单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 2001 - 2020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2001 | 2025-10-07 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to explore prognostic value and immune landscapes of methionine metabolism-related signature in breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1521269
PMID:39877420
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，探索了乳腺癌中甲硫氨酸代谢相关特征的预后价值和免疫景观 | 首次构建基于甲硫氨酸代谢相关基因的乳腺癌预后特征，并发现关键基因APOC1在调控巨噬细胞极化中的新功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索甲硫氨酸代谢在乳腺癌预后和免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者和乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, Cox回归, 体外实验 | 预后风险评分模型 | 转录组数据 | 基于TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2002 | 2025-10-07 |
Revisiting the female germline cell development
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1525729
PMID:39877734
|
综述 | 回顾雌性生殖细胞发育过程及其调控机制的最新研究进展 | 整合单细胞转录组/空间转录组学等先进技术揭示雌性生殖细胞发育的关键调控网络 | NA | 探索雌性生殖细胞发育的关键调控机制 | 开花植物的雌性生殖细胞系 | 植物发育生物学 | NA | 全标本单分子荧光原位杂交,激光辅助显微切割,染色质免疫沉淀测序,CRISPR基因编辑,单细胞转录组分析,空间转录组学 | NA | 转录组数据,表观遗传数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2003 | 2025-10-07 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
|
研究论文 | 开发了基于单细胞转录组学的精准医学计算流程PERCEPTION，用于预测患者对治疗的反应和耐药性 | 首次利用匹配的批量和单细胞表达谱构建治疗反应模型，在多个临床队列中优于现有预测方法 | NA | 开发精准医学工具以优化癌症患者的个性化治疗方案 | 癌症患者肿瘤单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤,乳腺癌,肺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算预测模型 | 单细胞转录组数据 | 多个临床队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2004 | 2025-10-07 |
Accurately deciphering spatial domains for spatially resolved transcriptomics with stCluster
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae329
PMID:38975895
|
研究论文 | 提出一种名为stCluster的新方法，通过整合图对比学习和多任务学习来改进空间转录组数据的表示学习，从而提高空间域识别准确性 | 首次将图对比学习与多任务学习相结合用于空间转录组数据分析，能够识别空间一致性模式并捕获基因表达与空间组织间的复杂关系 | 论文未明确说明方法的具体局限性 | 改进空间转录组数据中的空间域识别准确性 | 空间转录组数据中的空间域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图对比学习, 多任务学习 | 空间基因表达数据 | 多个数据集和平台，涵盖组织、器官和胚胎水平 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2005 | 2025-10-07 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals the alterations in epithelial cells during nodular formation in benign prostatic hyperplasia
2024-04-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05212-9
PMID:38654277
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了良性前列腺增生结节形成过程中上皮细胞的改变 | 首次发现BE5基底上皮细胞亚群在结节形成中的关键作用，并阐明其通过缺氧诱导的上皮-间质转化信号通路驱动BPH进展的机制 | 技术限制阻碍了对BPH患者的体内深入研究 | 探究良性前列腺增生结节形成的具体机制 | 良性前列腺增生患者的组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光染色,免疫组织化学染色 | RCTD(稳健细胞类型分解) | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,组织图像 | 未明确说明样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2006 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics dissects the transcriptome alterations of hematopoietic stem cells in myelodysplastic neoplasms
2024-04-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05165-z
PMID:38632656
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析骨髓增生异常肿瘤中造血干细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示MDS患者造血干细胞沿伪时间轴的转录组变化轨迹，并鉴定出PLCB1在白血病转化中的关键作用 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；体外实验结果需进一步体内验证 | 探索骨髓增生异常肿瘤中造血干细胞分化轨迹和白血病转化机制 | 骨髓增生异常肿瘤患者的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 骨髓增生异常肿瘤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | MDS患者造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2007 | 2025-10-07 |
A Systematic Overview of Single-Cell Transcriptomics Databases, their Use cases, and Limitations
2024-Apr-15, ArXiv
PMID:38699169
|
综述 | 系统评述单细胞转录组数据库的分类、应用场景与局限性 | 首次系统性地对大规模单细胞RNA测序数据库进行分类梳理，并提出通过用户友好型平台弥合计算科学与实验科学间的鸿沟 | 未涉及具体实验验证，主要聚焦数据库的宏观分析 | 评估单细胞转录组数据库的现状与发展方向 | 在线单细胞RNA测序数据库与存储库 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2008 | 2025-10-07 |
The integration of single-cell and bulk RNA-seq atlas reveals ERS-mediated acinar cell damage in acute pancreatitis
2024-04-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05156-0
PMID:38605381
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA-seq图谱揭示内质网应激介导的腺泡细胞损伤在急性胰腺炎中的作用机制 | 首次在单细胞水平描绘急性胰腺炎中腺泡细胞的转录组图谱，发现内质网应激和ERAD通路的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明急性胰腺炎的发病机制，特别是腺泡细胞的分子变化 | 急性胰腺炎小鼠的胰腺组织、急性胰腺炎患者的外周血样本 | 单细胞转录组学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因集富集分析, 伪时间分析, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 单细胞转录组数据, bulk RNA测序数据 | 多个单细胞测序数据集和bulk RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2009 | 2025-10-07 |
Analysis of brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke
2024-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01711-x
PMID:38177281
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析实验性中风后急性和亚急性期大脑与血液细胞的动态变化 | 首次系统揭示缺血性中风后不同时间点大脑和血液免疫细胞的转录组动态，预测巨噬细胞原位转分化和中性粒细胞的持续新招募过程 | 研究仅限于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明缺血性中风后大脑和血液免疫细胞的动态变化和多样性 | 实验性中风小鼠模型中的大脑和血液细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年雌雄小鼠的中风模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2010 | 2025-10-07 |
Gene regulatory patterning codes in early cell fate specification of the C. elegans embryo
2024-Jan-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87099
PMID:38284404
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了秀丽隐杆线虫胚胎早期细胞命运特化过程中的基因调控模式 | 首次系统分析了早期至晚期原肠胚形成阶段(28-102细胞期)的转录组，识别了119种胚胎细胞状态，发现了基于亚细胞谱系的模块化基因表达程序 | 研究聚焦于特定发育阶段(1-102细胞期)，可能未完全覆盖更晚期的发育事件 | 探索缺乏合胞体物种中细胞命运特化的基因调控机制 | 秀丽隐杆线虫胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1-102细胞阶段的胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2011 | 2025-10-07 |
Biomarker discovery in acetaminophen hepatotoxicity: leveraging single-cell transcriptomics and mechanistic insight
2024 Jan-Jun, Expert review of clinical pharmacology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/17512433.2024.2306219
PMID:38217408
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综述 | 本文探讨了对乙酰氨基酚肝毒性中生物标志物的发现，重点关注单细胞转录组学方法和机制研究 | 整合小鼠模型机制研究与人类对乙酰氨基酚过量病理生理学，利用单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术发现新型生物标志物 | 所有已发现的生物标志物仍需进一步验证，需要更大规模的队列研究来确认其临床实用性 | 识别对乙酰氨基酚诱导急性肝衰竭的预后生物标志物，以确定需要肝移植的患者 | 对乙酰氨基酚肝毒性机制、生物标志物发现 | 数字病理学 | 肝毒性、急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学方法 | NA | 转录组数据、分子表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2012 | 2025-10-07 |
DDO1002, an NRF2-KEAP1 inhibitor, improves hematopoietic stem cell aging and stress response
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae043
PMID:39872153
|
研究论文 | 本研究探讨NRF2-KEAP1抑制剂DDO1002在改善造血干细胞衰老和应激反应中的作用 | 首次揭示DDO1002通过激活NRF2-ARE通路改善衰老造血干细胞功能并缓解辐射诱导的造血损伤 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果仍需验证 | 探究DDO1002对造血干细胞衰老和辐射损伤的保护作用 | 造血干细胞(HSCs)，特别是衰老小鼠的造血干细胞 | 干细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞测序，竞争性移植实验 | NA | 基因表达数据，细胞功能数据 | 衰老小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2013 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intercellular crosstalk and the regulatory landscape of stromal cells during the whole life of the mouse ovary
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae041
PMID:39872151
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠卵巢整个生命周期中基质细胞的细胞间通讯和调控景观 | 首次整合从胚胎期到老年期的单细胞RNA测序数据，系统描绘卵巢基质细胞的发育轨迹和细胞间通讯网络，并鉴定出CD24阳性间充质祖细胞作为基质细胞起源 | 研究主要基于小鼠模型，人类卵巢中的情况可能需要进一步验证 | 探索卵巢基质细胞的异质性、发育轨迹和细胞间通讯网络 | 小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 卵巢衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从胚胎11.5天到12月龄小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2014 | 2025-10-07 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了GPR35在MASLD中调控肝脏分区特异性脂质代谢的机制 | 首次结合空间转录组学、空间代谢组学和脂质代谢组学，在肝脏分区水平上系统解析GPR35调控MASLD进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足；机制研究仍需进一步功能实验证实 | 阐明GPR35在代谢功能障碍相关脂肪肝病中调控肝脏分区特异性基因表达和代谢物分布的机制 | 小鼠肝脏组织，重点关注GPR35缺陷模型在MASLD进展中的变化 | 空间多组学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 空间转录组学，空间代谢组学，脂质代谢组学 | NA | 空间基因表达数据，空间代谢物分布数据 | GPR35缺陷小鼠模型 | NA | 空间转录组学，空间代谢组学 | NA | NA |
| 2015 | 2025-10-07 |
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae028
PMID:39872443
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组和染色质可及性分析揭示卵巢体细胞的进化特征 | 首次在人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子五个物种中整合分析单细胞转录组和染色质可及性数据，揭示卵巢细胞进化规律 | 研究仅针对成年卵巢，未涵盖发育过程；物种数量有限 | 探究不同物种间卵巢体细胞分子机制的保守性与差异性 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢体细胞 | 单细胞多组学 | 卵巢生理与疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 五个物种的卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2016 | 2025-10-07 |
Comparative dissection of transcriptional landscapes of human iPSC-NK differentiation and NK cell development
2024-Aug, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae032
PMID:39872864
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研究论文 | 通过比较分析人类iPSC-NK细胞分化与NK细胞发育的转录景观，识别诱导分化过程中的关键缺失因子 | 首次对胎儿肝脏NK细胞和iPSC-NK细胞进行关键分化阶段的比较性单细胞转录组分析，并创建具有NK细胞和巨噬细胞双重特征的STAT5A-iPSC新细胞系 | 未明确说明样本数量和实验重复次数，STAT5A-iPSC新细胞系的功能验证需要进一步临床前研究 | 解析iPSC-NK细胞分化机制以改进治疗性iNK细胞的生产和工程化 | 人类iPSC-NK细胞和胎儿肝脏NK细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2017 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility and its application on tumor investigation
2024-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae015
PMID:39872661
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综述 | 总结单细胞转录组和染色质可及性测序方法的最新进展，及其在肿瘤研究中的整合应用 | 整合单细胞转录组和表观遗传测序数据的生物信息学策略，深化对肿瘤发生发展的理解 | 未提及具体实验样本量和数据验证结果 | 探讨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用与整合策略 | 单细胞转录组和染色质可及性测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2018 | 2025-10-07 |
Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.03.601990
PMID:39005270
|
研究论文 | 通过构建人鼠嵌合脑模型研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用机制 | 开发了同时移植人类诱导多能干细胞来源的神经祖细胞和原始巨噬细胞祖细胞的新型共移植模型，首次在体内观察到人类小胶质细胞修剪人类神经元突触并吞噬神经元的现象 | 使用小鼠作为宿主环境可能无法完全模拟人类大脑的复杂微环境 | 研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用及其在神经系统疾病中的作用 | 人鼠嵌合脑模型中的人类神经细胞（神经元、小胶质细胞、大胶质细胞） | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序，超分辨率成像，3D重建技术，细胞间通讯分析 | 人鼠嵌合脑模型 | 基因表达数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2019 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing algorithms underestimate changes in transcriptional noise compared to single-molecule RNA imaging
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100933
PMID:39662473
|
研究论文 | 比较单细胞RNA测序算法与单分子RNA成像在转录噪声量化方面的差异 | 首次系统比较多种scRNA-seq算法与smFISH在量化转录噪声变化方面的性能差异 | 所有scRNA-seq算法均系统性低估噪声变化，且仅测试了代表性基因面板 | 评估基因组范围内转录噪声的最佳量化方法 | 人类和小鼠数据集中的基因表达噪声 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子RNA荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, smFISH | NA | NA |
| 2020 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes
2024-Dec, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003
PMID:39426602
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示生殖器疱疹患者免疫细胞多样性和系统性免疫反应特征 | 首次在单细胞水平系统分析生殖器疱疹患者外周血免疫细胞的转录组特征，发现特定免疫细胞亚群的激活状态和关键信号通路变化 | 样本量相对有限，主要关注外周血免疫细胞而未直接研究局部感染部位的免疫反应 | 探究HSV-2感染和复发过程中免疫系统的应答机制 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |