单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7858 篇文献，本页显示第 2021 - 2040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2021 | 2024-11-07 |
Intestinal epithelial adaptations to vertical sleeve gastrectomy defined at single-cell resolution
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110805
PMID:38309446
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，探讨了垂直袖状胃切除术（VSG）对小肠上皮细胞的影响 | 首次在单细胞分辨率下定义了VSG对小肠上皮细胞的适应性变化，并揭示了VSG恢复高脂饮食扰动的细胞类型特异性基因和通路 | 研究基于小鼠模型，结果的临床相关性需进一步验证 | 探讨垂直袖状胃切除术（VSG）对小肠上皮细胞的分子和细胞水平的影响 | 小肠上皮细胞及其在VSG后的适应性变化 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 2022 | 2024-11-07 |
YAP induces a neonatal-like pro-renewal niche in the adult heart
2024-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00428-w
PMID:38510108
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研究论文 | 研究探讨了YAP激活在成年心脏中诱导新生儿样再生微环境的作用 | 发现YAP激活可以重建心肌梗死后心脏的微环境，并诱导心脏再生 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类心脏中验证 | 研究YAP激活在成年心脏中的再生潜力及其微环境重建机制 | 成年表达YAP5SA的心肌细胞和心脏微环境 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠和人类心脏样本 |
| 2023 | 2024-11-07 |
Impacts of cryopreservation on phenotype and functionality of mononuclear cells in peripheral blood and ascites
2024-Feb, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2023-0136
PMID:38525442
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研究论文 | 研究了不同冷冻保存时间和额外冷冻-解冻循环对血液和腹水中单核细胞数量和功能的影响 | 首次探讨了不同冷冻保存条件对单核细胞亚型耐受性的影响 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 探讨冷冻保存对单核细胞表型和功能的影响 | 血液和腹水中的单核细胞 | NA | 卵巢癌 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 细胞 | 21份血液样本和8份腹水样本 |
| 2024 | 2024-11-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals Immune Education promotes T cell survival in mice subjected to the cecal ligation and puncture sepsis model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366955
PMID:38562928
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究免疫教育对小鼠T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中存活的影响 | 首次通过单细胞RNA测序探讨了免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 仅在单一早期时间点进行了研究，未探讨长期效应 | 研究免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 小鼠脾脏T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中的反应 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组小鼠样本：对照组、免疫教育组、CLP组和免疫教育CLP组 |
| 2025 | 2024-11-07 |
Revisiting roles of mast cells and neural cells in keloid: exploring their connection to disease activity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1339336
PMID:38524141
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研究论文 | 本文探讨了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩中的作用及其与疾病活动的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析了活动性瘢痕疙瘩、非活动性瘢痕疙瘩和成熟瘢痕样本，揭示了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩微环境中的重要作用 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 阐明肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩发病机制中的作用及其与疾病活动的关系 | 瘢痕疙瘩样本中的肥大细胞和神经细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个活动性瘢痕疙瘩样本，4个非活动性瘢痕疙瘩样本，3个成熟瘢痕样本 |
| 2026 | 2024-11-07 |
Comprehensive analysis of lactylation-related gene sets and mitochondrial functions in gastric adenocarcinoma: implications for prognosis and therapeutic strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1451725
PMID:39478860
|
研究论文 | 本研究探讨了乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义，并提出了新的治疗策略 | 本研究通过整合大规模基因组数据，利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了胃腺癌中独特的分子亚型及其与生存结果和免疫特征的关系，并提出了优于现有模型的预后模型 | NA | 探讨乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义，并提出新的治疗策略 | 胃腺癌中的乳酸化相关基因集、线粒体功能、肿瘤微环境、分子亚型、免疫细胞浸润和响应 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因组数据 | 大规模基因组数据，包括TCGA和多个GEO数据集 |
| 2027 | 2024-11-07 |
Identification and validation of efferocytosis-related biomarkers for the diagnosis of metabolic dysfunction-associated steatohepatitis based on bioinformatics analysis and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460431
PMID:39497821
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习方法，识别并验证了与代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 本研究首次系统地探讨了吞噬作用与MASH之间的关系，并通过机器学习构建了有效的诊断模型 | 本研究主要基于生物信息学分析和机器学习，缺乏大规模临床样本的验证 | 识别并验证与MASH诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）及其相关的吞噬作用过程 | 机器学习 | 肝病 | 机器学习算法 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 2028 | 2024-11-06 |
TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage
2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528
PMID:39494399
|
研究论文 | 研究探讨了肿瘤坏死因子α（TNFα）对小鼠软骨细胞转录组的影响 | 首次在单细胞分辨率下分析了TNFα对软骨细胞转录组的影响，并揭示了其对不同细胞群的差异性作用 | 研究仅限于新生C57BL/6小鼠的软骨细胞，未涉及其他物种或年龄段的小鼠 | 深入理解肿瘤坏死因子α（TNFα）在软骨细胞炎症反应中的作用 | 新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序（RNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 14,239个细胞和24,320个基因 |
| 2029 | 2024-11-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Metabolic Stress-Dependent Activation of Cardiac Macrophages in a Model of Dyslipidemia-Induced Diastolic Dysfunction
2024-Nov-05, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了高脂饮食诱导的ApoE敲除小鼠模型中心脏细胞的表达谱，揭示了代谢应激对心脏巨噬细胞的激活作用及其在舒张功能障碍中的作用 | 首次揭示了代谢应激通过内质网应激途径直接激活心脏巨噬细胞，并提出了钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂作为治疗HFpEF特定表型的潜在疗法 | NA | 探讨代谢应激对心脏炎症细胞的影响，特别是巨噬细胞，并评估钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂的潜在治疗效果 | ApoE敲除小鼠模型中的心脏细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ApoE敲除小鼠 |
| 2030 | 2024-11-06 |
Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy
2024-Nov-04, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0637
PMID:39495586
|
研究论文 | 研究探讨了血管紧张素转换酶（ACE）依赖的肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中的作用 | 揭示了ACE依赖的肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中的关键作用，为治疗提供了新的见解 | NA | 测试ACE依赖的肾内血管紧张素II是否破坏肾小管线粒体膜稳态并导致过量ROS生成 | 糖尿病肾小管病变中的线粒体膜稳态和ROS生成 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 2031 | 2024-11-06 |
Deciphering normal and cancer stem cell niches by spatial transcriptomics: opportunities and challenges
2024-Nov-04, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351956.124
PMID:39496456
|
研究论文 | 本文探讨了通过空间转录组学技术解析正常干细胞和癌症干细胞微环境的机会与挑战 | 利用下一代测序、单细胞转录组学和空间转录组学等先进技术，提供高分辨率和全面的疾病组织分子图谱 | 技术限制和计算工具的局限性阻碍了对这些微环境的全面表征 | 研究正常干细胞和癌症干细胞在不同器官中的特性及其在正常发育和肿瘤发生中的作用 | 正常干细胞和癌症干细胞及其微环境 | 数字病理学 | NA | 下一代测序、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2032 | 2024-11-06 |
Single-cell sequencing applications in acute myeloid leukemia
2024-Nov-04, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2024.2422833
PMID:39496597
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病中的应用及其进展 | 单细胞测序技术有助于理解急性髓系白血病中的遗传和功能异质性，特别是与白血病干细胞、克隆进化和可测量残留病监测相关的方面 | NA | 探讨单细胞测序技术在急性髓系白血病研究中的应用及其对临床实践的影响 | 急性髓系白血病及其相关细胞和遗传特征 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 2033 | 2024-11-06 |
Multiple Machine Learning Identifies Key Gene PHLDA1 Suppressing NAFLD Progression
2024-Nov-04, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02164-6
PMID:39496918
|
研究论文 | 本研究通过多重机器学习策略识别出关键基因PHLDA1，该基因在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展中起抑制作用 | 本研究首次通过多重机器学习策略识别出PHLDA1基因，并验证其在NAFLD进展中的抑制作用 | 本研究主要基于细胞和小鼠模型进行验证，尚未在人体临床试验中验证PHLDA1的疗效 | 识别和验证新的NAFLD生物标志物，以促进其预测、预防和个性化治疗 | NAFLD相关基因和免疫细胞 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CIBERSORT分析 | 多种机器学习模型 | 基因表达数据 | 三个NAFLD数据集中的23个重叠差异表达基因（DEGs），以及细胞和小鼠NAFLD模型 |
| 2034 | 2024-11-06 |
The study of Alzheimer's disease risk diagnosis based on natural killer cell marker genes in the multi-omics data
2024-Nov-03, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877241295316
PMID:39497294
|
研究论文 | 研究基于自然杀伤细胞标记基因的多组学数据进行阿尔茨海默病风险诊断 | 提出了一种新的特征选择算法ADGCN，并基于17个特征基因构建了诊断模型 | NA | 识别与阿尔茨海默病相关的特征基因，构建诊断模型并探索其潜在的生物学机制 | 自然杀伤细胞标记基因 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | ADGCN-XGBoost | 多组学数据 | NA |
| 2035 | 2024-11-06 |
Single-cell transcriptomics reveals IRF7 regulation of the tumor microenvironment in isocitrate dehydrogenase wild-type glioma
2024-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.754
PMID:39492838
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组测序分析了IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群基因表达调控网络，揭示了IRF7在IDH野生型胶质瘤微环境中的调控作用 | 首次系统地建立了IDH转录活性在胶质瘤中的单细胞水平调控机制，并绘制了相应的细胞图谱 | NA | 探讨IDH突变型和野生型胶质瘤的基因表达调控网络及其在肿瘤微环境中的作用 | IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | 机器学习模型 | RNA | IDH突变型和野生型胶质瘤患者 |
| 2036 | 2024-11-06 |
Seq-Scope: repurposing Illumina sequencing flow cells for high-resolution spatial transcriptomics
2024-Oct-31, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01065-0
PMID:39482362
|
研究论文 | Seq-Scope利用Illumina测序平台进行高分辨率、高内容的空间转录组分析 | Seq-Scope通过重新利用Illumina测序平台，克服了传统空间转录组技术的低分辨率、有限转录覆盖、复杂流程、可扩展性差和高成本等问题，提供亚微米级分辨率、高捕获效率、快速周转时间和精确的组织病理学注释 | NA | 开发一种高分辨率、高内容的空间转录组分析方法 | 组织切片的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 多个组织切片，面积为7 mm × 7 mm或更大 |
| 2037 | 2024-11-06 |
Identification of immune feature genes and intercellular profiles in diabetic cardiomyopathy
2024-Oct-15, World journal of diabetes
IF:4.2Q1
DOI:10.4239/wjd.v15.i10.2093
PMID:39493556
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研究论文 | 研究探讨了糖尿病心肌病（DCM）中的免疫分子机制，并基于免疫特征基因构建了诊断和预后模型 | 首次识别出Proenkephalin（Penk）和retinol binding protein 7（Rbp7）作为潜在的DCM生物标志物，并揭示了间质细胞与免疫细胞之间的异常表型转换和信号交流 | NA | 探讨糖尿病心肌病中的免疫分子机制并构建诊断和预后模型 | 糖尿病心肌病患者的免疫特征基因和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序（RNA-seq）、单样本基因集富集分析（ssGSEA）、实时定量聚合酶链反应和蛋白质印迹技术 | 机器学习 | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 验证队列中的样本数量未明确提及 |
| 2038 | 2024-11-06 |
Loss of Smek1 Induces Tauopathy and Triggers Neurodegeneration by Regulating Microtubule Stability
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400584
PMID:39206808
|
研究论文 | 研究探讨了Smek1在tauopathy中防止神经退行性变的作用 | 首次证明Smek1缺乏通过加剧tau病理和线粒体功能障碍以年龄依赖性方式逐渐诱导神经退行性变 | NA | 研究Smek1在tauopathy和神经退行性变中的生理和病理作用 | Smek1在tauopathy中的作用及其对神经退行性变的影响 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质相互作用分析 | Smek1敲除小鼠和shSmek1细胞 |
| 2039 | 2024-11-06 |
Myeloid Cells and Sensory Nerves Mediate Peritendinous Adhesion Formation via Prostaglandin E2
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405367
PMID:39207041
|
研究论文 | 研究探讨了骨髓细胞和感觉神经通过前列腺素E2介导腱周粘连形成的机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析结合条件性敲除小鼠模型，揭示了COX2在骨髓细胞和EP4基因在感觉神经中的作用，以及PGE2在腱修复中的复杂作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞RNA测序，可能无法完全反映人类临床情况 | 阐明前列腺素E2在腱周粘连形成和腱修复中的复杂作用 | 骨髓细胞、感觉神经、腱周粘连、腱修复 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠样本，以及八种条件性敲除小鼠 |
| 2040 | 2024-11-06 |
Hypoxic Upregulation of IER2 Increases Paracrine GMFG Signaling of Endoplasmic Reticulum Stress-CAF to Promote Chordoma Progression via Targeting ITGB1
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405421
PMID:39207055
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研究论文 | 研究揭示了缺氧环境下IER2上调通过靶向ITGB1促进脊索瘤进展的分子机制 | 首次阐明了缺氧微环境通过IER2上调促进脊索瘤进展的分子机制，并揭示了ERS-CAF通过IER2/GMFG/ITGB1轴调节SPP1巨噬细胞加剧脊索瘤进展 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 揭示脊索瘤中ERS-CAF亚群的致癌机制 | 脊索瘤中的ERS-CAF亚群及其在肿瘤进展中的作用 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、GeoMx数字空间分析仪、数据独立采集蛋白质组学、批量RNA测序、多重定量免疫荧光 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 多个脊索瘤样本 |