单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-06-18 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning to predict breast cancer prognosis: A study based on natural killer cell-related genes
2024-08, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18549
PMID:39098994
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据与机器学习方法，基于自然杀伤细胞相关基因构建乳腺癌预后预测模型 | 首次联合101种机器学习算法筛选最佳NKRG预后模型，并整合CellChat分析和药物活性预测验证临床适用性 | 摘要未提及验证队列的多样性，也未讨论模型在多中心数据中的泛化能力 | 构建基于自然杀伤细胞相关基因的乳腺癌预后模型以优化风险分层和个体化治疗 | 乳腺癌患者的单细胞转录组数据和临床预后信息 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso-随机生存森林（RSF） | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 202 | 2026-06-18 |
Psoriatic arthritis subtypes are phenocopied in humanized mice
2024-07-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.178213
PMID:39114979
|
研究论文 | 通过人源化小鼠模型研究银屑病关节炎亚型的表型复制 | 首次利用人源化NSG-SGM3小鼠重现银屑病和银屑病关节炎的表型，并揭示CD8+ T细胞和免疫球蛋白在发病中的关键作用 | 未提供转基因鼠模型的长期稳定性评估和临床转化的直接证据 | 阐明银屑病关节炎的免疫发病机制并验证人源化模型作为研究平台的有效性 | 银屑病和银屑病关节炎患者的外周血单核细胞、血清及记忆T细胞 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 空间转录组学、免疫荧光 | 人源化小鼠模型 | 转录组数据、图像数据 | 未具体说明样本数量，涉及患者外周血和血清 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 203 | 2026-06-18 |
Deciphering lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy response through an AI-driven stemness-related gene signature
2024-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18564
PMID:39046884
|
研究论文 | 通过人工智能驱动干性相关基因签名解码肺腺癌预后和免疫治疗反应 | 结合传统回归、机器学习和深度学习算法构建AI驱动的干性相关基因签名，并利用多组学数据探索其与肿瘤免疫微环境的关系 | NA | 探索肺腺癌干性相关基因在预后和免疫治疗反应中的作用 | 肺腺癌患者和细胞系 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低 | 传统回归、机器学习、深度学习集成网络 | 单细胞RNA测序数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 204 | 2026-06-18 |
Summary data-based Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing analyses identify immune associations with low-level LGALS9 in sepsis
2024-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18559
PMID:39044269
|
研究论文 | 通过汇总数据的孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析，发现低水平LGALS9与败血症的免疫关联 | 首次整合全基因组关联研究数据与表达数量性状位点数据，结合单细胞RNA测序揭示LGALS9抑制在单核细胞和T细胞亚型中的激活与分化机制 | NA | 深入研究败血症免疫细胞表型变化及其分子机制 | 败血症患者的免疫细胞，包括单核细胞和T细胞亚型 | 机器学习 | 败血症 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 205 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals SPP1-CD44-mediated macrophage-tumor cell interactions drive chemoresistance in TNBC
2024-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18525
PMID:38982317
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示SPP1-CD44介导的巨噬细胞与肿瘤细胞相互作用驱动三阴性乳腺癌化疗耐药 | 首次发现SPP1+巨噬细胞通过分泌SPP1信号与恶性细胞表面CD44相互作用，激活整合素通路下游PDE3B通路，从而驱动化疗耐药，并提出SPP1+巨噬细胞可作为治疗靶点 | 样本量较小（仅5例敏感和5例耐药患者），且未在更大规模队列或体内模型中验证该机制 | 探究三阴性乳腺癌化疗耐药的分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者的巨噬细胞和恶性细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 临床样本图像 | 10例三阴性乳腺癌患者（5例化疗敏感，5例耐药） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 206 | 2026-06-18 |
Adrenal gland macrophages regulate glucocorticoid production through Trem2 and TGF-β
2024-06-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174746
PMID:38869957
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型，揭示了肾上腺巨噬细胞通过Trem2和TGF-β调节糖皮质激素生成的分子机制 | 首次发现肾上腺巨噬细胞中的Trem2在应激反应中上调，并通过TGF-β信号通路负调控糖皮质激素生成，为压力相关疾病的免疫干预提供了新靶点 | 主要基于小鼠模型，结果向人类转化的可行性尚需验证；未对Trem2-TGF-β通路的上下游信号进行完整解析 | 探究肾上腺巨噬细胞在急性或慢性应激条件下调控糖皮质激素生成的分子机制 | 小鼠肾上腺巨噬细胞 | 机器学习 | 压力相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量，涉及野生型小鼠和Trem2条件性敲除小鼠的肾上腺组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 207 | 2026-06-18 |
DRA involvement in linaclotide-stimulated bicarbonate secretion during loss of CFTR function
2024-06-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172364
PMID:38869953
|
研究论文 | 研究林氯西肽在CFTR功能缺失情况下刺激十二指肠碳酸氢盐分泌的机制及DRA参与作用 | 首次发现林氯西肽能通过上调DRA表达来补偿CFTR功能缺失，促进十二指肠碳酸氢盐分泌，为囊性纤维化患者提供潜在治疗新策略 | 具体分子调控通路尚未完全阐明，且研究主要在动物模型和体外实验中进行，缺乏长期临床验证数据 | 探究林氯西肽在CFTR功能缺失时刺激十二指肠碳酸氢盐分泌的机制，以及DRA在该过程中的作用 | 小鼠十二指肠、人类十二指肠活检组织及类器官 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | scRNA-Seq, 共聚焦显微镜 | NA | 转录组测序数据、图像数据 | CFTR基因敲除小鼠、CFTR功能抑制剂处理的十二指肠标本、人类十二指肠单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 人类十二指肠单细胞RNA测序数据集分析 |
| 208 | 2026-06-18 |
Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of a TLR9 agonist in autochthonous murine sarcomas
2024-06-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.178767
PMID:39133651
|
research paper | 通过瘤内注射TLR9激动剂增强原位小鼠肉瘤的放疗反应 | 首次在原位软组织肉瘤模型中使用CRISPR/Cas9和化学致癌剂MCA生成高肿瘤突变负荷肿瘤，并证明CpG联合放疗通过CD8+ T细胞依赖机制显著增强肿瘤反应 | 未说明 | 研究TLR9激动剂CpG联合放疗增强肉瘤反应的免疫机制 | 原位软组织肉瘤小鼠模型 | machine learning | soft-tissue sarcoma | NA | NA | NA | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 209 | 2026-06-18 |
Deletion of Fbxw7 in oocytes causes follicle loss and premature ovarian insufficiency in mice
2024-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18487
PMID:39031722
|
研究论文 | 该研究揭示了卵母细胞特异性敲除Fbxw7会导致小鼠卵泡丢失和卵巢早衰，并探讨了其机制 | 首次证明了Fbxw7在卵巢功能中的重要作用，特别是通过单细胞RNA测序揭示了Clu和Ccl2转录本积累可能加速卵巢早衰的机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证，且未深入探讨FBXW7在卵巢中的具体调控网络 | 探讨FBXW7在卵泡发生和卵巢功能中的作用及其与卵巢早衰的关系 | 顺铂诱导的卵巢早衰小鼠模型和卵母细胞特异性Fbxw7敲除小鼠 | 机器学习 | 卵巢早衰 | 单细胞RNA测序，原位杂交 | 无 | 基因表达数据 | 使用顺铂处理小鼠模型和Fbxw7敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2026-06-18 |
Identifying the protective effects of miR-874-3p/ATF3 axis in intervertebral disc degeneration by single-cell RNA sequencing and validation
2024-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18492
PMID:38890795
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和验证揭示miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定ATF3为椎间盘退变的关键铁死亡基因，并验证miR-874-3p通过靶向ATF3抑制髓核细胞铁死亡、凋亡、炎症和细胞外基质降解的保护机制 | 未提及具体的局限性 | 探究miR-874-3p/ATF3信号轴在椎间盘退变中的病理机制和治疗潜力 | 椎间盘退变患者样本、大鼠模型及髓核细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、Western blotting、流式细胞术、ELISA、动物实验 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 | 椎间盘退变患者和椎间盘退变大鼠模型样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对患者样本和大鼠模型进行单细胞RNA测序分析 |
| 211 | 2026-06-18 |
Spatial analysis of recurrent glioblastoma reveals perivascular niche organization
2024-05-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179853
PMID:38805346
|
研究论文 | 通过空间分析揭示复发性胶质母细胞瘤的血管周围微环境组织特征 | 同时结合成像技术、无标记反射成像和单细胞空间转录组学，在同一切片上分析缺氧、血管生成、炎症微环境、细胞外基质组织、TERT启动子突变状态及致癌扩增，首次发现ECM纹理可预测单细胞遗传特征，并揭示复发性GBM中血管周围微环境的结构化组织 | NA | 探究遗传异质性与肿瘤微环境之间的相互作用，特别是在原发和复发性胶质母细胞瘤中的空间组织对肿瘤演化的影响 | 配对的原发和复发性胶质母细胞瘤存档肿瘤组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 成像技术、无标记反射成像、单细胞空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 配对的原发和复发性肿瘤组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 单细胞空间转录组学 |
| 212 | 2026-06-18 |
Coordinated immune dysregulation in juvenile dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2024-05-14, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176963
PMID:38743491
|
研究论文 | 通过单细胞基因组学揭示青少年皮肌炎中的协调性免疫失调 | 首次利用单细胞转录组学结合表面蛋白表达，系统揭示JDM不同疾病活动阶段的免疫细胞状态变化，并发现B细胞向未成熟幼稚状态的偏移以及Th2介导的炎症持续存在 | 未提及具体局限 | 解析青少年皮肌炎中免疫系统失调的细胞状态及机制 | 青少年皮肌炎患者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 青少年皮肌炎 | 单细胞转录组学、表面蛋白表达分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 不同疾病活动阶段的JDM患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 10x Genomics平台 |
| 213 | 2026-06-18 |
Selective CAR T cell-mediated B cell depletion suppresses IFN signature in SLE
2024-05-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179433
PMID:38722688
|
研究论文 | 应用单细胞RNA测序和T/B细胞库分析，深入解析CD19 CAR T细胞介导的B细胞清除对系统性红斑狼疮患者免疫信号通路的分子变化 | 首次通过结合单细胞RNA-Seq和T/B细胞库分析，揭示了B细胞清除后单核细胞和T细胞亚群中I型IFN信号通路的显著下调，证实了B细胞反应与SLE中IFN信号升高的因果关系 | 未在摘要中明确说明 | 阐明CD19 CAR T细胞介导的B细胞清除后SLE患者免疫信号通路的分子变化，以及B细胞反应与I型IFN信号升高之间的因果关系 | 系统性红斑狼疮患者 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA-Seq、T/B细胞库分析 | NA | 基因表达数据、免疫细胞库数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2026-06-18 |
Single-cell profiling transcriptomic reveals cellular heterogeneity and cellular crosstalk in choroidal neovascularization model
2024-05, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109877
PMID:38537669
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示脉络膜新生血管模型中视网膜色素上皮/脉络膜复合体的细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次利用单细胞测序全面解析视网膜色素上皮/脉络膜复合体的细胞异质性，鉴定出与脉络膜新生血管紧密相关的内皮细胞簇、参与nAMD发病的五种成纤维细胞簇和三种巨噬细胞簇，并构建了细胞间通讯网络 | 未提及该研究的局限 | 探索脉络膜新生血管模型中视网膜色素上皮/脉络膜复合体的细胞多样性和细胞间相互作用 | 脉络膜新生血管模型中的视网膜色素上皮/脉络膜复合体 | 生物信息学 | 老年性黄斑变性 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从脉络膜新生血管模型获取的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 215 | 2026-06-18 |
Cortical somatostatin long-range projection neurons and interneurons exhibit divergent developmental trajectories
2024-02-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.013
PMID:38086373
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学，研究小鼠皮层中表达生长抑素的抑制性神经元的发育轨迹 | 首次揭示SST+抑制性神经元在胚胎期分化为长投射神经元和两种中间神经元，并遵循不同的发育路径 | 中间神经元多样性可能需要在出生后早期进一步细化，文中未提供出生后阶段的详细数据 | 探究皮层抑制性神经元的细胞多样性出现的时间和机制 | 小鼠皮层中表达生长抑素的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎和出生后早期样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'，空间转录组学平台 |
| 216 | 2026-06-18 |
The role of NF-κB signaling pathway in reactive astrocytes among neurodegeneration after methamphetamine exposure by integrated bioinformatics
2024-02-08, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2023.110909
PMID:38061485
|
研究论文 | 通过整合生物信息学方法，探究NF-κB信号通路在甲基苯丙胺暴露后反应性星形胶质细胞导致神经退行性变中的作用 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，系统分析METH暴露后反应性星形胶质细胞的免疫微环境变化及其与帕金森病的共同致病机制，并利用随机森林算法建立诊断模型 | 未提及具体局限性，可能包括样本数量有限、动物模型与人类差异、以及NF-κB通路调控机制在体内外的验证不足 | 阐明METH暴露后反应性星形胶质细胞过度激活在神经退行性变中的作用及NF-κB信号通路的机制 | METH暴露后小鼠脑组织中的星形胶质细胞和神经元，以及人类GEO数据库中的转录组数据 | 机器学习 | 神经退行性疾病（帕金森病） | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 217 | 2026-06-18 |
Multipotent progenitors instruct ontogeny of the superior colliculus
2024-01-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.009
PMID:38096816
|
研究论文 | 通过MADM-CloneSeq技术分析小鼠上丘的发育谱系，揭示径向胶质前体细胞的多能性及PTEN依赖的细胞类型比例调控机制 | 首次在单细胞水平建立哺乳动物上丘发育的谱系框架，发现单个径向胶质前体细胞可产生所有兴奋性和抑制性神经元类型，并揭示PTEN信号调控不同神经元类型的适当比例 | 未明确说明实验样本量大小及是否涵盖所有上丘区域或发育阶段 | 阐明哺乳动物上丘细胞类型多样性的发育原理 | 小鼠上丘的径向胶质前体细胞及其产生的兴奋性和抑制性神经元与胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 遗传镶嵌分析, MADM-CloneSeq | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | MADM-CloneSeq（基于遗传镶嵌分析与双标记的单细胞克隆分析） |
| 218 | 2026-06-18 |
STOmicsDB: a comprehensive database for spatial transcriptomics data sharing, analysis and visualization
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad933
PMID:37953328
|
研究论文 | 介绍STOmicsDB，一个综合性的空间转录组学数据库，用于数据共享、分析和可视化 | 整合218个手工整理的数据集，涵盖17个物种，并支持用户自定义子数据库和快速可视化百万细胞 | 未明确说明局限性，但可能依赖手动整理数据集的完整性和覆盖范围 | 为空间转录组学数据提供一站式共享、分析和可视化平台 | 空间转录组学数据集（218个数据集，涵盖17个物种） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 218个数据集，涵盖17个物种 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 219 | 2026-06-18 |
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1063
PMID:37953308
|
研究论文 | StemDriver是一个综合性知识库，致力于功能注释参与造血干细胞命运决定的基因 | 利用单细胞RNA测序数据构建了完整的造血谱系图谱，并提供了标准化的数据分析流程 | 当前版本仅整合了42项研究数据，覆盖14种组织类型，可能未涵盖所有相关数据 | 为参与造血干细胞命运决定的基因提供功能注释和参考数据集 | 造血干细胞和成熟细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类样本23,839个基因，小鼠样本29,533个基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 220 | 2026-06-18 |
Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of the TLR9 agonist CpG to stimulate CD8 T cells in an autochthonous mouse model of sarcoma
2024-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.03.573968
PMID:38260522
|
研究论文 | 通过瘤内注射TLR9激动剂CpG增强自发性肉瘤小鼠模型对放疗的应答 | 首次在自发性肉瘤模型中验证CpG联合放疗对CD8 T细胞的依赖性机制，并结合CRISPR/Cas9和化学致癌物MCA构建高肿瘤突变负担模型 | 未在人体临床试验中验证，且机制研究主要基于小鼠模型 | 探究TLR9激动剂CpG增强放疗对软组织肉瘤的免疫应答机制 | 自发性软组织肉瘤小鼠模型 | 机器学习 | 软组织肉瘤 | CRISPR/Cas9, 化学诱导, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 质谱流式数据 | 自发性肉瘤小鼠模型，具体数量未在摘要中给出 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |