单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1390 篇文献，本页显示第 1341 - 1360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2024-08-05 |
ImmunoPET imaging of Trop2 expression in solid tumors with nanobody tracers
2024-Jan, European journal of nuclear medicine and molecular imaging
IF:8.6Q1
DOI:10.1007/s00259-023-06454-3
PMID:37792026
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研究论文 | 本文研究了使用纳米抗体探针在固体肿瘤中进行Trop2表达的免疫正电子发射成像（immunoPET） | 构建了特异性针对Trop2的免疫PET探针，并评估了其在前临床胰腺癌和胃癌模型中的诊断能力 | 文中未提及样本量的具体大小及其对结果的影响 | 评估Trop2在胰腺癌和胃癌中的表达及其作为靶向治疗的潜力 | 胰腺癌细胞系及其相关患者来源的胃癌模型 | 数字病理学 | 胰腺癌，胃癌 | 免疫正电子发射成像（immunoPET） | NA | 组织微阵列，单细胞测序 | 未明确提及具体样本量 |
| 1342 | 2024-08-07 |
Altered bile acid metabolism in skin tissues in response to ionizing radiation: deoxycholic acid (DCA) as a novel treatment for radiogenic skin injury
2024, International journal of radiation biology
IF:2.1Q2
DOI:10.1080/09553002.2023.2245461
PMID:37540505
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研究论文 | 研究放射性皮肤损伤（RSI）中胆汁酸（BAs）及其衍生物的代谢变化，并探讨去氧胆酸（DCA）作为治疗RSI的新疗法 | 发现放射性皮肤损伤中胆汁酸代谢的显著变化，并证实去氧胆酸（DCA）具有促进伤口愈合和减轻表皮增生的作用 | NA | 探究放射性皮肤损伤中胆汁酸及其衍生物的代谢变化 | 放射性皮肤损伤中的胆汁酸代谢 | NA | NA | 液相色谱-质谱联用（LC-MS），单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 大鼠皮肤组织，放射性皮肤损伤的人类和动物模型 |
| 1343 | 2024-08-07 |
Decreased CNNM2 expression in prefrontal cortex affects sensorimotor gating function, cognition, dendritic spine morphogenesis and risk of schizophrenia
2024-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-023-01732-y
PMID:37715107
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联研究（GWAS）和数量性状位点（QTL）分析，发现CNNM2基因在额叶皮层中的表达降低影响感觉运动门控功能、认知、树突棘形态发生以及精神分裂症的风险 | 首次揭示CNNM2基因在精神分裂症发病机制中的重要作用，并通过小鼠模型和蛋白质组学分析验证了其与精神分裂症内表型的关联 | NA | 旨在识别与精神分裂症风险相关的基因，并探讨其分子机制 | CNNM2基因在额叶皮层中的表达及其对感觉运动门控功能、认知和树突棘形态发生的影响 | 神经科学 | 精神分裂症 | 全基因组关联研究（GWAS）、数量性状位点（QTL）分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 使用PsychENCODE、ROSMAP和Banner数据库中的额叶皮层表达QTL（eQTL）和蛋白质QTL（pQTL）数据集 |
| 1344 | 2024-08-07 |
Single-Cell Mapping of Brain Myeloid Cell Subsets Reveals Key Transcriptomic Changes Favoring Neuroplasticity after Ischemic Stroke
2024-Jan, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01109-7
PMID:37755676
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，描绘了脑缺血后梗死周边区域的免疫细胞组成和转录特征，揭示了微胶质细胞和单核细胞衍生巨噬细胞在促进神经再生中的作用 | 首次详细描述了脑缺血后梗死周边区域免疫细胞的单细胞转录组特征，特别是微胶质细胞和单核细胞衍生巨噬细胞在神经再生中的作用 | NA | 探究脑缺血后免疫细胞在促进神经可塑性和神经再生中的作用 | 脑缺血后梗死周边区域的免疫细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 1345 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of necroptosis related gene signature to predict clinical outcomes, immune status and drug sensitivity in lower grade Glioma
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23947
PMID:38192784
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研究论文 | 本研究开发了一种可靠的坏死性凋亡相关基因特征，以预测低级别胶质瘤患者的预后 | 首次建立了基于坏死性凋亡相关基因的风险评分模型，揭示了其在低级别胶质瘤中的作用 | 未详细探讨坏死性凋亡在所有低级别胶质瘤中的作用机制 | 研究坏死性凋亡相关基因在低级别胶质瘤中的预后和免疫状态的影响 | 低级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | 基因表达分析、功能富集分析、共识聚类分析、单细胞测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 七个预后机械基因的样本 |
| 1346 | 2024-08-07 |
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1063
PMID:37953308
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研究论文 | StemDriver是一个专注于血液干细胞命运决定中基因功能注释的综合知识库 | 利用单细胞RNA测序数据成功构建了从血液干细胞初始形成到成熟细胞的全面谱系图，并进行了广泛的基因表达特征探索和表征 | NA | 构建一个全面的知识库，用于血液干细胞命运决定中基因功能的注释 | 血液干细胞命运决定中的基因功能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涵盖42项研究，包括从胚胎期到成年的14种组织类型，评估了23,839个人类样本基因和29,533个鼠样本基因 |
| 1347 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals ferrimagnetic vortex iron oxide nanoring-mediated mild magnetic hyperthermia exerts antitumor effects by alleviating macrophage suppression in breast cancer
2024-Jan, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115954
PMID:38039753
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研究论文 | 该文章探讨了铁氧体旋涡铁氧化物纳米环介导的温和磁热疗法（FVIO-MHT）对乳腺癌肿瘤微环境的影响 | 本研究利用单细胞转录组测序揭示FVIO-MHT通过改善巨噬细胞的抑制作用来增强抗肿瘤效果 | 研究未明确揭示FVIO-MHT在其他类型肿瘤微环境中的影响 | 研究FVIO-MHT在乳腺癌治疗中的潜力及其对肿瘤微环境的影响 | 主要集中在乳腺癌的肿瘤微环境及巨噬细胞的变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | NA |
| 1348 | 2024-08-07 |
Patch-seq: Multimodal Profiling of Single-Cell Morphology, Electrophysiology, and Gene Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3621-3_15
PMID:38194038
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研究论文 | 本文介绍了Patch-seq技术，该技术结合了全细胞膜片钳记录、免疫组织化学和单细胞RNA测序，用于全面分析单细胞的形态学、电生理学和转录组学特征 | Patch-seq技术首次实现了对单细胞多模态特征的综合分析，包括形态学、电生理学和基因表达模式 | NA | 探索细胞间丰富的多维表型变异，并在单细胞水平上直接关联基因表达与表型 | 单细胞的形态学、电生理学和基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 形态学、电生理学和转录组数据 | 单个细胞 |
| 1349 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-Jan-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:38193716
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研究论文 | 研究了蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）靶向治疗在套细胞淋巴瘤（MCL）中的抗药性问题 | 发现mTOR信号通路的激活是PRMT5抑制剂抗药性的关键因素，并验证了mTORC1抑制剂temsirolimus在克服PRMT5抑制剂抗药性中的疗效 | 研究主要基于细胞系和患者来源的异种移植（PDX）模型，需要进一步的临床试验验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的抗药性机制及潜在的克服策略 | 套细胞淋巴瘤细胞系和患者来源的异种移植模型 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个，初级抗性细胞系4个，抗性PDX模型若干 |
| 1350 | 2024-08-07 |
Adverse effects of gestational diabetes mellitus on fetal monocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108637
PMID:38188508
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康母亲和妊娠糖尿病（GDM）母亲胎儿脐带血单核细胞的转录组数据，揭示了GDM对胎儿单核细胞的不良影响。 | 首次揭示了GDM母亲胎儿脐带血中单核细胞的特征性变化，包括炎症相关通路下调和增殖相关通路上调，以及CXCL8+IL1B+亚群的扩增和功能增强。 | 研究仅限于脐带血单核细胞的分析，未涉及其他组织或细胞类型，可能需要进一步研究以全面理解GDM对胎儿的影响。 | 探讨妊娠糖尿病对胎儿单核细胞的影响及其潜在机制。 | 健康母亲和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞。 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括健康和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞，以及儿童和青少年外周血单核细胞和动脉粥样硬化斑块中的髓样细胞。 |
| 1351 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency
2024-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16487
PMID:37794835
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了豌豆芽发育及细胞类型特异性响应硼缺乏的情况 | 相较于传统的整体组织RNA测序分析，本研究能够捕捉到细胞类型特异性的响应，揭示了硼缺乏对植物生理响应的重要性 | NA | 旨在理解营养胁迫如何影响植物生长，并探索提高作物在营养限制条件下产量的方法 | 豌豆芽的发育及对硼缺乏的细胞类型特异性响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 豌豆芽的顶端细胞 |
| 1352 | 2024-08-07 |
Author Correction: Longitudinal scRNA-seq analysis in mouse and human informs optimization of rapid mouse astrocyte differentiation protocols
2024-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01531-0
PMID:37996532
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1353 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of zebrafish brain reveals adverse effects of manganese on neurogenesis
2024-Jan-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2023.122908
PMID:37952916
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研究论文 | 本文探讨了锰对斑马鱼大脑神经发生的影响及其机制 | 本研究首次揭示了不同浓度锰暴露对斑马鱼大脑神经发生的促进与抑制作用 | 本研究仅在斑马鱼模型中进行，是否适用于其他物种尚未确定 | 研究锰暴露对神经发生影响的具体机制 | 斑马鱼大脑的神经细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 正常组和锰暴露组的斑马鱼大脑样本 |
| 1354 | 2024-08-05 |
STOmicsDB: a comprehensive database for spatial transcriptomics data sharing, analysis and visualization
