单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-06 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559634
PMID:37823036
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现早发性阿尔茨海默病患者外周血中干扰素信号相关基因高表达的T细胞显著扩增 | 首次在早发性阿尔茨海默病患者中发现干扰素信号相关基因高表达的抗病毒样T细胞群显著扩增 | 样本量有限，需要进一步研究确认这些细胞在神经退行性疾病中的具体作用机制 | 探究早发性阿尔茨海默病的免疫反应特征 | 早发性阿尔茨海默病患者和临床正常对照者的外周血单核细胞及CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 微滴数字PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 约182,000个外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-06 |
Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing
2024-01-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adh8335
PMID:38198568
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析人类胎盘在分娩过程中母胎交流的细胞机制 | 首次建立人类胎盘单细胞图谱，揭示分娩过程中母胎细胞类型的转录组变化及细胞间通讯网络 | 研究主要关注足月分娩，对早产机制的分析仍需进一步验证 | 阐明分娩过程中母胎交流的细胞和分子机制 | 人类胎盘组织中的母体和胎儿细胞 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-06 |
Dynamics of Endothelial Cell Generation and Turnover in Arteries During Homeostasis and Diseases
2024-01-09, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种遗传增殖追踪系统，用于定量分析动脉内皮细胞在稳态和疾病状态下的生成动态和细胞分裂方向 | 开发了基于Cre-loxP和Dre-rox的双重组系统，实现了体内内皮细胞增殖的无缝时间记录 | 研究主要针对小鼠大血管，对人类血管的适用性需要进一步验证 | 揭示动脉内皮细胞在稳态和疾病状态下的生成动态和调控机制 | 小鼠动脉内皮细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除，遗传增殖追踪 | NA | 基因表达数据，细胞增殖数据 | 成年小鼠主动脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-06 |
BACH1 promotes tissue necrosis and Mycobacterium tuberculosis susceptibility
2024-Jan, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01523-7
PMID:38066332
|
研究论文 | 研究发现转录因子BACH1通过调控铁死亡促进结核分枝杆菌感染的组织坏死和宿主易感性 | 首次揭示BACH1通过抑制抗氧化基因表达调控铁死亡过程，从而影响结核分枝杆菌感染的宿主抵抗机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究BACH1在结核分枝杆菌感染中对宿主抵抗力的调控机制 | 小鼠模型、巨噬细胞、肺组织 | 分子生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 多个小鼠模型组（包括Bach1敲除和B6.Sst1小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-10-06 |
Dandelion uses the single-cell adaptive immune receptor repertoire to explore lymphocyte developmental origins
2024-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01734-7
PMID:37055623
|
研究论文 | 介绍用于单细胞V(D)J测序数据分析的计算流程Dandelion | 开发了能够改进V(D)J重叠群注释并识别非生产和部分剪接重叠群的单细胞分析流程，创建了可用于差异V(D)J使用分析和伪时间轨迹推断的AIR特征空间 | NA | 探索淋巴细胞发育起源 | 淋巴细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞V(D)J测序(scVDJ-seq), 单细胞RNA测序 | 计算流程 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞V(D)J测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-06 |
MICA: a multi-omics method to predict gene regulatory networks in early human embryos
2024-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302415
PMID:37879938
|
研究论文 | 开发了一种名为MICA的多组学方法，用于预测早期人类胚胎中的基因调控网络 | 首次将基于互信息的非线性方法应用于结合染色质可及性的单细胞多组学数据，能够捕获复杂的非单调依赖关系和反馈回路 | 在单细胞样本有限的情况下进行GRN推断存在困难 | 开发适用于单细胞多组学数据的基因调控网络预测方法 | 早期人类胚胎 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析 | 基于互信息的非线性方法 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 127 | 2025-10-06 |
YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulation in murine bone development
2024-01-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.11.029
PMID:38141609
|
研究论文 | 本研究揭示了YAP和TAZ在小鼠骨骼发育过程中协调成骨前体细胞动员与血管生成及力学调控的机制 | 首次发现YAP和TAZ在胚胎骨骼发育中空间耦合成骨前体细胞动员与血管生成，并调控血管形态发生和力学响应 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究胚胎骨骼发育过程中成骨前体细胞动员与血管生成协调作用的分子机制 | 小鼠胚胎骨骼发育过程中的成骨前体细胞和血管系统 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序，3D细胞共培养 | NA | 基因表达数据，细胞成像数据 | 小鼠胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-10-06 |
Insights into midgut cell types and their crucial role in antiviral immunity in the lepidopteran model Bombyx mori
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1349428
PMID:38420120
|
综述 | 本文综述了鳞翅目模型家蚕中肠细胞类型及其在抗病毒免疫中的关键作用 | 利用前沿单细胞转录组学揭示昆虫中肠细胞中先前未被识别的亚群，并阐明昆虫与高等哺乳动物胃肠道之间的显著相似性 | NA | 探讨昆虫中肠细胞类型在免疫防御中的复杂作用机制 | 家蚕中肠细胞类型（柱状细胞、肠内分泌细胞、杯状细胞和再生细胞） | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women with Systemic lupus erythematosus
2024, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2024.2376649
PMID:39066603
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析妊娠期系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞的免疫细胞组成和基因表达特征 | 首次在单细胞水平比较妊娠期活动性与非活动性SLE患者的免疫细胞比例和转录模式差异 | 样本量较小（仅12例患者），且未包含健康孕妇对照组 | 阐明妊娠期SLE患者的免疫细胞特征和分子机制 | 系统性红斑狼疮孕妇的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12例SLE患者（包含活动性/非活动性、妊娠/非妊娠分组） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序技术 |
| 130 | 2025-10-06 |
Immune cell profiling of preeclamptic pregnant and postpartum women by single-cell RNA sequencing
2024, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2022.2144291
PMID:36369864
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先兆子痫孕妇和产后妇女的免疫细胞特征 | 首次在单细胞水平系统描绘先兆子痫患者孕期和产后免疫细胞图谱，揭示免疫细胞亚群的异质性和动态变化 | 样本量较小（3例患者和2例对照），仅使用外周血单个核细胞进行研究 | 探究先兆子痫患者免疫系统在单细胞水平的特征和异质性 | 先兆子痫孕妇和健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例早发性先兆子痫孕妇和2例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 131 | 2025-10-06 |
Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues
2024, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003
PMID:39260934
|
综述 | 本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织免疫细胞中的存在与功能 | 系统梳理了不同趋化因子受体在淋巴器官中的特异性功能，如CXCR4在骨髓中的作用和CCR7在胸腺及次级淋巴组织中的调控机制 | 主要关注常规趋化因子受体，对非典型受体覆盖有限，且为综述性内容缺乏原始实验数据 | 探讨趋化因子受体在淋巴组织免疫细胞中的分布和功能 | 骨髓、胸腺、脾脏、淋巴结和派尔集合淋巴结等淋巴组织中的免疫细胞 | 免疫学 | NA | 高维光谱流式细胞术、单细胞测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-10-06 |
Digital profiling of cancer transcriptomes from histology images with grouped vision attention
2024-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.28.560068
PMID:37808782
|
研究论文 | 开发了一种基于分组视觉注意力的Transformer模型，从组织学图像预测癌症转录组 | 首次将Transformer架构应用于组织学图像进行全转录组预测，并展示了在空间基因表达预测和临床预后中的应用 | 模型在组织水平训练，空间基因表达预测能力仍需进一步验证 | 从组织学图像中预测癌症转录组特征 | 9种癌症类型的肿瘤样本 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习，转录组分析 | Transformer | 组织学图像，基因表达数据 | 预训练：1,802个正常组织样本；训练评估：4,331个肿瘤样本；验证：1,305个肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 133 | 2025-10-06 |
Origin and adult renewal of the gut lacteal musculature from villus myofibroblasts
2024-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.19.523242
PMID:36712064
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道绒毛平滑肌细胞的起源和成年更新机制 | 发现绒毛上皮下成纤维细胞前体通过中间收缩性肌成纤维细胞样表型成熟为平滑肌纤维的连续谱系，并鉴定NOTCH3-DLL4信号轴调控绒毛平滑肌与乳糜管组装 | 研究主要基于小鼠模型，人类肠道中的适用性需进一步验证 | 探究肠道绒毛平滑肌细胞的形成、分化和修复机制 | 小鼠肠道组织 | 发育生物学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序，定量谱系追踪 | NA | 基因表达数据，谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-06 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
|
研究论文 | 本文揭示了单细胞RNA测序数据中激活型KIR基因表达被低估的原因是标准比对流程对KIR转录本的错误分配 | 首次系统性地识别并验证了单细胞RNA测序标准流程中KIR转录本错误分配的问题及其对激活型KIR表达量化的影响 | NA | 探究单细胞RNA测序数据中KIR基因表达量化的准确性问题 | 杀伤性免疫球蛋白样受体(KIR)转录本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.07.574209
PMID:38249519
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学筛选胰腺癌表面受体靶点，开发靶向紧密连接蛋白claudin-4的分子成像诊疗剂 | 首次通过空间转录组学数据驱动筛选发现claudin-4作为胰腺癌诊疗靶点，开发了特异性肽类分子成像剂 | NA | 开发胰腺癌分子成像和诊疗新方法 | 胰腺癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 分子成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dysfunctional characteristics of PBMCs in patients with type 2 diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1501660
PMID:39916961
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析2型糖尿病患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次在单细胞水平揭示2型糖尿病患者PBMCs的转录组图谱，发现T细胞和单核细胞中的差异表达基因及关键信号通路 | 样本量较小（仅3名健康参与者和3名T2DM患者），需要更大规模研究验证 | 探索2型糖尿病患者外周血免疫细胞的功能特征和分子机制 | 2型糖尿病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，Ficoll密度梯度离心 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名参与者（3名健康对照，3名T2DM患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing highlights the influence of innate and adaptive immune response mechanisms in psoriatic arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490051
PMID:40084238
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者的免疫细胞基因表达特征 | 首次在单细胞水平比较有无皮肤银屑病的银屑病关节炎患者的免疫反应差异 | 未发现PsA-only和PsA/PsC患者间的差异表达基因，样本量相对有限 | 探索银屑病关节炎临床表型与免疫发病机制之间的关联 | 70名银屑病关节炎患者和10名健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | 差异表达分析，基因集富集分析 | 单细胞转录组数据 | 80个样本（70名患者+10名健康对照） | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody Single-Cell Analysis System |
| 138 | 2025-05-08 |
A review of single-cell transcriptomics and epigenomics studies in maternal and child health
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2343276
PMID:38709139
|
review | 本文综述了单细胞转录组学和表观基因组学在母婴健康领域的研究 | 总结了16个人类和哺乳动物胎盘的单细胞图谱以及31项关于母体暴露和并发症的单细胞研究 | NA | 综述单细胞测序技术在母婴健康领域的应用 | 人类和哺乳动物胎盘以及母体暴露和并发症 | 单细胞测序 | 母婴健康相关疾病 | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 单细胞测序数据 | 16个单细胞图谱和31项单细胞研究 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2025-05-07 |
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500153
PMID:39896800
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学特性及免疫微环境，为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 | 利用单细胞RNA测序技术系统研究HGSOC的肿瘤异质性和免疫微环境，发现与不良预后相关的C2 IGF2+肿瘤细胞亚型及其与肿瘤进展的关联 | 研究依赖于公开数据库的scRNA-seq数据，可能受限于样本量和数据质量 | 揭示HGSOC进展和治疗抵抗的分子机制，开发更有效的个性化治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的肿瘤细胞亚型及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2025-05-07 |
Elucidating the causal associations and mechanisms between circulating immune cells and idiopathic pulmonary fibrosis: new insights from Mendelian randomization and transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1437984
PMID:39896814
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组学分析，探讨循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及潜在生物标志物 | 结合孟德尔随机化和转录组学数据，首次系统性地研究了免疫细胞表型与IPF的因果关系，并鉴定了三个新的生物标志物 | 研究依赖于公开数据库的GWAS数据，可能存在样本选择偏倚 | 阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及机制 | 循环免疫细胞表型和特发性肺纤维化患者 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、转录组学分析、单细胞RNA测序 | IVW等五种孟德尔随机化方法 | 基因组关联研究数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自公开数据库的GWAS数据和IPF患者样本 | NA | NA | NA | NA |