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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1981 | 2024-08-07 |
Prediction of cell-cell communication patterns of dorsal root ganglion cells: single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.384067
PMID:37905887
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1982 | 2025-10-07 |
Androgen deprivation induces double-null prostate cancer via aberrant nuclear export and ribosomal biogenesis through HGF and Wnt activation
2024-Feb-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45489-4
PMID:38336745
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研究论文 | 研究揭示雄激素剥夺疗法通过异常HGF和Wnt信号激活诱导双阴性前列腺癌的机制 | 首次发现当前ADT通过异常HGF/MET信号激活进一步升高Wnt/β-catenin信号,并鉴定XPO1和核糖体蛋白在DNPC中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本,需要更大规模临床验证 | 探索雄激素剥夺疗法诱导双阴性前列腺癌的分子机制 | 前列腺癌细胞、小鼠前列腺组织、人类DNPC临床样本 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类临床DNPC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1983 | 2025-10-07 |
Gpnmb and Spp1 mark a conserved macrophage injury response masking fibrosis-specific programming in the lung
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182700
PMID:39509324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肺损伤后巨噬细胞亚群,揭示了Gpnmb和Spp1标记的巨噬细胞是组织损伤的保守反应而非纤维化特异性程序 | 首次发现巨噬细胞亚群聚类主要由细胞起源和组织分区驱动而非损伤模型,并鉴定出Gpnmb表达巨噬细胞作为组织损伤的保守反应标志 | 研究仅基于小鼠模型和已有的人类数据集,需要进一步实验验证机制 | 探究肺损伤后不同巨噬细胞亚群在健康修复和纤维化修复中的不同作用机制 | 小鼠肺巨噬细胞和人类肺疾病数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS或博来霉素处理的小鼠肺巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1984 | 2025-10-07 |
Predicting lung aging using scRNA-Seq data
2024-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012632
PMID:39700255
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据的年龄预测回归模型PolyEN | 提出了PolyEN模型,能够学习基因表达随时间的连续表示,并整合基因信息进行年龄预测 | NA | 基于单细胞RNA测序数据预测肺衰老 | 肺上皮细胞和肺内皮细胞 | 机器学习 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1985 | 2025-10-07 |
Metastasis of colon cancer requires Dickkopf-2 to generate cancer cells with Paneth cell properties
2024-Nov-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97279
PMID:39535280
|
研究论文 | 本研究揭示了Dickkopf-2(DKK2)通过调控HNF4A蛋白水平促进结肠癌转移过程中潘氏细胞特性癌细胞生成的新机制 | 首次发现DKK2在结肠癌转移中通过下调HNF4A蛋白水平诱导潘氏细胞特性癌细胞生成 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究结肠癌转移过程中潘氏细胞特性癌细胞生成的分子机制 | 结肠癌细胞、小鼠模型、患者转移样本 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 染色质可及性分析, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | C57BL/6小鼠模型和患者转移样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1986 | 2025-10-07 |
Single-cell, spatial, and fate-mapping analyses uncover niche dependent diversity of cochlear myeloid cells
2024-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.30.621184
PMID:39554030
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、命运图谱和联体共生实验揭示了小鼠耳蜗中五种髓系细胞亚群的多样性特征 | 首次系统揭示了耳蜗微环境中组织驻留巨噬细胞在基因表达、空间分布、发育起源和功能方面的独特异质性 | 研究主要聚焦小鼠模型,人类耳蜗巨噬细胞的特征仍需进一步验证 | 探索耳蜗髓系细胞的多样性及其与微环境的关系 | 小鼠耳蜗组织中的髓系细胞 | 单细胞生物学 | 听力相关疾病 | 单细胞转录组测序, 命运图谱分析, 联体共生实验 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | 小鼠耳蜗组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1987 | 2025-10-07 |
SDePER: a hybrid machine learning and regression method for cell-type deconvolution of spatial barcoding-based transcriptomic data
2024-Oct-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03416-2
PMID:39402626
|
研究论文 | 开发了一种结合机器学习和回归的混合方法SDePER,用于空间条形码转录组数据的细胞类型解卷积 | 提出混合机器学习和回归方法,解决ST与scRNA-seq数据间的平台效应,同时处理稀疏性和空间相关性 | NA | 开发空间转录组数据细胞类型解卷积方法 | 空间条形码转录组数据和参考单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 混合机器学习与回归模型 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 模拟数据和四个真实数据集 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1988 | 2025-10-07 |
Teplizumab induces persistent changes in the antigen-specific repertoire in individuals at risk for type 1 diabetes
2024-Aug-13, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177492
PMID:39137044
|
研究论文 | 研究Teplizumab治疗对1型糖尿病高危人群抗原特异性T细胞库的长期影响 | 首次揭示Teplizumab通过激活后耗竭和调节机制促进操作耐受性,并阻止自身反应性T细胞扩增的长期作用机制 | 研究样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探索Teplizumab在1型糖尿病高危人群中的长期免疫调节机制 | 1型糖尿病高危人群的外周血CD8+ T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究参与者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1989 | 2025-10-07 |
CTHRC1+ fibroblasts and SPP1+ macrophages synergistically contribute to pro-tumorigenic tumor microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68109-z
PMID:39075108
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了胰腺导管腺癌中CTHRC1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞的协同促癌作用 | 首次发现SPP1+巨噬细胞与CTHRC1+肌成纤维细胞在空间上共定位并协同促进免疫抑制性肿瘤微环境 | NA | 探索胰腺导管腺癌肿瘤微环境中细胞群体间的相互作用机制 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤微环境细胞群体 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1990 | 2025-10-07 |
Intestinal strictures in Crohn's disease: An update from 2023
2024-07, United European gastroenterology journal
IF:5.8Q1
DOI:10.1002/ueg2.12568
PMID:38546434
|
综述 | 本文对2023年克罗恩病肠道狭窄领域的最新研究进展进行了全面回顾 | 整合了单细胞测序等新技术在肠道狭窄研究中的应用,提供了对肠道纤维化狭窄的精准理解 | NA | 回顾克罗恩病肠道狭窄的研究进展,为研究人员和临床医生提供前沿信息 | 克罗恩病患者的肠道狭窄病变 | NA | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1991 | 2025-10-07 |
Intrinsic GATA4 expression sensitizes the aortic root to dilation in a Loeys-Dietz syndrome mouse model
2024-Dec, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00562-5
PMID:39567770
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析Loeys-Dietz综合征小鼠模型中血管平滑肌细胞的异质性,揭示GATA4表达如何增加主动脉根部对扩张的敏感性 | 首次发现表达GATA4的血管平滑肌细胞亚群在主动脉根部固有存在,并证明其具有低分化和促炎特征,且GATA4缺失可减轻主动脉根部扩张 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自现有单细胞RNA测序数据集验证 | 探究Loeys-Dietz综合征中主动脉根部特别易发生动脉瘤的分子机制 | Tgfbr1 LDS小鼠模型的主动脉血管平滑肌细胞 | 单细胞转录组学 | Loeys-Dietz综合征 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | LDS小鼠模型主动脉组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1992 | 2025-10-07 |
Zika virus exists in enterocytes and enteroendocrine cells of the Aedes aegypti midgut
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110353
PMID:39055935
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究寨卡病毒在埃及伊蚊中肠细胞中的分布和感染机制 | 首次在单细胞水平揭示寨卡病毒主要感染特定肠上皮细胞和肠内分泌细胞亚群,并发现载脂蛋白III在病毒感染中的关键作用 | 研究仅聚焦于中肠组织,未涉及其他可能受感染的蚊虫组织器官 | 阐明寨卡病毒在蚊媒中肠的细胞特异性感染机制 | 埃及伊蚊中肠细胞 | 单细胞生物学 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 寨卡病毒感染后的12个中肠细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1993 | 2025-10-07 |
nf-core/airrflow: An adaptive immune receptor repertoire analysis workflow employing the Immcantation framework
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012265
PMID:39058741
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研究论文 | 开发了一个名为nf-core/airrflow的适应性免疫受体库分析工作流程,用于处理AIRR-seq数据 | 整合了Immcantation框架,提供端到端的批量和单细胞AIRR-seq数据处理,解决了现有工具在并行化、可扩展性和高性能计算适应性方面的限制 | NA | 开发一个高效、可扩展的适应性免疫受体库测序数据分析工作流程 | B细胞和T细胞受体序列 | 生物信息学 | 传染病(COVID-19) | AIRR-seq(适应性免疫受体库测序) | NA | 测序数据 | 196个样本(97名COVID-19感染者和99名健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1994 | 2025-10-07 |
Dupilumab-associated head and neck dermatitis shows a pronounced type 22 immune signature mediated by oligoclonally expanded T cells
2024-Apr-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46540-0
PMID:38565563
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析dupilumab相关头颈部皮炎,揭示其独特的22型免疫特征 | 首次发现dupilumab治疗伴随T细胞寡克隆扩增驱动的22型免疫反应过度激活 | 样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 探究dupilumab相关头颈部皮炎的发生机制 | dupilumab相关头颈部皮炎患者皮肤活检组织 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自DAHND、未治疗AD和健康对照的皮肤穿刺活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1995 | 2025-10-07 |
Activation of TLR9 signaling suppresses the immunomodulating functions of CD55lo fibroblastic reticular cells during bacterial peritonitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1337384
PMID:38827745
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研究论文 | 本研究揭示TLR9信号通过抑制CD55lo成纤维网状细胞的免疫功能调控细菌性腹膜炎的免疫反应 | 首次发现CD55lo和CD55hi两种FRC亚群,并证明TLR9特异性抑制CD55lo亚群的免疫功能 | 未阐明TLR9信号通路在CD55lo FRC中的具体分子机制 | 探究TLR9信号在不同FRC亚群中的调控作用及其在细菌性腹膜炎中的免疫功能 | 小鼠和人类脂肪组织来源的成纤维网状细胞 | 免疫学 | 细菌性腹膜炎 | 单细胞RNA测序,过继转移实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1996 | 2025-10-07 |
Loss of cell junctional components and matrix alterations drive cell desquamation and fibrotic changes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.17.599411
PMID:38948715
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析,揭示了特发性肺纤维化中上皮细胞脱落与细胞连接成分丢失及基底膜基质失调的关联机制 | 首次在IPF中发现上皮细胞脱落现象,并通过空间多组学技术揭示了细胞连接成分下调与基质失调导致上皮脱落的分子机制 | 研究样本量有限,主要关注远端细支气管,未全面评估其他肺区域的变化 | 探究特发性肺纤维化中远端细支气管上皮细胞脱落的分子机制 | 特发性肺纤维化患者和无肺病史患者的远端细支气管上皮细胞及基底膜 | 空间生物学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 功能实验 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | IPF患者和无肺病史患者(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1997 | 2025-10-07 |
Molecular Profiling Defines Three Subtypes of Synovial Sarcoma
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404510
PMID:39257029
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研究论文 | 通过分子特征分析将滑膜肉瘤分为三种亚型 | 首次通过转录组分析将滑膜肉瘤分为三个分子亚型,并发现高风险亚型患者比例高于既往认知 | 样本量相对有限(91个肿瘤来自55例患者) | 阐明驱动滑膜肉瘤表型多样性的基因组事件 | 滑膜肉瘤患者肿瘤组织 | 癌症基因组学 | 滑膜肉瘤 | RNA测序,靶向DNA测序,蛋白质组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | 91个肿瘤样本来自55例患者 | NA | RNA测序,靶向DNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1998 | 2025-10-07 |
Human inherited PD-L1 deficiency is clinically and immunologically less severe than PD-1 deficiency
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231704
PMID:38634869
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研究论文 | 比较遗传性PD-L1缺陷与PD-1缺陷在临床和免疫学表现上的差异 | 首次发现人类遗传性PD-L1缺陷的临床表现比PD-1缺陷更轻微 | 仅研究两个家系病例,样本量有限 | 探究PD-1/PD-L1通路在自身免疫疾病中的作用机制 | 遗传性PD-L1缺陷的兄弟姐妹患者 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫表型分析 | NA | 基因测序数据, 转录组数据, 免疫表型数据 | 2例PD-L1缺陷患者,与先前报道的2例PD-1缺陷患者对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1999 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of the human parasite Schistosoma mansoni first intra-molluscan stage reveals tentative tegumental and stem-cell regulators
2024-03-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-55790-3
PMID:38472267
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术研究曼氏血吸虫在螺蛳宿主内发育早期的细胞类型和分子调控机制 | 首次对曼氏血吸虫母胞蚴阶段进行单细胞转录组分析,识别了六个细胞簇并预测了关键转录因子 | 研究聚焦于早期发育阶段,对后续发育阶段的分子机制了解仍然有限 | 阐明曼氏血吸虫在中间宿主螺蛳体内发育的细胞和分子机制 | 曼氏血吸虫母胞蚴阶段的单细胞 | 单细胞生物学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 曼氏血吸虫母胞蚴单细胞悬液 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的10x Genomics Chromium平台 |
| 2000 | 2025-10-07 |
From local to global gene co-expression estimation using single-cell RNA-seq data
2024-Jan-29, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujae001
PMID:38465983
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA-seq数据的基因共表达估计方法,从局部到全局分析基因关系 | 提出细胞特异性基因网络概念和平均局部密度差(aLDG)这一新的单变量依赖度量,能够检测非线性、非单调关系 | NA | 开发能够捕捉局部基因依赖关系的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数估计器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |