和无性阶段样本 |
| 2680 | 2024-10-19 |
Sex-specific proximal tubular cell differentiation pathways identified by single-nucleus RNA sequencing
2024-10-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73102-7
PMID:39402239
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术，研究了小鼠肾脏近端小管细胞在不同年龄段的性别特异性分化途径 | 首次揭示了近端小管细胞在晚期时间点的性别特异性表达谱，并使用轨迹和RNA速度分析技术描绘了这些细胞的分化途径 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 探讨肾脏近端小管细胞在不同年龄段的性别特异性分化途径 | 小鼠肾脏近端小管细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 68,775个细胞核，来自16只小鼠 |