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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2661 | 2024-12-16 |
Single-cell transcriptomics of vomeronasal neuroepithelium reveals a differential endoplasmic reticulum environment amongst neuronal subtypes
2024-Dec-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98250
PMID:39670989
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析小鼠犁鼻器感觉上皮细胞,揭示了不同神经元亚型之间的内质网环境的差异 | 首次通过单细胞转录组学揭示了犁鼻器感觉上皮细胞中不同神经元亚型的内质网环境差异,并提供了可搜索的基因表达模式网络资源 | 研究仅限于小鼠犁鼻器感觉上皮细胞,未涉及其他物种或其他类型的细胞 | 探究犁鼻器感觉上皮细胞中的细胞类型、发育基因表达模式以及神经元之间的功能差异 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的神经元亚型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠犁鼻器感觉上皮细胞中的多个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2662 | 2024-12-16 |
CAR T cells secreting NGF-neutralizing scFv enhance efficacy in clear cell renal cell carcinoma by relieving immunosuppression through immunosympathectomy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009910
PMID:39653553
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研究论文 | 本研究探讨了通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv来缓解肾透明细胞癌免疫抑制微环境,从而增强CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 首次提出通过CAR T细胞分泌NGF中和scFv实现肿瘤免疫交感神经切除,从而减弱肿瘤微环境的免疫抑制 | 研究主要集中在肾透明细胞癌,其结果在其他类型肿瘤中的适用性尚不明确 | 探索通过免疫交感神经切除增强CAR T细胞在实体瘤中的疗效 | 肾透明细胞癌的免疫抑制微环境和CAR T细胞的抗肿瘤效果 | 免疫学 | 肾癌 | RNA测序 | CAR T细胞 | RNA | 多种癌症类型的基因集和肾透明细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2663 | 2024-12-16 |
Multiomics reveals tumor microenvironment remodeling in locally advanced gastric and gastroesophageal junction cancer following neoadjuvant immunotherapy and chemotherapy
2024-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010041
PMID:39653554
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了局部晚期胃癌和胃食管交界癌在接受新辅助免疫治疗和化疗后肿瘤微环境的动态变化 | 首次通过多组学分析揭示了新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的动态变化,并构建了一个预测主要病理反应的模型 | 样本量较小,仅基于一个临床试验的数据,可能限制了结果的普适性 | 探讨新辅助免疫化疗对局部晚期胃癌和胃食管交界癌肿瘤微环境的影响及其机制 | 局部晚期胃癌和胃食管交界癌患者在接受新辅助免疫化疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序、全转录组测序、多重免疫荧光和单细胞RNA测序 | 回归模型 | 基因组数据、转录组数据、免疫细胞数据 | 30名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2664 | 2024-12-16 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Pivotal Role of DOCK2 in Sjögren Disease
2024-Dec, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.11738
PMID:39382155
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了DOCK2在干燥综合征中的关键作用,并验证了DOCK2抑制剂在SjD小鼠模型中的治疗效果 | 首次揭示了DOCK2在CD8+ T细胞中的高表达与干燥综合征的关联,并验证了DOCK2抑制剂在缓解疾病症状中的有效性 | 研究仅在SjD小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证DOCK2抑制剂的疗效 | 解析干燥综合征唾液腺中的致病细胞群体及其免疫通路,并探索DOCK2作为潜在治疗靶点的可能性 | 干燥综合征小鼠模型的唾液腺免疫细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 干燥综合征小鼠模型的唾液腺免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2665 | 2024-12-16 |
Impact of Mitophagy-Related Genes on the Diagnosis and Development of Esophageal Squamous Cell Carcinoma via Single-Cell RNA-seq Analysis and Machine Learning Algorithms
2024-Nov-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2407.07052
PMID:39344350
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研究论文 | 研究探讨了自噬相关基因在食管鳞状细胞癌诊断和预后中的作用,通过单细胞RNA测序和机器学习算法构建预测模型 | 首次通过单细胞RNA测序和机器学习算法构建了基于自噬相关基因的食管鳞状细胞癌预测模型,并验证了PYCARD基因在其中的关键作用 | 研究主要基于基因数据和机器学习模型,未涉及临床试验验证 | 探讨自噬相关基因在食管鳞状细胞癌诊断和预后中的作用,提供新的治疗策略 | 食管鳞状细胞癌及其自噬相关基因 | 机器学习 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因数据 | 169个自噬相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 2666 | 2024-12-16 |
Single-cell RNA-seq Reveals the Inhibitory Effect of Methamphetamine on Liver Immunity with the Involvement of Dopamine Receptor D1
2024-Oct-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae060
PMID:39196711
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序探讨甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的影响及多巴胺受体D1的参与 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的抑制作用,并发现多巴胺受体D1在其中的调节作用 | 研究仅限于慢性甲基苯丙胺暴露模型,未探讨急性暴露的影响 | 探讨甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的影响及多巴胺受体D1的参与 | 肝脏免疫细胞及多巴胺受体D1 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肝脏免疫细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 2667 | 2024-12-16 |
A specialized population of monocyte-derived tracheal macrophages promote airway epithelial regeneration through a CCR2-dependent mechanism
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110169
PMID:38993668
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研究论文 | 本文研究了单核细胞衍生的气管巨噬细胞在气道上皮再生中的作用,并揭示了CCR2依赖的机制 | 首次揭示了单核细胞衍生的气管巨噬细胞在气道上皮再生中的作用及其CCR2依赖的招募和激活机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨单核细胞衍生的气管巨噬细胞在气道上皮再生中的作用及其机制 | 小鼠气管巨噬细胞及其在气道损伤后的再生作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2668 | 2024-12-16 |
Integration of Pan-Cancer Cell Line and Single-Cell Transcriptomic Profiles Enables Inference of Therapeutic Vulnerabilities in Heterogeneous Tumors
2024-06-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3005
PMID:38581448
|
研究论文 | 本文开发了一种名为scIDUC的计算框架,通过整合单细胞转录组数据和泛癌细胞系筛选数据,预测个体细胞的药物疗效 | 提出了scIDUC框架,能够高效地将单细胞转录组数据转化为个体细胞的药物反应预测,为异质性肿瘤的治疗提供了新工具 | 需要进一步验证该框架在更多疾病类型和更大样本量中的适用性和准确性 | 开发一种能够预测异质性肿瘤中个体细胞药物反应的计算工具 | 单细胞转录组数据和泛癌细胞系筛选数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及横纹肌肉瘤、胰腺导管腺癌和去势抵抗性前列腺癌三种不同疾病的细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 2669 | 2024-12-16 |
Charting the cellular landscape of pulmonary arterial hypertension through single-cell omics
2024-May-03, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02823-0
PMID:38702687
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术,特别是单细胞RNA测序(scRNAseq),如何增强我们对肺动脉高压(PAH)的理解 | scRNAseq提供了更精细的视角,详细描述了PAH中的细胞多样性,识别了独特的细胞亚群、基因网络和驱动疾病的分子通路 | 本文主要讨论了现有研究的结果,未涉及具体的实验数据或方法 | 探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用及其对疾病理解的影响 | 肺动脉高压(PAH)的细胞病理学 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 涉及人类、大鼠和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2670 | 2024-12-16 |
CXCR6-positive circulating mucosal-associated invariant T cells can identify patients with non-small cell lung cancer responding to anti-PD-1 immunotherapy
2024-May-03, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03046-3
PMID:38698468
|
研究论文 | 研究探讨了黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞)在非小细胞肺癌(NSCLC)中的免疫特征及其与抗PD-1免疫治疗疗效的相关性 | 首次揭示了CXCR6阳性CD8+MAIT细胞在预测NSCLC患者对PD-1免疫治疗反应中的潜在作用 | 研究样本量较小,需要进一步验证结果的普适性 | 探讨MAIT细胞在NSCLC中的免疫特征及其与免疫检查点抑制剂治疗疗效的相关性 | 非小细胞肺癌患者及其对PD-1免疫治疗的反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、多重免疫荧光检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、免疫荧光数据 | 转移性非小细胞肺癌患者的血液和肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2671 | 2024-12-16 |
Molecular mechanisms reconstruction from single-cell multi-omics data with HuMMuS
2024-05-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae143
PMID:38460192
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HuMMuS的新方法,用于从单细胞多组学数据中推断调控机制 | HuMMuS能够捕捉生物大分子之间的合作,并可以轻松包含额外的分子调控层,这是与现有技术的主要区别 | NA | 开发一种新方法来推断单细胞多组学数据中的调控机制 | 单细胞多组学数据中的调控机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 多组学数据 | 小鼠大脑皮层的snmC-seq、scATAC-seq和scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2672 | 2024-12-16 |
Analyzing scRNA-seq data by CCP-assisted UMAP and tSNE
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311791
PMID:39671349
|
研究论文 | 本文研究了如何通过CCP辅助的UMAP和tSNE方法分析scRNA-seq数据,以提高可视化和准确性 | 本文引入了CCP方法作为UMAP和tSNE的初始化工具,显著提高了这两种降维技术的可视化和准确性 | NA | 提高scRNA-seq数据分析的准确性和可视化效果 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 21个公开数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2673 | 2024-12-15 |
Dynamic changes in serum adenosine and the adenosine metabolism-based signature for prognosis in HER2-positive metastatic breast cancer patients
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39545
PMID:39669152
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研究论文 | 研究探讨了HER2阳性转移性乳腺癌患者中血清腺苷及其代谢相关标志物在预后中的作用 | 首次动态监测HER2阳性转移性乳腺癌患者的血清腺苷水平,并验证了其在曲妥珠单抗治疗中的预测价值 | 研究样本量较小,且仅限于HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 探索腺苷在HER2阳性转移性乳腺癌中的预后意义及其在曲妥珠单抗治疗中的预测作用 | HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | DESeq2 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 109名HER2阳性转移性乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2674 | 2024-12-15 |
Cancer specific up-regulated lactate genes associated with immunotherapy resistance in a pan-cancer analysis
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39491
PMID:39669156
|
研究论文 | 本文通过比较TCGA队列中的恶性组织和正常组织,定义了一个泛癌上调乳酸评分,并评估了其在非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤中的免疫治疗效果 | 首次识别出癌症内在的乳酸特征,并揭示了其与免疫检查点抑制剂抵抗的相关性 | 研究主要基于TCGA和CPTAC数据集,可能存在数据偏倚;验证性研究仅限于NSCLC队列 | 识别与免疫治疗抵抗相关的癌症特异性上调乳酸基因,并探讨其潜在机制 | 非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 转录组学和蛋白质组学数据 | 涉及TCGA、CPTAC以及内部NSCLC队列的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2675 | 2024-12-15 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Dec-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92091
PMID:39665620
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研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经元再生的化合物 | 利用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子 profiling,筛选并验证了两种促进体内神经发生的化合物 | 目前该过程的效率有限 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经元再生能力 | 小鼠Müller胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 | NA | NA | NA | NA |
| 2676 | 2024-12-15 |
Multiparameter imaging reveals clinically relevant cancer cell-stroma interaction dynamics in head and neck cancer
2024-Dec-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.046
PMID:39471809
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研究论文 | 本文报道了一种通过多参数成像量化头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中癌细胞与基质相互作用动态的方法 | 首次结合细胞状态标记与形态特征,以单细胞分辨率量化HNSCC的表型多样性,并揭示了部分上皮-间充质转化(pEMT)对疾病预后的影响 | NA | 研究癌细胞与基质相互作用对头颈部鳞状细胞癌表型多样性和临床特征的影响 | 头颈部鳞状细胞癌中的癌细胞与基质相互作用 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 多参数成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2677 | 2024-12-15 |
Cell type and dynamic state govern genetic regulation of gene expression in heterogeneous differentiating cultures
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100701
PMID:39626676
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研究论文 | 研究探讨了在异质性分化培养物中,细胞类型和动态状态如何调控基因表达的遗传机制 | 利用异质性分化培养物系统,研究了53个人类供体的单细胞RNA测序数据,揭示了与发育和疾病相关基因的新型调控变异 | 研究主要集中在体外系统,可能无法完全反映体内复杂的调控机制 | 探讨人类遗传变异在不同细胞环境中的分子效应,以理解与疾病相关位点的机制 | 异质性分化培养物中的细胞类型和发育阶段 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 53个人类供体的900,000多个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2678 | 2024-12-15 |
Itaconate Ameliorates Experimental Autoimmune Uveitis by Modulating Teff/Treg Cell Imbalance Via the DNAJA1/CDC45 Axis
2024-Dec-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.23
PMID:39661355
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研究论文 | 本研究探讨了衣康酸(ITA)对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)的影响及其潜在机制,并确定了潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了衣康酸通过调节DNAJA1/CDC45轴来改善Teff/Treg细胞失衡,从而减轻EAU的炎症反应 | 本研究主要基于动物模型,尚未在人体中验证其疗效和安全性 | 阐明衣康酸对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其潜在机制,并确定潜在的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)及其相关细胞和分子机制 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型和葡萄膜炎患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2679 | 2024-12-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals the CRTAC1+ population actively contributes to the pathogenesis of spinal ligament degeneration by SPP1+ macrophage
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14320
PMID:39158018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CRTAC1+细胞群通过SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的致病作用 | 首次揭示了CRTAC1+软骨细胞样细胞和SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的关键作用,并发现了ATF3作为调控CRTAC1软骨细胞样细胞致病性的关键转录因子 | 研究仅限于特定类型的韧带样本,未来需要进一步验证这些发现是否适用于其他类型的韧带或更广泛的退行性疾病 | 建立韧带组织的综合转录组图谱,识别韧带退行性变的治疗靶点 | 脊柱韧带退行性变中的细胞异质性和关键致病机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个退行性韧带和3个创伤性韧带样本,共32,014个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2680 | 2024-12-15 |
Single-cell transcriptomic atlas of taste papilla aging
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14308
PMID:39169434
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了味蕾衰老的分子和细胞特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了味蕾衰老过程中差异表达的基因及其功能,并识别了与衰老相关的转录枢纽 | 研究仅限于味蕾细胞,未涉及其他感官细胞或整体衰老机制 | 揭示味蕾衰老的分子和细胞特征 | 味蕾细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年和年轻味蕾细胞 | NA | NA | NA | NA |