单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1284 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-11-13 |
Single-cell transcriptome analysis identifies a novel tumor-associated macrophage subtype predicting better prognosis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1466767
PMID:39507421
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，鉴定出一种新的胰腺导管腺癌相关巨噬细胞亚型，该亚型预示着更好的预后 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，鉴定出一种新的良性M2样巨噬细胞亚型（bM2-like TAMs），并揭示其在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤作用 | 本研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 深入了解胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞亚型及其对预后的影响，为免疫治疗提供新策略 | 胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大量单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 |
| 142 | 2024-11-13 |
Comprehensive single-cell and bulk transcriptomic analyses to develop an NK cell-derived gene signature for prognostic assessment and precision medicine in breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460607
PMID:39507529
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析，开发了一种基于NK细胞的基因特征，用于乳腺癌的预后评估和精准医疗 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组分析，开发了一种新的NK细胞相关基因特征，用于乳腺癌的预后评估和治疗反应预测 | NA | 开发一种新的NK细胞相关基因特征，用于乳腺癌的预后评估和精准医疗 | 乳腺癌中的NK细胞相关基因及其在预后评估和治疗反应预测中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、加权相关网络分析（WGCNA）、LASSO回归、空间转录组学（ST）、免疫组化（IHC） | NA | 基因表达数据 | 数据主要来源于TCGA和GEO数据库，具体样本数量未明确提及 |
| 143 | 2024-11-12 |
STING agonist inflames the cervical cancer immune microenvironment and overcomes anti-PD-1 therapy resistance
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1342647
PMID:38550593
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研究论文 | 研究探讨了STING激动剂在宫颈癌免疫微环境中的作用及其与抗PD-1疗法联合使用的潜力 | 首次探讨了STING激动剂MSA-2在宫颈癌治疗中的应用，并展示了其与抗PD-1疗法联合使用的显著效果 | 研究主要基于小鼠模型和公开数据集，需进一步验证在人体中的效果 | 探索STING激动剂在宫颈癌治疗中的作用及其与免疫检查点抑制剂联合使用的潜力 | 宫颈癌及其免疫微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据集的基因表达和临床病理数据，以及小鼠肿瘤模型U14和TC-1 |
| 144 | 2024-11-10 |
Interleukin 13 Promotes Maturation and Proliferation in Metaplastic Gastroids
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101366
PMID:38815928
|
研究论文 | 研究IL-13在胃化生细胞中的作用及其对细胞成熟和增殖的影响 | 建立了可靠的Meta1胃化生细胞模型，并揭示了IL-13通过STAT6信号通路促进胃化生细胞成熟和增殖的机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 探讨IL-13在胃化生细胞中的分子效应及其对细胞成熟和增殖的影响 | 胃化生细胞（SPEM细胞）及其在IL-13作用下的成熟和增殖 | NA | NA | 单细胞RNA测序、细胞分选、三维共培养、气液界面培养、STAT6抑制 | NA | 基因表达数据 | 来自Mist1-Kras转基因小鼠和IL-13-tdTomato报告小鼠的胃组织，以及人类胃化生细胞 |
| 145 | 2024-11-09 |
Humanized CXCL12 antibody delays onset and modulates immune response in alopecia areata mice: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1444777
PMID:39483478
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序探讨人源化CXCL12抗体在斑秃小鼠模型中的作用机制 | 首次使用人源化CXCL12抗体治疗斑秃，并通过单细胞RNA测序揭示其分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，需进一步在人体中验证 | 探讨人源化CXCL12抗体在斑秃治疗中的作用及其分子机制 | 斑秃小鼠模型及其免疫细胞 | NA | 斑秃 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的皮肤样本 |
| 146 | 2024-11-09 |
mRNA-seq-based analysis predicts: AEG-1 is a therapeutic target and immunotherapy biomarker for pan-cancer, including OSCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484226
PMID:39483471
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研究论文 | 本文通过mRNA-seq分析预测AEG-1是泛癌治疗靶点和免疫治疗生物标志物，包括OSCC | 首次全面分析了AEG-1表达与OSCC及其他肿瘤类型中免疫浸润的关系，并发现AEG-1与免疫浸润标志物之间的强相关性 | NA | 探讨AEG-1在泛癌中的表达及其与免疫浸润和患者预后的关系 | AEG-1在不同肿瘤类型中的表达水平、预后和临床病理特征 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | mRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个数据库中的多种肿瘤样本，包括OSCC |
| 147 | 2024-11-09 |
Potential molecular mechanisms of ETV6-RUNX1-positive B progenitor cell cluster in acute lymphoblastic leukemia revealed by single-cell RNA sequencing
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18445
PMID:39498293
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇在急性淋巴细胞白血病中的潜在分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇在急性淋巴细胞白血病中的细胞周期调控机制及其与NK细胞和T细胞的相互作用 | NA | 探索免疫景观和免疫细胞在急性淋巴细胞白血病进展中的作用 | ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇及其在急性淋巴细胞白血病中的作用 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GSE132509的ETV6-RUNX1和健康儿科样本的骨髓单个核细胞 |
| 148 | 2024-11-08 |
Inflammatory Mediators Suppress FGFR2 Expression in Human Keratinocytes to Promote Inflammation
2024, Molecular and cellular biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1080/10985549.2024.2399766
PMID:39340759
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研究论文 | 研究探讨了炎症介质如何抑制人角质形成细胞中FGFR2的表达以促进炎症 | 首次揭示了FGFR2在人角质形成细胞中抑制炎症的关键作用，并提出了FGFR2下调在特应性皮炎及其他炎症性疾病发病机制中的潜在作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨FGFR2在人角质形成细胞中的功能及其在炎症性疾病中的作用 | 人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 | NA | 特应性皮炎 | CRISPR/Cas9基因编辑技术，RNA测序 | NA | RNA | 体外培养的人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 |
| 149 | 2024-11-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals STAT1 Drives LHPP Downregulation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241293485
PMID:39497541
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据探讨了食管鳞状细胞癌（ESCC）中STAT1对LHPP下调的驱动作用 | 发现了STAT1在ESCC发病机制中对LHPP表达的调控作用，揭示了STAT1与LHPP之间的复杂调控回路 | NA | 探索食管鳞状细胞癌（ESCC）的分子机制和细胞动力学，特别是转录因子STAT1及其与LHPP的调控关系 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者及其细胞系 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 21名ESCC患者 |
| 150 | 2024-11-08 |
Approaches for Benchmarking Single-Cell Gene Regulatory Network Methods
2024, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322241287120
PMID:39502448
|
研究论文 | 本文讨论了单细胞基因调控网络方法的基准测试方法 | 本文首次全面讨论了基准测试方法，并提出了替代的基准数据集和额外的考虑因素 | 本文未具体讨论每种方法的优缺点，而是集中在基准测试方法的讨论上 | 探讨单细胞基因调控网络方法的基准测试方法 | 单细胞基因调控网络方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 151 | 2024-11-08 |
Ustekinumab affects myofibroblast metabolism to alleviate intestinal fibrosis by targeting KDELC1 in Crohn's disease through multi-machine learning combined with single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1476592
PMID:39502647
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研究论文 | 本研究通过多机器学习结合单细胞测序分析，探讨了乌司奴单抗通过靶向KDELC1基因缓解克罗恩病肠道纤维化的机制 | 首次揭示了乌司奴单抗通过靶向KDELC1基因影响肌成纤维细胞代谢，从而缓解肠道纤维化的机制 | 研究样本量较小，且仅限于克罗恩病患者，未来需扩大样本量并验证在其他疾病中的适用性 | 探讨乌司奴单抗在克罗恩病中缓解肠道纤维化的遗传机制 | 克罗恩病患者的肠道组织及健康对照组的肠道组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 克罗恩病患者和健康对照组的内镜手术标本 |
| 152 | 2024-11-08 |
Histamine and Th2 cytokines independently and synergistically upregulate MMP12 expression in human M2 macrophages
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429009
PMID:39502691
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研究论文 | 研究探讨了组胺和Th2细胞因子在人M2巨噬细胞中独立及协同上调MMP12表达的机制 | 揭示了Th2细胞因子和组胺调控MMP12表达的新机制，可能影响特应性皮炎皮肤屏障稳态 | NA | 研究MMP12在特应性皮炎皮肤病变中的表达及其调控机制 | 特应性皮炎患者的皮肤病变和健康个体的M2巨噬细胞 | NA | 特应性皮炎 | RNA测序 (scRNA-seq), 定量PCR, ELISA | NA | RNA | 特应性皮炎患者和健康个体的M2巨噬细胞样本 |
| 153 | 2024-11-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals Immune Education promotes T cell survival in mice subjected to the cecal ligation and puncture sepsis model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366955
PMID:38562928
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究免疫教育对小鼠T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中存活的影响 | 首次通过单细胞RNA测序探讨了免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 仅在单一早期时间点进行了研究，未探讨长期效应 | 研究免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 小鼠脾脏T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中的反应 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组小鼠样本：对照组、免疫教育组、CLP组和免疫教育CLP组 |
| 154 | 2024-11-07 |
Revisiting roles of mast cells and neural cells in keloid: exploring their connection to disease activity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1339336
PMID:38524141
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研究论文 | 本文探讨了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩中的作用及其与疾病活动的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析了活动性瘢痕疙瘩、非活动性瘢痕疙瘩和成熟瘢痕样本，揭示了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩微环境中的重要作用 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 阐明肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩发病机制中的作用及其与疾病活动的关系 | 瘢痕疙瘩样本中的肥大细胞和神经细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个活动性瘢痕疙瘩样本，4个非活动性瘢痕疙瘩样本，3个成熟瘢痕样本 |
| 155 | 2024-11-07 |
Comprehensive analysis of lactylation-related gene sets and mitochondrial functions in gastric adenocarcinoma: implications for prognosis and therapeutic strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1451725
PMID:39478860
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义，并提出了新的治疗策略 | 本研究通过整合大规模基因组数据，利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了胃腺癌中独特的分子亚型及其与生存结果和免疫特征的关系，并提出了优于现有模型的预后模型 | NA | 探讨乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义，并提出新的治疗策略 | 胃腺癌中的乳酸化相关基因集、线粒体功能、肿瘤微环境、分子亚型、免疫细胞浸润和响应 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因组数据 | 大规模基因组数据，包括TCGA和多个GEO数据集 |
| 156 | 2024-11-07 |
Identification and validation of efferocytosis-related biomarkers for the diagnosis of metabolic dysfunction-associated steatohepatitis based on bioinformatics analysis and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460431
PMID:39497821
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习方法，识别并验证了与代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 本研究首次系统地探讨了吞噬作用与MASH之间的关系，并通过机器学习构建了有效的诊断模型 | 本研究主要基于生物信息学分析和机器学习，缺乏大规模临床样本的验证 | 识别并验证与MASH诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）及其相关的吞噬作用过程 | 机器学习 | 肝病 | 机器学习算法 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 157 | 2024-11-06 |
Copper drives remodeling of metabolic state and progression of clear cell renal cell carcinoma
2024-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.16.575895
PMID:38293110
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研究论文 | 本文研究了铜在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的作用，揭示了铜如何驱动代谢重塑并促进肿瘤生长和进展 | 首次揭示了铜在ccRCC中的积累与肿瘤进展和复发的关系，并阐明了铜如何通过代谢重塑促进肿瘤生长 | NA | 探讨铜在透明细胞肾细胞癌中的作用及其对肿瘤生长和进展的影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | NA | 肾癌 | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 158 | 2024-11-06 |
Integrative analysis of COL6A3 in lupus nephritis: insights from single-cell transcriptomics and proteomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1309447
PMID:38855105
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和蛋白质组学分析，揭示了COL6A3在狼疮性肾炎中的关键作用 | 首次通过单细胞转录组学和蛋白质组学整合分析，揭示了COL6A3在狼疮性肾炎中的显著上调及其在关键信号通路中的重要作用 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 识别狼疮性肾炎相关的新型生物标志物和治疗靶点，以改善患者的治疗效果和预后 | 狼疮性肾炎患者和健康对照组的单细胞表达数据及蛋白质组学数据 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 狼疮性肾炎患者21例，健康对照组3例，狼疮性肾炎患者9例，无狼疮性肾炎的系统性红斑狼疮患者11例 |
| 159 | 2024-11-06 |
Oncofetal TRIM71 drives liver cancer carcinogenesis through remodeling CEBPA-mediated serine/glycine metabolism
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99633
PMID:39267787
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研究论文 | 研究揭示了TRIM71通过重塑CEBPA介导的丝氨酸/甘氨酸代谢在肝癌发生中的关键作用 | 首次发现TRIM71在肝癌中的特异性表达及其与不良预后的关联，并揭示了其通过与IGF2BP1形成蛋白复合物，依赖m6A修饰稳定CEBPA mRNA，增强丝氨酸/甘氨酸代谢途径，从而促进肝癌进展的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的临床验证 | 揭示肝癌中肿瘤生态系统的核心调控因子及其分子机制 | 肝癌及其相关样本的单细胞和批量RNA测序数据，以及小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 包括胎儿肝脏、正常肝脏、肝癌及其邻近样本的单细胞和批量RNA测序数据，以及小鼠模型 |
| 160 | 2024-11-06 |
Six3 and Six6 jointly control diverse target genes in multiple cell populations over developmental trajectories of mouse embryonic retinal progenitor cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0308839
PMID:39446806
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研究论文 | 研究了Six3和Six6转录因子在鼠胚胎视网膜祖细胞发育轨迹中对多种细胞群体目标基因的共同调控作用 | 首次揭示了Six3和Six6在视网膜祖细胞发育过程中对多种细胞群体目标基因的共同调控机制 | 仅限于鼠胚胎视网膜祖细胞的研究，未涉及其他物种或组织 | 探讨组织特异性祖细胞在器官发生中生成成体组织的分子机制 | 鼠胚胎视网膜祖细胞及其发育轨迹 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 控制组和Six3与Six6复合突变鼠胚胎眼杯样本 |