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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2101 | 2025-10-07 |
The transcription factor TCF21 is necessary for adoption of cell fates by Foxd1+ stromal progenitors during kidney development
2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.14.607910
PMID:39211232
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研究论文 | 本研究探讨转录因子TCF21在肾脏发育过程中对Foxd1+基质祖细胞命运决定的调控作用 | 首次揭示TCF21缺失导致肾脏基质细胞亚群特异性耗竭并诱导血管内皮标志物Emcn异常表达的新型细胞群体 | 研究仅聚焦于胚胎期14.5天的时间点,未涵盖肾脏发育全过程 | 解析TCF21在肾脏发育过程中调控Foxd1+基质祖细胞分化的分子机制 | 小鼠胚胎肾脏中的Foxd1+基质祖细胞 | 发育生物学 | 先天性肾脏异常 | 单细胞RNA测序, 免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 32,461个GFP+细胞来自E14.5胚胎肾脏 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2102 | 2025-10-07 |
Longitudinal analysis of genetic and epigenetic changes in human pluripotent stem cells in the landscape of culture-induced abnormality
2024-Nov, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01334-8
PMID:39482531
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研究论文 | 通过综合基因组学分析研究人类多能干细胞在体外培养过程中获得'培养适应性表型'的分子机制 | 首次在等基因hESC模型中系统分析培养诱导异常的表观遗传机制,揭示20q11.21拷贝数增加和表观遗传变化共同驱动培养适应性表型 | 研究基于特定hESC模型,结果可能不适用于所有人类多能干细胞系 | 探索人类多能干细胞在体外培养过程中遗传和表观遗传变化的分子机制 | 人类胚胎干细胞(hESCs)和人类多能干细胞(hPSCs) | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序, 单细胞ATAC-seq, 基因组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2103 | 2025-10-07 |
Continuous cell type diversification throughout the embryonic and postnatal mouse visual cortex development
2024-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616246
PMID:39829740
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研究论文 | 本研究构建了小鼠视觉皮层发育过程中的全面单细胞转录组和表观基因组细胞类型图谱 | 提供了胚胎期和出生后发育阶段最详细的小鼠视觉皮层细胞类型动态分子图谱,揭示了细胞类型在不同发育阶段的连续多样化过程 | 研究仅限于小鼠视觉皮层,结果可能无法直接推广到其他脑区或其他物种 | 揭示视觉皮层发育过程中细胞类型多样化的分子机制 | 小鼠视觉皮层发育过程中的兴奋性神经元、抑制性神经元和非神经元细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,单核多组学测序 | 发育轨迹重建 | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据 | 568,674个高质量单细胞转录组和194,545个高质量单核多组学数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | 10x Chromium | 单核Multiome测序技术,提供转录组和染色质可及性联合分析 |
| 2104 | 2025-01-22 |
An Integrative Approach to Precision Pre-implantation Genetic Diagnosis by Investigating Single-cell Sequencing, Polygenic Risk Assessment, Artificial Intelligence-guided Embryo Selection and Genome Editing in Embryos with COL4A1 c.1537G>A Mutation
2024 Oct-Dec, Journal of human reproductive sciences
DOI:10.4103/jhrs.jhrs_145_24
PMID:39831092
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2105 | 2025-10-07 |
Adhesion G Protein-Coupled Receptor Gpr126 (Adgrg6) Expression Profiling in Diseased Mouse, Rat, and Human Kidneys
2024-05-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100874
PMID:38786096
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研究论文 | 本研究系统分析了黏附G蛋白偶联受体Gpr126在小鼠、大鼠和人类肾脏疾病中的表达谱 | 首次在多种肾脏疾病模型中详细表征Gpr126的表达变化,并发现其在肾小管和肾小球损伤中的差异表达模式 | 研究主要关注表达谱分析,功能机制研究相对有限 | 探索Gpr126在肾脏疾病中的表达变化及其潜在治疗价值 | 小鼠、大鼠和人类肾脏组织样本 | 分子生物学 | 肾脏疾病 | RT-PCR, RNAscope定量分析, 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织样本 | 多种肾脏疾病患者样本(狼疮性肾炎、IgA肾病、FSGS、高血压、糖尿病、急性肾损伤、慢性肾脏病) | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列分析 | NA | NA |
| 2106 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Unveils Dynamic Immune Cell Responses during Haemonchus contortus Infection
2024-05-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100842
PMID:38786064
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示山羊在捻转血矛线虫感染期间外周血单个核细胞的动态免疫细胞反应 | 首次在单细胞水平上系统解析捻转血矛线虫感染期间宿主外周血单个核细胞的转录组特征和细胞通讯网络 | 样本量较小(仅4只山羊),需要更大规模研究验证 | 探究山羊对捻转血矛线虫感染的免疫应答机制 | 波尔山羊的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序,qPCR,粪便虫卵计数 | NA | 单细胞转录组数据 | 4只波尔山羊(2只感染组,2只对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2107 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cardiac Fibroblast-Specific Transcriptomic Changes in Dilated Cardiomyopathy
2024-04-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13090752
PMID:38727290
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示扩张型心肌病中心脏成纤维细胞特异性转录组变化 | 采用更新的生物信息学流程结合无监督聚类和参考标签转移,更全面注释单细胞数据集,发现心脏成纤维细胞特异性基因表达改变 | 未明确说明样本数量和技术重复情况,功能验证部分基因功能评估尚未完成 | 检测扩张型心肌病中细胞特异性转录组改变 | 人类扩张型心肌病心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2108 | 2025-10-07 |
Differentiation route determines the functional outputs of adult megakaryopoiesis
2024-03-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.02.006
PMID:38447571
|
研究论文 | 本研究通过命运示踪系统比较了巨核细胞生成的两种分化途径的功能差异 | 首次开发命运示踪系统区分巨核细胞的直接和逐步分化途径,并揭示它们产生功能不同的巨核细胞亚群 | NA | 探究巨核细胞生成的两种分化途径的功能重要性 | 成年小鼠的巨核细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 命运示踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2109 | 2025-10-07 |
An atlas of cells in the human tonsil
2024-02-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.01.006
PMID:38301653
|
研究论文 | 构建了包含超过55.6万个细胞的人类扁桃体细胞图谱,整合了五种数据模态 | 首次整合单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组、免疫组库测序和空间转录组学五种数据模态构建人类扁桃体细胞图谱 | NA | 建立人类扁桃体细胞图谱并解析其免疫功能 | 人类扁桃体细胞 | 单细胞多组学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, 单细胞表观基因组测序, 单细胞蛋白质组测序, 免疫组库测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | 超过556,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2110 | 2025-10-07 |
An exhausted-like microglial population accumulates in aged and APOE4 genotype Alzheimer's brains
2024-01-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.001
PMID:38159571
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现阿尔茨海默病大脑中积累了一种类似耗竭状态的炎症性小胶质细胞群 | 首次鉴定出在衰老和APOE4基因型阿尔茨海默病大脑中积累的终末炎症性小胶质细胞(TIM)群体 | 研究主要基于AD模型小鼠,人类样本验证有限 | 探究年龄和APOE4基因变异如何改变神经免疫功能 | 携带三种常见人类APOE等位基因的AD模型小鼠和人类AD患者脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | AD模型小鼠和人类AD患者脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2111 | 2025-10-07 |
TRIM24 Cooperates with Ras Mutation to Drive Glioma Progression through snoRNA Recruitment of PHAX and DNA-PKcs
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400023
PMID:38828688
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研究论文 | 本研究揭示TRIM24通过与Ras突变协同作用,通过snoRNA招募PHAX和DNA-PKcs驱动胶质瘤进展的分子机制 | 首次发现TRIM24与Ras突变协同驱动胶质瘤进展的新机制,阐明PHAX/U3 snoRNA/DNA-PKcs信号轴在表观遗传重编程中的作用 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 探究胶质瘤进展的表观遗传调控机制 | 胶质瘤细胞、人类神经干细胞、临床Ep-GBM标本 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床Ep-GBM标本及实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2112 | 2025-10-07 |
ARID1B maintains mesenchymal stem cell quiescence via inhibition of BCL11B-mediated non-canonical Activin signaling
2024-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48285-2
PMID:38816354
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研究论文 | 本研究揭示了ARID1B通过抑制BCL11B介导的非经典Activin信号通路维持间充质干细胞静息状态的新机制 | 首次发现ARID1B通过直接结合Bcl11b第三内含子抑制其表达,从而调控非经典Activin信号通路维持MSC静息状态 | 研究主要基于小鼠切牙模型,在人类系统中的验证尚需进一步研究 | 探究ARID1B在间充质干细胞静息维持中的调控功能和分子机制 | 小鼠GLI1+间充质干细胞谱系 | 干细胞生物学 | Coffin-Siris综合征 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2113 | 2025-10-07 |
Triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) regulates phagocytosis in glioblastoma
2024-05-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad257
PMID:38237157
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研究论文 | 本研究探讨了TREM2在胶质母细胞瘤中对髓系细胞吞噬功能的调控作用 | 首次发现TREM2在胶质瘤中与吞噬功能标志物正相关而非免疫抑制通路,并揭示其通过Syk信号通路介导吞噬作用 | 使用小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病,研究样本量未明确说明 | 探究TREM2在胶质母细胞瘤免疫病理和进展中的作用机制 | 人类胶质瘤样本和两种不同的小鼠胶质瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体内吞噬追踪方法,体外实验 | 小鼠胶质瘤模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2114 | 2025-10-07 |
The bone marrow is the primary site of thrombopoiesis
2024-01-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020895
PMID:37879046
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研究论文 | 本研究通过多种成像技术和单细胞RNA测序分析证实骨髓是血小板生成的主要场所 | 首次系统比较骨髓、脾脏和肺部巨核细胞的相对丰度及血小板生成能力,结合多种先进成像技术和单细胞测序数据分析 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据来源于已发表的单细胞测序数据库,需要进一步实验验证 | 确定在稳态条件下血小板生成的主要器官及其相对贡献 | 成年小鼠的骨髓、脾脏和肺部巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 双光子活体成像, 光片显微镜, 定量组织成像 | NA | 图像, 测序数据, 流式数据 | 成年小鼠骨髓、脾脏和肺部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2115 | 2025-10-07 |
Over Activation of IL-6/STAT3 Signaling Pathway in Juvenile Dermatomyositis
2024-Oct, Rheumatology and therapy
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s40744-024-00699-6
PMID:39073510
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研究论文 | 本研究探讨IL-6/JAK/STAT3信号通路在幼年皮肌炎中的异常激活机制及其与肌肉损伤的关系 | 首次通过单细胞RNA测序揭示JDM患者骨骼肌细胞、巨噬细胞和血管内皮细胞中JAK/STAT3通路的异常激活,并发现IL-6通过调节钙通道基因SLN和诱导ROS产生参与肌肉损伤 | 样本量有限(72例患者,仅2例进行scRNA-seq分析),亚组分析中TIF1γ阳性患者未显示IL-6显著升高 | 阐明IL-6激活JAK/STAT3通路在幼年皮肌炎发病机制中的作用 | 幼年皮肌炎患者(新诊断72例,治疗缓解期同一队列)及健康对照 | 免疫学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, RT-PCR, ROS检测 | NA | 血清样本, 肌肉活检组织, 细胞实验数据 | 72例JDM患者(含亚组分析),2例JDM患者肌肉活检scRNA-seq,体外骨骼肌细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2116 | 2025-10-07 |
The architecture of silk-secreting organs during the final larval stage of silkworms revealed by single-nucleus and spatial transcriptomics
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114460
PMID:38996068
|
研究论文 | 通过单核和空间转录组学揭示家蚕末龄幼虫丝腺器官的细胞和空间组织结构 | 首次结合单核和空间转录组学系统绘制家蚕末龄幼虫丝腺的细胞组成和空间结构图谱 | NA | 阐明丝腺器官的细胞空间组织和高效丝蛋白合成机制 | 家蚕末龄幼虫的丝腺器官 | 空间转录组学 | NA | 单核转录组学, 空间转录组学, 转基因技术 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2117 | 2025-10-07 |
The mechano-chemical circuit in fibroblasts and dendritic cells drives basal cell proliferation in psoriasis
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114513
PMID:39003736
|
研究论文 | 本研究揭示了树突状细胞通过机械-化学信号通路驱动成纤维细胞增强真皮硬度,从而促进银屑病基底细胞过度增殖的新机制 | 首次发现树突状细胞分泌的LGALS9可通过CD44受体作用于真皮成纤维细胞,建立机械-化学信号通路调控银屑病基底细胞增殖 | NA | 阐明银屑病发病机制中真皮成纤维细胞的作用及机械-化学信号通路 | 树突状细胞、真皮成纤维细胞、表皮基底细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫染色、硬度测量 | NA | 基因表达数据、空间定位数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2118 | 2025-10-07 |
Identification and characterization of TM4SF1+ tumor self-seeded cells
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114512
PMID:39003738
|
研究论文 | 本研究通过光转换标记技术识别并表征了TM4SF1+肿瘤自播种细胞,揭示了其在肿瘤生长和转移中的关键作用 | 首次建立准确追踪肿瘤自播种细胞的动物模型,发现TM4SF1作为TSCs特异性标志物,并证实其在癌症早期即可检测 | TSCs的追踪和分离技术仍存在挑战,需要进一步验证其临床应用的可行性 | 研究肿瘤自播种细胞的特性及其在癌症进展中的功能 | 循环肿瘤细胞和肿瘤自播种细胞 | 癌症生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,光转换标记技术 | 动物模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2119 | 2025-10-07 |
An atlas of GPCRs in dopamine neurons: Identification of the free fatty acid receptor 4 as a regulator of food and water intake
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114509
PMID:39003735
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研究论文 | 本研究通过构建多巴胺神经元中GPCR的图谱,发现游离脂肪酸受体4(FFAR4)是调节食物和水分摄入的关键因子 | 首次系统绘制了多巴胺神经元中GPCR的表达图谱,并鉴定出FFAR4作为连接高能量摄入与多巴胺奖赏通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要在其他物种中验证;部分受体的功能验证尚未完全完成 | 绘制中脑多巴胺神经元中G蛋白偶联受体的表达图谱,并探索其在代谢调节中的作用 | Dat-eGFP转基因小鼠的中脑多巴胺神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | qPCR阵列分析、单细胞RNA测序数据挖掘、离体钙成像、体内功能实验 | NA | 基因表达数据、钙成像数据、行为学数据 | Dat-eGFP小鼠的多巴胺神经元,分析了377个GPCR的表达 | NA | 单细胞RNA-seq、qPCR | NA | NA |
| 2120 | 2025-10-07 |
Patterns of Unwanted Biological and Technical Expression Variation Among 49 Human Tissues
2024-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102069
PMID:38670317
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研究论文 | 本研究利用GTEx数据集分析49种人体组织中基因表达变异的模式和原因 | 对17,282个样本进行大规模表达变异分析,识别出522个变异转录本簇并系统分类其生物学和技术原因 | 仅评估了最可变的前2%转录本,部分变异簇(14%)未能明确归因 | 探究人体组织基因表达中非期望变异的模式和原因 | 49种人体组织的17,282个基因表达样本 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 17,282个样本来自49种人体组织 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |