单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-05 |
Reproducible single cell annotation of programs underlying T-cell subsets, activation states, and functions
2024-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.03.592310
PMID:38746317
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研究论文 | 开发了T细胞注释工具TCAT，用于在单细胞水平量化T细胞的基因表达程序 | 提出了TCAT分析框架，能够同时量化预定义的基因表达程序，揭示了46个可重复的T细胞功能程序 | NA | 改进T细胞特征分析框架，解决传统分类与单细胞数据连续状态不匹配的问题 | T细胞亚群、激活状态和功能 | 单细胞分析 | COVID-19, 癌症 | 单细胞RNA测序 | TCAT分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 170万个T细胞，来自700名个体的38种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2024-08-07 |
Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis
2024-01-16, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01296-0
PMID:38225514
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-11-22 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2024-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00308-w
PMID:39567832
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2025-10-05 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111250
PMID:39569377
|
研究论文 | 本研究建立了视网膜单细胞RNA测序的样本多重标记方法，用于分析小鼠视网膜神经节细胞 | 使用胆固醇修饰寡核苷酸进行样本多重标记，能够同时解析样本来源和表型数据 | 研究聚焦于小鼠视网膜神经节细胞，方法在其他细胞类型中的适用性需要进一步验证 | 开发单细胞RNA测序样本多重标记方法以提高稀有细胞群体分析的效率 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微流控单细胞RNA测序平台 |
| 185 | 2025-10-05 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.12.618004
PMID:39416197
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了脂肪组织巨噬细胞在衰老过程中的多样性变化，发现神经相关巨噬细胞控制脂肪稳态并抑制年龄相关炎症 | 首次使用血管内标记排除循环髓系细胞，结合单细胞测序和正交验证，定义了寿命周期内驻留脂肪组织巨噬细胞的多样性变化，并发现CD169+神经相关巨噬细胞的新功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类脂肪组织巨噬细胞的变化模式可能有所不同 | 探究脂肪组织巨噬细胞如何控制年龄相关炎症和脂肪稳态 | 小鼠内脏白色脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 年龄相关疾病 | 单细胞测序，血管内标记，正交验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-05 |
Endothelial-adipocyte Cx43 Mediated Gap Junctions Can Regulate Adiposity
2024-Sep-10, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqae029
PMID:38984993
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞与脂肪细胞间Cx43介导的间隙连接在调节肥胖中的作用机制 | 首次发现内皮细胞特异性Cx43缺失会导致肥胖和血脂异常，而Cx43S368A突变小鼠能抵抗高脂饮食诱导的肥胖 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 研究脂肪毛细血管内皮细胞与脂肪细胞相互作用的机制及其对代谢功能的影响 | 小鼠和人类的内皮细胞与脂肪细胞 | 细胞生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序, 透射电子显微镜, 体外共培养系统 | NA | 基因表达数据, 显微镜图像 | 高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-05 |
Vascular heterogeneity of tight junction Claudins guides organotropic metastasis
2024-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00813-1
PMID:39289595
|
研究论文 | 本研究揭示了器官特异性血管异质性通过调控紧密连接蛋白Claudins的表达决定乳腺癌器官倾向性转移的机制 | 首次阐明血管内皮细胞特异性Claudins蛋白表达差异是决定器官特异性转移的关键因素，独立于癌细胞内在机制 | 研究主要聚焦于肺和肾脏转移的对比，其他器官转移机制尚未完全探索 | 探究乳腺癌器官特异性转移的机制 | 转移性乳腺 carcinoma 模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2025-10-05 |
Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium
2024-Feb-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序技术探究肥胖饮食对动脉和毛细血管内皮细胞线粒体基因表达的影响 | 首次揭示肥胖饮食导致脂肪和肠系膜内皮细胞表型趋同的机制，发现PPAR-γ在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 探究肥胖对内皮细胞代谢表型，特别是线粒体基因表达的影响 | 小鼠和人类脂肪组织及肠系膜的内皮细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖相关代谢疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞，人类内脏脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2025-10-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
|
研究论文 | 本文介绍了从狼疮易感小鼠中分离调节性B细胞并进行单细胞转录组分析的方法 | 首次在狼疮易感MRL/lpr小鼠模型中建立调节性B细胞的分离方案并应用于单细胞RNA测序分析 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 深入理解调节性B细胞在健康和疾病状态下的生物学特性 | 狼疮易感MRL/lpr小鼠的调节性B细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-05 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
|
综述 | 本文探讨单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用现状及其与传统方法的权衡 | 首次系统评述scRNA-seq在斑马鱼生殖毒理学领域的创新应用潜力，强调其在识别稀有细胞亚型和细胞特异性表达谱方面的独特优势 | 该技术在当前领域仍属未充分开发利用状态，且与传统方法存在技术权衡需要考量 | 探索单细胞RNA测序技术在生殖毒理学研究中的应用前景与方法学比较 | 斑马鱼性腺组织及其在毒物暴露下的细胞反应 | 单细胞组学 | 生殖毒理学 | 单细胞RNA测序, 下一代测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-05 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.10.588953
PMID:38645099
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研究论文 | 本研究通过基因组编辑技术揭示了人类特异性增强子HAR对大脑皮层发育的调控机制 | 首次证明人类特异性增强子HAR通过调控WNT信号通路精细调节神经前体细胞的增殖和神经发生能力 | 研究主要依赖动物模型和类器官，与真实人类大脑发育环境存在差异 | 探索人类特异性基因组区域HAR在皮层发育中的功能作用 | 基因组编辑小鼠、灵长类模型、人类和黑猩猩神经前体细胞及皮层类器官 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑、单细胞RNA测序、活体成像、谱系分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、成像数据 | 多种基因编辑动物模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-05 |
Intestinal epithelial adaptations to vertical sleeve gastrectomy defined at single-cell resolution
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110805
PMID:38309446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了垂直袖状胃切除术对小鼠小肠上皮细胞的特异性影响 | 首次在单细胞分辨率下系统定义VSG对肠道上皮不同细胞谱系的特异性分子适应机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 阐明垂直袖状胃切除术诱导肠道适应性的细胞分子机制 | 小鼠小肠上皮细胞 | 单细胞组学 | 肥胖和糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 验证的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 193 | 2025-10-05 |
Multi-condition and multi-modal temporal profile inference during mouse embryonic development
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.03.583179
PMID:38496477
|
研究论文 | 提出Sunbear联合建模框架，用于整合多条件和多模态的单细胞时间序列数据 | 开发能够整合多条件和多模态单细胞时间序列数据的联合建模框架，实现单细胞时间谱变化插补、多数据集多模态谱对齐以及缺失模态的外推预测 | 基于破坏性单细胞测量技术，无法捕获特定细胞的完整时间轨迹 | 开发单细胞多条件多模态时间序列数据的整合分析方法 | 小鼠胚胎发育过程中的单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 联合建模框架 | 单细胞时间序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-10-05 |
Cellular and transcriptional profiles of peripheral blood mononuclear cells pre-vaccination predict immune response to preventative MUC1 vaccine
2024-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.598031
PMID:38948837
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析疫苗接种前外周血单核细胞，预测MUC1预防性疫苗的免疫反应 | 首次在癌前病变人群中研究非病毒癌症疫苗，并通过单细胞分析发现免疫应答者的特定细胞类型和基因特征 | 样本量较小（16名应答者和16名无应答者），需要在更大规模研究中验证 | 评估MUC1肿瘤抗原疫苗的安全性和免疫原性，并寻找预测疫苗反应的生物标志物 | 有晚期结肠腺瘤病史的个体 | 单细胞测序分析 | 结肠腺瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯网络分析，差异基因表达分析 | 单细胞转录组数据 | 32名参与者（16名免疫应答者和16名无应答者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-05 |
A human stomach cell type transcriptome atlas
2024-02-14, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01812-5
PMID:38355543
|
研究论文 | 通过整合相关性分析方法构建人类胃部细胞类型转录组图谱 | 首次利用未分级的胃部RNAseq数据预测胃部细胞类型转录组特征，填补了主要单细胞测序图谱中胃部细胞类型基因富集谱的空白 | 基于相关性分析的预测方法而非直接单细胞测序，可能无法完全捕获细胞异质性 | 建立人类胃部细胞类型特异性基因表达图谱 | 人类胃部细胞（壁细胞、主细胞、胃黏液细胞、胃肠内分泌细胞等11种细胞类型） | 单细胞生物学 | 胃癌 | RNA-seq，整合相关性分析 | 相关性分析模型 | RNA测序数据 | 359名个体的未分级胃部RNAseq数据 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2025-10-05 |
A single-cell and spatial RNA-seq database for Alzheimer's disease (ssREAD)
2024-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49133-z
PMID:38844475
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研究论文 | 介绍了一个专门用于阿尔茨海默病的单细胞和空间RNA-seq数据库ssREAD | 提供了更广泛的AD相关数据集、优化的分析流程和改善的可用性，整合了大量单细胞和空间转录组数据 | NA | 解决阿尔茨海默病研究中单细胞和空间转录组数据缺乏综合性用户友好存储库的问题 | 阿尔茨海默病患者和模型动物的脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | 1,053个样本（277个整合数据集）包含7,332,202个细胞，以及381个空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-05 |
Construction of thyroid cancer classification and iodine metabolism related diagnostic model using thyroid differentiation score and bioinformation
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039464
PMID:39252309
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研究论文 | 构建基于甲状腺分化评分和生物信息学的甲状腺癌分类及碘代谢相关诊断模型 | 首次结合甲状腺分化评分与碘代谢特征构建甲状腺癌诊断模型，识别出5个独立预测基因 | 模型验证主要依赖公共数据库数据，需要进一步临床前瞻性研究验证 | 开发甲状腺癌亚型分类诊断模型以提高诊疗准确性 | 甲状腺癌患者基因表达数据和临床病理信息 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 逻辑回归模型, 机器学习模型 | 基因表达谱, 临床数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的甲状腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2025-10-05 |
CD8+ T-cell differentiation and dysfunction inform treatment response in acute myeloid leukemia
2024-09-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021680
PMID:38776511
|
研究论文 | 本研究通过多模态方法揭示了CD8+ T细胞分化状态与急性髓系白血病治疗反应的关系 | 发现早期记忆CD8+ T细胞分化为两个不同的终末状态，并揭示CD8+衰老细胞偏向分化是治疗抵抗的标志 | NA | 探究CD8+ T细胞分化状态、功能障碍与AML治疗反应的关联机制 | 急性髓系白血病患者的CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 高维流式细胞术, 单细胞转录组学 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-10-05 |
From womb to wellness: early environmental exposures, cord blood DNA methylation and disease origins
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2390823
PMID:39263926
|
综述 | 探讨胎儿环境暴露通过脐带血DNA甲基化影响疾病起源的机制与研究方向 | 系统阐述脐带血DNA甲基化作为胎儿表观遗传窗口的重要性，并提出单细胞测序等新技术应用前景 | 存在组织特异性问题、现有甲基化芯片覆盖度有限、细胞组成变异等混杂因素 | 阐明早期环境暴露与表观基因组相互作用机制，开发预防策略 | 脐带血DNA甲基化与胎儿环境暴露 | 表观遗传学 | 发育源性疾病 | DNA甲基化分析，单细胞测序 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-10-05 |
Epitranscriptomic regulation of cardiac fibrosis via YTHDF1-dependent PIEZO2 mRNA m6A modification
2024-12-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae239
PMID:39498803
|
研究论文 | 本研究揭示了YTHDF1通过m6A修饰调控PIEZO2表达的转录后机制在心脏纤维化中的作用 | 首次发现YTHDF1通过识别PIEZO2 mRNA的m6A修饰位点peak_26355调控其翻译，并影响心脏成纤维细胞自噬和纤维化的新表观转录组机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究机械敏感性离子通道Piezo家族在心脏纤维化中的分子机制 | 小鼠心脏成纤维细胞和实验性心脏纤维化模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA-seq，单细胞测序，组织学分析，生化分析 | NA | 基因表达数据，组织学图像，生化数据 | 实验小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |