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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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201 | 2025-07-26 |
CROPseq-multi: a versatile solution for multiplexed perturbation and decoding in pooled CRISPR screens
2024-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.17.585235
PMID:38558968
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研究论文 | 介绍了一种名为CROPseq-multi的多重扰动和解码解决方案,用于CRISPR筛选 | 开发了一种与mRNA嵌入条形码兼容的多重扰动系统,提高了条形码检测效率和解码效率 | 未明确提及具体限制 | 改进CRISPR筛选中的多重扰动和解码技术 | 遗传元素和表型 | 基因编辑 | NA | CRISPR, SpCas9, 单细胞测序 | NA | mRNA条形码 | 未明确提及样本数量 |
202 | 2025-07-26 |
Characterization of mismatch-repair/microsatellite instability-discordant endometrial cancers
2024-02-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.35030
PMID:37751191
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研究论文 | 本研究评估了子宫内膜癌中错配修复(MMR)/微卫星不稳定性(MSI)状态检测的一致性及其表达异质性的影响因素 | 揭示了MMR表达异质性病例的高复发率及其与肿瘤侵袭性的关联,并指出仅报告MMR完整/缺失会错过生物标志物导向治疗的机会 | 样本量相对有限(666例),且未对所有病例进行全转录组分析和下一代测序 | 评估子宫内膜癌中MMR/MSI状态检测的一致性及其临床意义 | 666例子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 免疫组化(IHC)、MSI检测、MLH1甲基化分析、全转录组分析、下一代测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 666例子宫内膜癌病例 |
203 | 2025-07-26 |
A Network Medical Framework based on Inflammatory Genes to Identify Drug Candidates for Abdominal Aortic Aneurysms
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序和RNA测序的生物医学数据,以及药物-靶标相互作用和蛋白质-蛋白质相互作用的网络医学数据,识别了腹主动脉瘤的关键靶点和潜在药物化合物 | 提出了一个基于炎症基因的网络医学框架,用于识别腹主动脉瘤的潜在药物候选物,并发现了与免疫评分和炎症通路密切相关的关键靶点SLC2A3和IER3 | 研究主要依赖于计算模拟和体外数据,尚未进行体内实验验证 | 识别腹主动脉瘤的关键靶点和潜在治疗药物 | 腹主动脉瘤的单细胞RNA测序和RNA测序数据,药物-靶标相互作用和蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | scRNA-seq, RNA-seq | 网络医学框架 | 基因表达数据,药物-靶标相互作用数据,蛋白质-蛋白质相互作用数据 | AAA和非动脉瘤对照样本中的10种细胞类型 |
204 | 2025-07-25 |
NOVEL ACTIVE PROTEINS FOR SEPSIS PROGNOSIS REVEALED THROUGH ScRNA-seq AND QUANTITATIVE PROTEOMICS
2024-12-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002408
PMID:38888471
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和定量蛋白质组学揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 首次结合scRNA-seq和定量蛋白质组学技术,识别出与脓毒症预后相关的活性蛋白,并揭示了不同患者群体的通路差异 | 样本量相对较小(脓毒症患者53例,对照16例),且仅分析了外周血样本 | 探索影响脓毒症预后的关键活性蛋白及其作用机制 | 脓毒症患者(NS=26,SV=27)和健康对照(Con=16)的外周血样本 | 生物医学研究 | 脓毒症 | scRNA-seq, DIA蛋白质组学, Viper算法 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 69例(53例脓毒症患者+16例对照) |
205 | 2025-07-25 |
Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111293
PMID:38996956
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示LRRc17介导的心脏成纤维细胞铁死亡在心肌梗死后心肌纤维化中的调节作用 | 首次发现LRRc17通过调节心脏成纤维细胞的铁死亡影响心肌梗死后纤维化的程度 | 研究仅基于GEO数据库中的两个数据集,样本量有限 | 阐明心肌梗死后纤维化的发病机制并寻找调节心室重构的治疗靶点 | 心脏成纤维细胞(CFs) | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、WGCNA、qRT-PCR、Western blotting | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE153485和GSE210159数据集 |
206 | 2025-07-25 |
IMPLICATIONS OF YWHAH GENE EXPRESSION IN THE EARLY DETECTION OF SEPSIS
2024-09-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002409
PMID:38904460
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研究论文 | 本研究探讨了YWHAH基因表达在脓毒症早期检测中的潜在作用 | 首次发现YWHAH基因表达在感染和脓毒症患者之间存在差异,为脓毒症的早期检测和治疗策略提供了新见解 | 研究主要基于公共单细胞转录组数据库和体外分析,需要进一步的临床验证 | 探索YWHAH基因表达与脓毒症早期检测的关联 | 感染个体和健康对照组的YWHAH基因表达 | 基因表达分析 | 脓毒症 | 实时聚合酶链反应(real-time PCR),加权基因共表达网络分析(WGCNA) | NA | 基因表达数据 | 公共单细胞转录组数据库中的样本 |
207 | 2025-07-25 |
TRANSCRIPTOMIC DIFFERENCES IN PERIPHERAL MONOCYTE POPULATIONS IN SEPTIC PATIENTS BASED ON OUTCOME
2024-08-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002379
PMID:38713581
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和通路分析,探讨了脓毒症患者外周单核细胞群体在转录组水平上的差异及其与临床结果的关系 | 首次在转录组水平上定义了脓毒症患者不同临床结果的免疫反应差异,特别是经典和非经典单核细胞的基因表达模式 | 研究样本量未明确说明,且未探讨其他免疫细胞类型的作用 | 阐明脓毒症患者不同临床结果的免疫学基础,寻找改善慢性危重病预后的治疗靶点 | 脓毒症患者的外周单核细胞群体 | 转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
208 | 2025-07-25 |
DIMINISHED EXPRESSION OF GLS IN CD4 + T CELLS SERVES AS A PROGNOSTIC INDICATOR ASSOCIATED WITH CUPROPTOSIS IN SEPTIC PATIENTS
2024-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002370
PMID:38662604
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研究论文 | 本研究探讨了与铜死亡相关的分子标志物在脓毒症患者中的表达及其对预后的影响 | 发现了与铜死亡相关的三个关键基因,并验证了GLS表达下降与O-GlcNAc水平降低的关系 | 铜与GLS变化之间的相关性需要进一步研究 | 探索脓毒症患者中与铜死亡相关的分子标志物,以帮助分层和改善预后 | 脓毒症患者的外周血样本和Jurkat细胞 | 分子生物学 | 脓毒症 | WGCNA、scRNA-seq、免疫印迹、流式细胞术、免疫荧光、CFSE分析 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 脓毒症患者的外周血样本和Jurkat细胞 |
209 | 2025-07-25 |
Antitumor efficacy and potential mechanism of FAP-targeted radioligand therapy combined with immune checkpoint blockade
2024-06-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01853-w
PMID:38825657
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研究论文 | 研究FAP靶向放射性配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及其潜在机制 | 首次展示了Ga/Lu标记的LNC1004在肿瘤模型中的摄取和保留增强,以及联合疗法在完全消除肿瘤和促进抗肿瘤免疫方面的效果 | 初步临床研究样本量有限,需要更大规模的临床试验验证 | 探索FAP靶向放射性配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及机制 | MC38/NIH3T3-FAP和CT26/NIH3T3-FAP肿瘤异种移植模型及难治性癌症患者 | 肿瘤学 | 癌症 | scRNA-seq, TCR测序 | NA | 基因表达数据、免疫组化数据 | 临床前研究使用小鼠模型,初步临床研究涉及难治性癌症患者 |
210 | 2025-07-25 |
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-05-31, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01840-1
PMID:38816371
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综述 | 本文系统总结了巨噬细胞在心血管疾病调控机制中的多样表型和功能可塑性,以及单细胞测序技术带来的新视角 | 利用单细胞测序技术揭示了巨噬细胞的异质性、细胞间相互作用及治疗靶点的下游机制,为心血管疾病的治疗提供了新的视角 | 未具体提及样本量或实验设计的详细限制 | 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的分子机制及治疗靶点 | 巨噬细胞在心血管疾病(如冠心病、瓣膜病、心肌炎、心肌病、心力衰竭、动脉粥样硬化和动脉瘤)中的作用 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
211 | 2025-07-25 |
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-05-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01838-9
PMID:38811552
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研究论文 | 本研究探讨了靶向BCL9/BCL9L如何通过促进常规1型树突状细胞(cDC1)的激活和肿瘤浸润来增强抗原呈递 | 揭示了靶向BCL9/BCL9L通过XCL1-XCR1轴和NF-κB/IRF1信号通路增强cDC1激活和抗原呈递的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索BCL9/BCL9L在肿瘤抗原呈递中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 | 常规1型树突状细胞(cDC1)、BCL9/BCL9L蛋白、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组分析、基因敲除小鼠模型 | Bcl9/Bcl9l敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,使用基因敲除小鼠和野生型小鼠进行对比 |
212 | 2025-07-25 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-04-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
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综述 | 本文综述了导管原位癌(DCIS)向浸润性乳腺癌(IDC)进展的分子特征及其临床意义 | 系统总结了DCIS向IDC转变的关键信号通路、分子特征及肿瘤微环境变化,并探讨了单细胞测序、空间转录组学和人工智能等新技术在研究中的应用 | NA | 深入理解DCIS的生物学特性及其向IDC转变的分子机制,以促进更有效的临床管理 | 导管原位癌(DCIS)和浸润性导管癌(IDC) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、人工智能 | NA | 分子数据、临床数据 | NA |
213 | 2025-07-25 |
Characterization of Immunosuppressive Myeloid Cells in Merkel Cell Carcinoma: Correlation with Resistance to PD-1 Pathway Blockade
2024-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-1957
PMID:37851052
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和多重免疫组化染色技术,探讨了默克尔细胞癌(MCC)中免疫抑制性髓系细胞的特征及其与PD-1通路阻断抵抗的相关性 | 首次在MCC中详细描述了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的免疫抑制特性及其与PD-1阻断治疗抵抗的关联 | 样本量相对较小(单细胞转录组学9例,免疫组化54例),且未明确验证TAMs与CD8 T细胞空间相互作用的临床意义 | 探究MCC中髓系细胞的免疫抑制特性及其对免疫治疗响应的影响 | 默克尔细胞癌患者肿瘤组织中的髓系细胞和CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 默克尔细胞癌 | 单细胞转录组学,多重免疫组化染色(multiplex IHC) | NA | 转录组数据,免疫组织化学图像数据 | 单细胞转录组学分析9例患者,免疫组化分析54例患者治疗前肿瘤样本 |
214 | 2024-08-07 |
Partners in Crime: Inferring Cell-to-cell Interactions in Kidney Allograft Rejection From Single-cell RNA Sequencing
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004763
PMID:37638872
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
215 | 2025-07-25 |
Exploring the Immune-related Molecular Mechanisms Underlying the Comorbidity of Temporal Lobe Epilepsy and Major Depressive Disorder through Integrated Data Set Analysis
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
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研究论文 | 通过整合数据集分析探索颞叶癫痫和重度抑郁症共病的免疫相关分子机制 | 识别了TLE和MDD共有的关键基因及其免疫相关分子机制,并预测了潜在治疗药物 | 研究依赖于公开数据库的数据,未进行实验验证 | 探索TLE和MDD共病的分子机制及其在诊断和治疗中的应用 | 颞叶癫痫(TLE)和重度抑郁症(MDD)患者 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 基因表达分析、WGCNA、PPI网络构建、LASSO、随机森林、ROC曲线分析、免疫浸润分析、单细胞测序 | LASSO、随机森林(RF) | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的脑组织基因表达数据 |
216 | 2025-07-24 |
Nanocoding: Lipid Nanoparticle Barcoding for Multiplexed Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.16.628827
PMID:39763829
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Nanocoding的新技术,利用脂质纳米颗粒(LNPs)在单细胞RNA测序(scRNA-seq)中实现高效条形码标记 | 使用脂质纳米颗粒(LNPs)进行条形码标记,提高了标记密度和稳定性,解决了现有DNA标记方法在异质细胞群体中的局限性 | 尽管在脂肪组织等复杂样本中表现出高标记率,但在其他组织类型中的表现尚未验证 | 开发一种高效、稳定的样本多重标记方法,以降低单细胞RNA测序的成本和批次效应 | 培养细胞系和组织消化物中的异质细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 培养细胞系、脾脏消化物和肥胖啮齿动物脂肪组织中的细胞 |
217 | 2025-07-24 |
Single cell and TCR analysis of immune cells from AAV gene therapy-dosed Duchenne muscular dystrophy patients
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101349
PMID:39524974
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析AAV基因治疗杜氏肌营养不良症患者的免疫细胞变化 | 首次在AAV基因治疗杜氏肌营养不良症患者中应用单细胞RNA测序和TCR测序技术,揭示了治疗后T细胞克隆扩增与人类疱疹病毒感染的相关性 | 样本量较小(仅5名参与者),且仅观察了外周血单个核细胞的变化 | 探究AAV基因治疗在杜氏肌营养不良症患者中引发的免疫反应机制 | 接受AAV基因治疗的杜氏肌营养不良症患者 | 基因治疗 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序,TCR测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,TCR序列数据 | 5名参与者的外周血单个核细胞样本 |
218 | 2025-07-24 |
Diverse NKT cells regulate early inflammation and neurological outcomes after cardiac arrest and resuscitation
2024-12-04, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq5796
PMID:39630883
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研究论文 | 该研究探讨了多样化NKT细胞在心脏骤停及复苏后早期炎症和神经学结果中的调节作用 | 首次发现多样化NKT细胞与良好神经学结果相关,并证实磺酸脂特异性dNKT细胞在小鼠模型中具有神经保护作用 | 研究结果主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探索心脏骤停后神经损伤的免疫调节机制并寻找潜在治疗靶点 | 院外心脏骤停患者和小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠心脏骤停模型 | RNA测序数据、临床数据 | 大规模OHCA患者队列和独立验证队列 |
219 | 2025-07-24 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Tonsils Reveals Nicotine Enhances HIV-1-Induced NLRP3 Inflammasome and Mitochondrial Activation
2024-11-20, Viruses
DOI:10.3390/v16111797
PMID:39599911
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了尼古丁如何增强HIV-1诱导的NLRP3炎症小体和线粒体激活 | 首次在人类扁桃体组织中揭示了HIV-1感染与尼古丁暴露的协同作用机制 | 研究仅使用扁桃体组织样本,未涉及其他免疫组织 | 探究HIV-1感染与尼古丁对免疫细胞功能的协同影响 | 人类扁桃体组织 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类扁桃体组织样本 |
220 | 2025-07-24 |
Exposure to BaA inhibits trophoblast cell invasion and induces miscarriage by regulating the DEC1/ARHGAP5 axis and promoting ubiquitination-mediated degradation of MMP2
2024-11-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.135594
PMID:39191013
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研究论文 | 本研究探讨了苯并[a]蒽(BaA)通过调控DEC1/ARHGAP5轴和促进MMP2的泛素化降解抑制滋养层细胞侵袭并导致流产的机制 | 首次发现BaA通过调控DEC1/ARHGAP5轴和MID1/MMP2通路导致流产的分子机制 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,人类样本的临床验证仍需进一步研究 | 阐明BaA导致流产的分子机制 | 人类绒毛外滋养层细胞(EVTs)和小鼠模型 | 生殖毒理学 | 流产 | RNA-seq、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 人类绒毛组织样本和原代EVTs细胞 |