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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2181 | 2025-10-07 |
Mechanistic insights into sevoflurane-induced hippocampal neuronal damage and cognitive dysfunction through the NEAT1/Nrf2 signaling axis in aged rats
2024-12-21, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09964-4
PMID:39707048
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了七氟醚通过NEAT1/Nrf2信号轴诱导老年大鼠海马神经元损伤和认知功能障碍的分子机制 | 首次发现lncRNA NEAT1通过抑制Nrf2/ARE/HO-1通路在七氟醚诱导的神经元损伤中发挥关键作用 | 研究仅针对老年大鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 阐明七氟醚麻醉导致老年患者神经损伤和认知功能障碍的分子机制 | 老年大鼠海马神经元 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,转录组分析,TUNEL染色,H&E染色,免疫组化,免疫荧光,流式细胞术 | 大鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 老年大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2182 | 2025-10-07 |
Durable complete response after combined treatment with tumor-infiltrating lymphocytes and oncolytic adenovirus (TILT-123) in a patient with metastatic mucosal melanoma
2024-Dec, Immuno-oncology technology
DOI:10.1016/j.iotech.2024.100726
PMID:39801682
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病例报告 | 报道一例转移性黏膜黑色素瘤患者通过肿瘤浸润淋巴细胞与溶瘤腺病毒联合治疗获得持久完全缓解的病例 | 首次展示TILT-123溶瘤病毒与肿瘤浸润淋巴细胞联合治疗在不使用预处理化疗或后处理白介素-2的情况下实现完全缓解 | 单病例报告,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探索联合免疫疗法在转移性黏膜黑色素瘤治疗中的效果 | 48岁女性转移性鼻窦黏膜黑色素瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞测序,免疫组织化学分析 | NA | 临床数据,单细胞测序数据,免疫组织化学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2183 | 2025-10-07 |
Spatial multiomics atlas reveals smooth muscle phenotypic transformation and metabolic reprogramming in diabetic macroangiopathy
2024-10-12, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02458-x
PMID:39395983
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研究论文 | 本研究首次构建了糖尿病大血管病变的空间多组学图谱,揭示了平滑肌细胞表型转化和代谢重编程的特征 | 首次构建了胫前动脉的空间基因-代谢图谱,揭示了平滑肌细胞表型转化的转录驱动网络和代谢重编程关键基因 | 样本仅来自11例截肢糖尿病患者,样本量有限 | 探索糖尿病大血管病变中平滑肌细胞表型转化和代谢重编程的分子机制 | 糖尿病患者的胫前动脉组织 | 空间多组学 | 糖尿病大血管病变 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,空间代谢组测序 | 多组学整合分析,细胞通讯分析,时间序列分析,网络分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,空间代谢组数据 | 11例糖尿病截肢患者的胫前动脉 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
| 2184 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics in thyroid eye disease
2024 Oct-Dec, Taiwan journal of ophthalmology
IF:1.0Q4
DOI:10.4103/tjo.TJO-D-23-00096
PMID:39803402
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综述 | 总结单细胞转录组学在甲状腺眼病研究中的最新突破和应用前景 | 首次系统综述单细胞RNA测序技术在甲状腺眼病研究中的应用,揭示疾病发病机制的新见解 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要依赖已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞转录组学在甲状腺眼病研究中的应用价值和未来方向 | 甲状腺眼病患者眼眶后组织 | 数字病理学 | 甲状腺眼病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | NA |
| 2185 | 2025-10-07 |
Interferon signaling and ferroptosis in tumor immunology and therapy
2024-Aug-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00668-w
PMID:39127858
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研究论文 | 本研究阐明了干扰素信号通路通过调控铁死亡影响CD8+T细胞耗竭的机制及其在肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次揭示干扰素信号通路与铁死亡的相互作用机制,并发现沉默HSPA6或DNAJB1可增强PD-1疗法疗效 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究干扰素信号通路对肿瘤细胞铁死亡的影响及其与CD8+T细胞耗竭的关联机制 | 肿瘤细胞、CD8+T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序、生物信息学分析、体外实验、体内验证 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质水平数据、细胞活性数据 | TCGA数据库数据及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2186 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics reveals gene interactions and signaling pathway dynamics in rat embryos with anorectal malformation
2024-05-21, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09878-1
PMID:38769159
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了大鼠胚胎肛门直肠畸形的基因表达特征和信号通路动态 | 首次在胚胎发育过程中应用空间转录组学技术,揭示了肛门直肠畸形中位置特异性基因表达模式和信号通路协同作用 | 研究仅针对GD14-GD16胚胎期,缺乏更早期或更晚期的发育阶段分析 | 探究肛门直肠畸形的分子机制和基因调控网络 | 大鼠胚胎(正常组和肛门直肠畸形组) | 空间转录组学 | 肛门直肠畸形 | 空间转录组学,免疫荧光染色,WGCNA,GSEA,PROGENy | NA | 空间基因表达数据,图像数据 | GD14-GD16胚胎期大鼠样本(包含正常和畸形病例) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2187 | 2025-10-07 |
Miltefosine reinvigorates exhausted T cells by targeting their bioenergetic state
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101869
PMID:39657666
|
研究论文 | 本研究通过筛选FDA批准的小分子库,发现米替福新能够通过改善T细胞的生物能量状态来逆转T细胞耗竭 | 首次发现米替福新能够以不依赖PD-1/PD-L1的方式逆转T细胞耗竭,即使在PD-1抗体治疗无效的终末耗竭状态下仍能增强CAR-T细胞活性 | 研究主要基于体外模型和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发针对T细胞耗竭的新型免疫治疗策略 | 耗竭的CAR-T细胞和T细胞 | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞测序,小分子筛选 | CAR-T细胞模型,同种异体和同基因肿瘤模型 | 基因表达数据,细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2188 | 2025-10-07 |
Upregulation of multiple key molecules is correlated with poor prognosis and immune infiltrates in hepatocellular carcinoma by bulk and single-cell RNA-seq
2024-Nov-12, Aging
DOI:10.18632/aging.206151
PMID:39537209
|
研究论文 | 本研究通过bulk和单细胞RNA-seq分析,构建了基于关键基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次结合三种差异分析方法和单细胞测序技术鉴定肝细胞癌关键基因,并建立与免疫细胞浸润相关的预后模型 | 研究主要基于TCGA数据库,缺乏外部验证队列 | 构建肝细胞癌预后预测模型并探索关键基因与免疫浸润的关系 | 肝细胞癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2189 | 2025-10-07 |
Lactylation-driven TNFR2 expression in regulatory T cells promotes the progression of malignant pleural effusion
2024-Dec-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010040
PMID:39721754
|
研究论文 | 本研究揭示了乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控调节性T细胞中TNFR2表达的机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 首次发现乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控NF-κB p65转录因子,进而上调TNFR2表达的新表观遗传机制 | NA | 探索调节性T细胞中TNFR2表达的调控机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 人类和小鼠的恶性胸腔积液样本及调节性T细胞 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2190 | 2025-10-07 |
Global identification of mammalian host and nested gene pairs reveal tissue-specific transcriptional interplay
2024-Dec-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279430.124
PMID:39578100
|
研究论文 | 本研究通过构建小鼠和人类宿主/嵌套基因对的全面目录,揭示了组织特异性转录互作模式 | 提供了最新的宿主/嵌套基因对目录,发现转录共现具有组织特异性,特别是在睾丸组织中尤为普遍 | NA | 系统识别哺乳动物宿主和嵌套基因对,揭示其组织特异性转录互作机制 | 小鼠和人类基因组中的宿主/嵌套基因对 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2191 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Sheds Light on Tumor Evolution: Perspectives from City of Hope's Clinical Trial Teams
2024-Dec-10, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13247507
PMID:39768430
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学在临床肿瘤研究中的应用及其对理解肿瘤演化的意义 | 提出了整合单细胞RNA测序到临床实验设计的实践经验,并强调了计算团队与临床团队协作的'团队医学'方法 | 实施单细胞方法面临高质量细胞获取、技术变异性和复杂计算分析等挑战 | 理解肿瘤异质性对肿瘤演化和治疗反应的影响,以开发更有效的治疗方法 | 乳腺癌、脑癌和卵巢癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多种癌症(乳腺癌、脑癌、卵巢癌) | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2192 | 2025-10-07 |
Deciphering progressive lesion areas in breast cancer spatial transcriptomics via TGR-NMF
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae707
PMID:39780487
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研究论文 | 本研究开发了TGR-NMF方法,用于解析乳腺癌空间转录组数据中的疾病进展相关区域 | 提出了三图正则化非负矩阵分解方法和单元化策略,整合基因表达和空间位置邻域拓扑,能够利用完整的基因表达计数数据并提高可解释性 | 未明确说明样本数量和具体的技术验证细节 | 解析乳腺癌组织异质性,识别与疾病进展相关的空间区域 | 乳腺癌空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | TGR-NMF(三图正则化非负矩阵分解) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2193 | 2025-10-07 |
Targeting squalene epoxidase restores anti-PD-1 efficacy in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis-induced hepatocellular carcinoma
2024-Nov-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331117
PMID:38744443
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研究论文 | 本研究探讨了角鲨烯环氧酶在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎诱导的肝细胞癌中通过调节肿瘤免疫微环境影响抗PD-1疗效的机制 | 首次揭示SQLE通过胆固醇积累导致CD8+ T细胞线粒体功能障碍和髓源性抑制细胞活化,从而介导免疫抑制并影响抗PD-1疗效 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究SQLE在MASH-HCC肿瘤免疫微环境调节中的作用及对抗PD-1疗效的影响 | 肝细胞特异性SQLE转基因和敲除小鼠、原位移植模型和人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | 转基因小鼠模型、敲除小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2194 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional atlas of human breast cancers and model systems
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70044
PMID:39417215
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研究论文 | 构建了人类乳腺癌的单细胞转录图谱,包含患者样本和多种模型系统 | 整合了多种乳腺癌模型系统的单细胞RNA测序数据,开发了动态细胞样本注释方法 | 样本数量有限,模型系统与真实患者样本仍存在差异 | 深入理解乳腺癌细胞多样性,识别有效治疗方法 | 乳腺癌患者肿瘤组织、淋巴结转移灶、减乳成形术样本、PDX模型、PDXO类器官和细胞系 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | SCSubtype, TNBCtype细胞分型预测器 | 单细胞转录组数据 | 117个样本,共506,719个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2195 | 2025-10-07 |
Loss of p53 and SMAD4 induces adenosquamous subtype pancreatic cancer in the absence of an oncogenic KRAS mutation
2024-Sep-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101711
PMID:39232498
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型证明在KRAS野生型背景下,Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2缺失可诱导自发性胰腺癌发生 | 首次建立KRAS野生型自发性胰腺癌小鼠模型,揭示p53和SMAD4/TGFBR2缺失可独立于致癌KRAS突变驱动胰腺癌发生 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究KRAS野生型胰腺癌的发病机制 | 基因工程小鼠模型(PPSSC和PPTTC模型) | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,基因工程小鼠模型 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | 多个基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2196 | 2025-10-07 |
The Effect of Exposure to Neighborhood Violence on Glucocorticoid Receptor Signaling in Lung Tumors
2024-07-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0032
PMID:38912926
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研究论文 | 本研究探讨了居住区暴力犯罪暴露对肺肿瘤中糖皮质激素受体信号通路的影响 | 首次将社区暴力犯罪暴露与肺肿瘤中糖皮质激素受体染色质招募的重新编程联系起来 | 样本量较小(仅15个肺肿瘤样本),研究结果需要更大样本验证 | 研究社会压力暴露与肺肿瘤基因表达之间的关系 | 肺肿瘤样本和居住区暴力犯罪率 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学,CUT&RUN(ChIP测序技术) | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 15个肺肿瘤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 2197 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109916
PMID:38812536
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研究论文 | 构建了迄今为止最全面的小鼠视网膜单细胞图谱,整合了约33万个细胞的数据 | 创建了最大的小鼠视网膜单细胞RNA测序数据集,首次整合多个数据集构建综合细胞图谱,识别了138种细胞类型 | 仅使用C57BL/6J野生型小鼠,可能不适用于其他品系或疾病模型 | 构建全面的小鼠视网膜单细胞图谱以解决现有数据集的局限性 | C57BL/6J小鼠视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,抗体磁珠分选 | NA | 单细胞基因表达数据 | 约190,000个单细胞(本研究),整合后超过330,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2198 | 2025-10-07 |
Pro-inflammatory feedback loops define immune responses to pathogenic Lentivirus infection
2024-02-05, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01290-y
PMID:38317183
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示致病性慢病毒感染引发促炎反馈环路导致疾病进展的免疫机制 | 利用遗传相似但毒力不同的SIV变异株感染模型,结合纵向单细胞转录组和细胞通讯分析,首次发现致病性慢病毒通过逃逸干扰素应答并激活CXCL10/CXCL16驱动的促炎放大环路 | 研究局限于猪尾猕猴模型,未在人类HIV感染中直接验证 | 揭示慢病毒致病性差异的免疫学基础 | 感染不同毒力SIV变异株的猪尾猕猴免疫细胞 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞转录组测序,细胞间通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 猪尾猕猴感染队列的纵向样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2199 | 2025-10-07 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomics to elucidate the role and potential mechanisms of autophagy in aging tissue
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00996-w
PMID:39414741
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研究论文 | 本研究通过整合大量和单细胞转录组数据,揭示自噬在血液组织衰老过程中的关键作用及机制 | 首次通过整合大规模正常组织和AML样本的转录组数据,在单细胞分辨率水平确定经典单核细胞是衰老过程中自噬水平升高的关键细胞类型,并发现缺氧是重要调控因素 | 研究主要基于生物信息学分析,需要实验验证;样本来源和数量可能存在偏差 | 识别自噬与衰老相关性最强的组织,探索自噬在衰老组织微环境中的功能和机制 | 正常组织样本、不同年龄血液样本、急性髓系白血病样本 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 超过7000个正常组织样本、不同年龄血液单细胞数据、2000多个AML样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2200 | 2025-10-07 |
Non-glycanated ΔDCN isoform in muscle invasive bladder cancer mediates cancer stemness and gemcitabine resistance
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00998-8
PMID:39466536
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研究论文 | 本研究鉴定出膀胱癌干细胞中非糖基化ΔDCN亚型,揭示其通过诱导干细胞表型和赋予吉西他滨化疗耐药性促进肿瘤进展 | 首次在膀胱癌干细胞中发现非糖基化ΔDCN亚型,揭示其与糖基化DCN在细胞定位和功能上的对立作用 | 研究机制尚未完全阐明,临床样本量有限 | 阐明DCN对膀胱癌干细胞调控作用及在肌层浸润性膀胱癌中的机制 | 膀胱癌干细胞、膀胱癌细胞系、临床组织样本 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、慢病毒转染、CCK8检测、球体形成实验 | NA | 基因表达数据、临床病理特征、生存数据 | 来自TCGA和GEO数据库的数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |