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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-04-11 |
Side- and Disease-Dependent Changes in Human Aortic Valve Cell Population and Transcriptomic Heterogeneity Determined by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121623
PMID:39766890
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了人类主动脉瓣膜中细胞群体和转录组异质性在瓣膜不同侧面及疾病进展中的变化 | 首次采用新的取样方法,独立收集主动脉瓣膜纤维侧和心室侧的富集内皮细胞样本进行单细胞RNA测序,揭示了瓣膜内皮细胞在侧面和疾病依赖下的高度异质性,并识别出多个与疾病相关的独特细胞亚群和转录因子 | 样本量较小(仅5名捐赠者),且样本涵盖了从非病变到纤维钙化阶段的不同疾病状态,可能限制了统计效力或对特定疾病阶段的深入分析 | 探究钙化性主动脉瓣膜病(CAVD)在瓣膜纤维侧优先发展的细胞和分子机制 | 人类主动脉瓣膜细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名捐赠者的主动脉瓣膜小叶,共分析82,356个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 222 | 2026-04-11 |
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.626682
PMID:39713308
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3功能获得性突变综合征中CD8+ T细胞功能失调的分子机制,重点关注嘌呤能信号通路的改变 | 首次揭示STAT3 GOF变异通过改变CD39、CD73和A2AR表达,导致嘌呤能信号失调,从而驱动CD8+ T细胞病理 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型,机制细节仍需进一步验证 | 阐明STAT3 GOF变异导致CD8+ T细胞功能失调的分子机制 | STAT3 GOF患者和小鼠模型中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫调节障碍 | 单细胞RNA测序、高维免疫分析、功能评估 | NA | 基因表达数据、功能数据 | STAT3 GOF患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2026-04-11 |
Isolation and Comprehensive Analysis of Cochlear Tissue-Derived Small Extracellular Vesicles
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408964
PMID:39497619
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研究论文 | 本研究评估了三种耳蜗组织消化及耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV)分离方法,首次提出使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为最优分离方法,并全面分析了CDsEV的内容物和细胞来源 | 首次提出并验证了使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的最优分离方法,并首次通过单CDsEV测序与单细胞RNA测序数据的联合分析来追踪CDsEV的细胞来源 | 研究主要基于方法学优化和初步分析,未深入探讨CDsEV在耳蜗疾病中的具体作用机制或进行大规模临床验证 | 评估耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的分离方法,并分析其内容物和细胞来源,以增强对耳蜗内CDsEV功能的理解 | 耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV)及其内容物(miRNAs和蛋白质) | 生物医学研究 | 听力相关疾病 | 小RNA测序、蛋白质组学、单CDsEV测序、单细胞RNA测序 | NA | 测序数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2026-04-11 |
Targeting immune-fibroblast cell communication in heart failure
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08008-5
PMID:39443792
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞分析揭示了心力衰竭中免疫细胞与成纤维细胞间的通讯机制,并验证了靶向IL-1β信号通路可减轻心肌纤维化并改善心脏功能 | 首次在人类心脏疾病中系统解析免疫-成纤维细胞通讯的分子机制,并发现CCR2巨噬细胞通过IL-1β信号驱动FAP/POSTN成纤维细胞分化的空间特异性机制 | 样本量相对有限(45例),且主要依赖观察性数据和动物模型验证,未涉及长期临床疗效评估 | 探究人类心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞通讯的分子机制,并开发针对心肌纤维化的治疗策略 | 健康供体、急性梗死和慢性心力衰竭的人类心脏组织样本,以及小鼠心脏损伤模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞多组学分析(基因表达、表位定位、染色质可及性)、空间转录组学、遗传谱系追踪 | NA | 单细胞基因表达数据、表位数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 45例人类心脏样本(包括健康、急性梗死和慢性心力衰竭)及多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 225 | 2026-04-11 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52490-4
PMID:39294132
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研究论文 | 本文提出了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性的顺式调控元件及其调控基因 | 开发了一种将高度多重CRISPRa扰动与scRNA-seq结合的新方法,首次在单细胞水平上系统评估细胞类型特异性增强子和启动子对基因表达的调控作用 | 研究仅针对K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元两种细胞类型,未涵盖更广泛的细胞类型或体内环境 | 开发一种高通量筛选方法,以识别细胞类型特异性的CRISPRa响应顺式调控元件及其靶基因 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用493个gRNA靶向候选顺式调控元件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 226 | 2026-04-11 |
In vivo single-cell CRISPR uncovers distinct TNF programmes in tumour evolution
2024-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07663-y
PMID:39020166
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研究论文 | 本研究开发了一种体内单细胞CRISPR策略,系统性研究了150个最常见突变的鳞状细胞癌基因在组织范围内的克隆动态,揭示了肿瘤坏死因子(TNF)信号模块在肿瘤演化中的不同作用 | 开发了结合超声引导子宫内慢病毒显微注射、单细胞RNA测序和引导捕获的体内单细胞CRISPR筛选策略,首次在哺乳动物组织中纵向监测克隆扩张并记录其单细胞转录组水平的基因程序 | 研究主要聚焦于鳞状细胞癌相关基因,其他癌症类型的普适性有待验证;体内模型的复杂性可能限制某些机制的完全解析 | 探究正常组织中克隆扩张的机制,以及为何仅有少数克隆最终转化为恶性肿瘤 | 鳞状细胞癌相关基因、上皮组织克隆、肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞CRISPR筛选、单细胞RNA测序、引导捕获测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及150个最常见突变的鳞状细胞癌基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 227 | 2026-04-11 |
Elucidating the Transcriptional States of Spermatogenesis-Joint Analysis of Germline and Supporting Cell, Mice and Human, Normal and Perturbed, Bulk and Single-Cell RNA-Seq
2024-07-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070840
PMID:39062554
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综述 | 本文综述了精子发生研究的分子基础,强调通过整合分析(包括正常与病理状态、小鼠与人类数据、表型与分子谱、生殖细胞与支持细胞)来推进对男性不育精准医学的理解 | 提出了精子发生研究的四个整合轴,结合单细胞RNA测序等先进技术,揭示生殖细胞发育新阶段和睾丸微环境中的未知细胞亚型 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且依赖于现有研究的整合,可能受限于当前技术和方法的不完全覆盖 | 阐明精子发生的转录状态,以促进对男性不育的精准医学诊断和治疗策略的开发 | 生殖细胞(如精原细胞)和支持细胞(如Sertoli细胞和Leydig细胞),涉及小鼠和人类样本 | 自然语言处理 | 男性不育 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 228 | 2026-04-11 |
Targeting Microglia in Alzheimer's Disease: Pathogenesis and Potential Therapeutic Strategies
2024-07-11, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070833
PMID:39062547
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综述 | 本文综述了小胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用,并探讨了以该细胞为靶点的潜在治疗策略 | 系统总结了基于单细胞测序技术揭示的小胶质细胞在AD病程中的动态表型变化,并提出了针对小胶质细胞功能增强与神经炎症抑制的双重治疗策略框架 | NA | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用机制并探索相关治疗策略 | 小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2026-04-11 |
Pan-cancer analysis of super-enhancer-induced LINC00862 and validation as a SIRT1-promoting factor in cervical cancer and gastric cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101982
PMID:38718436
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研究论文 | 本文通过泛癌分析探讨了LINC00862的生物学意义,并验证了其在宫颈癌和胃癌中作为SIRT1促进因子的作用 | 揭示了LINC00862作为超级增强子诱导的基因,通过竞争性结合miR-29c-3p释放SIRT1的促癌功能,并验证了其作为免疫治疗疗效预测生物标志物的潜力 | NA | 探索LINC00862在泛癌中的生物学意义及其作为免疫治疗生物标志物的潜力 | LINC00862基因在多种癌症中的表达及其调控机制 | 生物信息学 | 宫颈癌,胃癌 | 生物信息学分析,染色质免疫沉淀,RNA免疫沉淀,虚拟筛选,体外和体内实验 | NA | TCGA数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 230 | 2026-04-11 |
Accurate Identification of Spatial Domain by Incorporating Global Spatial Proximity and Local Expression Proximity
2024-06-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060674
PMID:38927077
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研究论文 | 本文提出了一种名为SECE的深度学习方法,用于准确识别空间转录组学数据中的空间域,通过整合全局空间邻近性和局部表达邻近性来优化组织微环境和生物功能分析 | SECE方法首次同时捕捉局部和全局空间关系,并利用表达相似性和空间相似性聚合信息,克服了现有方法仅基于局部或全局关系进行分割的局限性 | NA | 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性,以更好地阐明组织微环境和生物功能 | 空间转录组学数据中的空间点(spots) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间转录组学数据 | 六个真实空间转录组学数据集,涵盖四个不同平台 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 231 | 2026-04-11 |
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07478-x
PMID:38839950
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研究论文 | 本研究揭示了MYCT1在调控人类造血干细胞内吞和环境感知中的关键作用,以维持干细胞特性 | 首次将MYCT1识别为人类造血干细胞的关键调节因子,通过控制内吞作用和环境感知来维持干细胞特性,并发现其在细胞培养中下调是HSC扩增的脆弱点 | 研究主要基于胎儿肝脏和脐带血来源的HSPCs,未涉及成人或其他来源的造血干细胞,且机制细节如MYCT1与信号通路的相互作用需进一步探索 | 探究人类造血干细胞自我更新和移植能力的调控机制,以改善体外培养扩增功能 | 人类造血干细胞和祖细胞(HSPCs),包括胎儿肝脏和脐带血来源 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,慢病毒介导的基因敲低和过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胎儿肝脏和脐带血HSPCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 232 | 2026-04-11 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534017
PMID:37034704
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研究论文 | 本文介绍了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性调控元件及其调控基因 | 开发了一种新方法,通过随机组合多个gRNA并利用单细胞RNA测序分析,系统性地测试CRISPRa对增强子和启动子的扰动效果,实现了细胞类型特异性调控元件的大规模筛选 | 方法可能依赖于细胞特定的染色质景观或额外作用因子,限制了在某些细胞类型中的普适性,且样本规模相对较小 | 旨在识别细胞类型特异性、CRISPRa响应的调控元件,以促进基因治疗中靶向基因激活的gRNA筛选 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因编辑与单细胞组学 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用493个gRNA靶向候选调控元件,在K562细胞和iPSC衍生神经元中进行测试 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 233 | 2026-04-11 |
Universal recording of immune cell interactions in vivo
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07134-4
PMID:38448581
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研究论文 | 本文报道了一种名为uLIPSTIC的通用技术,用于在体内记录免疫细胞之间以及免疫与非免疫细胞之间的瞬时物理相互作用 | 开发了通用版本的LIPSTIC技术,不再依赖特定受体-配体通路,能够记录任意细胞间的物理相互作用 | 未明确提及技术本身的局限性,但暗示了先前版本仅能测量特定细胞间相互作用的限制 | 开发一种通用技术以在体内记录细胞间的物理相互作用 | 免疫细胞(如CD8 T细胞、树突状细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞)与非免疫细胞(如肠道上皮细胞) | 免疫学 | NA | LIPSTIC/uLIPSTIC技术,单细胞转录组学 | NA | 分子标记数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2026-04-10 |
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202406153
PMID:39313983
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微孔微针与CAR-TREM2-巨噬细胞的策略,通过调节纤维化微环境来管理疤痕 | 工程化构建了能够靶向DPP4成纤维细胞并调节疤痕微环境中内皮细胞亚型的CAR-TREM2-巨噬细胞,并首次将其与微孔微针递送系统结合用于疤痕治疗 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序分析,缺乏大规模的体内长期疗效和安全性验证 | 开发一种通过多因子调节疤痕微环境来抑制疤痕形成的有效治疗策略 | 皮肤损伤后的疤痕组织,重点关注DPP4阳性成纤维细胞、异质性血管内皮细胞和TREM2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤疤痕 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2026-04-10 |
Harnessing Porphyrin Accumulation in Liver Cancer: Combining Genomic Data and Drug Targeting
2024-08-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14080959
PMID:39199347
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研究论文 | 本研究通过基因组数据和单细胞RNA测序,揭示了肝癌中血红素生物合成过程的异常,即“卟啉过度驱动”,导致中间代谢物积累,并探讨了靶向此过程的药物协同策略 | 首次在肝癌中发现“卟啉过度驱动”现象,将血红素中间代谢物积累与肿瘤生存及患者预后不良联系起来,并提出了靶向治疗的药物协同策略 | 研究主要基于体外概念验证数据,缺乏体内实验验证,且样本规模和临床转化潜力未明确说明 | 探究健康和癌变肝脏中血红素和卟啉代谢的差异,以识别肝癌治疗的新靶点 | 人类肝脏组织,包括健康肝脏和肝癌样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNAseq),转录组学分析 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2026-04-10 |
Spatial transcriptomics reveal neuron-astrocyte synergy in long-term memory
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07011-6
PMID:38326616
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研究论文 | 本研究利用空间和单细胞转录组学揭示了基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子结构 | 首次结合单细胞RNA测序和单分子空间转录组学技术,在完整脑切片中提供了长期记忆印迹的丰富空间图谱,并揭示了神经元与星形胶质细胞之间的协同作用 | NA | 阐明基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子机制 | 基底外侧杏仁核中的神经元和星形胶质细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 237 | 2026-04-10 |
Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites
2024-02-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7481
PMID:38354249
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研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过减少血流再循环并激活代谢转导酶SCD1来催化保护性脂质代谢物,从而改善血管内皮功能 | 首次揭示了运动通过调节血流动力学(如减少再循环和振荡剪切指数)并激活内皮SCD1酶,催化油酸和棕榈油酸等抗炎脂质代谢物,为血管保护提供新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证;SCD1的具体信号通路和长期效应需进一步探索 | 探究运动如何通过代谢转导酶SCD1介导血管保护作用,以改善心脏代谢疾病 | 野生型小鼠、内皮特异性SCD1敲除小鼠、高脂饮食诱导的小鼠模型以及小鼠主动脉组织 | NA | 心血管疾病 | 非靶向代谢组学分析、单细胞转录组学、计算机模拟分析、腺病毒转染 | NA | 代谢组数据、转录组数据、计算机模拟数据 | 未明确指定样本数量,涉及多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2026-04-10 |
Hypoblast from human pluripotent stem cells regulates epiblast development
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06871-2
PMID:38052228
|
研究论文 | 本研究通过遗传和非遗传方法从人类多能干细胞生成真正的下胚层细胞,并构建了模拟胚胎发育的三维双层结构 | 首次从人类多能干细胞生成真实的下胚层细胞,并成功构建了能模拟胚胎前后轴模式和前原肠胚阶段细胞形成的三维双层结构 | 研究受限于体外模型,可能无法完全复制体内胚胎发育的复杂性 | 研究人类胚胎发育过程中下胚层和滋养外胚层对胚胎发育的调控机制 | 人类多能干细胞、下胚层细胞、滋养外胚层细胞、三维双层结构 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 239 | 2026-04-09 |
Integrative Protocol for Generation of iPSC-Derived 3D Human Hepatic Organoids
2024-12-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67070
PMID:39714036
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研究论文 | 本文描述了一种利用人诱导多能干细胞生成三维人源肝类器官的优化方案 | 提出了一种从hiPSC到三维肝类器官的简化、标准化流程,并整合了适用于单细胞RNA测序的优化解离策略 | 方案耗时较长(46-50天),且未在多种疾病模型或大规模药物筛选中验证其普适性 | 建立稳定的人源肝细胞三维培养体系,用于肝脏发育研究、疾病建模、药物开发和移植潜力探索 | 人诱导多能干细胞衍生的三维肝类器官 | 干细胞与类器官技术 | 肝脏疾病 | 免疫荧光、定量RT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 240 | 2026-04-09 |
PRDM16 determines specification of ventricular cardiomyocytes by suppressing alternative cell fates
2024-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402719
PMID:39304345
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子PRDM16在心脏发育中通过抑制替代细胞命运来指定心室心肌细胞身份的关键作用 | 首次揭示PRDM16通过抑制心室传导系统和心房命运的主调控因子活性,促进心室工作心肌细胞身份,并利用单细胞RNA+ATAC测序技术验证其在二元细胞命运决定中的功能 | 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中直接验证;PRDM16表达在出生后下降,其长期影响需进一步探究 | 探究PRDM16在心脏发育中对心室心肌细胞身份决定的作用机制 | 小鼠心脏发育过程中的心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |