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当前共找到 1392 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2024-08-05 |
CROST: a comprehensive repository of spatial transcriptomics
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad782
PMID:37791883
|
研究文章 | 本文介绍了CROST，一个综合的空间转录组数据库 | 建立了一个包括182个空间转录组数据集的数据库，并提供在线工具供用户分析数据 | 当前数据库的可用性有限，可能无法涵盖所有相关数据 | 旨在提供一个全面的平台来访问和分析空间转录组数据 | 涉及来自不同物种、器官和疾病的高质量空间转录组样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 包含182个空间转录组数据集和1033个子数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1322 | 2024-08-07 |
scPlantDB: a comprehensive database for exploring cell types and markers of plant cell atlases
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad706
PMID:37638765
|
research paper | 本文介绍了一个名为scPlantDB的植物单细胞数据库的构建方法 | scPlantDB整合了来自17种植物的67个高质量数据集，约250万个细胞的单细胞转录组数据，提供了单细胞水平的基因表达交互可视化 | NA | 构建一个全面的植物单细胞数据库，以探索植物细胞图谱中的细胞类型和标记 | 植物细胞类型和标记 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 约250万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1323 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing Constructs a Predictive Model of Key Genes in Multiple Sclerosis and Explores Molecular Mechanisms Related to Cellular Communication
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S442684
PMID:38226354
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和转录组测序构建了多发性硬化症中关键基因的预测模型，并探索了与细胞通信相关的分子机制 | 创新点在于通过单细胞分析与转录组数据相结合，发现新的关键基因并构建了有效的预测模型 | 本研究的样本数量和数据来源可能限制了结果的普遍性 | 研究旨在为多发性硬化症的早期诊断和治疗提供新的生物标志物和机制理解 | 研究对象是多发性硬化症患者的基因表达和免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序和转录组测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 从基因表达综合数据库中获取的多发性硬化症患者基因表达谱 | NA | NA | NA | NA |
| 1324 | 2024-08-05 |
Exploring the efficacious constituents and underlying mechanisms of sini decoction for sepsis treatment through network pharmacology and multi-omics
2024-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2023.155212
PMID:38029626
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研究论文 | 本研究通过网络药理学分析探讨了传统中药处方四逆汤在治疗脓毒症的治疗机制 | 研究首次识别CX3CR1作为影响脓毒症预后的关键分子，并揭示了四逆汤活性成分通过相关途径调节血红素代谢、减少炎症和改善免疫功能的机制 | 研究可能存在个体差异对四逆汤效果的影响，且未完全阐明所有机制 | 探讨四逆汤在治疗脓毒症中的治疗机制 | 以脓毒症患者为研究对象，分析其基因表达和免疫细胞相互作用 | 数字病理学 | 脓毒症 | 网络药理学，单细胞测序 | 无监督聚类分析 | 基因表达数据，药物成分数据 | 脓毒症患者的多个基因模块和免疫细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 1325 | 2024-08-07 |
T proliferating cells derived autophagy signature associated with prognosis and immunotherapy resistance in a pan-cancer analysis
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108701
PMID:38222108
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研究论文 | 本研究通过手动整理自噬基因集，并在TCGA队列中比较恶性组织和正常组织，定义了一个泛癌自噬特征，该特征源自T增殖细胞，并通过多个单细胞RNA测序数据集进行验证 | 首次揭示了泛癌自噬特征与免疫治疗抵抗和预后之间的关系，并探讨了其在肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | NA | 探讨自噬特征在泛癌中的免疫治疗预测作用及其机制调控 | 泛癌自噬特征及其与免疫治疗抵抗和预后的关联 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 涉及转移性肾细胞癌、非小细胞肺癌、膀胱癌和黑色素瘤等多个队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1326 | 2024-08-07 |
Expression of PD-1 mitigates phagocytic activities TAM in osteosarcoma
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23498
PMID:38223729
|
研究论文 | 本研究探讨了程序性死亡1（PD-1）在肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的表达及其对骨肉瘤（OS）转移的影响 | 首次揭示了PD-1在TAMs中的表达抑制其吞噬能力，从而促进骨肉瘤转移的机制 | NA | 研究PD-1在TAMs中的表达对骨肉瘤转移的影响及其机制 | 骨肉瘤肺转移中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和肿瘤浸润淋巴细胞（TILs） | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15500个来自人骨肉瘤肺转移病变的单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1327 | 2024-08-05 |
What role does GPR65 play in the progression of osteosarcoma? Its mechanism and clinical significance
2024-Jan-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03216-5
PMID:38218960
|
研究论文 | 本研究旨在探讨GPR65在骨肉瘤的微环境、增殖及迁移中的作用 | 首次阐明GPR65在骨肉瘤发展中的作用及其机制，强调其作为预后生物标志物的潜力 | 研究样本均为术后标本，可能影响结果的普适性 | 探索GPR65在骨肉瘤进展中的机制及其临床意义 | 97名骨肉瘤患者的转录组数据及六个术后标本的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 生物样本数据 | 97名骨肉瘤患者和六个手术标本 | NA | NA | NA | NA |
| 1328 | 2024-08-05 |
BIDCell: Biologically-informed self-supervised learning for segmentation of subcellular spatial transcriptomics data
2024-Jan-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44560-w
PMID:38218939
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为BIDCell的自监督深度学习框架，用于亚细胞空间转录组数据的分割 | BIDCell引入了生物学启发的损失函数，通过学习空间分布的基因表达与细胞形态之间的关系，克服了传统方法在细胞分割中的挑战 | 未提及具体的局限性 | 提高单细胞空间表达分析的精确度 | 使用来自公共库的单细胞转录组数据和细胞形态信息进行细胞分割 | 数字病理学 | NA | 自监督深度学习 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1329 | 2024-08-05 |
Zhilong Huoxue Tongyu capsule alleviates myocardial fibrosis by improving endothelial cell dysfunction
2024-Jan, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2023.07.001
PMID:38223805
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研究论文 | 该论文研究了智龙活血通瘀胶囊对心肌纤维化中内皮细胞功能障碍的影响 | 首次提供了智龙活血通瘀胶囊通过调节内皮-间质转化和MHC-II表达来改善心肌纤维化的证据 | 缺乏对长期疗效和作用机制的深入探讨 | 研究智龙活血通瘀胶囊对心肌纤维化中内皮细胞功能障碍的治疗效果 | 心肌纤维化过程中受到影响的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 免疫荧光染色、组织染色 | 小鼠模型 | 生物标志物、心脏超声波和组织学数据 | 使用异丙肾上腺素注射建立的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1330 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes of kidneys in a 6-month-old boy with Denys-Drash syndrome reveal stromal cell heterogeneity in the tumor microenvironment
2024-Jan, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfad277
PMID:38223339
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了Denys-Drash综合征患者肾脏组织中的细胞异质性 | 发现了一个新的WT1基因突变，并通过单细胞RNA测序揭示了Wilms肿瘤和肾脏组织中的细胞成分异质性 | NA | 探索Denys-Drash综合征患者肾脏组织中的细胞成分和相互作用 | Denys-Drash综合征患者的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 31,135个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1331 | 2024-08-05 |
Update on Biomarkers in Renal Cell Carcinoma
2024-Jan, American Society of Clinical Oncology educational book. American Society of Clinical Oncology. Annual Meeting
DOI:10.1200/EDBK_430734
PMID:38207251
|
研究论文 | 该文章更新了肾细胞癌生物标志物的相关进展 | 本文创新性地探索了宿主因素及其对免疫系统的深入特征化，并提出了新技术以克服现有技术面临的挑战 | 尽管对肿瘤内在特征进行了广泛研究，但尚未提供明确和可靠的预测生物标志物 | 本文旨在识别能够预测治疗反应和耐药性的生物标志物 | 研究对象主要是肾细胞癌及其相关的生物标志物 | 肿瘤病理学 | 肾癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1332 | 2024-08-07 |
A proteome-wide screen identifies the calcium binding proteins, S100A8/S100A9, as clinically relevant therapeutic targets in aortic dissection
2024-Jan, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.107029
PMID:38056513
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析，发现钙结合蛋白S100A8/S100A9在主动脉夹层中作为新的治疗靶点 | 首次确定S100A8/S100A9作为主动脉夹层的治疗靶点，并通过药物ABR-25757验证其安全性和有效性 | NA | 发现主动脉夹层的新治疗靶点 | 主动脉夹层患者和对照组的升主动脉样本 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1333 | 2024-08-07 |
Self-organized BMP signaling dynamics underlie the development and evolution of digit segmentation patterns in birds and mammals
2024-Jan-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2304470121
PMID:38175868
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间基因表达分析，结合数学模型，研究了鸟类和哺乳动物趾部分节模式的发育和进化机制 | 首次揭示了BMP信号通路中的自组织Turing系统如何形成周期性的关节模式，并能重现体内观察到的时空基因表达动态 | NA | 探讨BMP信号通路在鸟类和哺乳动物趾部分节模式发育中的作用 | 鸟类和哺乳动物的趾部分节模式 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1334 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Pancreatic Islets From Early Diabetic Mice Identifies Anxa10 for Ca2+ Allostasis Toward β-Cell Failure
2024-Jan-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0212
PMID:37871012
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了早期糖尿病小鼠胰腺胰岛的转录组，发现Anxa10基因在钙离子异稳态中的作用及其与β细胞功能障碍的关系 | 发现了糖尿病特异性的内分泌和非内分泌细胞类型的转录组景观，并识别了一个新的前糖尿病基因Anxa10，该基因在代谢应激下诱导并调节钙离子流入 | NA | 揭示2型糖尿病中β细胞功能障碍的全面机制 | 早期糖尿病小鼠的胰腺胰岛 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 糖尿病db/db小鼠的胰腺胰岛 | NA | NA | NA | NA |
| 1335 | 2024-08-07 |
HAMSAB diet ameliorates dysfunctional signaling in pancreatic islets in autoimmune diabetes
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108694
PMID:38213620
|
研究论文 | 本文研究了HAMSAB饮食对自身免疫性糖尿病中胰腺胰岛功能障碍信号的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了HAMSAB饮食对胰腺胰岛细胞基因表达的影响 | 研究主要在NOD小鼠模型中进行，需要进一步在人类患者中验证 | 探讨HAMSAB饮食对改善1型糖尿病血糖控制的作用机制 | 胰腺胰岛细胞及其中免疫细胞的基因表达 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NOD小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1336 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data revealed T cell marker genes based molecular sub-types and a prognostic signature in lung adenocarcinoma
2024-01-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50787-w
PMID:38200058
|
研究论文 | 本研究揭示了基于T细胞标记基因的肺腺癌分子亚型和预后特征 | 提出了一种基于T细胞标记基因的预后签名，具有预测肺腺癌患者免疫治疗结果的潜力 | 该研究的特定T细胞贡献尚未得到充分探讨 | 旨在基于T细胞标记基因 delineate 分子亚型和预后指标 | 研究肺腺癌（LUAD）中T细胞的作用及其相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | Cox分析 | 单细胞数据和批量RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1337 | 2024-08-07 |
Identification of CD8+ T-cell exhaustion signatures for prognosis in HBV-related hepatocellular carcinoma patients by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-Jan-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11804-3
PMID:38200408
|
研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别了与HBV相关肝细胞癌患者预后相关的CD8+ T细胞耗竭特征。 | 建立了新的CD8+ T细胞耗竭指数（TEI）模型，该模型有望预测HBV相关肝细胞癌患者的临床预后和潜在的免疫治疗效果。 | NA | 研究CD8+ T细胞耗竭特征在HBV相关肝细胞癌患者中的预后价值及免疫治疗反应。 | HBV相关肝细胞癌患者的CD8+ T细胞耗竭特征。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1338 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Sequence Profiling on the Morphogenesis of Secondary Hair Follicles in Ordos Fine-Wool Sheep
2024-Jan-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010584
PMID:38203755
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序分析了Ordos细毛羊次级毛囊形态发生过程中的分子机制 | 首次揭示了Ordos细毛羊次级毛囊形态发生的分子机制，并通过伪时间分析构建了真皮系细胞和表皮系细胞的分化轨迹 | NA | 旨在分析Ordos细毛羊毛囊形成过程中的分子机制，以改善其纤维直径和羊毛产量 | Ordos细毛羊的次级毛囊形态发生 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1339 | 2024-08-05 |
Integrated Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data Constructs and Validates a Prognostic Model for Non-small Cell Lung Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.90768
PMID:38213729
|
研究论文 | 本研究整合了传统的肿瘤大块RNA测序和单细胞RNA测序数据，构建了非小细胞肺癌的预后模型 | 该研究创新性地将单细胞RNA-seq数据与大块RNA-seq数据相结合，并纳入临床特征来构建预后模型 | 研究未提及样本的长期随访数据与模型的外部验证 | 研究旨在为非小细胞肺癌患者开发精确的预后模型 | 研究对象为非小细胞肺癌患者的数据，包括基因表达和临床特征 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | LASSO和Cox回归模型 | 基因表达数据 | 参与研究的样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1340 | 2024-08-05 |
Batch correction of single-cell sequencing data via an autoencoder architecture
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad186
PMID:38213820
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研究论文 | 本文开发了一种基于自编码器的批次校正方法，用于整合单细胞测序数据集 | 提出了一种半监督深度学习架构，能有效去除批次效应并保持生物信号 | 未提及特定的限制 | 解决单细胞测序数据集中批次效应的问题 | 多个来自不同来源的单细胞测序数据集 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 自编码器 | 基因表达数据 | 四个单细胞测序数据集 | NA | NA | NA | NA |