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad933
PMID:37953328
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研究论文 | 这篇文章介绍了STOmicsDB，一个提供空间转录组数据共享、分析和可视化的综合数据库 | STOmicsDB集成了218个手动筛选的数据集，并提供了可定制的子数据库功能，以增强数据的可重用性和互操作性 | 尚未提及具体的限制 | 旨在促进空间转录组数据的共享和分析 | 规则和分析空间转录组数据集，以揭示细胞类型和空间区域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 数据集 | 包含218个数据集，代表17种物种 |
| 1355 | 2024-08-07 |
Author Correction: Spatial transcriptomics uncover sucrose post-phloem transport during maize kernel development
2024-Jan-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44536-w
PMID:38177159
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1356 | 2024-08-05 |
ITGB4 upregulation is associated with progression of lower grade glioma
2024-01-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-49801-y
PMID:38172503
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研究论文 | 研究表明ITGB4在低级别神经胶质瘤中上调，并且能准确预测其预后 | ITGB4被发现是一个良好预测低级别神经胶质瘤预后的风险因素，并且与免疫相关基因密切相关 | 该研究未详细探讨ITGB4在神经胶质瘤中的具体机制 | 揭示ITGB4在低级别神经胶质瘤中的作用和其与预后的关系 | 研究对象为低级别神经胶质瘤患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 免疫组化分析、单细胞测序分析、非负矩阵分解聚类分析 | Cox回归模型 | 肿瘤组织样本 | 研究中涉及的样本数量未明确说明 |
| 1357 | 2024-08-07 |
Predicting cell types with supervised contrastive learning on cells and their types
2024-01-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50185-2
PMID:38172501
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研究论文 | 本文提出了一种基于监督对比学习的细胞类型注释新模型SCLSC，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型预测 | SCLSC模型采用实例-类型对的对比学习方法，不同于以往实例-实例对的对比学习，提高了细胞类型预测的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督对比学习 | 基因表达数据 | 大量细胞 |
| 1358 | 2024-08-05 |
Upregulated PPP1R14B is connected to cancer progression and immune infiltration in kidney renal clear cell carcinoma
2024-Jan, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03228-z
PMID:37261660
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研究论文 | 本研究探讨了PPP1R14B在肾透明细胞癌中的预后和发展作用 | 发现PPP1R14B在KIRC中上调并作为独立风险因素，与肿瘤浸润免疫细胞相关 | 研究仅基于TCGA和ICGC队列，未包括不同患者群体的样本 | 确定PPP1R14B是否可以作为KIRC的预后生物标志物 | 肾透明细胞癌(KIRC)患者的样本 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA-seq | NA | 生物样本 | 使用了TCGA和ICGC队列中的患者样本及我们的临床样本 |
| 1359 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analysis decodes the kidney microenvironment induced by polystyrene microplastics in mice receiving a high-fat diet
2024-Jan-03, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-023-02266-7
PMID:38167034
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研究论文 | 本研究揭示了聚苯乙烯微塑料和高脂饮食诱导的小鼠肾脏微环境单细胞转录组特征 | 首次系统性揭示了聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏细胞和免疫细胞的分子变化 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 研究聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏发展的影响 | 聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏微环境的影响 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35天的高脂饮食和继续暴露于聚苯乙烯微塑料的小鼠模型 |
| 1360 | 2024-08-07 |
HSV1 microRNAs in glioblastoma development: an in silico study
2024-01-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-45249-2
PMID:38167429
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研究论文 | 本研究通过计算方法探讨HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用 | 首次研究HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用，并揭示其在肿瘤抑制基因和致癌基因表达调控中的潜在影响 | 仅通过计算方法进行研究，未进行实验验证 | 探讨HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用及其对肿瘤抑制基因和致癌基因表达的影响 | HSV1编码的microRNAs及其在胶质母细胞瘤发展中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE158284、GSE153679和GSE182109数据集，具体样本数量未详细说明 |