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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2561 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq in diabetic foot ulcer wound healing
2024 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.13218
PMID:39264020
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索糖尿病足溃疡创面愈合的分子机制 | 首次在单细胞水平系统研究糖尿病足溃疡创面愈合过程中的细胞亚群、基因和分子特征 | NA | 深入理解糖尿病足溃疡创面愈合机制并识别潜在治疗靶点 | 糖尿病足溃疡慢性创面相关细胞 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2562 | 2025-10-07 |
Intestinal Stromal Cells in the Turmoil of Inflammation and Defective Connective Tissue Remodeling in Inflammatory Bowel Disease
2024-09-03, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izae066
PMID:38581412
|
综述 | 本文综述了肠道基质细胞在炎症性肠病中对炎症反应和细胞外基质重塑的调控作用 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示了基质细胞表型复杂性及空间功能分区,为靶向治疗提供新视角 | 当前IBD治疗主要针对炎症过程,对纤维狭窄或瘘管性疾病疗效有限 | 探讨肠道基质细胞在IBD发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 肠道上皮下肌成纤维细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2563 | 2025-10-07 |
Interleukin 13 Promotes Maturation and Proliferation in Metaplastic Gastroids
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101366
PMID:38815928
|
研究论文 | 本研究建立Meta1胃类器官模型,探究IL-13通过STAT6信号通路促进SPEM细胞成熟与增殖的机制 | 首次建立可稳定传代的SPEM细胞体外类器官模型,揭示IL-13/STAT6轴在胃黏膜化生中的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明IL-13对SPEM细胞成熟和增殖的分子机制 | 小鼠胃类器官(正常和化生型)、人类化生胃类器官、ILC2细胞 | 细胞生物学 | 胃黏膜化生 | 单细胞RNA测序、细胞分选、三维共培养、气液界面培养、STAT6抑制实验 | 类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质磷酸化数据 | Mist1-Kras转基因小鼠和IL-13-tdTomato报告基因小鼠的胃组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2564 | 2025-10-07 |
Multi-omics analyses and machine learning prediction of oviductal responses in the presence of gametes and embryos
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598905
PMID:38915688
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研究论文 | 通过多组学分析和机器学习预测输卵管对配子和胚胎存在的响应机制 | 开发了基于transformer的机器学习模型整合转录组和蛋白质组数据,首次系统揭示输卵管对配子和胚胎的时空特异性响应 | 小鼠模型与人类输卵管炎症反应存在部分差异,样本采集时间点有限 | 阐明输卵管与配子/胚胎之间的适应性相互作用机制 | 小鼠输卵管组织及输卵管液样本 | 机器学习 | 生殖系统疾病 | RNA-seq, scRNA-seq, 蛋白质组学 | transformer | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 小鼠输卵管组织在不同交配后时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2565 | 2025-10-07 |
Type I interferon signaling pathway enhances immune-checkpoint inhibition in KRAS mutant lung tumors
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2402913121
PMID:39186651
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现KRAS突变肺肿瘤中I型干扰素通路受损,恢复该通路可增强免疫检查点抑制疗效 | 首次揭示KRAS突变肺肿瘤中I型干扰素通路受损是贯穿肿瘤发展的关键特征,证明恢复该通路可使免疫冷肿瘤转化为热肿瘤 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索KRAS突变肺肿瘤早期发展阶段的功能性改变及其对免疫治疗的影响 | 表达KRAS致癌基因的小鼠肺泡II型细胞及携带p53或LKB1突变的小鼠和人类晚期肿瘤 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2566 | 2025-10-07 |
cfDiffusion: diffusion-based efficient generation of high quality scRNA-seq data with classifier-free guidance
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf071
PMID:39987461
|
研究论文 | 提出基于扩散模型的高质量单细胞RNA测序数据生成方法cfDiffusion | 结合无分类器引导和高级特征缓存机制,显著降低训练成本并提高多属性单细胞数据生成效率 | 推理时间仍长于scDiffusion方法 | 解决单细胞RNA测序数据模拟中的质量和效率问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2567 | 2025-10-07 |
Characterization of an orthotopic mouse transplant model reveals early changes in the tumor microenvironment of lung cancer
2024-Nov, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:39044458
|
研究论文 | 本研究通过建立原位移植小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术揭示了肺癌早期肿瘤微环境的细胞和分子变化 | 首次在携带Kras G12C突变的Lewis肺癌原位移植模型中,通过检测突变Kras转录本识别肿瘤细胞,并系统揭示了早期肿瘤微环境中成纤维细胞、髓系细胞和T/NK细胞的表型变化 | 研究基于小鼠移植模型,可能无法完全模拟人类肺癌的自然发生过程 | 探究肺癌早期阶段的细胞和分子动态变化 | Lewis肺癌细胞系(LLC)和原位移植小鼠模型 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2568 | 2025-10-07 |
POSTN+ cancer-associated fibroblasts determine the efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024-Jul-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008721
PMID:39067872
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据、空间转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌免疫治疗抵抗中的关键作用 | 首次系统鉴定POSTN+ CAF亚群在肝癌免疫治疗中的屏障作用,并阐明其通过IL-6/STAT3信号通路招募SPP1+巨噬细胞形成免疫抑制微空间的机制 | 研究基于六个数据集的220个样本,样本来源和数量可能存在局限性 | 探究肝细胞癌免疫治疗抵抗机制,特别关注癌症相关成纤维细胞亚群的作用 | 肝细胞癌患者肿瘤微环境中的细胞组成和相互作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 220个样本来自六个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2569 | 2025-10-07 |
The rise of single-cell transcriptomics in yeast
2024-04, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3934
PMID:38403881
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在酵母研究中的应用现状与发展前景 | 系统总结了酵母单细胞RNA测序技术面临的独特技术挑战及解决方案 | NA | 探讨单细胞转录组技术在酵母研究中的技术发展和应用潜力 | 酵母单细胞转录组学研究 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2570 | 2025-10-07 |
scMGATGRN: a multiview graph attention network-based method for inferring gene regulatory networks from single-cell transcriptomic data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae526
PMID:39417321
|
研究论文 | 提出基于多视图图注意力网络的scMGATGRN方法,用于从单细胞转录组数据推断基因调控网络 | 首次将多视图图注意力网络应用于基因调控网络推断,能够同时利用局部特征信息和高阶邻居特征信息 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性 | 开发更准确的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图注意力网络(GAT), 多视图注意力机制 | 单细胞转录组数据 | 7个基准单细胞RNA测序数据集,来自5个细胞系(2个人类,3个小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2571 | 2025-10-07 |
Identification of microenvironment features associated with primary resistance to anti-PD-1/PD-L1 + antiangiogenesis in gastric cancer through spatial transcriptomics and plasma proteomics
2024-Sep-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02092-x
PMID:39272096
|
研究论文 | 通过空间转录组学和血浆蛋白质组学分析胃癌对抗PD-1/PD-L1+抗血管生成联合疗法原发性耐药的肿瘤微环境特征 | 首次结合空间转录组学和血浆蛋白质组学系统分析胃癌联合治疗耐药机制,发现M2巨噬细胞浸润和S100A10过表达的关键作用 | 研究样本仅限REGOMUNE II期临床试验的 Caucasian 患者群体,样本代表性有限 | 探究胃癌患者对抗PD-1/PD-L1+抗血管生成联合疗法原发性耐药的分子机制 | 晚期胃癌患者 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学, 血浆蛋白质组学, 生物标志物分析 | NA | 空间转录组数据, 血浆蛋白质数据, 临床数据 | REGOMUNE II期临床试验患者群体 | NA | 空间转录组学, 血浆蛋白质组学 | NA | NA |
| 2572 | 2025-10-07 |
SFXN1-mediated immune cell infiltration and tumorigenesis in lung adenocarcinoma: A potential therapeutic target
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111918
PMID:38537539
|
研究论文 | 本研究探讨了SFXN1在肺腺癌中的功能作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示SFXN1通过调节ERK磷酸化和CCL20表达影响免疫细胞浸润的分子机制 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库,需要更多临床样本验证 | 研究SFXN1在肺腺癌进展中的功能意义并评估其治疗靶点潜力 | 肺腺癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的RNA-seq和scRNA-seq数据 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, Western blot, IHC | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2573 | 2025-10-07 |
Integrated scRNAseq analyses of mouse cochlear supporting cells reveal the involvement of Ezh2 in hair cell regeneration
2024-Jan-28, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09173-y
PMID:38281217
|
研究论文 | 通过整合分析小鼠耳蜗支持细胞的单细胞RNA测序数据,揭示Ezh2在毛细胞再生中的潜在作用 | 首次通过整合多个发育时间点的单细胞RNA测序数据,识别出与发育阶段相关的共表达基因,并发现Ezh2和KLF15可能是关键转录调控因子 | 研究主要基于公共数据库的测序数据,需要进一步实验验证Ezh2的具体调控机制 | 探索小鼠耳蜗毛细胞再生能力的分子基础 | 小鼠耳蜗前感觉细胞和支持细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损伤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠耳蜗组织从胚胎期14天到出生后33天的多个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2574 | 2025-10-07 |
Ectopic expression of NKG7 enhances CAR-T function and improves the therapeutic efficacy in liquid and solid tumors
2024-Dec, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107506
PMID:39551173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现NKG7过表达可增强CAR-T细胞功能并提高对液体和实体瘤的治疗效果 | 首次利用临床样本单细胞测序数据发现NKG7可作为增强CAR-T细胞功能的靶点,并验证其在多种消化系统癌症模型中的治疗效果 | 研究样本量有限(19例单细胞测序数据),且缺乏治疗后活检样本验证 | 探索增强CAR-T细胞功能的策略并提高其抗肿瘤疗效 | 消化系统癌症患者肿瘤浸润T细胞及B7H3阳性消化系统癌细胞系 | 单细胞测序分析 | 消化系统癌症 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞模型 | 单细胞RNA测序数据 | 19例消化系统癌症临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2575 | 2025-10-07 |
Gas6-Axl signal promotes indoor VOCs exposure-induced pulmonary fibrosis via pulmonary microvascular endothelial cells-fibroblasts cross-talk
2024-08-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.134786
PMID:38824778
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研究论文 | 本研究通过建立室内VOCs暴露小鼠模型,揭示了Gas6-Axl信号通过肺微血管内皮细胞与成纤维细胞相互作用促进肺纤维化的新机制 | 首次发现室内VOCs暴露通过诱导肺微血管内皮细胞PANoptosis表型分泌Gas6,激活成纤维细胞Axl受体促进肺纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证 | 阐明室内挥发性有机化合物暴露诱导肺纤维化的分子机制 | 小鼠模型、肺微血管内皮细胞、肺成纤维细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | VOCs暴露小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2576 | 2025-10-07 |
Systemic immune profiling analysis identifying M2-TAM related genes predicted colon cancer prognosis and chemotherapy responses
2024-Dec-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000040979
PMID:39969348
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研究论文 | 本研究通过系统免疫分析鉴定M2-TAM相关基因,用于预测结肠癌预后和化疗反应 | 开发了新的M2样巨噬细胞标记基因,建立了基于7个基因的M2-TAM风险模型,并通过孟德尔随机化验证了免疫检查点与结肠癌的因果关系 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索与M2样巨噬细胞相关的新生物标志物,用于结肠癌预后预测和治疗反应评估 | 结肠癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,LASSO回归,Cox回归,孟德尔随机化 | 风险预测模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结肠癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2577 | 2025-10-07 |
Genetic inference and single cell expression analysis of potential targets in heart failure and breast cancer
2024-Oct-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06010-y
PMID:39460820
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研究论文 | 通过遗传推断和单细胞表达分析探索心力衰竭与乳腺癌的潜在遗传靶点 | 整合全基因组关联研究、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,首次系统揭示ITM2B基因在乳腺癌中的功能作用 | 研究样本量未明确说明,体外实验仅针对MCF7细胞系,缺乏体内验证 | 探索心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点并验证其因果关系 | 心力衰竭和乳腺癌相关的遗传变异及ITM2B基因 | 生物信息学 | 乳腺癌,心血管疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫荧光 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2578 | 2025-10-07 |
Astrocytes Modulate a Specific Paraventricular Thalamus→Prefrontal Cortex Projection to Enhance Consciousness Recovery from Anesthesia
2024-Aug-21, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1808-23.2024
PMID:38926088
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研究论文 | 本研究揭示了星形胶质细胞通过调控丘脑室旁核→前额叶皮层特定神经通路促进七氟醚麻醉后意识恢复的新机制 | 首次发现星形胶质细胞Kir4.1通道在麻醉恢复中的关键作用,并鉴定出丘脑室旁核中两种不同的谷氨酸能神经元亚型 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未验证在雌性动物中的适用性;机制研究主要集中于PVT-mPFC通路 | 探索星形胶质细胞在麻醉后意识恢复中的调控机制 | 雄性小鼠的丘脑室旁核星形胶质细胞和谷氨酸能神经元 | 神经科学 | 麻醉相关意识障碍 | 单细胞RNA测序,电生理记录,膜片钳技术 | 动物模型 | 基因表达数据,电生理数据 | 雄性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2579 | 2025-10-07 |
Pharmacological suppression of the OTUD4/CD73 proteolytic axis revives antitumor immunity against immune-suppressive breast cancers
2024-Mar-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176390
PMID:38530357
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现OTUD4/CD73蛋白水解轴是治疗免疫抑制性三阴性乳腺癌的潜在靶点,并开发了特异性抑制剂ST80 | 首次揭示OTUD4通过去泛素化稳定CD73的机制,开发了特异性抑制剂ST80,并证明其能增强抗PD-L1疗法的效果 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行人体临床试验 | 开发针对免疫抑制性乳腺癌的新型免疫治疗策略 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 多组学分析,空间转录组学,实验验证 | NA | 多组学数据,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2580 | 2025-10-07 |
[Microglia differential genes and their functions in paraquat-induced Parkinson's disease-like in mice's brains based on single-cell RNA sequencing]
2024-Apr-20, Zhonghua lao dong wei sheng zhi ye bing za zhi = Zhonghua laodong weisheng zhiyebing zazhi = Chinese journal of industrial hygiene and occupational diseases
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序分析百草枯诱导帕金森病样小鼠脑内小胶质细胞亚群的差异基因及相关信号通路 | 首次在百草枯诱导的帕金森病样小鼠模型中通过单细胞RNA测鉴定了小胶质细胞亚群,并发现其向M2表型极化的新机制 | 样本量较小(每组3只小鼠),且仅在细胞系中验证了部分基因表达 | 阐明百草枯诱导帕金森病样脑部变化的机制 | C57BL/6小鼠和小鼠小胶质细胞(BV2细胞) | 单细胞测序分析 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,实时荧光定量PCR,生物信息学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 6只6周龄雄性C57BL/6小鼠(对照组和实验组各3只),BV2细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |