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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2481 | 2025-10-07 |
Rejuvenated iPSC-derived GD2-directed CART Cells Harbor Robust Cytotoxicity Against Small Cell Lung Cancer
2024-03-11, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0259
PMID:38380966
|
研究论文 | 本研究开发了源自iPSC的年轻化GD2-CARrejT细胞,显著增强了对小细胞肺癌的细胞毒性 | 首次将GD2-CAR导入iPSC来源的年轻化细胞毒性T淋巴细胞,并通过单细胞RNA测序揭示了TIGIT低表达与细胞毒性增强的机制关联 | 研究主要聚焦于机制探索,临床前验证阶段尚未进入人体试验 | 增强GD2导向CAR-T细胞对小细胞肺癌的杀伤效果 | 小细胞肺癌细胞及GD2-CAR修饰的免疫细胞 | 免疫治疗 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序,细胞重编程 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据,细胞功能数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2482 | 2025-01-07 |
Prognostic model based on M2 macrophage-related signatures for predicting outcomes, enhancing risk stratification, and providing therapeutic insights in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Dec-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e41007
PMID:39759325
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研究论文 | 本研究提出了一种基于M2巨噬细胞相关基因的预测模型,用于对新诊断的弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者进行风险分层、预后预测和免疫特征评估 | 利用M2巨噬细胞相关基因构建预测模型,提供新的治疗选择和风险分层方法 | 研究依赖于公开数据库的数据,可能受到数据质量和样本量的限制 | 开发一种预测模型,用于DLBCL患者的风险分层和预后预测 | 新诊断的DLBCL患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的DLBCL患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2483 | 2025-01-07 |
The network structural entropy for single-cell RNA sequencing data during skin aging
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae698
PMID:39757115
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析皮肤老化过程中的基因网络,引入网络结构熵来量化老化过程中基因网络的复杂性 | 引入网络结构熵来量化老化过程中基因网络的复杂性,并发现老化细胞中的整体网络结构熵增加 | 未提及具体局限性 | 理解老化过程中细胞功能变化的分子机制 | 单细胞RNA测序数据中的基因网络 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 随机游走模型 | 基因表达数据 | 超过15,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2484 | 2025-01-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the changes of the pulmonary immune environment in rat after Siegesbeckia orientalis L. treatment
2024-Nov, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2024.101035
PMID:39759974
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了东方泽兰治疗后大鼠肺部免疫环境的变化 | 使用单细胞RNA测序技术详细分析东方泽兰治疗对大鼠肺部免疫环境的影响 | NA | 研究东方泽兰治疗对大鼠肺部免疫环境的影响 | 大鼠肺部免疫环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2485 | 2025-01-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics analysis of non-small cell lung cancer
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48700-8
PMID:38782901
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,探讨了非小细胞肺癌中的肿瘤生态系统,特别是髓系细胞的作用 | 揭示了肿瘤中抗炎性巨噬细胞与NK细胞/T细胞之间的反向关系,以及巨噬细胞在肿瘤中的转录重编程现象 | 样本量相对较小,仅包括25名未接受治疗的患者 | 研究非小细胞肺癌肿瘤生态系统中的免疫细胞类型及其作用 | 25名未接受治疗的腺癌和鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 约900,000个细胞,来自25名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2486 | 2025-01-07 |
MUSTANG: Multi-sample spatial transcriptomics data analysis with cross-sample transcriptional similarity guidance
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100986
PMID:38800365
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MUSTANG的空间转录组数据分析框架,能够通过跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性进行多样本空间转录组数据的细胞去卷积 | MUSTANG框架创新性地结合了跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性,提升了多样本空间转录组数据的分析能力 | NA | 开发一种能够有效分析多样本空间转录组数据的框架,以揭示组织样本细胞特征中的生物学见解 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 一个半合成空间转录组数据集和三个真实世界空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2487 | 2025-01-07 |
DeepDecon accurately estimates cancer cell fractions in bulk RNA-seq data
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100969
PMID:38800361
|
研究论文 | 本文介绍了DeepDecon,一种利用单细胞基因表达信息准确预测大块组织中癌细胞比例的深度神经网络模型 | DeepDecon通过迭代估计癌细胞比例的策略,提高了大块RNA-seq数据中细胞组成分解的准确性 | NA | 研究目的是提高大块RNA-seq数据中癌细胞比例的估计准确性 | 大块RNA-seq数据中的癌细胞比例 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | 深度神经网络 | RNA-seq数据 | 模拟和真实癌症数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2488 | 2025-01-07 |
Comprehensive integration of single-cell transcriptomic data illuminates the regulatory network architecture of plant cell fate specification
2024-May, Plant diversity
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.pld.2024.03.008
PMID:38798726
|
研究论文 | 本文通过整合63个已发表的单细胞转录组数据集,构建了一个全面的植物幼苗单细胞转录组图谱,揭示了细胞类型特异性基因调控网络 | 首次整合大量单细胞转录组数据,构建了涵盖广泛组织的植物细胞图谱,并系统性地构建了细胞类型特异性基因调控网络 | NA | 揭示植物细胞命运决定的调控网络架构 | 植物幼苗 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了63个已发表的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2489 | 2025-01-07 |
Spatial transcriptomics in breast cancer: providing insight into tumor heterogeneity and promoting individualized therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1499301
PMID:39749323
|
研究论文 | 本文综述了空间转录组学的关键技术方法、最新进展及其在乳腺癌中的应用,并讨论了当前空间转录组学方法的局限性和未来发展前景 | 空间转录组学解决了单细胞RNA测序缺乏空间信息的问题,能够定位和区分特定组织区域内功能基因的活跃表达,有助于识别新的乳腺癌亚型和空间区分特征,促进个体化精准治疗 | 当前空间转录组学方法仍存在局限性,未来需要进一步发展和改进 | 推进乳腺癌研究,全面理解肿瘤异质性、肿瘤微环境和耐药机制 | 乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2490 | 2025-01-07 |
New Posttranslational Modification Lactylation Brings New Inspiration for the Treatment of Rheumatoid Arthritis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497240
PMID:39758940
|
综述 | 本文综述了乳酸化在类风湿性关节炎(RA)相关细胞和机制中的研究,为RA的发病机制、诊断和治疗提供了新的见解 | 提出了乳酸化作为一种新的翻译后修饰在RA中的关键作用,并发现了潜在的生物标志物 | 本文为综述文章,未涉及具体实验数据,缺乏直接的研究验证 | 探讨乳酸化在类风湿性关节炎中的作用及其潜在的治疗应用 | 类风湿性关节炎相关细胞,如成纤维样滑膜细胞(FLSs)和巨噬细胞 | 生物医学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2491 | 2025-01-07 |
Unveiling Ventilator-Associated Pneumonia: S100A8 as a Promising Biomarker Through Integrated RNA-Seq Analysis
2024, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S495121
PMID:39759083
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA-Seq分析,揭示了S100A8作为呼吸机相关性肺炎(VAP)的潜在生物标志物 | 结合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析,筛选并验证了S100A8作为VAP诊断的潜在生物标志物,为VAP诊断提供了新的视角 | 样本量相对较小,仅分析了46个VAP样本和48个正常样本 | 探索VAP的发病机制并识别潜在的生物标志物 | 呼吸机相关性肺炎(VAP)患者 | 生物信息学 | 肺炎 | RNA-Seq, scRNA-seq, Western blot | NA | RNA序列数据 | 46个VAP样本和48个正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2492 | 2025-01-07 |
Spatially-resolved analyses of muscle invasive bladder cancer microenvironment unveil a distinct fibroblast cluster associated with prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522582
PMID:39759522
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研究论文 | 本研究利用成像质谱流式细胞术(IMC)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,分析了肌肉浸润性膀胱癌(MIBC)微环境的空间异质性,并揭示了一个与预后相关的特定成纤维细胞簇 | 通过IMC和scRNA-seq技术结合空间转录组学(ST),首次揭示了MIBC微环境中特定成纤维细胞簇(S3)与内皮细胞之间的相互作用及其对预后的影响 | 样本量相对较小(40个组织样本),且研究结果需要进一步验证 | 评估MIBC微环境的空间异质性,并探索其临床意义 | 肌肉浸润性膀胱癌(MIBC)的微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 成像质谱流式细胞术(IMC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST) | 机器学习算法 | 图像、RNA序列数据 | 40个组织样本中的185个感兴趣区域 | NA | NA | NA | NA |
| 2493 | 2025-01-06 |
Online-adjusted evolutionary biclustering algorithm to identify significant modules in gene expression data
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae681
PMID:39749664
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研究论文 | 本文提出了一种新的基于进化的双聚类算法OAEVOB,用于高效处理大规模基因表达数据 | OAEVOB算法引入了在线调整功能,通过更新突变概率和交叉参数来有效识别显著基因群组 | 现有算法未解决对不同基因表达数据源的泛化问题 | 开发一种可靠的创新方法,用于深入分析生物数据并确保基于准确信息做出决策 | 基因表达数据 | 机器学习 | 癌症 | DNA微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序 | 进化算法 | 基因表达数据 | 六个来自不同测序数据源的基因表达数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2494 | 2025-01-06 |
BACT: nonparametric Bayesian cell typing for single-cell spatial transcriptomics data
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae689
PMID:39751646
|
研究论文 | 本文提出了一种非参数贝叶斯模型BACT,用于单细胞空间转录组数据的细胞类型分析 | BACT模型无需预先指定细胞类型数量,能够自动从数据中学习细胞类型数量,并利用非参数Potts先验引入邻近细胞的空间依赖性 | NA | 解决现有细胞空间聚类方法需要预先指定细胞类型数量的问题 | 单细胞空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞空间转录组技术 | 非参数贝叶斯模型 | 基因表达数据和空间坐标数据 | 三个单细胞空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2495 | 2025-01-06 |
Engineered T cell therapy for central nervous system injury
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07906-y
PMID:39232158
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研究论文 | 本文探讨了工程化T细胞疗法在中枢神经系统损伤中的应用,通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠和人类脊髓损伤相关T细胞的克隆扩增及其抗原特异性 | 利用mRNA基础的T细胞受体重构技术生成工程化瞬时自身免疫T细胞,展示了其在CNS损伤模型中的显著神经保护效果 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的应用和效果尚需进一步验证 | 开发针对中枢神经系统损伤的免疫介导细胞疗法 | 小鼠和人类的脊髓损伤相关T细胞 | 生物医学工程 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序,mRNA基础的T细胞受体重构 | NA | RNA序列数据 | 未明确提及具体样本数量,涉及小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2496 | 2025-01-06 |
MNMST: topology of cell networks leverages identification of spatial domains from spatial transcriptomics data
2024-05-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03272-0
PMID:38783355
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研究论文 | 本文提出了一种多层网络模型MNMST,用于通过联合学习识别空间转录组数据中的空间域 | 利用细胞网络的拓扑结构精确表征和区分空间域,提高了空间域的识别和可解释性,超越了现有基线方法 | 未提及具体局限性 | 提高空间转录组数据中空间域的识别和可解释性 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 多层网络模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2497 | 2025-01-06 |
Integrated epigenetic and transcriptional single-cell analysis of t(11;14) multiple myeloma and its BCL2 dependency
2024-01-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020276
PMID:37729611
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞水平的ATAC-seq和RNA-seq技术,分析了t(11;14)多发性骨髓瘤(MM)的表观遗传调控和转录组特征,并探讨了其对BCL2抑制剂venetoclax的依赖性 | 首次在原发性MM细胞中整合单细胞ATAC-seq和RNA-seq分析,深入解析了t(11;14) MM的表观遗传调控组和转录组特征及其与venetoclax耐药性的关系 | 研究主要聚焦于t(11;14) MM,未涵盖其他类型的多发性骨髓瘤 | 揭示t(11;14)多发性骨髓瘤对BCL2抑制剂的依赖性及其表观遗传调控机制 | t(11;14)多发性骨髓瘤患者 | 表观遗传学 | 多发性骨髓瘤 | ATAC-seq, RNA-seq | NA | 单细胞测序数据 | 原发性MM样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2498 | 2025-01-05 |
Spatial transcriptomics reveals unique metabolic profile and key oncogenic regulators of cervical squamous cell carcinoma
2024-Dec-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06011-y
PMID:39741285
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了宫颈鳞状细胞癌(CSCC)肿瘤微环境和代谢特征,揭示了不同肿瘤区域的代谢分布及其与肿瘤分化程度的关系 | 首次结合空间转录组学(ST)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,详细描绘了CSCC肿瘤边缘和核心区域的空间代谢分布,并发现了APP和TRPS1在肿瘤进展中的关键作用 | 研究样本量有限,且主要基于FFPE样本,可能影响结果的普适性 | 深入理解CSCC的肿瘤微环境和代谢特征,探索肿瘤进展的潜在机制 | 宫颈鳞状细胞癌(CSCC)患者的FFPE肿瘤样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 空间转录组学(ST)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | CSCC患者的FFPE肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2499 | 2025-01-05 |
Targeting AURKA with multifunctional nanoparticles in CRPC therapy
2024-Dec-30, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-03070-7
PMID:39734237
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研究论文 | 本研究探讨了ART-T细胞膜包裹的AMS@AD纳米颗粒在光热-化疗-免疫联合治疗中对去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的疗效 | 首次将光热、化疗和免疫治疗结合,使用T细胞膜仿生纳米颗粒靶向AURKA,为CRPC提供了一种新的三重联合治疗方法 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行临床试验,实际疗效和安全性仍需进一步验证 | 评估CM-AMS@AD纳米颗粒在CRPC治疗中的疗效和潜在临床应用 | 去势抵抗性前列腺癌(CRPC) | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、动态光散射、透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | TCGA-PRAD数据集和GEO数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2500 | 2025-01-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies the expression of hemoglobin in chondrocyte cell subpopulations in osteoarthritis
2024-Dec-30, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-024-00519-3
PMID:39736555
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了骨关节炎中软骨细胞亚群中血红蛋白的表达特征及其相关通路 | 首次在软骨细胞中发现血红蛋白的表达,并揭示了其在骨关节炎进展中的潜在机制 | 研究依赖于公共数据库中的数据,未进行实验验证 | 探讨骨关节炎中软骨细胞亚群中血红蛋白的表达特征及其相关通路 | 正常人和骨关节炎患者的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库下载的正常人和骨关节炎患者的数据 | NA | NA | NA | NA |