单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7858 篇文献，本页显示第 2001 - 2020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2001 | 2024-11-07 |
Novel mechanisms of intestinal flora regulation in high-altitude hypoxia
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38220
PMID:39498080
|
研究论文 | 研究探讨了在高海拔低氧环境下，厚壁菌门介导的巨噬细胞极化和糖酵解代谢重编程的分子机制 | 揭示了厚壁菌门通过抑制HIF-1α/糖酵解途径来缓解高海拔低氧引起的肠道黏膜屏障损伤 | NA | 探究高海拔低氧环境下肠道菌群调节的分子机制 | 厚壁菌门介导的巨噬细胞极化和糖酵解代谢重编程 | NA | NA | 单细胞转录组测序、蛋白质组分析、代谢组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA |
| 2002 | 2024-11-07 |
Deciphering STAT3's negative regulation of LHPP in ESCC progression through single-cell transcriptomics analysis
2024-Oct-28, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00962-0
PMID:39468431
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了STAT3对LHPP在食管鳞状细胞癌进展中的负调控作用 | 发现了STAT3对LHPP表达的显著调控作用，揭示了食管鳞状细胞癌发病机制的新方面 | NA | 阐明食管鳞状细胞癌中的细胞动力学和分子机制，特别是STAT3与LHPP的转录相互作用 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤和邻近正常组织细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 44,206个细胞样本，包括21名食管鳞状细胞癌患者的临床样本 |
| 2003 | 2024-11-07 |
Metabolic reprogramming landscape of pan-cancer by single-cell transcriptome data integration
2024-Oct-24, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.10.026
PMID:39500689
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2004 | 2024-11-07 |
CXCL9, CXCL10, and CCL19 synergistically recruit T lymphocytes to skin in lichen planus
2024-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179899
PMID:39190494
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和体外迁移实验，揭示了扁平苔藓中CXCL9、CXCL10和CCL19协同招募T淋巴细胞到皮肤的机制 | 首次发现扁平苔藓角质形成细胞和成纤维细胞特异性分泌CXCL9、CXCL10和CCL19，并证明这些细胞因子协同增强CD8+ T细胞的招募 | 研究样本量较小，仅涉及7名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨扁平苔藓的分子发病机制并寻找新的治疗靶点 | 扁平苔藓患者的皮肤和血液样本 | 免疫学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7名扁平苔藓患者及其健康对照者的皮肤和血液样本 |
| 2005 | 2024-11-07 |
Single-cell transcriptomics of pediatric Burkitt lymphoma reveals intra-tumor heterogeneity and markers of therapy resistance
2024-Oct-18, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02431-3
PMID:39424708
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析儿童伯基特淋巴瘤的肿瘤内异质性和治疗抵抗标志物 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了儿童伯基特淋巴瘤的肿瘤内异质性，并识别出与治疗抵抗相关的候选生物标志物 | 研究仅分析了EBV阴性的伯基特淋巴瘤样本，可能无法完全代表所有病例 | 探讨儿童伯基特淋巴瘤的异质性及治疗反应与非反应者的特征差异 | 儿童伯基特淋巴瘤患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个诊断时的EBV阴性伯基特淋巴瘤样本 |
| 2006 | 2024-11-07 |
Characterization of EpCAM-Positive and EpCAM-Negative Tumor Cells in Early-Stage Breast Cancer
2024-Oct-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252011109
PMID:39456890
|
研究论文 | 研究早期乳腺癌中EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞的特征 | 强调了EpCAM阴性CTC的存在，并评估了不同亚群中的干细胞标志物和EMT标志物 | 需要进一步研究以阐明EpCAM阴性和阳性CTC的预后意义 | 探讨早期乳腺癌中EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞的特征及其预后意义 | 早期乳腺癌中的EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 涉及早期乳腺癌患者的CTC和原发肿瘤样本 |
| 2007 | 2024-11-07 |
Microglia Signatures: A Cause or Consequence of Microglia-Related Brain Disorders?
2024-Oct-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010951
PMID:39456734
|
研究论文 | 本文探讨了小胶质细胞特征与相关脑部疾病之间的关系 | 利用单细胞RNA测序技术，详细研究了小胶质细胞在不同功能状态下的独特基因表达模式 | NA | 探讨小胶质细胞特征与神经退行性疾病和其他脑部疾病之间的关联 | 小胶质细胞的基因表达特征及其在不同病理条件下的变化 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2008 | 2024-11-07 |
Deubiquitinase USP18 inhibits hepatic stellate cells activation and alleviates liver fibrosis via regulation of TAK1 activity
2024-Oct-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114235
PMID:39236989
|
研究论文 | 研究揭示了去泛素化酶USP18通过调节TAK1活性抑制肝星状细胞活化和减轻肝纤维化的机制 | 首次揭示了USP18在肝星状细胞活化中的作用及其通过调节TAK1活性减轻肝纤维化的机制 | NA | 揭示肝星状细胞活化的分子机制，寻找抑制肝纤维化的有效靶点 | 肝星状细胞（HSCs）和去泛素化酶USP18 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠原代肝星状细胞和CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型 |
| 2009 | 2024-11-07 |
Profiling Long Noncoding RNA in Psoriatic Skin Using Single-Cell RNA Sequencing
2024-Sep-27, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.010
PMID:39342985
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了银屑病皮肤中长非编码RNA（lncRNA）的表达谱及其在表皮分化中的作用 | 首次在单细胞水平上详细分析了银屑病皮肤中lncRNA的表达谱及其细胞来源 | 研究样本仅限于6名银屑病患者，可能影响结果的普适性 | 探讨单细胞RNA测序技术在银屑病皮肤中lncRNA表达谱分析中的应用 | 银屑病患者的皮肤样本，包括未受累和受累的皮肤组织 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名银屑病患者的皮肤样本 |
| 2010 | 2024-11-07 |
Hematopoietic cells emerging from hemogenic endothelium exhibit lineage-specific oxidative stress responses
2024-Sep-24, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107815
PMID:39326495
|
研究论文 | 研究了人类胚胎发育过程中，缺氧条件对内皮细胞向造血细胞转变及其后续造血过程的影响 | 首次揭示了不同造血谱系细胞在缺氧条件下对氧化应激的特异性反应，并发现了影响血细胞发育的关键转录和代谢途径 | NA | 探讨缺氧条件对内皮细胞向造血细胞转变及其后续造血过程的影响 | 内皮细胞向造血细胞转变及其后续造血过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同造血谱系细胞 |
| 2011 | 2024-11-07 |
Multi-level multi-view network based on structural contrastive learning for scRNA-seq data clustering
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae562
PMID:39494609
|
研究论文 | 提出了一种基于结构一致性对比学习的scRNA-seq数据聚类方法 | 引入了多层次多视角网络和对比学习，以提高scRNA-seq数据聚类的准确性 | NA | 解决scRNA-seq数据高维度和复杂性带来的聚类挑战 | scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | 多层次多视角网络 | scRNA-seq数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 |
| 2012 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Shows that Circulating Monocytes Enriched in IFN Signaling Are Associated with Nontuberculous Mycobacteria Pulmonary Disease in Cystic Fibrosis
2024-Sep-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202312-2279LE
PMID:38889330
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2013 | 2024-11-07 |
Primate-specific BTN3A2 protects against SARS-CoV-2 infection by interacting with and reducing ACE2
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105281
PMID:39142074
|
研究论文 | 研究探讨了灵长类特异性蛋白BTN3A2通过与ACE2相互作用，减少ACE2表达，从而保护宿主细胞免受SARS-CoV-2感染的机制 | 首次揭示了BTN3A2在抑制SARS-CoV-2感染中的关键作用，并提出了通过模拟BTN3A2的单克隆抗体来开发COVID-19治疗新途径的可能性 | NA | 揭示SARS-CoV-2与宿主细胞相互作用的分子机制，为COVID-19的预防和治疗提供新思路 | BTN3A2在COVID-19中的作用及其与ACE2的相互作用 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、基因编辑、免疫沉淀、流式细胞术、生物层干涉测量、竞争性ELISA | NA | RNA | 基因编辑细胞系、转基因小鼠、COVID-19患者病理组织样本 |
| 2014 | 2024-11-07 |
Intra-patient spatial comparison of non-metastatic and metastatic lymph nodes reveals the reduction of CD169+ macrophages by metastatic breast cancers
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105271
PMID:39173531
|
研究论文 | 研究乳腺癌细胞对淋巴结中免疫细胞的影响，特别是CD169+巨噬细胞的减少 | 首次系统比较了非转移性和转移性淋巴结中CD169+巨噬细胞的数量，并发现转移性淋巴结中CD169+巨噬细胞显著减少 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者 | 探讨乳腺癌细胞对淋巴结中免疫细胞的影响机制 | 非转移性和转移性淋巴结中的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、成像质谱流式细胞术、组织学分析 | NA | 组织切片 | 6名乳腺癌患者的淋巴结样本，以及58名患者的474个组织切片 |
| 2015 | 2024-11-07 |
Unleashed monocytic engagement in Sézary syndrome during the combination of anti-CCR4 antibody with type I interferon
2024-05-28, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010043
PMID:38489234
|
研究论文 | 研究探讨了在Sézary综合征中，结合抗CCR4抗体和I型干扰素治疗如何激活单核细胞并消除恶性CD4+ T细胞 | 首次揭示了在Sézary综合征治疗中，结合I型干扰素和抗CCR4抗体可以激活单核细胞的吞噬作用，从而有效清除恶性CD4+ T细胞 | 研究主要集中在体外实验和临床试验，缺乏长期随访数据 | 探讨在Sézary综合征中，如何通过联合治疗策略有效清除恶性CD4+ T细胞 | Sézary综合征中的恶性CD4+ T细胞和单核细胞 | NA | 皮肤癌 | 单细胞转录组分析，高吞吐量T细胞受体测序 | NA | 转录组数据，T细胞受体序列 | 涉及Sézary综合征患者的样本 |
| 2016 | 2024-11-07 |
Deciphering the regulatory landscape of murine splenic response to anemic stress at single-cell resolution
2024-04-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011965
PMID:38315834
|
研究论文 | 研究了小鼠脾脏在贫血压力下的单细胞分辨率调控景观 | 发现了早期红系前体细胞在贫血压力下的显著出现，并识别出一种新的标记物CD81用于标记红细胞岛中的中心巨噬细胞 | NA | 探索贫血压力下红系前体细胞的分子机制 | 小鼠脾脏组织中的红系前体细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从接受苯肼和连续放血的小鼠中分离的脾脏组织样本 |
| 2017 | 2024-11-07 |
Modeling primitive and definitive erythropoiesis with induced pluripotent stem cells
2024-03-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011708
PMID:38290102
|
研究论文 | 本文利用诱导多能干细胞（iPSCs）模型研究了原始和确定性红细胞生成过程中的差异 | 首次通过iPSCs生成了同基因的原始和确定性红细胞，并进行了功能和转录组学比较 | NA | 研究原始和确定性红细胞生成的差异及其在遗传性血液疾病建模中的应用 | 诱导多能干细胞（iPSCs）生成的原始和确定性红细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从健康胎儿肝脏细胞生成的iPSCs及其衍生的红细胞 |
| 2018 | 2024-11-07 |
Gastrulation-stage gene expression in Nipbl+/- mouse embryos foreshadows the development of syndromic birth defects
2024-Mar-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4239
PMID:38507484
|
研究论文 | 研究了Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成阶段的基因表达，揭示了与Cornelia de Lange综合征相关的出生缺陷的早期迹象 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成和早期心脏新月阶段的基因表达变化，发现了与出生缺陷相关的基因表达失调和谱系分配错误 | NA | 探讨Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成阶段的基因表达变化及其与出生缺陷的关系 | Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成和早期心脏新月阶段的基因表达 | NA | 遗传性出生缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和Nipbl+/-小鼠胚胎 |
| 2019 | 2024-11-07 |
Expansion of memory Vδ2 T cells following SARS-CoV-2 vaccination revealed by temporal single-cell transcriptomics
2024-Mar-20, NPJ vaccines
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41541-024-00853-9
PMID:38509155
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研究论文 | 研究了mRNA SARS-CoV-2疫苗接种后Vδ2 T细胞的分子变化 | 揭示了第二次疫苗接种后Vδ2 T细胞的记忆特征，并通过体外实验验证了其效应功能 | NA | 探讨mRNA SARS-CoV-2疫苗接种后Vδ2 T细胞的免疫反应变化 | Vδ2 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序和γδ-TCR测序 | NA | RNA | 纵向研究中的多个时间点样本 |
| 2020 | 2024-11-07 |
A Foundation Model for Cell Segmentation
2024-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567630
PMID:38045277
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellSAM的细胞分割基础模型，该模型能够跨多种细胞成像数据进行泛化 | CellSAM基于Segment Anything Model (SAM)开发了一种提示工程方法用于掩码生成，并通过训练对象检测器CellFinder来自动检测细胞并提示SAM生成分割结果 | NA | 开发一种能够跨不同细胞成像领域泛化的细胞分割模型 | 细胞分割在多种成像数据中的应用 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | 基础模型 | 图像 | 涉及哺乳动物细胞（组织和细胞培养）、酵母和细菌的图像，跨越多种成像模式 |