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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-08-26 |
Transcriptional and functional remodeling of lung-resident T cells and macrophages by Simian varicella virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408212
PMID:38887303
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研究论文 | 利用单细胞测序和恒河猴模型，研究猿猴水痘病毒（SVV）感染对肺部常驻T细胞和巨噬细胞的转录组和功能重塑 | 首次结合单细胞测序和恒河猴实验模型，揭示SVV感染对肺部常驻T细胞和巨噬细胞的转录组重塑，特别是感染细胞与旁观者细胞的差异表达 | 摘要中未提及 | 明确VZV在感觉神经节潜伏和传播的机制，通过SVV感染模型研究肺部急性免疫反应 | 恒河猴肺部常驻T细胞和巨噬细胞（感染和旁观者） | 单细胞测序、免疫学 | 水痘及带状疱疹 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体数量，但为恒河猴模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2026-08-26 |
Integration of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to construct liver hepatocellular carcinoma stem cell signatures to explore their impact on patient prognosis and treatment
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298004
PMID:38635528
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建肝细胞肝癌干细胞特征，并探讨其对患者预后和治疗的影响 | 构建了基于癌症干细胞相关基因的新型预后风险模型，并评估了其对免疫治疗和化疗药物敏感性的预测能力 | 未提及 | 构建肝细胞肝癌干细胞特征，以预测患者预后并指导治疗策略 | 肝细胞肝癌患者的肿瘤干细胞相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体数量，基于公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2026-08-26 |
A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0303914
PMID:38809858
|
研究论文 | 利用斑马鱼开发了一种基于CRISPR-Cas9的F0靶向筛选，结合单细胞RNA测序、CRISPR反向遗传学和高内涵成像，鉴定出影响肠道神经系统建立的相关基因，并发现阿片受体参与其神经化学编码 | 首次在斑马鱼中建立高效、快速的体内F0 CRISPR筛选流程，整合单细胞RNA测序、CRISPR反向遗传学和高含量成像技术，用于系统性鉴定肠道神经系统发育相关的新基因 | 摘要中未明确指出局限性，可能包括F0嵌合体效果、候选基因功能验证不足或仅针对斑马鱼模型的适用性限制 | 鉴定参与肠道神经系统建立的关键基因，并探索其功能，以增进对神经系统构建的理解 | 斑马鱼体内肠道神经嵴细胞及其发育过程中的肠道神经系统 | 分子生物学 | 先天性巨结肠病 | CRISPR-Cas9 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 224 | 2026-08-26 |
Hub genes identification and validation of ferroptosis in SARS-CoV-2 induced ARDS: perspective from transcriptome analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1407924
PMID:39170609
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研究论文 | 通过转录组分析识别并验证SARS-CoV-2诱导的急性呼吸窘迫综合征中与铁死亡相关的核心基因 | 首次在SARS-CoV-2诱导的ARDS中系统性识别铁死亡相关核心基因，并综合运用WGCNA、差异表达分析、单细胞测序及实验验证 | 需要进一步的实验验证以巩固发现并探索针对COVID-19背景下ARDS的治疗干预措施 | 探究铁死亡在SARS-CoV-2诱导的ARDS中的潜在作用及识别潜在诊断标志物和治疗靶点 | COVID-19患者中不同严重程度的ARDS以及BEAS-2B细胞体外模型 | 生物信息学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 转录组分析 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 包含COVID-19患者数据及BEAS-2B细胞系 | NA | 转录组测序 | NA | NA |
| 225 | 2026-08-26 |
Exploring the molecular mechanisms of macrophages in islet transplantation using single-cell analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1407118
PMID:39267737
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研究论文 | 利用单细胞分析探索胰岛移植中巨噬细胞的分子机制，揭示了同种异体移植中巨噬细胞亚群的异质性及其在免疫排斥中的作用。 | 通过单细胞RNA测序对胰岛移植中的巨噬细胞进行无偏聚类，首次鉴定出三个不同的巨噬细胞亚群，并揭示了其分化轨迹和细胞因子响应差异，为移植免疫机制提供了新见解。 | 研究基于公开数据集，可能受限于样本量和数据质量，且缺乏功能实验验证。 | 阐明胰岛移植中巨噬细胞的异质性及其在移植排斥和存活中的分子机制，寻找潜在治疗靶点。 | 胰岛移植移植物中的巨噬细胞。 | 单细胞分析 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类、Monocle 2轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 来自GSE198865数据集的同系和异系胰岛移植移植物样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2026-08-26 |
A CD8+ T cell related immune score predicts survival and refines the risk assessment in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408109
PMID:39346926
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研究论文 | 本研究通过构建CD8+ T细胞相关的15基因预后签名（CTCG15），结合CIBERSORTx与单细胞测序及流式细胞术验证，以提高急性髓系白血病患者的风险分层和预后预测能力 | 首次开发了基于CD8+ T细胞相关基因的预后风险评分CTCG15，并验证其与2022年欧洲白血病网络（ELN）整合后能显著提升预后预测效能 | 未明确提及研究的局限性 | 开发并验证CD8+ T细胞相关的免疫风险评分，以改善急性髓系白血病患者的风险分层和预后预测 | 急性髓系白血病（AML）患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq、单细胞RNA测序、流式细胞术、LASSO回归 | LASSO回归模型 | 基因表达数据和临床数据 | 多个数据集，包括六个不同平台，具体样本数量未明确 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |
| 227 | 2026-08-26 |
Immunological characteristics of bronchoalveolar lavage fluid and blood across connective tissue disease-associated interstitial lung diseases
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408880
PMID:39524435
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析支气管肺泡灌洗液和血液中的免疫细胞，以阐明结缔组织病相关间质性肺病的免疫学特征 | 首次通过单细胞RNA测序全面分析CTD-ILD患者BALF和血液中的免疫细胞，揭示不同CTD-ILD亚型特有的免疫特征 | 样本量较小（39例），且未进行功能验证实验 | 阐明结缔组织病相关间质性肺病的免疫学特征，为理解发病机制和发现潜在生物标志物提供依据 | 39名新诊断ILD患者（包括干燥综合征、皮肌炎、类风湿关节炎、系统性硬化症、ANCA相关血管炎和特发性间质性肺炎）的BALF和血液免疫细胞 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 39例患者（BALF和血液样本） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 228 | 2026-08-25 |
Reconstruction of single-cell lineage trajectories and identification of diversity in fates during the epithelial-to-mesenchymal transition
2024-08-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2406842121
PMID:39093947
|
研究论文 | 本研究采用最优传输分析重建了TGF-β诱导MCF10A细胞系上皮间质转化过程中的单细胞谱系轨迹，并识别了不同细胞命运的多样性。 | 利用最优传输分析在无需牺牲细胞的情况下重建EMT过程中的过去轨迹，精确识别了低EMT、部分EMT和高EMT三种不同轨迹，并精确定位了关键基因（如JUN、FOS、MYC等）在不同轨迹早期阶段的差异表达时间点。 | 摘要中未明确提及局限性。 | 探究上皮间质转化过程中早期细胞状态如何分化成不同命运轨迹的精确时间和机制。 | TGF-β诱导的MCF10A细胞系中的细胞状态和命运轨迹。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 最优传输 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 229 | 2026-08-25 |
Opening the Black Box: Spatial Transcriptomics and the Relevance of Artificial Intelligence-Detected Prognostic Regions in High-Grade Serous Carcinoma
2024-07, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100508
PMID:38704029
|
研究论文 | 本研究结合人工智能识别与空间转录组学，分析高级别浆液性癌中与预后相关的肿瘤区域，揭示其分子特征 | 首次将人工智能检测的预后相关区域与空间转录组学相结合，以探索传统形态学无法区分的肿瘤区域的分子特征 | 样本量较小（16例患者），且研究为概念验证性质，可能需要更大规模的研究来验证发现 | 通过空间转录组学分析人工智能识别的高级别浆液性癌预后相关区域，以增进对疾病结局相关生物学特征的理解 | 16例高级别浆液性癌患者的肿瘤组织，包括人工智能识别为与化疗反应相关区域及背景肿瘤区域 | 数字病理学 | 高级别浆液性癌 | 空间转录组学 | 人工智能（深度学习）模型 | 图像与转录组数据 | 16例患者，每例包含人工智能识别的区域和背景区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 230 | 2026-08-25 |
Quantitative Multiplexed Analysis of Indoleamine 2,3-Dioxygenase (IDO) and Arginase-1 (ARG1) Expression and Myeloid Cell Infiltration in Colorectal Cancer
2024-04, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100450
PMID:38369188
|
研究论文 | 本研究使用定制10重免疫组化分析和监督机器学习数字图像分析，评估了833例结直肠癌患者中IDO和ARG1的表达及髓系细胞浸润，并探讨了其预后价值和空间分布 | 首次在大型结直肠癌队列中结合多重免疫组化和机器学习进行定量空间分析，揭示IDO和ARG1在不同髓系细胞及肿瘤细胞中的分布模式及其预后意义 | 研究基于观察性数据，未进行功能实验验证，且IDO/ARG1表达分析依赖于特定抗体和算法，可能影响结果的普适性 | 阐明IDO和ARG1在结直肠癌微环境中的表达模式、空间分布及预后价值，以理解宿主免疫反应在肿瘤进展中的作用 | 833例结直肠癌患者的肿瘤组织样本，包括单核细胞、粒细胞、肥大细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化, 机器学习, 单细胞RNA测序 | 监督机器学习模型 | 图像, 基因表达数据 | 833例结直肠癌患者的组织样本及62例单细胞RNA测序数据 | NA | 免疫组化, 单细胞RNA-seq | NA | 定制10重免疫组化检测，单细胞RNA测序使用公共数据 |
| 231 | 2026-08-25 |
Enabling methanol fixation of pediatric nasal wash during respiratory illness for single cell sequencing in comparison with fresh samples
2024-02, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-023-02780-2
PMID:37758866
|
研究论文 | 本研究开发了一种使用甲醇固定的儿科鼻洗液样本进行单细胞RNA测序的方案，并与新鲜样本进行比较，发现两者在定性和定量参数上无显著差异 | 首次提出并验证了甲醇固定儿科鼻洗液样本用于单细胞RNA测序的方案，解决了临床样本处理灵活性不足和多中心协作受限的问题 | 研究为试点研究，样本量可能有限，且仅针对住院儿童的下呼吸道感染患者，可能无法推广至其他人群或疾病 | 开发并验证一种利用甲醇固定的儿科鼻洗液样本进行单细胞RNA测序的方案，以克服临床样本处理的挑战，并促进多中心合作 | 患有下呼吸道感染的住院儿童的鼻洗液样本 | 机器学习和数字病理学 | 下呼吸道感染（包括肺炎、支气管炎和细支气管炎） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和甲醇固定 | NA | 单细胞基因表达数据 | 试点研究，具体样本数量未在标题和摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2026-08-25 |
Comparative study on differential expression analysis methods for single-cell RNA sequencing data with small biological replicates: Based on single-cell transcriptional data of PBMCs from COVID-19 severe patients
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299358
PMID:38536877
|
研究论文 | 本文比较了8种差异表达分析方法在少量生物学重复下的单细胞RNA测序数据中的性能，特别关注它们在模拟和真实数据上的适应性。 | 首次系统评估了多种差异表达分析方法在少量生物学重复条件下的性能，并发现基于信息熵的新方法DEF-scRNA-seq具有显著优势。 | 未提及具体局限性。 | 评估不同差异表达分析方法在少量生物学重复下的适用性，为研究人员提供选择建议。 | 来自COVID-19重症患者外周血单个核细胞（PBMCs）的单细胞转录组数据，以及模拟数据集。 | 自然语言处理 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量，但涉及PBMCs数据。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2026-08-25 |
Clusterin knockdown has effects on intracellular and secreted von Willebrand factor in human umbilical vein endothelial cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298133
PMID:38363768
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研究论文 | 本研究探讨了簇蛋白（CLU）敲低对人脐静脉内皮细胞中细胞内和分泌型血管性血友病因子（VWF）的影响。 | 首次基于单细胞RNA测序分析发现CLU是VWF的潜在调控因子，并利用siRNA和CRISPR-Cas9两种方法验证CLU敲低对VWF蛋白水平的影响，但未改变VWF mRNA或Weibel-Palade小体。 | 研究仅在人脐静脉内皮细胞中进行，未在体内模型中验证；且未深入探讨CLU调控VWF的分子机制。 | 评估CLU在VWF调控中的作用，特别是与血管性血友病（VWD）的相关性。 | 人脐静脉内皮细胞（HUVECs）以及来自对照和VWD患者的内皮集落形成细胞（ECFCs）。 | 分子生物学 | 血管性血友病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、siRNA敲低、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据、蛋白水平数据、细胞形态学数据 | 未明确样本数量，但包括对照和VWD患者的ECFCs以及HUVECs | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 234 | 2026-08-25 |
Comprehensive analysis of single cell and bulk data develops a promising prognostic signature for improving immunotherapy responses in ovarian cancer
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298125
PMID:38346070
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，开发了一种用于改善卵巢癌免疫治疗反应的新型预后签名。 | 利用单细胞和批量数据的综合分析解码肿瘤异质性，并基于候选基因构建了稳定的细胞特征相关预后签名（CCIS），该签名在预后评估和患者分层中表现优异。 | 研究基于公共数据集，可能缺乏外部验证和前瞻性临床验证。 | 开发一种用于卵巢癌预后评估和免疫治疗反应预测的基因签名，以改善临床决策。 | 卵巢癌患者，涉及E-MTAB-8107、TCGA-OV、GSE63885和GSE26193四个公共数据集。 | 机器学习和数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 随机森林算法、Cox回归 | 基因表达数据和临床数据 | 包含四个公共数据集，涉及卵巢癌患者样本，具体样本数未在摘要中说明。 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2026-08-25 |
sc2MeNetDrug: A computational tool to uncover inter-cell signaling targets and identify relevant drugs based on single cell RNA-seq data
2024-01, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011785
PMID:38181047
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研究论文 | 开发了一个基于单细胞RNA测序数据的计算工具sc2MeNetDrug，用于识别细胞类型、揭示细胞间信号通讯并预测潜在有效药物。 | 首次专门设计用于基于scRNA-seq数据揭示微环境中的细胞间通讯并预测抑制这些通讯的潜在药物，同时提供用户友好的图形界面以简化复杂分析流程。 | 未提及具体局限性。 | 开发一个开源计算工具，以简化scRNA-seq数据分析，识别疾病微环境中的细胞类型、异常信号通路和细胞间相互作用，并预测可干扰细胞间信号通讯的有效药物。 | 疾病微环境中的细胞，如肿瘤细胞或阿尔茨海默病大脑中的神经元，以及基质细胞和免疫细胞。 | 生物信息学 | 癌症及阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2026-08-25 |
Single-cell RNA-seq analysis revealed the stemness of a specific cluster of B cells in acute lymphoblastic leukemia progression
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18296
PMID:39465162
|
研究论文 | 利用单细胞RNA-seq分析，揭示急性淋巴细胞白血病进展中特定B细胞群的干性特征及其在免疫微环境中的关键作用 | 首次通过单细胞测序识别出与细胞增殖和干性相关的B细胞亚群（B cells 1），并发现其通过RXRB和MYC等关键转录因子调控肿瘤进展，为ALL靶向治疗提供新方向 | 未提及 | 探索B细胞在急性淋巴细胞白血病进展中的异质性及其对免疫微环境的调节作用 | 儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）样本和健康样本中的B细胞 | 单细胞转录组学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、Transwell实验、划痕愈合实验 | 无特定模型 | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 未明确样本数量，但包含ALL和健康样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于GEO数据库的公共数据，使用Seurat和harmony包分析，CellMarker2.0进行细胞注释 |
| 237 | 2026-08-24 |
Endothelial cell diversity: the many facets of the crystal
2024-08, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16660
PMID:36266750
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综述 | 本文综述了内皮细胞在不同器官和病理条件下的分子异质性，探讨其多样性及其功能意义 | 利用单细胞RNA测序、谱系追踪和交叉遗传学等先进技术，全面揭示了内皮细胞在时间和空间上的分子与功能异质性，突破了传统对内皮细胞仅具有交换功能的认知 | 未提及具体局限性 | 阐明内皮细胞在不同器官和血管床中的分子异质性及其在生理和病理条件下的作用 | 内皮细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪、交叉遗传学 | NA | 基因表达数据、表观基因组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 238 | 2026-08-23 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify COL6A3 as a prognostic biomarker in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2024-11-15, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02168-8
PMID:39548577
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析，确定COL6A3作为未分化多形性肉瘤的预后生物标志物 | 首次结合单细胞和空间转录组学方法，在未分化多形性肉瘤及其亚型中识别出COL6A3作为预后生物标志物，并优于现有肉瘤预后基因面板 | 样本量相对较小，仅包含5个活检标本和1个切除标本，可能限制结果的广泛适用性 | 通过单细胞和空间转录组学表征未分化多形性肉瘤及其相关肿瘤，并寻找预后生物标志物 | 未分化多形性肉瘤（包括非典型纤维黄瘤和皮肤多形性肉瘤）的活检和切除标本 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 5个活检标本和1个切除标本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 239 | 2026-08-23 |
Hunger signalling in the olfactory bulb primes exploration, food-seeking and peripheral metabolism
2024-Nov, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102025
PMID:39236785
|
研究论文 | 本研究探讨了嗅球中饥饿素受体（GHSR）如何影响嗅觉功能、觅食行为及外周代谢。 | 首次通过条件性基因敲除小鼠模型，证明嗅球GHSR在饥饿状态下对嗅觉功能、探索行为和代谢调节的关键作用，并结合单细胞和空间转录组数据鉴定GHSR+神经元类型。 | 研究主要基于小鼠模型，未涉及人类；未深入探究GHSR下游信号通路的具体分子机制。 | 阐明嗅球中GHSR在调节嗅觉功能、觅食行为及代谢过程中的作用机制。 | 小鼠（嗅球GHSR缺失小鼠及对照） | 神经科学 | NA | 行为学分析、scRNA-seq、空间转录组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、行为数据、代谢数据 | 未明确，涉及小鼠模型和多组学数据集 | 未明确（可能包含10x Genomics） | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 未明确 | 未明确 |
| 240 | 2026-08-23 |
STIE: Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in in situ capturing-based spatial transcriptomics
2024-08-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51728-5
PMID:39214995
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研究论文 | 提出STIE算法，基于原位捕获空间转录组数据，通过整合组织学图像核形态实现单细胞水平的解卷积、卷积和聚类 | 首次实现原位捕获空间转录组数据在单细胞水平的全切片尺度分析，通过期望最大化算法对齐转录组与组织学图像，并恢复约70%间隙区域的缺失细胞 | 未在摘要中明确提及局限性 | 实现原位捕获空间转录组数据的单细胞水平分析，提高细胞类型特异基因表达推断的准确性，并揭示单细胞水平的空间生物学见解 | 原位捕获空间转录组数据及其匹配的组织学图像 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 期望最大化算法 | 空间转录组数据和组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |