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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-04-09 |
Dysfunctional β-cell longevity in diabetes relies on energy conservation and positive epistasis
2024-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402743
PMID:39313296
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研究论文 | 本文探讨了PFKFB3表达β细胞在2型糖尿病中的功能失调与长寿机制,揭示了其通过能量节约和正上位性相互作用来维持生存的机制 | 首次将PFKFB3表达β细胞与“失败者”细胞特征联系起来,并揭示了PFKFB3通过正上位性相互作用促进功能失调β细胞在糖尿病中长寿的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,人类样本数量可能不足,且机制验证主要在动物模型中进行 | 研究PFKFB3如何掩盖功能失调β细胞的竞争特性,并探索其在2型糖尿病中的作用机制 | 人类和小鼠的PFKFB3阳性β细胞,特别是2型糖尿病中的“失败者”β细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间转录组数据 | 来自nPOD的2型糖尿病胰腺样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 242 | 2026-04-09 |
Upregulation of multiple key molecules is correlated with poor prognosis and immune infiltrates in hepatocellular carcinoma by bulk and single-cell RNA-seq
2024-11-12, Aging
DOI:10.18632/aging.206151
PMID:39537209
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研究论文 | 本研究通过bulk和单细胞RNA-seq分析,构建了一个基于多个关键基因的肝细胞癌预后预测模型 | 结合三种R包进行差异分析以提高稳健性,并利用单细胞测序揭示关键基因在免疫细胞中的表达模式 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏外部验证队列,且未进行功能实验验证基因机制 | 构建肝细胞癌的预后预测模型并探索关键基因与免疫浸润的关系 | 肝细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肝癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO回归, Cox分析 | RNA表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 243 | 2026-04-09 |
Single-cell sequencing technology to characterize stem T-cell subpopulations in acute T-lymphoblastic leukemia and the role of stem T-cells in the disease process
2024-10-17, Aging
DOI:10.18632/aging.206123
PMID:39422621
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析前体T细胞急性淋巴细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病过程中的作用 | 通过单细胞测序识别Pre-T ALL中的关键免疫细胞亚群,特别是干细胞T细胞,并揭示其通过转录因子KLF2和FOS以及配体-受体对参与疾病发展的机制 | 数据来源于公共数据库,可能受样本来源和测序质量的限制,且未进行实验验证 | 探究Pre-T ALL中干细胞T细胞亚群的特征及其在疾病进展中的角色 | 前体T细胞急性淋巴细胞白血病患者的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | AUCell, Monocle, inferCNV, CellphoneDB | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 244 | 2026-04-09 |
Revealing a cancer-associated fibroblast-based risk signature for pancreatic adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA-seq analysis
2024-09-26, Aging
DOI:10.18632/aging.206043
PMID:39332020
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA-seq分析,揭示了胰腺腺癌中癌症相关成纤维细胞(CAF)的风险特征,并构建了一个七基因风险特征用于预测预后和免疫治疗反应 | 首次探索了基于CAF的风险特征在胰腺腺癌中的预后意义,并构建了一个结合年龄和CAF特征的列线图模型,用于准确预测患者预后和免疫治疗反应 | 研究依赖于公开数据库数据,可能受样本异质性和数据质量限制,且风险特征在临床验证前需进一步外部验证 | 探索癌症相关成纤维细胞(CAF)在胰腺腺癌中的预后价值,并构建预测模型 | 胰腺腺癌(PAAD)患者样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq),微阵列分析 | LASSO回归,Cox回归,列线图模型 | RNA-seq数据,微阵列数据 | 来自GSE155698(单细胞数据)、TCGA-PAAD队列和GEO数据库的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 245 | 2026-04-09 |
The cell rejuvenation atlas: leveraging network biology to identify master regulators of rejuvenation strategies
2024-09-09, Aging
DOI:10.18632/aging.206105
PMID:39264584
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SINGULAR的细胞年轻化图谱,通过单细胞RNA-seq和网络生物学方法,系统分析了多种年轻化策略在多个器官中的分子机制 | 首次构建了统一的细胞年轻化图谱,利用网络生物学在单细胞分辨率下比较不同年轻化策略,并识别出调控年轻化反应的关键主调节因子 | 未在摘要中明确提及具体限制,但可能涉及数据覆盖范围或实验验证的局限性 | 旨在揭示年轻化策略的分子机制,以设计更全面的细胞年轻化干预措施 | 多种年轻化策略(如热量限制和部分重编程)在多个器官中的细胞 | 网络生物学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 246 | 2026-04-09 |
A broken network of susceptibility genes in the monocytes of Crohn's disease patients
2024-09, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302394
PMID:38925865
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和两个独立的单细胞转录组数据集,探索了克罗恩病患者和健康对照中232个易感基因的表达网络 | 揭示了易感基因在人类肠道单核细胞中特异性严格表达,并首次在单细胞水平上展示了健康对照中易感基因网络的完整性及其在克罗恩病患者中的破坏 | 研究依赖于两个独立数据集,样本量可能有限,且未详细探讨环境因素如何具体影响基因网络 | 研究克罗恩病中大量易感基因的表达机制及其网络状态 | 克罗恩病患者和健康对照的肠道单核细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 两个独立数据集,具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 247 | 2026-04-09 |
Exploration of bacterial lipopolysaccharide-related genes signature based on T cells for predicting prognosis in colorectal cancer
2024-08-06, Aging
DOI:10.18632/aging.206041
PMID:39115879
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研究论文 | 本研究基于T细胞相关的细菌脂多糖基因特征,构建并验证了一个用于预测结直肠癌预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 首次整合单细胞RNA测序数据和毒理基因组数据库,筛选出与T细胞相关的细菌脂多糖基因,并构建了一个新的预后风险特征模型,用于预测结直肠癌患者的预后和免疫治疗反应 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且样本量有限,可能影响模型的泛化能力 | 探索细菌脂多糖相关基因与T细胞的关系,以开发新的生物标志物来预测结直肠癌的预后和免疫治疗反应 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 预后风险特征模型 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA-COAD队列和GSE39582队列的结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 248 | 2026-04-09 |
Integrating single-cell RNA-seq to identify fibroblast-based molecular subtypes for predicting prognosis and therapeutic response in bladder cancer
2024-07-18, Aging
DOI:10.18632/aging.206021
PMID:39033778
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,识别基于成纤维细胞的分子亚型,以预测膀胱癌患者的预后和治疗反应 | 建立了一个基于成纤维细胞标记基因的新型预后特征,用于预测膀胱癌患者的生存和免疫治疗反应 | NA | 预测膀胱癌患者的预后和治疗反应 | 膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 249 | 2026-04-09 |
Inflammatory risk contributes to post-COVID endothelial dysfunction through anti-ACKR1 autoantibody
2024-07, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402598
PMID:38740432
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19康复者体内抗ACKR1自身抗体与血管功能障碍的关联及其机制 | 首次揭示了COVID-19后抗ACKR1自身抗体与内皮功能障碍的关联,并发现其通过抗体依赖性细胞毒性机制而非直接细胞毒性作用,同时识别了ACKR1的N端胞外域关键表位 | 研究主要基于观察性队列和体外实验,需要进一步在体实验验证;样本来源和规模可能限制普遍性结论 | 探究COVID-19后持续炎症状态下自身抗体导致血管功能障碍的机制 | COVID-19康复者、小鼠组织内皮细胞、人静脉内皮细胞、患者外周血单个核细胞 | NA | COVID-19后遗症、血管疾病 | 单细胞转录组测序、抗体纯化、细胞毒性实验、蛋白质重组技术 | NA | 转录组数据、临床数据、体外实验数据 | 健康COVID-19康复者队列(具体数量未明确)、独立随访队列(中位随访6.7年)、小鼠多种组织内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 250 | 2026-04-09 |
Frataxin deficiency shifts metabolism to promote reactive microglia via glucose catabolism
2024-07, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402609
PMID:38631900
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研究论文 | 本研究探讨了弗里德赖希共济失调(FRDA)中frataxin(FXN)缺乏如何通过葡萄糖分解代谢促进反应性小胶质细胞,并揭示了丁酸盐通过调节免疫代谢途径改善神经功能的潜力 | 首次在单细胞水平上揭示了FXN缺乏导致小胶质细胞稳态丧失并转向糖酵解和衣康酸生成,并发现丁酸盐通过衣康酸-Nrf2-GSH通路和Hcar2介导恢复小胶质细胞稳态 | 研究基于小鼠模型,结果在人类FRDA患者中的适用性需进一步验证 | 探究FRDA中FXN缺乏对小胶质细胞免疫代谢的影响及丁酸盐的治疗潜力 | FRDA小鼠模型的小脑组织和小胶质细胞 | 免疫代谢学 | 弗里德赖希共济失调 | 单细胞RNA测序,代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,代谢组学数据 | FRDA小鼠模型的小脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2026-04-09 |
Unfolding the mysteries of heterogeneity from a high-resolution perspective: integration analysis of single-cell multi-omics and spatial omics revealed functionally heterogeneous cancer cells in ccRCC
2024-06-26, Aging
DOI:10.18632/aging.205974
PMID:38944814
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞多组学和空间组学数据,揭示了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中功能异质性癌细胞的分类、空间分布及其临床意义 | 首次结合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组测序,从多组学和空间维度系统解析ccRCC的肿瘤内异质性,并识别出调控功能异质性癌细胞的关键转录因子 | 未明确说明样本数量及具体测序平台细节,可能限制了结果的普适性和技术可重复性 | 阐明透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤内异质性的分子机制及其在癌症转移、复发和治疗抵抗中的作用 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤组织 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq),空间转录组测序(stRNA-seq),批量RNA测序(RNA-seq) | 一致性非负矩阵分解(cNMF)算法 | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2026-04-09 |
A human neural crest model reveals the developmental impact of neuroblastoma-associated chromosomal aberrations
2024-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47945-7
PMID:38702304
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研究论文 | 本研究利用人类胚胎干细胞分化模型,结合单细胞转录组和表观组分析,探索了神经母细胞瘤中染色体17q/1q增益对神经嵴细胞发育的影响 | 首次建立了人类神经嵴模型,系统评估了神经母细胞瘤相关染色体畸变在发育过程中的作用,揭示了拷贝数变异与MYCN过表达协同促进肿瘤发生的机制 | 模型基于体外分化系统,可能无法完全模拟体内肿瘤发生的复杂微环境 | 探究胚胎肿瘤中拷贝数变异如何影响发育过程并驱动肿瘤发生 | 人类胚胎干细胞分化的神经嵴细胞及其交感肾上腺衍生物 | 发育生物学与肿瘤学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序,单细胞表观组分析 | 人类胚胎干细胞分化模型 | 单细胞转录组数据,表观组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞表观组学 | NA | NA |
| 253 | 2026-04-09 |
Single-cell multi-ome regression models identify functional and disease-associated enhancers and enable chromatin potential analysis
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01689-8
PMID:38514783
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCARlink的单细胞多组学回归模型,用于预测基因表达并识别功能性和疾病相关的增强子 | 开发了基于正则化泊松回归的基因级调控模型,避免了传统基因-峰相关性分析的局限性,并支持染色质潜力分析 | 未明确提及具体样本量或实验验证的局限性 | 构建单细胞多组学回归模型以识别增强子与靶基因的关联并分析染色质潜力 | 单细胞多组学测序数据(scRNA-seq和scATAC-seq) | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 正则化泊松回归模型 | 单细胞多组学测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 254 | 2026-04-08 |
A multidimensional analysis reveals distinct immune phenotypes and the composition of immune aggregates in pediatric acute myeloid leukemia
2024-Jul-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.03.03.23286485
PMID:37961528
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研究论文 | 本研究通过多维分析揭示了儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的组成、表型和空间结构,特别是免疫浸润特征和T/B细胞聚集体的细胞构成 | 首次在儿童AML中发现约三分之一病例存在免疫浸润的骨髓微环境,并识别出大型T细胞网络及富含T/B细胞的免疫聚集热点 | 研究样本量有限,且主要基于观察性分析,未深入验证免疫聚集体的功能机制 | 解析儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的组成与空间结构,为免疫治疗提供新见解 | 儿童急性髓系白血病患者及非白血病对照的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、免疫表型数据 | 儿童AML病例及非白血病对照(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 255 | 2026-04-08 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2024-01-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44210-1
PMID:38191471
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了前列腺癌进展中肿瘤微环境内间充质细胞的分子变化及其关键作用 | 首次通过跨物种(小鼠模型与人类肿瘤)单细胞分析,系统鉴定了八个保守的间充质细胞亚群,并发现骨转移相关基质特征,提出了超越Gleason评分的新型预后基因标志物 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类样本验证相对有限;未深入探讨间充质细胞与其他肿瘤微环境成分的动态互作机制 | 解析前列腺癌进展过程中肿瘤基质细胞的分子特征与功能作用 | 前列腺癌肿瘤微环境中的间充质细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四种基因工程小鼠模型及对应人类肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-04-07 |
Application of Spatial Transcriptomics in Digestive System Tumors
2024-12-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15010021
PMID:39858416
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用,包括其在探索肿瘤空间结构、异质性、肿瘤微环境及细胞间相互作用方面的作用,以及在诊断、预后和治疗中的潜力 | 强调了空间转录组学与单细胞RNA测序、人工智能和机器学习相结合在消化系统肿瘤研究中的重要性 | NA | 总结空间转录组学在消化系统肿瘤研究中的最新进展、应用前景和技术挑战 | 消化系统肿瘤 | 数字病理学 | 消化系统肿瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 257 | 2026-04-07 |
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08105-5
PMID:39506125
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,分析了免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者的心脏、肿瘤和血液中的免疫反应 | 首次在irMyocarditis患者中同时分析心脏、肿瘤和血液的免疫反应,揭示了心脏扩增的T细胞克隆与肿瘤组织中的T细胞克隆重叠度低,并发现血液中循环CD8 T细胞存在心脏扩增TCR与致命病例相关 | 样本量相对有限(28例患者),且未明确心脏自身抗原的具体靶点 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系 | 免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者的心脏组织、肿瘤组织和血液样本 | 单细胞组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,显微镜技术,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据,显微图像,蛋白质数据 | 28名irMyocarditis患者和41名未受影响个体的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2026-04-07 |
Polyclonal-to-monoclonal transition in colorectal precancerous evolution
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08133-1
PMID:39478225
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研究论文 | 本研究利用碱基编辑器启用的DNA条形码系统,在小鼠肠道肿瘤发生模型中绘制单细胞谱系图,揭示了结直肠癌前病变的多克隆起源和向单克隆的转变过程 | 首次在体内模型中系统性地描绘了结直肠癌前病变的单细胞进化谱系,并提出了多克隆向单克隆转变的模型 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究结直肠癌前病变的起源和进化机制 | 小鼠肠道组织(正常、炎症和肿瘤)以及人类散发性结直肠息肉 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 碱基编辑器启用的DNA条形码系统、单细胞RNA测序、bulk全外显子组测序、单腺体全基因组测序 | NA | 单细胞谱系数据、基因组数据、转录组数据 | 260,922个单细胞来自小鼠正常、炎症和肿瘤肠道组织 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2026-04-07 |
Preparation of Frozen Non-Human Primate Fetal Islets for Combined Single Nuclei RNA-Sequencing and ATAC-Sequencing, and Bulk Metabolomics
2024-11-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66849
PMID:39584693
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研究论文 | 本研究提出了一种方法,用于从冷冻非人灵长类胎儿胰岛组织中同时进行单核RNA测序、ATAC测序和批量代谢组学分析 | 开发了一种整合单核RNA测序、ATAC测序和批量代谢组学的多组学方法,适用于稀缺样本,并避免了批次效应 | 方法依赖于冷冻组织,可能不适用于新鲜样本,且具体应用限于非人灵长类胎儿胰岛 | 研究代谢在通过表观遗传修饰建立细胞身份中的作用,并开发多组学技术以分析稀缺样本 | 非人灵长类胎儿胰岛组织 | 单细胞多组学 | NA | 单核RNA测序, ATAC测序, 毛细管电泳-质谱 | NA | RNA序列数据, ATAC序列数据, 代谢物数据 | 跨越两年收集的冷冻非人灵长类胎儿胰岛样本 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 批量代谢组学 | NA | NA |
| 260 | 2026-04-07 |
Gene regulatory mechanisms of T cell exhaustion in diffuse large B cell lymphoma based on single-cell transcriptome data
2024-11, Leukemia research
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.leukres.2024.107588
PMID:39307100
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研究论文 | 本研究利用公共单细胞转录组数据,全面分析了弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中T细胞耗竭的基因调控机制 | 首次在DLBCL中基于单细胞转录组数据系统识别了耗竭T细胞的亚型、基因表达特征及关键基因ID3的上调,并构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络以揭示核心调控蛋白 | 研究依赖于公共数据,未进行独立实验验证;样本量有限,可能影响结果的普适性;未深入探讨ID3基因的具体功能机制 | 探究DLBCL中T细胞耗竭的分子机制,以寻找新的治疗靶点 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者及正常扁桃体组织中的T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 未明确具体样本数量,但使用了公共单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |