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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-04-15 |
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627006
PMID:39713439
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研究论文 | 本文提出了一种名为cosmoDA的新型差异丰度测试方案，用于处理具有相关特征的组成型高通量测序数据 | 扩展了a-b幂交互模型以纳入协变量信息，并结合广义得分匹配估计框架，显著降低了相关特征导致的假阳性检测 | 未明确说明模型对极端稀疏数据或大规模特征交互的适用性限制 | 开发能够准确估计群体异质性下特征交互并降低假发现率的差异丰度测试方法 | 稀疏组成型计数数据，特别是单细胞RNA测序和扩增子测序数据 | 生物信息学 | NA | 高通量测序，单细胞RNA-seq，扩增子测序 | a-b幂交互模型，广义得分匹配估计 | 组成型计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2026-04-15 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-11, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
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研究论文 | 本研究通过大规模测序数据和CRISPRi实验，揭示了人类阿尔茨海默病衰老大脑中广泛存在的转座子失调及其与神经炎症的关联 | 首次在人类阿尔茨海默病衰老大脑中系统表征了转座子表达数量性状位点，并通过CRISPRi实验验证了特定转座子对C1QTNF4基因表达的神经元特异性抑制作用 | 研究主要基于三个脑库的数据，样本代表性可能有限，且CRISPRi实验仅在iPSC衍生神经元中进行，未涵盖其他脑细胞类型 | 探究人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座子失调的遗传调控机制及其在疾病中的作用 | 人类阿尔茨海默病患者的衰老脑组织样本及iPSC衍生神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序、全基因组测序、CRISPR干扰 | 数量性状位点分析 | 基因组数据、转录组数据 | 基于三个人类AD脑库的大规模样本 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、全基因组测序 | NA | NA |
| 203 | 2026-04-15 |
A scalable approach to topic modelling in single-cell data by approximate pseudobulk projection
2024-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402713
PMID:39107066
|
研究论文 | 本文提出了一种名为ASAP的可扩展近似方法，用于单细胞RNA-seq数据中的主题建模，通过近似伪批量投影提高计算效率 | ASAP方法在单细胞RNA-seq数据分析中实现了比现有方法更准确且计算时间和内存消耗大幅降低的可扩展近似主题建模 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种可扩展的近似方法，用于单细胞数据中的主题建模，以降低计算资源需求 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 概率主题模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2026-04-15 |
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.611061
PMID:39345364
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研究论文 | 本研究通过抑制TRPC3通道，改善了阿尔茨海默病模型中的突触功能障碍和记忆缺陷 | 首次发现TRPC3在AD患者和模型中的上调，并鉴定出抑制剂JW-65能通过恢复钙信号通路发挥神经保护作用 | 研究主要基于动物和细胞模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究TRPC3通道在阿尔茨海默病神经退行性变中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | AD患者脑组织、AD小鼠模型（急性和慢性）以及培养的大鼠海马神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq、生物信息学分析、RNA-seq | NA | RNA-seq数据、细胞和动物模型数据 | AD患者队列的已发表单细胞RNA-seq数据、死后AD脑组织、急性和慢性AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2026-04-15 |
Lin-CD117+CD34+FcεRI+ progenitor cells are increased in chronic spontaneous urticaria and predict clinical responsiveness to anti-IgE therapy
2024-09, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16127
PMID:38634175
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研究论文 | 本研究探讨了慢性自发性荨麻疹患者外周血中Lin-CD117+CD34+FcεRI+祖细胞的增加及其对抗IgE疗法临床反应性的预测价值 | 首次将外周血中特定的祖细胞亚群（Lin-CD34+CD117+FcεRI+）与CSU的临床表型及抗IgE治疗反应相关联，并利用单细胞RNA测序揭示了其细胞谱系组成 | 样本量相对有限（CSU患者n=55，对照组n=22），单细胞RNA测序仅在部分患者（n=8）和对照（n=4）中进行，需要更大规模的研究验证 | 探究慢性自发性荨麻疹的病理机制，并寻找预测抗IgE治疗（奥马珠单抗）临床反应性的生物标志物 | 慢性自发性荨麻疹患者（n=55，其中12人接受奥马珠单抗治疗）和健康对照（n=22）的外周血样本 | 免疫学，皮肤病学 | 慢性自发性荨麻疹 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据，单细胞转录组数据 | CSU患者55例（其中12例接受奥马珠单抗），健康对照22例；scRNA-Seq子集：CSU患者8例，健康对照4例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 206 | 2026-04-15 |
Hepatic organoids move from adolescence to maturity
2024-06, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15893
PMID:38451053
|
综述 | 本文回顾了肝类器官作为研究工具的发展历程，并探讨了其在肝脏基础研究、药物发现与安全性测试以及疾病病理生物学理解三个领域的贡献 | 系统性地阐述了肝类器官从“青春期”向“成熟期”发展的关键路径，并前瞻性地指出了未来五年内单细胞RNA测序、CRISPR技术与类器官方法学改进相结合将带来的突破 | 未提供具体的实验数据或案例研究，主要基于现有文献和发展趋势进行评述 | 评估肝类器官作为研究工具的当前应用与未来潜力，推动其在肝脏疾病研究和治疗中的应用 | 肝类器官及其在肝脏研究中的应用 | 组织工程与疾病模型 | 肝脏疾病（包括肝纤维化） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR技术、类器官培养技术 | 类器官模型 | 综述性文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 207 | 2026-04-15 |
Thrombospondin 2 is a key determinant of fibrogenesis in non-alcoholic fatty liver disease
2024-02, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15792
PMID:38010940
|
研究论文 | 本研究通过分析NAFLD患者的单细胞RNA测序数据、肝组织样本和LX-2细胞，揭示了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的高表达及其通过TGFβ通路调控纤维化的机制 | 首次在NAFLD中通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，明确了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的特异性高表达，并发现其通过非经典TGFβ-SMAD2/3通路调控胶原生成 | 研究主要基于体外细胞模型（LX-2细胞）和基因数据集分析，缺乏体内实验验证；样本量未明确说明，可能影响结果的普适性 | 识别NAFLD中表达THBS2/TSP2的特定细胞，并探究其上调的分子机制 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者肝组织、肝星状细胞（HSCs）及LX-2细胞系 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、定量聚合酶链反应（qPCR）、原位杂交、计算生物学、遗传学、免疫学和药理学方法 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、肝组织样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 208 | 2026-04-14 |
The periosteum provides a stromal defence against cancer invasion into the bone
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07822-1
PMID:39169177
|
研究论文 | 本研究揭示了骨膜通过形成基质屏障来抵御头颈部鳞状细胞癌骨侵袭的机制 | 首次证明骨膜反应是抵御癌症骨侵袭的天然防御机制，并发现HIF1α-TIMP1信号轴在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证相对有限 | 探究骨膜在癌症骨侵袭过程中的生理功能和分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的骨侵袭过程 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，组织学分析，基因编辑小鼠模型 | 基因可调控小鼠模型 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 人类HNSCC病变样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 209 | 2026-04-14 |
Diversity of group 1 innate lymphoid cells in human tissues
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01885-y
PMID:38956380
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞（ILC1s）的多样性，揭示了不同组织中ILC1亚型的高度可变性 | 首次通过单细胞RNA测序和流式细胞术系统性地描绘了人类组织中ILC1s的多样性，并识别出肠道上皮中富含成熟的EOMES ILC1s以及其他组织中表达ZNF683的NK细胞，这些发现为理解ILC1-NK谱系在疾病中的表型和功能变化奠定了基础 | NA | 研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞（ILC1s）的多样性和分布 | 人类组织中的第1组先天淋巴样细胞（ILC1s）和自然杀伤（NK）细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 210 | 2026-04-14 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immunomodulatory Effects of Stem Cell Factor and Granulocyte Colony-Stimulating Factor Treatment in the Brains of Aged APP/PS1 Mice
2024-07-10, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070827
PMID:39062541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了干细胞因子和粒细胞集落刺激因子联合治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中的免疫调节作用 | 首次在单细胞水平上揭示了SCF+G-CSF治疗如何调节小胶质细胞和外周髓系细胞以减轻阿尔茨海默病病理 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证；样本量较小（仅使用APP/PS1小鼠） | 探究SCF+G-CSF治疗在老年阿尔茨海默病大脑中的修复机制 | 28月龄APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 28月龄APP/PS1小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 211 | 2026-04-14 |
DeepIMAGER: Deeply Analyzing Gene Regulatory Networks from scRNA-seq Data
2024-06-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070766
PMID:39062480
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepIMAGER的先进计算工具，通过深度学习和数据整合来推断细胞特异性基因调控网络 | DeepIMAGER采用监督学习方法，将基因对的共表达模式转化为类图像表示，并整合转录因子结合信息进行模型训练，显著提高了基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种能够从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞特异性基因调控网络的工具 | 基因调控网络，涉及多种细胞类型，包括多发性骨髓瘤树突状细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq, ChIP-seq | 深度学习 | 图像表示（由基因对共表达模式转化而来） | 六种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2026-04-14 |
Exploring the Molecular Mechanism of Comorbidity of Type 2 Diabetes Mellitus and Colorectal Cancer: Insights from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-06-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060693
PMID:38927096
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研究论文 | 本研究首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制，并识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3作为潜在的免疫生物标志物和药物靶点 | 首次整合bulk组学和单细胞测序验证来系统揭示T2DM与CRC共病的分子机制，识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3，并发现ENTPD3阳性的癌症相关成纤维细胞亚群具有独特的肿瘤抑制特征和免疫治疗预测价值 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏体内外实验验证；样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制和免疫学基础 | 2型糖尿病和结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Connectivity Map, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2026-04-14 |
Single-Nucleus RNA-Seq Reveals Spermatogonial Stem Cell Developmental Pattern in Shaziling Pigs
2024-05-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060607
PMID:38927011
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了沙子岭猪睾丸中精原干细胞（SSCs）的发育模式 | 首次在沙子岭猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸组织细胞发育图谱，并识别了调控SSCs自我更新和维持的潜在标记基因及信号通路 | 研究样本仅来自沙子岭猪，可能限制了结果的普适性；且未进行功能验证实验 | 探究沙子岭猪睾丸发育，特别是精原干细胞的发育模式 | 沙子岭猪睾丸组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 来自9只沙子岭猪睾丸的82,027个单细胞，覆盖三个关键出生后发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 214 | 2026-04-14 |
GTADC: A Graph-Based Method for Inferring Cell Spatial Distribution in Cancer Tissues
2024-04-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040436
PMID:38672453
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研究论文 | 提出一种基于图深度学习的GTADC方法，用于推断癌症组织中细胞的空间分布 | 利用Silhouette分数精确捕获每种细胞类型内具有显著表达差异的基因，并引入图结构有效整合空间转录组学和单细胞测序数据的空间关系与拓扑结构 | 未明确说明方法在特定癌症类型或数据规模下的验证局限性 | 实现癌症组织中不同细胞类型空间组成的精确解析，以支持早期癌症检测与理解 | 癌症组织中的细胞空间分布与相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学（ST），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基于图的深度学习方法（GTADC） | 空间转录组数据，单细胞基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2026-04-14 |
Colorectal Cancer-Associated Myofibroblasts Exhibit Enhanced Angiogenin Expression and Signaling via the PLXNB2 Receptor
2024-04, The Journal of surgical research
IF:1.8Q2
DOI:10.1016/j.jss.2023.12.036
PMID:38295715
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了结直肠癌相关肌成纤维细胞中血管生成素及其受体PLXNB2表达上调，并参与肿瘤-基质细胞通讯 | 首次在人类结直肠癌组织中，利用单细胞RNA测序数据定量推断细胞间通讯网络，发现CRC相关肌成纤维细胞特异性上调血管生成素和PLXNB2受体表达 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源为公开数据库和独立数据集，但具体样本数量未明确说明 | 探究血管生成素在人类结直肠癌肿瘤微环境中细胞间通讯的作用 | 人类正常结肠组织和结直肠癌组织中的细胞，特别是肌成纤维细胞和CRC细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 216 | 2026-04-14 |
SPINK1 Overexpression Correlates with Hepatocellular Carcinoma Treatment Resistance Revealed by Single Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics
2024-02-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14030265
PMID:38540686
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了SPINK1过表达与肝细胞癌治疗耐药性之间的关联 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统阐明了SPINK1在肝细胞癌治疗耐药中的作用机制，并发现其通过上调药物代谢调节因子（如CYP3A4和ABCB1）来促进耐药性 | 研究主要基于相关性分析和体外实验，缺乏体内动物模型验证SPINK1作为治疗靶点的直接疗效 | 探究SPINK1对肝细胞癌治疗耐药性的影响及其分子机制 | 肝细胞癌（HCC）细胞及患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 两个肝细胞癌队列的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 217 | 2026-04-14 |
Peripheral Lymphocytes in Primary Liver Cancers: Elevated NK and CD8+ T Cells and Dysregulated Selenium Metabolism
2024-02-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14020222
PMID:38397459
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞测序技术，探讨了原发性肝癌（HCC和ICC）对外周血淋巴细胞（PBLs）的影响，发现NK细胞和CD8+ T细胞数量升高且与复发风险相关，并揭示了硒代谢异常 | 首次系统评估原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响，结合单细胞测序发现CD8+ T细胞中TGFβ信号下调及硒代谢通路异常，并通过蛋白质组学验证SELENBP1和SEPP1的表达变化 | 样本来源可能有限，未详细说明具体样本量或患者队列特征，且依赖公共数据库（GEO）数据，可能影响结果普适性 | 探究原发性肝癌（HCC和ICC）对外周血淋巴细胞组成和功能的影响，并分析其与临床预后的关联 | 原发性肝癌患者（包括肝细胞癌和肝内胆管癌）及良性肝病患者的外周血淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，生物信息学分析，蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞术数据，蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序技术 |
| 218 | 2026-04-13 |
Single-cell RNA sequencing combined with proteomics of infected macrophages reveals prothymosin-α as a target for treatment of apical periodontitis
2024-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.01.018
PMID:38237771
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合蛋白质组学，揭示了感染巨噬细胞中prothymosin-α（PTMA）的上调，并验证了其作为根尖周炎治疗靶点的潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析根尖周炎中单核/巨噬细胞的异质性，并鉴定出PTMA作为新的治疗靶点 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，尚未进行人体临床试验 | 阐明单核/巨噬细胞在慢性根尖周炎进展中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 慢性根尖周炎患者的根尖周病变组织、健康对照牙周组织、THP-1来源的巨噬细胞、小鼠和大鼠的根尖周炎模型 | 单细胞组学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫荧光染色, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及患者组织样本、细胞系及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2026-04-13 |
Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation
2024-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.016
PMID:38128723
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析，探讨了早期引入浓缩饲料如何通过过量丁酸积累阻断角质细胞分化，从而诱导瘤胃上皮角化不全 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示了瘤胃上皮细胞异质性和分化轨迹，并建立了瘤胃器官样模型来验证丁酸在角化不全中的作用 | 研究仅基于新生羔羊模型，结果可能无法直接推广到其他反刍动物或不同年龄阶段 | 阐明瘤胃上皮角化过程及导致角化不全的关键瘤胃代谢物 | 24只14日龄羔羊的瘤胃组织和瘤胃液样本 | 单细胞组学 | 瘤胃上皮角化不全 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 免疫荧光, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 基因表达数据 | 24只羔羊分为三组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2026-04-12 |
Therapeutic application of human type 2 innate lymphoid cells via induction of granzyme B-mediated tumor cell death
2024-02-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.12.015
PMID:38211590
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研究论文 | 本文探讨了人类2型先天淋巴样细胞（ILC2s）通过诱导颗粒酶B介导的肿瘤细胞死亡在肿瘤治疗中的潜在应用 | 首次发现人类ILC2s分泌颗粒酶B并直接裂解肿瘤细胞，通过DNAM-1-CD112/CD155相互作用调控，揭示了其在抗肿瘤免疫中的新角色 | 未明确长期安全性或临床转化中的具体挑战 | 研究人类ILC2s的抗肿瘤机制及其治疗潜力 | 人类2型先天淋巴样细胞、急性髓系白血病细胞及实体瘤模型 | 免疫学 | 白血病、实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |