单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1388 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-01-05 |
Single-cell and spatiotemporal transcriptomic profiling of brain immune infiltration following Venezuelan equine encephalitis virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1497839
PMID:39749347
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在小鼠模型中全面分析了Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV)感染后脑部免疫细胞的转录组特征 | 揭示了VEEV感染后脑部免疫细胞的不同亚群及其独特的转录特征，包括一种表达I型干扰素的小胶质细胞亚群，以及髓系细胞和细胞毒性淋巴细胞的顺序浸润 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 阐明VEEV感染后脑部免疫反应的机制，特别是特定免疫细胞亚群的作用 | VEEV感染后的小鼠脑部免疫细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 162 | 2025-01-03 |
A cost-effective protocol for single-cell RNA sequencing of human skin
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1393017
PMID:39539550
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研究论文 | 本文介绍了一种成本效益高的人类皮肤单细胞RNA测序（scRNAseq）和流式细胞术分析的新协议 | 提出了一种无标签样本多重化策略，结合souporcell算法，实现了配对血液和皮肤样本的scRNAseq分析，并提供了同时进行流式细胞术分析的详细步骤 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种成本效益高的方法，使更多研究者能够进行皮肤样本的scRNAseq和流式细胞术分析 | 人类皮肤样本 | 单细胞RNA测序 | NA | scRNAseq, 流式细胞术 | souporcell算法 | RNA序列数据, 流式细胞术数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 163 | 2024-12-29 |
The combined use of scRNA-seq and network propagation highlights key features of pan-cancer Tumor-Infiltrating T cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0315980
PMID:39729479
|
研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序和网络传播技术，揭示了泛癌肿瘤浸润T细胞的关键特征 | 结合单细胞RNA测序和网络传播技术，克服了单细胞转录组学中的噪声和稀疏性问题，并揭示了TI-Treg和Tex的发育、功能及其免疫代谢特异性 | NA | 提高免疫肿瘤学中药物选择性和有效性的未来治疗发展 | 肿瘤浸润调节性T细胞（TI-Tregs）和耗竭T细胞（Tex） | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 164 | 2024-12-29 |
[Neuronal models based on olfactory epithelial cells in the study of the pathogenesis of mental disorders]
2024, Zhurnal nevrologii i psikhiatrii imeni S.S. Korsakova
DOI:10.17116/jnevro202412412120
PMID:39731365
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综述 | 本文综述了基于嗅觉上皮细胞的神经元模型在研究精神障碍发病机制中的应用 | 利用嗅觉上皮细胞模型研究精神疾病的分子机制，特别是通过单细胞RNA测序和DNA甲基化分析等先进技术 | NA | 研究精神障碍的发病机制及个性化治疗方法 | 精神分裂症、双相情感障碍和阿尔茨海默病 | 神经科学 | 精神障碍 | 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 细胞数据 | NA |
| 165 | 2024-12-28 |
An update review of the application of single-cell RNA sequencing in pregnancy-related diseases
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1415173
PMID:39717096
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在妊娠相关疾病中的应用 | 提供了scRNA-seq技术在人类胎盘研究中的最新进展，特别是在正常妊娠和妊娠相关疾病中的应用 | 讨论了scRNA-seq技术在生殖领域中的局限性和未来展望 | 更新产科医生对scRNA-seq技术在妊娠并发症中的理解，以帮助诊断和治疗这些疾病 | 人类胎盘，特别是在正常妊娠和妊娠相关疾病中的细胞 | 生物信息学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 166 | 2024-12-28 |
Exposure to Nanoplastics Cause Caudal Vein Plexus Damage and Hematopoietic Dysfunction by Oxidative Stress Response in Zebrafish (Danio rerio)
2024, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S485091
PMID:39723177
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研究论文 | 本研究探讨了纳米塑料对斑马鱼尾静脉丛发育和造血功能的负面影响及其机制 | 首次揭示了纳米塑料通过氧化应激反应导致斑马鱼尾静脉丛损伤和造血功能障碍的分子机制 | 研究仅基于斑马鱼胚胎模型，未涉及其他生物或人类细胞模型 | 探究纳米塑料对斑马鱼早期造血器官发育的影响 | 斑马鱼胚胎 | 环境毒理学 | NA | 荧光显微镜、RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | 斑马鱼胚胎 |
| 167 | 2024-12-28 |
Integration of bulk/scRNA-seq and multiple machine learning algorithms identifies PIM1 as a biomarker associated with cuproptosis and ferroptosis in abdominal aortic aneurysm
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1486209
PMID:39723205
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和多种机器学习算法，识别出与腹主动脉瘤中铁死亡和铜死亡相关的生物标志物PIM1 | 首次通过整合单细胞RNA测序和多种机器学习算法，识别出与腹主动脉瘤中铁死亡和铜死亡相关的生物标志物PIM1 | 研究主要依赖于生物信息学分析和机器学习模型，实验验证部分相对有限 | 识别与腹主动脉瘤中铁死亡和铜死亡相关的生物标志物 | 腹主动脉瘤 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, RT-qPCR, western blot | LASSO, REF, RF, SVM | RNA-seq数据 | 三个小鼠模型的scRNA-seq数据集和一个人类PBMC的bulk RNA-seq数据集 |
| 168 | 2024-12-28 |
Migrasome regulator TSPAN4 shapes the suppressive tumor immune microenvironment in pan-cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1419420
PMID:39723210
|
研究论文 | 本文探讨了TSPAN4在多种癌症中的表达及其对肿瘤免疫抑制微环境的影响 | 首次揭示了TSPAN4作为迁移体调节因子在泛癌症中塑造免疫抑制肿瘤微环境的关键作用 | TSPAN4在癌症中的具体机制仍需进一步实验验证 | 研究TSPAN4在癌症中的表达及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 多种癌症类型，特别是胶质瘤 | 癌症研究 | 泛癌症 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | TCGA Pan-Cancer (PANCAN) 和 TCGA TARGET GTEx 数据集 |
| 169 | 2024-12-28 |
Multi-omics in exploring the pathophysiology of diabetic retinopathy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1500474
PMID:39723239
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）及其他多组学技术在糖尿病视网膜病变（DR）研究中的重要作用 | 通过整合scRNA-seq与转录组学、遗传关联研究及多组学分析，揭示了DR发病机制的新见解，并识别了新的生物标志物、易感基因和潜在治疗靶点 | 尽管多组学技术提供了丰富的数据，但其在DR研究中的应用仍处于早期阶段，需要更多的验证和临床转化研究 | 探索糖尿病视网膜病变的病理生理机制 | 糖尿病视网膜病变（DR） | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多组学分析 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA |
| 170 | 2024-12-26 |
Single-cell profiling uncovers synovial fibroblast subpopulations associated with chondrocyte injury in osteoarthritis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1479909
PMID:39720254
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞损伤之间的相互作用和关联 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞之间的相互作用，并识别了具有修复和保护作用的CILP+成纤维细胞以及可能加剧软骨损伤的POSTN+成纤维细胞 | 研究主要基于单细胞测序数据，缺乏体内实验验证，且样本量未明确说明 | 阐明骨关节炎中滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用和关联，以深化对骨关节炎发病机制的理解 | 骨关节炎患者的滑膜细胞和软骨细胞 | 单细胞测序 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 171 | 2024-12-25 |
Cell and tissue-specific glycosylation pathways informed by single-cell transcriptomics
2024-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559616
PMID:38260527
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了人类组织和细胞类型中的糖基化相关基因表达，揭示了细胞和组织特异性糖基化途径 | 首次在糖科学领域应用单细胞转录组学，揭示了糖基化基因和糖基化途径表达的层次结构，并展示了细胞和组织特异性糖基化模式 | 研究依赖于Tabula Sapiens数据集，可能无法涵盖所有人类组织和细胞类型 | 探讨单细胞水平上糖基化相关基因的表达模式及其在不同组织和细胞类型中的特异性 | 人类组织和细胞类型中的糖基化相关基因和糖基化途径 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | Tabula Sapiens数据集中的人类组织和细胞类型 |
| 172 | 2024-12-25 |
Cell-Specific Targeting of the Endothelium in the Cardiorenal Syndrome
2024, Cardiorenal medicine
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000537764
PMID:38342088
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研究论文 | 本文探讨了针对心血管肾综合征中内皮细胞的靶向治疗策略 | 本文提出了基于病毒载体的细胞特异性内皮细胞靶向治疗，以避免非靶向效应，改善治疗抵抗，并减少疾病进展的残留风险 | NA | 开发针对心血管肾综合征的新型靶向治疗策略 | 内皮细胞在心血管和肾脏疾病中的作用 | NA | 心血管疾病 | 测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-12-25 |
Integrative multi-omics analysis reveals a novel subtype of hepatocellular carcinoma with biological and clinical relevance
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517312
PMID:39712016
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了一种新的肝细胞癌亚型，并构建了预测模型 | 本研究通过整合多种组学数据，包括bulk RNA测序、蛋白质组分析、单细胞RNA测序、空间转录组测序和基因组测序，发现了一种新的肝细胞癌亚型XPO1+Epithelial，并构建了肿瘤纯度和肿瘤微环境相关的预后风险模型 | 本研究主要基于实验室数据和公共数据集，样本量和临床验证可能存在局限性 | 本研究的目的是通过多组学分析揭示肝细胞癌的新亚型，并构建预后预测模型 | 本研究的对象是肝细胞癌患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学分析（bulk RNA测序、蛋白质组分析、单细胞RNA测序、空间转录组测序、基因组测序） | NA | 多组学数据（RNA、蛋白质、基因组、单细胞RNA、空间转录组） | 实验室数据和公共数据集中的肝细胞癌样本 |
| 174 | 2024-12-25 |
Exploring the heterogeneity of osteosarcoma cell characteristics and metabolic states and their association with clinical prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1507476
PMID:39712023
|
研究论文 | 本研究探讨了骨肉瘤细胞特征和代谢状态的异质性及其与临床预后的关联 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢途径分析，揭示了骨肉瘤细胞的异质性，并开发了一个包含风险特征的预测模型，为骨肉瘤的靶向治疗和预后评估提供了新的视角 | 本研究的样本量较小，且仅基于公开数据库的数据，可能影响结果的普适性 | 阐明骨肉瘤的分子机制和代谢特征及其与患者预后的关系 | 骨肉瘤细胞的特征和代谢状态及其与临床预后的关联 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 风险特征模型 | 基因表达数据 | 9个样本的单细胞测序数据，多个公共数据库中的骨肉瘤样本和健康对照样本 |
| 175 | 2024-12-25 |
Effects of PGK1 on immunoinfiltration by integrated single-cell and bulk RNA-sequencing analysis in sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1449975
PMID:39712033
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，探讨了磷酸甘油酸激酶1（PGK1）在脓毒症中的免疫浸润作用 | 首次揭示了PGK1在脓毒症中的显著上调及其作为诊断标志物的潜力，并探讨了其在免疫相关通路和细胞类型中的作用 | 研究主要基于现有数据集，缺乏体内实验验证 | 探讨PGK1在脓毒症中的作用及其作为诊断标志物的潜力 | PGK1在脓毒症患者中的表达及其对免疫浸润的影响 | NA | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 多个数据集中的脓毒症患者样本 |
| 176 | 2024-12-25 |
Exploring the impact of deubiquitination on melanoma prognosis through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1509049
PMID:39712483
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索去泛素化对黑色素瘤预后的影响，并构建了一个新的预后模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析去泛素化相关基因在黑色素瘤中的作用，并构建了一个有效的预后模型 | 需要进一步的临床验证以确认模型的适用性 | 研究去泛素化在黑色素瘤中的作用，并开发新的预后模型 | 黑色素瘤细胞和患者的预后 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林和岭回归 | RNA测序数据 | 使用了来自TCGA队列和外部验证队列的数据 |
| 177 | 2024-12-25 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing to Explore the Molecular Mechanisms Related to Skin Photoaging
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496328
PMID:39713718
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组测序探索皮肤光老化的分子机制 | 发现了三个关键基因（Atp2b1、Plekho2和Tspan13）在光老化过程中的重要作用，并验证了这些基因在免疫细胞浸润和代谢途径中的关键作用 | NA | 揭示皮肤光老化的分子机制 | 光老化患者的基因表达谱和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞测序、转录组测序、RT-qPCR、免疫荧光标记、Western blotting | LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的光老化患者基因表达数据 |
| 178 | 2024-12-25 |
Construction and clinical application of a risk model based on N6-methyladenosine regulators for colorectal cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18719
PMID:39717046
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研究论文 | 本研究基于N6-甲基腺苷（m6A）调控因子构建了一个结直肠癌（CRC）的风险模型，并探讨了其在临床中的应用 | 首次基于m6A调控因子构建了CRC的风险评分模型，并验证了其在区分高风险和低风险患者中的有效性 | 研究主要基于现有数据集，缺乏大规模的临床验证 | 开发一个基于m6A调控因子的风险模型，用于预测结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者的m6A调控因子表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | RNA序列数据 | AC-ICAM和GSE33113数据集中的结直肠癌样本，以及GSE146771单细胞RNA-seq数据集 |
| 179 | 2024-12-25 |
Neuron stress-related genes serve as new biomarkers in hypothalamic tissue following high fat diet
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1443880
PMID:39717104
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研究论文 | 研究探讨了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化及其作为新生物标志物的潜力 | 首次揭示了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化，并发现Bmi1基因作为关键基因反映肥胖的病理生理机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床转化和人类应用仍需进一步验证 | 探讨高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中基因表达变化，寻找新的生物标志物 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中的神经应激相关基因 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞测序 RNA-seq 蛋白质印迹 免疫荧光染色 | LASSO模型 | 基因表达数据 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型 |
| 180 | 2024-12-25 |
Vascular Smooth Muscle Cells Transdifferentiate into Chondrocyte-Like Cells and Facilitate Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0555
PMID:39717465
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研究论文 | 本文研究了血管平滑肌细胞向类软骨细胞的转分化及其在半月板纤维软骨再生中的作用 | 首次发现血管平滑肌细胞可以转分化为纤维软骨细胞，并参与自发性的半月板再生；低强度脉冲超声刺激可以增强这种转分化过程 | 研究主要在动物模型中进行，尚未在人体中验证其有效性和安全性 | 探索有效的半月板纤维软骨再生策略 | 血管平滑肌细胞、半月板纤维软骨、低强度脉冲超声刺激 | NA | NA | 低强度脉冲超声（LIPUS）、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了平滑肌细胞系追踪转基因小鼠和比格犬的半月板缺损模型 |