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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2461 | 2025-10-07 |
Miltefosine reinvigorates exhausted T cells by targeting their bioenergetic state
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101869
PMID:39657666
|
研究论文 | 本研究通过筛选FDA批准的小分子库,发现米替福新能够通过改善T细胞的生物能量状态来逆转T细胞耗竭 | 首次发现米替福新能够以不依赖PD-1/PD-L1的方式逆转T细胞耗竭,即使在PD-1抗体治疗无效的终末耗竭状态下仍能增强CAR-T细胞活性 | 研究主要基于体外模型和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发针对T细胞耗竭的新型免疫治疗策略 | 耗竭的CAR-T细胞和T细胞 | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞测序,小分子筛选 | CAR-T细胞模型,同种异体和同基因肿瘤模型 | 基因表达数据,细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2462 | 2025-10-07 |
Upregulation of multiple key molecules is correlated with poor prognosis and immune infiltrates in hepatocellular carcinoma by bulk and single-cell RNA-seq
2024-Nov-12, Aging
DOI:10.18632/aging.206151
PMID:39537209
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研究论文 | 本研究通过bulk和单细胞RNA-seq分析,构建了基于关键基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次结合三种差异分析方法和单细胞测序技术鉴定肝细胞癌关键基因,并建立与免疫细胞浸润相关的预后模型 | 研究主要基于TCGA数据库,缺乏外部验证队列 | 构建肝细胞癌预后预测模型并探索关键基因与免疫浸润的关系 | 肝细胞癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2463 | 2025-10-07 |
Lactylation-driven TNFR2 expression in regulatory T cells promotes the progression of malignant pleural effusion
2024-Dec-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010040
PMID:39721754
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控调节性T细胞中TNFR2表达的机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 首次发现乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控NF-κB p65转录因子,进而上调TNFR2表达的新表观遗传机制 | NA | 探索调节性T细胞中TNFR2表达的调控机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 人类和小鼠的恶性胸腔积液样本及调节性T细胞 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2464 | 2025-10-07 |
Global identification of mammalian host and nested gene pairs reveal tissue-specific transcriptional interplay
2024-Dec-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279430.124
PMID:39578100
|
研究论文 | 本研究通过构建小鼠和人类宿主/嵌套基因对的全面目录,揭示了组织特异性转录互作模式 | 提供了最新的宿主/嵌套基因对目录,发现转录共现具有组织特异性,特别是在睾丸组织中尤为普遍 | NA | 系统识别哺乳动物宿主和嵌套基因对,揭示其组织特异性转录互作机制 | 小鼠和人类基因组中的宿主/嵌套基因对 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2465 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Sheds Light on Tumor Evolution: Perspectives from City of Hope's Clinical Trial Teams
2024-Dec-10, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13247507
PMID:39768430
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学在临床肿瘤研究中的应用及其对理解肿瘤演化的意义 | 提出了整合单细胞RNA测序到临床实验设计的实践经验,并强调了计算团队与临床团队协作的'团队医学'方法 | 实施单细胞方法面临高质量细胞获取、技术变异性和复杂计算分析等挑战 | 理解肿瘤异质性对肿瘤演化和治疗反应的影响,以开发更有效的治疗方法 | 乳腺癌、脑癌和卵巢癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多种癌症(乳腺癌、脑癌、卵巢癌) | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2466 | 2025-10-07 |
Deciphering progressive lesion areas in breast cancer spatial transcriptomics via TGR-NMF
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae707
PMID:39780487
|
研究论文 | 本研究开发了TGR-NMF方法,用于解析乳腺癌空间转录组数据中的疾病进展相关区域 | 提出了三图正则化非负矩阵分解方法和单元化策略,整合基因表达和空间位置邻域拓扑,能够利用完整的基因表达计数数据并提高可解释性 | 未明确说明样本数量和具体的技术验证细节 | 解析乳腺癌组织异质性,识别与疾病进展相关的空间区域 | 乳腺癌空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | TGR-NMF(三图正则化非负矩阵分解) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2467 | 2025-10-07 |
Targeting squalene epoxidase restores anti-PD-1 efficacy in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis-induced hepatocellular carcinoma
2024-Nov-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331117
PMID:38744443
|
研究论文 | 本研究探讨了角鲨烯环氧酶在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎诱导的肝细胞癌中通过调节肿瘤免疫微环境影响抗PD-1疗效的机制 | 首次揭示SQLE通过胆固醇积累导致CD8+ T细胞线粒体功能障碍和髓源性抑制细胞活化,从而介导免疫抑制并影响抗PD-1疗效 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究SQLE在MASH-HCC肿瘤免疫微环境调节中的作用及对抗PD-1疗效的影响 | 肝细胞特异性SQLE转基因和敲除小鼠、原位移植模型和人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | 转基因小鼠模型、敲除小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2468 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional atlas of human breast cancers and model systems
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70044
PMID:39417215
|
研究论文 | 构建了人类乳腺癌的单细胞转录图谱,包含患者样本和多种模型系统 | 整合了多种乳腺癌模型系统的单细胞RNA测序数据,开发了动态细胞样本注释方法 | 样本数量有限,模型系统与真实患者样本仍存在差异 | 深入理解乳腺癌细胞多样性,识别有效治疗方法 | 乳腺癌患者肿瘤组织、淋巴结转移灶、减乳成形术样本、PDX模型、PDXO类器官和细胞系 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | SCSubtype, TNBCtype细胞分型预测器 | 单细胞转录组数据 | 117个样本,共506,719个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2469 | 2025-10-07 |
The Effect of Exposure to Neighborhood Violence on Glucocorticoid Receptor Signaling in Lung Tumors
2024-07-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0032
PMID:38912926
|
研究论文 | 本研究探讨了居住区暴力犯罪暴露对肺肿瘤中糖皮质激素受体信号通路的影响 | 首次将社区暴力犯罪暴露与肺肿瘤中糖皮质激素受体染色质招募的重新编程联系起来 | 样本量较小(仅15个肺肿瘤样本),研究结果需要更大样本验证 | 研究社会压力暴露与肺肿瘤基因表达之间的关系 | 肺肿瘤样本和居住区暴力犯罪率 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学,CUT&RUN(ChIP测序技术) | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 15个肺肿瘤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 2470 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109916
PMID:38812536
|
研究论文 | 构建了迄今为止最全面的小鼠视网膜单细胞图谱,整合了约33万个细胞的数据 | 创建了最大的小鼠视网膜单细胞RNA测序数据集,首次整合多个数据集构建综合细胞图谱,识别了138种细胞类型 | 仅使用C57BL/6J野生型小鼠,可能不适用于其他品系或疾病模型 | 构建全面的小鼠视网膜单细胞图谱以解决现有数据集的局限性 | C57BL/6J小鼠视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,抗体磁珠分选 | NA | 单细胞基因表达数据 | 约190,000个单细胞(本研究),整合后超过330,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2471 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling and modeling of mouse brain at single-cell resolution reveals cell proximity effects of aging and rejuvenation
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.16.603809
PMID:39071282
|
研究论文 | 通过单细胞空间转录组学构建小鼠大脑时空图谱,开发空间衰老时钟模型揭示衰老和 rejuvenation 过程中的细胞邻近效应 | 首次开发基于空间转录组学的机器学习模型(空间衰老时钟),系统揭示衰老过程中细胞对邻近细胞的影响机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类大脑的适用性需要进一步验证 | 探究大脑衰老过程中细胞间相互作用的分子机制及其对组织功能衰退的影响 | 小鼠大脑细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞空间转录组测序 | 深度学习, 机器学习 | 空间转录组数据 | 420万个细胞,来自20个不同年龄阶段的小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 2472 | 2025-10-07 |
A wound-induced differentiation trajectory for neurons
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322864121
PMID:38976727
|
研究论文 | 本研究揭示了涡虫在伤口诱导下通过NFY转录因子调控神经元分化的机制 | 首次发现伤口诱导的NFY转录因子结合在脑再生早期启动神经分化通路 | 研究仅聚焦于涡虫模型,机制在其他再生动物中的普适性尚未验证 | 探究伤口诱导的转录调控事件如何启动神经元分化和脑再生 | 具有高再生能力的涡虫 | 发育生物学 | NA | 染色质可及性分析,单细胞转录组测序,功能研究 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2473 | 2025-10-07 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-06-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
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研究论文 | 本研究探讨SOS1和MEK抑制剂联合治疗对KRASG12D胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及免疫治疗响应改善机制 | 首次揭示SOS1i+MEKi联合治疗通过调节iCAF和髓系细胞导致免疫抑制微环境,并提出CD40激动剂联合检查点阻断的新策略 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索KRAS靶向治疗对肿瘤微环境的影响及改善免疫治疗响应的组合策略 | KRASG12D/p53突变小鼠胰腺导管腺癌细胞系(KPCY)及荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KPCY细胞系及荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2474 | 2025-10-07 |
Flow Cytometry Analysis of Microglial Phenotypes in the Murine Brain During Aging and Disease
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5018
PMID:38948260
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研究论文 | 开发了一种优化的流式细胞术方案,用于区分小鼠脑组织中四种不同的小胶质细胞表型 | 建立了无需细胞分选、成像或单细胞RNA测序就能区分四种小胶质细胞表型的流式细胞术方案,具有成本低、通量高的优势 | 该方法依赖于前期单细胞RNA测序研究确定的基因标记,可能需要特定多色检测能力的细胞分析仪 | 开发一种区分小胶质细胞表型的标准化流程 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞 | 免疫学 | 神经退行性疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据 | NA | Cytek | 流式细胞术 | Cytek Aurora | Cytek Aurora 5激光光谱流式细胞仪 |
| 2475 | 2025-10-07 |
LYVE-1-expressing Macrophages Modulate the Hyaluronan-containing Extracellular Matrix in the Mammary Stroma and Contribute to Mammary Tumor Growth
2024-05-31, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0205
PMID:38717149
|
研究论文 | 本研究揭示了LYVE-1+巨噬细胞通过调节透明质酸细胞外基质促进乳腺肿瘤生长的机制 | 首次证明LYVE-1+巨噬细胞通过降解透明质酸和调节免疫微环境促进肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究LYVE-1+巨噬细胞在乳腺基质和肿瘤微环境中的功能 | 小鼠乳腺组织和乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2476 | 2025-10-07 |
Identification of MUC1-C as a Target for Suppressing Progression of Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2024-05-14, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0011
PMID:38619287
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研究论文 | 本研究揭示了MUC1-C蛋白在头颈部鳞状细胞癌进展中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现MUC1-C通过整合STAT1炎症通路与∆Np63、SOX2基因表达,驱动头颈部鳞癌干细胞状态 | 主要基于细胞系研究,需要更多体内实验验证 | 探索MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌进展中的作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系和肿瘤样本 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2477 | 2025-10-07 |
Role of ferroptosis in neuroimmunity and neurodegeneration in multiple sclerosis revealed by multi-omics data
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18396
PMID:38801304
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研究论文 | 通过多组学数据揭示铁死亡在多发性硬化症神经免疫和神经退行性变中的作用 | 开发了铁死亡水平的计算指标,首次通过整合单核RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学数据系统研究铁死亡在多发性硬化症中的作用机制 | 铁死亡在多发性硬化症中的确切作用机制仍需进一步验证 | 探究铁死亡在多发性硬化症发病机制中的作用 | 多发性硬化症患者样本 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | snRNA-seq, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, AUCell方法 | 诊断模型 | 多组学数据 | 七个不同白质病变区域的样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 2478 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals evolutionary reconfiguration of embryonic cell fate specification in the sea urchin Heliocidaris erythrogramma
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.30.591752
PMID:38746376
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研究论文 | 通过单细胞转录组比较分析揭示海胆胚胎细胞命运特化的进化重配置 | 首次利用比较单细胞RNA-seq发育时间序列揭示胚胎模式形成中的多样化进化变化 | 需要后续实验验证候选调控相互作用的假设 | 研究发育进化中调控互作的改变如何影响表型多样性 | 海胆Heliocidaris erythrogramma和其近缘物种的胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海胆物种的发育时间序列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2479 | 2025-10-07 |
Single-cell insights: pioneering an integrated atlas of chromatin accessibility and transcriptomic landscapes in diabetic cardiomyopathy
2024-04-25, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02233-y
PMID:38664790
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据,揭示了糖尿病心肌病中染色质可及性和转录组景观的细胞状态和分子变化 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据构建糖尿病心肌病的综合图谱,识别了关键的转录因子和细胞亚群特异性变化 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明糖尿病心肌病的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 野生型和糖尿病心肌病小鼠的心脏组织 | 单细胞多组学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光染色 | Seurat, Signac, chromVAR, Cicero | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | WT和DCM小鼠心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Multiome | 10x Multiome单细胞RNA和ATAC联合测序文库 |
| 2480 | 2025-10-07 |
Mechanisms of imbalanced testicular homeostasis in infancy due to aberrant histone acetylation in undifferentiated spermatogonia under different concentrations of Di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) exposure
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123742
PMID:38460586
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研究论文 | 本研究探讨了婴儿期不同浓度DEHP暴露通过组蛋白乙酰化异常导致睾丸稳态失衡的分子机制 | 首次揭示了婴儿期DEHP暴露通过线粒体功能障碍和组蛋白乙酰化异常导致未分化精原细胞命运差异的机制,并发现其对睾丸稳态的长期影响持续至成年期 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;DEHP暴露剂量和时程可能无法完全模拟真实环境暴露情况 | 阐明婴儿期DEHP暴露对睾丸发育和生殖系统功能的毒性机制 | 新生小鼠睾丸组织中的未分化精原细胞、支持细胞和间质细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第5天小鼠,分别接受40μg/kg和80μg/kg DEHP暴露10天 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |