单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1388 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-01-07 |
New Posttranslational Modification Lactylation Brings New Inspiration for the Treatment of Rheumatoid Arthritis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497240
PMID:39758940
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综述 | 本文综述了乳酸化在类风湿性关节炎（RA）相关细胞和机制中的研究，为RA的发病机制、诊断和治疗提供了新的见解 | 提出了乳酸化作为一种新的翻译后修饰在RA中的关键作用，并发现了潜在的生物标志物 | 本文为综述文章，未涉及具体实验数据，缺乏直接的研究验证 | 探讨乳酸化在类风湿性关节炎中的作用及其潜在的治疗应用 | 类风湿性关节炎相关细胞，如成纤维样滑膜细胞（FLSs）和巨噬细胞 | 生物医学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 142 | 2025-01-07 |
Unveiling Ventilator-Associated Pneumonia: S100A8 as a Promising Biomarker Through Integrated RNA-Seq Analysis
2024, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S495121
PMID:39759083
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研究论文 | 本研究通过整合RNA-Seq分析，揭示了S100A8作为呼吸机相关性肺炎（VAP）的潜在生物标志物 | 结合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析，筛选并验证了S100A8作为VAP诊断的潜在生物标志物，为VAP诊断提供了新的视角 | 样本量相对较小，仅分析了46个VAP样本和48个正常样本 | 探索VAP的发病机制并识别潜在的生物标志物 | 呼吸机相关性肺炎（VAP）患者 | 生物信息学 | 肺炎 | RNA-Seq, scRNA-seq, Western blot | NA | RNA序列数据 | 46个VAP样本和48个正常样本 |
| 143 | 2025-01-07 |
Unveiling the NEFH+ malignant cell subtype: Insights from single-cell RNA sequencing in prostate cancer progression and tumor microenvironment interactions
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517679
PMID:39759507
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了前列腺癌中NEFH+恶性细胞亚型的存在，并探讨了其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次识别出与高级别前列腺癌密切相关的NEFH+恶性细胞亚型，并揭示了其与肿瘤微环境的复杂相互作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证其临床应用的可行性 | 提高前列腺癌的预防、诊断和治疗水平，改善患者预后和生活质量 | 前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 风险评分模型 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据，并使用MDA PCa 2b和VCap细胞系进行验证 |
| 144 | 2025-01-07 |
Spatially-resolved analyses of muscle invasive bladder cancer microenvironment unveil a distinct fibroblast cluster associated with prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522582
PMID:39759522
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研究论文 | 本研究利用成像质谱流式细胞术（IMC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，分析了肌肉浸润性膀胱癌（MIBC）微环境的空间异质性，并揭示了一个与预后相关的特定成纤维细胞簇 | 通过IMC和scRNA-seq技术结合空间转录组学（ST），首次揭示了MIBC微环境中特定成纤维细胞簇（S3）与内皮细胞之间的相互作用及其对预后的影响 | 样本量相对较小（40个组织样本），且研究结果需要进一步验证 | 评估MIBC微环境的空间异质性，并探索其临床意义 | 肌肉浸润性膀胱癌（MIBC）的微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 成像质谱流式细胞术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | 机器学习算法 | 图像、RNA序列数据 | 40个组织样本中的185个感兴趣区域 |
| 145 | 2025-01-06 |
Integrated epigenetic and transcriptional single-cell analysis of t(11;14) multiple myeloma and its BCL2 dependency
2024-01-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020276
PMID:37729611
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞水平的ATAC-seq和RNA-seq技术，分析了t(11;14)多发性骨髓瘤（MM）的表观遗传调控和转录组特征，并探讨了其对BCL2抑制剂venetoclax的依赖性 | 首次在原发性MM细胞中整合单细胞ATAC-seq和RNA-seq分析，深入解析了t(11;14) MM的表观遗传调控组和转录组特征及其与venetoclax耐药性的关系 | 研究主要聚焦于t(11;14) MM，未涵盖其他类型的多发性骨髓瘤 | 揭示t(11;14)多发性骨髓瘤对BCL2抑制剂的依赖性及其表观遗传调控机制 | t(11;14)多发性骨髓瘤患者 | 表观遗传学 | 多发性骨髓瘤 | ATAC-seq, RNA-seq | NA | 单细胞测序数据 | 原发性MM样本 |
| 146 | 2025-01-05 |
Identification of virus-rich intermediate cells as crucial players in SARS-CoV-2 infection and differentiation dynamics of human airway epithelium
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1507852
PMID:39735182
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据，揭示了SARS-CoV-2感染早期人类气道上皮细胞的动态变化，并发现了一种新的病毒富集中间细胞（VRI细胞） | 首次识别出病毒富集中间细胞（VRI细胞），并揭示了其在SARS-CoV-2感染中的关键作用 | 研究主要依赖于体外培养的气道上皮细胞模型，可能无法完全反映体内复杂的感染环境 | 研究SARS-CoV-2与人类气道上皮细胞的早期相互作用，以揭示病毒复制和传播机制 | 人类鼻腔和气管上皮细胞 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 147 | 2025-01-05 |
Unveiling Key Biomarkers and Mechanisms in Septic Cardiomyopathy: A Comprehensive Transcriptome Analysis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S486763
PMID:39735900
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了脓毒性心肌病（SCM）的关键生物标志物及其潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序和功能富集分析，揭示了SCM与免疫反应、铁死亡、焦亡、铜死亡及m6A RNA甲基化修饰之间的联系 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 识别SCM的关键生物标志物并探索其潜在机制 | 正常小鼠和SCM小鼠 | 生物信息学 | 脓毒性心肌病 | 转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR | NA | RNA测序数据 | GSE53007和GSE207363数据集中的小鼠样本 |
| 148 | 2025-01-05 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Heterogeneity of T Cells in Mice with Systemic Lupus Erythematosus and Neuronal Inflammation
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S474211
PMID:39735894
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探索了系统性红斑狼疮（SLE）小鼠中T细胞的异质性及其从脾脏到大脑的迁移 | 发现了SLE小鼠中显著表达Eomes和其他特定标志物的双阴性T细胞群体，并揭示了这些细胞与细胞衰老和耗竭的强关联 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类患者 | 探索系统性红斑狼疮小鼠中T细胞的异质性及其在神经炎症中的作用 | MRL/lpr小鼠和BALB/c小鼠的脑和脾脏组织 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 27704个来自MRL/lpr小鼠的细胞和25355个来自BALB/c小鼠的健康对照细胞 |
| 149 | 2025-01-05 |
Single-Cell Sequencing and Machine Learning Integration to Identify Candidate Biomarkers in Psoriasis: INSIG1
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S492875
PMID:39735895
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和机器学习整合，识别了银屑病中的候选生物标志物INSIG1，并验证了其治疗潜力 | 结合单细胞RNA测序和机器学习方法，识别了银屑病中新的候选基因INSIG1，并验证了其与T细胞的负相关性及其在脂肪酸代谢中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，仍需进一步的临床和体内实验验证 | 识别银屑病中的新治疗靶点和候选生物标志物 | 银屑病患者和T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | RNA测序数据 | NA |
| 150 | 2025-01-05 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and prognostic markers of myeloid precursor cells in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494106
PMID:39737198
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和单细胞RNA测序数据，识别了与急性髓性白血病（AML）预后相关的关键基因，并建立了一个预后评估模型 | 识别了八个与AML预后显著相关的关键基因，并构建了一个有效的预后评估模型，揭示了AML细胞在免疫功能和代谢途径上的差异 | NA | 提高AML预后预测的准确性 | 急性髓性白血病（AML）患者 | 生物信息学 | 急性髓性白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预后评估模型 | RNA测序数据 | NA |
| 151 | 2025-01-05 |
Identifying the NEAT1/miR-26b-5p/S100A2 axis as a regulator in Parkinson's disease based on the ferroptosis-related genes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0316179
PMID:39739972
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，识别了与帕金森病（PD）相关的铁死亡相关基因（FRGs），并构建了竞争性内源RNA（ceRNA）网络，以评估PD的发病机制 | 首次识别了NEAT1/miR-26b-5p/S100A2轴作为PD中铁死亡的调控机制，并构建了基于FRGs的诊断模型 | 研究样本量较小，且主要依赖于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 评估帕金森病的发病机制，特别是与铁死亡相关的基因调控网络 | 帕金森病患者的中脑黑质样本 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因集富集分析（GSEA）、一致性聚类分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习算法、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 97个中脑黑质样本 |
| 152 | 2025-01-05 |
Unraveling Alzheimer's disease: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomic
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1515981
PMID:39741706
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综述 | 本文综述了单细胞测序和空间转录组学在阿尔茨海默病研究中的最新进展 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示了阿尔茨海默病的细胞异质性和神经免疫机制，发现了与疾病相关的小胶质细胞亚群和基因表达变化 | 需要进一步整合其他组学数据以实现对阿尔茨海默病的全面理解 | 理解复杂的细胞相互作用，以识别新的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病的细胞异质性和神经免疫机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 153 | 2025-01-05 |
Single-Cell and Transcriptome Analysis of Periodontitis: Molecular Subtypes and Biomarkers Linked to Mitochondrial Dysfunction and Immunity
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S498739
PMID:39741754
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组数据分析，揭示了牙周炎中免疫反应与线粒体功能障碍之间的相互作用，并识别了新的分子亚型和生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序和转录组数据分析，识别了牙周炎的四种分子亚型，并发现了与线粒体功能障碍和免疫反应相关的生物标志物 | 研究结果需要进一步在更大规模的临床样本中进行验证，以确认其普遍性和实用性 | 阐明线粒体功能障碍和免疫反应在牙周炎发病机制中的作用，识别分子亚型并发现诊断生物标志物，以支持精准医学方法 | 牙周炎患者 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、转录组分析、qPCR、IHC | 机器学习算法 | RNA测序数据、临床样本数据 | 牙周炎患者的单细胞RNA测序和转录组数据 |
| 154 | 2025-01-05 |
Breast pericytes: a newly identified driver of tumor cell proliferation
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1455484
PMID:39741968
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研究论文 | 本文通过新开发的FACS方法，成功识别并纯化了乳腺组织中的各种细胞类型，包括周细胞，并利用这些数据分析了肿瘤中细胞类型特异性基因表达，揭示了周细胞特异性基因与乳腺癌患者死亡率之间的强关联 | 首次成功识别并纯化乳腺组织中的周细胞，并发现周细胞在乳腺癌中的关键作用，特别是在促进肿瘤细胞增殖方面 | 周细胞的低丰度、固有异质性以及与其他细胞类型的共享标记表达使得识别和纯化周细胞具有挑战性 | 研究乳腺癌微环境中的关键因素，特别是周细胞在肿瘤细胞增殖中的作用 | 乳腺组织中的周细胞和乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | FACS, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 155 | 2025-01-05 |
Hidden features: CD36/SR-B2, a master regulator of macrophage phenotype/function through metabolism
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468957
PMID:39742252
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review | 本文综述了CD36/Scavenger Receptor B2在巨噬细胞表型和功能中的核心作用，特别是在代谢调控方面 | 强调了CD36在巨噬细胞代谢表达谱中的关键作用，以及其在微环境变化下对巨噬细胞功能的重塑潜力 | 主要基于现有文献综述，缺乏新的实验数据支持 | 探讨CD36/Scavenger Receptor B2在巨噬细胞表型和功能调控中的作用 | 巨噬细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化、肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 156 | 2025-01-05 |
Machine learning-based selection of immune cell markers in osteosarcoma: prognostic determination and validation of CLK1 in disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468875
PMID:39742274
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研究论文 | 本文通过机器学习方法筛选骨肉瘤中的免疫细胞标志物，构建预后模型并验证CLK1在疾病进展中的作用 | 利用多算法计算框架和单细胞RNA测序数据，开发了基于肿瘤浸润免疫细胞（TIIC）的基因特征，并验证了CLK1作为潜在致癌基因的作用 | 研究样本量较小，仅包含11个骨肉瘤样本，且功能验证仅限于MG63和U2OS细胞系 | 提高骨肉瘤患者的预后预测能力，并探索肿瘤微环境中的关键基因 | 骨肉瘤患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、拷贝数变异（CNV）分析、免疫印迹 | 20种机器学习算法 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 11个骨肉瘤样本 |
| 157 | 2025-01-05 |
Leveraging single-cell and multi-omics approaches to identify MTOR-centered deubiquitination signatures in esophageal cancer therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490623
PMID:39742278
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研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学方法，识别了食管癌治疗中以MTOR为中心的去泛素化特征 | 首次开发了基于14个去泛素化相关基因（DUBGs）的基因特征模型，用于预测食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的预后和免疫治疗反应，并验证了MTOR作为潜在治疗靶点 | 研究主要依赖于TCGA-ESCC和GSE53624数据集，样本来源可能有限，且需要进一步临床验证 | 探索去泛素化相关基因在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的作用，并开发预测模型以指导个性化治疗 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 癌症研究 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、Cox回归模型、细胞间通讯分析、基因本体富集分析、突变分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据、突变数据 | TCGA-ESCC和GSE53624数据集中的患者样本 |
| 158 | 2025-01-05 |
FB5P-seq-mAbs: monoclonal antibody production from FB5P-seq libraries for integrative single-cell analysis of B cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1505971
PMID:39742275
|
研究论文 | 本文提出了一种整合FACS-based 5'-end单细胞RNA测序（FB5P-seq）和单克隆抗体克隆的方法，用于单B细胞的综合分析 | 该方法结合了单细胞RNA测序和单克隆抗体克隆，能够从单B细胞中获取转录组和抗原受体序列，并生产相应的单克隆抗体进行功能分析 | 需要从单B细胞中克隆抗体并进行功能分析，过程较为复杂 | 开发一种用于单B细胞综合分析的集成方法，以追踪B细胞在免疫反应中的激活和成熟 | B细胞 | 单细胞分析 | NA | FACS-based 5'-end单细胞RNA测序（FB5P-seq），单克隆抗体克隆 | NA | RNA-seq数据，抗体序列数据 | 卵清蛋白特异性小鼠生发中心B细胞 |
| 159 | 2025-01-05 |
Development and validation of a programmed cell death index to predict the prognosis and drug sensitivity of gastric cancer
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1477363
PMID:39744132
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一种基于程序性细胞死亡（PCD）的胃癌预后和药物敏感性预测指标 | 开发了一种新的十二基因标志物PCDI，用于预测胃癌患者的预后和药物敏感性，并建立了整合PCDI和临床特征的高性能列线图 | 研究依赖于公开的转录组数据和临床信息，可能受到数据质量和样本量的限制 | 开发一种基于PCD的胃癌预后和药物敏感性预测指标 | 胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 转录组数据分析 | LASSO回归分析 | 转录组数据和临床信息 | TCGA-STAD数据集以及GSE62254、GSE15459和GSE26901微阵列数据用于验证，GSE183904单细胞转录组数据用于分析 |
| 160 | 2025-01-05 |
ABCA1 promote tumor environment heterogeneity via epithelial mesenchymal transition in Huh7 and HepG2 liver cancer cell
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1498528
PMID:39749197
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）中细胞通讯的内在机制，通过单细胞测序分析了恶性细胞亚群和癌症相关成纤维细胞（CAF）亚群，揭示了它们通过受体-配体相互作用的相互作用，并特别关注了SPP1 | 通过单细胞测序和湿实验室实验揭示了ABCA1在肝细胞癌中的促癌作用，并开发了基因风险评分模型来预测患者预后 | 研究主要基于Huh7和HepG2肝癌细胞系，可能无法完全代表所有肝细胞癌的异质性 | 探讨肝细胞癌中细胞通讯的内在机制及其对肿瘤微环境异质性的影响 | Huh7和HepG2肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 基因风险评分模型 | 单细胞数据 | Huh7和HepG2肝癌细胞系 |