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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2041 | 2025-10-07 |
Invasive growth of brain metastases is linked to CHI3L1 release from pSTAT3-positive astrocytes
2024-06-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae013
PMID:38271182
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研究论文 | 本研究揭示了pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过释放CHI3L1促进脑转移瘤侵袭性生长的机制 | 首次发现pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过分泌CHI3L1驱动脑转移瘤的侵袭性生长,并证实STAT3和CHI3L1可作为治疗靶点 | NA | 探究脑转移瘤侵袭模式与pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞的关系及其作为STAT3抑制预测生物标志物的潜力 | 人类脑转移瘤样本、患者来源异种移植模型、小鼠模型、脑切片-肿瘤共培养体系 | 肿瘤学 | 脑转移瘤 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、脑切片-肿瘤共培养实验 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2042 | 2025-10-07 |
Mesenchymal Traits as an Intrinsic Feature of Undifferentiated Cells
2024-Dec-24, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb13010001
PMID:39846630
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研究论文 | 本研究通过分析公开单细胞转录组数据集,探讨间充质表型与未分化细胞状态的内在联系 | 挑战传统观点,提出间充质表型不仅是结构支持特征,更是未分化多能状态的形态学表达 | 基于公开数据集的分析,缺乏实验验证 | 探索间充质表型在胚胎发育和成体器官中与细胞未分化状态的关系 | 早期胚胎阶段和成体组织的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公开单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2043 | 2025-10-07 |
TRIM44, a Novel Prognostic Marker, Supports the Survival of Proteasome-Resistant Multiple Myeloma Cells
2024-08-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171431
PMID:39273003
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研究论文 | 本研究揭示了TRIM44在多发性骨髓瘤中的预后价值和治疗抵抗机制 | 首次系统阐明TRIM44通过连接泛素-蛋白酶体系统和自噬途径,支持蛋白酶体抑制剂耐药性骨髓瘤细胞生存的新机制 | 研究主要基于回顾性队列分析,需要进一步的前瞻性研究验证TRIM44的临床价值 | 探讨TRIM44在多发性骨髓瘤预后和治疗抵抗中的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 | 癌症生物学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 858例多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2044 | 2025-10-07 |
3D-Bioprinted Co-Cultures of Glioblastoma Multiforme and Mesenchymal Stromal Cells Indicate a Role for Perivascular Niche Cells in Shaping Glioma Chemokine Microenvironment
2024-08-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171404
PMID:39272976
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研究论文 | 本研究利用3D生物打印技术构建胶质母细胞瘤与间充质基质细胞共培养模型,探索血管周围微环境细胞在塑造胶质瘤趋化因子微环境中的作用 | 首次结合公共测序数据分析和3D生物打印技术,揭示血管周围微环境细胞对胶质母细胞瘤趋化因子谱多样性的关键调控作用 | 研究仅使用两种胶质母细胞瘤细胞系,未涵盖GBM的完整异质性;体外模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究胶质母细胞瘤微环境中不同细胞类型对趋化因子分泌的贡献 | 胶质母细胞瘤细胞系(U-251和DK-MG)和间充质基质细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 3D生物打印,单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 3D共培养模型 | RNA测序数据,分泌组数据 | 两种胶质母细胞瘤细胞系和间充质基质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2045 | 2025-10-07 |
Genome Restructuring around Innate Immune Genes in Monocytes in Alcohol-associated Hepatitis
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.07.607014
PMID:39211112
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研究论文 | 本研究通过Hi-C技术分析酒精相关性肝炎患者单核细胞的基因组三维结构变化 | 首次在酒精相关性肝炎患者单核细胞中发现基因组三维结构的显著改变,特别是在天然免疫基因簇区域 | 样本量较小(仅4例患者和4例对照),需要更大规模研究验证 | 探究酒精相关性肝炎中单核细胞基因组三维结构变化及其对炎症基因表达的调控 | 酒精相关性肝炎患者和健康对照者的单核细胞 | 基因组学 | 酒精相关性肝炎 | Hi-C, scRNA-seq | NA | 基因组三维构象数据, 单细胞转录组数据 | 4例AH患者和4例健康对照 | NA | 高通量染色质构象捕获, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2046 | 2025-10-07 |
Negative binomial mixture model for identification of noise in antibody-antigen specificity predictions from single-cell data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae170
PMID:39659592
|
研究论文 | 提出一种使用负二项混合模型对LIBRA-seq单细胞数据进行去噪的方法 | 首次将负二项混合模型应用于LIBRA-seq数据的噪声识别,通过聚类抗原计数为信号和噪声组分 | 方法在不同样本间存在数据规模和噪声结构的变异 | 提高单细胞B细胞受体测序数据中抗体-抗原特异性预测的准确性 | LIBRA-seq单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞B细胞受体测序,LIBRA-seq | 负二项混合模型 | 单细胞测序数据 | 9名供者代表的独立LIBRA-seq实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | LIBRA-seq(通过测序连接B细胞受体与抗原特异性) |
| 2047 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing elucidates cellular plasticity in esophageal small cell carcinoma following chemotherapy treatment
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1477705
PMID:39850495
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析食管小细胞癌患者化疗前后的细胞可塑性变化 | 首次在单细胞水平揭示食管小细胞癌化疗后的细胞可塑性动态变化及肿瘤微环境组成改变 | 仅基于单个患者的样本分析,样本量有限 | 探究食管小细胞癌化疗后细胞可塑性的分子机制 | 食管小细胞癌患者化疗前后的肿瘤组织样本 | 单细胞测序分析 | 食管小细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者化疗前后配对的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2048 | 2025-10-07 |
NBAtlas: A harmonized single-cell transcriptomic reference atlas of human neuroblastoma tumors
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114804
PMID:39368085
|
研究论文 | 本研究整合了七个单细胞或单核转录组数据集,构建了一个包含362,991个细胞的人类神经母细胞瘤协调参考图谱 | 创建了首个涵盖61名患者的大规模神经母细胞瘤单细胞转录组协调参考图谱,揭示了肿瘤区室转录组特征与临床结局的关联 | 整合的研究数据量仍有限,可能无法完全代表神经母细胞瘤的全部异质性 | 构建人类神经母细胞瘤的单细胞转录组参考图谱并解析其肿瘤异质性 | 神经母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61名患者的362,991个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 2049 | 2025-10-07 |
PD-L1 restrains PD-1+Nrp1lo Treg cells to suppress inflammation-driven colorectal tumorigenesis
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114819
PMID:39368087
|
研究论文 | 本研究揭示PD-L1通过抑制PD-1+Nrp1lo Treg细胞调控IL6中性粒细胞募集,从而控制炎症驱动性结直肠肿瘤发生 | 首次发现PD-L1通过调控PD-1+Nrp1lo Treg细胞亚群和IL6中性粒细胞来抑制结直肠肿瘤发生的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究PD-L1在结直肠癌中调控T细胞功能的具体机制 | 小鼠结直肠肿瘤模型中的T细胞亚群和中性粒细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2050 | 2025-10-07 |
Persistent bone marrow hemozoin accumulation confers a survival advantage against bacterial infection via cell-intrinsic Myd88 signaling
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114850
PMID:39392758
|
研究论文 | 本研究揭示了疟疾中血晶素在骨髓持续沉积通过细胞内在Myd88信号通路增强先天免疫记忆的机制 | 首次发现血晶素通过细胞内在Myd88依赖途径诱导骨髓生成偏向,并证实其能增强单核细胞杀菌能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究血晶素沉积对造血和免疫反应的调控机制 | 骨髓造血祖细胞和单核细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 骨髓嵌合体, 骨内注射 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2051 | 2024-10-12 |
Correction to: Single-cell RNA sequencing comparison of CD4+, CD8+ and T-cell receptor γδ+ cutaneous T-cell lymphomas reveals subset-specific molecular phenotypes
2024-Oct-11, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae374
PMID:39392468
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2052 | 2025-10-07 |
Notch signaling regulates macrophage-mediated inflammation in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.08.016
PMID:39317200
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示Notch-RBPJ信号通路在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中调控单核细胞向巨噬细胞转化的关键作用 | 首次揭示Notch-RBPJ信号通路在MASH中控制单核细胞-巨噬细胞转化的时空动态机制,发现Rbpj缺陷通过上调CD36表达促进保护性Ly6C单核细胞的脂质摄取 | 巨噬细胞分化和功能的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝病/脂肪性肝炎中巨噬细胞分化和功能的调控机制 | 肝脏巨噬细胞群体(包括驻留库普弗细胞和单核来源巨噬细胞) | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序,命运图谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2053 | 2025-10-07 |
CD4+ T cells reactive to a hybrid peptide from insulin-chromogranin A adopt a distinct effector fate and are pathogenic in autoimmune diabetes
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.07.024
PMID:39214091
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性糖尿病中CD4 T细胞对胰岛素衍生表位的反应动态和致病性 | 发现InsC-ChgA特异性CD4 T细胞偏向独特的Th1效应表型且具有致病性,而其他胰岛素表位特异性T细胞主要呈现调节表型 | 研究仅限于NOD小鼠模型,未在人类患者中验证 | 探究自身免疫性糖尿病中CD4 T细胞对不同胰岛素衍生表位的反应特性和致病机制 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的CD4 T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序, 四聚体分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从胰腺中分选的CD4 T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2054 | 2025-10-07 |
Cryo-PRO facilitates whole blood cryopreservation for single-cell RNA sequencing of immune cells from clinical samples
2024-Sep-19, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.18.24313760
PMID:39371152
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研究论文 | 开发了一种名为Cryo-PRO的全血冷冻保存方法,用于临床样本免疫细胞的单细胞RNA测序 | 首次提出直接从冷冻保存的全血中分离PBMC的方法,将现场处理时间从2小时以上缩短至15分钟以内 | 仅在23名脓毒症患者中进行了验证,样本量相对较小 | 开发更便捷的临床样本处理方法以促进单细胞RNA测序在多中心研究中的应用 | 脓毒症患者的外周血单核细胞(PBMC) | 单细胞测序 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 23名脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2055 | 2025-10-07 |
Scalable imaging-free spatial genomics through computational reconstruction
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606465
PMID:39149311
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研究论文 | 开发了一种无需成像的空间转录组学方法,通过分子扩散模式和计算重建获得空间基因组学数据 | 利用分子扩散模式计算重建空间数据,无需依赖成像或直接配准设备 | NA | 开发可扩展的无成像空间基因组学技术 | 组织中的细胞及其分子程序 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,分子扩散分析,计算重建 | UMAP算法 | 空间转录组数据,分子相互作用矩阵 | NA | NA | 空间转录组学 | Slide-seq, Slide-tags | 二维条形码阵列 |
| 2056 | 2025-10-07 |
LMNA-Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-Derived iPSC Differentiation Support Cell Type and Lineage-Specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency
2024-09-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171479
PMID:39273049
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC通过单细胞转录组学分析LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 首次在患者来源的iPSC分化过程中通过单细胞RNA测序揭示LMNA单倍体不足对心肌细胞和心外膜来源细胞基因表达和发育的细胞类型特异性调控紊乱 | 方法需要改进以进一步研究iPSC衍生模型中表观遗传和分化机制 | 研究LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 来自携带LMNA c.357-2A>G剪接位点突变家族的患者来源iPSC及其分化细胞 | 单细胞转录组学 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | iPSC分化模型 | 单细胞转录组数据 | 12个样本(4个患者样本,8个对照样本),涵盖7个时间点,共110,521个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2057 | 2025-10-07 |
Keratin 8/18a.1 Expression Influences Embryonic Neural Crest Cell Dynamics and Contributes to Postnatal Corneal Regeneration in Zebrafish
2024-09-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171473
PMID:39273043
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现角蛋白中间丝基因K8和K18a.1在斑马鱼眼部发育和角膜再生中的重要作用 | 首次揭示K8和K18a.1在斑马鱼神经嵴细胞迁移和角膜再生中的功能,并发现K18a.1受视黄酸调控 | 使用吗啉代寡核苷酸进行基因敲降可能存在脱靶效应,研究主要聚焦于斑马鱼模型 | 探究神经嵴细胞在眼部发育和角膜再生中的分子机制 | 斑马鱼胚胎神经嵴细胞和成年斑马鱼角膜组织 | 发育生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫荧光显微镜, 吗啉代寡核苷酸敲降 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 斑马鱼胚胎和成年个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2058 | 2025-10-07 |
circRNAs as Epigenetic Regulators of Integrity in Blood-Brain Barrier Architecture: Mechanisms and Therapeutic Strategies in Multiple Sclerosis
2024-08-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13161316
PMID:39195206
|
综述 | 本文综述了环状RNA通过调节血脑屏障完整性在多发性硬化症中的作用机制及治疗策略 | 首次系统阐述circRNAs通过表观遗传调控血脑屏障完整性的机制,为多发性硬化症治疗提供新靶点 | 目前仍处于机制探索阶段,缺乏临床验证数据 | 探讨circRNAs在维持血脑屏障完整性中的作用及其在多发性硬化症治疗中的应用潜力 | 血脑屏障内皮细胞、紧密连接和粘附连接蛋白、环状RNA | 神经科学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2059 | 2025-10-07 |
Regulatory B Cells Expressing Granzyme B from Tolerant Renal Transplant Patients: Highly Differentiated B Cells with a Unique Pathway with a Specific Regulatory Profile and Strong Interactions with Immune System Cells
2024-07-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13151287
PMID:39120317
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肾移植耐受患者中表达颗粒酶B的调节性B细胞特征 | 首次发现肾移植耐受患者中GZMB B细胞是高度分化的B细胞,具有独特的发育轨迹和特异性转录组特征 | 样本量较小(每组3例患者),需要更大规模研究验证 | 确定表达颗粒酶B的调节性B细胞在肾移植耐受患者外周血中是否富集 | 肾移植患者的外周血单个核细胞和体外诱导的GZMB B细胞 | 单细胞组学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | 伪时序轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 9例肾移植患者(3例稳定功能,3例药物耐受,3例抗体介导排斥) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2060 | 2025-10-07 |
Transition of signal requirement in hematopoietic stem cell development from hemogenic endothelial cells
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404193121
PMID:39042698
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研究论文 | 本研究揭示了造血干细胞从生血内皮细胞发育过程中信号需求的变化 | 首次阐明了干细胞因子和血小板生成素在不同发育阶段对造血干细胞诱导的关键作用,并建立了无血清无饲养层的培养系统 | 研究主要基于小鼠胚胎模型,在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探索造血干细胞从生血内皮细胞发育过程中的信号需求机制 | 小鼠胚胎期的生血内皮细胞、前造血干细胞-I和前造血干细胞-II | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | E10.5至E11.5小鼠胚胎的背主动脉及周围组织、胎肝 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |