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当前共找到 7465 篇文献，本页显示第 2541 - 2560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2541 | 2025-01-05 |
Identifying the NEAT1/miR-26b-5p/S100A2 axis as a regulator in Parkinson's disease based on the ferroptosis-related genes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0316179
PMID:39739972
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，识别了与帕金森病（PD）相关的铁死亡相关基因（FRGs），并构建了竞争性内源RNA（ceRNA）网络，以评估PD的发病机制 | 首次识别了NEAT1/miR-26b-5p/S100A2轴作为PD中铁死亡的调控机制，并构建了基于FRGs的诊断模型 | 研究样本量较小，且主要依赖于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 评估帕金森病的发病机制，特别是与铁死亡相关的基因调控网络 | 帕金森病患者的中脑黑质样本 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因集富集分析（GSEA）、一致性聚类分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习算法、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 97个中脑黑质样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2542 | 2025-01-05 |
Unraveling Alzheimer's disease: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomic
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1515981
PMID:39741706
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综述 | 本文综述了单细胞测序和空间转录组学在阿尔茨海默病研究中的最新进展 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示了阿尔茨海默病的细胞异质性和神经免疫机制，发现了与疾病相关的小胶质细胞亚群和基因表达变化 | 需要进一步整合其他组学数据以实现对阿尔茨海默病的全面理解 | 理解复杂的细胞相互作用，以识别新的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病的细胞异质性和神经免疫机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2543 | 2025-01-05 |
Single-Cell and Transcriptome Analysis of Periodontitis: Molecular Subtypes and Biomarkers Linked to Mitochondrial Dysfunction and Immunity
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S498739
PMID:39741754
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组数据分析，揭示了牙周炎中免疫反应与线粒体功能障碍之间的相互作用，并识别了新的分子亚型和生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序和转录组数据分析，识别了牙周炎的四种分子亚型，并发现了与线粒体功能障碍和免疫反应相关的生物标志物 | 研究结果需要进一步在更大规模的临床样本中进行验证，以确认其普遍性和实用性 | 阐明线粒体功能障碍和免疫反应在牙周炎发病机制中的作用，识别分子亚型并发现诊断生物标志物，以支持精准医学方法 | 牙周炎患者 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、转录组分析、qPCR、IHC | 机器学习算法 | RNA测序数据、临床样本数据 | 牙周炎患者的单细胞RNA测序和转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2544 | 2025-01-05 |
Hidden features: CD36/SR-B2, a master regulator of macrophage phenotype/function through metabolism
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468957
PMID:39742252
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review | 本文综述了CD36/Scavenger Receptor B2在巨噬细胞表型和功能中的核心作用，特别是在代谢调控方面 | 强调了CD36在巨噬细胞代谢表达谱中的关键作用，以及其在微环境变化下对巨噬细胞功能的重塑潜力 | 主要基于现有文献综述，缺乏新的实验数据支持 | 探讨CD36/Scavenger Receptor B2在巨噬细胞表型和功能调控中的作用 | 巨噬细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化、肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2545 | 2025-01-05 |
Machine learning-based selection of immune cell markers in osteosarcoma: prognostic determination and validation of CLK1 in disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468875
PMID:39742274
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研究论文 | 本文通过机器学习方法筛选骨肉瘤中的免疫细胞标志物，构建预后模型并验证CLK1在疾病进展中的作用 | 利用多算法计算框架和单细胞RNA测序数据，开发了基于肿瘤浸润免疫细胞（TIIC）的基因特征，并验证了CLK1作为潜在致癌基因的作用 | 研究样本量较小，仅包含11个骨肉瘤样本，且功能验证仅限于MG63和U2OS细胞系 | 提高骨肉瘤患者的预后预测能力，并探索肿瘤微环境中的关键基因 | 骨肉瘤患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、拷贝数变异（CNV）分析、免疫印迹 | 20种机器学习算法 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 11个骨肉瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2546 | 2025-01-05 |
Leveraging single-cell and multi-omics approaches to identify MTOR-centered deubiquitination signatures in esophageal cancer therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490623
PMID:39742278
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研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学方法，识别了食管癌治疗中以MTOR为中心的去泛素化特征 | 首次开发了基于14个去泛素化相关基因（DUBGs）的基因特征模型，用于预测食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的预后和免疫治疗反应，并验证了MTOR作为潜在治疗靶点 | 研究主要依赖于TCGA-ESCC和GSE53624数据集，样本来源可能有限，且需要进一步临床验证 | 探索去泛素化相关基因在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的作用，并开发预测模型以指导个性化治疗 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 癌症研究 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、Cox回归模型、细胞间通讯分析、基因本体富集分析、突变分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据、突变数据 | TCGA-ESCC和GSE53624数据集中的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2547 | 2025-01-05 |
FB5P-seq-mAbs: monoclonal antibody production from FB5P-seq libraries for integrative single-cell analysis of B cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1505971
PMID:39742275
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研究论文 | 本文提出了一种整合FACS-based 5'-end单细胞RNA测序（FB5P-seq）和单克隆抗体克隆的方法，用于单B细胞的综合分析 | 该方法结合了单细胞RNA测序和单克隆抗体克隆，能够从单B细胞中获取转录组和抗原受体序列，并生产相应的单克隆抗体进行功能分析 | 需要从单B细胞中克隆抗体并进行功能分析，过程较为复杂 | 开发一种用于单B细胞综合分析的集成方法，以追踪B细胞在免疫反应中的激活和成熟 | B细胞 | 单细胞分析 | NA | FACS-based 5'-end单细胞RNA测序（FB5P-seq），单克隆抗体克隆 | NA | RNA-seq数据，抗体序列数据 | 卵清蛋白特异性小鼠生发中心B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2548 | 2025-01-05 |
Development and validation of a programmed cell death index to predict the prognosis and drug sensitivity of gastric cancer
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1477363
PMID:39744132
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一种基于程序性细胞死亡（PCD）的胃癌预后和药物敏感性预测指标 | 开发了一种新的十二基因标志物PCDI，用于预测胃癌患者的预后和药物敏感性，并建立了整合PCDI和临床特征的高性能列线图 | 研究依赖于公开的转录组数据和临床信息，可能受到数据质量和样本量的限制 | 开发一种基于PCD的胃癌预后和药物敏感性预测指标 | 胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 转录组数据分析 | LASSO回归分析 | 转录组数据和临床信息 | TCGA-STAD数据集以及GSE62254、GSE15459和GSE26901微阵列数据用于验证，GSE183904单细胞转录组数据用于分析 | NA | NA | NA | NA |
| 2549 | 2025-01-05 |
ABCA1 promote tumor environment heterogeneity via epithelial mesenchymal transition in Huh7 and HepG2 liver cancer cell
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1498528
PMID:39749197
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）中细胞通讯的内在机制，通过单细胞测序分析了恶性细胞亚群和癌症相关成纤维细胞（CAF）亚群，揭示了它们通过受体-配体相互作用的相互作用，并特别关注了SPP1 | 通过单细胞测序和湿实验室实验揭示了ABCA1在肝细胞癌中的促癌作用，并开发了基因风险评分模型来预测患者预后 | 研究主要基于Huh7和HepG2肝癌细胞系，可能无法完全代表所有肝细胞癌的异质性 | 探讨肝细胞癌中细胞通讯的内在机制及其对肿瘤微环境异质性的影响 | Huh7和HepG2肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 基因风险评分模型 | 单细胞数据 | Huh7和HepG2肝癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 2550 | 2025-01-05 |
Single-cell and spatiotemporal transcriptomic profiling of brain immune infiltration following Venezuelan equine encephalitis virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1497839
PMID:39749347
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在小鼠模型中全面分析了Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV)感染后脑部免疫细胞的转录组特征 | 揭示了VEEV感染后脑部免疫细胞的不同亚群及其独特的转录特征，包括一种表达I型干扰素的小胶质细胞亚群，以及髓系细胞和细胞毒性淋巴细胞的顺序浸润 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 阐明VEEV感染后脑部免疫反应的机制，特别是特定免疫细胞亚群的作用 | VEEV感染后的小鼠脑部免疫细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2551 | 2025-01-04 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in the immune microenvironment of spinal cord injury]
2024-Dec, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:39750053
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示脊髓损伤后局部免疫微环境中的细胞异质性和复杂的细胞间相互作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的应用，以更全面地理解脊髓损伤的病理生理过程 | 脊髓损伤后的局部免疫微环境 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2552 | 2025-01-04 |
Single-cell multi-omic and spatial profiling of human kidneys implicates the fibrotic microenvironment in kidney disease progression
2024-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01802-x
PMID:39048792
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学和空间分析技术，研究了人类肾脏在健康和疾病状态下的空间和分子特征，特别是纤维化微环境在肾脏疾病进展中的作用 | 结合单细胞、单核、空间RNA表达和单核开放染色质数据，首次全面绘制了人类肾脏的空间分子图谱，并揭示了纤维化微环境在疾病分类和预后中的临床价值 | 研究样本数量有限（81个），且主要关注糖尿病和高血压相关的肾脏疾病，可能无法完全代表其他类型的肾脏疾病 | 揭示肾脏健康和疾病状态下的空间和分子特征，特别是纤维化微环境的作用 | 人类肾脏样本（健康、糖尿病和高血压相关疾病） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞多组学、空间RNA表达（Visium、CosMx）、单核开放染色质分析 | NA | 单细胞RNA表达数据、空间RNA表达数据、单核开放染色质数据 | 81个样本（包括健康、糖尿病和高血压相关疾病的肾脏样本） | NA | NA | NA | NA |
| 2553 | 2025-01-04 |
Deciphering the heterogeneity of neutrophil cells within circulation and the lung cancer microenvironment pre- and post-operation
2024-02-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09850-z
PMID:38319415
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了非小细胞肺癌患者手术前后血液和肿瘤组织中的中性粒细胞亚群的分布，并开发了一种过表达率（OER）计算方法来评估中性粒细胞亚群的特异性 | 开发了过表达率（OER）计算方法，用于评估中性粒细胞亚群的特异性，并识别出具有潜在临床应用价值的基因组合 | 研究样本量有限，且仅针对非小细胞肺癌患者，未涵盖其他类型的癌症 | 评估非小细胞肺癌患者手术前后中性粒细胞亚群的分布及其特异性，以帮助诊断和预后评估 | 非小细胞肺癌患者手术前后的血液和肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤和癌旁组织、手术前后血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2554 | 2025-01-03 |
Intervention of Tanshinone IIA on the PGK1-PDHK1 Pathway to Reprogram Macrophage Phenotype After Myocardial Infarction
2024-Dec, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07520-6
PMID:37991600
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研究论文 | 本研究探讨了丹参酮IIA通过调节巨噬细胞的能量代谢和表型变化来改善心肌梗死的机制 | 首次提出丹参酮IIA通过PGK1-PDHK1信号通路调节巨噬细胞能量代谢和表型变化的机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨丹参酮IIA在心肌梗死治疗中的药理作用及其机制 | 心肌梗死模型中的巨噬细胞 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | RT-PCR, ELISA, 免疫荧光, JC-1, 钙离子浓度检测, 活性氧检测, 线粒体电子显微镜分析, 单细胞转录组数据挖掘, 细胞转录组测序, 分子对接技术 | 心肌梗死模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞表型数据 | 心肌梗死模型中的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2555 | 2025-01-03 |
Tcf21 as a Founder Transcription Factor in Specifying Foxd1 Cells to the Juxtaglomerular Cell Lineage
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.25.586641
PMID:38585851
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研究论文 | 本文探讨了Tcf21在Foxd1+基质祖细胞向肾小球旁细胞（JG细胞）分化中的关键作用 | 首次揭示了Tcf21在早期肾脏发育中对Foxd1+细胞向JG细胞分化的关键作用，并通过单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序分析了Tcf21的表达动态 | Tcf21在已确立的肾素表达细胞中的作用未被充分探讨 | 研究Tcf21在Foxd1+祖细胞向JG细胞分化中的作用 | Foxd1+基质祖细胞和肾小球旁细胞（JG细胞） | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞基因表达数据，染色质可及性数据 | 2,054个GFP+细胞（基质谱系） | NA | NA | NA | NA |
| 2556 | 2025-01-03 |
A cost-effective protocol for single-cell RNA sequencing of human skin
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1393017
PMID:39539550
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研究论文 | 本文介绍了一种成本效益高的人类皮肤单细胞RNA测序（scRNAseq）和流式细胞术分析的新协议 | 提出了一种无标签样本多重化策略，结合souporcell算法，实现了配对血液和皮肤样本的scRNAseq分析，并提供了同时进行流式细胞术分析的详细步骤 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种成本效益高的方法，使更多研究者能够进行皮肤样本的scRNAseq和流式细胞术分析 | 人类皮肤样本 | 单细胞RNA测序 | NA | scRNAseq, 流式细胞术 | souporcell算法 | RNA序列数据, 流式细胞术数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 2557 | 2025-01-02 |
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627006
PMID:39713439
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的a-b幂交互模型，用于处理包含协变量信息的稀疏组合计数数据，并结合差异丰度测试方法cosmoDA，以减少相关特征导致的假阳性检测 | 扩展了a-b幂交互模型以包含协变量信息，并提出了新的差异丰度测试方法cosmoDA，显著降低了相关特征的假发现率 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种能够准确表征异质群体中协变量依赖关系的模型，并减少差异丰度测试中的假阳性检测 | 稀疏组合计数数据，特别是单细胞RNA测序和扩增子测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，扩增子测序 | a-b幂交互模型 | 计数数据 | 模拟数据和真实数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2558 | 2025-01-02 |
Neutrophils drive sexual dimorphism in experimental periodontitis
2024-Dec-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625678
PMID:39677749
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研究论文 | 本研究旨在通过阐明性别特异性的牙周病进展机制，改善牙周病的治疗 | 揭示了中性粒细胞在牙周病性别二态性中的机制作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证有限 | 改善牙周病的治疗 | C57BL/6j小鼠和人类牙周病患者 | NA | 牙周病 | 流式细胞术、单细胞测序 | NA | 实验数据、临床数据 | ≥5只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 2559 | 2025-01-02 |
Pan-cancer analysis of the immunological and oncogenic roles of ATAD2 with verification in papillary thyroid carcinoma
2024-09-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73274-2
PMID:39333272
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研究论文 | 本文通过泛癌分析探讨了ATAD2在肿瘤进展和免疫相互作用中的角色，并在甲状腺乳头状癌中进行了验证 | 首次在泛癌范围内系统分析了ATAD2的表达、突变及其与免疫浸润的关系，并在甲状腺乳头状癌中验证了其致癌功能 | 研究主要依赖于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨ATAD2在肿瘤进展和免疫相互作用中的共同角色，并验证其在甲状腺乳头状癌中的致癌功能 | ATAD2基因及其在多种肿瘤中的表达和突变情况 | 肿瘤学 | 甲状腺乳头状癌 | 单细胞测序、MTT、伤口愈合、transwell、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、突变数据、单细胞测序数据 | 利用TCGA、GTEx、CPTAC、HPA和cBioPortal数据库中的泛癌数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2560 | 2025-01-01 |
Interpretable machine learning-driven biomarker identification and validation for Alzheimer's disease
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80401-6
PMID:39730451
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研究论文 | 本研究结合生物信息学方法和可解释的机器学习，识别并验证了阿尔茨海默病的可靠生物标志物 | 引入了交互式SHAP面板用于精确决策，并通过可解释的机器学习诊断模型提供了新的生物标志物识别见解，特别是MYH9作为潜在的新生物标志物 | RHOQ在AD细胞模型和人脑组织样本中的mRNA表达模式相反，其作用仍需进一步探索 | 提高阿尔茨海默病的早期检测和诊断准确性，改善干预效果 | 阿尔茨海默病 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、单细胞转录组分析 | 机器学习算法、SHAP | 基因表达数据 | GEO数据库中的AD数据集 | NA | NA | NA | NA |