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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 2381 - 2400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2381 | 2024-12-24 |
scEGOT: single-cell trajectory inference framework based on entropic Gaussian mixture optimal transport
2024-Dec-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05988-z
PMID:39710672
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scEGOT的单细胞轨迹推断框架，基于熵高斯混合最优传输理论，用于推断细胞分化轨迹 | scEGOT框架具有高解释性和低计算成本，能够应用于单细胞RNA-seq数据并扩展到其他单细胞数据类型如scATAC-seq | NA | 研究细胞分化机制并推断细胞分化轨迹 | 人类原始生殖细胞样细胞（PGCLC）诱导系统 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生成模型 | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2382 | 2024-12-24 |
Elevation of ANXA1 associated with potential protective mechanism against ferroptosis and immune cell infiltration in age-related macular degeneration
2024-Dec-23, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-02163-1
PMID:39710756
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研究论文 | 本研究探讨了铁死亡相关基因及其与免疫细胞浸润在年龄相关性黄斑变性（AMD）中的作用 | 本研究首次揭示了ANXA1在AMD中通过抑制铁死亡和调节免疫细胞浸润发挥潜在保护作用 | 本研究主要基于数据集分析和细胞模型验证，未来需要进一步在临床样本中验证ANXA1的作用 | 探讨铁死亡相关基因及其与免疫细胞浸润在AMD中的作用机制 | 年龄相关性黄斑变性（AMD）患者及正常对照的基因表达和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 老年性疾病 | RT-qPCR, 免疫荧光, CIBERSORT | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自Gene Expression Omnibus的数据集, 细胞模型和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2383 | 2024-12-24 |
A novel human pluripotent stem cell gene activation system identifies IGFBP2 as a mediator in the production of haematopoietic progenitors in vitro
2024-Dec-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94884
PMID:39714446
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研究论文 | 开发了一种新的可诱导CRISPR介导的激活策略（iCRISPRa），用于驱动多个人类多能干细胞中内源性转录因子的表达，以促进体外造血祖细胞的分化 | 首次使用iCRISPRa系统激活内源性转录因子，并发现IGFBP2在造血祖细胞发育中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验，尚未验证该系统在体内环境中的有效性 | 探索从诱导多能干细胞（iPSCs）中生成功能性细胞的方法，并研究造血祖细胞分化的机制 | 人类多能干细胞（iPSCs）及其向造血祖细胞的分化过程 | 干细胞生物学 | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 九个候选转录因子 | NA | NA | NA | NA |
| 2384 | 2024-12-24 |
Programmed cell death pathways in lung adenocarcinoma: illuminating tumor drug resistance and therapeutic opportunities through single-cell analysis
2024-Dec-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01736-0
PMID:39714518
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了程序性细胞死亡途径在肺腺癌中的作用，揭示了肿瘤异质性、免疫浸润和预后的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了程序性细胞死亡途径在肺腺癌中的作用，并发现了铁死亡和焦亡与良好生存结果的显著关联 | 研究仅限于肺腺癌，且样本量未在摘要中明确提及 | 探讨程序性细胞死亡途径在肺腺癌中的作用，揭示肿瘤药物抵抗和治疗机会的机制 | 肺腺癌中的程序性细胞死亡途径，包括凋亡、坏死、焦亡和铁死亡 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2385 | 2024-12-24 |
Exploring the role of Disulfidptosis in glioma progression: insights into tumor heterogeneity and therapeutic potential through single-cell RNA sequencing
2024-Dec-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01685-8
PMID:39714742
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研究论文 | 本研究探讨了Disulfidptosis在胶质瘤进展中的作用，通过单细胞RNA测序揭示肿瘤异质性和治疗潜力 | 首次研究了Disulfidptosis在胶质瘤中的作用，并利用单细胞RNA测序技术揭示了肿瘤异质性和潜在的治疗靶点 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行体内或体外实验验证 | 探讨Disulfidptosis在胶质瘤进展中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 胶质瘤细胞及其对Disulfidptosis的响应 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自胶质瘤患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2386 | 2024-12-24 |
Dynamics of liver cancer cellular taxa revealed through single-cell RNA sequencing: Advances and challenges
2024-Dec-15, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217394
PMID:39689824
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术揭示肝癌细胞动态的研究进展和挑战 | 单细胞RNA测序技术揭示了肝癌异质性和肿瘤微环境的关键分子驱动因素和表型景观 | 本文主要讨论了当前研究的挑战和局限性 | 探讨肝癌细胞动态的研究进展和挑战，推动个性化治疗的发展 | 肝癌的细胞动态、肿瘤微环境及其分子驱动因素 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2387 | 2024-12-24 |
Integrative Protocol for Generation of iPSC-Derived 3D Human Hepatic Organoids
2024-Dec-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67070
PMID:39714036
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研究论文 | 本文描述了一种利用人诱导多能干细胞（hiPSCs）生成3D人肝类器官（HHOs）的优化方法 | 提出了一个从hiPSC生成HHOs的直接3D协议，模拟人类胚胎发育阶段，并优化了细胞解离策略以进行单细胞RNA测序 | NA | 开发一种稳定生成肝细胞培养物的方法，以用于肝脏研究 | 人诱导多能干细胞（hiPSCs）生成的3D人肝类器官（HHOs） | NA | NA | 免疫荧光、定量RT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2388 | 2024-12-24 |
Expanding GABAergic Neuronal Diversity in iPSC-Derived Disease Models
2024-Dec-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.626438
PMID:39677822
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研究论文 | 本研究开发了一种新策略，通过过表达转录因子ASCL1和DLX2并结合双SMAD和WNT抑制，高效驱动人类多能干细胞分化为多种区域特异性的GABA能神经元类型 | 本研究创新性地整合了转录因子过表达与信号通路抑制，成功分化出多样化的GABA能神经元，并揭示了其命运调控机制 | 传统方法在神经分化、培养周期和PSC系间变异性方面存在挑战 | 开发一种新策略以克服传统方法的局限性，并研究GABA能神经元在神经发育和精神疾病中的作用 | 人类多能干细胞衍生的GABA能神经元及其在疾病模型中的应用 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多种区域特异性的GABA能神经元类型 | NA | NA | NA | NA |
| 2389 | 2024-12-24 |
PRDM16 determines specification of ventricular cardiomyocytes by suppressing alternative cell fates
2024-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402719
PMID:39304345
|
研究论文 | 本文研究了转录因子PRDM16在心脏发育早期阶段的作用，特别是其对心室心肌细胞特化的影响 | 首次证明了PRDM16在心肌细胞中通过抑制其他细胞命运来决定心室心肌细胞的特化 | NA | 探讨PRDM16在心脏发育中的作用及其对心室心肌细胞特化的影响 | PRDM16在心脏发育中的功能及其对心室心肌细胞特化的调控机制 | NA | 心血管疾病 | RNA+ATAC单细胞测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2390 | 2024-12-24 |
IGF2BP2 Shapes the Tumor Microenvironment by Regulating Monocyte and Macrophage Recruitment in Bladder Cancer
2024-Dec, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70506
PMID:39711402
|
研究论文 | 本研究探讨了IGF2BP2在膀胱癌肿瘤微环境中的作用，特别是其对单核细胞和巨噬细胞招募的影响 | 首次揭示了IGF2BP2作为m6A阅读子在调节膀胱癌肿瘤微环境中对巨噬细胞招募和极化的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的数据分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨IGF2BP2在膀胱癌肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗效果的影响 | IGF2BP2在膀胱癌中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 来自公共数据库的转录组和单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2391 | 2024-12-24 |
stHGC: a self-supervised graph representation learning for spatial domain recognition with hybrid graph and spatial regularization
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae666
PMID:39710435
|
研究论文 | 提出了一种名为stHGC的自监督图表示学习框架，用于空间域识别，结合了混合图和空间正则化 | 创新点在于提出了stHGC框架，通过混合邻居图和自监督图表示学习方法，有效整合了空间位置和基因表达信息，并引入了空间正则化约束以保留空间邻居的结构信息 | 未提及具体的局限性 | 旨在解决空间转录组学中有效整合空间位置和基因表达信息的挑战，以准确识别空间域 | 研究对象是空间转录组数据中的空间域识别 | 空间转录组学 | NA | 自监督图表示学习 | 图注意力机制 | 空间转录组数据 | 未提及具体的样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 2392 | 2024-12-24 |
A scalable approach to topic modelling in single-cell data by approximate pseudobulk projection
2024-Oct, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402713
PMID:39107066
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研究论文 | 本文提出了一种可扩展的方法ASAP，用于单细胞数据中的主题建模，通过近似伪批量投影来减少计算资源需求 | ASAP方法比现有方法更准确，且计算时间大幅减少，内存消耗更低 | NA | 开发一种适用于单细胞RNA-seq数据分析的可扩展主题建模方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 主题模型 | 基因表达数据 | 大量单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2393 | 2024-12-24 |
PD-L1 regulates inflammatory programs of macrophages from human pluripotent stem cells
2024-02, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302461
PMID:37949473
|
研究论文 | 本文研究了PD-L1在人类多能干细胞衍生的巨噬细胞中的炎症调控作用 | 首次揭示了PD-L1在人类多能干细胞衍生的巨噬细胞中调控炎症程序的作用 | 实验中使用的PD-L1 KO细胞系和抑制剂的具体细节未在摘要中明确说明 | 探讨PD-L1在巨噬细胞发育和炎症调控中的作用 | 人类多能干细胞衍生的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | PD-L1 KO人类多能干细胞及其衍生的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2394 | 2024-12-23 |
Integrated machine learning reveals the role of tryptophan metabolism in clear cell renal cell carcinoma and its association with patient prognosis
2024-Dec-21, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00576-w
PMID:39707545
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研究论文 | 本研究探讨了色氨酸代谢在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与患者预后的关联，并开发了一个基于色氨酸代谢的预测模型 | 首次开发了基于色氨酸代谢的预测模型，用于评估透明细胞肾细胞癌患者的预后和治疗反应 | 实验验证仅限于少数基因和组织样本，需要进一步的临床验证 | 研究色氨酸代谢在透明细胞肾细胞癌中的作用，并开发预测模型以改善患者分层和个性化治疗 | 透明细胞肾细胞癌患者的预后和治疗反应 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、qRT-PCR、Western blot、CCK8实验、transwell实验 | 机器学习模型 | 多组学数据 | 多个数据集和实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2395 | 2024-12-23 |
Single-cell transcriptomics reveal the prognostic roles of epithelial and T cells and DNA methylation-based prognostic models in pancreatic cancer
2024-Dec-21, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-024-01800-0
PMID:39709423
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序和DNA甲基化数据，揭示了胰腺癌中上皮细胞和T细胞的预后作用，并构建了基于DNA甲基化的预后模型 | 首次整合单细胞RNA测序和DNA甲基化数据，构建了基于上皮细胞和T细胞特异性甲基化模式的预后模型 | 研究主要基于TCGA数据集，可能存在样本偏倚，需要进一步在其他数据集上验证 | 探讨胰腺癌中不同细胞类型的预后作用，并开发基于DNA甲基化的预后模型 | 胰腺癌中的上皮细胞和T细胞，以及基于这些细胞的DNA甲基化特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，DNA甲基化 | NA | 基因组数据，临床数据 | 使用了TCGA数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 2396 | 2024-12-23 |
Low expression of CCKBR in the acinar cells is associated with insufficient starch hydrolysis in ruminants
2024-Dec-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07406-9
PMID:39706905
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研究论文 | 本文研究了成年山羊和新生山羊胰腺外分泌功能的差异，并探讨了CCKBR受体表达与反刍动物淀粉消化能力的关系 | 首次结合scRNA-seq和蛋白质组学分析，揭示了成年山羊胰腺外分泌功能优于新生山羊，并发现CCKBR受体在腺泡细胞中的低表达与淀粉水解不足有关 | 研究仅限于山羊，未探讨其他反刍动物的情况 | 探讨反刍动物淀粉消化能力低下的生理机制，为提高淀粉利用率提供理论依据 | 成年山羊和新生山羊的胰腺外分泌功能及CCKBR受体表达 | NA | NA | scRNA-seq, 蛋白质组学分析 | NA | RNA, 蛋白质 | 成年山羊和新生山羊 | NA | NA | NA | NA |
| 2397 | 2024-12-23 |
Crosstalk between CD180-overexpression macrophages and glioma cells worsens patient survival through malignant phenotype promotion and immunosuppressive regulation
2024-Dec-20, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-01029-w
PMID:39707188
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研究论文 | 研究探讨了CD180过表达巨噬细胞与胶质瘤细胞之间的相互作用，揭示了其通过促进恶性表型和免疫抑制调控来恶化患者生存的机制 | 首次揭示了CD180在胶质瘤中的预后作用及其在免疫抑制调控和恶性表型促进中的作用，为胶质瘤的免疫治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 探讨CD180在胶质瘤中的分子机制及其对患者预后的影响 | CD180过表达巨噬细胞与胶质瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 使用了三个胶质瘤细胞系进行共培养实验 | NA | NA | NA | NA |
| 2398 | 2024-12-23 |
Integrating single-cell RNA-Seq and machine learning to dissect tryptophan metabolism in ulcerative colitis
2024-Dec-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05934-w
PMID:39707393
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和机器学习技术，解析了溃疡性结肠炎中色氨酸代谢的异质性及其关键基因 | 首次在单细胞水平揭示了溃疡性结肠炎中色氨酸代谢的异质性，并确定了关键基因CTSS、S100A11和TUBB | NA | 解析溃疡性结肠炎中色氨酸代谢的调控机制及其关键基因 | 溃疡性结肠炎中的色氨酸代谢及其相关基因 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林、Boruta算法、LASSO、SVM-RFE、GBM | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2399 | 2024-12-23 |
C3+ cancer-associated fibroblasts promote tumor growth and therapeutic resistance in gastric cancer via activation of the NF-κB signaling pathway
2024-Dec-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05939-5
PMID:39707456
|
研究论文 | 研究探讨了C3+癌症相关成纤维细胞通过激活NF-κB信号通路促进胃癌生长和治疗抵抗的作用 | 首次揭示了C3+癌症相关成纤维细胞在胃癌中的具体标记物及其通过NF-κB信号通路促进肿瘤进展和治疗抵抗的机制 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在临床试验中验证其治疗策略的有效性 | 探讨C3+癌症相关成纤维细胞在胃癌中的作用及其机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 胃癌中的C3+癌症相关成纤维细胞及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、多重免疫荧光染色、RNA干扰 | NA | RNA序列、免疫荧光图像 | 多个独立胃癌患者队列及体外细胞实验 | NA | NA | NA | NA |
| 2400 | 2024-12-23 |
Single-cell multi-omics analysis reveals candidate therapeutic drugs and key transcription factor specifically for the mesenchymal subtype of glioblastoma
2024-Dec-20, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01332-3
PMID:39707474
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、单核转座酶可及染色质测序和批量RNA测序数据，揭示了胶质母细胞瘤间质亚型的核心基因模块、候选治疗药物和关键转录因子 | 本研究首次通过多组学分析揭示了胶质母细胞瘤间质亚型的核心基因模块、候选治疗药物和关键转录因子，并验证了其在体外和人体样本中的有效性 | 本研究的局限性在于仅聚焦于胶质母细胞瘤的间质亚型，未涵盖其他亚型，且体外实验结果需进一步在临床试验中验证 | 研究胶质母细胞瘤间质亚型的详细特征，发现潜在的治疗策略，并提高对GBM患者的精准治疗 | 胶质母细胞瘤的间质亚型肿瘤细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核转座酶可及染色质测序（snATAC-seq）、批量RNA测序 | NA | 基因组数据 | 55,845个来自肿瘤和邻近正常组织的单细胞 | NA | NA | NA | NA |