单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2321	2024-10-26	Integrated immunogenomic analyses of single-cell and bulk profiling construct a T cell-related signature for predicting prognosis and treatment response in osteosarcoma 2024-Oct-22, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01461-8 PMID:39436466	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量测序数据，构建了一个与T细胞相关的特征，用于预测骨肉瘤患者的预后和治疗反应	本研究首次通过单细胞RNA测序数据识别了与T细胞相关的基因，并构建了一个预测骨肉瘤患者预后的特征	本研究主要基于公共数据库的数据，未涉及临床试验验证	研究T细胞相关基因在骨肉瘤发病机制中的作用，并构建预测模型	骨肉瘤患者的T细胞相关基因和免疫反应	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	3000个高度可变基因，多个骨肉瘤细胞系
2322	2024-10-26	Single-cell transcriptomics reveals tumor microenvironment changes and prognostic gene signatures in hepatocellular carcinoma 2024-Oct-22, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113317 PMID:39447409	研究论文	本文利用单细胞RNA转录组数据研究了肝细胞癌（HCC）恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记	首次通过单细胞RNA转录组数据揭示了HCC进展过程中肿瘤微环境的主要成分变化，并识别了与预后相关的基因标记	研究基于公开的单细胞RNA转录组数据，样本量有限，可能影响结果的普适性	探究肝细胞癌恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记	肝细胞癌患者的单细胞RNA转录组数据	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	来自不同阶段的HCC患者样本，代表I-IV期
2323	2024-10-26	Isotope Encoded chemical Imaging Identifies Amyloid Plaque Age Dependent Structural Maturation, Synaptic Loss, and Increased Toxicity 2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.08.617019 PMID:39416086	研究论文	研究使用同位素编码的化学成像技术，追踪阿尔茨海默病中β-淀粉样蛋白斑块的形成和成熟过程，并分析其对神经元功能和毒性的影响	首次将动态MSI、结构斑块成像和全基因组空间转录组学在单个斑块水平上进行功能整合，提供了前所未有的时间和空间分辨率	NA	阐明早期β-淀粉样蛋白斑块形成过程中的生化过程，并研究斑块成熟对神经元功能和毒性的影响	β-淀粉样蛋白斑块的形成和成熟过程，以及其对神经元功能和毒性的影响	数字病理学	阿尔茨海默病	质谱成像(MSI)、代谢同位素标记、超光谱共聚焦显微镜	NA	图像、基因表达数据	使用敲入Aβ小鼠模型，样本包括10个月和18个月大的动物
2324	2024-10-26	Sex-dependent APOE4 neutrophil-microglia interactions drive cognitive impairment in Alzheimer's disease 2024-Oct, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-024-03122-3 PMID:38961225	研究论文	研究探讨了APOE4在阿尔茨海默病中通过中性粒细胞与小胶质细胞相互作用驱动认知障碍的性别依赖性	发现了APOE4女性携带者中与认知障碍相关的新型中性粒细胞亚群，并揭示了IL-17F在其中的作用机制	研究主要基于小鼠模型和独立人群，需要进一步在人类中验证	探讨APOE4在阿尔茨海默病中驱动认知障碍的机制，并寻找潜在的治疗靶点	APOE4女性携带者中的中性粒细胞与小胶质细胞相互作用	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞转录组学、多重流式细胞术	NA	基因表达数据	两个独立人群的APOE4女性携带者
2325	2024-10-26	Integrated immuno-transcriptomic analysis of ovarian cancer identifies a four-chemokine-dominated subtype with antitumor immune-active phenotype and favorable prognosis 2024-Oct, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-024-02803-7 PMID:39095528	研究论文	本研究通过整合免疫转录组分析卵巢癌样本，识别出一种以四种趋化因子为主的亚型，该亚型具有抗肿瘤免疫活性和良好的预后	本研究首次在卵巢癌中引入了一种基于四种趋化因子的免疫分类方法，并验证了其在多中心队列中的有效性	本研究的样本量虽然较大，但仍需在更多不同来源的样本中进一步验证	探讨卵巢癌中免疫活性肿瘤表型与临床结局之间的关系	卵巢癌样本及其免疫微环境	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	2850个卵巢癌样本和39个单细胞RNA测序样本
2326	2024-10-26	Berberine Protects against Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating Intrahepatic T Cell Heterogeneity 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405182 PMID:39135526	研究论文	研究探讨了小檗碱通过调节肝内T细胞异质性来抑制肝细胞癌进展的机制	首次详细阐述了小檗碱通过调节肝内T细胞异质性来抑制肝细胞癌进展的机制	研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证	探讨小檗碱在肝细胞癌中的抗肿瘤作用及其机制	小檗碱对肝细胞癌免疫微环境的影响	NA	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	使用小鼠模型进行研究
2327	2024-10-26	A LDH-Derived Metal Sulfide Nanosheet-Functionalized Bioactive Glass Scaffold for Vascularized Osteogenesis and Periprosthetic Infection Prevention/Treatment 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202403009 PMID:39159063	研究论文	开发了一种基于LDH衍生的硫化物纳米片功能化的生物活性玻璃支架，用于血管化骨再生和预防/治疗假体周围感染	该支架具有优异的近红外二区光热性能，能有效消除假体周围感染，并在骨质量和血管新生方面表现出显著增强效果	NA	解决骨科植入手术后常见的假体周围感染和假体松动问题	生物活性玻璃支架及其在血管化骨再生和感染预防/治疗中的应用	NA	NA	转录组测序，单细胞测序	NA	NA	NA
2328	2024-10-26	From Cell to Gene: Deciphering the Mechanism of Heart Failure With Single-Cell Sequencing 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202308900 PMID:39159065	综述	本文综述了单细胞测序技术在解析心力衰竭机制中的应用	单细胞测序技术能够精确分析单个细胞的基因结构和表达，揭示心力衰竭过程中细胞成分和基因表达的变化	当前心血管研究中面临的挑战	深入探讨心力衰竭的潜在机制	心力衰竭的细胞异质性和细胞间通讯网络	数字病理学	心血管疾病	单细胞测序	NA	基因表达数据	NA
2329	2024-10-26	GJB2 Promotes HCC Progression by Activating Glycolysis Through Cytoplasmic Translocation and Generating a Suppressive Tumor Microenvironment Based on Single Cell RNA Sequencing 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202402115 PMID:39162005	研究论文	研究GJB2通过细胞质转位激活糖酵解并生成抑制性肿瘤微环境促进肝细胞癌进展的机制	发现GJB2在肝细胞癌中的高表达与不良预后相关，并通过细胞质转位激活糖酵解和生成抑制性肿瘤微环境	NA	寻找肝细胞癌的有效治疗靶点	GJB2在肝细胞癌中的表达及功能	NA	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
2330	2024-10-26	Retinoic acid induces human gastruloids with posterior embryo-like structures 2024-Oct, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-024-01487-8 PMID:39164488	研究论文	研究展示了视黄酸（RA）和Matrigel的早期脉冲可以诱导人类胚胎样后部结构的形成	首次展示了视黄酸和Matrigel的组合可以诱导人类胚胎样后部结构的形成，包括神经管、分段体节和多种细胞类型	研究主要集中在体外模型，尚未在体内验证这些结构的功能和发育潜力	探索视黄酸在早期人类胚胎发育中的作用，并开发新的体外模型	人类胚胎样结构，包括神经管、体节和多种细胞类型	发育生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确提及具体样本数量
2331	2024-10-26	Novel Arf1 Inhibitors Drive Cancer Stem Cell Aging and Potentiate Anti-Tumor Immunity 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202404442 PMID:39225354	研究论文	研究介绍了两种新型Arf1抑制剂DU101和DU102，通过触发癌症干细胞衰老和增强抗肿瘤免疫，展示了其在癌症治疗中的潜力	首次引入DU101和DU102作为新型Arf1抑制剂，通过单细胞测序分析其对肿瘤免疫微环境的重塑作用，并发现其能增加肿瘤相关CD8+ CD4+双阳性T细胞，从而提高癌症患者的无病生存率	NA	探索新型Arf1抑制剂在癌症治疗中的应用，特别是其对癌症干细胞衰老和抗肿瘤免疫的影响	Arf1抑制剂DU101和DU102对癌症干细胞和肿瘤免疫微环境的影响	癌症研究	癌症	单细胞测序	NA	细胞	小鼠癌症和PDX模型，以及癌症患者样本
2332	2024-10-26	Astrocyte-induced Cdk5 expedites breast cancer brain metastasis by suppressing MHC-I expression to evade immune recognition 2024-Oct, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-024-01509-5 PMID:39304713	研究论文	研究揭示了星形胶质细胞诱导的Cdk5通过抑制MHC-I表达促进乳腺癌脑转移的免疫逃逸机制	首次揭示了星形胶质细胞诱导的Cdk5在乳腺癌脑转移中的作用，并阐明了其通过抑制MHC-I表达实现免疫逃逸的分子机制	研究主要在小鼠模型中进行，需要进一步在临床样本中验证	探讨乳腺癌脑转移的免疫逃逸机制及其潜在治疗策略	乳腺癌脑转移、星形胶质细胞、Cdk5、MHC-I	癌症研究	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
2333	2024-10-26	Proteomic Heterogeneity of the Extracellular Matrix Identifies Histologic Subtype-Specific Fibroblast in Gastric Cancer 2024-Oct, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.mcpro.2024.100843 PMID:39305996	研究论文	研究探讨了胃癌中细胞外基质（ECM）的蛋白质组异质性，并分析了其与组织学亚型和患者预后的关系	首次通过定量蛋白质组学分析胃癌去细胞化组织中的肿瘤ECM，识别出与特定组织学亚型相关的关键分子标记	研究主要集中在ECM的蛋白质组分析，未涉及其他分子层面的深入探讨	研究胃癌中细胞外基质的蛋白质组异质性及其与组织学亚型和患者预后的关系	胃癌患者的去细胞化组织样本	数字病理学	胃癌	定量蛋白质组学分析	NA	蛋白质组数据	多个胃癌患者的去细胞化组织样本
2334	2024-10-26	HKDC1 promotes liver cancer stemness under hypoxia through stabilizing β-catenin 2024-Sep-06, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001085 PMID:39250463	研究论文	研究探讨了HKDC1在低氧条件下通过稳定β-catenin促进肝癌细胞干性的机制	首次揭示了HKDC1在肝癌转移中的特异性作用及其通过稳定β-catenin增强肝癌细胞干性的分子机制	NA	比较HKDC1与其他HKs在肝癌中的细胞特异性，并研究其在肝癌转移中的分子机制	HKDC1、HK1、HK2在肝癌中的表达及其对肝癌转移的影响	数字病理学	肝癌	RNA原位杂交、单细胞RNA测序、代谢组学分析	NA	RNA	两个肝癌小鼠模型及肝癌和胆管癌患者肿瘤样本
2335	2024-10-26	Osr1-mediated mesothelial transition of liver mesenchymal cells exacerbates fibrotic liver damage 2024-Sep-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.02.024 PMID:38414241	研究论文	研究揭示了在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）模型小鼠中，肝星状细胞（HSCs）在肝损伤后向间皮细胞（MCs）的转变过程，并探讨了Osr1基因在这一过程中的作用	首次发现肝星状细胞在肝损伤后可以转变为间皮细胞，并揭示了Osr1基因在这一转变中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨肝星状细胞在肝损伤后的转变过程及其在肝纤维化中的作用	肝星状细胞、间皮细胞、Osr1基因	NA	肝病	单细胞RNA测序、体内谱系追踪	NA	RNA	非酒精性脂肪性肝炎（NASH）模型小鼠
2336	2024-10-26	Organoids for Cancer Research: Advances and Challenges 2024-Sep, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400056 PMID:38977414	综述	本文综述了癌症类器官在癌症研究中的进展、应用、优势、局限性和前景	癌症类器官作为复杂肿瘤微环境的模型，有望提高肿瘤药物开发的成功率并重现最有效的治疗方案	癌症类器官的应用仍面临挑战，包括技术限制和标准化问题	探讨癌症类器官在临床肿瘤治疗中的应用潜力	癌症类器官及其在肿瘤药物开发中的应用	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	NA	NA
2337	2024-10-26	A Single-Cell Transcriptome Profiling of Triptolide-Induced Nephrotoxicity in Mice 2024-Sep, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400120 PMID:38864263	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了雷公藤内酯诱导的小鼠肾毒性效应及其机制	首次在单细胞分辨率下全面描述了雷公藤内酯处理后肾脏细胞的转录组变化和细胞组成	NA	揭示雷公藤内酯诱导的肾毒性机制	雷公藤内酯处理后的小鼠肾脏组织	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	控制组和雷公藤内酯处理组的小鼠肾脏组织
2338	2024-10-26	Single-cell multi-omics analysis reveals cooperative transcription factors for gene regulation in oligodendrocytes 2024-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.19.599799 PMID:38948852	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，识别了在少突胶质细胞中协同调控基因表达的转录因子	本文首次通过深度学习模型预测转录因子对目标基因表达的影响，并计算了转录因子重要性和转录因子间相互作用得分	实验验证仅限于部分转录因子对，且使用的是大鼠外周神经的ChIP-seq数据	研究少突胶质细胞中转录因子如何协同调控基因表达	少突胶质细胞及其相关基因和转录因子	基因组学	NA	单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、ChIP-seq	深度学习模型	基因表达数据、染色质可及性数据	未明确提及具体样本数量
2339	2024-10-26	Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1 2024-Jun-21, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adm9817 PMID:38896611	研究论文	本文验证了CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴成像生物标志物的准确性	首次证明了CMKLR1在单细胞RNA测序数据中的表达作为巨噬细胞的瞬时标志物，并展示了其在小鼠模型中作为PET成像靶点的潜力	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	验证CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴的成像生物标志物的准确性	CMKLR1在肺部炎症-纤维化轴中的作用及其作为成像生物标志物的潜力	数字病理学	肺纤维化	单细胞RNA测序、正电子发射断层扫描(PET)	NA	RNA测序数据	小鼠模型和IPF患者样本
2340	2024-10-26	SUB1 promotes colorectal cancer metastasis by activating NF-κB signaling via UBR5-mediated ubiquitination of UBXN1 2024-Jun, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-023-2429-5 PMID:38240906	研究论文	研究探讨了SUB1通过激活NF-κB信号通路促进结直肠癌转移的机制	首次揭示了SUB1通过UBR5介导的UBXN1泛素化激活NF-κB信号通路，从而促进结直肠癌转移	NA	探讨SUB1在结直肠癌转移中的作用及其分子机制	SUB1、UBR5、UBXN1及其在结直肠癌转移中的作用	NA	结直肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序	NA	RNA	NA