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当前共找到 7465 篇文献，本页显示第 2201 - 2220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2201 | 2025-10-07 |
BANMF-S: a blockwise accelerated non-negative matrix factorization framework with structural network constraints for single cell imputation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae432
PMID:39242194
|
研究论文 | 提出一种带有结构网络约束的分块加速非负矩阵分解框架BANMF-S，用于单细胞RNA测序数据的插补 | 通过构建基因-基因相似性网络和细胞-细胞相似性网络作为正则化项，并采用分块化策略通过分布式随机梯度下降加速优化 | NA | 解决单细胞RNA测序中的dropout事件问题，提高数据质量 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF), 随机梯度下降 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2202 | 2025-10-07 |
Preoperative electroacupuncture versus sham electroacupuncture for the treatment of postoperative ileus after laparoscopic surgery for colorectal cancer in China: a study protocol for a multicentre, randomised, sham-controlled trial
2024-07-05, BMJ open
IF:2.4Q1
DOI:10.1136/bmjopen-2023-083460
PMID:38969370
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研究论文 | 评估术前电针与假电针对结直肠癌腹腔镜手术后肠梗阻恢复效果的多中心随机对照试验 | 首次采用多中心随机假对照试验设计评估术前电针对POI的预防作用，并结合单细胞RNA测序进行机制研究 | 样本量相对较小（80例），仅在中国进行，结果可能受文化背景和医疗实践差异影响 | 评估术前电针对结直肠癌腹腔镜手术后肠梗阻的预防和恢复效果 | 接受结直肠癌腹腔镜手术的患者 | 临床医学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 随机对照试验 | 临床数据，生物样本 | 80例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2203 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics: background, technologies, applications, and challenges
2024-Apr-30, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09553-y
PMID:38689046
|
综述 | 本文综述单细胞转录组学技术的发展背景、技术平台、应用场景及当前面临的挑战 | 系统整合单细胞转录组学最新技术进展，涵盖空间转录组学和多组学技术的衔接点 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 总结单细胞转录组学技术发展现状与未来方向 | 单细胞测序技术及其生物信息学方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2204 | 2025-10-07 |
Maternal factor Trim75 contributes to zygotic genome activation program in mouse early embryos
2024-Apr-20, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09349-0
PMID:38643284
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据发现母源因子Trim75在小鼠早期胚胎合子基因组激活中的潜在作用 | 首次通过RNA速率分析识别Trim75作为次要ZGA的潜在驱动因子，并揭示其可能通过招募EP300和建立H3K27ac修饰促进胚胎发育 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证 | 探索母源因子在哺乳动物合子基因组激活中的作用机制 | 小鼠早期胚胎和胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA速率分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2205 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals the transcriptional alterations in the submandibular glands of aged mice
2024-03, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2023.12.002
PMID:38142941
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析老年小鼠颌下腺的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示老年小鼠颌下腺不同细胞类型的基因表达变化，特别是细胞衰老标志物和MHC I类分子的表达变化 | 研究仅针对小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；样本量未明确说明 | 阐明衰老相关唾液腺变化的分子机制 | 成年和老年小鼠的颌下腺组织 | 单细胞组学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年和老年小鼠颌下腺（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2206 | 2025-10-07 |
COL6A3 enhances the osteogenic differentiation potential of BMSCs by promoting mitophagy in the osteoporotic microenvironment
2024-Jan-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-08918-z
PMID:38270688
|
研究论文 | 本研究探讨COL6A3基因通过促进线粒体自噬增强骨髓间充质干细胞在骨质疏松微环境中的成骨分化能力 | 首次发现COL6A3基因可通过促进线粒体自噬改善骨质疏松微环境中BMSCs的成骨分化能力 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索COL6A3基因在骨质疏松微环境中对BMSCs成骨分化的调控机制 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 细胞生物学 | 骨质疏松症 | 慢病毒转染, Western blot, 免疫荧光, TUNEL检测, JC-1染色 | NA | 蛋白质表达数据, 细胞成像数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2207 | 2025-02-05 |
Development of a deep learning-based 1D convolutional neural network model for cross-species natural killer T cell identification using peripheral blood mononuclear cell single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Veterinary world
IF:1.7Q2
DOI:10.14202/vetworld.2024.2846-2857
PMID:39897371
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研究论文 | 本研究开发了一种基于一维卷积神经网络（1DCNN）的模型，用于跨物种识别自然杀伤T细胞（NKT细胞），并利用外周血单核细胞（PBMC）的单细胞RNA测序数据进行验证 | 首次应用1DCNN模型进行跨物种NKT细胞识别，并成功识别了人类、犬类和猪类PBMC中的NKT细胞 | 需要进一步研究验证这些发现，并且模型在其他细胞类型识别中的应用尚未验证 | 开发一种用于跨物种NKT细胞识别的深度学习模型 | 人类、犬类和猪类的外周血单核细胞（PBMC） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 1DCNN | RNA测序数据 | 人类、犬类和猪类的PBMC数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2208 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas of the Culex tarsalis midgut during West Nile virus infection
2024-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.603613
PMID:39091762
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了白纹伊蚊中肠细胞图谱，并研究了西尼罗河病毒感染的细胞特异性动态 | 首次在高效传播媒介白纹伊蚊中建立中肠单细胞图谱，揭示了不同细胞类型对病毒感染的差异性易感性 | 未检测到典型蚊虫抗病毒免疫基因在中肠整体水平上的显著上调 | 研究西尼罗河病毒在蚊虫中肠的感染动态和细胞特异性反应 | 白纹伊蚊中肠细胞 | 单细胞组学 | 西尼罗河病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2209 | 2025-10-07 |
Novel insights into the heterogeneity of FOXP3 + Treg cells in drug-induced allergic reactions through single-cell transcriptomics
2024-10, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-024-09509-1
PMID:39073709
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示FOXP3+调节性T细胞在药物诱导过敏反应中的异质性及其免疫调节作用 | 首次在药物诱导过敏反应背景下发现FOXP3+Treg细胞的显著转录组异质性，并证实FOXP3过表达可减轻过敏反应 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究FOXP3+Treg细胞在药物诱导过敏反应中的异质性和免疫调节功能 | 小鼠模型中的FOXP3+调节性T细胞 | 单细胞转录组学 | 药物过敏反应 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,CRISPR/Cas9基因编辑,ELISA,细胞增殖检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2210 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing revealed immune heterogeneity and its association with disease activity in rheumatoid arthritis patients
2024-10, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-024-09513-5
PMID:39009881
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序技术，揭示类风湿关节炎患者免疫异质性及其与疾病活动的关联 | 首次整合单细胞转录组/T细胞受体测序与两个大型队列的bulk RNA测序数据，系统揭示类风湿关节炎中免疫细胞异质性及其临床关联 | 样本来源仅限于外周血单个核细胞和滑膜液，未包含其他组织类型 | 探究类风湿关节炎患者免疫环境特征及其与临床特征的关联 | 类风湿关节炎患者的外周血单个核细胞和滑膜液样本 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 类风湿关节炎患者的外周血和滑膜液样本，整合两个大型队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2211 | 2025-10-07 |
T cell receptor clonotype in tumor microenvironment contributes to intratumoral signaling network in patients with colorectal cancer
2024-10, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-024-09478-5
PMID:39112913
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中T细胞受体克隆型与信号网络的关系 | 首次在结直肠癌中整合单细胞转录组和T细胞受体测序，揭示TCR克隆扩增与肿瘤免疫信号网络的关联 | 样本量相对有限（30对样本），且仅针对结直肠癌 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中基因表达和免疫特征 | 结直肠癌患者肿瘤组织和配对正常组织 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 数字图像分析 | NA | 单细胞基因表达数据, TCR序列数据, 图像数据 | 30对结直肠癌和配对正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2212 | 2025-10-07 |
ABCA7-dependent induction of neuropeptide Y is required for synaptic resilience in Alzheimer's disease through BDNF/NGFR signaling
2024-Sep-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100642
PMID:39216475
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研究论文 | 本研究通过构建abca7基因敲除斑马鱼模型，揭示了ABCA7通过调控神经肽Y表达维持阿尔茨海默病中突触完整性的新机制 | 首次发现ABCA7通过BDNF/NGFR信号通路调控神经肽Y表达，从而维持突触可塑性和脑韧性 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，需要进一步在人类样本中验证 | 探究ABCA7基因在阿尔茨海默病发病机制中的功能作用 | 斑马鱼模型、人诱导多能干细胞分化的神经元、临床患者数据 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞转录组测序 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、转录组数据、临床数据 | 斑马鱼模型、人类神经元细胞、临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2213 | 2025-10-07 |
An 18-gene signature of recurrence-associated endothelial cells predicts tumor progression and castration resistance in prostate cancer
2024-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02761-0
PMID:38997406
|
研究论文 | 本研究开发了一个18基因复发相关内皮细胞特征，用于预测前列腺癌的肿瘤进展和去势抵抗 | 首次识别并验证了与前列腺癌复发相关的内皮细胞亚群及其18基因特征，该特征在预测肿瘤复发和去势抵抗方面优于临床病理因素和商业基因签名 | 研究基于多个队列但样本量有限，需要进一步的功能验证和前瞻性研究确认临床适用性 | 探索前列腺癌中内皮细胞异质性对肿瘤复发和去势抵抗的预后和治疗意义 | 前列腺癌患者样本中的内皮细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，机器学习算法 | 11种机器学习算法通过嵌套交叉验证比较 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 8个批量转录组队列和4个单细胞RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2214 | 2025-10-07 |
Exploit Spatially Resolved Transcriptomic Data to Infer Cellular Features from Pathology Imaging Data
2024-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606654
PMID:39149252
|
研究论文 | 提出一种利用空间转录组数据标注病理图像的新方法，开发STpath模型预测细胞类型比例和肿瘤微环境分类 | 首次利用配对的空间转录组数据解决病理图像标注稀缺问题，开发了创新的迁移学习神经网络模型STpath | 训练数据有限，模型性能可能受细胞类型比例变化和图像分辨率影响 | 从病理成像数据中推断细胞特征，解决病理图像标注稀缺问题 | 乳腺癌数据集中的病理图像和空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，深度学习 | 迁移学习神经网络，STpath | 病理图像，空间转录组数据 | 三个不同的乳腺癌数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2215 | 2025-10-07 |
Identification of spatial homogeneous regions in tissues with concordex
2024-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.28.546949
PMID:39071320
|
研究论文 | 提出了一种基于空间转录组数据识别组织中空间同质区域的方法 | 开发了名为concordex的新工具，通过分析k近邻图来识别空间同质区域 | NA | 识别组织中细胞类型组成同质的空间区域 | 组织样本中的空间同质区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | k近邻图 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2216 | 2025-10-07 |
Characteristics of splenic PD-1+ γδT cells in Plasmodium yoelii nigeriensis infection
2024-06, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-023-09441-w
PMID:38265549
|
研究论文 | 本研究探讨了约氏疟原虫感染小鼠脾脏中表达PD-1的γδT细胞的表型和功能特征及其分子机制 | 首次揭示了RORα通过调控NF-κB信号通路在PD-1+ γδT细胞功能调节中的作用机制 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人体中验证 | 探究PD-1在γδT细胞功能调节中的作用机制 | 约氏疟原虫感染的C57BL/6小鼠脾脏γδT细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 感染约氏疟原虫的小鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2217 | 2025-10-07 |
Transcript-specific enrichment enables profiling rare cell states via scRNA-seq
2024-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.27.587039
PMID:38586040
|
研究论文 | 开发了一种名为PERFF-seq的可扩展方法，通过RNA流式荧光原位杂交技术实现基于特定RNA转录本的稀有细胞亚群富集和单细胞RNA测序分析 | 提出了基于RNA转录本的细胞富集方法，克服了传统流式分选依赖细胞表面蛋白标记和高质量抗体的限制，特别适用于需要分离细胞核的组织样本 | 方法在新鲜冷冻和FFPE脑组织样本中验证，但在其他组织类型中的应用效果需要进一步验证 | 开发能够富集表达特定标记转录本的稀有细胞群并进行单细胞RNA测序分析的技术 | 免疫细胞群体和脑组织样本中的细胞核 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA流式荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 141,227个免疫细胞和29,522个脑组织细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2218 | 2024-08-07 |
Correction to: Adjustment of scRNA-seq data to improve cell-type decomposition of spatial transcriptomics
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae155
PMID:38581651
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2219 | 2025-10-07 |
scEVOLVE: cell-type incremental annotation without forgetting for single-cell RNA-seq data
2024-01-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae039
PMID:38366803
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的细胞类型增量标注方法scEVOLVE，解决持续学习新细胞类型时的灾难性遗忘问题 | 首次提出细胞类型增量标注概念，结合对比样本回放和分区置信度最大化原则，引入细胞类型解相关策略 | NA | 开发能够持续学习新细胞类型的单细胞标注系统 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2220 | 2025-10-07 |
Adjustment of scRNA-seq data to improve cell-type decomposition of spatial transcriptomics
2024-01-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae063
PMID:38426323
|
研究论文 | 开发基于实例的迁移学习框架调整scRNA-seq数据以改善空间转录组数据的细胞类型分解 | 首次提出通过迁移学习调整scRNA-seq数据以匹配空间转录组数据的基因表达分布 | 未明确说明方法对特定组织类型或技术平台的适用性限制 | 改善空间转录组数据的细胞类型分解准确性 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | 迁移学习框架 | 基因表达数据 | 模拟数据集和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |