单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7524 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-06-15 |
Type 1 immunity enables neonatal thymic ILC1 production
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh5520
PMID:38232171
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研究论文 | 该研究探讨了1型免疫对新生儿胸腺内固有淋巴细胞（ILCs）的影响，特别是1型ILCs（ILC1s）的扩增和外周归巢 | 揭示了新生儿胸腺内1型ILCs的独特性和未成熟性，以及1型免疫如何促进这些细胞的扩增和外周归巢 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚待验证 | 研究1型免疫对新生儿胸腺内固有淋巴细胞的影响 | 新生儿胸腺内的1型固有淋巴细胞（ILC1s） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | RNA测序数据，成像数据 | 小鼠新生儿胸腺组织 |
| 202 | 2025-06-15 |
Tenascin-C expressing touch dome keratinocytes exhibit characteristics of all epidermal lineages
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi5791
PMID:38241368
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研究论文 | 本研究探讨了触觉圆顶（TD）角质形成细胞的特性及其在皮肤稳态中的作用 | 发现TD角质形成细胞具有多种表皮谱系的分子特征，并能在损伤后产生Merkel细胞 | 未明确TD角质形成细胞维持稳态的具体分子机制 | 研究TD角质形成细胞在皮肤稳态中的维持机制及其多谱系特性 | 触觉圆顶（TD）角质形成细胞 | 细胞生物学 | NA | scRNA-seq, 谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 203 | 2025-06-14 |
A sexually dimorphic hepatic cycle of periportal VLDL generation and subsequent pericentral VLDLR-mediated re-uptake
2024-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52751-2
PMID:39341814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肝脏中性别、空间和时间对异源物质解毒和脂蛋白代谢的显著影响，并发现了一种性别二态性的肝循环机制 | 首次揭示了性别二态性如何影响肝脏的时空功能逻辑，特别是在VLDL生成和再摄取方面的性别差异 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据相对有限 | 探究性别二态性对肝脏功能时空逻辑的影响 | 小鼠和人类肝脏 | 分子生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，但涉及小鼠和人类肝脏样本 |
| 204 | 2025-06-14 |
Hypoxia induces ROS-resistant memory upon reoxygenation in vivo promoting metastasis in part via MUC1-C
2024-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51995-2
PMID:39341835
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research paper | 该研究探讨了缺氧条件下乳腺癌细胞如何通过MUC1-C促进转移的机制 | 揭示了缺氧诱导的ROS抵抗记忆在再氧合过程中促进转移的新机制，特别是通过MUC1-C的作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床应用的直接证据仍需进一步验证 | 研究缺氧如何通过MUC1-C促进乳腺癌转移 | 乳腺癌细胞和循环肿瘤细胞(CTCs) | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 动物模型和患者来源的异种移植模型 | 基因表达数据和细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及动物模型和患者来源的异种移植模型 |
| 205 | 2025-06-14 |
Introducing synthetic thermostable RNase inhibitors to single-cell RNA-seq
2024-09-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52717-4
PMID:39333520
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研究论文 | 本文介绍了一种合成热稳定RNase抑制剂（SEQURNA）在单细胞RNA测序中的应用，证明其性能优于常用的蛋白质重组RNase抑制剂（RRIs） | 提出了一种新型合成热稳定RNase抑制剂，相比传统RRIs在重现性、通量和实验流程上具有独特优势，并能减少干冰运输需求 | 未提及具体样本量或实验规模限制 | 改进单细胞转录组学中的RNase抑制技术 | 合成热稳定RNase抑制剂（SEQURNA）与蛋白质重组RNase抑制剂（RRIs） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 206 | 2025-06-14 |
The chemokine receptor CXCR3 promotes CD8+ T cell-dependent lung pathology during influenza pathogenesis
2024-01-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj1120
PMID:38170765
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research paper | 研究探讨了CXCR3趋化因子受体在流感发病过程中对CD8+ T细胞依赖性肺病理的促进作用 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了CD8+ T细胞亚群在流感感染期间的多样性，并发现CXCR3阻断可以减轻肺损伤而不影响病毒清除 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索CD8+ T细胞在流感控制与肺病理中的双重作用及CXCR3的潜在治疗价值 | 流感感染的小鼠肺组织中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 流感感染的小鼠模型 |
| 207 | 2025-06-13 |
OrthologAL: A Shiny application for quality-aware humanization of non-human pre-clinical high-dimensional gene expression data
2024-Nov-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.25.625000
PMID:39651293
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research paper | 介绍了一个名为OrthologAL的Shiny应用程序，用于将非人类临床前高维基因表达数据高质量地转换为人类同源基因数据 | OrthologAL利用BioMart数据库访问Ensembl的不同基因集，无需用户生成代码，即可实现非人类转录组的人类同源基因转换 | 未明确提及具体限制 | 促进药理学转录组数据库在临床前研究模型中的应用，并简化非人类转录组的人类同源基因转换 | 单细胞、单核和空间转录组数据，包括髓母细胞瘤患者来源的异种移植模型以及小鼠和大鼠的脊髓损伤模型 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤、脊髓损伤 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 208 | 2025-06-13 |
Chromosome-contiguous genome for the Haecon-5 strain of Haemonchus contortus reveals marked genetic variability and enables the discovery of essential gene candidates
2024-11, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2024.08.003
PMID:39168434
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研究论文 | 本文报道了澳大利亚Haecon-5株Haemonchus contortus的染色体连续基因组，揭示了显著的遗传变异性并发现了潜在必需基因候选 | 首次提供了Haecon-5株的高质量染色体连续基因组，并采用跨物种机器学习方法预测了必需单拷贝基因 | 研究仅针对Haecon-5株，与其他菌株的比较仍需进一步验证 | 为宿主-寄生虫相互作用、药物发现和群体遗传学研究提供基因组资源 | Haemonchus contortus寄生虫的Haecon-5株 | 基因组学 | 寄生虫感染 | 比较基因组分析、机器学习、单细胞RNA-seq | 跨物种机器学习模型 | 基因组序列、转录组数据 | 1个Haecon-5株基因组（约280 Mb）和19,234个蛋白质编码基因模型 |
| 209 | 2025-06-13 |
Matrisomics: Beyond the extracellular matrix for unveiling tumor microenvironment
2024-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2024.189178
PMID:39241895
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research paper | 本文探讨了癌症组织中基质组蛋白的多样化模式及其在肿瘤微环境中的作用 | 利用多种组学方法（包括表观组学、基因组学、转录组学和蛋白质组学）及新技术（如单细胞RNA测序和空间转录组学）研究癌症基质组 | 癌症基质组的具体机制和临床应用尚未完全阐明 | 揭示癌症基质组在肿瘤微环境中的调控作用及其临床意义 | 癌症组织中的基质组蛋白 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 表观组学, 基因组学, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | 组学数据 | NA |
| 210 | 2025-06-13 |
Hematopoietic cells emerging from hemogenic endothelium exhibit lineage-specific oxidative stress responses
2024-11, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107815
PMID:39326495
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研究论文 | 研究人类胚胎发生过程中，血源性内皮细胞（HE）在不同缺氧条件下对造血过程的影响及其对氧化应激的响应 | 揭示了不同HE来源的血细胞谱系在缺氧条件下的转录变化及氧化应激反应的差异，特别是红细胞对氧化应激的易感性和CD45细胞的抗性机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨缺氧和氧化应激如何影响血源性内皮细胞衍生的造血谱系 | 人类胚胎中的血源性内皮细胞及其衍生的血细胞谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 211 | 2025-06-13 |
Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617070
PMID:39416184
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research paper | 该研究探讨了抗体Fab和Fc特性在促进结核分枝杆菌限制中的作用 | 通过Fc交换优化保护性抗体，揭示了Fc效应功能在结核分枝杆菌限制中的关键作用，并发现抗体介导的限制与组织水平免疫反应的重组相关 | 研究主要基于小鼠模型，未涉及人类临床试验 | 探究抗体在结核分枝杆菌限制中的机制 | 结核分枝杆菌和单克隆抗体 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 212 | 2025-06-13 |
The frequency of CD38+ alveolar macrophages correlates with early control of M. tuberculosis in the murine lung
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52846-w
PMID:39358361
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞RNA测序在小鼠模型中展示了不同肺泡巨噬细胞亚群在结核病进展或控制中的不同作用 | 揭示了CD38阳性和阴性肺泡巨噬细胞在结核病控制中的动态作用及其表观遗传预激活机制 | 研究仅基于小鼠模型，结果在人类中的适用性有待验证 | 探究肺泡巨噬细胞亚群在结核病控制中的作用机制 | 小鼠模型中的肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 213 | 2025-06-13 |
The estrogen response in fibroblasts promotes ovarian metastases of gastric cancer
2024-09-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52615-9
PMID:39349474
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素通过激活ER-MDK-LRP1信号轴促进胃癌卵巢转移的分子机制 | 首次发现卵巢成纤维细胞在雌激素刺激下分泌MDK，通过MDK-LRP1轴促进胃癌细胞迁移和侵袭 | 样本量较小（18例患者），且仅关注了雌激素-MDK-LRP1这一条信号通路 | 探究胃癌卵巢转移的分子机制 | 胃癌患者的卵巢转移瘤样本 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 18例胃癌患者的45个肿瘤样本 |
| 214 | 2025-06-13 |
CD38+ Alveolar macrophages mediate early control of M. tuberculosis proliferation in the lung
2024-Jul-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3934768/v1
PMID:39070650
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研究论文 | 本研究通过多模态单细胞RNA测序分析，揭示了CD38+肺泡巨噬细胞在结核病早期控制结核分枝杆菌增殖中的关键作用 | 首次鉴定出CD38+单核细胞来源的肺泡巨噬细胞(moAMs)和组织驻留肺泡巨噬细胞(TR-AMs)作为细菌生长的重要控制者，并发现CD38 TR-AMs在感染前具有独特的染色质特征 | 研究主要关注小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究不同巨噬细胞亚群在结核病感染过程中的动态作用和调控机制 | 肺泡巨噬细胞亚群 | 免疫学 | 结核病 | 多模态scRNA-seq分析, scATAC-seq分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明样本数量，但涉及多个感染时间点的巨噬细胞亚群分析 |
| 215 | 2025-06-13 |
An inducible genetic tool to track and manipulate specific microglial states reveals their plasticity and roles in remyelination
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.05.005
PMID:38821054
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research paper | 该研究开发了一种可诱导的遗传工具Clec7a-CreER，用于追踪和操纵特定小胶质细胞状态，揭示了它们的可塑性及其在髓鞘再生中的作用 | 开发了Clec7a-CreER这一新型遗传工具，首次实现了对PAMs和DAMs的精准追踪和操纵，揭示了小胶质细胞状态的可塑性及其在疾病恢复中的功能 | 研究主要聚焦于PAMs和DAMs，其他小胶质细胞亚群的功能尚未完全阐明 | 探究小胶质细胞状态的可塑性及其在中枢神经系统发育和疾病中的功能 | 增殖区域相关小胶质细胞(PAMs)和疾病相关小胶质细胞(DAMs) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 可诱导Cre-loxP系统 | NA | 基因表达数据 | 多个发育阶段和疾病模型中的小胶质细胞 |
| 216 | 2025-06-13 |
Loss of function of male-specific lethal 3 (Msl3) does not affect spermatogenesis in rodents
2024-05, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.669
PMID:37847071
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research paper | 研究探讨了雄性特异性致死蛋白3（Msl3）在啮齿动物精子发生中的作用 | 首次在啮齿动物中研究了Msl3在减数分裂进入中的作用，并发现其功能丧失不影响精子发生 | 研究仅针对啮齿动物，未涉及其他哺乳动物或灵长类 | 探究Msl3在哺乳动物减数分裂进入中的作用 | 小鼠精子发生过程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、条件性敲除小鼠模型 | 条件性敲除小鼠模型 | RNA-seq数据 | NA |
| 217 | 2025-06-13 |
An individualized stemness-related signature to predict prognosis and immunotherapy responses for gastric cancer using single-cell and bulk tissue transcriptomes
2024-01, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.6908
PMID:38168907
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研究论文 | 开发了一种基于胃癌干细胞特性的个体化特征签名，用于预测预后和免疫治疗反应 | 利用单细胞RNA-Seq数据和批量组织转录组数据，开发了一种能够逐个分析患者个体化特征的签名，克服了批次效应问题 | 研究依赖于现有的单细胞和批量转录组数据集，可能受到数据质量和样本来源的限制 | 开发一个个体化的胃癌干细胞相关特征签名，用于预测患者预后和免疫治疗效果 | 胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-Seq, 批量组织转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多个独立测试数据集中的胃癌样本 |
| 218 | 2025-06-12 |
A protocol for time-resolved transcriptomics through metabolic labeling and combinatorial indexing
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103356
PMID:39356643
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过代谢标记和组合索引进行时间分辨转录组学研究的优化协议 | 提出了一种自动化友好的代谢标记RNA协议，结合单细胞RNA测序和组合索引技术，用于捕获基因表达的时间动态信息 | 需要参考Maizels等人的研究以获取完整的协议执行细节 | 研究基因表达的动态变化 | 单细胞RNA | 转录组学 | NA | 4-thiouridine (4sU)标记，单细胞RNA测序，组合索引 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 219 | 2025-06-12 |
Protocol for mapping T cell activation using single-cell RNA-seq
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103409
PMID:39427308
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研究论文 | 本文提出了一种基于抗CD3/CD28珠刺激和单细胞RNA测序（scRNA-seq）的T细胞激活研究协议 | 使用抗CD3/CD28珠刺激和scRNA-seq技术研究T细胞激活的详细协议 | 协议的具体执行细节需参考Li等人的文献 | 研究T细胞激活的分子机制 | 人类外周血单个核细胞（PMBCs）和CD4 T细胞 | 生物医学研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 220 | 2025-06-12 |
Protocol for isolating specific C. elegans neuron types for bulk and single-cell RNA sequencing
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103439
PMID:39514392
|
研究论文 | 本文提出了一种分离特定神经元类型用于批量及单细胞RNA测序的方案 | 提供了一种针对秀丽隐杆线虫特定神经元类型的分离、RNA提取及单细胞测序准备的详细步骤 | 方案可能不适用于其他生物体的神经元分离 | 开发一种分离特定神经元类型用于基因表达分析的方法 | 秀丽隐杆线虫的神经元 | 分子生物学 | NA | RNA测序（包括批量及单细胞RNA测序）、荧光激活细胞分选（FACS） | NA | RNA序列数据 | 幼虫和成年秀丽隐杆线虫的特定神经元类型 |