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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2381 | 2024-10-25 |
Spatial transcriptomics: a new frontier in accurate localization of breast cancer diagnosis and treatment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483595
PMID:39439806
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研究论文 | 本文总结了空间转录组学在乳腺癌诊断和治疗中的最新发现 | 空间转录组学为研究肿瘤内部结构差异和肿瘤微环境组成提供了新的视角 | NA | 探讨空间转录组学在乳腺癌精准治疗中的应用 | 乳腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
2382 | 2024-10-25 |
Exploring shared biomarkers and shared pathways in insomnia and atherosclerosis using integrated bioinformatics analysis
2024, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2024.1477903
PMID:39439987
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析,探索失眠与动脉粥样硬化之间的共享生物标志物和通路 | 首次通过整合生物信息学分析,筛选出失眠与动脉粥样硬化之间的共享基因,并构建了预测模型 | 研究主要基于现有数据库数据,未进行实验验证 | 探索失眠与动脉粥样硬化之间的共享通路和诊断生物标志物 | 失眠和动脉粥样硬化 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析、基因差异表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、机器学习算法 | NA | 基因表达数据 | NA |
2383 | 2024-10-25 |
Integrating Bulk and Single-cell RNA-seq to Construct a Macrophage-related Prognostic Model for Prognostic Stratification in Triple-negative Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101042
PMID:39440065
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研究论文 | 本研究整合了bulk和单细胞RNA测序数据,构建了一个与巨噬细胞相关的预后模型,用于三阴性乳腺癌的预后分层 | 本研究首次整合bulk和单细胞RNA测序数据,构建了一个与巨噬细胞相关的预后模型,用于三阴性乳腺癌的预后分层 | 本研究仅限于三阴性乳腺癌,未涵盖其他类型的乳腺癌 | 探索三阴性乳腺癌中巨噬细胞的异质性,并建立一个与巨噬细胞相关的预后模型,用于三阴性乳腺癌的预后分层 | 三阴性乳腺癌中的巨噬细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
2384 | 2024-10-25 |
Bibliometric and visual analysis of single-cell multiomics in neurodegenerative disease arrest studies
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1450663
PMID:39440247
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研究论文 | 本研究通过文献计量学方法分析了单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用现状和趋势 | 首次系统性地利用文献计量学方法分析单细胞多组学在神经退行性疾病研究中的应用 | 主要依赖于文献计量学方法,缺乏实验数据和具体技术细节的深入分析 | 分析单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用现状和趋势 | 单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞多组学 | NA | 文献 | 596篇出版物 |
2385 | 2024-10-24 |
Circulating RAC1 contributed to steroid-sensitive nephrotic syndrome: Mendelian randomization, single-cell RNA-sequencing, proteomic, and experimental evidence
2024-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2024.2416087
PMID:39422242
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研究论文 | 研究探讨并验证了循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征(SSNS)之间的潜在因果关系 | 通过孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、蛋白质组学分析和实验研究,首次系统地验证了循环RAC1与SSNS之间的因果关系 | 研究主要集中在基因表达和蛋白质水平上,未深入探讨RAC1在细胞内的具体作用机制 | 探索并验证循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征之间的潜在因果关系 | 循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征(SSNS) | NA | 肾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 包括SSNS患者和健康对照的外周血单个核细胞样本,以及最小变化肾病综合征患者的样本 |
2386 | 2024-10-24 |
Timing, initiation and function: An in-depth exploration of the interaction network among neutrophil extracellular traps related genes in acute pancreatitis
2024-Nov-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112923
PMID:39137629
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序,深入探讨了中性粒细胞外陷阱(NETs)相关基因在急性胰腺炎(AP)中的相互作用网络及其关键生物行为 | 首次探索了NETs在AP中的时间点和发病机制,为后续研究提供了基因靶点 | NA | 全面探索NETs在急性胰腺炎中的关键生物行为,包括时间点和发病机制 | 中性粒细胞外陷阱(NETs)相关基因及其在急性胰腺炎中的作用 | NA | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) | NA | RNA | AP小鼠模型 |
2387 | 2024-10-24 |
Single-cell analysis in rheumatic and allergic diseases: insights for clinical practice
2024-Nov, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-024-01043-3
PMID:38914790
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在风湿性和过敏性疾病临床样本中的应用,探讨了其在疾病发病机制中的作用及在临床实践中的潜在应用 | 结合scRNA-seq数据和细胞表面分子特征、染色质可及性及空间信息等多种细胞属性,深入理解病理机制 | 单细胞分析结果转化为临床实践和开发个性化治疗策略仍面临挑战 | 探讨单细胞分析在风湿性和过敏性疾病中的应用,并讨论其在临床实践中的应用前景 | 风湿性和过敏性疾病的临床样本,包括类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、系统性硬化症、过敏性呼吸道疾病和特应性皮炎 | 数字病理学 | 风湿性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | 涉及多种风湿性和过敏性疾病的临床样本,包括外周血细胞和局部病变组织 |
2388 | 2024-10-24 |
Circulating Immune Cells from Early- and Late-onset Pre-eclampsia Displays Distinct Profiles with Differential Impact on Endothelial Activation
2024-Nov-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400196
PMID:39302114
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研究论文 | 研究了早发型和晚发型先兆子痫患者循环免疫细胞的差异及其对内皮细胞激活的影响 | 首次比较了早发型和晚发型先兆子痫患者循环免疫细胞的差异,并探讨了其对内皮细胞激活的影响 | 研究仅限于体外实验,未涉及临床干预或长期效果的评估 | 探讨早发型和晚发型先兆子痫患者系统性免疫变化及其对内皮细胞激活的影响 | 早发型和晚发型先兆子痫患者及正常妊娠对照组的循环免疫细胞 | NA | 妊娠相关疾病 | 流式细胞术、多重检测、细胞内细胞因子染色、单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 早发型先兆子痫、晚发型先兆子痫及正常妊娠对照组 |
2389 | 2024-10-24 |
Albumin reprograms the B cell transcriptional landscape and improves neutrophil antimicrobial function in patients with decompensated cirrhosis
2024-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101184
PMID:39434891
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研究论文 | 研究探讨了白蛋白在失代偿性肝硬化患者中对B细胞转录组景观的重新编程作用,以及其对中性粒细胞抗菌功能的影响 | 发现白蛋白能够促进B细胞转录组的重新编程和扩增,并改善中性粒细胞的抗菌功能,从而降低失代偿性肝硬化患者感染的发生率 | 研究样本量较小,且未进行随机对照临床试验,需要进一步的大规模临床研究验证 | 探讨白蛋白在失代偿性肝硬化患者中的免疫调节作用及其对感染发生率的影响 | 失代偿性肝硬化患者和健康志愿者的外周血单核细胞及中性粒细胞 | NA | 肝硬化 | RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 共涉及20名失代偿性肝硬化患者和34名健康志愿者的外周血单核细胞,以及6名失代偿性肝硬化患者和9名健康志愿者的中性粒细胞 |
2390 | 2024-10-24 |
Senescent Syncytiotrophoblast Secretion During Early Onset Preeclampsia
2024-Oct-23, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 研究早发型子痫前期中衰老的合体滋养层细胞分泌物的变化 | 首次通过单核RNA测序结合空间转录组学技术,识别出早发型子痫前期中合体滋养层细胞的转录组状态变化,并验证了其在临床多中心队列中的应用 | 研究主要集中在早发型子痫前期的早期预测标记物,未涉及治疗策略的开发 | 探索早发型子痫前期的发病机制,寻找有效的早期预测标记物 | 早发型子痫前期和健康对照组的母胎界面单位(胎儿绒毛和母体蜕膜) | NA | 妊娠相关疾病 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA | 早发型子痫前期和健康对照组的母胎界面单位样本 |
2391 | 2024-10-24 |
Bioengineered Extracellular Vesicles Delivering siMDM2 Sensitize Oxaliplatin Therapy Efficacy in Colorectal Cancer
2024-Oct-23, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202403531
PMID:39440640
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研究论文 | 研究通过生物工程改造的外泌体递送siMDM2,增强奥沙利铂在结直肠癌治疗中的疗效 | 首次结合单细胞转录组测序和动态网络生物标志物,揭示了奥沙利铂耐药早期阶段线粒体电子传递链复合物I功能抑制的现象,并通过工程化外泌体递送siMDM2,验证了其在改善奥沙利铂化疗疗效中的应用 | 研究主要集中在体外和动物模型中,尚未在临床试验中验证 | 探讨奥沙利铂耐药的早期机制,并开发新的治疗策略 | 结直肠癌细胞和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 包括患者来源的异种移植模型和肝肺转移小鼠模型 |
2392 | 2024-10-24 |
Distinct deregulation trends of transcriptional protein complexes in aging naive T cells
2024-Oct-22, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae231
PMID:39437255
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研究论文 | 研究了衰老对幼稚CD4+和CD8+ T细胞中转录蛋白复合物的影响 | 整合单细胞RNA测序数据和蛋白质-蛋白质及域-域相互作用网络,预测和比较了衰老相关的转录蛋白复合物,并识别了其解释衰老相关变异的能力 | NA | 研究衰老对T细胞亚群的影响及其潜在的免疫系统功能障碍 | 幼稚CD4+和CD8+ T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自三个不同年龄组的幼稚CD4+和CD8+ T细胞 |
2393 | 2024-10-24 |
-RAMP3 promotes hepatocellular carcinoma tumor cell-mediated CCL2 degradation by supporting membrane distribution of ACKR2
2024-Oct-21, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113419
PMID:39437486
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研究论文 | 研究探讨了RAMP3与ACKR2的结合及其在肝细胞癌肿瘤微环境中对CCL2降解的协同调控作用 | 首次揭示了RAMP3通过支持ACKR2的膜分布促进CCL2在肝细胞癌中的降解 | 研究主要基于细胞系和生物信息学分析,缺乏临床样本的验证 | 探索RAMP3与ACKR2在肝细胞癌中的相互作用及其对CCL2降解的影响 | RAMP3、ACKR2、CCL2以及肝细胞癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | RNA序列、蛋白质相互作用数据 | 使用了人肝细胞癌细胞系Huh7和HepG2以及小鼠肝细胞癌细胞系Hepa1-6 |
2394 | 2024-10-24 |
Multiple Machine Learning Models, Molecular Subtyping and Singlecell Analysis Identify PANoptosis-related Core Genes and their Association with Subtypes in Crohn's Disease
2024-Oct-21, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究利用多种机器学习模型和单细胞分析技术,识别了与克罗恩病相关的PANoptosis核心基因及其与亚型的关联 | 首次构建了具有良好识别效果的PANoptosis特征,揭示了PANoptosis在克罗恩病中的潜在作用 | NA | 探讨PANoptosis与克罗恩病的关系及其在疾病中的作用机制 | 克罗恩病患者的PANoptosis相关基因及其亚型 | 机器学习 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林、支持向量机、决策树、高斯混合模型 | 基因表达数据 | 多个队列的克罗恩病患者样本 |
2395 | 2024-10-24 |
Perioperative chemoimmunotherapy induces strong immune responses and long-term survival in patients with HLA class I-deficient non-small cell lung cancer
2024-Oct-20, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009762
PMID:39428126
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研究论文 | 研究了围手术期化疗免疫疗法在HLA I类缺陷的非小细胞肺癌患者中的疗效和免疫反应机制 | 首次探讨了围手术期化疗免疫疗法在HLA I类缺陷的非小细胞肺癌患者中的疗效和免疫反应机制 | 样本量较小,需要进一步的大规模研究验证 | 探讨围手术期化疗免疫疗法在HLA I类缺陷的非小细胞肺癌患者中的疗效和免疫反应机制 | HLA I类缺陷的非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化、空间转录组学 | NA | 组织样本 | 24名非小细胞肺癌患者 |
2396 | 2024-10-24 |
Integrative multi-omics analysis reveals the role of tumor-associated endothelial cells and their signature in prognosis of intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Oct-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05750-2
PMID:39427165
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤相关内皮细胞(TECs)与肿瘤微环境(TME)中免疫细胞的相互作用及其对肿瘤预后的影响 | 通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)揭示了TECs在肿瘤血管生成中的作用及其显著异质性,并构建了TEC特征(TEC.Sig),该特征可预测患者对免疫治疗的反应 | 研究主要基于单细胞RNA测序和空间转录组学分析,可能需要更多临床数据验证TEC.Sig的预测能力 | 探讨肿瘤相关内皮细胞与免疫细胞在肿瘤微环境中的相互作用及其对肿瘤预后的影响 | 肿瘤相关内皮细胞(TECs)、免疫细胞、肿瘤微环境(TME) | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学分析 | NA | RNA | 来自肝内胆管癌(ICC)患者的肿瘤、正常和淋巴结组织样本 |
2397 | 2024-10-24 |
Mapping RANKL- and OPG-expressing cells in bone tissue: the bone surface cells as activators of osteoclastogenesis and promoters of the denosumab rebound effect
2024-Oct-18, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00362-4
PMID:39424806
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研究论文 | 本文研究了骨组织中RANKL和OPG表达细胞的定位,探讨了骨表面细胞在破骨细胞生成和地诺单抗反弹效应中的作用 | 首次使用原位杂交技术直接识别通过RANKL/OPG途径激活破骨细胞生成的细胞,并分析了OPG:Fc和PTH处理对RANKL和OPG表达的影响 | 研究主要基于小鼠模型,结果的临床相关性需要进一步验证 | 揭示地诺单抗停药后反弹性骨吸收的细胞机制 | 骨组织中的RANKL和OPG表达细胞 | NA | NA | 原位杂交技术 | NA | RNA | 小鼠样本,包括OPG:Fc和PTH处理组 |
2398 | 2024-10-24 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveal microenvironment disruptions by androgen in mouse ovary
2024-Oct-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111028
PMID:39429789
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了在小鼠卵巢中,雄激素诱导的多囊卵巢综合征(PCOS)样模型中颗粒细胞和膜细胞亚群的功能和数量变化 | 首次在亚群水平上揭示了雄激素对颗粒细胞和膜细胞的影响,特别是GC5和TC2亚群的炎症和脂质代谢活动增强 | 研究仅限于小鼠模型,结果是否适用于人类PCOS患者尚需进一步验证 | 探讨雄激素在多囊卵巢综合征中对卵巢微环境的影响 | 小鼠卵巢中的颗粒细胞和膜细胞亚群 | 数字病理学 | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠PCOS样模型 |
2399 | 2024-10-24 |
Antigen specificity of clonally-enriched CD8+ T cells in multiple sclerosis
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.07.611010
PMID:39282370
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研究论文 | 研究了多发性硬化症(MS)中克隆扩增的CD8+ T细胞的抗原特异性 | 首次综合运用单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析MS患者脑脊液和血液中的CD8+ T细胞,并发现了识别EBV抗原和新模拟表位的CD8+ T细胞克隆型 | 研究样本仅限于治疗前的MS患者和对照组,且样本量较小 | 揭示多发性硬化症中CD8+ T细胞的克隆身份、功能和抗原特异性 | 多发性硬化症患者的脑脊液和血液中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | RNA | 治疗前的MS患者和对照组 |
2400 | 2024-10-24 |
Accurate identification of locally aneuploid cells by incorporating cytogenetic information in single cell data analysis
2024-10-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-75226-2
PMID:39406835
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研究论文 | 本文开发了两种方法partCNV和partCNVH,用于快速准确地检测具有局部拷贝数缺失或扩增的非整倍体细胞,并结合细胞遗传信息进行单细胞数据分析 | 本文提出了两种新方法partCNV和partCNVH,通过结合细胞遗传信息和隐马尔可夫模型,提高了非整倍体细胞检测的准确性和可解释性 | NA | 开发和评估用于检测血液癌症中单细胞非整倍体细胞的新方法 | 血液癌症患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 血液癌症 | 单细胞RNA测序 | 隐马尔可夫模型 | RNA测序数据 | 三个血液癌症患者的单细胞RNA测序数据集 |