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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2161 | 2025-10-07 |
Intestinal cell diversity and treatment responses in a parasitic nematode at single cell resolution
2024-Apr-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10203-7
PMID:38575858
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学技术揭示猪蛔虫肠道细胞的多样性及其对驱虫药物治疗的差异反应 | 首次在单细胞分辨率下表征寄生性线虫肠道细胞的表型多样性,并鉴定出独特的Clade III相关基因富集群 | 研究仅针对成年雌性猪蛔虫,未涵盖其他发育阶段或性别 | 解析寄生性线虫肠道细胞多样性及其对驱虫药物的反应机制 | 成年雌性猪蛔虫的肠道细胞 | 单细胞生物学 | 寄生虫感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未处理肠道细胞的单个细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2162 | 2025-10-07 |
The cell-type-specific spatial organization of the anterior thalamic nuclei of the mouse brain
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113842
PMID:38427564
|
研究论文 | 本研究通过整合多种技术揭示了小鼠前丘脑核团的细胞类型组成和空间组织原则 | 首次在单细胞和空间分辨率水平绘制了前丘脑核团的细胞类型组成,发现了离散和连续的空间组织模式 | 研究仅限于小鼠模型,人类或其他物种的适用性需要进一步验证 | 解析前丘脑核团的细胞类型组成和空间组织结构 | 小鼠前丘脑核团 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 2163 | 2025-10-07 |
Single-cell spatial transcriptomic and translatomic profiling of dopaminergic neurons in health, aging, and disease
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113784
PMID:38386560
|
研究论文 | 通过单细胞空间转录组和多巴胺能神经元翻译组分析,研究健康、衰老和疾病状态下小鼠大脑多巴胺能神经元的表达特征 | 首次结合单细胞空间转录组和多巴胺能神经元翻译组分析,在空间背景下深度表征多巴胺能神经元特征,并识别出CASR作为多巴胺能钙处理的调节因子 | 研究基于帕金森病转基因小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究大脑多巴胺能神经元在健康、衰老和疾病状态下的空间基因表达特征 | 年轻和年老小鼠大脑中的多巴胺能神经元及其他27种细胞类型 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 单细胞空间转录组学, 翻译组分析 | NA | 空间基因表达数据 | 年轻和年老小鼠大脑样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 2164 | 2025-10-07 |
A molecular atlas of adult C. elegans motor neurons reveals ancient diversity delineated by conserved transcription factor codes
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113857
PMID:38421866
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了成年秀丽隐杆线虫运动神经元的全面分子图谱,揭示了由保守转录因子编码定义的神经元多样性 | 首次系统描绘成年线虫运动神经元分子图谱,发现同源域转录因子组合编码在不同物种间保守地定义运动神经元多样性 | 研究主要聚焦线虫模型,在哺乳动物中的验证仍需进一步扩展 | 解析成年动物运动神经元的分子组成特征和组织原则 | 成年秀丽隐杆线虫运动神经元 | 单细胞基因组学 | 运动神经元疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13,200个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2165 | 2025-10-07 |
Mosaic deletion of claudin-5 reveals rapid non-cell-autonomous consequences of blood-brain barrier leakage
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113911
PMID:38446668
|
研究论文 | 通过诱导成年小鼠内皮细胞特异性Cldn5基因嵌合缺失,研究血脑屏障渗漏的非细胞自主性后果 | 首次在成熟大脑中诱导内皮特异性Cldn5嵌合缺失,揭示血脑屏障渗漏引起的快速非细胞自主性转录组变化 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 研究CLDN5缺失对成熟血脑屏障功能的影响及其分子机制 | 成年小鼠脑内皮细胞、小胶质细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 血脑屏障相关疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | 小鼠基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2166 | 2025-10-07 |
The TET-Sall4-BMP regulatory axis controls craniofacial cartilage development
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113873
PMID:38427557
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型揭示了TET-Sall4-BMP调控轴在颅面软骨发育中的关键作用机制 | 首次发现Sall4通过介导Tet2/3共相分离形成凝聚物,促进bmp4启动子区域5mC氧化,从而激活bmp4表达的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 探究颅面微畸形的分子发病机制 | 斑马鱼胚胎的咽弓软骨发育过程 | 发育生物学 | 颅面微畸形 | 单细胞RNA测序, 生化分析, 遗传学分析 | 斑马鱼模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2167 | 2025-10-07 |
Transgenic tools targeting the basal ganglia reveal both evolutionary conservation and specialization of neural circuits in zebrafish
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113916
PMID:38484735
|
研究论文 | 本研究通过创建转基因工具揭示了斑马鱼基底神经节神经回路的进化保守性与特异性 | 首次在成年斑马鱼中开发了靶向基底神经节特定亚群的转基因工具,并发现了与哺乳动物不同的神经通路连接方式 | 研究主要聚焦于斑马鱼模型,需要进一步验证在更高等生物中的普适性 | 研究基底神经节神经回路的进化保守性与物种特异性 | 成年斑马鱼的基底神经节神经回路 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 转基因技术 | NA | 基因表达数据, 神经解剖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2168 | 2025-10-07 |
Stem-like progenitor and terminally differentiated TFH-like CD4+ T cell exhaustion in the tumor microenvironment
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113797
PMID:38363680
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和小鼠模型揭示了肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞耗竭的分化特征及其抗肿瘤免疫机制 | 首次发现肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞存在干细胞样祖细胞和终末分化的细胞毒性亚群,并阐明其与CD8+ T细胞耗竭模式的相似性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞的耗竭特征及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肿瘤浸润性CD4+ T细胞和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2169 | 2025-10-07 |
Optimization of Tissue Digestion Methods for Characterization of Photoaged Skin by Single Cell RNA Sequencing Reveals Preferential Enrichment of T Cell Subsets
2024-01-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13030266
PMID:38334658
|
研究论文 | 比较三种人体皮肤组织消化方法,评估细胞产量和活力,并发现顺序消化法能提高非抗原呈递肥大细胞和CD8 T细胞比例 | 首次系统比较皮肤组织消化方法对单细胞RNA测序中免疫细胞亚群富集的影响,揭示顺序消化法对特定T细胞亚群的偏好性富集 | 仅比较三种消化方法,样本量有限,未评估长期保存样本的效果 | 优化皮肤组织消化方法以提高单细胞RNA测序的细胞产量和活力 | 人体皮肤组织 | 单细胞测序 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2170 | 2025-01-15 |
Mechanisms of HIF1A-mediated immune evasion in gastric cancer and the impact on therapy resistance
2024-10-10, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09917-x
PMID:39384651
|
研究论文 | 本研究探讨了胃癌中静止癌细胞(QCCs)通过HIF1A介导的免疫逃逸机制及其对治疗抵抗的影响 | 揭示了QCCs通过HIF1A介导的糖酵解相关基因上调来抵抗T细胞介导的免疫反应的分子机制,并展示了HIF1A沉默在增强免疫治疗效果方面的潜力 | 研究主要依赖于小鼠模型和体外实验,需要进一步在人类临床试验中验证这些发现 | 探索胃癌中QCCs的免疫抑制机制及其对免疫治疗抵抗的影响,以改进治疗策略 | 胃癌中的静止癌细胞(QCCs)及其与免疫细胞的相互作用 | 癌症研究 | 胃癌 | 基因编辑技术、转录组测序、单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据、细胞实验数据 | 未明确提及具体样本数量,但使用了小鼠模型和体外细胞实验 | NA | NA | NA | NA |
| 2171 | 2025-01-15 |
The role of GDF15 in attenuating noise-induced hidden hearing loss by alleviating oxidative stress
2024-09-18, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09912-2
PMID:39289208
|
研究论文 | 本研究探讨了GDF15在减轻噪声引起的隐性听力损失(HHL)中的作用,通过缓解氧化应激来保护耳蜗 | 首次揭示了GDF15在HHL中的保护作用,并提出了针对GDF15的治疗策略 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 研究GDF15在噪声引起的隐性听力损失中的作用 | 小鼠耳蜗 | 生物医学 | 听力损失 | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 转录组数据 | HHL小鼠的耳蜗细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2172 | 2025-01-15 |
Single-cell transcriptomics reveals antigen-presenting capacity and therapeutic resistance potential of immunomodulatory endothelial cells in colorectal cancer
2024-06, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.1311
PMID:38874280
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了结直肠癌中免疫调节内皮细胞的抗原呈递能力和治疗耐药潜力 | 首次聚焦于免疫调节内皮细胞(IMECs)在肿瘤免疫平衡调节中的作用及其对抗血管生成疗法(AATs)的影响 | 研究主要基于公开数据库的单细胞转录组数据,缺乏实验验证 | 探讨结直肠癌中免疫调节内皮细胞的功能及其对抗血管生成疗法的影响 | 结直肠癌中的免疫调节内皮细胞(IMECs) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于公开数据库的结直肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2173 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals insights into epithelial abnormalities in ovarian endometriosis
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113716
PMID:38412094
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析卵巢子宫内膜异位症中上皮细胞的异常变化 | 首次在单细胞水平揭示子宫内膜异位症中纤毛细胞比例增加及其抗凋亡机制,发现NNMT-FOXO1-BIM信号通路和HLA II类分子介导的慢性炎症新机制 | 样本量相对有限(34例),需要进一步功能验证实验确认分子机制 | 探究卵巢子宫内膜异位症的病理生理机制 | 34例个体的正常、在位和异位子宫内膜组织 | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 34例个体,涵盖增殖期和分泌期子宫内膜 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高精度单细胞RNA测序 |
| 2174 | 2025-01-15 |
Single-cell RNA-seq reveals keratinocyte and fibroblast heterogeneity and their crosstalk via epithelial-mesenchymal transition in psoriasis
2024-03-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06583-z
PMID:38472183
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了银屑病中角质形成细胞和成纤维细胞的异质性及其通过上皮-间质转化的相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了银屑病皮肤中角质形成细胞和成纤维细胞的异质性,并发现它们通过上皮-间质转化相互作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证仍需进一步研究 | 探索银屑病的发病机制,特别是角质形成细胞和成纤维细胞在其中的作用 | 银屑病模型小鼠和野生型小鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 13个样本中的94,759个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2175 | 2025-10-07 |
Gasdermin E promotes translocation of p65 and c-jun into nucleus in keratinocytes for progression of psoriatic skin inflammation
2024-03-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06545-5
PMID:38429278
|
研究论文 | 本研究探讨了Gasdermin E在角质形成细胞中通过促进p65和c-jun核转位推动银屑病皮肤炎症进展的机制 | 首次揭示GSDME以不依赖细胞焦亡的方式通过促进p65和c-jun核转位参与银屑病发病机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,需要进一步临床验证 | 阐明角质形成细胞中GSDME在银屑病发病机制中的具体作用 | 银屑病患者皮肤样本、IMQ诱导的银屑病样皮炎小鼠模型、角质形成细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, GEO数据分析, 基因敲除 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | GEO数据集中的银屑病患者样本和IMQ诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2176 | 2025-10-07 |
Endocardium gives rise to blood cells in zebrafish embryos
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113736
PMID:38308842
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼胚胎模型证实心内膜能够产生血细胞 | 首次在斑马鱼胚胎中通过实时成像和谱系追踪证实心内膜来源的髓系细胞生成 | 研究仅针对斑马鱼胚胎模型,在哺乳动物中的保守性需要进一步验证 | 探究心内膜在造血过程中的贡献 | 斑马鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,实时成像,谱系追踪,表达分析 | NA | 基因表达数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2177 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal role of SETD2-H3K36me3 in murine pancreatic organogenesis
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113703
PMID:38265933
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术揭示了SETD2-H3K36me3在小鼠胰腺器官发生中的时空调控作用 | 首次系统阐明SETD2介导的H3K36me3修饰在胰腺发育过程中的动态变化及其对内外分泌谱系分化的调控机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类胰腺发育中验证 | 探究组蛋白修饰H3K36me3在胰腺器官发生中的调控作用 | 小鼠胚胎胰腺发育过程 | 表观遗传学 | 胰腺疾病 | CUT&Tag, ATAC-seq, bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据,转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性测序,靶向切割标记技术 | NA | NA |
| 2178 | 2025-10-07 |
The single-cell transcriptome program of nodule development cellular lineages in Medicago truncatula
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113747
PMID:38329875
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了蒺藜苜蓿根瘤发育过程中细胞谱系的转录重编程机制 | 首次在蒺藜苜蓿中构建了根瘤发育的单细胞转录组图谱,鉴定了参与共生响应的表皮根毛和中柱亚细胞类型,并发现新的根瘤形成调控因子STYLISH 4 | 研究主要关注早期根瘤发育阶段,对成熟根瘤的功能研究相对有限 | 解析豆科植物与根瘤菌共生过程中根瘤发育的细胞类型特异性转录调控网络 | 蒺藜苜蓿野生型Jemalong A17及其超结瘤突变体sunn-4的根组织细胞 | 植物单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断,基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变体苜蓿根组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2179 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of cervical exfoliated cells reveals potential biomarkers and cellular pathogenesis in cervical carcinogenesis
2024-02-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06522-y
PMID:38346944
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈脱落细胞,揭示宫颈癌发生过程中的潜在生物标志物和细胞发病机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘宫颈癌发生过程中免疫细胞和上皮细胞的动态变化,鉴定出脂质相关巨噬细胞作为预测LSIL向HSIL进展的生物标志物 | 样本量相对有限(15个样本),需要在更大队列中验证研究结果 | 探索宫颈癌发生过程中的细胞异质性和潜在生物标志物 | 宫颈脱落细胞 | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 15个样本(包含正常宫颈、LSIL、HSIL和恶性肿瘤),56,173个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2180 | 2025-10-07 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.20.629650
PMID:39764057
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研究论文 | 开发了一种名为IN-DEPTH的空间多组学整合方法,用于分析肿瘤微环境中的空间重组 | 提出IN-DEPTH方法实现同一切片的空间蛋白质组学和转录组学整合分析,并开发SGCC算法进行多模态空间数据分析 | 未明确说明样本数量的具体限制和方法的适用范围 | 开发空间多组学整合方法以深入理解肿瘤微环境的空间组织 | 淋巴组织和弥漫性大B细胞淋巴瘤(EBV阳性和阴性) | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞分析 | k-bandlimited Spectral Graph Cross-Correlation (SGCC) | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |