单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 1361 - 1380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals that the immunosuppression landscape induced by chronic stress promotes colorectal cancer metastasis
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23552
PMID:38169984
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研究论文 | 本研究通过建立慢性不可预测轻度应激（CUMS）和原位结直肠癌的复合小鼠模型，利用10✕Genomics单细胞转录组测序技术，揭示了慢性应激状态下肿瘤免疫细胞趋向于更抑制和耗竭的状态，并描述了整体炎症环境与免疫抑制景观之间的相互作用。 | 首次揭示了慢性应激诱导的免疫抑制环境促进结直肠癌转移的机制，并提供了针对伴有抑郁症的结直肠癌患者的免疫治疗新策略。 | NA | 研究慢性应激对结直肠癌免疫微环境的影响及其对肿瘤进展的作用。 | 慢性应激状态下的小鼠结直肠肿瘤样本。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 8只小鼠的肿瘤样本，近30,000个细胞 |
| 1362 | 2024-08-05 |
Exploring the relationship between immune heterogeneity characteristic genes of rheumatoid arthritis and acute myeloid leukemia
2024-Jan-02, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00852-7
PMID:38165493
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研究论文 | 本研究探讨了类风湿关节炎的免疫异质性特征基因与急性髓系白血病之间的关系 | 该文章揭示了类风湿关节炎特征基因与急性髓系白血病的关联，提供了肉芽肿标记物的新见解 | 研究可能受限于获取的数据样本和数据库的限制 | 旨在通过RA研究发现AML的骨髓生物标志物 | 研究对象包括类风湿关节炎患者的滑膜转录组数据和急性髓系白血病患者的骨髓测序数据 | 数字病理学 | 类风湿关节炎, 急性髓系白血病 | 单细胞测序, 转录组测序 | 随机森林分类器 | 基因组数据 | NA |
| 1363 | 2024-08-05 |
Single-cell Transcriptomic Analysis Reveals an Immunosuppressive Network Between POSTN CAFs and ACKR1 ECs in TKI-resistant Lung Cancer
2024 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20430
PMID:38151287
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了TKI耐药性肺癌中POSTN CAFs与ACKR1 ECs之间的免疫抑制网络 | 首次探讨了TKI治疗中血管内皮细胞与癌相关成纤维细胞亚群的关系 | 未能详细探讨不同CAF和EC亚群在其他癌症中的作用 | 探讨非小细胞肺癌中TKI治疗耐药的机制 | 47个不同阶段的非小细胞肺癌组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | RNA数据 | 49个晚期非小细胞肺癌样本 |
| 1364 | 2024-08-07 |
Identification of basement membrane-related signatures for estimating prognosis, immune infiltration landscape and drug candidates in pancreatic adenocarcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.89665
PMID:38169540
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA数据库中的数据，构建了与基底膜（BM）相关的基因风险评分系统，用于评估胰腺腺癌（PAAD）患者的预后、免疫浸润景观和潜在药物候选物 | 本研究首次开发了一种与基底膜相关的基因签名，为PAAD的诊断、预后评估、候选药物和治疗管理提供了新的见解和靶点 | NA | 探索基底膜相关基因在评估胰腺腺癌患者预后、微环境和治疗反应中的作用 | 胰腺腺癌（PAAD）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单变量和LASSO Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA数据库中的数据 |
| 1365 | 2024-08-07 |
Identification of a PANoptosis-related Gene Signature for Predicting the Prognosis, Tumor Microenvironment and Therapy Response in Breast Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.90113
PMID:38169571
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研究论文 | 本研究通过Cox回归分析、随机森林算法和LASSO算法识别了与PANoptosis相关的基因特征，用于预测乳腺癌的预后、肿瘤微环境和治疗反应 | 首次构建了基于PANoptosis相关评分的精确预测模型，并揭示了PANoptosis相关基因特征在调节乳腺癌肿瘤微环境和药物敏感性的重要性 | NA | 探索PANoptosis在乳腺癌中的作用，并开发预测乳腺癌预后和治疗反应的生物标志物 | 乳腺癌患者的PANoptosis相关基因特征及其对预后、肿瘤微环境和治疗反应的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 随机森林算法、LASSO算法、RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | 涉及大量RNA和单细胞RNA测序数据 |
| 1366 | 2024-08-05 |
Integrating Single-cell and Bulk RNA-seq to Construct a Metastasis-related Model for Evaluating Immunotherapy and Chemotherapy in Uveal Melanoma
2024-Jan-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本文探讨了原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤的异质性，并构建了一个与转移相关的模型。 | 通过整合单细胞和大规模RNA测序数据，发现了调控UM转移的潜在分子并建立了预后模型。 | 未提及该研究的具体限制。 | 改进转移性葡萄膜黑色素瘤患者的精准治疗。 | 焦点是原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤及其细胞类型。 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA-seq | LASSO和Cox回归分析 | 基因表达数据 | 包含157个转录差异基因 |
| 1367 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Role of Cancer-associated Fibroblasts in Skin Melanoma
2024-Jan-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据揭示了皮肤黑色素瘤中癌症相关成纤维细胞的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了癌症相关成纤维细胞在皮肤黑色素瘤中的分子机制 | 研究仅基于三个病例的单细胞RNA测序数据，可能存在样本量不足的问题 | 揭示癌症相关成纤维细胞在皮肤黑色素瘤中的作用及其分子机制 | 皮肤黑色素瘤中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个皮肤黑色素瘤病例 |
| 1368 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics and chromatin accessibility profiling elucidate the kidney-protective mechanism of mineralocorticoid receptor antagonists
2024-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157165
PMID:37906287
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学和染色质可及性分析来阐明矿物皮质激素受体拮抗剂的肾脏保护机制 | 研究揭示了矿物皮质激素的靶基因和细胞类型，以及不同拮抗剂在高血压和心肾损伤模型中的保护作用 | 主要在大鼠模型中进行研究，可能在临床应用上存在局限性 | 探讨矿物皮质激素受体拮抗剂对高血压相关肾病的保护机制 | 矿物皮质激素拮抗剂及其在大鼠模型中的应用 | 数字病理学 | 高血压相关肾病 | 单细胞表达分析和染色质可及性分析 | 大鼠模型 | 基因表达数据，细胞类型数据 | 大鼠模型，样本数量未具体说明 |
| 1369 | 2024-08-07 |
Establishment and characterization of a recurrent malignant peripheral nerve sheath tumor cell line: RsNF
2024-Jan, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-023-01000-7
PMID:37938540
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研究论文 | 本文建立并描述了一种复发性恶性周围神经鞘瘤细胞系RsNF，该细胞系源自NF1患者，并通过全外显子测序检测到NF1和SUZ12体细胞突变。 | 通过肿瘤分子标记物靶向测序和单细胞转录组测序，发现该细胞系中染色体7的拷贝数变异增加，并过度表达ZNF804B和EGFR等基因。 | NA | 研究恶性周围神经鞘瘤的肿瘤异质性并开发多样化的治疗选择。 | 复发性恶性周围神经鞘瘤细胞系RsNF。 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 单个细胞系 |
| 1370 | 2024-08-05 |
Integrative analysis reveals chemokines CCL2 and CXCL5 mediated shear stress-induced aortic dissection formation
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23312
PMID:38163105
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研究论文 | 本研究通过定量生物信息学分析探讨了与剪切应力相关的主动脉夹层形成中的关键分子 | 通过整合分析确定了与剪切应力相关的核心AD差异基因及其潜在治疗剂 | 本研究未能完全阐明剪切应力对主动脉夹层的所有影响机制 | 探讨剪切应力诱导的主动脉夹层形成过程中关键分子的作用 | 主要研究与剪切应力诱导的主动脉夹层相关的化学因子和基因 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | RNA测序 | 无具体模型类型提及 | 基因表达数据 | 分析三个数据集的临床样本及公共RNA测序数据库，共计367个基因 |
| 1371 | 2024-08-05 |
Enhancing Spatial Transcriptomics Analysis by Integrating Image-Aware Deep Learning Methods
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160299
|
研究论文 | 本文章提出了一种新方法，通过整合空间转录组学和组织病理图像数据，以捕捉患者数据中的生物学意义模式 | 整合空间转录组学与组织病理图像数据的新方法，强调了图像感知深度学习在肿瘤分析中的应用 | 没有提到具体的局限性 | 研究如何使用深度学习技术更好地分析空间转录组学数据 | 针对高度侵袭性的癌症类型，如胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤，三阴性乳腺癌 | 深度学习 | ResNet | 图像，基因表达数据 | 未提及样本量 |
| 1372 | 2024-08-07 |
Isolation and functional identification of immune cells in hemolymph of blood clams Tegillarca granosa
2024-Jan, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.109320
PMID:38122950
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，对血蛤Tegillarca granosa的血液细胞进行了分子层面的分类和功能鉴定 | 首次报道了血蛤Tegillarca granosa免疫细胞的分离和鉴定，为理解其免疫防御机制提供了新视角 | NA | 旨在深入研究红血软体动物的先天免疫系统 | 血蛤Tegillarca granosa的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1373 | 2024-08-07 |
Profiling joint tissues at single-cell resolution: advances and insights
2024-Jan, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-023-01052-x
PMID:38057475
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞分辨率下对人类关节组织进行分析的进展及其对健康和疾病中这些组织的结构和功能的洞察 | 通过单细胞RNA测序和时间飞行流式细胞术等技术，识别了构成关节组织的不同亚群，并构建了关节组织的单细胞图谱 | NA | 旨在揭示关节组织在健康和疾病中的组织和功能，并探索潜在的治疗靶点 | 关节组织，包括软骨、骨和滑膜 | 数字病理学 | 骨关节炎，类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序，时间飞行流式细胞术 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未提及 |
| 1374 | 2024-08-05 |
Translatome Profiling of Tissue-Resident Macrophages Using the RiboTag Approach
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3437-0_17
PMID:37639128
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研究论文 | 本文讨论了一种新的方法RiboTag，用于从粗糙的组织提取物中获取组织驻留巨噬细胞的转录组。 | 提出了RiboTag方法，可以避免传统细胞分离中的偏差和伪影 | 只集中于脑巨噬细胞的研究，没有涉及其他类型的组织巨噬细胞 | 探索RiboTag方法在组织驻留巨噬细胞研究中的应用 | 脑巨噬细胞，包括小胶质细胞和边界相关细胞 | 数字病理学 | NA | RiboTag | NA | 转录组 | NA |
| 1375 | 2024-08-07 |
Hemocyte Nuclei Isolation from Adult Drosophila melanogaster for snRNA-seq
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3437-0_4
PMID:37639115
|
研究论文 | 本文提供了一种从成年果蝇中分离血细胞核用于单核RNA测序（snRNA-seq）的详细方案 | 首次提供了从成年果蝇血细胞中分离核用于snRNA-seq的具体方法 | NA | 研究果蝇血细胞在不同实验条件下的功能和特性 | 成年果蝇的血细胞核 | NA | NA | snRNA-seq | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 1376 | 2024-08-05 |
Computational immunogenomic approaches to predict response to cancer immunotherapies
2024-Jan, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-023-00830-6
PMID:37907723
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综述 | 本文综述了用于分析癌症免疫治疗反应的计算免疫基因组方法 | 提出了新颖的计算方法和机器学习算法，以从基因组和转录组测序数据中提取临床有用的信息 | 未能充分探讨计算方法和测序技术在改善癌症患者管理中的真实潜力和局限性 | 研究计算免疫基因组方法在癌症免疫疗法中的应用与影响 | 主要研究肿瘤、基质及免疫细胞的基因组和转录组数据 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞转录组测序和多组学方法 | 机器学习算法 | 基因组和转录组数据 | 涉及多种癌症类型的大规模基因组数据 |
| 1377 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling Indicates a Proinflammatory Role of Meningeal Ectopic Lymphoid Tissue in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
2024-Jan, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200185
PMID:38100739
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，比较了脑膜异位淋巴组织（mELT）与次级淋巴器官（SLOs）在自发性慢性实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的基因表达谱，揭示了mELT在多发性硬化症进展中的关键作用 | 首次揭示了脑膜异位淋巴组织（mELT）在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的促炎作用，并提出了mELT可能是中枢神经系统炎症的关键驱动因素 | 研究仅限于动物模型，尚未在人类多发性硬化症患者中验证 | 探究多发性硬化症进展的机制及如何预防 | 脑膜异位淋巴组织（mELT）与次级淋巴器官（SLOs）中的免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1378 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 receptor ACE2 is upregulated by fatty acids in human MASH
2024-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100936
PMID:38074511
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研究论文 | 本文研究了代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中SARS-CoV-2受体ACE2的表达及其细胞来源 | 首次揭示了脂肪酸在人类MASLD中上调ACE2表达的现象 | NA | 探讨MASLD患者中SARS-CoV-2受体ACE2的表达水平及其细胞来源 | 人类MASLD患者的肝脏组织 | NA | 脂肪性肝病 | 转录组学, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 图像 | 243个MASLD样本, 161个纤维炎症性肝病样本, 9个脂肪肝样本, 7个对照样本, 5个肝硬化样本, 14个正常肝脏样本, 745个初级细胞样本 |
| 1379 | 2024-08-05 |
TTC22 as a potential prognostic marker and therapeutic target in pancreatic cancer: Insights into immune infiltration and epithelial‑mesenchymal transition
2024-Jan, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2023.14143
PMID:38034483
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研究论文 | 本文探讨了TTC22在胰腺癌中的潜在预后标志物和治疗靶点的作用 | 首次揭示了TTC22在胰腺癌中的表达与临床参数及免疫浸润的负相关性 | 尚需进一步研究以明确TTC22在胰腺癌中的确切作用 | 研究TTC22在胰腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 主要研究胰腺癌及其相关细胞系中的TTC22表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 临床数据和细胞系数据 | NA |
| 1380 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals SATB2/NOTCH1 signaling promotes the progression of malignancy of epithelial cells from papillary thyroid cancer
2024-Jan, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23631
PMID:37877736
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研究论文 | 这篇文章揭示了SATB2/NOTCH1信号通路促进乳头状甲状腺癌上皮细胞恶性进展的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SATB2与NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌中的作用及其与恶性转变的关系 | 样本量仅限于五名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨SATB2和NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌进展中的作用 | 四名乳头状甲状腺癌患者和一名良性甲状腺肿瘤患者的样本 | 数字病理学 | 乳头状甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 五名患者（包括两名乳头状甲状腺微癌患者、两名侵袭性Advanced PTC患者和一名良性甲状腺肿瘤患者） |