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当前共找到 1397 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-07-01 |
Integrating genomics and AI to uncover molecular targets for mRNA vaccine development in lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381445
PMID:39430760
|
研究论文 | 整合基因组学与人工智能，揭示狼疮性肾炎mRNA疫苗开发的分子靶点 | 将单细胞基因组学与无矩阵分解和机器学习算法相结合，系统识别狼疮性肾炎中潜在的mRNA疫苗靶点 | 信息来源有限，无法确定具体局限性 | 通过单细胞和批量转录组数据，利用机器学习识别LN中mRNA疫苗开发的潜在分子靶点 | 24名狼疮性肾炎患者和10名健康对照的单个核细胞，以及额外患者和对照的批量RNA-seq数据 | 机器学习 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 非负矩阵分解，机器学习算法 | 基因表达数据 | 24例LN患者和10例健康对照的单个核细胞，以及额外LN患者和对照的批量RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2026-06-30 |
Inferring Gene Regulatory Networks and Predicting the Effect of Gene Perturbations via IQCELL
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2022_465
PMID:36790623
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方法论文 | 提出IQCELL平台，从单细胞RNA测序数据推断布尔基因调控网络，并可模拟正常和扰动条件下的网络行为 | 提供了一个从原始数据集开始实现IQCELL的详细指南，包括数据处理、信息基因推断、基因调控网络推断以及在正常和扰动条件下的网络模拟 | NA | 提供一种从单细胞RNA测序数据推断布尔基因调控网络并预测基因扰动效应的平台 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2026-06-30 |
Single-Cell mRNA-sncRNA Co-sequencing of Preimplantation Embryos
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_487
PMID:37278916
|
研究论文 | 提出了一种单细胞mRNA-sncRNA共测序方法，用于研究植入前胚胎的细胞动力学 | 首次在同一胚胎单细胞中同时进行mRNA和小非编码RNA测序，实现了多组学联合分析 | 未提及具体限制，但可能涉及技术复杂性和细胞损伤风险 | 开发单细胞多组学方法以深入理解植入前胚胎发育的细胞动态 | 小鼠和人类的植入前胚胎单个细胞 | 数字病理学 | 不适用 | Smart-Seq2, Small-Seq | 不适用 | 转录组数据, 小非编码RNA数据 | 单个胚胎细胞（具体数量未提及） | 不适用 | 单细胞RNA-seq, 单细胞小非编码RNA-seq | Smart-Seq2, Small-Seq | 在同一个胚胎单细胞上依次进行Smart-Seq2和Small-Seq |
| 124 | 2026-06-30 |
Evaluation of Stem-Cell Embryo Models by Integration with a Human Embryo Single-Cell Transcriptome Atlas
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_492
PMID:37351839
|
研究论文 | 通过整合人类胚胎单细胞转录组图谱评估干细胞胚胎模型 | 提出了一种整合不同实验室和不同技术获取的单细胞数据集的分析方法，用于比较和优化干细胞来源的胚胎模型 | 未明确说明局限性 | 改进对人类胚泡模型的评估，通过单细胞分辨率与胚胎转录组图谱的整合分析来优化干细胞胚胎模型 | 人类胚泡模型（类囊胚）、人类胚胎数据集和二维体外早期发育模型系统数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本数据（单细胞转录组数据） | 涉及多个实验室和技术的多个单细胞数据集，未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2026-06-29 |
Single-cell sequencing reveals SATB2/NOTCH1 signaling promotes the progression of malignancy of epithelial cells from papillary thyroid cancer
2024-01, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23631
PMID:37877736
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示SATB2/NOTCH1信号通路促进甲状腺乳头状癌上皮细胞恶性进展 | 首次利用单细胞RNA测序构建了新的甲状腺乳头状癌RNA表达谱，发现一个高度侵袭性的上皮细胞亚群，并证实SATB2/NOTCH1通路是导致该亚群高致癌性的关键机制 | 样本量较小，仅包含4例PTC患者和1例良性肿瘤患者，且缺乏功能验证实验的详细描述 | 探索甲状腺乳头状癌上皮细胞从良性向恶性转化的分子机制及关键调控通路 | 甲状腺乳头状癌患者和良性甲状腺肿瘤患者的组织样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 4例甲状腺乳头状癌患者和1例良性甲状腺肿瘤患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2026-06-26 |
Non-coding genome contribution to ALS
2024, International review of neurobiology
DOI:10.1016/bs.irn.2024.04.002
PMID:38802183
|
综述 | 总结非编码基因组在肌萎缩侧索硬化症（ALS）遗传风险中的作用，并强调细胞特异性功能注释的重要性 | 提出通过单细胞表观遗传图谱和空间转录组学改进细胞特异性基因组功能注释，以揭示非编码风险变异的功能，并解决编码与非编码变异之间的明显矛盾 | 未提供具体实验数据或样本分析，主要基于现有文献总结和理论推测 | 探索非编码基因组在ALS遗传病因学中的贡献，推动针对未解遗传因素的研究 | ALS疾病相关的非编码基因组变异及其在中枢神经系统细胞类型中的功能影响 | 自然语言处理 | 肌萎缩侧索硬化症 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 127 | 2026-06-26 |
Predictive biomarkers and initial analysis of maternal immune alterations in postpartum preeclampsia reveal an immune-driven pathology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380629
PMID:38745664
|
研究论文 | 本研究探讨产后子痫前期的母体免疫变化及其预测生物标志物，揭示免疫驱动的病理机制 | 首次在产后子痫前期患者诊断时进行单细胞转录组分析，发现胎盘CD163+细胞和孕早期血压作为预测生物标志物的潜力 | 样本采集时间点不一致（产后48小时至25天），且为初步研究，需要更大规模验证 | 理解产后子痫前期的免疫贡献及识别围产期预测生物标志物 | 产后子痫前期患者和正常妊娠女性的胎盘和血液样本 | 机器学习 | 妊娠期疾病 | 单细胞转录组学,流式细胞术,细胞内细胞因子染色,免疫组化 | NA | 文本,图像 | 产后子痫前期患者和正常妊娠对照组，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 128 | 2026-06-26 |
Protocol of a prospective multicenter study on comorbidity impact on multiple sclerosis and antibody-mediated diseases of the central nervous system (COMMIT)
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380025
PMID:39021565
|
研究论文 | 一项前瞻性多中心研究方案，探讨共病对多发性硬化及中枢神经系统抗体介导疾病的影响 | 首次系统研究血管共病对MS、NMOSD和MOGAD临床及旁临床参数的影响，结合多种先进技术进行标志物分析 | 未提及具体局限性 | 评估共病（尤其是血管共病）及相关风险因素对MS、NMOSD和MOGAD临床和旁临床参数的影响 | MS、NMOSD和MOGAD患者（有或无共病）以及健康对照者 | 机器学习 | 多发性硬化, 视神经脊髓炎谱系疾病, MOG抗体相关疾病 | 蛋白质组学、超敏ELISA、RT-qPCR、质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 外周血和脑脊液样本数据、OCT图像、MRI图像 | 多中心前瞻性研究，样本量未具体说明 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 129 | 2026-06-26 |
Dynamic immune status analysis of peripheral blood mononuclear cells in patients with Klebsiella pneumoniae bloodstream infection sepsis using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380211
PMID:38898888
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析肺炎克雷伯菌血流感染脓毒症患者外周血单个核细胞的动态免疫状态 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究肺炎克雷伯菌血流感染引起的脓毒症在急性期和恢复期外周血单个核细胞的免疫状态变化 | 样本量较小（共13名受试者），可能限制结果的一般性和统计效力 | 分析肺炎克雷伯菌血流感染脓毒症患者外周血单个核细胞在急性期和恢复期的免疫状态变化 | 外周血单个核细胞 | 机器学学习 | 肺炎克雷伯菌血流感染脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 13名受试者，包括3名健康对照、7名急性期患者（其中4名死亡）和3名恢复期患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2026-06-26 |
Distinct cuproptosis patterns in hepatocellular carcinoma patients correlate with unique immune microenvironment characteristics and cell-cell communication, contributing to varied overall survival outcomes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1379690
PMID:38868777
|
研究论文 | 探讨肝癌患者铜死亡模式与免疫微环境特征及细胞间通讯的关联，以及对总生存期的影响 | 首次揭示铜死亡相关基因在肝细胞癌中与免疫微环境和细胞间通讯的关联，并构建了基于铜死亡相关基因的预后风险模型 | 未提及具体局限性信息 | 探索肝细胞癌中细胞铜死亡与免疫微环境的相关性，为免疫治疗提供潜在见解 | 肝细胞癌患者的铜死亡相关基因表达、免疫微环境及细胞间通讯 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, LASSO Cox分析, WGCNA, 共识聚类 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库和GEO数据库的肝癌患者样本（具体数量未提及） | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq（推测） | TCGA和GEO数据库来源的测序数据， 平台细节未明确提供 |
| 131 | 2026-06-20 |
SORC: an integrated spatial omics resource in cancer
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad820
PMID:37811897
|
研究论文 | 开发了一个整合的癌症空间组学资源SORC，用于可视化和分析癌症空间转录组数据 | 首次构建了涵盖17种癌症类型、269个切片共计722,899个点的综合空间组学资源，并整合了匹配的单细胞RNA-seq数据，提供五大分析模块 | 未明确提及局限性 | 提供一个全面的空间解析癌症细胞图谱，增强对肿瘤微环境的理解 | 17种癌症类型的空间转录组数据集，包括722,899个点、269个切片，以及匹配的334,379个单细胞和46种细胞类型 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 269个切片、722,899个点、334,379个单细胞、46种细胞类型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-06-20 |
CellSTAR: a comprehensive resource for single-cell transcriptomic annotation
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad874
PMID:37855686
|
研究论文 | CellSTAR是一个全面的单细胞转录组注释资源数据库，整合了 expertly 注释的参考数据和数万个标记基因，用于细胞类型注释 | 首次提供涵盖数百种细胞类型的综合专家注释参考数据，并整合了参考数据和标记基因的集体考量 | 无可用信息 | 开发一个全面的单细胞转录组注释资源数据库，支持细胞类型注释和细胞异质性研究 | 单细胞转录组数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | 无可用信息 | 单细胞转录组测序 | NA | 文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2026-06-20 |
CellCommuNet: an atlas of cell-cell communication networks from single-cell RNA sequencing of human and mouse tissues in normal and disease states
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad906
PMID:37850657
|
research paper | CellCommuNet是一个综合性数据资源，用于探索人类和小鼠组织在正常和疾病状态下单细胞RNA测序数据中的细胞间通信网络 | 首次构建了包含376个单数据集和118个疾病与正常样本比较数据集的细胞间通信网络图谱，提供交互式图形展示和差异分析功能 | NA | 建立全面的细胞间通信网络数据库，促进生物学研究 | 人类和小鼠组织在正常和疾病状态下的单细胞RNA测序数据 | machine learning | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 376个单数据集和118个比较数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2026-06-19 |
DiSignAtlas: an atlas of human and mouse disease signatures based on bulk and single-cell transcriptomics
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad961
PMID:37930831
|
研究论文 | DiSignAtlas是一个整合人类和小鼠多种疾病转录组特征的综合数据库，提供基于批量与单细胞测序数据的疾病分子标志物资源 | 首次构建覆盖1836种疾病类型、包含181434个转录组图谱和10306个比较数据集的大型跨物种疾病特征数据库，并整合单细胞RNA测序数据与多维度分析工具 | 未提及数据库的更新频率及用户自定义分析功能的支持程度 | 构建全面的人类和小鼠疾病转录组特征资源库，支持生物标志物发现与转化研究 | 人类和小鼠的1836种非冗余疾病类型的转录组数据 | 生物信息学 | 多疾病类型 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 181434个转录组图谱，包括328个单细胞RNA测序数据集，包含疾病组与对照组 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2026-06-19 |
SCAN: Spatiotemporal Cloud Atlas for Neural cells
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad895
PMID:37930842
|
研究论文 | 构建了一个名为SCAN的神经网络细胞时空云图谱数据库，整合并分析了神经系统的高质量单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 首次系统整合了超过1000万个细胞的神经系统中单细胞RNA测序和空间转录组数据，覆盖900多个物种并包含100多种神经系统疾病数据，创建了交互式数据库SCAN | 未提及 | 构建神经系统的时空云图谱数据库，以促进神经科学研究和神经系统疾病诊断策略开发 | 神经系统的单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病、帕金森病、唐氏综合征 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 10679684个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 136 | 2026-06-18 |
Multipotent progenitors instruct ontogeny of the superior colliculus
2024-01-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.009
PMID:38096816
|
研究论文 | 通过MADM-CloneSeq技术分析小鼠上丘的发育谱系，揭示径向胶质前体细胞的多能性及PTEN依赖的细胞类型比例调控机制 | 首次在单细胞水平建立哺乳动物上丘发育的谱系框架，发现单个径向胶质前体细胞可产生所有兴奋性和抑制性神经元类型，并揭示PTEN信号调控不同神经元类型的适当比例 | 未明确说明实验样本量大小及是否涵盖所有上丘区域或发育阶段 | 阐明哺乳动物上丘细胞类型多样性的发育原理 | 小鼠上丘的径向胶质前体细胞及其产生的兴奋性和抑制性神经元与胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 遗传镶嵌分析, MADM-CloneSeq | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | MADM-CloneSeq（基于遗传镶嵌分析与双标记的单细胞克隆分析） |
| 137 | 2026-06-18 |
STOmicsDB: a comprehensive database for spatial transcriptomics data sharing, analysis and visualization
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad933
PMID:37953328
|
研究论文 | 介绍STOmicsDB，一个综合性的空间转录组学数据库，用于数据共享、分析和可视化 | 整合218个手工整理的数据集，涵盖17个物种，并支持用户自定义子数据库和快速可视化百万细胞 | 未明确说明局限性，但可能依赖手动整理数据集的完整性和覆盖范围 | 为空间转录组学数据提供一站式共享、分析和可视化平台 | 空间转录组学数据集（218个数据集，涵盖17个物种） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 218个数据集，涵盖17个物种 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2026-06-18 |
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1063
PMID:37953308
|
研究论文 | StemDriver是一个综合性知识库，致力于功能注释参与造血干细胞命运决定的基因 | 利用单细胞RNA测序数据构建了完整的造血谱系图谱，并提供了标准化的数据分析流程 | 当前版本仅整合了42项研究数据，覆盖14种组织类型，可能未涵盖所有相关数据 | 为参与造血干细胞命运决定的基因提供功能注释和参考数据集 | 造血干细胞和成熟细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类样本23,839个基因，小鼠样本29,533个基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2026-06-18 |
Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of the TLR9 agonist CpG to stimulate CD8 T cells in an autochthonous mouse model of sarcoma
2024-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.03.573968
PMID:38260522
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研究论文 | 通过瘤内注射TLR9激动剂CpG增强自发性肉瘤小鼠模型对放疗的应答 | 首次在自发性肉瘤模型中验证CpG联合放疗对CD8 T细胞的依赖性机制，并结合CRISPR/Cas9和化学致癌物MCA构建高肿瘤突变负担模型 | 未在人体临床试验中验证，且机制研究主要基于小鼠模型 | 探究TLR9激动剂CpG增强放疗对软组织肉瘤的免疫应答机制 | 自发性软组织肉瘤小鼠模型 | 机器学习 | 软组织肉瘤 | CRISPR/Cas9, 化学诱导, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 质谱流式数据 | 自发性肉瘤小鼠模型，具体数量未在摘要中给出 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptome atlas of peripheral immune features to Omicron breakthrough infection under booster vaccination strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460442
PMID:39835127
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序，揭示了加强免疫策略下Omicron突破感染的外周免疫特征 | 首次在单细胞水平系统解析Omicron突破感染后的免疫特征，发现加强疫苗诱导的积极抗病毒潜力以及第四剂吸入式Ad5-nCoV可能引发的“训练免疫”现象 | NA | 研究加强疫苗接种策略下Omicron突破感染的外周免疫特征 | 15例外周血单核细胞（PBMC）样本，包括Omicron感染者和未感染但加强免疫的对照 | 单细胞转录组学 | Omicron突破感染 | 单细胞RNA测序，T细胞/B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，TCR/BCR测序数据 | 15例外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞TCR/BCR测序 | NA | NA |