单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7465 篇文献，本页显示第 2341 - 2360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2341 | 2025-10-07 |
Comparative analysis of rhesus macaque and human placental organoids highlights evolutionary differences in placentation
2024-Oct-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.11.617873
PMID:39416122
|
研究论文 | 通过建立猕猴和人类胎盘类器官模型，比较分析两者在胎盘形成过程中的进化差异 | 首次建立猕猴胎盘类器官模型，并通过单细胞RNA测序揭示猕猴与人类滋养细胞转录特征的异同 | 仅比较了猕猴和人类两个物种，可能无法完全代表所有灵长类的胎盘进化特征 | 探究灵长类胎盘进化的分子机制和物种间差异 | 猕猴和人类的胎盘组织及衍生的类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 猕猴和人类胎盘类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2342 | 2025-10-07 |
Unraveling the phenotypic states of human innate-like T cells: Comparative insights with conventional T cells and mouse models
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114705
PMID:39264810
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了人类先天样T细胞与传统T细胞的转录特征 | 揭示了人类先天样T细胞不分化成多个效应亚群而是发展混合型1/型17效应潜能的独特特征，并发现人类缺乏2型T细胞的物种特异性差异 | 研究主要关注人类和小鼠的比较，可能不适用于其他物种的免疫机制 | 探索先天样T细胞与传统T细胞的转录特征差异及其发育途径 | 人类胸腺和血液中的先天样T细胞和传统T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2343 | 2025-10-07 |
Molecular and spatial signatures of human and rat corpus cavernosum physiopathological processes at single-cell resolution
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760
PMID:39299236
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组测序，绘制了人类和大鼠阴茎海绵体在正常和疾病状态下的空间细胞图谱 | 首次在分子水平揭示了人类和大鼠阴茎海绵体的空间异质性，并发现了机械力信号在不同区域的分布差异 | 研究仅涉及人类和大鼠两个物种，且体外实验条件可能与体内环境存在差异 | 探究阴茎海绵体在生理和病理状态下的分子解剖结构和细胞异质性 | 人类和大鼠的阴茎海绵体组织 | 单细胞生物学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类和大鼠阴茎海绵体样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 2344 | 2025-10-07 |
Bioinformatics and machine learning approaches reveal key genes and underlying molecular mechanisms of atherosclerosis: A review
2024-Aug-02, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000038744
PMID:39093811
|
综述 | 通过生物信息学和机器学习方法探索动脉粥样硬化的关键基因及分子机制 | 整合多种生物信息学工具和机器学习算法识别动脉粥样硬化的关键基因，并首次分析其与铁死亡基因的关联 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 揭示动脉粥样硬化的遗传调控机制和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化相关基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因表达分析 | LASSO回归，随机森林 | 基因表达数据 | GSE20129和GSE90074数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2345 | 2025-10-07 |
Cell-cell communication and initial population composition shape the structure of potato spindle tuber viroid quasispecies
2024-Mar-29, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae012
PMID:38252648
|
研究论文 | 本研究探讨细胞间通讯和初始种群组成如何影响马铃薯纺锤块茎类病毒准种结构的形成 | 首次通过比较缺乏胞间连丝的成熟保卫细胞和离体培养的叶肉原生质体，揭示细胞间通讯对类病毒准种结构的影响 | 研究仅针对马铃薯纺锤块茎类病毒中间株系，结果可能不适用于其他类病毒或病毒 | 阐明类病毒准种结构的形成机制 | 马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)及其变异体 | 植物病理学 | 植物病毒感染 | 单细胞测序,共感染实验 | NA | 基因组序列数据 | 番茄植株的保卫细胞和叶肉原生质体 | NA | NA | NA | NA |
| 2346 | 2025-10-07 |
Magnetically functionalized hydrogels for high-throughput genomic applications
2024-Jan-22, Advanced materials technologies
IF:6.4Q1
DOI:10.1002/admt.202301155
PMID:38645306
|
研究论文 | 本研究开发了一种磁功能化水凝胶珠用于简化单细胞基因组学中的分池方法 | 首次实现水凝胶珠的磁功能化，显著提高分池方法的纯化效率和自动化潜力 | 未明确说明磁功能化珠在长期稳定性或大规模生产中的表现 | 开发自动化单细胞基因组学工作流程的新方法 | 磁功能化水凝胶珠 | 单细胞基因组学 | NA | BAG-Seq单细胞测序 | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2347 | 2025-10-07 |
GMFGRN: a matrix factorization and graph neural network approach for gene regulatory network inference
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad529
PMID:38261340
|
研究论文 | 提出一种基于矩阵分解和图神经网络的基因调控网络推断新方法GMFGRN | 结合图神经网络进行矩阵分解学习基因表征嵌入，能有效消除传递性相互作用且计算资源需求低 | NA | 从单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN), 矩阵分解 | 基因表达数据 | 8个静态单细胞RNA测序数据集和4个时间序列数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2348 | 2025-10-07 |
The lysosome-related characteristics affects the prognosis and tumor microenvironment of lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1497312
PMID:39839650
|
研究论文 | 本研究通过构建溶酶体风险特征来预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次系统研究溶酶体相关基因在肺腺癌中的作用，构建了7个关键基因的风险特征，并在单细胞水平验证其功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索溶酶体相关基因在肺腺癌预后和肿瘤微环境中的作用 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外实验 | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2349 | 2025-10-07 |
Comparative evaluation of ACetic - MEthanol high salt dissociation approach for single-cell transcriptomics of frozen human tissues
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1469955
PMID:39839668
|
研究论文 | 评估ACME HS方法在冷冻人体组织中单细胞转录组学的应用效果 | 首次将ACME方法优化应用于人类内分泌组织，并使用高盐洗涤缓冲液替代标准PBS以稳定RNA | 主要针对人类内分泌组织，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 开发适用于冷冻组织的单细胞分离方法，提高单细胞RNA测序质量 | 人类内分泌组织样本 | 单细胞转录组学 | 内分泌系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41个组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2350 | 2025-10-07 |
Exploring the shared gene signatures and mechanism among three autoimmune diseases by bulk RNA sequencing integrated with single-cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1520050
PMID:39840076
|
研究论文 | 通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析探索三种自身免疫疾病的共享基因特征和机制 | 首次整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析三种自身免疫疾病的共享基因特征，并利用机器学习算法筛选诊断生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探究多发性硬化症、系统性红斑狼疮和类风湿关节炎三种自身免疫疾病的共享基因特征，识别早期诊断生物标志物 | 多发性硬化症、系统性红斑狼疮和类风湿关节炎患者及EAE小鼠模型 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, 机器学习算法, Cibersort算法 | 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2351 | 2025-10-07 |
Construction of a neutrophil extracellular trap formation-related gene model for predicting the survival of lung adenocarcinoma patients and their response to immunotherapy
2024-Dec-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-463
PMID:39830760
|
研究论文 | 基于中性粒细胞胞外诱捕网形成相关基因构建肺腺癌患者生存预测和免疫治疗反应评估模型 | 首次利用中性粒细胞胞外诱捕网形成相关基因构建肺腺癌预后特征模型，并验证其在预测免疫治疗反应方面的价值 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 构建肺腺癌预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR，生物信息学分析 | LASSO Cox回归模型，风险评分模型 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2352 | 2024-12-11 |
Improved tool for scRNA-seq analysis
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02040-x
PMID:39653731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2353 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics elucidates medulla niche supporting germinal center response in myasthenia gravis-associated thymoma
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114677
PMID:39180749
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示重症肌无力相关胸腺瘤中支持生发中心反应的髓质微环境特征 | 首次利用空间转录组技术系统描绘胸腺瘤中髓质区域的特殊微环境，发现MG特异性生发中心结构与神经肌肉髓质胸腺上皮细胞的定位特征 | 样本量有限，主要聚焦胸腺瘤和胸腺增生样本，需要更大规模研究验证 | 阐明重症肌无力在胸腺中的病理机制 | 胸腺瘤和胸腺增生样本 | 空间转录组学 | 重症肌无力 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2354 | 2025-10-07 |
Regulatory mechanisms orchestrating cellular diversity of Cd36+ olfactory sensory neurons revealed by scRNA-seq and scATAC-seq analysis
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114671
PMID:39215999
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析揭示Cd36+嗅觉感觉神经元细胞多样性的调控机制 | 首次发现Cd36+/-嗅觉感觉神经元的分化差异发生在未成熟阶段，并鉴定出Mef2a和Hdac9作为发育分岔的重要调控因子 | NA | 揭示嗅觉系统中细胞多样性的调控机制 | Cd36+和Cd36-嗅觉感觉神经元 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 2355 | 2025-10-07 |
DCX knockout ferret reveals a neurogenic mechanism in cortical development
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114508
PMID:39018244
|
研究论文 | 本研究通过建立DCX基因敲除雪貂模型，揭示了无脑回畸形皮质发育的神经发生机制 | 首次建立DCX基因敲除雪貂模型，准确再现人类无脑回畸形表型，并利用单核RNA测序和空间转录组学绘制了无脑回皮质图谱 | 未明确说明样本规模和模型验证的局限性 | 探究无脑回畸形的细胞和分子机制，以及DCX在皮质发育中的作用 | DCX基因敲除雪貂模型及其脑组织 | 神经科学 | 无脑回畸形 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 基因敲除 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 2356 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals dynamics of gene expression for 2D elongation and 3D growth in Physcomitrium patens
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114524
PMID:39046878
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小立碗藓从2D伸长到3D生长过程中基因表达的动态变化 | 首次在单细胞分辨率下系统分析苔藓植物2D向3D生长转变的细胞异质性和分子特征 | 研究仅针对小立碗藓，结果在其他植物中的普适性有待验证 | 探究植物从2D向3D生长转变的分子机制和细胞异质性 | 小立碗藓(Physcomitrium patens)的所有主要营养组织 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 超过17,000个单细胞，涵盖2D丝状体(叶绿丝和茎丝)和3D结构(芽和配子体) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2357 | 2025-10-07 |
Transcriptional noise, gene activation, and roles of SAGA and Mediator Tail measured using nucleotide recoding single-cell RNA-seq
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114593
PMID:39102335
|
研究论文 | 开发了一种时间分辨的新生单细胞RNA测序方法，用于测量酿酒酵母中基因特异性转录噪声和活跃基因比例 | 首次使用时间分辨的新生单细胞RNA测序方法量化转录噪声和基因激活状态，揭示了SAGA和Mediator Tail在调控基因激活中的新功能 | 研究仅限于酿酒酵母模型，未在其他生物系统中验证 | 测量基因特异性转录噪声和活跃基因比例，研究转录调控机制 | 酿酒酵母基因转录过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2358 | 2025-10-07 |
Lipid-associated macrophages for osimertinib resistance and leptomeningeal metastases in NSCLC
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114613
PMID:39116206
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现脂质相关巨噬细胞RNASE1_M与奥希替尼耐药和肺癌软脑膜转移相关 | 首次在EGFR突变非小细胞肺癌患者脑脊液中鉴定出与奥希替尼耐药和软脑膜转移相关的特定巨噬细胞亚型RNASE1_M | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证发现 | 探索非小细胞肺癌奥希替尼耐药后软脑膜转移的免疫机制 | EGFR突变非小细胞肺癌伴中枢神经系统转移患者的脑脊液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2359 | 2025-10-07 |
A human fetal cerebellar map of the late second trimester reveals developmental molecular characteristics and abnormality in trisomy 21
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114586
PMID:39137113
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制人类胎儿小脑在妊娠晚期第二季度的发育图谱，揭示正常发育特征及21三体综合征异常 | 首次系统描绘人类胎儿小脑在妊娠18-25周的关键发育期细胞图谱，发现UBC祖细胞分布规律及胶质细胞发育轨迹，并揭示21三体综合征的分子异常 | 研究样本仅涵盖特定发育阶段（GW18-25），样本量有限，且未验证功能机制 | 解析人类胎儿小脑在妊娠晚期第二季度的正常与异常发育分子特征 | 人类胎儿小脑组织样本（包括正常和21三体综合征样本） | 单细胞基因组学 | 21三体综合征（唐氏综合征） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 妊娠18-25周人类胎儿小脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2360 | 2025-10-07 |
Human liver sinusoidal endothelial cells support the development of functional human pluripotent stem cell-derived Kupffer cells
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114629
PMID:39146183
|
研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞成功培育出功能性的库普弗细胞，并证实肝窦内皮细胞对其发育的关键支持作用 | 首次证明人类多能干细胞来源的卵黄囊样造血祖细胞可在肝窦内皮细胞支持下发育为功能性库普弗细胞 | 研究主要基于小鼠模型，在人类体内的实际应用效果仍需进一步验证 | 研究人类库普弗细胞的发育机制 | 人类多能干细胞、肝窦内皮细胞、卵黄囊样造血祖细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NSG小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |