单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 2281 - 2300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2281 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiling of thymic dysregulation and viral tropism after neonatal roseolovirus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375508
PMID:38895117
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析新生儿玫瑰疹病毒感染后胸腺转录组变化和病毒嗜性 | 首次完整描绘新生儿感染后玫瑰疹病毒在胸腺中的嗜性特征，并建立首个体外MRV感染细胞培养系统 | 研究局限于小鼠模型，人类玫瑰疹病毒的直接影响仍需进一步验证 | 探究新生儿玫瑰疹病毒感染如何破坏胸腺功能并诱发自身免疫疾病 | 新生小鼠胸腺细胞和髓质胸腺上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)，伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2282 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of lung fibroblasts in a bleomycin-induced systemic sclerosis mouse model
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151017
PMID:39608052
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究博来霉素诱导的系统性硬化症小鼠模型中肺成纤维细胞的转录组特征 | 首次在系统性硬化症小鼠模型中鉴定出两个不同的成纤维细胞亚群：NPNT阳性和PI16阳性细胞，并比较了皮下和气管内博来霉素诱导模型的差异 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探索成纤维细胞在肺纤维化中的分子机制 | 系统性硬化症小鼠模型中的肺成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 博来霉素诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2283 | 2025-10-07 |
Surface Molecular Markers for the Isolation of Viable Fibroblast Subpopulations in the Female Reproductive Tract: A Comprehensive Review
2024-Dec-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010233
PMID:39796089
|
综述 | 本文系统综述了女性生殖道中成纤维细胞亚群的表面分子标记及其在选择性细胞分离中的应用潜力 | 基于两千多篇研究文章，首次全面整合女性生殖系统中成纤维细胞亚群的表面标记和分子特征 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要依赖现有文献分析 | 识别和表征女性生殖道中成纤维细胞亚群及其特异性表面标记 | 女性生殖系统中的成纤维细胞亚群 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 转录组数据, 蛋白质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2284 | 2025-10-07 |
Differential Expression of CXCL12 in Human and Mouse Hair: Androgens Induce CXCL12 in Human Dermal Papilla and Dermal Sheath Cup
2024-Dec-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010095
PMID:39795953
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化分析，揭示了CXCL12在人类毛囊真皮乳头细胞和真皮鞘杯细胞中与雄激素受体共表达的现象 | 首次证明CXCL12在人类毛囊中与雄激素受体共表达，并发现CXCL12抗体可通过抑制雄激素受体活性促进毛发生长 | 研究主要基于体外实验，缺乏完整的体内验证 | 探究雄激素诱导的CXCL12对毛囊细胞的影响及其在雄激素性脱发中的作用机制 | 人类和小鼠皮肤组织、毛囊真皮乳头细胞、真皮鞘杯细胞 | 分子生物学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 毛发器官培养, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2285 | 2025-10-07 |
MPCD Index for Hepatocellular Carcinoma Patients Based on Mitochondrial Function and Cell Death Patterns
2024-Dec-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010118
PMID:39795978
|
研究论文 | 基于线粒体功能和细胞死亡模式构建肝细胞癌患者的MPCD指数 | 首次结合线粒体功能和程序性细胞死亡模式，通过机器学习构建MPCDI指数用于HCC患者分型 | NA | 研究肝细胞癌中线粒体功能与细胞死亡模式的关系并构建预后指数 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, RNA-seq | 机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | NA |
| 2286 | 2025-10-07 |
Advances in DNA/RNA Sequencing and Their Applications in Acute Myeloid Leukemia (AML)
2024-Dec-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26010071
PMID:39795930
|
综述 | 本文探讨DNA/RNA测序技术在急性髓系白血病研究中的最新进展及其临床应用潜力 | 系统总结单细胞RNA测序在发现白血病干细胞稀有亚群方面的突破性进展 | 测序技术的临床广泛应用仍受成本、数据复杂性和伦理问题限制 | 评估DNA/RNA测序技术在急性髓系白血病诊疗中的应用前景 | 急性髓系白血病分子机制和白血病干细胞 | 基因组学 | 急性髓系白血病 | 全基因组测序, 全外显子组测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序, 全外显子组测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 2287 | 2025-10-07 |
MICROGLIA AGING IN THE HIPPOCAMPUS ADVANCES THROUGH INTERMEDIATE STATES THAT DRIVE ACTIVATION AND COGNITIVE DECLINE
2024-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.09.588665
PMID:38645176
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了海马区小胶质细胞在衰老过程中的中间状态及其对神经炎症和认知衰退的驱动作用 | 首次识别了小胶质细胞衰老过程中的中间状态，并证明这些中间状态通过异种共生实验和药理学方法驱动炎症激活和认知功能下降 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明小胶质细胞在衰老过程中从稳态到功能障碍的进展机制 | 小鼠海马区小胶质细胞 | 神经科学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序，假时间分析，条件性基因敲除 | 小鼠模型，异种共生模型 | 单细胞转录组数据 | 跨越成年寿命期的小鼠海马区小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2288 | 2025-10-07 |
Neutrophils with low production of reactive oxygen species are activated during immune priming and promote development of arthritis
2024-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103401
PMID:39471640
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术系统分析了胶原蛋白诱导关节炎模型中骨髓来源中性粒细胞的功能特征，揭示了活性氧在免疫启动阶段的保护作用机制 | 首次在免疫启动阶段发现高表达NCF1的中性粒细胞亚群，并揭示ROS通过代谢重编程调控中性粒细胞炎症表型的双向作用机制 | 研究基于小鼠关节炎模型，在人类RA疾病中的直接适用性需要进一步验证 | 探究中性粒细胞在类风湿关节炎发病机制中的作用，特别是ROS调控的分子机制 | 胶原蛋白诱导的关节炎模型小鼠骨髓来源中性粒细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞测序技术，功能分析，代谢组学 | NA | 单细胞测序数据，代谢组数据，功能实验数据 | 胶原蛋白诱导关节炎模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2289 | 2025-10-07 |
[Molecular mechanism of Xinyang Tablets in improving myocardial fibrosis in uremic cardiomyopathy based on single-cell sequencing technology]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术探讨了心阳片对尿毒症心肌病心肌纤维化的改善作用及其分子机制 | 首次在单细胞水平揭示心阳片通过抑制内源性和外源性骨桥蛋白改善尿毒症心肌病心肌纤维化的作用机制 | 研究仅使用小鼠模型，样本量有限，需要进一步临床验证 | 研究心阳片对尿毒症心肌病心肌纤维化的治疗作用及分子机制 | 尿毒症心肌病小鼠模型的心脏组织细胞 | 单细胞测序分析 | 尿毒症心肌病 | 单细胞RNA测序 | t-SNE, K-means聚类, Seurat, Monocle3, CellChat | 单细胞基因表达数据 | 尿毒症心肌病小鼠模型分组研究 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 2290 | 2025-10-07 |
Supervised analysis of alternative polyadenylation from single-cell and spatial transcriptomics data with spvAPA
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae720
PMID:39799000
|
研究论文 | 提出了一种用于单细胞和空间转录组数据中可变多聚腺苷酸化分析的监督分析框架spvAPA | 开发了首个专门针对单细胞和空间转录组APA数据的监督分析框架，整合了基因表达和APA双模态数据 | 未明确说明方法在特定数据类型或实验条件下的潜在限制 | 开发专门针对单细胞和空间转录组数据中可变多聚腺苷酸化分析的计算方法 | 单细胞和空间转录组数据中的可变多聚腺苷酸化特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 加权最近邻算法, 稀疏偏最小二乘判别分析 | 基因表达数据, APA数据 | 九个单细胞和空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2291 | 2025-10-07 |
Integrating scRNA-seq and scATAC-seq with inter-type attention heterogeneous graph neural networks
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae711
PMID:39800872
|
研究论文 | 提出一种名为scMI的异构图嵌入方法，通过跨模态注意力机制整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据 | 设计了跨类型注意力机制来有效捕获基因与染色质可及性区域之间的长程跨模态相互作用，不依赖motif数据库 | 未明确说明方法在特定细胞类型或疾病背景下的适用性限制 | 开发单细胞多组学数据整合方法，改善跨模态关系学习 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 异构图神经网络, 注意力机制 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2292 | 2025-10-07 |
Deep learning in integrating spatial transcriptomics with other modalities
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae719
PMID:39800876
|
综述 | 系统回顾深度学习在整合空间转录组学与其他模态数据中的应用 | 首次系统综述深度学习整合空间转录组学与多模态数据的方法，提出分类框架并总结整合策略 | 作为综述文章，不包含原始实验验证 | 促进开发更全面利用多模态信息的稳健计算方法 | 空间转录组学数据整合方法 | 机器学习 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序，组织学成像，染色质成像 | 深度学习 | 空间转录组数据，组织学图像，染色质图像，scRNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq，空间多组学 | NA | NA |
| 2293 | 2025-10-07 |
CellMsg: graph convolutional networks for ligand-receptor-mediated cell-cell communication analysis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae716
PMID:39800874
|
研究论文 | 提出了一种基于图卷积网络的细胞间通讯分析计算框架CellMsg | 结合配体-受体多模态特征和图卷积网络识别高可信度配体-受体相互作用，采用三点估计方法量化细胞间通讯强度 | NA | 开发计算工具解析细胞间通讯 | 细胞间通讯和配体-受体相互作用 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN) | 单细胞RNA测序数据 | 四个基准LRI数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2294 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics of IPMN Reveals Divergent Indolent and Malignant Lineages
2024-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.29.620810
PMID:39554015
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤，揭示了惰性和恶性谱系的分化 | 首次使用数字空间RNA分析技术识别IPMN中与癌症风险相关的三种不同转录组状态 | 样本量较小(仅10个IPMN标本)，需要更大规模研究验证 | 开发改善IPMN风险分类准确性的分子诊断方法 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)标本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 数字空间RNA分析(DSP-RNA),全转录组测序 | NA | 空间转录组数据,基因表达数据 | 10个IPMN标本，涵盖从正常导管到癌症的各级异型增生 | Illumina | 空间转录组学,全转录组测序 | Illumina测序平台 | 数字空间RNA分析(DSP-RNA)技术 |
| 2295 | 2025-10-07 |
Robust single nucleus RNA sequencing reveals depot-specific cell population dynamics in adipose tissue remodeling during obesity
2024-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588525
PMID:38645263
|
研究论文 | 本研究开发了一种稳健的单核RNA测序技术，并应用于揭示肥胖过程中脂肪组织重塑的细胞群动态变化 | 开发了适用于多种组织类型的核分离技术，显著提高了snRNA-seq数据质量；首次系统表征了肥胖过程中脂肪组织不同区域的细胞动态变化；通过整合bulk核RNA测序识别了按大小和功能分类的脂肪细胞亚群 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 研究肥胖过程中脂肪组织重塑的细胞群动态变化机制 | 脂肪组织中的各种细胞类型，特别是不同大小的脂肪细胞亚群 | 单细胞测序 | 肥胖 | 单核RNA测序(snRNA-seq), bulk核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2296 | 2025-10-07 |
Decoding functional hematopoietic progenitor cells in the adult human lung
2024-Feb-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3576483/v2
PMID:38077002
|
研究论文 | 本研究揭示了成人肺脏中存在功能性造血祖细胞及其在血管丰富的肺泡间质生态位中的分布 | 首次在人类肺脏中发现具有增殖和移植潜能的造血前体细胞，其频率与骨髓相当，并揭示了肺源性祖细胞特有的免疫和造血通路激活特征 | NA | 探索肺脏作为髓外造血器官的功能潜力 | 成人肺组织中的CD34+造血祖细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2297 | 2025-10-07 |
Cytokines reprogram airway sensory neurons in asthma
2024-12-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115045
PMID:39661516
|
研究论文 | 本研究揭示了哮喘中细胞因子通过JAK/STAT6通路重编程气道伤害感受神经元获得促炎表型的机制 | 首次发现IL-13通过JAK/STAT6通路触发伤害感受神经元中Npy1r过表达，并揭示NPY/NPY1R信号轴在限制神经元兴奋性中的代偿作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究过敏反应中伤害感受神经元获得促炎特性的分子机制 | 小鼠气道伤害感受神经元 | 神经免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序，逆行追踪，谱系报告，细胞因子筛选 | NA | 基因表达数据，细胞成像 | 卵清蛋白诱导的过敏性气道炎症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2298 | 2025-10-07 |
Cytokines reprogram airway sensory neurons in asthma
2024-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.525731
PMID:39345572
|
研究论文 | 本研究揭示了哮喘中细胞因子如何重编程气道感觉神经元及其在过敏反应中的作用机制 | 发现了一类特异性支配气道的炎症性迷走伤害感受神经元，并阐明了IL-13通过JAK/STAT6通路驱动神经元重编程的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究过敏性气道炎症中伤害感受神经元获得促炎特性的分子机制 | 小鼠气道伤害感受神经元和肺免疫细胞 | 神经免疫学 | 哮喘 | 逆行追踪、谱系报告、单细胞RNA测序、细胞特异性基因敲除 | NA | 基因表达数据、细胞测序数据 | 卵清蛋白诱导的气道炎症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2299 | 2025-10-07 |
Restoration of neuronal progenitors by partial reprogramming in the aged neurogenic niche
2024-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00594-3
PMID:38553564
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学系统分析部分重编程对老年小鼠脑室下区神经发生生态位的影响 | 首次揭示部分重编程可特异性恢复老年神经发生生态位中的神经母细胞比例，并证明其改善作用具有生态位内在性 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性仍需验证 | 探索部分重编程对老年大脑神经发生生态位的影响机制 | 老年小鼠的脑室下区神经发生生态位和神经干细胞培养物 | 神经科学 | 老年性脑功能衰退 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年小鼠神经发生生态位和神经干细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2300 | 2025-10-07 |
Angiogenesis-on-a-chip coupled with single-cell RNA sequencing reveals spatially differential activations of autophagy along angiogenic sprouts
2024-01-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44427-0
PMID:38172108
|
研究论文 | 本研究通过血管生成芯片结合单细胞RNA测序技术，揭示了自噬在血管新生芽孢中不同空间位置的差异性激活模式 | 首次将血管生成芯片与单细胞RNA测序相结合，揭示了自噬在血管新生芽孢中不同细胞群体的空间差异性激活 | 研究依赖于体外芯片模型，可能无法完全模拟体内复杂的血管生成微环境 | 探究自噬在血管新生过程中不同空间位置的功能异质性 | 血管内皮细胞 | 单细胞生物学 | 血管生成相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 血管生成芯片模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |