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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-06 |
Involvement of S100A6/S100A11 in T-Cell Immune Regulatory in HCC Revealed by Single Cell RNA-seq
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241252610
PMID:38766816
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示S100A6/S100A11在肝细胞癌T细胞免疫调控中的作用机制 | 首次发现S100A6/S100A11在肿瘤T细胞中差异表达并通过NF-κB通路影响肿瘤微环境 | 未明确说明样本数量和研究队列的具体特征 | 探究S100蛋白家族在肝细胞癌免疫细胞中的作用机制 | 肝细胞癌和乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 时序细胞轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-06 |
Updates in Skin Cancer in Transplant Recipients and Immunosuppressed Patients: Review of the 2022-2023 Scientific Symposium of the International Immunosuppression and Transplant Skin Cancer Collaborative
2024, Transplant international : official journal of the European Society for Organ Transplantation
IF:2.7Q2
DOI:10.3389/ti.2024.12387
PMID:38562207
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综述 | 总结2022年国际免疫抑制与移植皮肤癌协作组科学研讨会关于移植受者和免疫抑制患者皮肤癌的最新研究进展 | 汇集了皮肤癌在免疫抑制人群中的最新研究成果,包括化学预防、免疫抑制方案、免疫治疗和空间转录组学等前沿领域 | NA | 回顾和总结移植受者和长期免疫抑制患者皮肤癌研究领域的最新科学进展 | 实体器官移植受者和其他形式长期免疫抑制患者 | NA | 皮肤癌 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment of small cell lung cancer-associated malignant pleural effusion
2024-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15145
PMID:38010064
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示小细胞肺癌相关恶性胸腔积液的肿瘤免疫微环境特征 | 首次在SCLC-MPE中应用单细胞转录组测序分析肿瘤免疫微环境 | 仅基于单一样本分析,样本量有限 | 揭示小细胞肺癌恶性胸腔积液的免疫微环境特征 | 小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8008个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序技术 |
| 144 | 2025-10-06 |
Macrophage Dysfunction in Respiratory Disease
2024, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-031-65944-7_9
PMID:39406908
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综述 | 本文探讨肺巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制 | 整合谱系追踪和单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞在肺部疾病中的代谢特征和线粒体活性变化 | 未涉及具体实验验证和临床干预研究 | 解析巨噬细胞功能障碍在呼吸系统疾病发病机制中的作用 | 肺巨噬细胞(包括肺泡巨噬细胞和组织驻留细胞) | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-06 |
Diverse contribution of amniogenic somatopleural cells to cardiovascular development: With special reference to thyroid vasculature
2024-01, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.532
PMID:36038963
|
研究论文 | 本研究探讨了羊膜生成体壁细胞在心血管发育中的多样化贡献,特别关注甲状腺血管系统的形成 | 首次发现羊膜生成体壁细胞不仅形成羊膜,还迁移入胚胎分化为多种心血管细胞类型,并揭示其在甲状腺血管形成中的特异性作用 | iASCs的详细分化过程和最终分布仍不完全清楚 | 阐明羊膜生成体壁细胞在心血管发育中的作用机制 | 鹌鹑-鸡嵌合体胚胎中的羊膜生成体壁细胞 | 发育生物学 | 心血管发育异常 | 单细胞转录组分析, 嵌合体分析, 外植体培养 | NA | 基因表达数据, 细胞分布数据 | 鹌鹑-鸡嵌合体胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics identifies candidate stromal drivers of benign prostatic hyperplasia
2024-01-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176479
PMID:37971878
|
研究论文 | 通过空间转录组学识别良性前列腺增生中潜在的基质驱动因子 | 首次结合激光显微切割与空间转录组学技术定位BPH基质中的关键分泌因子,验证了IGF1和CXCL13在基质-上皮相互作用中的功能 | 研究仅部分支持历史假说,未完全阐明所有驱动BPH的分子机制 | 探究良性前列腺增生的基质驱动机制 | 良性前列腺增生患者的前列腺组织及体外培养的BPH-1细胞球体和患者来源类器官 | 空间转录组学 | 前列腺增生 | 激光显微切割,空间转录组学,RNA原位杂交,3D细胞培养 | NA | 空间转录组数据,RNA表达数据,组织图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 147 | 2025-10-06 |
Integrin β1-rich extracellular vesicles of kidney recruit Fn1+ macrophages to aggravate ischemia-reperfusion-induced inflammation
2024-01-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169885
PMID:38258908
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示肾脏缺血再灌注损伤中近端肾小管细胞通过整合素β1丰富的细胞外囊泡招募Fn1+巨噬细胞加剧炎症反应的分子机制 | 首次系统分析IRI微环境中EV携带蛋白介导的细胞间通讯,发现整合素β1富集的EV在招募Fn1+巨噬细胞和放大炎症反应中的关键作用 | 缺乏对EV分泌阻断剂GW4869作用机制的深入探讨,研究主要聚焦早期IRI阶段的细胞通讯 | 阐明肾脏缺血再灌注损伤中近端肾小管细胞与单核吞噬细胞间的细胞通讯机制 | 小鼠肾脏组织、近端肾小管细胞、单核吞噬细胞(特别是Fn1+巨噬细胞) | 分子生物学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 蛋白质谱分析, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-06 |
Multiomics characterization of breast angiosarcoma from an Asian cohort reveals enrichment for angiogenesis signaling pathway and tumor-infiltrating macrophages
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1515935
PMID:39872529
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法对亚洲人群乳腺血管肉瘤进行分子特征分析,揭示了血管生成信号通路和肿瘤浸润巨噬细胞的富集 | 首次在亚洲人群中系统描述乳腺血管肉瘤的分子特征,并通过空间转录组学揭示肿瘤微环境中免疫细胞分布 | 样本量较小(16例乳腺血管肉瘤),且为单中心研究 | 阐明亚洲人群乳腺血管肉瘤的临床特征和分子机制 | 176例血管肉瘤患者,其中16例乳腺血管肉瘤和104例头颈部血管肉瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全基因组测序, 基因表达谱分析, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 基因表达数据, 空间转录组数据 | 176例血管肉瘤患者(16例乳腺血管肉瘤,104例头颈部血管肉瘤) | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学, 基因表达谱分析 | 10x Visium, NanoString nCounter | 10x Visium空间转录组技术,NanoString基因表达分析系统 |
| 149 | 2025-10-06 |
Identification of immune-related gene signatures for chronic obstructive pulmonary disease with metabolic syndrome: evidence from integrated bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-01-29, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad043
PMID:37878760
|
研究论文 | 通过整合批量和单细胞RNA测序数据识别慢性阻塞性肺疾病合并代谢综合征的免疫相关基因标志物 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别出13个COPD与MetS共有的免疫相关枢纽基因,并发现肺泡巨噬细胞中活性氧的潜在关键作用 | 研究基于公共数据集,需要进一步实验验证枢纽基因的功能机制 | 识别慢性阻塞性肺疾病合并代谢综合征的共享免疫相关生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病和代谢综合征患者 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 | WGCNA, 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2025-10-06 |
Utilization of donor CLL-1 CAR-T cells for the treatment of relapsed of acute myeloid leukemia following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491341
PMID:39896798
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研究论文 | 评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的疗效和安全性 | 首次在临床试验中评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗移植后复发AML的疗效,并使用单细胞RNA测序分析CAR-T细胞动态 | 样本量较小(仅12例患者),缺乏对照组 | 评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗移植后复发AML的疗效和安全性 | 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病患者 | 细胞治疗 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞治疗 | NA | 临床数据,单细胞测序数据 | 14例入组患者,12例完成治疗 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2025-10-06 |
Advances in epigenetic studies of plant cadmium stress
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1489155
PMID:40520647
|
综述 | 本文综述了植物对镉胁迫的表观遗传响应机制研究进展 | 整合基因组学、单细胞测序和空间转录组学等先进技术研究植物镉胁迫表观遗传机制 | NA | 为分析主要作物重金属胁迫的表观遗传机制提供理论见解 | 植物 | 植物表观遗传学 | NA | 基因组学, 单细胞测序, 空间转录组学, 表观基因组学 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-06 |
Type 1 immunity enables neonatal thymic ILC1 production
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh5520
PMID:38232171
|
研究论文 | 本研究揭示了1型免疫通过促进新生胸腺ILC1细胞的扩增和外周归巢来应对病毒感染等炎症条件 | 首次发现新生胸腺中存在独特的未成熟ILC1亚群,并证实1型细胞因子能促进其扩增和胸腺外迁 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证 | 探究1型免疫对胸腺驻留先天淋巴样细胞的影响 | 新生小鼠胸腺ILC1细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,活体成像,胸腺移植 | NA | 基因表达数据,影像数据 | 新生小鼠胸腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 153 | 2025-10-06 |
Tenascin-C expressing touch dome keratinocytes exhibit characteristics of all epidermal lineages
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi5791
PMID:38241368
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现触圆顶角质形成细胞特异性表达Tenascin-C,并揭示这些细胞具有自我维持能力和多向分化潜能 | 首次鉴定Tenascin-C作为触圆顶角质形成细胞的标志物,并证明其在稳态维持和损伤修复中的独特功能 | 未明确触圆顶角质形成细胞分子调控机制的具体细节 | 探究触圆顶角质形成细胞的稳态维持机制和分子特征 | 小鼠皮肤触圆顶角质形成细胞 | 细胞生物学 | NA | scRNA-seq, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-06 |
The chemokine receptor CXCR3 promotes CD8+ T cell-dependent lung pathology during influenza pathogenesis
2024-01-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj1120
PMID:38170765
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了CXCR3在促进CD8+ T细胞依赖性流感肺部病理中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出调控CD8+ T细胞毒性反应的独特调控因子,并证明CXCR3阻断可减轻流感相关肺损伤而不影响病毒清除 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探索CD8+ T细胞在流感控制与肺部病理中的双重作用及其特定亚群功能 | 流感感染小鼠肺组织中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 流感感染小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-06 |
An individualized stemness-related signature to predict prognosis and immunotherapy responses for gastric cancer using single-cell and bulk tissue transcriptomes
2024-01, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.6908
PMID:38168907
|
研究论文 | 开发基于胃癌干性特征的个体化签名用于预测预后和免疫治疗反应 | 首次构建基于样本内基因相对表达排序的个体化干性特征签名,克服批次效应限制 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证 | 开发个体化胃癌预后和免疫治疗反应预测模型 | 胃癌患者样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 基于基因对相对表达排序的签名模型 | 基因表达数据 | 多个数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2025-10-06 |
Demultiplexing of single-cell RNA-sequencing data using interindividual variation in gene expression
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae085
PMID:38911824
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研究论文 | 本研究开发了一种利用个体间基因表达变异进行单细胞RNA测序数据解卷积的计算方法 | 提出基于个体间差异共表达模式的解卷积方法,无需额外实验步骤即可对混合样本进行细胞来源鉴定 | NA | 开发单细胞RNA测序混合样本的解卷积计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 差异共表达分析 | 基因表达数据 | 6只同基因近交系小鼠和30个人类样本(脓毒症患者和健康个体) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 157 | 2025-10-06 |
Analysis of community connectivity in spatial transcriptomics data
2024, Frontiers in applied mathematics and statistics
IF:1.3Q3
DOI:10.3389/fams.2024.1403901
PMID:40475302
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组数据分析中社区连通性分析的新方法 | 开发了首个能够表征细胞群落连通性的计算方法BANYAN,填补了现有工具无法分析群落内和群落间细胞相对相似性的空白 | 方法仅在模拟研究和有限的实际数据集上进行了验证,需要更广泛的应用验证 | 开发空间转录组数据中细胞群落连通性分析的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞群落 | 空间转录组学 | 黑色素瘤脑转移、浸润性导管癌、小细胞肺癌 | 空间转录组学 | 贝叶斯多层网络模型 | 空间转录组数据 | 多个真实数据集,包括小鼠大脑、黑色素瘤脑转移、浸润性导管癌和人类小细胞肺癌样本 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | 10x Visium, NanoString CosMx | 10x Visium空间转录组平台,NanoString CosMx空间分子成像平台 |
| 158 | 2025-10-06 |
Stromal Cell Isolation from Hematopoietic Organs
2024-01-26, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66231
PMID:38345255
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研究论文 | 本文提供了从造血器官中分离高质量基质细胞的逐步操作方案 | 建立了适用于小鼠和人类胸腺以及小鼠骨骼和骨髓的基质细胞分离标准化流程,并讨论了影响单细胞测序兼容性的关键因素 | 主要关注基质细胞分离技术,未涉及具体生物学机制研究 | 开发优化的基质细胞分离方法以支持高质量单细胞多组学研究 | 小鼠和人类造血器官(胸腺、骨骼、骨髓)中的基质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞多组学测序,FACS分析/分选 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 159 | 2025-10-06 |
BATF2 inhibits the stem cell-like properties and chemoresistance of gastric cancer cells through PTEN/AKT/β-catenin pathway
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.98389
PMID:39629124
|
研究论文 | 本研究探讨BATF2通过PTEN/AKT/β-catenin通路抑制胃癌干细胞特性和化疗耐药性的机制 | 首次揭示BATF2通过调控PTEN/AKT/ABCG2通路影响胃癌干细胞特性和化疗敏感性的新机制 | 样本量相对有限(9例胃癌样本),需在更大队列中验证 | 阐明BATF2在胃癌干细胞特性和化疗耐药性中的调控作用 | 胃癌细胞、肿瘤细胞球体、类器官和小鼠模型 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,细胞培养,肿瘤球体形成,类器官培养,免疫组化,免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据,体外实验数据,体内实验数据 | 9例胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-06 |
Deciphering the effects of radiopharmaceutical therapy in the tumor microenvironment of prostate cancer: an in-silico exploration with spatial transcriptomics
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99516
PMID:39629134
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研究论文 | 结合空间转录组学和计算模型探索放射性药物治疗对前列腺癌肿瘤微环境的影响 | 首次将空间转录组学与计算建模相结合,系统评估不同靶向放射性药物治疗在前列腺癌肿瘤微环境中的剂量分布和疗效差异 | 仅基于两名患者的三组空间转录组学数据集,样本量有限;假设所有配体具有相似的药代动力学参数可能不够准确 | 探索放射性药物治疗在前列腺癌肿瘤微环境中的剂量学和生物学效应 | 前列腺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 计算建模, 偏微分方程求解, 生理药代动力学模型 | 对流-反应-扩散模型, 线性二次模型, MIRD剂量学形式体系 | 空间转录组学数据 | 2名前列腺癌患者的3个空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |