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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2121 | 2024-11-02 |
The G protein-coupled receptor ADGRG6 maintains mouse growth plate homeostasis through IHH signaling
2024-Oct-29, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjae144
PMID:39236220
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研究论文 | 研究ADGRG6/GPR126在维持小鼠生长板稳态中的作用及其通过IHH信号通路的机制 | 揭示了ADGRG6在维持小鼠生长板稳态中的关键作用,特别是通过调节PTHrP/IHH信号通路来影响软骨细胞的增殖和肥大分化 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类中验证其相关性 | 探讨ADGRG6在维持小鼠生长板稳态中的作用及其分子机制 | 小鼠生长板中的软骨细胞和骨软骨前体细胞 | NA | NA | 分子遗传学和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用甲醛固定石蜡包埋的组织样本进行研究 |
2122 | 2024-11-02 |
Application and new findings of scRNA-seq and ST-seq in prostate cancer
2024-Oct-29, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-024-00206-w
PMID:39470950
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综述 | 本文综述了scRNA-seq和ST-seq技术在前列腺癌研究中的应用和新发现 | 介绍了scRNA-seq和ST-seq技术在揭示前列腺癌及其微环境异质性和功能变化方面的突破 | NA | 探讨前列腺癌发病机制和疾病进展,为诊断和治疗提供参考 | 前列腺癌及其微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | scRNA-seq, ST-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
2123 | 2024-11-02 |
Integrative spatial and genomic analysis of tumor heterogeneity with Tumoroscope
2024-Oct-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53374-3
PMID:39472583
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研究论文 | 本文提出了Tumoroscope,一种概率模型,通过整合病理图像、全外显子测序和空间转录组数据,以接近单细胞分辨率准确推断癌症克隆及其定位 | Tumoroscope是首个能够直接基于体细胞点突变在肿瘤组织中映射克隆的技术,并明确解决了空间转录组学点中克隆比例的去卷积问题 | NA | 研究肿瘤的空间和基因组异质性对癌症进展、治疗和生存的影响 | 前列腺癌和乳腺癌数据集中的肿瘤克隆及其空间模式 | 数字病理 | 前列腺癌 | 全外显子测序 | 概率模型 | 图像、基因组数据、转录组数据 | 前列腺癌和乳腺癌数据集 |
2124 | 2024-11-02 |
A method for in silico exploration of potential glioblastoma multiforme attractors using single-cell RNA sequencing
2024-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74985-2
PMID:39472601
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研究论文 | 本文提出了一种利用单细胞RNA测序数据寻找潜在癌症吸引子的方法,并在胶质母细胞瘤数据集中进行了测试 | 本文创新性地使用癌症吸引子概念解释胶质母细胞瘤的异质性,并通过构建基因调控网络和参数估计框架来探索潜在的吸引子 | 本文的方法主要在胶质母细胞瘤数据集中进行了测试,其通用性在其他类型癌症中的表现尚未充分验证 | 研究胶质母细胞瘤的潜在吸引子,并探索其在癌症动力学模拟和治疗靶点研究中的应用 | 胶质母细胞瘤的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | 基因表达数据 | NA |
2125 | 2024-11-02 |
Alteration of the metabolite interconversion enzyme in sperm and Sertoli cell of non-obstructive azoospermia: a microarray data and in-silico analysis
2024-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77875-9
PMID:39472682
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研究论文 | 研究非阻塞性无精子症患者精子和小管细胞中代谢物相互转化酶的基因表达模式 | 使用微阵列和生物信息学技术分析了2912个编码代谢物相互转化酶的基因,并预测了这些蛋白质的功能和分子相互作用,识别出关键的枢纽基因 | NA | 探讨非阻塞性无精子症患者睾丸细胞中代谢物相互转化酶的基因表达模式,以理解其分子机制 | 非阻塞性无精子症患者的精子和小管细胞 | NA | NA | 微阵列分析,生物信息学 | NA | 基因表达数据 | 2912个基因,3个非阻塞性无精子症患者的小管细胞样本 |
2126 | 2024-11-02 |
HTS and scRNA-seq revealed that the location and RSS quality of the mammalian TRBV and TRBJ genes impact biased rearrangement
2024-Oct-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10887-x
PMID:39472808
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研究论文 | 研究探讨了哺乳动物TRBV和TRBJ基因的位置和RSS质量对偏倚重排的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和高通量测序揭示了TRBV和TRBJ基因的位置和RSS质量对V(D)J重排频率的影响 | 尚未完全阐明具体的调控机制和效率 | 研究V(D)J重排的机制和效率 | 哺乳动物TRBV和TRBJ基因的位置和RSS质量 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和高通量测序 (HTS) | NA | RNA序列 | 包括灵长类(人类和猕猴)、啮齿类(BALB/c、C57BL/6和昆明小鼠)、偶蹄类(水牛)和翼手类(Rhinolophus affinis)等多个物种 |
2127 | 2024-11-02 |
A tumorigenicity evaluation platform for cell therapies based on brain organoids
2024-Oct-29, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-024-00446-5
PMID:39472972
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研究论文 | 本文介绍了一种基于脑类器官的细胞治疗致瘤性评估平台 | 提出了使用脑类器官和胶质母细胞瘤样类器官模型来评估细胞治疗产品的致瘤性风险,相较于传统动物模型具有更高的检测敏感性 | NA | 评估脑类器官在细胞治疗致瘤性评估中的应用潜力 | 人多能干细胞(hPSCs)和从中衍生的中脑多巴胺(mDA)细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自人胚胎干细胞的中脑多巴胺细胞、hPSCs、混合细胞以及未成熟的中脑多巴胺细胞,并将其注射到脑类器官和NOD SCID小鼠中进行评估 |
2128 | 2024-11-02 |
Cystic fibrosis-related diabetes is associated with reduced islet protein expression of GLP-1 receptor and perturbation of cell-specific transcriptional programs
2024-10-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76722-1
PMID:39463434
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研究论文 | 研究囊性纤维化相关糖尿病中GLP-1受体表达减少及其对细胞特异性转录程序的影响 | 首次揭示了囊性纤维化相关糖尿病中GLP-1受体蛋白表达减少,并发现α和β细胞特异性通路的失调 | 研究仅基于免疫组化和空间转录组学数据,缺乏功能验证实验 | 探讨囊性纤维化相关糖尿病中胰腺病理机制,寻找改善治疗方法 | 囊性纤维化相关糖尿病患者的胰腺组织 | NA | 囊性纤维化 | 免疫组化、空间转录组学 | NA | 组织 | 囊性纤维化相关糖尿病患者与非囊性纤维化/非糖尿病患者的胰腺组织 |
2129 | 2024-11-02 |
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618486
PMID:39464096
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研究论文 | 研究分析了人类抗糖抗体的B细胞受体库,揭示了抗糖反应的驱动机制 | 首次结合BCR受体克隆与表达以及单细胞转录组学分析,探讨了抗N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)抗体的B细胞库及其免疫进化 | NA | 探讨人类抗糖抗体反应的驱动机制及其在早期儿童时期的亲和力成熟过程 | 抗N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)抗体的B细胞库 | 免疫学 | NA | BCR受体克隆与表达、单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 人类队列中的B细胞 |
2130 | 2024-11-02 |
Characterization of Cancer Stem Cells in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma by Single-cell RNA Sequencing
2024-Oct-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae056
PMID:39107908
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,全面表征喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞 | 首次在单细胞水平上全面表征喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞特性 | 研究样本仅限于三名患者,可能影响结果的普适性 | 识别喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞及其分子机制 | 喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名喉鳞状细胞癌患者的匹配原发肿瘤组织、癌旁组织和局部淋巴结 |
2131 | 2024-11-02 |
ADAMTS7 Promotes Smooth Muscle Foam Cell Expansion in Atherosclerosis
2024-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582156
PMID:38463994
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研究论文 | 研究探讨了ADAMTS7在动脉粥样硬化中促进平滑肌泡沫细胞扩张的机制 | 首次揭示了ADAMTS7在平滑肌细胞和内皮细胞中表达,并通过增加PU.1和CD36表达促进氧化低密度脂蛋白摄取,从而促进泡沫细胞形成和动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨ADAMTS7在动脉粥样硬化中的细胞特异性机制 | ADAMTS7在平滑肌细胞和内皮细胞中的表达及其对动脉粥样硬化的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
2132 | 2024-11-02 |
Unraveling the role of low-density lipoprotein-related genes in lung adenocarcinoma: Insights into tumor microenvironment and clinical prognosis
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24230
PMID:38488684
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研究论文 | 研究探讨了低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的作用及其对肿瘤微环境和临床预后的影响 | 首次系统地研究了低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的作用,并开发了一种新的低密度脂蛋白相关签名用于预后评估 | 研究主要基于单细胞转录组数据,可能无法全面反映所有相关基因的表达情况 | 揭示低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的功能及其对肿瘤微环境和临床预后的影响 | 低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的表达模式及其与肿瘤微环境和临床预后的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
2133 | 2024-11-02 |
WIP1-mediated regulation of p38 MAPK signaling attenuates pyroptosis in sepsis-associated acute kidney injury
2024-Sep, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152832
PMID:38943814
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研究论文 | 研究探讨了WIP1在脓毒症相关急性肾损伤中的作用及其通过p38 MAPK信号通路调控细胞焦亡的机制 | 首次揭示了WIP1在肾脏中的作用及其在脓毒症相关急性肾损伤中通过p38 MAPK信号通路调控细胞焦亡的机制 | 研究主要集中在小鼠模型和体外细胞实验,缺乏人体临床数据 | 探讨WIP1在脓毒症相关急性肾损伤中的作用及其调控机制 | 小鼠和人类肾2细胞 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 蛋白质 | 小鼠和人类肾2细胞 |
2134 | 2024-11-02 |
Six1 Regulates Mouse Incisor Development by Promoting Dlx1/2/5 Expression
2024-Sep, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241256286
PMID:39101661
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研究论文 | 研究探讨了Six1在调控小鼠下门齿发育中的关键作用及其分子机制 | 首次揭示了Six1通过促进Dlx1/2/5表达在牙胚发育中的重要作用 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类中验证 | 阐明Six1在牙胚发育中的调控作用及其分子机制 | 小鼠下门齿发育过程中的牙胚细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠牙胚发育不同阶段的样本 |
2135 | 2024-11-02 |
APOE ε4-associated downregulation of the IL-7/IL-7R pathway in effector memory T cells: Implications for Alzheimer's disease
2024-Sep, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14173
PMID:39129310
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研究论文 | 研究探讨了APOE ε4等位基因对IL-7/IL-7R通路的影响及其在阿尔茨海默病中的作用 | 揭示了APOE ε4等位基因下调IL-7/IL-7R通路在调节神经炎症和海马萎缩中的作用 | NA | 探讨APOE ε4等位基因对IL-7/IL-7R通路的影响及其在阿尔茨海默病中的作用 | APOE ε4携带者和非携带者的外周血单核细胞 | NA | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | RNA | 54名晚期阿尔茨海默病患者(包括28名APOE ε4携带者和26名非携带者) |
2136 | 2024-11-02 |
Autophagy Regulates Age-Related Jawbone Loss via LepR+ Stromal Cells
2024-Sep, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241264810
PMID:39185629
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研究论文 | 研究探讨了自噬在年龄相关性下颌骨丢失中的作用,特别是通过LepR+基质细胞 | 首次揭示了自噬在年龄相关性下颌骨丢失中的关键作用,并提出了通过激活自噬来缓解下颌骨丢失的新方法 | 研究主要集中在小鼠模型上,需要进一步在人类中验证 | 研究自噬在下颌骨老化和骨量减少中的作用 | 下颌骨及其衍生的基质细胞(JBSCs) | NA | NA | RNA测序、单细胞转录组学 | NA | RNA序列数据 | 包括老年人和老年小鼠的下颌骨样本,以及LepR-Cre/JBSCs |
2137 | 2024-11-02 |
Monocyte Single-Cell Multimodal Profiling in Cardiovascular Disease Risk States
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324457
PMID:39105287
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研究论文 | 本文通过单细胞多模态分析研究了心血管疾病风险状态下单核细胞的转录组和表型特征 | 本文首次使用CITE-seq和单细胞RNA测序技术,全面描述了单核细胞的转录组和表型景观,并发现了多种功能不同的亚群 | 本文主要集中在单核细胞的研究,未涉及其他免疫细胞类型 | 研究心血管疾病风险因素对单核细胞亚群的影响 | 单核细胞及其在心血管疾病中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 表型数据 | 437,126个单核细胞样本 |
2138 | 2024-11-02 |
Remodeling of anti-tumor immunity with antibodies targeting a p53 mutant
2024-06-18, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01566-1
PMID:38886748
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研究论文 | 开发针对p53突变体的单克隆抗体,并通过脂质纳米颗粒递送,以重塑抗肿瘤免疫反应 | 首次开发出针对p53热点突变E285K的单克隆抗体,并通过脂质纳米颗粒递送,显示出强大的抗肿瘤效果 | 研究主要集中在体外和体内实验,尚未进行临床试验 | 探索针对p53突变体的精准治疗策略 | p53突变体及其在肿瘤中的作用 | 癌症研究 | 癌症 | 单细胞测序(scRNA-seq) | 单克隆抗体(mAbs) | 蛋白质 | NA |
2139 | 2024-11-02 |
Identification of restrictive molecules involved in oncolytic virotherapy using genome-wide CRISPR screening
2024-05-23, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01554-5
PMID:38783389
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选技术,识别出限制溶瘤病毒疗法效果的分子,并研究了其在胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌中的应用 | 本文创新性地通过CRISPR筛选技术识别出PARP1作为HSV-1复制的限制因子,并展示了PARP抑制剂与免疫检查点抑制剂联合使用在溶瘤病毒疗法中的协同作用 | NA | 克服溶瘤病毒疗法的固有限制,为三阴性乳腺癌、胶质母细胞瘤和其他恶性肿瘤的临床治疗提供有价值的见解 | 溶瘤病毒疗法在胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌中的应用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | CRISPR筛选 | NA | RNA | 涉及胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌的模型 |
2140 | 2024-11-02 |
GRouNdGAN: GRN-guided simulation of single-cell RNA-seq data using causal generative adversarial networks
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48516-6
PMID:38744843
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研究论文 | 介绍了一种基于基因调控网络(GRN)引导的参考型因果隐式生成模型GRouNdGAN,用于模拟单细胞RNA-seq数据、体内扰动实验和基准测试GRN推断方法 | 通过在其架构中施加用户定义的GRN,GRouNdGAN模拟稳态和瞬态单细胞数据集,其中基因在其调控转录因子(TF)的控制下因果表达 | NA | 开发一种新的生成模型,用于模拟单细胞RNA-seq数据和基准测试基因调控网络推断方法 | 单细胞RNA-seq数据、基因调控网络推断方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 生成对抗网络(GAN) | 基因表达数据 | 六个实验参考数据集 |