单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 2201 - 2220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2201 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling and modeling of mouse brain at single-cell resolution reveals cell proximity effects of aging and rejuvenation
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.16.603809
PMID:39071282
|
研究论文 | 通过单细胞空间转录组学构建小鼠大脑时空图谱，开发空间衰老时钟模型揭示衰老和 rejuvenation 过程中的细胞邻近效应 | 首次开发基于空间转录组学的机器学习模型（空间衰老时钟），系统揭示衰老过程中细胞对邻近细胞的影响机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类大脑的适用性需要进一步验证 | 探究大脑衰老过程中细胞间相互作用的分子机制及其对组织功能衰退的影响 | 小鼠大脑细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞空间转录组测序 | 深度学习, 机器学习 | 空间转录组数据 | 420万个细胞，来自20个不同年龄阶段的小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 2202 | 2025-10-07 |
A wound-induced differentiation trajectory for neurons
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322864121
PMID:38976727
|
研究论文 | 本研究揭示了涡虫在伤口诱导下通过NFY转录因子调控神经元分化的机制 | 首次发现伤口诱导的NFY转录因子结合在脑再生早期启动神经分化通路 | 研究仅聚焦于涡虫模型，机制在其他再生动物中的普适性尚未验证 | 探究伤口诱导的转录调控事件如何启动神经元分化和脑再生 | 具有高再生能力的涡虫 | 发育生物学 | NA | 染色质可及性分析，单细胞转录组测序，功能研究 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2203 | 2025-10-07 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-06-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
|
研究论文 | 本研究探讨SOS1和MEK抑制剂联合治疗对KRASG12D胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及免疫治疗响应改善机制 | 首次揭示SOS1i+MEKi联合治疗通过调节iCAF和髓系细胞导致免疫抑制微环境，并提出CD40激动剂联合检查点阻断的新策略 | 研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索KRAS靶向治疗对肿瘤微环境的影响及改善免疫治疗响应的组合策略 | KRASG12D/p53突变小鼠胰腺导管腺癌细胞系(KPCY)及荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KPCY细胞系及荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2204 | 2025-10-07 |
Flow Cytometry Analysis of Microglial Phenotypes in the Murine Brain During Aging and Disease
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5018
PMID:38948260
|
研究论文 | 开发了一种优化的流式细胞术方案，用于区分小鼠脑组织中四种不同的小胶质细胞表型 | 建立了无需细胞分选、成像或单细胞RNA测序就能区分四种小胶质细胞表型的流式细胞术方案，具有成本低、通量高的优势 | 该方法依赖于前期单细胞RNA测序研究确定的基因标记，可能需要特定多色检测能力的细胞分析仪 | 开发一种区分小胶质细胞表型的标准化流程 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞 | 免疫学 | 神经退行性疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据 | NA | Cytek | 流式细胞术 | Cytek Aurora | Cytek Aurora 5激光光谱流式细胞仪 |
| 2205 | 2025-10-07 |
LYVE-1-expressing Macrophages Modulate the Hyaluronan-containing Extracellular Matrix in the Mammary Stroma and Contribute to Mammary Tumor Growth
2024-05-31, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0205
PMID:38717149
|
研究论文 | 本研究揭示了LYVE-1+巨噬细胞通过调节透明质酸细胞外基质促进乳腺肿瘤生长的机制 | 首次证明LYVE-1+巨噬细胞通过降解透明质酸和调节免疫微环境促进肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究LYVE-1+巨噬细胞在乳腺基质和肿瘤微环境中的功能 | 小鼠乳腺组织和乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，基因敲除模型 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据，组织学数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2206 | 2025-10-07 |
Identification of MUC1-C as a Target for Suppressing Progression of Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2024-05-14, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0011
PMID:38619287
|
研究论文 | 本研究揭示了MUC1-C蛋白在头颈部鳞状细胞癌进展中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现MUC1-C通过整合STAT1炎症通路与∆Np63、SOX2基因表达，驱动头颈部鳞癌干细胞状态 | 主要基于细胞系研究，需要更多体内实验验证 | 探索MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌进展中的作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系和肿瘤样本 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2207 | 2025-10-07 |
Role of ferroptosis in neuroimmunity and neurodegeneration in multiple sclerosis revealed by multi-omics data
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18396
PMID:38801304
|
研究论文 | 通过多组学数据揭示铁死亡在多发性硬化症神经免疫和神经退行性变中的作用 | 开发了铁死亡水平的计算指标，首次通过整合单核RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学数据系统研究铁死亡在多发性硬化症中的作用机制 | 铁死亡在多发性硬化症中的确切作用机制仍需进一步验证 | 探究铁死亡在多发性硬化症发病机制中的作用 | 多发性硬化症患者样本 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | snRNA-seq, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, AUCell方法 | 诊断模型 | 多组学数据 | 七个不同白质病变区域的样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 2208 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals evolutionary reconfiguration of embryonic cell fate specification in the sea urchin Heliocidaris erythrogramma
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.30.591752
PMID:38746376
|
研究论文 | 通过单细胞转录组比较分析揭示海胆胚胎细胞命运特化的进化重配置 | 首次利用比较单细胞RNA-seq发育时间序列揭示胚胎模式形成中的多样化进化变化 | 需要后续实验验证候选调控相互作用的假设 | 研究发育进化中调控互作的改变如何影响表型多样性 | 海胆Heliocidaris erythrogramma和其近缘物种的胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海胆物种的发育时间序列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2209 | 2025-10-07 |
Single-cell insights: pioneering an integrated atlas of chromatin accessibility and transcriptomic landscapes in diabetic cardiomyopathy
2024-04-25, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02233-y
PMID:38664790
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据，揭示了糖尿病心肌病中染色质可及性和转录组景观的细胞状态和分子变化 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据构建糖尿病心肌病的综合图谱，识别了关键的转录因子和细胞亚群特异性变化 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明糖尿病心肌病的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 野生型和糖尿病心肌病小鼠的心脏组织 | 单细胞多组学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光染色 | Seurat, Signac, chromVAR, Cicero | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | WT和DCM小鼠心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Multiome | 10x Multiome单细胞RNA和ATAC联合测序文库 |
| 2210 | 2025-10-07 |
Mechanisms of imbalanced testicular homeostasis in infancy due to aberrant histone acetylation in undifferentiated spermatogonia under different concentrations of Di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) exposure
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123742
PMID:38460586
|
研究论文 | 本研究探讨了婴儿期不同浓度DEHP暴露通过组蛋白乙酰化异常导致睾丸稳态失衡的分子机制 | 首次揭示了婴儿期DEHP暴露通过线粒体功能障碍和组蛋白乙酰化异常导致未分化精原细胞命运差异的机制，并发现其对睾丸稳态的长期影响持续至成年期 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；DEHP暴露剂量和时程可能无法完全模拟真实环境暴露情况 | 阐明婴儿期DEHP暴露对睾丸发育和生殖系统功能的毒性机制 | 新生小鼠睾丸组织中的未分化精原细胞、支持细胞和间质细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第5天小鼠，分别接受40μg/kg和80μg/kg DEHP暴露10天 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2211 | 2025-10-07 |
Rejuvenated iPSC-derived GD2-directed CART Cells Harbor Robust Cytotoxicity Against Small Cell Lung Cancer
2024-03-11, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0259
PMID:38380966
|
研究论文 | 本研究开发了源自iPSC的年轻化GD2-CARrejT细胞，显著增强了对小细胞肺癌的细胞毒性 | 首次将GD2-CAR导入iPSC来源的年轻化细胞毒性T淋巴细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了TIGIT低表达与细胞毒性增强的机制关联 | 研究主要聚焦于机制探索，临床前验证阶段尚未进入人体试验 | 增强GD2导向CAR-T细胞对小细胞肺癌的杀伤效果 | 小细胞肺癌细胞及GD2-CAR修饰的免疫细胞 | 免疫治疗 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，细胞重编程 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据，细胞功能数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2212 | 2025-10-07 |
MEF2C Hypofunction in GABAergic Cells Alters Sociability and Prefrontal Cortex Inhibitory Synaptic Transmission in a Sex-Dependent Manner
2024-Mar, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2024.100289
PMID:38390348
|
研究论文 | 本研究探讨了GABA能细胞中MEF2C功能低下对小鼠社交行为和前额叶皮层抑制性突触传递的影响，并发现这些影响具有性别特异性 | 首次揭示了MEF2C在发育中GABA能细胞的功能缺陷会导致雌性特异性的社交行为异常和前额叶皮层抑制性突触传递改变 | 研究仅限于小鼠模型，人类MCHS患者中未观察到明显的性别偏倚，机制尚未完全阐明 | 探究MEF2C在GABA能神经元中的功能低下对MEF2C单倍体不足综合征样表型的影响 | 转基因小鼠模型，特别是GABA能细胞中Mef2c杂合缺失的小鼠 | 神经科学 | 神经发育障碍，自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学，膜片钳电生理学，光遗传学，脑电图 | 转基因小鼠模型 | 行为学数据，电生理记录，基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，使用转基因小鼠进行研究 | NA | 单细胞RNA测序，电生理记录，光遗传学 | NA | NA |
| 2213 | 2025-10-07 |
Kidney double positive T cells have distinct characteristics in normal and diseased kidneys
2024-02-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54956-3
PMID:38396136
|
研究论文 | 本研究揭示了肾脏中TCR+CD4+CD8+双阳性T细胞在正常和疾病状态下的独特特征 | 首次系统描述了正常和疾病状态下肾脏双阳性T细胞的表型、功能和代谢特征 | 双阳性T细胞在肾脏中为次要群体，样本量有限 | 探究肾脏双阳性T细胞在生理和病理条件下的特征与功能 | 小鼠和人类肾脏组织 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肾脏和人类肾细胞癌患者肾脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2214 | 2025-01-07 |
Prognostic model based on M2 macrophage-related signatures for predicting outcomes, enhancing risk stratification, and providing therapeutic insights in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Dec-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e41007
PMID:39759325
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于M2巨噬细胞相关基因的预测模型，用于对新诊断的弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者进行风险分层、预后预测和免疫特征评估 | 利用M2巨噬细胞相关基因构建预测模型，提供新的治疗选择和风险分层方法 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制 | 开发一种预测模型，用于DLBCL患者的风险分层和预后预测 | 新诊断的DLBCL患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的DLBCL患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2215 | 2025-01-07 |
The network structural entropy for single-cell RNA sequencing data during skin aging
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae698
PMID:39757115
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析皮肤老化过程中的基因网络，引入网络结构熵来量化老化过程中基因网络的复杂性 | 引入网络结构熵来量化老化过程中基因网络的复杂性，并发现老化细胞中的整体网络结构熵增加 | 未提及具体局限性 | 理解老化过程中细胞功能变化的分子机制 | 单细胞RNA测序数据中的基因网络 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 随机游走模型 | 基因表达数据 | 超过15,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2216 | 2025-01-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the changes of the pulmonary immune environment in rat after Siegesbeckia orientalis L. treatment
2024-Nov, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2024.101035
PMID:39759974
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了东方泽兰治疗后大鼠肺部免疫环境的变化 | 使用单细胞RNA测序技术详细分析东方泽兰治疗对大鼠肺部免疫环境的影响 | NA | 研究东方泽兰治疗对大鼠肺部免疫环境的影响 | 大鼠肺部免疫环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2217 | 2025-01-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics analysis of non-small cell lung cancer
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48700-8
PMID:38782901
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，探讨了非小细胞肺癌中的肿瘤生态系统，特别是髓系细胞的作用 | 揭示了肿瘤中抗炎性巨噬细胞与NK细胞/T细胞之间的反向关系，以及巨噬细胞在肿瘤中的转录重编程现象 | 样本量相对较小，仅包括25名未接受治疗的患者 | 研究非小细胞肺癌肿瘤生态系统中的免疫细胞类型及其作用 | 25名未接受治疗的腺癌和鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 约900,000个细胞，来自25名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2218 | 2025-01-07 |
MUSTANG: Multi-sample spatial transcriptomics data analysis with cross-sample transcriptional similarity guidance
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100986
PMID:38800365
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MUSTANG的空间转录组数据分析框架，能够通过跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性进行多样本空间转录组数据的细胞去卷积 | MUSTANG框架创新性地结合了跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性，提升了多样本空间转录组数据的分析能力 | NA | 开发一种能够有效分析多样本空间转录组数据的框架，以揭示组织样本细胞特征中的生物学见解 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 一个半合成空间转录组数据集和三个真实世界空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2219 | 2025-01-07 |
DeepDecon accurately estimates cancer cell fractions in bulk RNA-seq data
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100969
PMID:38800361
|
研究论文 | 本文介绍了DeepDecon，一种利用单细胞基因表达信息准确预测大块组织中癌细胞比例的深度神经网络模型 | DeepDecon通过迭代估计癌细胞比例的策略，提高了大块RNA-seq数据中细胞组成分解的准确性 | NA | 研究目的是提高大块RNA-seq数据中癌细胞比例的估计准确性 | 大块RNA-seq数据中的癌细胞比例 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | 深度神经网络 | RNA-seq数据 | 模拟和真实癌症数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2220 | 2025-01-07 |
Comprehensive integration of single-cell transcriptomic data illuminates the regulatory network architecture of plant cell fate specification
2024-May, Plant diversity
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.pld.2024.03.008
PMID:38798726
|
研究论文 | 本文通过整合63个已发表的单细胞转录组数据集，构建了一个全面的植物幼苗单细胞转录组图谱，揭示了细胞类型特异性基因调控网络 | 首次整合大量单细胞转录组数据，构建了涵盖广泛组织的植物细胞图谱，并系统性地构建了细胞类型特异性基因调控网络 | NA | 揭示植物细胞命运决定的调控网络架构 | 植物幼苗 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了63个已发表的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |