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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2201 | 2024-10-30 |
Acyloxyacyl Hydrolase Protects against Kidney Injury via Inhibition of Tubular CD74-Macrophage Crosstalk
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.91237
PMID:38904010
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研究论文 | 研究了乙酰氧乙酰水解酶(AOAH)通过抑制肾小管上皮细胞CD74信号通路来保护肾脏免受损伤和纤维化的作用 | 首次揭示了AOAH在肾脏损伤中的保护作用,并提出了通过靶向肾脏AOAH来预防肾纤维化进展的策略 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体中验证AOAH的作用 | 探讨AOAH在肾脏损伤和纤维化中的作用及其机制 | 乙酰氧乙酰水解酶(AOAH)、肾小管上皮细胞(PTECs)、巨噬细胞 | NA | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了野生型(WT)和AOAH缺失的小鼠模型 |
2202 | 2024-10-30 |
CD8 T cells induce the peritubular capillary rarefaction during AKI to CKD transition
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.96812
PMID:38904017
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研究论文 | 研究探讨了CD8 T细胞在急性肾损伤(AKI)向慢性肾病(CKD)转变过程中诱导肾小管周围毛细血管稀疏的作用 | 首次揭示了CD8 T细胞通过CXCL16-CXCR6途径介导的巨噬细胞招募,诱导内皮细胞凋亡,从而在AKI向CKD转变过程中导致肾小管周围毛细血管稀疏 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证其机制 | 探讨AKI向CKD转变过程中CD8 T细胞的作用机制 | CD8 T细胞在AKI向CKD转变中的作用及其机制 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的单细胞RNA测序数据 |
2203 | 2024-10-30 |
Single-cell RNA-Seq analysis of molecular changes during radiation-induced skin injury: the involvement of Nur77
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.100417
PMID:39346541
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了辐射诱导皮肤损伤过程中分子变化和细胞间通讯,并探讨了Nur77在其中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了辐射诱导皮肤损伤过程中的分子变化和细胞间通讯,并发现了Nur77作为潜在的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和辐射事故患者的皮肤样本,结果的外推性可能有限 | 阐明辐射诱导皮肤损伤过程中单细胞水平的分子变化和细胞间通讯 | 辐射诱导皮肤损伤过程中单细胞水平的分子变化和细胞间通讯 | 数字病理学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类皮肤样本11个细胞群,大鼠皮肤样本13个细胞群 |
2204 | 2024-10-30 |
Seeing or believing in hyperplexed spatial proteomics via antibodies: New and old biases for an image-based technology
2024, Biological imaging
DOI:10.1017/S2633903X24000138
PMID:39464237
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研究论文 | 本文重新评估了通过抗体免疫检测进行超复用空间蛋白质组学(即>15个标记)的各个步骤,发现人眼在图像分割、信号阈值设定、抗体验证和图标渲染等过程中存在局限性 | 本文提出了BRAQUE工具,能够在标记无关的方式下从低信噪比的标记中提取粒度信息,并发现现有抗体在超复用免疫染色中的非预期染色结果,强调了更新抗体特异性定义的必要性 | 人眼在区分灰度和亮度水平方面存在局限性,且仅选择包含可见信号的图像进行分析 | 重新评估超复用空间蛋白质组学中的各个步骤,探讨人眼在其中的作用及其局限性 | 超复用空间蛋白质组学中的图像分割、信号阈值设定、抗体验证和图标渲染等步骤 | 数字病理学 | NA | 抗体免疫检测 | NA | 图像 | 公共人类淋巴结数据集 |
2205 | 2024-10-30 |
Integrating anoikis and ErbB signaling insights with machine learning and single-cell analysis for predicting prognosis and immune-targeted therapy outcomes in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446961
PMID:39464883
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研究论文 | 本研究通过整合凋亡和ErbB信号通路,利用机器学习和单细胞分析技术,预测肝细胞癌的预后和免疫靶向治疗效果 | 开发了Anoikis-ErbB相关签名(AERS)模型,用于预测肝细胞癌的预后和免疫靶向治疗效果 | NA | 预测肝细胞癌的预后和免疫靶向治疗效果 | 肝细胞癌患者的预后和免疫靶向治疗效果 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO + RSF | 基因表达数据 | 包括TCGA、ICGC和三个独立验证队列以及内部队列的数据 |
2206 | 2024-10-30 |
Gastrointestinal stromal tumors regulate macrophage M2 polarization through the MIF/CXCR4 axis to immune escape
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1431535
PMID:39464891
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研究论文 | 研究胃肠道间质瘤(GIST)中免疫细胞的浸润及其在肿瘤进展中的作用 | 发现MIF/CXCR4轴是巨噬细胞与肿瘤细胞之间最常见的配体-受体相互作用,并揭示了GIST细胞通过该轴调节巨噬细胞M2极化的机制 | 仅限于体外实验和80个GIST样本的免疫组化分析,缺乏更大规模和更全面的体内研究 | 探讨GIST中浸润免疫细胞的类型及其与肿瘤进展的关系 | 胃肠道间质瘤(GIST)中的免疫细胞浸润及其作用 | 数字病理学 | 胃肠道间质瘤 | 单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术、实时PCR | NA | RNA | 80个GIST样本 |
2207 | 2024-10-30 |
Single-cell RNA-seq analysis revealed the stemness of a specific cluster of B cells in acute lymphoblastic leukemia progression
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18296
PMID:39465162
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了急性淋巴细胞白血病进展中B细胞的干细胞特性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了急性淋巴细胞白血病中B细胞的干细胞特性及其在疾病进展中的关键作用 | 研究样本仅来自GEO数据库,可能存在数据偏差;未涉及临床试验验证 | 探讨急性淋巴细胞白血病中B细胞在调节免疫微环境中的关键作用 | 急性淋巴细胞白血病中的B细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 急性淋巴细胞白血病和健康样本的单细胞RNA测序数据 |
2208 | 2024-10-30 |
Integration of ubiquitination-related genes in predictive signatures for prognosis and immunotherapy response in sarcoma
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1446522
PMID:39469643
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研究论文 | 研究分析了泛素化相关基因在肉瘤中的表达模式、预后意义及其机制,并构建了预测模型 | 首次系统分析了泛素化相关基因在肉瘤中的表达模式及其预后意义,并构建了预测模型 | 研究主要基于公共数据库和临床样本,缺乏大规模前瞻性临床试验验证 | 探讨泛素化相关基因在肉瘤中的表达模式及其预后意义,并构建预测模型 | 泛素化相关基因在肉瘤中的表达及其预后意义 | 数字病理学 | 肉瘤 | RT-qPCR | LASSO-Cox回归 | 基因表达数据 | TCGA-SARC数据库中的样本及GEO数据库和临床组织样本 |
2209 | 2024-10-29 |
Comprehensive integration of single-cell RNA and transcriptome RNA sequencing to establish a pyroptosis-related signature for improving prognostic prediction of gastric cancer
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.02.002
PMID:38404710
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据,建立了一个与细胞焦亡相关的特征,以提高胃癌患者的预后预测 | 首次整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据,建立了一个与细胞焦亡相关的特征,用于预测胃癌患者的生存时间和治疗反应 | 需要进一步验证该特征在不同人群和不同治疗方案中的适用性 | 探索细胞焦亡相关基因作为胃癌患者的预后生物标志物和治疗指标的价值 | 胃癌患者的细胞焦亡相关基因表达和分布 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO分析 | RNA | GSE183904数据集和TCGA数据库中的胃癌转录组数据 |
2210 | 2024-10-29 |
Bulk and single-cell RNA-seq analyses reveal canonical RNA editing associated with microglia homeostasis and its role in sepsis-associated encephalopathy
2024-Nov-12, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 研究分析了大量和小鼠脑组织及小胶质细胞样本的单细胞RNA测序数据,探讨了与小胶质细胞稳态相关的经典RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的作用 | 首次揭示了小胶质细胞稳态与RNA编辑在脓毒症相关脑病中的关系,并提供了新的见解 | 研究主要基于小鼠模型,结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨小胶质细胞稳态与RNA编辑在脓毒症相关脑病中的关系 | 小鼠脑组织及小胶质细胞样本 | 数字病理学 | 脓毒症相关脑病 | RNA测序 | NA | RNA | 107个脑组织和小胶质细胞样本 |
2211 | 2024-10-29 |
Neuron-glia crosstalk and inflammatory mediators in migraine pathophysiology
2024-Nov-12, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文综述了偏头痛病理生理学中神经炎症机制的细胞和分子层面 | 介绍了PBR28-靶向成像和单细胞测序等新技术在理解偏头痛神经炎症机制中的应用 | NA | 探讨偏头痛的神经炎症机制及其在个性化治疗中的应用 | 偏头痛的神经炎症机制,包括细胞和分子层面的研究 | NA | 偏头痛 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
2212 | 2024-10-29 |
Tertiary Lymphoid Structure in Dental Pulp: The Role in Combating Bacterial Infections
2024-Oct-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406684
PMID:39465672
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研究论文 | 研究牙髓中的三级淋巴结构(TLS)在对抗细菌感染中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了健康和炎症牙髓中TLS的标志物,并发现炎症牙髓中免疫细胞类型和比例增加 | 研究主要集中在人类和小鼠模型上,可能不适用于其他物种 | 探讨牙髓中三级淋巴结构在免疫反应和细菌感染中的作用 | 健康和炎症状态下的牙髓 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康和炎症状态下的人类牙髓样本,以及小鼠牙髓炎模型 |
2213 | 2024-10-29 |
Blocking the HIF-1α/glycolysis axis inhibits allergic airway inflammation by reducing ILC2 metabolism and function
2024-Oct-27, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16361
PMID:39462230
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研究论文 | 研究HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用 | 首次揭示了HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步在人体中验证 | 探讨HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用 | 小鼠和人类的ILC2细胞 | NA | 哮喘 | 糖酵解抑制剂和HIF-1α抑制剂 | NA | 转录组数据、代谢数据和染色质免疫沉淀分析 | 小鼠和人类样本 |
2214 | 2024-10-29 |
Aging alters the effect of adiponectin receptor signaling on bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2024-Oct-27, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14390
PMID:39462849
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研究论文 | 研究衰老对脂肪细胞因子受体信号在骨髓来源间充质干细胞中作用的影响 | 首次观察到衰老小鼠骨髓中脂肪细胞因子受体表达的差异,并揭示了这些差异对骨再生和修复的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨衰老如何改变脂肪细胞因子受体信号对骨髓来源间充质干细胞的影响 | 衰老小鼠和年轻小鼠的骨髓来源间充质干细胞 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 衰老小鼠和年轻小鼠 |
2215 | 2024-10-29 |
Glial 'omics in ischemia: Acute stroke and chronic cerebral small vessel disease
2024-Oct-27, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24634
PMID:39463002
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研究论文 | 本文探讨了在缺血性中风和慢性脑小血管疾病中,胶质细胞(包括小胶质细胞)在神经免疫反应中的关键作用 | 通过转录组分析和单细胞RNA测序,识别了缺血暴露下小胶质细胞的不同基因表达特征,并发现了新的细胞亚型和功能假设 | NA | 研究胶质细胞在缺血性中风和慢性脑小血管疾病中的作用 | 小胶质细胞和星形胶质细胞在缺血性中风和慢性脑小血管疾病中的反应 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
2216 | 2024-10-29 |
Integrative analysis of bulk and single-cell transcriptomic data reveals novel insights into lipid metabolism and prognostic factors in hepatocellular carcinoma
2024-Oct-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01487-y
PMID:39453509
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研究论文 | 本研究整合了大量和单细胞转录组数据,揭示了肝细胞癌中脂质代谢相关基因的状态及其作为预后因子的潜力 | 首次整合大量和单细胞转录组数据,识别出与脂质代谢相关的基因,并开发了机器学习模型用于预测肝细胞癌的预后 | 研究依赖于公共数据库中的数据,可能存在数据质量和代表性的限制 | 探讨肝细胞癌中脂质代谢相关基因的状态及其作为预后因子的潜力 | 肝细胞癌患者的脂质代谢相关基因及预后因子 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 大量和单细胞转录组数据来自公共数据库 |
2217 | 2024-10-29 |
Microglia regulate GABAergic neurogenesis in prenatal human brain through IGF1
2024-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.19.619180
PMID:39464051
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研究论文 | 研究揭示了微胶质细胞通过IGF1调节人类胎儿大脑中GABA能神经元的生成 | 首次揭示了微胶质细胞通过IGF1促进神经前体细胞增殖和GABA能神经元发育的新机制 | NA | 探讨人类胎儿大脑中GABA能神经元生成的发育机制 | 人类胎儿大脑中的GABA能神经元和微胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、生物信息学和组织学分析 | NA | 转录组数据 | 使用新开发的神经免疫hMGE类器官模型进行实验 |
2218 | 2024-10-29 |
The First Comprehensive Description of the Platelet Single Cell Transcriptome
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618506
PMID:39464035
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研究论文 | 首次全面描述了血小板单细胞转录组 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析血小板转录组,揭示了血小板基因表达的异质性 | 现有的细胞识别算法可能导致血小板被错误分类为其他血细胞类型 | 扩展对血小板功能的理解,超越其在凝血中的传统角色 | 血小板单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名健康供体的血小板样本 |
2219 | 2024-10-29 |
In vivo CRISPRi screen identified lncRNA portfolio crucial for cutaneous squamous cell carcinoma tumor growth
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.16.618774
PMID:39464078
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研究论文 | 通过体内CRISPRi筛选,识别出对皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长至关重要的lncRNA组合 | 首次通过单细胞测序数据和CRISPR干扰筛选,识别出在皮肤鳞状细胞癌中起关键作用的lncRNA组合 | 研究主要集中在体外和异种移植模型中,未来需要进一步验证这些lncRNA在人体内的作用 | 揭示皮肤鳞状细胞癌发展中的非编码RNA的作用 | 皮肤鳞状细胞癌中的lncRNA | 数字病理学 | 皮肤癌 | CRISPR干扰筛选 | NA | 单细胞测序数据 | 来自正常和皮肤鳞状细胞癌的人类皮肤组织样本 |
2220 | 2024-10-29 |
The mTOR Pathway: A Common Link Between Alzheimer's Disease and Down Syndrome
2024-Oct-17, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13206183
PMID:39458132
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研究论文 | 本文探讨了mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症之间的共同联系 | 本文首次利用基因组学、空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学等新技术,分析mTOR通路与唐氏综合症相关阿尔茨海默病的关系 | 本文尚未完全揭示唐氏综合症相关阿尔茨海默病病理进展的机制 | 研究mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症中的作用 | mTOR通路及其上游调控因子在唐氏综合症相关阿尔茨海默病中的作用 | NA | 阿尔茨海默病 | 基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA | NA |